ويصف هذا البروتوكول تقنية باستخدام الماوس سبلينوسيتيس لاكتشاف أنماط الجزيئية المرتبطة بالعوامل الممرضة التي تغير التعبير الجيني الجزيئي على مدار الساعة.
مقالة منهجية
ويصف هذا البروتوكول تقنية باستخدام الماوس سبلينوسيتيس لاكتشاف أنماط الجزيئية المرتبطة بالعوامل الممرضة التي تغير التعبير الجيني الجزيئي على مدار الساعة.
من السلوك للتعبير الجيني، تنظيم إيقاعات circadian تقريبا جميع جوانب علم وظائف الأعضاء. وهنا، نقدم منهجية لتحدي سبلينوسيتيس الماوس مع أنماط الجزيئية المرتبطة بالعوامل الممرضة (بامبس) lipopolysaccharide (LPS)، ODN1826، وقتل الحرارة الليستريه المستوحدة ، ودراسة أثرها على الجزيئية الإيقاعية على مدار الساعة. سابقا، وقد ركزت الدراسات على دراسة تأثير لبس على مدار الساعة الجزيئية باستخدام مجموعة متنوعة من النهج في فيفو و السابقين فيفو من مجموعة متنوعة نماذج (مثل الماوس وفار، والإنسان). ويصف هذا البروتوكول بالعزلة والتحدي سبلينوسيتيس، فضلا عن المنهجية لتقييم ساعة الجينات التعبير التحدي فيما بعد عن طريق PCR الكمي. يمكن استخدام هذا النهج لتقييم ليس فقط تأثير العناصر الجرثومية على مدار الساعة الجزيئية لكن الجزيئات الأخرى، فضلا عن أنه قد يغير التعبير على مدار الساعة. ويمكن استخدام هذا النهج في ندف أربا الآلية الجزيئية لكيفية تأثير تفاعل مستقبلات بمب-عدد القتلى-مثل التعبير على مدار الساعة.
الساعة الرئيسية في الثدييات، الذي ينظم ذبذبات ح 24 لما يقرب من جميع الجوانب لعلم وظائف الأعضاء والسلوك، يقع داخل نواة suprachiasmatic (SCN)1،تحت المهاد2. وبالإضافة إلى تنظيم العمليات البيولوجية على المستوى العضوي، مزامنة الساعة الرئيسية أيضا الطرفية الساعات الخلوية في جميع أنحاء الجسم3،،من45. بينما تتألف الآلية الجزيئية على مدار الساعة من على الأقل ثلاث حلقات التغذية المرتدة النسخي متعدية المتشابكة، نواة تتكون من الفترة (Per1-3)، كريبتوتشرومي (Cry1-2)، Bmal1، و على مدار الساعة الجينات6،7. إلى جانب الحفاظ على دقة توقيت ساعة جزيئية أساسية، بعض منتجات الجينات المساعدة على مدار الساعة (مثلاً، القس-erbα و دبة) أيضا تنظيم الجينات غير على مدار الساعة، أي ساعة الجينات التي تسيطر عليها (ككجس)6 , 7.
وقد وصف الساعات الجزيئية الوظيفية في مختلف الأنسجة المناعية (مثلاً، الطحال والعقد الليمفاوية)8 والخلايا (مثلاً ب الخلايا، والخلايا الجذعية، الضامة)8،9. الكشف عن هذه الخلايا وتستجيب لمسببات الأمراض المرتبطة أنماط الجزيئية (بامبس)، المكونات الميكروبية مصانة، عن طريق مستقبلات الاعتراف المناعة الفطرية مثل عدد القتلى تشبه المستقبلات (TLRs)10. حتى الآن، وقد وصف 13 TLRs الوظيفية، التي تعترف بمكونات الميكروبية مثل مكونات جدار الخلية البكتيرية وفلاجلر البروتين والأحماض النووية الجرثومية10. لقد ثبت بمب، lipopolysaccharide (LPS)، مكون جدار الخلية للبكتيريا سلبية الغرام المعترف بها TLR4، إلى تغيير إيقاعات circadian على المستويين العضوي والجزيئية على حد سواء. على سبيل المثال، الناجم عن تأخر المرحلة مضاءة مثل مقاسا بنشاط في الفئران11 في فيفو التحدي للبس وأدت إلى انخفاض على مدار الساعة التعبير الجيني في اللجنة الفرعية للتغذية في الكبد كما تحددها التهجين في الموقع و PCR الكمي، على التوالي، في12من الفئران. بعد تحديا في فيفو مع لبس، كشف تحليل للدم المحيطي البشري الكريات البيضاء13 و14 من الأنسجة الدهنية تحت الجلد التعبير غيرت عدة الجينات على مدار الساعة الذي يقاس عن طريق قبكر. أخيرا، غيرت السابقين فيفو التحديات لبس الضامة البشرية والضامة البريتوني الماوس، أدت أيضا إلى التعبير على مدار الساعة مقاسا قبكر14.
هنا، يمكننا وصف بروتوكول لتقييم تأثير "لبس بامبس"، ODN1826 (أونميثيلاتيد النوكليوتيد الاصطناعية التي تحتوي على زخارف البد)، وقتلت الحرارة الليستريه المستوحدة (HKLM)، المعترف بها TLR4 و TLR9 و TLR2، على التوالي، التعبير الجيني الجزيئي على مدار الساعة في سبلينوسيتيس الماوس. ويتضمن البروتوكول استئصال الماوس والعزلة سبلينوسيتي والتحدي والحمض النووي الريبي استخراج، كدنا التوليف و qPCR لتقييم العديد من الجينات على مدار الساعة. يسمح هذا البروتوكول للحصول في الوقت المناسب على عدد كبير من الخلايا المناعية مع القليل جداً من الحيوان أو التلاعب الخلوية، التي يمكن ثم طعن السابقين فيفو مع بامبس مختلف. لقد ثبت على مدار الساعة الجزيئية لتعدل مختلف جوانب الاستجابة المناعية8،،من1516، ولذلك توقف عقارب الساعة الجزيئية يضر على الأرجح الاختلاف تعتمد على الوقت المناسب الاستجابة المناعية. وبالإضافة إلى ذلك، نظراً لانقطاع إيقاعات circadian يمكن أن تؤدي إلى أمراض خطيرة17،18،،من1920، قد تكون ذات فائدة للباحثين لتحدي سبلينوسيتيس مع مجموعة واسعة من الجزيئات وتقييم تأثيرها على مدار الساعة.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
أثناء الدراسة، ورعاية الحيوان ومعاملة الامتثال لسياسة "المعاهد الوطنية للصحة"، تم وفقا للمبادئ التوجيهية المؤسسية، وأقرتها جامعة هارتفورد الحيوان رعاية الحيوان المؤسسية واستخدام اللجنة.
1-الرائعة للحيوانات
ملاحظة: تستخدم الفئران الذكور B6129SF2/ي عشرين أسبوع في الدراسة.
2-إعداد الصكوك والثقافة المتوسطة، والمتوسطة التحدي
3-سبلينوسيتي العزلة والتحدي
4-الجيش الملكي النيبالي العزلة وكدنا التوليف
5-الكمية تفاعل البوليميراز المتسلسل (qPCR)
6. التحليل الإحصائي
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
كانت التضحية الفئران في ZT13، سبلينوسيتيس كانت معزولة وتحدي السابقين فيفو بلبس بامبس، ODN1826، أو HKLM. بعد ح 3، تم عزل الحمض النووي الريبي، وكان يستخدم qPCR لتقييم مستويات التعبير النسبي للجينات الجزيئية على مدار الساعة على مدار الساعة، Per2، دبة، و القس erbα مقارنة مع الخلايا التحكم دون منازع. بعد التحدي بمب، مستويات التعبير على مدار الساعة لم تكن تختلف اختلافاً كبيرا من التعبير في الخلايا التحكم (الشكل 1
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ضمن هذا البروتوكول، يمكن استخدامها جهاز المطياف الضوئي ميكروفولومي قياس وتقييم نقاء الجيش الملكي النيبالي المستخدمة في تحديد التعبير الجيني. امتصاص الأشعة فوق البنفسجية الخفيفة في 260 من الأحماض النووية شمال البحر الأبيض المتوسط، البروتينات عادة تمتص الضوء في 280 نانومتر، بينما الملوثات المحتملة الأخرى المستخدمة أثناء إجراء استخراج الحمض النووي الريبي (مثل الفينول) قابلة للاكتشاف في 230 نيوتن متر. لذلك، بتقييم امتصاص (أ) نسبة في 260/280 نانومتر (الحمض النووي الريبي للبروتين) و 260/230 نيوتن متر (الحمض النووي الر...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ليس له علاقة بالكشف عن صاحب البلاغ.
هذا العمل كان يدعمها المنح "البحثية كلية" من مكتب بكلية الآداب والعلوم عميد في جامعة هارتفورد.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| الشرائح المتجمدة | فيشر | 12-550-343 | |
| مصافي الخلايا | فيشر | 22363547 | |
| عديدات السكاريد الدهنية ؛ | InvivoGen | ltrl-eklps | |
| ODN1826 | InvivoGen | Tlrl-1826-1 | |
| HKLM | InvivoGen | Tlrl-hklm | |
| RPMI 1640 | Gibco | 11875-093 | |
| PBS | Gibco | 20012-043 | |
| RNeasy Mini Kit | Qiagen | 74104 أو 74106 | |
| RNase Free DNase | Set Qiagen | 79254 | |
| 6 آبار لوحة ثقافة الخلايا | دنفيل | T1006 | |
| 50 مل أنابيب | كورنينج | 352070 | |
| أنابيب 15 مل | كورنينج | 352097 | |
| السعة cDNA النسخ العكسي | كيت ThermoFisher | 4368814 | |
| TaqMan مقايسات التعبير الجيني b-actin | ThermoFisher | Mm00607939_s1 | |
| فحوصات التعبير الجيني TaqMan Per2 | ThermoFisher | Mm00478113_m1 | |
| TaqMan مقايسات التعبير الجيني Rev-erba | ThermoFisher | Mm00520708_m1 | |
| TaqMan مقايسات التعبير الجيني Bmal1 | ThermoFisher | Mm00500226_m1 | |
| TaqMan فحوصات التعبير الجيني Dbp | ThermoFisher | Mm00497539_m1 | |
| qPCR آلة StepOnePlus | ThermoFisher | ||
| TaqMan Gene Expression Master Mix | ThermoFisher | 4369016 | |
| MicroAmp لوحة تفاعل سريعة 96 بئر (0.1 مل) | التحليل | ThermoFisher 4346907 | |
| Prism 7.0a |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن