هنا، نحن تقرير فضية بسيطة ومنخفضة التكلفة تلطيخ البروتوكول الذي يتطلب سوى ثلاثة من الكواشف ودقيقة 7 من تجهيز، وهو مناسبة لتوليد سريعة عالية الجودة الاشتراكية السوفياتية البيانات في التحليل الجيني.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
* These authors contributed equally
هنا، نحن تقرير فضية بسيطة ومنخفضة التكلفة تلطيخ البروتوكول الذي يتطلب سوى ثلاثة من الكواشف ودقيقة 7 من تجهيز، وهو مناسبة لتوليد سريعة عالية الجودة الاشتراكية السوفياتية البيانات في التحليل الجيني.
تكرار تسلسل بسيط (SSR) واحد من العلامات الأكثر فعالية استخدامها في البحوث الجينية النباتية والحيوانية وبرامج التربية الجزيئية. تلوين الفضة أسلوب مستخدمة على نطاق واسع للكشف عن علامات الاشتراكية السوفياتية في جل بولياكريلاميدي. ومع ذلك، البروتوكولات التقليدية لتلطيخ الفضية من الناحية التقنية شاقة وتستغرق وقتاً طويلاً. مثل العديد من المختبرات البيولوجية الأخرى تم التقنيات، والفضة تلطيخ البروتوكولات اطراد الأمثل لتحسين كفاءة الكشف. هنا، نحن تقرير فضية مبسطة تلطيخ الأسلوب الذي يقلل تكاليف الكاشف إلى حد كبير ويعزز وضوح القرار وصورة كشف. يتطلب الأسلوب الجديد الكواشف الثلاثة (نترات الفضة, هيدروكسيد الصوديوم وفورمالدهايد)، خطوتين رئيسيتين (التشريب والتنمية) وفقط 7 دقائق لتجهيز لجل polyacrylamide غير يشوه. بالمقارنة مع بروتوكولات سبق الإبلاغ عنها، هذا الأسلوب الجديد هو أسهل وأسرع ويستخدم أقل من الكواشف الكيميائية للكشف عن إصلاح قطاع الأمن. ولذلك، سيستفيد هذا فضية بسيطة ومنخفضة التكلفة وفعالة تلطيخ البروتوكول بمساعدة الواسمات تربية قبل جيل سريعة لإصلاح قطاع الأمن علامة البيانات ورسم الخرائط الجينية.
وضع علامات على أساس بكر قد أحدث ثورة في علم الوراثة النباتية وتربية1. ومن علامات (SSR) تكرار تسلسل بسيط بين علامات الحمض النووي الأكثر شيوعاً والأكثر تنوعاً. تغطية الجينوم واسعة ووفرة وخصوصية الجينوم، والتكرار بعض الأسس الموضوعية لعلامات الاشتراكية السوفياتية بالإضافة إلى الإرث كودومينانت للكشف عن الأنماط الجينية متخالف2. واستخدمت عدة دراسات علامات الاشتراكية السوفياتية للتحقيق في التنوع الوراثي وتتبع النسب وبناء خرائط الربط الجينية ورسم خريطة للجينات للسمات الهامة اقتصاديا3،4.
يتم فصل منتجات PCR علامات الاشتراكية السوفياتية يشيع استخدام التفريد [اغروس] أو هلام polyacrylamide وتصور مع تلطيخ الفضة أو تحت ضوء الأشعة فوق البنفسجية ثم بعد تلطيخ مع اثيديوم بروميد. تلوين الفضة لشظايا من الحمض النووي في الهلام بولياكريلاميدي هو أكثر حساسية من غيرها المصبوغة أساليب5،6 وقد استخدمت على نطاق واسع للكشف عن شظايا من الحمض النووي مثل الاشتراكية السوفياتية علامات7.
مثل العديد من تقنيات المختبرات البيولوجية، تلطيخ الفضة من المواد الهلامية polyacrylamide تحسنا مطردا منذ، أولاً يتم الإبلاغ عنها كأسلوب تصور يفتت في 19798. التقنية تعديل في البداية للكشف عن شظايا من الحمض النووي من قبل بسام et al. 6 وفي عام 1991 وتحسنت ثم سانغينتي وزملاء العمل9 في عام 1994. وقد تم تحسين الأسلوب كذلك في الماضي بضعة عقود6،7،9،10،11،12،13،14 , 15-ومع ذلك، معظم هذه الإصدارات المحدثة من البروتوكولات لا تزال لديها بعض العيوب مثل ارتفاع الطلب التقنية وطويلة تجهيز الوقت للتثبيت وتركيب6، التي تحد من تطبيق هذه البروتوكولات7، 11. وضع بروتوكول أمثل الذي يجمع بين منخفضة التكلفة بكفاءة عالية من الحمض النووي جزء الكشف عن حاجة ملحة للتطبيق الروتيني للفضة تلطيخ في الأبحاث البيولوجية.
وباﻹضافة إلى ذلك، جل polyacrylamide يمكن تقسيم المواد الهلامية polyacrylamide يشوه وغير يشوه، وكلاهما يمكن استخدامها للكشف عن علامات الاشتراكية السوفياتية استخدام الفضة تلطيخ الأسلوب. التأثير والقرار التي لا تختلف كثيرا، ولكن غير يشوه الهلام polyacrylamide هي أسهل للعملية وتأخذ أقل وقت16.
استناداً إلى البحوث السابقة15، هدف الدراسة الحالية لوصف فضة أمثل تلطيخ البروتوكول بالتفصيل للكشف عن علامات الاشتراكية السوفياتية في جل polyacrylamide غير يشوه سريعة وسهلة ومنخفضة التكاليف.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1-إعداد منتجات PCR علامات الاشتراكية السوفياتية
2-إعداد الحلول Polyacrylamide الهلام الصب
3-إعداد المواد الهلامية Polyacrylamide للتفريد
4-تشغيل والهلام
5-الفضة تلطيخ للكشف عن علامات الاشتراكية السوفياتية في غير Polyacrylamide هلام-
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
أمبليكونس بكر قد أنتجت باستخدام أزواج التمهيدي الاشتراكية السوفياتية المقابلة في ملفوف صيني المزهرة والتبغ. بعد التفريد، كانت ملطخة الجل polyacrylamide استخدام الفضة أعلاه تلطيخ البروتوكول، الذي لا لبس فيه الكشف عن أنماط النطاقات من علامات الاشتراكية السوفياتية (الشكل 1).
لمقارنة كفاءة الكشف عن مختلف الفضة تلطيخ البروتوكولات، منتجات PCR علامات الاشتراكية السوفياتية في التبغ والمزهرة ملفوف صيني تم فص...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الغسيل جل بعد التلقيح خطوة حاسمة. حجم الغسيل عدم كفاية الوقت والمياه قد تتسبب إزالة الحل التشريب ناقصة على سطح اللوحة والهلام، ويؤدي إلى خلفية داكنة. النامية الوقت المناسب خطوة رئيسية أخرى، يمكن أن يؤدي تطوير الإفراط في خلفية بني داكن مع الصورة التباين المنخفض من شظايا من الحمض النووي. وبالإضافة إلى ذلك، يؤثر خطوة التلقيح إلى حد كبير على كفاءة المصبوغة من شظايا من الحمض النووي. على الرغم من تمديد وقت الحمل أكثر من 5 دقيقة أو زيادة مقدار3 إنيو في الحل التشريب لم تتحسن إلى حد كبير نوعية المصبوغة، الحد من الإشباع...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الكتاب يعلن أن لديهم لا تضارب المصالح المالية.
تم تمويل هذا العمل بمؤسسة العلوم الطبيعية قوانغدونغ في الصين (2015A030313500) والمقاطعات الرئيسية التعاونية أبحاث منهاج العمل الدولي للرئيسية العلمية البحوث مشروع قوانغدونغ التعليم العالي (2015KGJHZ015)، العلم و خطة تكنولوجيا إدارة قوانغدونغ احتكار التبغ (201403، 201705) والعلوم والتكنولوجيا خطة قوانغدونغ الصين (2016B020201001)، مشروع التدريب الوطنية للابتكار لطلاب المرحلة الجامعية (201711078001). الإشارة إلى الأسماء التجارية أو المنتجات التجارية في هذا المنشور هو فقط لغرض توفير معلومات محددة ولا يعني توصية أو تأييد من قبل "وزارة الزراعة الأمريكية". وزارة الزراعة هو موفر تكافؤ الفرص ورب العمل.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| مزيج PCR الرئيسي (Green Taq Mix) | Vazyme Biotech Co. Ltd ، الصين | #P131-03 | |
| 50-2000 نقطة أساس سلم الحمض النووي | Bio-Rad ، الولايات المتحدة الأمريكية | # 170-8200 | |
| DL500 علامة الحمض النووي | Takara Bio Inc. ، اليابان | #3590A | |
| تريس | سانغون للتكنولوجيا الحيوية شنغهاي ، الصين | # 77-86-1 | |
| حمض البوريك | سانغون للتكنولوجيا الحيوية شنغهاي ، الصين | # 10043-35-3 | |
| EDTA-Na 2< / sub> | مصنع الكاشف الكيميائي في قوانغتشو ، الصين | # 6381-92-6 | |
| أكريلاميد | سانجون للتكنولوجيا الحيوية شنغهاي ، الصين | # 79-06-1 | |
| N ، N'-methylene-bis-acrylamide | Sangon Biotech شنغهاي ، الصين | # 110-26-9 | |
| N ، N ، N '، N'-TETRAMETHYLETHYLENEDIAMINE | SANGON BIOTECH شنغهاي ، الصين | # 110-18-9 | |
| الأمونيوم بيرسلفات | قوانغتشو الكيميائي ، الصين | # 7727-54-0 | |
| Bind-silane | Solarbio بكين ، الصين | #B8150 | |
| AgNO3< / sub> | Sinopharm الكاشف الكيميائي بكين المحدودة ، الصين | # 7761-88-8 | |
| الكاشف الكيميائي للفورمالديهايد | تيانجين داماو ، الصين | # 50-00-0 | |
| مصنع الكاشف الكيميائي NaOH قوانغتشو ، الصين | # 1310-73-2 | ||
| مصنع الكاشف الكيميائي لحمض الخليك في قوانغتشو ، الصين | # 64-19-7 | ||
| Na 2< / sub>CO3< / sub> | الكاشف الكيميائي Tianjin DaMao ، الصين | # 497-19-8 | |
| مصنع الكاشف الكيميائي للإيثانول قوانغتشو ، الصين | # 64-17-5 | ||
| HNO< فرعي>3< / فرعي> | الكواشف الكيميائي في قوانغتشو ، الصين | # 7697-37-2 | |
| Na 2< / sub>S2< / sub>O3< / sub>.5H2< / sub>O | Sinopharm Chemical Reagent Co.، Ltd ، الصين | # 10102-17-7 | |
| Eriochrome الأسود T (EBT) | مصنع الكاشف الكيميائي Tianjin DaMao ، الصين | # 1787-61-7 | |
| صينية بلاستيكية | شنغهاي Yi Chen Plastic Co.، Ltd ، | China-TS-1 | |
| Shaker | Qilinbeter JiangSu ، | China-BenQ | |
| M800 Scanner | BenQ ، | ||
| مزود الطاقة | Beijing Liuyi Instrument Factory ، | China-High | |
| في جميع أنحاء أنظمة الهلام العمودية ، JY-SCZF | بكين Tunyi Electrophoresis المحدودة ، الصين | - |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.