ويصف هذا البروتوكول كيفية حفز الخلايا مع الببتيدات المشتقة من الميتوكوندريا، وتقييم تتالي إرسال الإشارات والتعريب والرمات-البروتينات.
مقالة منهجية
ويصف هذا البروتوكول كيفية حفز الخلايا مع الببتيدات المشتقة من الميتوكوندريا، وتقييم تتالي إرسال الإشارات والتعريب والرمات-البروتينات.
الببتيدات المشتقة من الميتوكوندريا (مدبس) هي فئة جديدة من الببتيدات التي تم ترميزها بإطارات صغيرة للقراءة المفتوحة داخل جينات أخرى معروفة لجينوم المتقدرية. وقد مدبس طائفة واسعة من الآثار البيولوجية مثل حماية الخلايا العصبية من المبرمج، وتحسين علامات التمثيل الغذائي، وحماية الخلايا من العلاج الكيميائي. هومانين كان أول حزب الألفية الديمقراطي يمكن اكتشافها وهو الببتيد درس آخر بين أسرة حزب الألفية الديمقراطي. قد اتسمت بعناية مستقبلات الغشاء ومسارات الإشارات المتلقين للمعلومات من هومانين. مدبس إضافية مثل الكلمات-ج و SHLP1-6 وقد اكتشفت في الآونة الأخيرة ولم توضيح آليات إرسال الإشارات. هنا يمكننا وصف أسلوب ثقافة القائمة على خلايا لتحديد وظيفة هذه الببتيدات. على وجه الخصوص، تقنيات تجزئة الخلية في تركيبة مع النشاف الغربية يسمح بتحديد كمي للتنشيط وازفاء جزيء إشارات هامة. في حين أن هناك أساليب أخرى لتجزئة الخلية، الموضحة هنا طريقة سهلة ومباشرة. يمكن استخدام هذه الأساليب لتوضيح إليه العمل هذه الببتيدات والعوامل العلاجية الأخرى.
وتبين الدراسات الناشئة أن الببتيدات المشتقة من الميتوكوندريا (مدبس) تلعب دوراً هاما في سيتوبروتيكشن والايض2،،من13. فهم المسار توصيل الإشارات حضور مدبس يعطينا نظرة ثاقبة الآلية التي تعدل مدبس وظائف مختلفة. الديمقراطي التي تم تحديدها أولاً، هومانين، قد ثبت أن زيادة خارج الخلية كيناز ينظم إشارة 1/2 (ERK1/2) الفسفرة من خلال مستقبلات لها ملزمة4،5. غير تأثير المصب التنشيط ERK1/2 لا يزال مستقصاة.
تتالي ERK1/2 يعمل كوسيط أساسي في مجموعة متنوعة من العمليات الخلوية بما في ذلك الانتشار والهجرة الخلية والايض الخلوي، والبقاء على قيد الحياة والمبرمج6،،من78. لتنسق جميع هذه العمليات الخلوية متميزة، والنشاط والتعريب سوبسيلولار ERK1/2 أحكام ينظم فوسفاتاسيس والسقالة البروتينات9،10. بالإضافة إلى تعديل بوستترانسلاشونال، جولات مكوكية دينامية ERK1/2 ينظم أيضا إرسال الإشارات الدالة، والنشاط، وخصوصية11،12. هو أساسا في سيتوسول13مترجمة ERK1/2. تساعد مجموعة من البروتينات وترسيخ سقالة الاحتفاظ ERK1/2 في العناصر سيتوسكيليتال، على السطح من العضيات، أو تنتشر في السيتوبلازم13. عند التحفيز، وهو فوسفوريلاتيد ERK1/2 ويصبح ينفصل ترسيخ البروتينات، مما يتيح نقل جسد ERK1/2 إلى المقصورات سوبسيلولار الأخرى، بما في ذلك نواة، الميتوكوندريا، غولجي، و، ليسوسوميس14 15 , 16.
على الرغم من أن من المعروف هومانين لتنشيط ERK1/2 يشير إلى المسار، فقط لوحظ أن تفعيل ERK1/2 في ليساتيس خلية الإجمالي. كما هو موضح سابقا، نظراً للترجمة سوبسيلولار ERK1/2 يلعب دوراً حاسما في أثره المتلقين للمعلومات، وتحليل التعريب سوبسيلولار ومستويات إجمالي فوسفوريلاتيد ERK1/2 ضروري لتوفير فهم شامل ERK1/2 التي يسببها هومانين التنشيط وتفعيل أهداف المتلقين للمعلومات.
فهم العضيات الهدف من تنشيط ERK1/2، تم إجراء تجزئة سوبسيلولار تليها النشاف الغربية فوسفوريلاتيد ERK1/2. ويمكن تنفيذ هذا الأسلوب بسهولة كما أنها تستخدم معدات المختبرات القياسية والكواشف. المقصورات سوبسيلولار معزولة بدرجة نقاء عالية، مما يسمح في النتائج التي تفسر بشكل مباشر. إيمونوستاينينج ERK1/2 قد تسفر عن نتائج مماثلة. بعض المقصورات سوبسيلولار غير الثابتة نسبيا لتصور وتتطلب أساليب التثبيت وبيرميبيليزيشن الخاصة. تختلف مستويات ERK1/2 في المقصورات سوبسيلولار، وهذا الاختلاف يمكن أن تسبب الإشارات السلبية إيجابية وكاذبة كاذبة عند النظر في كل خلية ليساتيس. ولذلك، إيمونوبلوت استخدام المقصورات سوبسيلولار معزولة يعطينا فهم أفضل للتعريب ERK1/2.
براعة الأسلوب الذي يتيح إدخال تعديلات على البروتوكول للتحقيق في آثار المنشطات الأخرى بما في ذلك أخرى مدبس أو إزفاء من جزيئات إشارات أخرى مثل STAT3. مؤخرا تم ترميزها المكتشفة الصغيرة مثل هومانين الببتيدات (شلبس) من منطقة الرنا الريباسي 16S حيث يتم ترميز هومانين، ولديهم خصائص مشابهة ولكنها متميزة بالمقارنة مع حماد17. على سبيل المثال، تنشيط SHLP2 و SHLP3 ERK1/2 بعد 8 س على الرغم من أن ينشط هومانين ERK1/2 ضمن الحد الأدنى 5 دراسة الترجمة سوبسيلولار ERK1/2 ردا على الببتيدات مختلفة سيتيح لنا فهم أفضل لعلم الأحياء من هذه الببتيدات. تظهر الأدلة أظهرت أن توطين سوبسيلولار مما يشير إلى جزيئات تلعب دوراً حاسما في آثارها المتلقين للمعلومات. على سبيل المثال، STAT3 المعروف تقليديا لتكون أساسا في سيتوسول في الخلايا يستريح مترجمة، وثم أنها translocates إلى النواة لتنشيط الجينات ردا على السيتوكينات18. كما STAT3 translocates إلى الميتوكوندريا وينظم دورة TCA و إنتاج ATP19. وفيما يتعلق بالتنظيم أوتوفاجي، ينظم التعريب سوبسيلولار مختلفة من STAT3 أوتوفاجي في مختلف طرق20. على سبيل المثال، STAT3 النووية ترانسكريبتيونالي ينظم الجينات المتعلقة أوتوفاجي ويعمل المغير أوتوفاجي. STAT3 هيولى مؤثرا يحول دون أوتوفاجي بالتفاعل مع إشارات الجزيئات أوتوفاجي. يحول دون STAT3 الميتوكوندريا ويمنع ميتوفاجي بقمع أوتوفاجي الأكسدة المستحث. ولذلك، هذا الأسلوب عزل المقصورة سوبسيلولار أمر حاسم لفهم دور أخرى إشارات الجزيئات، وكذلك ERK1/2.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. "معاملة الببتيد" للخلايا
2. تجزئة سوبسيلولار سيتوسول ونواة
3. "كسر Mitochondrial الخام"
4. الغربية النشاف "البروتينات" الخاصة والرمات
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
استخدام الإجراء المعروضة هنا، نحن تعامل الخلايا HEK293 و SH SY5Y مع ميكرو 1 و 100 ميكرومتر S14G-هومانين، هومانين قوية تناظرية21، على التوالي، في استكمال وسائل الإعلام للفترات الزمنية المشار إليها (الشكل 1A و الرقم 1 ب). ثم درسنا شكل إجمالي وفوسفوريلاتيد ERK1/2 في منتدى المجالس الرومانسية202/Tyr204 من مستخلصات البروتين الكلي. S14G-هومانين العلاج أظهرت...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
هنا، نحن أثبت أن يحدث التنشيط ERK1/2 الببتيد بوساطة هومانين في نوعين من خلايا مختلفة، وتعريب سوبسيلولار لتنشيط ERK1/2 يمكن أن تختلف تبعاً للظروف (مثلاً، جرعة الببتيد والنقطة الزمنية، والخلية نوع). وقد ثبت أن هومانين إشارات عن طريق مستقبلات مختلفة اثنين22،23، مما قد يفسر الاختلافات في الإشارات بين خطوط الخلايا اثنين، فضلا عن الحاجة إلى جرعات مختلفة من هومانين. لم تدرس الآثار الفسيولوجية لهذا تماما، بل أنها قد تشير إلى إحدى الآليات الممكنة للردود الأنسجة ت...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
نحاس كوهين هو المساهم واستشاري لكلفن كوبر, Inc. ين عملت كمستشار لشركة كوبر
هذا العمل كان يدعمها أليسون/عفر "زمالات ما بعد الدكتوراه" في "برنامج بحوث الشيخوخة" إلى سيك، ومنح جائزة مؤسسة جلين، والمعاهد الوطنية للصحة للكمبيوتر (1P01AG034906، 1R01GM 090311، 1R01ES 020812). تظهر كافة المؤلفين في الفيلم.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| p44 / 42 MAPK (ERK1 / 2) | الخلية | 9102 | التخفيف 1: 1,000 |
| phospho-p44 / 42 MAPK (ERK1 / 2) (Thr202 / Tyr204) إشارات | الخلية | 4370 | التخفيف 1: 1,000 |
| خلية | Lamin B1 | 12586 | علامة نووية ، تخفيف 1: 1,000 |
| GAPDH | إشارات الخلية | 5174 | علامة السيتوبلازمية ، التخفيف 1: 2,000 |
| Tom20 | سانتا كروز | SC-17764 | علامة الميتوكوندريا ، التخفيف 1: 2،000 |
| الخلية | المترافقة المضادة للأرانب HRP | 7074 | التخفيف 1: 30،000 |
| RIPA تحلل واستخراج عازلة | ThermoFisher SCIENTIFIC | 89900 | |
| 100 مم طبق ثقافة | ThermoFisher SCIENTIFIC | 12556002 | |
| HNG الببتيد | Genescript | ||
| 25 مم مرشح سيلينج | ThermoFisher SCIENTIFIC | 09-719A | |
| HEPES | Sigma | H3375 | |
| MgCl2 | Sigma | M8266 | |
| KCl | Sigma | P9333 | |
| Glycerol | Sigma | G9012 | |
| Triton X-100 | ThermoFisher SCIENTIFIC | BP151-100 | |
| EDTA | Sigma | 3609 | |
| MOPS | Sigma | M1254 | |
| EGTA | Sigma | E3889 | |
| السكروز | سيجما | S7903 | |
| Tris-base | ThermoFisher SCIENTIFIC | BP152-1 | |
| HCL | Sigma | H1758 | |
| PBS | Lonza | 17-512F | |
| مكشطة الخلية | FALCON | 353085 | |
| التوقف والتجارة; كوكتيل مثبط البروتياز والفوسفاتيز (100X) | ThermoFisher SCIENTIFIC | 78440 | |
| مجموعات طاحونة الأنسجة من Thomas Pestle مع بثور ناعمة | توماس Scientific | 3432S90 | |
| Tween-20 | ThermoFisher SCIENTIFIC | BP337-500 | |
| BSA | ThermoFisher SCIENTIFIC | BP1600-100 | |
| 8-16٪ Mini-PROTEAN TGX جل | البروتين مسبقة الصبBIO RAD | 4561104 | |
| Mini Trans-Blot Module | BIO RAD | 1658030 | |
| نظام نقل توربو عبر اللطخة | BIO RAD | 1704150 | |
| Trans-Blot Turbo RTA Mini PVDF Transfer Kit | BIO RAD | 1704272 | |
| Clarity Western ECL Blotting Tركائز | BIO RAD | 1705060 | |
| استعادة المخزن المؤقت لتجريد اللطخة الغربية | ThermoFisher SCIENTIFIC | 21059 | |
| Dulbecco's Modified Eagle Medium | ThermoFisher SCIENTIFIC | 11965-092 | |
| Sonicator ، Medel: FB120 | ThermoFisher SCIENTIFIC | 695320-07-12 |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن