اليوم الأول:
1-عابر تعداء الخلايا غشائي
- إذا رغبت في ذلك، من تعداء عابرة للبشرية الحبل الوريد غشائي الخلايا (هوفيك) استخدام النوكليوتيد الجينات التنظيمية (مثل مايكرو-الكشف أو الحمض النووي الريبي التدخل الصغيرة (siRNA)) والكاشف ليبوفيكتاميني المناسبة وفقا لأداء إرشادات الشركة المصنعة.
ملاحظة: هذا البروتوكول قد حققت نجاحا كبيرا أداء عكس ترانسفيكشنز مع تسلسل siRNA مخصصة وكاشف تعداء تجارية (انظر الجدول المواد). المؤلفين لم تختبر الأخرى بروتوكولات تعداء والكاشفات مع هذا التحليل. خطوات تعداء عكس استخدام الكواشف المذكورة فيما يلي:
- إعادة تشكيل سيرناس المجففة بالتبريد أو ميكرورناس بتركيز 20 ميكرومتر في المياه الحرة نوكلياسي.
- جعل الحلول تعداء في النسبة التالية: 1 مل من أي مصل وسائل الإعلام الحرة مع 9 ميليلتر siRNA أو ميكرورنا.
- تحرض الحل والسماح لها باحتضانها لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة.
- إضافة 18 ميليلتر من تعداء كاشف للحل وتحرض.
- يسمح الحل لاحتضان كل 10 إلى 15 دقيقة في درجة حرارة الغرفة مدة 20-40 دقيقة، التحريض الحل لفترة الحضانة.
- بينما هو حضانة الحل تعداء، فصل هوفيك استخدام حل مفرزة خلية (مثلاً، أككوتاسي). لقارورة T175، يغسل قارورة مع 10 مل من الفوسفات مخزنة المالحة (PBS)، ثم إضافة 5 مل من محلول مفرزة الخلية واحتضان قارورة في 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق.
- إضافة 5 مل من وسائل الإعلام كاملة إلى قارورة T175، وإزالة تعليق خلية من قارورة والطرد المركزي 1200 لفة في الدقيقة لمدة 3 دقائق.
- إزالة المادة طافية باستخدام الشافطة فراغ وريسوسبيند بيليه الخلية في كثافة 1 × 106 خلايا كل مل في EGM2.
ملاحظة: هذا البروتوكول قد حققت نجاحا كبيرا باستخدام "الخلية غشائي النمو المتوسطة" (EGM2) الذي يحتوي على طقم عيار عامل النمو القياسية، فضلا عن إضافي 10 ٪ FBS.
- وبمجرد الانتهاء من حل تعداء تفرخ، لوحة 1 مل من محلول في صفيحة 10 سم، وإضافة 1 مل تعليق هوفيك في الأعلى.
- إضافة مل 7 إضافية وسائط كاملة لكي مل 9 وحدة التخزين النهائي في اللوحة 10 سم.
- جعل اثنين على الأقل 10 سم لوحات قيمتها الخلايا لكل شرط تعداء التأكد من أن هناك ما يكفي من خلايا متاحة للخطوات اللاحقة في المقايسة.
ملاحظة: هذه الشروط يؤدي تركيز عمل نهائي للجينات اليغنوكليوتيد التنظيمية من 20 نانومتر. الكتاب وجدت هذه الشروط أن يسفر ضربة قاضية 60-80% من التعبير الجيني لأهدافها للفائدة. باحثين آخرين قد تحتاج إلى تحسين ظروف تعداء وفقا لاحتياجاتها التجريبية.
- تبادل وسائل الإعلام إضافة وظيفة ح 4-6 مجمعات siRNA مع وسائل الإعلام كاملة جديدة.
ملاحظة: تم تطوير هذا البروتوكول باستخدام ممر هوفيك 1-2.
2 يوم
2-طلاء من حبات ميكروكارير مع خلايا بطانية
- إعادة تشكيل الخرز ميكروكارير (مثلاً، 3 سيتوديكس) بتركيز 60,000 الخرز/مل في برنامج تلفزيوني والاوتوكلاف.
ملاحظة: حبات ميكروكارير تأتي بتركيز حوالي 3 × 106 حبات كل غرام. إعادة تشكيل الخرز بنسبة 20 ملغ حبات الواحد مل من برنامج تلفزيوني للحصول على كثافة حبة من حبات تقريبا 60,000/mL.
- أنابيب قاسمة 1 مل وسائط كاملة في العدد المطلوب من القاع المستديرة Fluorescence تنشيط الخلية الفرز (نظام مراقبة الأصول الميدانية).
- "الماصة؛" 20 ميليلتر من تعليق حبة ميكروكارير في كل أنبوبة (تأخذ الرعاية لضمان أن الحل حبة هو حراكه جيدا قبل بيبيتينج).
ملاحظة: المحتمل سيكون هناك تقلب كبير في تركيز العمل النهائي الخرز موجودة في تعليق حبة ميكروكارير معينة. الخرز يمكن أن تنضم بسهولة إلى الجانبين من الحاويات البلاستيكية والزجاج الذي يمكن أن يغير إلى حد كبير حبة تركيز في الحل. سوف تحتاج حجم أنسب حل حبة إضافة إلى أنبوب نظام مراقبة الأصول الميدانية لكل دفعة من تعليق حبة ميكروكارير يحددها المحقق تجريبيا. الأرقام المعروضة هنا تهدف إلى خدمة أكثر كنقطة انطلاق. ومن الناحية المثالية، ينبغي أن يكون الأمثل الشروط حتى تكون هناك 10-20 حبات مضمنة داخل الجل فيبرينوجين كل بئر في 24 لوحة جيدا في نهاية المقايسة. راجع مزيد من المناقشة في جزء المناقشة أدناه فيما يتعلق بالاستغلال الأمثل للأرقام الخرز للمقايسة.
- فصل transfected تعداء بوست ح 24 هوفيك استخدام الحل مفرزة الخلية كما يلي:
- تغسل كل لوحة 10 سم الخلايا مع 5 مل من برنامج تلفزيوني، ثم أضف 2 مل الحل مفرزة الخلية واحتضان الخلايا في 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق.
- ريسوسبيند الخلايا بتركيز 1 × 106 خلايا/مل في وسائل الإعلام كاملة.
- أضف 1 مل تعليق خلية (أي 1 × 106 هوفيك) لكل أنبوبة نظام مراقبة الأصول الميدانية التي تحتوي على حبات.
- بلطف تحرض أنابيب نظام مراقبة الأصول الميدانية كل 20 دقيقة لمدة 4 ح في 37 درجة مئوية (إذا كان الشروع في الخطوة 3، 4) أو 2.5 إلى 3 ح (إذا كان الشروع في الخطوة 3، 2).
ملاحظة: هذه مدة وتواتر حدوث قلاقل قد تجريبيا حددت الباحثين السابقة الذين الأمثل حبة الأساسية تنتشر المقايسة. 4 لم يتم اختبارها ترددات أخرى من الانفعالات والمدد الزمنية للخطوة طلاء حبة من المؤلفين.
3-متسلسلة طلاء بيريسيتيس على حبات المغلفة هوفيك ميكروكارير
- يبدأ فصل الخلايا 10T1/2 (بيريسيتيس) باستخدام الحل مفرزة الخلية (التربسين) على النحو التالي:
- أغسل قارورة T175 مع 10 مل من برنامج تلفزيوني، ثم أضف 5 مل التربسين واحتضان في 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق.
- ريسوسبيند 10T1/2 بتركيز 2 × 105 خلايا/0.5 مل في وسائل الإعلام كاملة.
ملاحظة: خلايا تم شراؤها من جمع الثقافة نوع الأمريكية (ATCC).
ملاحظة: الخلايا 10T1/2 الثقافة في الحد الأدنى الأساسية المتوسطة (MEM) تستكمل مع 10% FBS و 1% البنسلين والستربتوميسين.
- بعد 2.5 إلى 3 ح للتحريض على حبة + الحل هوفيك، انتظر 5 دقائق للسماح الخرز وهوفيك التعويم الحر لتسوية إلى الجزء السفلي من الأنبوب.
- إزالة 0.5 مل من وسائل الإعلام كاملة من كل أنبوبة ماصة P1000 استخدام وإضافة 2 × 105 10T1/2 في وسائل الإعلام كاملة بحجم 0.5 مل لكل أنبوبة نظام مراقبة الأصول الميدانية. تحرض حل الخلية وحبه وثم الاستمرار في احتضان عند 37 درجة مئوية. ما زالت تحرض كل 20 دقيقة حتى الخرز وقد تم تحريكها لإجمالي ح 4.
ملاحظة: نسبة هوفيك 5: 1 بيريسيتي على الخرز أمر ضروري للحفاظ على التغطية المناسبة بيريسيتي للسفن.
ملاحظة: الخطوات البديلة التالية يمكن اتباعها بدلاً من ذلك في هذه النقطة في البروتوكول:
- تحرض الخرز وهوفيك فقط من أجل ح 4.
- بمجرد اكتمال ح 4 طلاء هوفيك من الخرز ميكروكارير، تحرض الأنابيب مرة أخيرة، انتظر 30-60 ثانية، ثم على الفور إزالة 1.5 1.75 مل من محلول من أنبوب نظام مراقبة الأصول الميدانية.
ملاحظة: هذا ينبغي السماح الوقت الكافي لمعظم الخرز تسوية بينما سيتم إزالتها هوفيك التعويم الحر كثيرة في وسائل الإعلام.
- إضافة 2 × 105 10T1/2 في وسائل الإعلام كاملة وإحضار وحدة التخزين نظام مراقبة الأصول الميدانية أنبوب يصل إلى 2 مل.
- بلطف تحرض أنابيب نظام مراقبة الأصول الميدانية كل 20 دقيقة لمدة ساعة إضافية.
- بمجرد اكتمال التحريض، بلطف تحرض الأنابيب مرة واحدة أخيرة وفورا إزالة الحل الكامل (2 مل)، وإضافته إلى لوحة 6-سم. إضافة 3 مل إضافية وسائط كاملة لكل لوحة ووضع اللوحات في الحاضنة 37 درجة مئوية بين عشية وضحاها.
3 يوم
4-إعداد حلول جل فيبرينوجين
- إعداد الحلول العامل aprotinin بتركيز 1 ملغ/مل في برنامج تلفزيوني وثرومبين في 50 وحدة/مل.
ملاحظة: يمكن إجراؤها بمخزون كبير من كل من هذه الحلول وتخزينها في 4 درجات مئوية لمدة سنة على الأقل.
- جعل حلاً جديدة من الفيبرينوجين بتركيز 2 ملغ/مل. جعل الحل ما يكفي أن يكون 2.5 مل من محلول الواحدة وتحريكها نظام مراقبة الأصول الميدانية الأنبوبة.
- الحارة الحل في حمام مائي 37 درجة مئوية لمدة 10 دقيقة للسماح لكل من الفيبرينوجين الخوض في الحل.
- إضافة ميليلتر 37.5 من حل أبروتينين كل 1 مل من محلول الفيبرينوجين.
- عقيمة تصفية الحل وتوضع جانبا في درجة حرارة الغرفة.
5-إعداد الخرز لزرع هلام
- فحص الأطباق التي تحتوي على الخرز المغلفة ميكروكارير تحت المجهر باستخدام هدف X 20 لضمان أن جميع حبات قد تم المغلفة بما فيه الكفاية بخلايا بطانية.
- قوة "الماصة؛" الحل مطلي من الخلايا لفصل لهم من لوحة 6-سم ووضع الحل في أنبوب. أغسل اللوحة 2 X مرات إضافية مع وسائل الإعلام كاملة ونقل إلى الأنبوب لجمع جميع حبات المتبقية التي قد تنضم إلى اللوحة.
- تجنب إدخال فقاعات الهواء واستخدم ماصة p1000 لتقليل إجهاد القص على الخرز المغلفة بالخلية البطانية.
- إذا كان تقييم كفاءة siRNA ضربة قاضية في خلايا بطانية المسبق، في الخطوة 2، من المؤكد أن يكون لوحة خرز المطلي هوفيك فقط. ثم خلال هذه الخطوة (5.2)، فصل الخرز وجمع بقايا هوفيك تعلق على لوحة لعزل الحمض النووي الريبي وتحليل قبكر.
- انتظر 3 دقائق للسماح الخرز في الحل بتسوية إلى الجزء السفلي من الأنبوب.
- إزالة جزء كبير من المادة طافية قدر الإمكان دون الإخلال ببيليه حبة استخدام تلميح ماصة p1000 (لا تستخدم المضخة فراغ).
- أضف 1 مل من وسائل الإعلام كاملة لكل أنبوبة والخرز ريسوسبيند.
- انتظر 30-60 ثانية للسماح بالخرز لتسوية للأسفل. قم بإزالة جزء كبير من المادة طافية كإمكانية استخدام ماصة P1000 دون إزعاج بيليه حبة. لا تستخدم المضخة فراغ كما هو زيادة كبيرة في احتمال إزالة بيليه حبة بطريق الخطأ.
- كرر الخطوات من 5.5 و 5.6 إضافية مرتين. والهدف هو إزالة قدر من هوفيك التعويم الحر الذي قد تم فصل من لوحة 6-سم قدر الإمكان، بينما لا إزالة عدد كبير جداً من الخرز هوفيك المغلفة، التي ينبغي أن يستقر في الأنبوب نظام مراقبة الأصول الميدانية بسرعة أكبر من خلايا التعويم الحر.
- إضافة 1 مل من وسائل الإعلام كامل إلى الخرز.
6-تضمين المغلفة الخرز في جل فيبرينوجين
- قم بإزالة الوسائط قدر ممكن دون إزعاج بيليه حبة في كل أنبوبة نظام مراقبة الأصول الميدانية باستخدام ماصة P1000.
- ريسوسبيند الخرز في 2.5 مل من محلول الفيبرينوجين.
- "الماصة؛" ميليلتر 13 الحل ثرومبين إلى كل المطلوب كذلك من صفيحة زجاجية 24-جيدا. الطلاء في صفيحة زجاجية أمر ضروري لتمكين التصوير الأمثل لبراعم.
ملاحظة: لا تترك ثرومبين يجلس في بئر لأكثر من 5-10 دقيقة قبل الخطوة التالية.
- إضافة 0.5 مل من محلول حبة/الفيبرينوجين لكل بئر.
- من المؤكد أن ريسوسبيند الحل حبة جيدا قبل بيبيتينج الحل في كل مرة.
- أخذ الحيطة والحذر عناية "الماصة؛" مباشرة إلى ثرومبين موجودة بالفعل في البئر. ببطء "الماصة؛" صعودا وهبوطاً 2-3 مرات لمزيج دقيق الحل، مع أخذ الحذر عدم إدخال أي فقاعات الهواء.
- تأكد من تغيير تلميح ماصة بين الآبار.
- أخذ الحيطة والحذر عدم التحرك أو اضطراب لوحة عند أي نقطة خلال الأولية فيبرينوجين تخثر الدم، كما أن أي تحرك قد يؤدي إلى تعطيل تكوين هلام.
- اترك لوحة يجلس في غطاء محرك السيارة لمدة 30 دقيقة في درجة حرارة الغرفة.
- نقل اللوحة بعناية إلى حاضنة 37 درجة مئوية ح 1.5-2 إضافية للسماح للجل ترسيخ تماما
7-طلاء الليفية على رأس جل فيبرينوجين
- خلال آخر 30 دقيقة من ترسيخ هلام، فصل عادي الليفية الرئة البشرية (نهلف) على النحو التالي:
- أغسل قارورة T175 الخلايا مع 10 مل من برنامج تلفزيوني، ثم أضف 5 مل من محلول مفرزة الخلية واحتضانها في 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق.
- ريسوسبيند نهلف بتركيز 20,000 خلايا/مل في وسائل الإعلام كاملة.
ملاحظة: يمكن استزراع الخلايا نهلف مع دولبيكو تعديل النسر المتوسطة (دميم) وتستكمل مع 10% FBS و 1% "البنسلين والستربتوميسين".
- بلايت 1 مل تعليق خلية نهلف على الجل من كل بئر ووضع مرة أخرى في الحاضنة.
- تغيير الوسائط كاملة كل يوم لمدة المقايسة.
8-مراقبة تنتشر على مدى 2-7 أيام بعد زرع حبة في جل فيبرينوجين. طول الفترة الزمنية المطلوبة لتنتشر سيتوقف على عدد هوفيك المرور والكثير.
9-تثبيت تنتشر الإنزيم
- بمجرد حدث تنتشر كافية ليتمكن من تحديد فرق المظهرية بين مجموعات علاجية، غسل جميع الآبار مرة واحدة مع 2 مل من برنامج تلفزيوني.
- إضافة 0.5 مل من محلول مفرزة خلية لكل بئر ووضع اللوحة في حاضنة 37 درجة مئوية لمدة 5 دقائق.
- إزالة اللوحة من الحاضنة والاستفادة من الجانبين من اللوحة.
ملاحظة: الغرض من هذه الخطوة إزالة أكبر عدد ممكن من الخلايا نهلف المتزايد على رأس جل فيبرينوجين قدر الإمكان لتسهيل اختراق جسم جل فضلا عن تصوير جل. وقت الحضانة المجموع مع الخلية المفرزة الحل قد تحتاج إلى تعديل لتحسين إزالة نهلف. وحذر الباحثين هي لعدم احتضان الهلام لفترات طويلة من الوقت الحل مفرزة الخلية قد تخترق الجل وتبدأ تعطيل هياكل غشائي داخل.
- بمجرد تمت إزالة كمية كافية من الخلايا نهلف، إخماد الحل مفرزة الخلية مع 1 مل من وسائل الإعلام كاملة.
- نضح بفصل نهلف والوسائط باستخدام الشافطة فراغ، وغسل الآبار مرة واحدة مع 1 مل من برنامج تلفزيوني.
- إضافة 300 ميليلتر من محلول بارافورمالدهيد 2% في برنامج تلفزيوني لكل بئر واحتضان في درجة حرارة الغرفة لمدة 10 دقائق.
- إزالة الحل بارافورمالدهيد 2% وتغسل كل 3 مرات أيضا مع 1 مل من برنامج تلفزيوني لمدة 3 دقائق في درجة حرارة الغرفة.
ملاحظة: يرجى التخلص من 2% بارافورمالدهيد الحل المناسب وفقا للمبادئ التوجيهية "الصحة البيئية" والسلامة (EHS).
- أضف 1 مل من برنامج تلفزيوني لكل خير وتخزينها في 4 درجات مئوية حتى جاهزة وصمة عار أو صورة براعم.
10-تلطيخ لتنتشر في التحليل
- إضافة 300 ميليلتر من 0.5% 100 تريتون العاشر في برنامج تلفزيوني لكل جيد واحتضان لمدة 30 إلى 45 دقيقة في درجة حرارة الغرفة.
- باستخدام الشافطة فراغ، إزالة X100 تريتون ويغسل 3 مرات في برنامج تلفزيوني لمدة 5 دقائق.
- إضافة 500 ميليلتر من عرقلة الحل لكل جيل واحتضان بين عشية وضحاها في 4 درجات مئوية.
ملاحظة: حل حظر تتكون من المكونات التالية: 1% ألبومين المصل البقري (BSA) 5% FBS، 0.1% توين-20 و antiserum 1% (استخدام نفس الأنواع التي تستمد منها الأجسام المضادة الثانوية الخاصة بك) في برنامج تلفزيوني.
- إزالة الحل حظر من كل بئر وإضافة 300 ميليلتر المصبوغة الحل الذي يحتوي على جسم الأولية لكل بئر.
ملاحظة: الحل المصبوغة هو نفسه كحل حظر، ولكن دون أنتيسيروم هذا. الكتاب نجاحا تفرخ مع الأجسام المضادة الأولية في تخفيف من 1: 200 إلى 1: 400.
- احتضان الأجسام الأولية في تلطيخ الحل عن 24 ساعة عند 4 درجة مئوية.
- نضح حل جسم الأولية ويغسل 3 مرات في تبس مع توين 0.5% عن 20 دقيقة في درجة حرارة الغرفة مع هزاز لطيف. بعد الغسيل الثالث، استبدال مع المخزن المؤقت للمياه العذبة والصرف الصحي مرة أخرى وتخزينها في 4 درجات مئوية بين عشية وضحاها.
- احتضان مع جسم الثانوي الفلورسنت المخفف 1: 1000 في تلطيخ الحل ح 2 في درجة حرارة الغرفة.
- إزالة الأجسام المضادة الثانوية الحل المصبوغة وتغسل 5 مرات لكل 20 دقيقة مع TBS المحتوية على 0.5% توين في درجة حرارة الغرفة مع هزاز لطيف.
- تمييع النووية وصمة عار في برنامج تلفزيوني واحتضان بين عشية وضحاها في 4 درجات مئوية.
ملاحظة: هذا البروتوكول قد حققت نجاحا كبيرا مع 1:10000 هويشت المخفف في برنامج تلفزيوني.
ملاحظة: ليست هناك حاجة إزالة الحل المصبوغة النووية قبل التصوير.
- الصورة في غضون أيام قليلة من الانتهاء من تلطيخ لالتقاط الإشارات الأمثل الفلورسنت.
11-تنتشر في التحليل الكمي
- بعد قد تم تصويرها براعم، استيراد ملفات الصور في إيماجيج واستخدام أداة العد لحساب العدد براعم، أو أداة لقياس أطوال تنبت خط.
ملاحظة: يتم تعريف براعم كنتوءات غشائي بطول أكبر من أو يساوي قطر حبة تنتشر من خلالها. 11 يمكن قياس طول تنبت كالمسافة من النقطة التي تبدأ برعم جاحظ الخروج من حبة غيض برعم. تنبت متوسط طول كل حبة ومتوسط عدد براعم كل حبة مقاييس مفيدة لتقييم التأثيرات المظهرية لإسكات الجينات في تنتشر الأوعية. يمكن أيضا استخدام متوسط عدد الخرز التي تحتوي على برعم واحد على الأقل من كل مجموعة المعاملة كمقياس لتقييم مدى متانة تنتشر.