على الرغم من المزايا التي تتيحها بيوكاتاليسيس، تكامل الخطوات بيوكاتاليتيك في المسارات الاصطناعية أو مجموع طرق بيوكاتاليتيك يظل معظمها يقتصر على القرارات الحركية الانزيمية. تستخدم هذه الطرق على نطاق واسع كخطوة أولى في توليف الكيماوي الانزيمية غير متماثلة، ولكن بيوكاتاليسيس يوفر العديد من الإمكانيات أكثر في المجموعة الوظيفية إينتيركونفيرسيونس مع ستيريوسيليكتيفيتي عالية1،2،3 . وعلاوة على ذلك، كردود فعل بيوكاتاليتيك تجري في ظروف مماثلة، أنه من الممكن ولذلك القيام بسلسلة من ردود الفعل في وعاء واحد أزياء4،5.
مراوان الكحوليات الأمينية جزيئات تنوعاً للاستخدام كمساعدين أو السقالات في توليف العضوية6. كثيرا ما يتم العثور على مجموعة الأمينية الكحول في نواتج الأيض الثانوية والمكونات الصيدلانية الفعالة (API). كحول β الأمينية الأساسية متوفرة بسهولة من الأحماض الأمينية α المقابلة بالتوليف الكيميائي التقليدية، ولكن الوصول إلى كحول γ الأمينية مراوان أو الكحوليات الأمينية الثانوية يتطلب في أغلب الأحيان مملة المسارات الاصطناعية جنبا إلى جنب مع الحساسة مراقبة الفراغية7،،من89،10. نظراً لأن ستيريوسيليكتيفيتي عالية، بيوكاتاليسيس قد توفر طريقا اصطناعية متفوقة على هذه اللبنات مراوان11،12،،من1314.
نحن سابقا عنها التوليف من مونو-ودي-هيدروكسي-L-ليسينيس دياستيريوسيليكتيفي هيدروكسيليشن الانزيمية تحفزها ديوكسيجيناسيس الحديد (II)/α-كيتواسيد-تعتمد على الأسرة أوكسيجيناسي (αKAO) (الشكل 1)15. على وجه الخصوص، بدءاً من L-يسين، ديوكسيجيناسي KDO1 يحفز التشكيل (ق3)-هيدروكسي مشتقة من (1)، بينما (ص4)-يتشكل مشتق (2) برد فعل مع ديوكسيجيناسي KDO2. هيدروكسيليشنز ريجيوديفيرجينت المتعاقبة ب KDO1 و KDO2 يؤدي إلى التشكيل (3ص،ص4)-ديهيدروكسي-L-يسين (3) في شكل نقي بصريا. ومع ذلك، يعوق الركازة محدودية نطاق هذه الإنزيمات الاستفادة منها كبيرة في التوليف الكيميائي، خاصة في هيدروكسيليشن الأمينات البسيطة، كما ضروري لنشاط16مجموعة حمض الكربوكسيلية في α-موقف المجموعة الأمينية.

رقم 1: تحويلات بيوكاتاليتيك من L-يسين- تحويل (3ق)-هيدروكسي-L-يسين (1) تحفزها ديوكسيجيناسي KDO1؛ (4ص)-هيدروكسي-L-يسين (2) تحفزها ديوكسيجيناسي KDO2؛ و (3ص،ص4)-ديهيدروكسي-L-يسين (3) فعل تتالي تحفزها تباعا ديوكسيجيناسيس KDO1 و KDO2. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
إزالة رد فعل مشترك في الأيض17. على وجه الخصوص، الأحماض الأمينية DCs (EC 4.1.1) هي خالية من مساعد (بيروفويل-التابعة) أو الإنزيمات تعتمد على حزب العمال التقدمي، وتحفيز إزالة الأحماض الأمينية إلى بوليامينيس المقابلة في البكتيريا والكائنات أعلى18،19 , 20 , 21 , 22-مونو-وديهيدروكسي المركبات (الشكل 3) 4–7، 10–11 تناظر الهيدروكسيلية كادافيريني، ديامينى التي حصل عليها إزالة L-يسين. كادافيريني لبنة أساسية للصناعة الكيميائية، وعلى وجه التحديد مكون بوليمرات البولي أميد والبولي. ولذلك، الإنتاج القائم على السيرة الذاتية لهذا ديامينى من الموارد المتجددة جذبت الاهتمام كبديل للمسار القائم على النفط، والكائنات الحية الدقيقة المختلفة وقد تم تصميمها لهذا الغرض. في هذه المسارات الأيضية، يسين DC (أقل البلدان نمواً) هو إنزيم الرئيسية. أقل البلدان نمواً إنزيم تعتمد على حزب العمال التقدمي المنتمين إلى ألانين راسيماسي (ع) هيكلية الأسرة23. حزب العمال التقدمي-تعتمد على وحدات تحكم المجال Dc (حزب العمال التقدمي-DCs) معروفة لتكون الركيزة الخاصة بدرجة عالية. ومع ذلك، تملك الإنزيمات قليلة القدرة على المجون طفيف، بنشاط نحو L ornithine و L-يسين من الأحماض الأمينية، كما على سبيل المثال أقل البلدان نمواً من روميرانتيوم سيلينوموناس (سروممن أقل البلدان نمواً)، الذي لديه ثوابت الحركية مماثلة ل يسين و ornithine إزالة24،25. هذه الركيزة الموسعة خصوصية يجعل هذا الإنزيم مرشح جيد لإزالة من مونو-ودي-هيدروكسي-L-يسين. وبالإضافة إلى ذلك، للبحث عن وحدات تحكم المجال Dc النشطة نحو مشتقات جذور الهيدروكسيل ليسين، قمنا بدراسة سياق الجينوم الجينات ترميز الإنزيمات αKAO. وفي الواقع، في جينومات بدائية الجينات ترميز الإنزيمات المشاركة في نفس مسار السكروز هي عموما شارك مترجمة في مجموعات الجينات. تم العثور على الجين KDO2 (من بينينسيس تشيتينوفاجا) المترجمة يشترك مع أحد جينات ترميز المفترضة حزب العمال التقدمي-DC (الشكل 2). وفي المقابل، لا ترميز الجينات للعاصمة قد وجد عند تحليل سياق المجينية ديوكسيجيناسي KDO1. ولذلك اختير البروتين حزب العمال التقدمي-العاصمة من بينينسيس جيم (DCCpin) كمرشح واعدة لتحفيز هذه الخطوة إزالة من رد فعل تتالي.

رقم 2: سياق المجينية جين KDO2 في بينينسيس جيم-- الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
ونتيجة لذلك، قمنا بتصميم تتالي الانزيمية ردود الفعل التي تنطوي على ديوكسيجيناسيس ووحدات تحكم المجال Dc لتحقيق توليف كحول الاليفاتيه مراوان β و γ-الأمينية من الأحماض الأمينية (الشكل 3). وكما ذكر سابقا، يدخل أكسدة ج-ح تحفزها αKAO مركز ستيريوجينيك هيدروكسي استبداله مع مجموع دياستيريوسيليكتيفيتي؛ سيتم الاحتفاظ عدم التطابق Cβ/γ في الخطوة ديكاربوكسيلاتيفي، الذي يؤثر فقط على الكربون Cα من مجموعة من الأحماض الأمينية16.

رقم 3: تحليل ريتروسينثيتيك- ريتروسينثيسيس (A) من الكحوليات الأمينية β و γ (R)-1، 5-ديامينوبينتان-2-ol (4) من (5ص)-هيدروكسي-L-يسين، وديامينوبينتان (S)-1، 5--2-الرتب الأخرى (5) و 1، 5-ديامينوبينتان-3-الرتب الأخرى (6) من L-يسين. (ب) ريتروسينثيسيس β، γ-وبيتا، δ الأمينية ديولس (2ق، 3S)-1، 5-ديامينوبينتاني-2، 3-ديول (10) و (2ص، 4S) ديامينوبينتاني-1، 5--2، 4-ديول (11) بدءاً من (5ص)- هيدروكسي-L-يسين، و (2ص، 3R) ديامينوبينتاني-1، 5--2، 3-ديول (7) بدءاً من L-يسين. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
بدءاً من L-يسين وبه (ص5)-مشتق هيدروكسي، نحن تقرير هنا اثنين/ثلاثة الخطوة، وعاء واحد، الإجراء الانزيمية الجمع بين ديوكسيجيناسيس ووحدات تحكم المجال Dc--حزب العمال التقدمي للحصول على الهدف الكحوليات الأمينية. قبل تركيب على نطاق المختبر من الجزيئات المستهدفة، طور الأسلوب في جدول تحليلي لضبط شروط رد فعل، مثلاً، وتركيزات الإنزيم، المطلوبة للسماح للتحويل الكامل لانطلاق المواد؛ أننا نقدم هذا الإجراء أيضا.