1-الأعمال التحضيرية
-
إعداد حلول للأسفار في الموقع التهجين (الأسماك). إعداد جميع الحلول باستخدام الماء عالي النقاوة.
- إعداد 5 × المخزن المؤقت "روب تعديل": خلات البوتاسيوم 275 مم، خلات الصوديوم 200 ملم، السكروز 500 مم، الجلوكوز 50 مم، وكلوريد المغنيسيوم 6 مم، وكلوريد الكالسيوم 5 مم، حموضة حبيس 500 ملم = 7.4. تحقيق درجة الحموضة 7.4 استخدام 10 N هيدروكسيد الصوديوم. فلتر تعقيم وتخزين في-20 درجة مئوية. ذوبان الجليد وتمييع إلى 1 x حسب الحاجة وتخزين 1 x مختبرين في-20 درجة مئوية.
- إعداد 10 × الفوسفات مخزنة المالحة (PBS) استخدام 1.3 م كلوريد الصوديوم، 70 مم نا2هبو4، 30 مم NaH2ص4. تحقيق درجة الحموضة 7.0 باستخدام 10 N هيدروكسيد الصوديوم. تعقيم بالتعقيم التعقيم أو تصفية.
-
إعداد كوفيرسليبس بولي-L-يسين يوم واحد قبل اللازمة.
- "الماصة؛" الإيثانول 70% يحتوي على 1% حمض الهيدروكلوريك على سطح ساترة 18 ملم × 18 ملم #1.5 واحتضان 5 دقيقة استخدام الشفط بالتخلية لإزالة السائل. كرر مع الماء المعقم عالي النقاوة. وتغطي سطح ساترة مع 0.1 مغ/مل بولي-L-يسين واحتضان لمدة 10 دقائق.
- نضح لإزالة السائل والهواء الجاف لأدنى 10 مخزن كوفيرسليبس بولي-L-يسين الجانب الأعلى في وعاء من بلاستيك مع غطاء ضيقة لتجنب الغبار.
- إعداد باستور سحبت الماصات لإزالة السائل الحلول دون إزالة بويضات. فوق لهب موقد بنسن، الحرارة منتصف الزجاج طويلة ماصة باستور حين سحب بلطف في كل نهاية حتى يذوب الزجاج وتسحب بعيداً.
2-جيل من ذراع المسبار للأسماك
ملاحظة: جميع أجهزة الطرد المركزي خطوات تتم في ~ 16,000-21,000 س ز (السرعة القصوى في معظم الجدول الأعلى ميكروسينتريفوجيس). يدور الطرد المركزي موجزة تبين الغزل لدوامة س. 5-15 تشير إلى فورتيكسينج ~ 15 s في أقصى سرعة إلا إذا ذكر خلاف ذلك.
ملاحظة: يمكن الحصول على BACs لتحقيقات الذراع من "الموارد باك باك". كروموسوم X اثنين الذراع يوتشروماتيك المسابير استخدمت بنجاح باستخدام هذا الأسلوب. واحد ذراع المسبار كان يتألف من ستة BAC استنساخ المقابلة الخلوية إلى العصابات 7B 6E (BACR17C09، BACR06J12، BACR35J16، BACR20K01، BACR35A18، BACR26L11). ذراع المسبار أخرى تتألف من ست باك استنساخ المقابلة لعصابات الخلوية 2 واو-3 ج (BACR13K19، BACR21G11، BACR09H13، BACR30B01، BACR34O03، BACR03D13). BACs على كروموسوم المورفولوجية الأخرى قد تصفحها المناطق في: http://www.fruitfly.org/sequence/X1-11-assembly.html. اثنين بيريسينتريك المسابير التي تعترف بتكرار فضائية بي بي 359 من كروموسوم إكس قد استخدمت بنجاح باستخدام هذا الأسلوب. تحقيق النوكليوتيدات 22 وقد استخدمت على نطاق واسع، ويعمل بشكل جيد (5 '-Cy3-أججاتكجتاجكاكتكجتات)19،23. تحقيق النوكليوتيدات 28 تم اختبارها مؤخرا وعملت أيضا بشكل جيد (5 '-Cy3-ججاتكجتاجكاكتجتاتاجكتجك)24. [هبلك] تنقية النوكليوتيد 5 ' المسمى مع فلوروفوري محددة صدرت من مصدر تجاري (مثلاً، تقنيات الحمض النووي المتكاملة).
- الإعدادية BAC استنساخ الحمض النووي بعد عدة تعليمات كما هو محدد في الجدول للمواد. ريسوسبيند بيليه الحمض النووي التي تم الحصول عليها من 100 مل ثقافة في 200 TE ميليلتر؛ تركيز الحمض النووي النهائي يجب أن تتراوح بين 5-40 نانوغرام/ميليلتر اعتماداً على استنساخ باك.
- أداء تضخيم الحمض النووي لكل باك باستخدام مجموعة التضخيم، كما هو محدد في الجدول للمواد، وبروتوكول التالية. عملية "باك الحمض النووي" لاستنساخ كل على حدة. استخدام المخازن المؤقتة المتوفرة مع مجموعة أدوات في الخطوات 2.2.1 من خلال 2.2.3 والأنزيمات.
- تجزئة عشوائي للحمض النووي BAC: لكل باك، استخدام الشركة المصرية للاتصالات لإعداد 10 ميليلتر من حل الحمض النووي 1 نانوغرام/ميليلتر في أنبوب بكر 200 ميليلتر. إضافة ميليلتر 1 X 10 تجزئة المخزن المؤقت. ضع الأنبوبة في جهاز PCR عند 95 درجة مئوية للضبط 4 دقيقة بارد فورا العينة في الماء المثلج والطرد المركزي بإيجاز. الحضانة وقت حساس وأي انحراف قد يغير النتائج.
- إعداد المكتبة
ملاحظة: يستخدم هذا الأسلوب كبسولة تفجير عشوائي لإنشاء مكتبة شظايا أمبليفيابل.
- للأنبوبة التي تحتوي على الحمض النووي إضافة ما يلي: 2 ميليلتر من 1 × مكتبة إعداد المخزن المؤقت، 1 ميليلتر من "مكتبة تثبيت الحل". مزيج دقيق من فورتيكسينج والطرد المركزي لفترة وجيزة، ووضع الأنبوب في جهاز PCR عند 95 درجة مئوية للحد الأدنى 2 بارد فورا العينة في الماء المثلج والطرد المركزي بإيجاز.
- إضافة 1 ميليلتر من "إنزيم إعداد مكتبة" بأنبوب بكر ومزيج وأجهزة الطرد المركزي بإيجاز. بكر مكان الأنبوبة في جهاز PCR واحتضان كما يلي: 16 درجة مئوية لمدة 20 دقيقة، 24 درجة مئوية لمدة 20 دقيقة, 37 درجة مئوية لمدة 20 دقيقة، 75 درجة مئوية لمدة 5 دقائق، ثم عقد في 4 درجات مئوية.
- إزالة عينات من الجهاز بكر والطرد المركزي بإيجاز. وقد تضخم فورا عينات أو المخزنة في-20 درجة مئوية لمدة تصل إلى ثلاثة أيام.
- تضخيم مكتبة BAC الحمض النووي
- إضافة الكواشف التالية إلى رد فعل عشوائي جزء 15 ميليلتر الكامل: ميليلتر 7.5 10 x ميكس ماجستير التضخيم، ميليلتر 47.5 Nuclease المياه مجاناً، 5 ميليلتر "وغ دنا بوليميريز". مزيج دقيق من فورتيكسينج والطرد المركزي بإيجاز.
- بكر مكان الأنبوبة في جهاز PCR واحتضان كما يلي: الأولى تمسخ 95 درجة مئوية لمدة دقيقة 3، 14 دورات تمسخ في 94 درجة مئوية لمدة 15 ثانية، تليها الصلب/ملحق في 65 درجة مئوية لمدة 5 دقائق، ثم عقد في 4 درجات مئوية.
- بعد الانتهاء من ركوب الدراجات، الاعتداء تركيز الحمض النووي. يجب أن يكون تركيز الحمض النووي على الأقل 800 نانوغرام/الحفاظ على عينات ميليلتر. في 4 درجات مئوية أو مخزن في-20 درجة مئوية حتى جاهزة الهضم. بشكل اختياري، تقييم حجم جزء الحمض النووي عن طريق تشغيل 400 نانوغرام من الحمض النووي على 2% [اغروس] هلام. الأجزاء يجب أن تتراوح من 200 شركة بريتيش بتروليوم إلى 3 كيلو بايت (الشكل 2).
- هضم إنزيم التقييد لتضخيم الحمض النووي
- مكان 20 ميكروغرام لتضخيم الحمض النووي من المقطع السابق في أنبوب [ميكروفوج] 1.5 مل. إضافة 20 وحدة العالول، هايلل، مسيل، مسبل، والشركة، والوحدات 25 بفوكل، 0.5 ميليلتر 100 x جيش صرب البوسنة، ميليلتر 5 10 × تقييد إنزيم الهضم المخزن المؤقت، وضبط حجم الصوت إلى 50 ميليلتر بإضافة المقدار المناسب من النقاوة H2o.
- احتضان الخلاصة بين عشية وضحاها في 37 درجة مئوية في حاضنة لمنع التكثيف على الغطاء. الإيثانول يعجل بالحمض النووي هضمها. إضافة إلى الخلاصة: 1 ميليلتر الجليكوجين، المجلد 1/10 م 3 خلات الصوديوم، 2.5 حجم الصف الجزيئية 100 ٪ الإيثانول. احتضان في-80 درجة مئوية ح 1 أو بين عشية وضحاها.
- أجهزة الطرد المركزي لمدة 30 دقيقة في 4 درجات مئوية. بيليه "يغسل الحمض النووي" مع حجم 1 غرفة الإيثانول 70% temp وتدور لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية. إزالة المادة طافية والسماح للحمض النووي بيليه الجوية الجافة أو الجافة بلطف مع تيار مستمر من الهواء.
- ريسوسبيند بيليه الحمض النووي في 36 ميليلتر العقيمة عالي النقاوة ح2س واستخدم 1 ميليلتر من الحمض النووي للاعتداء تركيز الحمض النووي، الذي ينبغي أن يكون حوالي 285 نانوغرام/ميليلتر. تخزين الحمض النووي في-20 درجة مئوية.
- تقييم اختيارياً الحمض النووي جزء حجم تشغيل 400 نانوغرام من الحمض النووي على 2% [اغروس] هلام. معظم الشظايا يجب أن تتراوح بين 100-200 شركة بريتيش بتروليوم، مع إشارة خفوتا ما يصل إلى 500 bp (الشكل 2).
- 3 ' رد فعل المخلفات
- تؤذي الحمض النووي هضمها عند 100 درجة مئوية لمدة 1 دقيقة في كتلة حرارة. البرد فورا في الماء المثلج. ميليلتر 35 من الحمض النووي، قم بإضافة ما يلي: 50 مم 400 ميليلتر الصوديوم كاكوديلاتي، 1 ميليلتر 10 مم DTT ودوامه جيدا. إضافة 4 ميليلتر 25 مم كوكل2، ميليلتر 2.5 مم 2 5-(3-aminoallyl)-dUTP من آريس وسم كيت على النحو المحدد في جدول المواد، 5 ميليلتر 1 مم دتتب، ميليلتر 18 5 x TdT المخزن المؤقت، وترانسفيراز ديوكسينوكليوتيديل المحطة الطرفية 1 ميليلتر (TdT) 400 ش/ميليلتر. ودوامه، وأجهزة الطرد المركزي بإيجاز.
تنبيه: كوكل2 السمية، وارتداء الحماية المناسبة.
- احتضانها ح 2 في 37 درجة مئوية في حاضنة لمنع التكثيف. أضف 1 ميليلتر من 250 مم يدتا التوقف عن الرد ودوامه بإيجاز مزيج. الإيثانول يعجل الحمض النووي الذيل كما هو موضح أعلاه (الخطوات 2.3.2-2.3.4). ريسوسبيند بيليه الحمض النووي المجففة في 10 ميليلتر العقيمة عالي النقاوة ح2"مخزن سين" الحمض النووي في-20 درجة مئوية حتى على استعداد للاستمرار.
- إجراء اقتران صبغة الفلورسنت استخدام الحمض النووي عدة وضع العلامات كما هو محدد في "الجدول المواد".
ملاحظة: بمجرد إضافة صبغة الاحتفاظ بعينات في الظلام.
- تؤذي الحمض النووي الذيل عند 95 درجة مئوية لمدة 5 دقائق في كتلة حرارة. فورا بارد الحمض النووي في الماء المثلج وأجهزة الطرد المركزي بإيجاز. إعداد المخزن المؤقت وضع العلامات وفقا لتعليمات كيت وإضافة 6 ميليلتر لكل عينة من الحمض النووي. ريسوسبيند كل أنبوب صبغة في 4 ميليلتر من [دمس] من الطقم. دوامة وأجهزة الطرد المركزي بإيجاز.
- استخدام أنبوب واحد من الصبغة لكل رد فعل وضع العلامات. إضافة حل صبغ للحمض النووي، ودوامه، وأجهزة الطرد المركزي بإيجاز. تبني رد فعل وضع العلامات في درجة حرارة الغرفة ح 2 في الظلام. إضافة 3 ميليلتر من هيدروكسيلاميني م 3 التوقف عن رد فعل تتبعها 77 ميليلتر من خالية نوكلاس ح2س من الطقم. دوامة وأجهزة الطرد المركزي بإيجاز.
- إزالة الصبغة غير مترافق باستخدام مجموعة تنقية بكر كما هو محدد في الجدول للمواد. اتبع إرشادات الشركة المصنعة. الوت الحمض النووي من العمود مرتين باستخدام ميليلتر 40 شطف المخزن المؤقت في كل مرة.
- الإيثانول يعجل بالحمض النووي المسمى كما هو موضح سابقا (الخطوات 2.3.2-2.3.4). ريسوسبيند بيليه الحمض النووي المجففة في 10 ميليلتر شطف العازلة.
- إعداد الخليط مسبار
- للحمض النووي، المسمى وتحديد تركيز الصبغة fluorochrome في pmol/ميليلتر. أن تركيز fluorophore قد تتراوح بين 30-100 pmol/ميليلتر، اعتماداً البكالوريا. تركيز الحمض النووي قد تتراوح بين 300-800 نانوغرام/ميليلتر.
ملاحظة: الإعداد ميكرواري يعمل جيدا على ميكروفولومي جهاز المطياف الضوئي، مثل تلك المحددة في الجدول للمواد. في إطار ميكرواري، حدد الحمض النووي-50، وحدد في فلوروتشرومي.
- إنشاء مزيج رئيسي عن طريق الجمع بين كميات اكويمولار (بمول فلور) من كل من المسابر باك. دوامة 30 ثانية قبل الجمع. لتجنب دورات تجميد/ذوبان الجليد، وتحضير مختبرين لمزيج الرئيسي، وتطبيق الفيلم البارافين للأنابيب لمنع التبخر، وتخزينها في الظلام في-20 درجة مئوية.
ملاحظة: mastermix التي تحتوي على 250 بمول كل من باك الفردية 6 تحقيقات في إجمالي حجم 30-50 ميليلتر يعمل جيدا. قاسمة تتضمن 25 بمول (فلور) لكل باك سيكون كافياً لردود فعل التهجين ميليلتر 40 اثنين، مع تركيز تحقيق نهائي ل 0.31 pmol فلور/ميليلتر لكل باك.
3-تشريح والتثبيت من بويضات
- جمع 30 من الإناث العذراء للنمط الوراثي المناسب. لإثراء لأواخر المرحلة بويضات، عقد الإناث دون الذكور في قنينة مع الغذاء يطير والخميرة الجافة لمدة 3-5 أيام قبل تشريح25. قبل التشريح، اليوم نقل الإناث دون الغاز إلى قنينة جديدة مع الخميرة.
-
إجراء التشريح.
ملاحظة: انظر الشكل 3 للأدوات اللازمة. تتم إزالة الحلول باستخدام ماصة باستور سحبت إلا إذا ذكر خلاف ذلك. عند نقل المبيض دائماً استخدام تلميح ماصة مطلية بحل جيش صرب البوسنة "10%".
- في طبق تشريح ضحلة التي تحتوي على المخزن المؤقت "تعديل روب"، استخدام الملقط لإزالة المبيض من أنثى واحدة. استخدام الملقط أو إبرة تنغستن تباعد بلطف كل المبيض، مما يتيح الحل للاتصال أوفاريوليس الداخلية. نقل زوج المبايض مفلطح إلى 1.5 مل [ميكروفوج] أنبوب يحتوي على المخزن المؤقت 1 مل "روب تعديل".
- كرر الخطوة 3.2.1 تتراكم المبيض من الإناث 20-25 في 1.5 مل [ميكروفوج] أنابيب. الانتهاء من تشريح الإناث 20-25 في 10 دقيقة.
-
إجراء التثبيت كما يلي.
- مع سحبت ماصة باستور، إزالة السائل في [ميكروفوج] أنابيب واستخدام P1000 لإضافة 500 ميليلتر من 37 درجة مئوية حل بسرعة المبايض وثم إضافة 500 ميليلتر من درجة حرارة الغرفة هيبتان فورا إلى المبايض.
- إزالة اهتزاز [ميكروفوج] أنابيب لخلط ووضع على نوتاتور لدقيقة 3 [ميكروفوج] أنابيب من نوتاتور ومكان في حامل أنبوب لمدة 1 دقيقة للسماح بويضات لتترسب في القاع. وقت التثبيت الإجمالي 4 دقيقة.
تنبيه: حل وهيبتان السامة، وارتداء الحماية المناسبة.
- إزالة الحل الإصلاح وشطف المبيض 3 مرات في 500 ميليلتر من برنامج تلفزيوني يحتوي على جيش صرب البوسنة 0.5% و 0.1% Triton X-100 (ببسبتكس)
- كرر للأنماط الجينية المتبقية.
4-إزالة تشوريونس والأغشية فيتيلين
ملاحظة: انظر الشكل 3 للأدوات اللازمة.
-
منفصلة في أواخر المرحلة بويضات
- أضف 1 مل ببسبتكس إلى طبق تشريح ضحلة. استخدم P200 مع تلميح المغلفة جيش صرب البوسنة لتحويل المبايض الثابتة (في ~ 150 ميليلتر) إلى الطبق الضحلة. "الماصة؛" المبايض صعودا وهبوطاً بطرف ماصة المغلفة جيش صرب البوسنة طرد بويضات ناضجة من بويضات أقل نضجاً.
- عندما يتم فصل أواخر المرحلة بويضات بما فيه الكفاية، نقل جميع الأنسجة إلى أنبوب [ميكروفوج] 500 ميليلتر. إزالة السائل الزائد مع سحبت ماصة باستور، مما أسفر عن 150-200 ميليلتر في الأنبوب. تكرار المقطع 4.1 للأنماط الجينية المتبقية.
-
إعداد للمتداول
- قبل الرطب طبق عميق جيدا مع 200 ميليلتر ببسبتكس-الغطاء وتوضع جانبا. الحصول على 3 شرائح الزجاج متجمد وتعيين الشريحة #3 جانبا. فرك بلطف المناطق متجمد الزجاج للشرائح #1 و #2 معا. شطف لهم في المياه إزالة أي شظايا الزجاج وجاف مع مسح المتاح.
- معطف المناطق متجمد من الشرائح #1 و #2 مع ببسبتكس بإضافة 50 ميليلتر من ببسبتكس إلى شريحة واحدة وفرك هذه المنطقة مع الشريحة الأخرى. إزالة السائل مع مسح المتاح.
- ضع الشرائح تحت مجهر تشريح في التكوين هو موضح في الشكل 4A. الحفاظ على دعم المناطق متجمد من الشرائح #1 و #2 في الاتصال، مع الشريحة #3 الشريحة #2.
-
بويضات لفة؛ التأكد من أن الاتجاه من المتداول دائماً في خط مستقيم وحركة دائرية ابدأ.
- ماصة برويت P200 نصيحة في ببسبتكس وتفريق بويضات في [ميكروفوج] أنابيب من بيبيتينج صعودا وهبوطاً. نقل 50 ميليلتر من بويضات تحتوي على سائل إلى وسط الجزء متجمد الزجاج من الشريحة #1. رفع الشريحة #2 للقيام بذلك.
- انخفاض ببطء الشريحة #2 حتى يخلق التوتر السطحي للسائل ختم بين المنطقتين متجمد الزجاج. ينبغي أن يكون هناك سائل ما يكفي لتغطية منطقة متجمد ولكن لا شيء ينبغي أن تتسرب خارج. إذا كان هو فيضان السائل، استخدام ماصة باستور سحبت لإزالة السائل الزائد.
- اضغط أسفل الشريحة (#1) في مكان يد واحدة واستخدام اليد الأخرى لتحريك الشريحة الأعلى (#2) ذهابا وإيابا في اتجاه أفقي، والحفاظ على مستوى الشريحة #2، ومعتمد على الشريحة #3. أداء تحت مجهر للتصور سهل تحركات البويضات والتقدم.
ملاحظة: هذه الحركة سوف تولد الاحتكاك وتسبب بويضات "رول" وتفقد تشوريونس بهم. ينبغي أن تستخدم الحد الأدنى من الضغوط والتحركات ينبغي أن تكون قصيرة وسريعة.
- بعد بضع حركات في الاتجاه الأفقي، قليلاً تغيير زاوية حركة (الشكل 4 باء). زيادات متعددة، تزيد تدريجيا هذه الزاوية إلى 90° حتى حركة الشريحة الأعلى (رقم 2) عمودي على اتجاه انطلاق (الشكل 4 باء). لاحظ أن تشوريونس الفارغة ستكون مرئية في السائل وسوف تظهر بويضات تفتقر إلى تشوريونس أطول وأرق.
- كرر الخطوات 4.3.3-4.3.4 حوالي 7-10 مرات حتى يصبح الحل غائم قليلاً. إيقاف المتداول عندما يبدو أن غالبية بويضات (75-85 في المائة) قد فقدت هذه الأغشية فيتيلين.
ملاحظة: وضع نهاية مدببة مميزة غالباً ما مرئياً على بويضات تفتقر إلى أغشية فيتيلين. فيتيلين الأغشية أكثر صعوبة لإزالة من تشوريونس. قد يتم تطبيق الضغط الخفيف إلى الشريحة الأعلى (الشريحة #2) حين المتداول لتحقيق إزالة الأغشية فيتيلين. في محاولة لإزالة الأغشية فيتيلين من جميع بويضات غالباً ما تسفر عن تدمير بويضات أخرى.
- بلطف رفع الشريحة الأعلى (رقم 2)، وسحب أحد أركانه إلى مركز المنطقة متجمد أسفل الشريحة (#1) حيث أن توالت بويضات تتراكم في وسط منطقة متجمد. كذلك طبق بويضات شطف من كل الشرائح مع ببسبتكس في الأعماق المحتوية على ببسبتكس.
- تنظيف الشرائح #1 و #2 مع الماء عالي النقاوة، الجافة مع مسح المتاح، وإعادة تعيين. كرر الخطوات 4.3.1-4.3.6 حتى قد تم إرجاع جميع بويضات من نفس النمط الوراثي. وهذا يتطلب عادة 3-4 جولات من المتداول في التركيب الوراثي.
-
إزالة الأنقاض بعد المتداول
- أضف 1 مل ببسبتكس إلى أنبوب مخروطي 15 مل. دوامة السائل معطف الجانبين من الأنبوب.
- استخدام ببسبتكس المغلفة P1000 ماصة تلميح، نقل بويضات تدحرجت من الأعماق طبق أيضا إلى أنبوب مخروطي الشكل يحتوي على 1 مل من ببسبتكس. إضافة مل 2 إضافية من ببسبتكس إلى الأنبوبة المخروطية التي تحتوي على بويضات.
- واسمحوا بويضات البدء في تسوية للأسفل، ثم إزالة الجزء العلوي 2 مل محلول يحتوي على الحطام (تشوريونس، فيتيلينيس، إلخ) مع P1000 وتجاهل. إذا لزم الأمر، إجراء الأنبوبة المخروطية على خلفية داكنة لمشاهدة بويضات معتمة كما أنها تغرق.
- إضافة مل 2 إضافية من ببسبتكس إلى بويضات، وكرر الخطوة 4.4.3. كرر 4.4.3. لما مجموعة 3 جولات لإزالة الأنقاض.
- استخدام ببسبتكس المغلفة P1000 ماصة تلميح، بويضات نقل مرة أخرى إلى الأصلي 500 ميليلتر [ميكروفوج] أنابيب. 20-25 الإناث ينبغي أن تسفر عن حوالي 50 ميليلتر من بويضات ناضجة توالت.
- تكرار المقطع 4 للأنماط الجينية المتبقية باستخدام الشرائح الطازجة متجمد وطبق تنظيف عميق جيدا وأنبوب مخروطي الشكل جديد لكل الوراثي.
- إذا كان من الضروري تخزين، نقل بويضات لبرنامج تلفزيوني 1 x 0.1% 100 تريتيونكس ومخزن بين عشية وضحاها في 4 درجات مئوية. لا ينصح بتخزين طويل الأجل لأنه يمكن عكس crosslinking فورمالدهايد بالمنظفات غير الأيونية.
5-الأسماك
ملاحظة: يتم تنفيذ يغسل جميع على نوتاتور في درجة حرارة الغرفة إلا إذا ذكر خلاف ذلك. بويضات قد تم توالت يستغرق وقتاً أطول لتسوية إلى الأسفل [ميكروفوج] أنابيب، لا سيما في الحلول التي تحتوي على ميثلامين. من المهم أن يكون المريض عند تغيير الحلول بحيث لا يتم فقدان بويضات في العملية. وهذا قد يتطلب الانتظار 5-15 دقيقة للسماح لبويضات تسوية بعد يشطف ويغسل. كما لاحظ أن بويضات في ميثلامين أقل معتمة.
-
معاملة استخراج ورناسي
- شطف بويضات مع 500 ميليلتر من برنامج تلفزيوني يحتوي على 1% Triton X-100 (ببستكس). إزالة السائل وإضافة 500 ميليلتر "استخراج المخزن المؤقت" (ببستكس التي تحتوي على رناسي). تبني على نوتاتور في درجة حرارة الغرفة ح 2.
-
يغسل التهجين قبل
- شطف بويضات 3 مرات مع 500 ميليلتر 2 × المالحة سترات الصوديوم الذي يحتوي على 20 توين (سكت). يسخن قاسمة (~ 500 ميليلتر/النمط الوراثي) 2 × سكت + ميثلامين 50% إلى 37 درجة مئوية.
تنبيه: ميثلامين السامة، وارتداء الحماية المناسبة.
- أغسل بويضات 3 مرات لكل 10 دقيقة في 500 ميليلتر 2 x SSCT. أغسل بويضات لمدة 10 دقائق في 500 ميليلتر 2 × سكة + ميثلامين 20%. أغسل بويضات لمدة 10 دقائق في 500 ميليلتر 2 × سكة + ميثلامين 40%. أغسل بويضات لمدة 10 دقائق في 500 ميليلتر 2 × سكة + ميثلامين 50%.
- إزالة السائل وإضافة 500 ميليلتر من 37 درجة مئوية 2 × سكة + ميثلامين 50% من الخطوة 5.2.1 العينة واحتضانها ح 2 في 37 درجة مئوية بالتناوب.
ملاحظة: يعمل فرن تهجين مجهزة دوار جيدا لهذا. يمكن استخدامها رغوة [ميكروفوج] أنابيب "تعويم" يعلق على محور دوار لتأمين الأنابيب.
-
تمسخ والتهجين
- لكل أنبوبة من بويضات، استخدام 40 ميليلتر من 1 x التهجين العازلة التي تحتوي على 2.5 نانوغرام/ميليلتر سينتروميريك التحقيق و 0.31 pmol فلور/ميليلتر من كل مسبار BAC. تعد حلاً للتحقيق في التهجين المخزن المؤقت كافية لجميع الأنماط الجينية. دوامة التحقيق مزيج 30 ثانية قبل إضافة.
- استخدام تلميح ماصة P200 المغلفة بجيش صرب البوسنة، نقل بويضات لأنبوب بكر 200 ميليلتر. الاحتفاظ بعينات في 37 درجة مئوية وتسوية بويضات السماح للأسفل، ثم استخدم ماصة باستور سحبت لإزالة السائل قدر الإمكان.
- إضافة 40 ميليلتر من التهجين محلول يحتوي على مسبار (أعد في القسم 2) لبويضات. ضع الأنبوب PCR التي تحتوي على بويضات في الجهاز بكر واحتضان كما يلي: 37 درجة مئوية لمدة 5 دقائق، 92 درجة مئوية لمدة 3 دقائق، ثم 37 درجة مئوية بين عشية وضحاها. بعد التحقيق إضافة إلى بويضات، الاحتفاظ بها في الظلام بقدر الإمكان.
-
يغسل بعد التهجين
- يسخن 2 × سكة + ميثلامين 50% إلى 37 درجة مئوية والاحتفاظ بها في الحاضنة التهجين. مع جيش صرب البوسنة المغلفة P200 "الماصة؛" تلميح، إضافة 100 ميليلتر من 37 درجة مئوية 2 × سكة + ميثلامين 50% إلى أنبوب بكر مع بويضات ونقل بويضات لأنبوب [ميكروفوج] جديدة 500 ميليلتر.
- إضافة ميليلتر 400 إضافية من 37 درجة مئوية 2 × سكة + ميثلامين 50% إلى نفس الأنبوب واسمحوا بويضات يستقر عند 37 درجة مئوية في الحاضنة.
ملاحظة: تسوية غالباً ما يستغرق وقتاً أطول في هذه الخطوة. ليس من غير المألوف أن يستغرق 15 دقيقة أو أكثر. انعدام الصبر سيؤدي إلى خسائر كبيرة من بويضات.
- أغسل بويضات 3 مرات لكل 20 دقيقة في 500 ميليلتر 37 درجة مئوية 2 × سكة + ميثلامين 50% عند 37 درجة مئوية بالتناوب. تبقى بويضات في 37 درجة مئوية في حين أنها تسوية.
- أغسل بويضات 3 مرات لكل 10 دقيقة في 500 ميليلتر 37 درجة مئوية 2 × سكة + ميثلامين 50% عند 37 درجة مئوية بالتناوب. تبقى بويضات في 37 درجة مئوية في حين أنها تسوية.
- في درجة حرارة الغرفة، تغسل بويضات لمدة 10 دقائق في 500 ميليلتر 2 × سكة + ميثلامين 40% في نوتاتور. أغسل بويضات لمدة 10 دقائق في 500 ميليلتر 2 × سكة + ميثلامين 20%. أغسل بويضات لمدة 10 دقائق في 500 ميليلتر 2 x SSCT.
-
وصمة عار مع DAPI
تنبيه: DAPI السامة، وارتداء الحماية المناسبة.
- أغسل بويضات لمدة 20 دقيقة في 500 ميليلتر DAPI الحل (1 ميكروغرام/مل) في 2 x SSCT على نوتاتور. شطف بويضات 3 مرات في 500 ميليلتر 2 x SSCT. أغسل بويضات 2 مرات لكل 10 دقيقة في 500 ميليلتر 2 x SSCT على نوتاتور. ويمكن تخزين عينات لما يصل إلى 4 س في درجة حرارة الغرفة في الظلام حتى أنهم على استعداد لجبل على كوفيرسليبس.
-
تصاعد
ملاحظة: انظر الشكل 3 للأدوات اللازمة.
- مكان بولي-L-يسين المغلفة ساترة تحت مجهر تشريح. إزالة السائل من أنبوب بويضات، ضبط الحجم الإجمالي لحوالي 150 ميليلتر. مع جيش صرب البوسنة المغلفة P200 نصيحة ماصة, ماصة صعودا وهبوطاً لتفريق بويضات طوال الحل، ومن ثم نقل 40 ميليلتر من بويضات/الحل إلى ساترة مغلفة بولي-L-يسين.
- قم بإزالة بعض من السائل من ساترة استخدام ماصة باستور سحبت حتى بويضات التمسك ساترة ولكن لا تزال محاطة بسائل. مع الملقط، اضغط باستمرار بكشف الغطاء عن جانب واحد واستخدام إبرة تنغستن لننأى بلطف بكتل من بويضات، نقلها إلى تحقيق طبقة واحدة من بويضات غير متداخلة.
- قم بإزالة ما تبقى السائل حول بويضات مع ماصة باستور سحبت. تأخذ شريحة زجاجية نظيفة واستخدام الغاز المضغوط لتفجير أي الغبار. إضافة 22 ميليلتر من تركيب وسائط (مثل، برولونج--الذهب) إلى منتصف الشريحة. انخفاض ببطء الانزلاق نحو ساترة، مع وسائل الإعلام المتزايدة التي تواجه العينة، حتى وسائل الإعلام يمس العينة. سوف يسبب التوتر السطحي ساترة الانضمام إلى الشريحة.
- وضع الشرائح في وعاء من بلاستيك مع غطاء ضيقة يحتوي على طبقة من ديسيكانت الطازجة (مثلاً، دريريتي). واسمحوا الشرائح جاف لمدة 3-5 أيام في الظلام قبل التصوير. وقت الجفاف قد تختلف تبعاً لدرجة رطوبة الغرفة.
6-التصوير
- عند إزالة الشرائح الجافة من مربع ديسيكانت، تنظيفها لإزالة أي جزيئات الغبار. ختم كوفيرسليبس بطلاء الأظافر. قد يتم تخزين الشرائح مختومة إلى أجل غير مسمى في-20 درجة مئوية.
- اكتساب الليزر مسح الصور [كنفوكل] استخدام هدفا نفط X 40 ارتفاع فتحه عددية مع 6 X التكبير الرقمي.
ملاحظة: من الناحية المثالية، برامج النظام سيسمح واحدة للبحث عن ووضع علامة على موقع س ص من الكروموسومات هو لبويضات متعددة أثناء عرضها باستخدام ابيفلوريسسينسي. هذه الإمكانية يوفر الوقت أثناء جلسة تصوير. السريع تبيض مع هدفا X ارتفاع فتحه عددية 60 التي قد تعمل استعماله غير مناسب مع النظام [كنفوكل] الذي تم اختياره، ولكن لأنظمة أخرى.
- التقاط سلسلة Z لكل البويضات، إعداد أعلى وأسفل السلسلة باستخدام إشارة DAPI.
ملاحظة: كسب، الإزاحة، وسوف تحتاج إلى طاقة الليزر يحدد تجريبيا باستخدام مجموعة فرعية بويضات. حالما يتم العثور على المعايير المناسبة، ينبغي بذل سوى تعديلات طفيفة.
إذا غيرت اكتساب إعدادات مطلوبة، واستخدام المكدس الصورة التي تم جمعها سابقا لتقدير التغييرات الضرورية. لتفادي تبييض، الامتناع عن التصوير ذراع المسبار مسبقاً قبل التقاط سلسلة Z. مع حجم خطوة 0.25 ميكرومتر، سلسلة Z عادة تتراوح بين 25 30 الخطوات تبعاً لاتجاه والموضع من الكروموسومات. حجم أصغر لخطوة قد يحسن قدرة المرء على تقييم ما إذا كان يتم فصل الأسماك المكانين في البعد المحوري، ولكن هناك مفاضلة مع الوقت المطلوب لالتقاط أصغر الخطوات وفقدان كثافة إشارة بسبب تبيض. هدف العاشر 40 مع 6 × زوم رقمي، وحقل صورة 1,024 × 512 ينشئ صور بحجم بكسل من 0.05 ميكرومتر.
7-صورة التحليل والتهديف لعيوب التماسك
- ديكونفولفي سلسلة Z لتحسين إشارة إلى نسبة الضوضاء لكل البويضات19.
ملاحظة: مجموعة من برامج مثل تلك المحددة في الجدول المواد يسمح أحد ديكونفولفي باستخدام استعادة التكاملية، فضلا عن المحاصيل والتباين-تعزيز الصور. الأهم من ذلك، لا بد من مجموعة من برامج التي يسمح أحد لمشاهدة الصور ونقاط لعيوب التماسك في ثلاثة أبعاد.
- لكل البويضات، جدولة عدد الذراع والبؤر سينتروميريك التي كولوكاليزي مع إشارة DAPI. ويؤدي فقدان التماسك ثلاث أو أربع إشارات مميزة والمنفصلين عن ذويهم لإجراء تحقيق معين. فإنه ليس من غير المألوف لمراقبة اثنين من البؤر التي ترتبط بخيط رفيع. بالمعايير الأكثر صرامة، هذه البؤر لا يعتبر "فصل".