هنا توضح لنا كيف جزيء واحد التعريب تنشيط صور مجهرية يمكن الاضطلاع على المحطة الطرفية الأعصاب الحركية ليعيش melanogaster المورفولوجية الثالثة instar اليرقة.
مقالة منهجية
هنا توضح لنا كيف جزيء واحد التعريب تنشيط صور مجهرية يمكن الاضطلاع على المحطة الطرفية الأعصاب الحركية ليعيش melanogaster المورفولوجية الثالثة instar اليرقة.
عدد متزايد من تقنيات مجهرية فائقة القرار تساعد على الكشف عن الآليات التي تحكم العالم النانوي الخلوي. تصوير جزيء واحد تكتسب زخما لأنه يوفر الوصول الاستثنائي إلى تصور الجزيئات الفردية في الخلايا الحية. هنا، يمكننا وصف أسلوب الذي قمنا بتطوير أداء تتبع الجسيمات أحادية المنشط صور التعريب مجهرية (سبتبالم) في اليرقات المورفولوجية . الاتصالات متشابك يعتمد على البروتينات بريسينابتيك الرئيسية التي تعمل بالارساء، فتيلة، وتعزيز الانصهار التي تحتوي على ناقل عصبي حويصلات مع غشاء البلازما. مجموعة من تفاعلات البروتين البروتين والدهن البروتين محكم ينظم هذه العمليات والبروتينات بريسينابتيك ولذلك يحمل تغييرات في الحركة المرتبطة بكل من هذه الأحداث الرئيسية. التحقيق في كيفية التنقل من هذه البروتينات يرتبط بوظيفتها الفسيولوجية في الحيوانات حية سليمة أمر ضروري لفهم هذه الآلية الدقيقة للعمل. استخراج البروتين التنقل مع دقة عالية في فيفو يتطلب التغلب على قيود مثل الشفافية الضوئية، وإمكانية الوصول، وعمق الاختراق. يصف لنا كيف instar البروتينات الفلورية فوتوكونفيرتيبلي معلم للبروتين بريسينابتيك سينتاكسين-1A يمكن تصور عبر الإضاءة المائلة طفيف وتعقبها في المحطة الطرفية الأعصاب الحركية أو على طول إكسون العصبون الثالثة المورفولوجية يرقة.
الاتصالات العصبية تعتمد على إطلاق سراح العصبي، الذي يحدث من خلال التنظيم الانصهار التي تحتوي على ناقل عصبي حويصلات متشابك مع غشاء البلازما1. هذه العملية تسمى الرقابة2،،من34،،من56 ديناميكية للغاية ويمكن أن تنظم أعلى أو أسفل وفقا للتقلبات في معدل التحفيز7. البروتينات المشاركة في هذه العمليات تخضع البراونية، وعرض ذلك نانومترى منظمة قادرة على الحفاظ على طائفة من ربط الإجراءات التي ترتكز عليها هذه الوظائف الفسيولوجية. بروتينات الغشاء البلازما ديناميكية للغاية، السماح بالتراكب الجانبي الجزيئات في nanoclusters على غشاء البلازما7،،من89،10،11، 12. على هذا النحو، التحقيق في التنقل من هذه البروتينات تساعد على توضيح طريقة العمل8. البروتينات متشابك مثل قابل للذوبان اثيلماليميدي ن العوامل الحساسة مرفق البروتين مستقبلات (الافخاخ)، على سبيل المثال سينتاكسين-1A، من المعروف الآن أن يحمل التنقل الأفقي السريع، فضلا عن الوحشي الملائمة داخل nanoclusters التي قد تخدم الجزيئية مستودعات ومواقع لحويصلة الانصهار9،13،،من1415.
التطور الأخير للبروتينات الفلورية فوتوكونفيرتيبلي، مثل أحادي (m) ايوس16،17 و18من كايد، سمح القرار نانومترى البروتينات غشاء البلازما الخلايا العصبية عن طريق استخدام نهج هذه كالتعريب تنشيط صور مجهرية (النخيل) والتعمير البصرية العشوائية مجهرية (العاصفة)14،،من1519. وقد مكنت هذه التطورات التحقيقات في التنقل ونانوكلوستيرينج من البروتينات البيولوجية في استزراع الخلايا الحية والخلايا العصبية. في الآونة الأخيرة، وقد أجريت دراسات توضيح (بدقة عالية مماثلة) ديناميات وتنظيم هذه البروتينات الغشاء في الخلايا العصبية للكائنات الحية سليمة مثل موس موسكولوس، ايليجانس كاينورهابديتيس، و Melanogaster المورفولوجية14،20،،من2122.
التحقيق لمنظمة البروتين في الجسم الحي وديناميات يتطلب ليس فقط استخدام أدوات التصوير المتقدمة مؤخرا القرار فائقة (مثل النخيل، والعواصف، وفوتوكونفيرتيبلي فلوروفوريس)، ولكن أيضا القدرة على التغلب على العوائق مثل هذه كإمكانية الحصول على البروتين، وعمق تغلغل الليزر التصوير. التصوير البروتينات داخل الخلية في حيوان سليمة أصلاً صعبة كما التصوير البروتينات في هياكل مضمن عميقة داخل الأنسجة الحية للحيوان سليمة، مثل الحصين الماوس سليمة. ومن ثم فهي أكثر سهولة تصويرها البروتينات في أو بالقرب من سطح الأنسجة. وهناك صعوبة أخرى مع التصوير في فيفو ضمان إمكانية تكرار نتائج عبر الحيوانات. كما التشريح قد تختلف عن عينة واحدة إلى أخرى، تحديد هيكل بسهولة من النسخ المتماثل في مختلف العينات الحيوانية سليمة يمكن أن يكون أيضا تحديا. استخدام الهياكل النمطية، مثل synapses، والمساعدة في التغلب على بعض هذه الصعوبات.
الدراسات التي أجريت مؤخرا قد تصويرها التنقل البروتين في الحيوانات مع البشرة شفافة بصريا مثل ايليجانس كاينورهابديتيس22، بينما التحقيقات الأخرى يكون تصويرها المنظمة البروتين على السطح النسيج/الجهاز، على سبيل المثال تصوير أكتين في الخلايا العصبية القشرية عن طريق الجمجمة الماوس يعيش21. وفي بعض الحالات، استخدمت المسكنات لإبقاء الحيوان متحرك؛ ومع ذلك، المسكنات محددة قد تؤثر سلبا على بروتين الفائدة. ولذلك ينبغي استكشاف وسائل بديلة للحفاظ على الحيوانات غير متحرك خلال في فيفو تصوير للتقليل من الأخطاء.
تحذير آخر للقرار فائقة التصوير في فيفو هو أن الليزر المستخدمة لإلقاء الضوء على بروتينات الفائدة يمكن أن تؤثر سلبا على الأنسجة المحيطة، ويوصي بحفظ ومن ثم شدة الإثارة منخفضة قدر الإمكان. إضاءة الأنسجة المحيطة بالليزر يميل أيضا إلى زيادة الإشارات الخلفية. استخدام الإثارة منخفض الكثافة يساعد في الحد من الخلفية، والتحذير بأنه يمكن أن يؤدي أيضا إلى انخفاض في العائد فوتون بروتين فلوري. الطرح الخلفية أثناء التحليل يمكن أن تستخدم كوسيلة بديلة لتقليل الإشارات الخلفية قبل تحليل الصور.
المورفولوجية يعرض الكائن حي مثالي للتصوير في فيفو كما أنه يوفر الأدوات الوراثية الراسخة لتحقيق وظيفة البروتين محددة. تسلسل تفعيل المنبع (UAS)-Gal4 نظام يتيح التعبير الزماني والمكاني للبروتينات، وذلك يمكن استخدامها للتعامل مع23من كبيرة، حيث أن التحفيز الحراري الجينية المورفولوجية عابر باستخدام الأسرة الفرعية المحتملة مستقبلات A1 (dTRPA1)24 أو علم البصريات الوراثية التحفيز باستخدام كشريمسون فر تحول ريد25 يمكن أن تكون جنبا إلى جنب مع التصوير14. أننا تغلبنا على العديد من المضاعفات الناجمة عن أداء في فيفو تصوير جزيء وحيدة في هذا النظام والآن تصف كيف يمكن القيام تتبع الجسيمات أحادية في يرقات الطور الثالث melanogaster المورفولوجية .
1-تصميم المعدلة وراثيا المورفولوجية معربا عن البروتينات معلم mEos2
2-تشريح ليرقة الطور الثالث
3-قليلاً منحرف إضاءة مجهرية تتبع الجسيمات أحادية
4-واحد جزيء التعريب في اليرقات الثابتة
استخدام البروتوكول المعدلة وراثيا المدرجة أعلاه، سينتاكسين--1A--mEos2 دروسوفيلاميلانوجاستير وقد تم إنشاؤها (الشكل 1). المعدلة وراثيا وثالثاً instar المورفولوجية تم تشريح اليرقات على قاعدة أسطوانية PDMS (الشكل 2A-F). تصور الجزيئات واحدة من سينتاكسين-1A، استخدمنا النخيل في مجهر TIRF مع إضاءة الليزر منحرف قليلاً14.
تم تعقب الجزيئات واحدة من سينتاكسين-1A على المحطات presynaptic الأعصاب الحركية في العضلات 6 الجزء الثاني المتعلق بالبطن. يمكن أن يتم الكشف عن الفلورية الخضراء من mEos2 كما هو موضح بالصورة ذات الدقة المنخفضة من سينتاكسين--1A--mEos2 على النوع 1b boutons عندما متحمس باستخدام الليزر 488 نانومتر (الشكل 3A). في تجارب التصوير، 405 شمال البحر الأبيض المتوسط وشمال البحر الأبيض المتوسط 561 الإثارة الليزر تصوير أعماق كانت 133.5 نانومتر و 165.6 شمال البحر الأبيض المتوسط، على التوالي. تم اقتناء الصورة الخضراء كمتوسط 16 الإطارات الفردية. واستخدمت هذه الصورة الخضراء لإنشاء المنطقة للفائدة التي تستخدم للحد من تحليل لتعريب في الفيلم فوتوكونفيرتيد للمحطات الطرفية الأعصاب presynaptic السيارات وحدها.
تحليل الأفلام سبتبالم فوتوكونفيرتيد المكتسبة المتولدة كثافة فائقة حلها، معامل الانتشار، وخرائط مسار (الشكل 3A). كذلك كان كمياً التنقل سينتاكسين--1A--mEos2 بتحليل لمتوسط مربع تشريد (MSD) المسارات الفردية (الشكل 3B). مقارنات إحصائية يمكن أن يتم استخدام المنطقة تحت المنحنى MSD (الشكل 3B). المزيد من التحليل للتنقل غلة توزيع معامل نشر سينتاكسين--1A--mEos2، وهذا يمكن تقييمها إحصائيا بالمقارنة للهاتف النقال إلى السكان غير متحركة (الشكل 3).

الشكل 1 : إنشاء بنيات معلم mEos2. PFL44S-أتتب-الإشراف-w + ناقلات هو خطيا مع بامهي وإكسباي. الأجزاء المتداخلة تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) ترميز بروتين الاهتمام (POI) و mEos2، على التوالي، يمكن استنساخ، على سبيل المثال، في فيفو جزئ في ura3- خلايا الخميرة أو الجمعية جيبسون. ملاحظة أننا المستنسخة لتوليد التحوير سينتاكسين--1A--mEos2، في بناء محاط بتسلسل منظم والمنهي سينتاكسين-1A الذاتية. يمكن بعد ذلك حقن بناء الناتجة عن الأجنة المورفولوجية لإنشاء خط الطيران المعدلة وراثيا معربا عن بروتين الاهتمام (POI) تنصهر فيها mEos2. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-

الشكل 2 : المورفولوجية يرقة تسلخ والإضاءة المائلة. (أ) مخطط عرض المورفولوجية يرقة تسلخ تجري على قاعدة PDMS نصف أسطواني. يرقة شرائح قد احتفظوا PDMS هلام باستخدام دبابيس مينوتين. (ب-ج) وضعت الإعدادية PDMS اليرقة داخل طبق ثقافة زجاجية تحتوي على متوسط حشرة شنايدر. استخدمت مجهر TIRF في تكوين إضاءة منحرف قليلاً تصور سينتاكسين--1A--mEos2 في المحطات الطرفية الأعصاب الحركية. (د-F) قاعدة PDMS نصف أسطواني مع تشريح المورفولوجية اليرقة. إعداد يرقة-PDMS وضعت في طبق تصوير مليئة المتوسطة شنايدر، واليرقه تم تصويرها في المجهر النخيل القرار فائقة. مقياس بار، 10 مم-(تم تعديل هذا الرقم من14). الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-

الشكل 3 : في فيفو تتبع من mEos2-سينتاكسين-1A في الأعصاب الحركية presynaptic المحطة الطرفية. (A) A منخفضة الدقة TIRF صورة سينتاكسين--1A--mEos2 على نوع 1b موتور الأعصاب طرفية. تحليل لأفلام فوتوكونفيرسيون تصويرها في 33 هرتز ولدت سبتبالم حل فائقة الكثافة ومعامل نشر، ومسار الخرائط. وكانت المسارات الفردية 5,309 المصورة اقتناء الفيلم إطارات أكثر 16,000. مقياس بار، 3 ميكرومتر. (ب-ج) كان رسم ساحة يعني تشريد (MSD) سينتاكسين--1A--mEos2 من 6 محطات الأعصاب الحركية المختلفة؛ استخدمت المنطقة تحت منحنى MSD (AUC) لقياس مستوى التنقل. ويكشف توزيع معامل نشر متحركة وغير متحركة من السكان سينتاكسين-1A التي يمكن قياسها كمياً كنسب من بعضها البعض؛ تم الحصول على متوسط مسارات ~ 2,400 كل السيارات الأعصاب الطرفية (n = 3 اليرقات). البيانات المعروضة كمتوسط الخطأ المعياري للوسط. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
ويصف هذا البروتوكول تتبع جزيء واحد من البروتينات معلم mEos2 عند تقاطع العضلية اليرقة الطور الثالث المورفولوجية . لتجنب التعبير المفرط للبروتين المحورة وراثيا، كان يقودها التعبير سينتاكسين-1A-mEos2 الذاتية سينتاكسين-1A المروج. الدراسات المتعلقة بالتنقل البروتين متشابك معظمها كانت محدودة للتحقيقات في المختبر من استزراع الخلايا والخلايا العصبية القشرية9،11،،من1213. ما إذا كانت هذه البروتينات يحمل تواقيع التنقل مماثلة في الحيوانات حية غير معروف إلى حد كبير. تصور التنقل البروتين وحيد في فيفو، لها قيود مثل العمق الضوئي الشفافية، وإمكانية الوصول، وتغلغل يتعين التغلب عليها. تشريح إعداد اليرقات وتصور الوصلات العصبية العضلية مضمن على سطح العضلات، علينا أن نتجنب مسألة الشفافية الضوئية وسهولة الوصول إليها. باءت بالفشل محاولات صورة جزيء واحد التنقل في التكوين TIRF العادية. ومع ذلك، يتيح استخدام الإضاءة منحرف قليلاً لزيادة الإثارة الليزر اختراق العمق. وعلاوة على ذلك، ساعد مينوتين دبابيس تستخدم لشل اليرقة لتجنب أي أثر سلبي ممكن استعمال مخدر على التنقل البروتين. من الممكن استخدام أعلى التكبير الأهداف، مثل 100 × أهداف الغمر النفط، إلى تصور جزيئات مفردة في فيفو. ومع ذلك، قد يزيد التكبير زيادة حدوث الانجرافات خارج التركيز. وبالإضافة إلى ذلك، لدينا وتستخدم كثافة أقل (~ 30%) 561 نانومتر الليزر بنجاح إلى جزيئات صورة واحدة في محطات الأعصاب الحركية. قد يلزم إجراء اختبارات إضافية لاستخدام طاقة الليزر أقل.
هذا البروتوكول مناسبة لتصور تنقل البروتينات متشابك داخل بقرب غشاء البلازما الخلايا العصبية. باستخدام هذا النهج، كانت تنقل البروتين الفخ-سينتاكسين-1A وأوتوفاجوسومي ملزمة البروتين Atg18a-14،بنجاح المصورة فيفو في26. تنقل البروتينات في الخلايا العصبية الحركية ويمكن أيضا أن تكون محاور عصبية التحقيق27. ومع ذلك، قد يصعب التحقيق في تنقل البروتينات في الدماغ أو الحبل البطني العصب لتقييم سبب إشارة خلفية عالية تنتجها الأنسجة الكامنة؛ وباﻹضافة إلى ذلك، تصور التنقل البروتين في نفس بنية الدماغ سوف يتطلب فلوريسسينتلي علامات بنية الدماغ (لضمان قابليتها للتكرار)، ويتطلب الاستخدام المزدوج-كاميرا التصوير.
الأساليب الحالية المتاحة للفحص المجهري القرار فائقة في المورفولوجية معظمها يقتصر على تصوير الأجنة، بدلاً من الأكثر نمواً يرقة الطور الثالث38،39. المشكلة الرئيسية مع هذه البروتوكولات هو أنها تسفر عن عدد قليل من المسارات في منطقة تصويرها، وبالتالي الحيلولة دون إجراء تحليل متعمق لتنقل الدول22،40. لدينا في فيفو جزيء واحد تتبع بروتوكول لديه القدرة على توليد عدد كبير من المسارات، ولذلك يمكن أن تستخدم في نماذج حيوانية أخرى مثل كاينورهابيديتيس ايليجانس والزرد. وفي الواقع، ولدت كل سلسلة NMJ مسارات ~ 2,400 يجعلها مناسبة لتحليل مختلف الدول المتنقلة والتحولات بين هذه الدول14،27. بالإضافة إلى ذلك، في فيفو جزيء واحد التصوير استراتيجيات كثيرة تعتمد على استخدام المسكنات شل الحيوانات20،22، الذي قد يغير الوظيفة الفسيولوجية التي يتم التصوير. هنا نحن الأمثل على بروتوكول 'خالية من التخدير' لشل اليرقات باستخدام دبابيس مينوتين.
قد يكون احتمال استخدام هذا البروتوكول لتصور تنقل البروتينات في ثلاثة أبعاد. التقدم الذي أحرز مؤخرا في مجهرية فائقة القرار السماح بالتنقل البروتين تصور في المختبر في 'x'، 'نعم'، و 'z' أبعاد41،42. غير حساب أسلوبنا الحالي لتنقل البروتينات في محور 'z'. بعد المورفولوجية موتور الأعصاب الطرفية هيكل كروي وسيكون نهج مستقبل قيماً تحديد كمية البروتين التنقل في حجم ثلاثي الأبعاد43. من الممكن تصوير في z-البعد باستخدام عدسة أستيجماتيك. بدلاً من ذلك، في وضع TIRF44،45، كما يتم زيادة z-القرار. ومع ذلك، في تجاربنا، استخدمنا الإضاءة منحرف قليلاً تصور الجزيئات واحدة من syntaxin1A-mEos2 دون عدسة أستيجماتيك.
وفي الختام، معلم توافر كلا المعدلة وراثيا المورفولوجية ذبابة الأوراق المالية معربا عن البروتينات مع بروتين فوتوكونفيرتيبلي، PDMS قاعدة تشريح اليرقة المحورة وراثيا، فضلا عن مجهر TIRF مزودة بإمكانية تغيير زاوية الإضاءة هي أهم الأدوات اللازمة لتصور البروتينات واحد كما هو موضح في هذا البروتوكول.
الكتاب ليس لها علاقة بالكشف عن.
ونشكر سبارتا جان-باتيست وشوكت دانيال (المعهد، يزار التابع لجامعة بوردو) على دعمهم الكريم مع تحليل جزيء واحد. ونشكر خصوصا بالماس نك وجيسيكا مكجاو (QBI، جامعة كوينز لاند) لمساعدتهم مع الفيديو تسجيل التعليق الصوتي، فضلا عن الشكل تصميم الرسوم البيانية. هذا العمل كان يدعمها المشروع اكتشاف مجلس البحوث الأسترالية (ع) (DP170100125 إلى F.A.M.)، "مجلس البحوث الأسترالي" (LE0882864 منحة بشرية إلى F.A.M.)، "مستقبل الزمالة" (FT100100725 إلى B.V.S.)، "مجلس البحوث الأسترالية" (منحة بشرية LE130100078 إلى F.A.M). ومنح "تمويل المشروع" (APP1103923 إلى B.V.S.). F.A.M. وهو زميل أبحاث كبار NHMRC (ONT1060075).
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| PDMS (مجموعة المطاط الصناعي السيليكوني Sylgard 184) | Dow Corning Corporation | 000000000001064291 | |
| طبق ثقافة ذو قاع زجاجي | في المختبر Scientific | D29-20-1.5-N | |
| مجهر ستيريو بصري | أوليمبوس | SZ51 | |
| ملاقط منحنية (نمط 5/45) | علوم المجهر الإلكتروني | 0208-5AC-PO | |
| دبابيس دقيقة (0.1 مم) | أدوات العلوم الدقيقة | 26002-10 | |
| حشرة شنايدر متوسطة | سيجما ، علوم الحياة | S0146 | |
| Vannas مقص الربيع | أدوات العلوم | الدقيقة 15000-00 | |
| ملقط ناعم (دومون # 5) | أدوات العلوم الدقيقة | 11254-20 | |
| ELYRA PS.1 مجهر | زايس | PS.1 | |
| محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS) | Lonza | 17-515Q | |
| Paraformaldehyde (16٪) | علوم المجهر الإلكتروني | 15710 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T-9284 | |
| مصل الماعز العادي | Sigma-Aldrich | G9023 | |
| Maxyclear Snaplock أنبوب الطرد المركزي الدقيق (1.7 مل) | الاستحواذ Axygen | MCT-175-C | |
| Zen Black | Carl Zeiss، 2012 | ||
| برنامج Metamorph | الأجهزة الجزيئية | 7.7.8 | PALM Tracer Plugin |
| Fly strain | w1118< / sup> ؛ HA-Sx1A-mEos2 |