مقالة منهجية

عزل ثيلاكويدس النشطة فسيولوجيا واستخدامها في فحوصات البروتين الطاقة تعتمد على النقل

DOI:

10.3791/58393

⸱

سبتمبر 28, 2018

 ,  ,  , 
1Department of Plant Biology, University of California - Davis

في هذه المقالة

ملخص

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

نقدم بروتوكولات هنا لعزل عالية الغلة من ثيلاكويدس النشطة فسيولوجيا وفحوصات البروتين النقل بلاستيدات الخضراء التوأم ارجينين إزفاء (كتات)، الافرازية (cpSec1)، وإشارة التعرف على مسارات الجسيمات (كبسرب).

الملخص

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

الجبيلة هي العضيات في النباتات الخضراء المسؤولة عن القيام بالعديد من الأيضية الأساسية، أبرزها عملية التمثيل الضوئي. ضمن المعايشة، النظام غشاء ثايلاكويد يضم جميع أصباغ التمثيل الضوئي ومجمعات مركز رد الفعل، ومعظم حاملات الإلكترون، وهي مسؤولة عن توليف ATP تعتمد على الضوء. أكثر من 90% بروتينات بلاستيدات الخضراء المشفرة في النواة ومترجمة في سيتوسول واستيرادها فيما بعد إلى بلاستيدات الخضراء. زيادة البروتين النقل إلى أو عبر غشاء ثايلاكويد يستخدم واحد من أربعة مسارات إزفاء. هنا، يمكننا وصف أسلوب عالية الغلة لعزل ثيلاكويدس النقل المختصة من البازلاء (بيسوم Pisum)، جنبا إلى جنب مع فحوصات النقل خلال الثلاث تعتمد على الطاقة كبتات و cpSec1، وكبسرب بوساطة مسارات. هذه الأساليب تمكن التجارب المتصلة بالتعريب البروتين ثايلاكويد وعلم الطاقة النقل آليات إزفاء البروتين عبر الأغشية البيولوجية.

المقدمة

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

يجب أن يكون ترانسلوكاتيد ما يقرب من جميع البروتينية الآلية المسؤولة عن وظيفة بلاستيدات الخضراء المناسبة من سيتوسول1. في المغلفات بلاستيدات الخضراء، يتم استيراد ركائز البروتين من خلال ترانسلوكون الغشاء الخارجي (TOC) وترانسلوكون من الغشاء الداخلي (عرة)2. مواصلة استهداف ثايلاكويد غشاء والتجويف يحدث خلال إزفاء (كتات) ارجينين التوأم3و الافرازية (cpSec1)4، إشارة اعتراف الجسيمات (كبسرب)5ومسارات الإدراج التلقائي6 . طريقة لعزل عالية الغلة المعايشة النشطة فسيولوجيا والأغشية ثايلاكويد ضروري لقياس علم الطاقة وحركية الحدث إزفاء، فهم آليات النقل المتنوعة في كل مسار، وتعريب بروتين معين الركيزة لمصلحة أي من المقصورات متميزة ستة من بلاستيدات الخضراء.

عزل أغشية من بلاستيدات الخضراء عروض أفضل التجريبية السيطرة على العوامل البيئية (مثل تركيزات الملح والركيزة، ووجود ATP/غتب، وظروف الأس الهيدروجيني) التي تؤثر على قياس النقل علم الطاقة و حركية. هذه البيئة في المختبر يفسح المجال لاستكشاف تفاصيل إزفاء آليا لنفس الأسباب. وباﻹضافة إلى ذلك، بينما تحسنت البرمجيات التنبؤية لتعريب بروتينات بلاستيدات الخضراء7،8، في المختبر فحوصات النقل توفر طريقة أسرع لتأكيد عبر فحوصات الفلورسنت المستندة إلى الفحص المجهري أن تتطلب علامة نيون وراثيا مرمزة، تحول النباتات و/أو أجسام مضادة محددة. نقدم هنا، بروتوكولات للعزلة بلاستيدات الخضراء وثايلاكويد من البازلاء (بيسوم بسام)، وكذلك لفحوصات النقل الأمثل لكل من المسارات إزفاء ثايلاكويد المعتمدة على الطاقة.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1-المواد الأولى

  1. نقع حوالي 55 غ البازلاء لمدة 3 ساعات في 400 مل ماء المقطر ومن ثم تبذر في علبة بلاستيكية (35 سم × 20 سم × 6 سم) في التربة مغطاة بطبقة رقيقة من الفيرميكوليت.
  2. تنمو في علبة البازلاء عند 20 درجة مئوية تحت الضوء/الظلام (50 µE/م2ق) ح 12/12 دورة 9 إلى 15 يوما.
  3. تعد الركيزة البروتين وفقا لطريقة مفضلة.
    ملاحظة: لقد أعددنا ركائز البروتين باستخدام مجموعة متنوعة من الطرق، بما في ذلك 1) النسخ في المختبر من والبلازميدات المنقي تليها الترجمة باستخدام مقتطفات جرثومة القمح أو أرنب خلية شبكية ليساتيس حضور [ح]3[--لوسين أو [35S]--الميثيونين، 2) في المختبر الترجمة باستخدام مجموعة أدوات ترجمة/نسخ إلى جانب مثل تي أن تي مجموعات من بروميجا، مع راديولابيلينج على النحو المذكور أعلاه، و 3) تنقية البروتين overexpressed في كولاي. عموما هي تطفئ المشعة في المختبر منتجات الترجمة مع 50 ملم حمض أميني الباردة قبل استخدامها في النقل من ردود الفعل. كل من هذه الأساليب يتطلب عادة بعض التحسين لكل الركيزة البروتين الجديد. للحصول على مثال نظام يقترن في المختبر ، راجع لينغ وجارفيس (2016)9.

2-بلاستيدات الخضراء العزلة والتحديد الكمي

ملاحظة: هو الخطوة الأولى في إعداد ثيلاكويدس عزلة المعايشة سليمة10. ينبغي أن تظل جميع المواد الباردة أثناء الإعداد. استثارة للمعايشة ينبغي التعامل معها بلطف، كما الكسر في هذه الخطوة يمكن أن تحد بشدة من الغلة ثايلاكويد اللاحقة.

  1. إعداد عقب حلول مسبقاً.
    1. 2 × Grinding المخزن المؤقت (2xGB): 100 مم حبيس ك الأس الهيدروجيني 7.3، السوربيتول 660 مم، 2 مم مجكل2, 2 مم2من الحركة، 4 مم يدتا، جيش صرب البوسنة 0.2%.
    2. 2 x استيراد المخزن المؤقت (2xIB): 100 مم تريسيني ك أو K-حبيس pH 8.0، السوربيتول 660 ملم، 8 ملم مجكل2.
      ملاحظة: استخدمت تركيزات مجكل2 تتراوح من 3 ملم إلى 10 ملم دون اختلافات ملحوظة.
  2. إعداد تدرج كثافة مستمر سينتريفوجينج خليط من 15 مل بيركول و 15 مل من 2xGB في 30,900 ز في دوار زاوية ثابتة لمدة 30 دقيقة في 4 درجات مئوية مع الفرامل قبالة.
  3. حصاد حوالي 25 جرام البازلاء يوم 9-15 القديمة وتجانسه في 95 مل 1xGB. وقد استخدمت بنجاح خلاط مع شحذ شفرات أو بوليترون. تصفية هذا الخليط من خلال طبقات 2 على الأقل من ميراكلوث في قمع.
    ملاحظة: الحد من كمية الأنسجة الجذعية ليس ضروريا لكن يمكن جعل عملية التذويب أسهل، مما يقلل من الكسر بلاستيدات الخضراء التي يمكن أن تحدث مع مزج المطول.
  4. بيليه في 3,000 ز في دوار دلو يتأرجح لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية، وريسوسبيند برفق في 1 مل 1xGB. قد تكون الرسام أسلوب استثارة أكثر لطيف.
  5. طبقة تعليق الخضراء على رأس التدرج بركل وأجهزة الطرد المركزي في 8,000 ز في دوار دلو يتأرجح لمدة 10 دقائق في 4 درجات مئوية مع الفرامل قبالة بعناية.
  6. حصاد الشريط الأخضر السفلي يحتوي على المعايشة سليمة في أنبوب جديد بعناية. تدور المعايشة سليمة المستردة في 1,800 ز في دوار دلو يتأرجح لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية، وتجاهل المادة طافية ولطف ريسوسبيند بيليه في 1xIB. كرر هذا يغسل الخطوة مرة أخرى، ريسوسبيندينج في 30 مل 1xIB في كل مرة، مع تعليق النهائي في 1 مل 1xIB.
  7. للتحديد الكمي لمحتوى الكلوروفيل (شيلي)، مزيج 10 ميليلتر للمعايشة حراكه تماما مع 5 مل من الأسيتون 80% وتصفية من خلال ورق الترشيح 1 واتمان (سمك الاسمية 180 ميكرون). سجل امتصاص في 720 نانومتر، 663 شمال البحر الأبيض المتوسط، و 645 نانومتر في جهاز المطياف الضوئي وحساب تركيز شيلي باستخدام الصيغة التالية11:
    [شيلي] مغ/مل = [40.2* (663 –720) + 101.4* (645 –720)] * 0.1
  8. ضبط المعايشة إلى 1 مغ/مل مكافئات شيلي مع 1xIB.

3-عزل ثيلاكويدس

ملاحظة: ثيلاكويدس يعدها تحلل ناقص التوتر للمعايشة سليمة. ويتحقق ذلك بتعريض المعايشة للمخزن مؤقت ناقص التوتر التي تفتقر إلى السوربيتول. ثيلاكويدس معزولة يمكن أن تستخدم لفحص أي من مسارات إزفاء، لكن استخراج stromal (جنوب شرق) كما يجب عزلة أثناء إعداد هذا إذا كانت المسارات أما cpSec1 أو كبسرب التحقيق.

  1. إعداد وقت مبكر الحلول التالية.
    1. ناقص التوتر تحلل العازلة: 50 مم تريسيني ك أو K-حبيس pH 8.0، 8 مم مجكل2.
    2. 2 × النفط الخام المخزن المؤقت ستروما (لتركيز SE): 100 مم كحبيس pH 8.0، السوربيتول 660 ملم، 8 ملم مجكل2.
    3. لايملي عينة المخزن المؤقت (للحزب الديمقراطي الصربي صفحة، وتستكمل مع يدتا): 125 ملم تريس الأس الهيدروجيني 6.8، 10% الحزب الديمقراطي الصربي، الجلسرين 20%, 0.05 مغ/مل بروموفينول الأزرق, 10% β-mercaptoethanol، 10 مم يدتا.
  2. إذا كان استرداد سراج الدين ليس ضروريا، الطرد المركزي المعايشة سليمة في 1,000 ز في دوار دلو يتأرجح لمدة دقيقة 6 في 4 درجات مئوية.
    1. تجاهل المادة طافية وريسوسبيند إلى 1 مغ/مل في "المخزن المؤقت لتحلل ناقص التوتر". تبني على الجليد في الظلام لمدة 10 دقيقة، مع خلط أحياناً.
    2. استرداد ثيلاكويدس من سينتريفوجينج في 3,200 ز في يتأرجح دلو الدوار لمدة 8 دقائق في 4 درجات مئوية. أغسل ثيلاكويدس مرتين، ريسوسبيندينج مع 1 إلى 2 مل من المخزن المؤقت لتحلل كل الوقت. ريسوسبيند مع 1 مل 1xIB وريكوانتيفي شيلي أعلاه في البروتوكول العزلة بلاستيدات الخضراء.

4-stromal استخراج الانتعاش وتركيز

  1. إذا كان من الضروري استعادة سراج الدين، تقسيم المعايشة سليمة إلى 600 ميليلتر مختبرين في أنابيب ميكروسينتريفوجي 1.5 مل والطرد المركزي كل أنبوبة في 1,000 ز في يتأرجح دلو الدوار لمدة دقيقة 6 في 4 درجات مئوية.
    ملاحظة: هذا المجلد مناسب عند استخدام أنابيب ميكروسينتريفوجي 1.5 مل، مما يساعد على منع الاضطرابات بيليه في نهاية المطاف للأغشية المتبقية.
    1. ريسوسبيند إلى 1 مغ/مل شيلي في "المخزن المؤقت لتحلل ناقص التوتر" واحتضان على الجليد في الظلام لمدة 10 دقيقة، كما هو الحال في الخطوة 3.2.1.
    2. الطرد المركزي كل أنبوبة في س 3,200 ز في يتأرجح دلو الدوار لمدة 8 دقائق في 4 درجات مئوية ونقل ضوء أخضر أو أصفر طافية التالية بلاستيدات الخضراء تحلل إلى أنبوب ميكروسينتريفوجي جديدة مع وحدة تخزين تساوي 2 × النفط الخام المخزن المؤقت سدى.
    3. أغسل ثيلاكويدس مع وحدات التخزين 2 تحلل المخزن المؤقت (تقارب 0.5 ملغ/مل) وتجميع باستخدام الطرد المركزي في 3,200 ز في يتأرجح دلو الدوار لمدة 8 دقائق في 4 درجات مئوية. ريسوسبيند إلى 1 مغ/مل شيلي في 1xIB على الجليد.
    4. الطرد المركزي ستروما الخام في 42,000 ز في دوار زاوية ثابتة لمدة 30 دقيقة عند 4 درجة مئوية لإزالة أغشية متبقية. يمكن استخدام إيمونوبلوتينج للبروتينات المغلف الخارجي والداخلي للتحقق من نقاء المادة طافية.
    5. جمع 95% الحجم من كل أنبوبة دون إزعاج بيليه الأصفر والأخضر الصغيرة. ملاحظة حجم مأخوذة من كل أنبوبة.
    6. إعداد المقتطف stromal تتركز (SE)، تجمع supernatants جمعها والتركيز على استخدام خمسة إضعاف مركز موكو كاتشين 4 مل 30.
      ملاحظة: سراج الدين أعد بهذه الطريقة ما يعادل ستروما مشتقة من المعايشة في 2.5 ملغ/مل التناظر إذا لزم الأمر، يمكن أن تكون سراج الدين تتركز عشرة إضعاف إلى 5 ملغ/مل مكافئات شيلي. سراج الدين وسيكون اللون الذهبي ولزج. في أجهزة الطرد المركزي المختبر RT أسطورة مع يتأرجح دلو الدوار، وهذا يتطلب حوالي 10 دقيقة لكل مل مركزة.

5-النقل عن طريق كتات المسار

ملاحظة: على عكس cpSec1 أو كبسرب، مسار كبتات لا تتطلب مكونات قابلة للذوبان أو مناشئ إضافة مصادر الطاقة؛ فقط هو القوة الدافعة بروتون يحركها الخفيفة اللازمة3. ولذلك، فقط معزولة من البروتين ثيلاكويدس والركيزة مطلوبة من أجل المقايسة. ركائز النموذجية هي الوسيطة أشكال كاتشين 17 (كما يتضح في الشكل رقم 1) و 23 مفارز كاتشين الأكسجين المتطورة المعقدة، و iOE17 و iOE23، على التوالي، ولكن أشكال السلائف، و prOE17، و prOE23، ويمكن أيضا بنجاح نقلها. تحتوي النماذج السلائف ثنائية الطرفي ن الاستهداف التسلسل الكامل، بينما الأشكال الوسيطة فقط ثايلاكويد استهداف التسلسل.

  1. إعداد مزيج النقل كتات مع 0.33 ملغ/مل ثيلاكويدس شيلي، 5 ملم ATP من مخزون أعدت في 1xIB، وديثيوثريتول 8 مم (DTT) من أسهم على استعداد في 1xIB، على الجليد. ATP غير مطلوب تماما لرد الفعل هذا إذا أجريت تحت الإضاءة.
  2. بدء النقل عن طريق إدخال 01:30 وحدة التخزين بحجم مزيج البروتين الركيزة في النقل. إذا لم تكن مستعدة البروتين الركيزة في 1xIB، إعداد إضعاف مع 2xIB أولاً، ثم استخدم 01:30 وحدة التخزين بحجم من الركازة المخفف في مزيج النقل 1:1.
    ملاحظة: تتنوع استناداً إلى طريقة إعداد تركيزات الركازة. عادة، سيتيح التحضير في المختبر nanomolar للمبالغ micromolar، بينما overexpression سيسمح ل micromolar المبالغ ميليمولار. يجب أيضا النظر في أساليب الكشف، كما أكثر حساسية من إيمونوبلوتينج أوتوراديوجرافي وفلوروجرافي.
  3. إلقاء الضوء على تعليق 80-100 µE/م2s من الإشعاع النشط متعددات (الاسمية) لمدة 10 دقائق في درجة حرارة الغرفة. وإذا لزم حركية النقل، قبل حجته مزيج ثيلاكويدس ورد فعل إلى درجة حرارة الغرفة وتُضِيءُ لمدة تصل إلى 30 دقيقة.
  4. التوقف عن رد فعل النقل مع تمييع 8-fold 1xIB المثلج واسترداد ثيلاكويدس بالطرد المركزي في 3,200 ز في ميكروسينتريفوجي لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية.
  5. إزالة الركازة المتبقية التي لم يكن قد تم نقلها، ريسوسبيند بيليه ثايلاكويد في 120 ميليلتر من 1xIB وهضم البروتين الخارجية بإضافة 6 ميليلتر من 2 مغ/مل ثيرموليسين و 10 مم كاكل2 في 1xIB.
  6. احتضان حوزتي رد فعل على الجليد لمدة 40 دقيقة، وآرو حوزتي ثم بمضاعفة الحجم مع 25 مم يدتا أعدت في 1xIB.
  7. استرداد ثيلاكويدس من سينتريفوجينج في 3,200 ز في ميكروسينتريفوجي لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية. أغسل ثيلاكويدس المستردة في ميكروليتر 120 مم 5 يدتا في 1xIB ونقل إلى أنبوب جديد.
  8. الطرد المركزي في 3,200 ز في ميكروسينتريفوجي لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية. ريسوسبيند في وحدة تخزين مناسبة لايملي عينة المخزن المؤقت تستكمل مع 10 ملم يدتا. حجم ميليلتر 40 عادة ما يكفي كشف الركازة على هلام الحزب الديمقراطي الصربي صفحة ويحافظ على عينة لتكرار الهلام عند الضرورة.
  9. وضع العينات في حمام مائي يغلي لمدة 10 دقائق وتحليلها بالحزب الديمقراطي الصربي صفحة. قد استخدمت بنجاح لكشف البروتينات نقلها أوتوراديوجرافي أو فلوروجرافي، أو النشاف الغربية من البروتينات غير أصلي أو حانمه معلم.

6-النقل من خلال مسار cpSec1

ملاحظة: النقل من خلال ترانسلوكون cpSec1 يتطلب البروتين stromal cpSecA112،13، التي يمكن شراؤها عبر overexpression في14، كولاي15 أو استردادها من خلال التركيز ستروما خلال ثايلاكويد العزلة. هو ركيزة نموذجية فرعية كاتشين 33 من الأكسجين في التطور المعقدة (prOE33)، كما هو مبين في الشكل 2.

  1. إعداد مزيج cpSec1 النقل مع 0.33 ملغ/مل ثيلاكويدس شيلي، شيلي 0.83 مغ/مل سي أي ما يعادل أو 1.5 ميكروغرام من cpSecA1 المؤتلف، و 5 ملم ATP على الجليد، واحتضان لمدة 10 دقائق. خليط رد فعل نقل نموذجية هنا 72 ميكروليتر، يصل من 60 ميكروليتر بسبب إضافة سراج الدين.
    1. إذا كان سيتم استخدام cpSecA1 المؤتلف بدلاً من سراج الدين، ضبط cpSecA1 المنقي مع حجم متساوية من 2xIB، ثم تضعف بتركيز مناسب لإضافة إلى ردود فعل النقل (مثلاً، 0.75 ميكروغرام/ميليلتر).
      ملاحظة: للتخزين على المدى الطويل، cpSecA1 يتم تخزين على الجليد في غرفة مبردة، والتي تسيطر عليها بعد تنقية كما يلغي تجميد النشاط.
  2. بدء النقل عن طريق إدخال 01:10 وحدة التخزين بحجم مزيج البروتين الركيزة للنقل. إذا لم تكن مستعدة البروتين الركيزة في 1xIB، إعداد إضعاف 1:1 مع 2xIB وإضافة 01:10 وحدة التخزين بحجم البروتين المخفف لهذا المزيج النقل.
  3. تبني رد الفعل في درجة حرارة الغرفة لمدة 10 دقائق تحت 80 – 100 µE/م2s الاسمية. مرة أخرى، قد يلزم وقت أطول لحركية أو بعض ركائز.
  4. بعد المعالجة الخفيفة، تمييع 8 إضعاف مع ردود فعل 1xIB وأجهزة الطرد المركزي المثلج في 3200 ز في ميكروسينتريفوجي لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية.
  5. تعامل مع ثيرموليسين وآرو مع يدتا أعلاه في خطوات 5.5 من خلال 5.7.
  6. الطرد المركزي في 3,200 ز في ميكروسينتريفوجي لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية وريسوسبيند بيليه في وحدة تخزين مناسبة لايملي عينة المخزن المؤقت تستكمل مع 10 ملم يدتا. مكان في حمام الماء لمدة 10 دقيقة قبل تحميلها على الحزب الديمقراطي الصربي صفحة جل يغلي.

7-الإدراج عن طريق كبسرب المسار

ملاحظة: يتطلب إدماج كبسرب بوساطة الضوء حصاد البروتينات المعقدة (لهكب) ينظر في الشكل 3 cpSRP54 و cpSRP43، وكبفتسي16. يتم توفير هذه المكونات إلى رد فعل النقل عن طريق استخراج stromal مركزة، كما هو موضح لبروتوكول النقل cpSec1.

  1. إعداد كبسرب نقل المزيج مع 0.33 ملغ/مل ATP شيلي ثيلاكويدس، 0.83 مغ/مل شيلي يعادل سراج الدين، و 5 ملم على الجليد واحتضان لمدة 10 دقائق.
  2. بدء النقل عن طريق إدخال 01:10 وحدة التخزين بحجم مزيج البروتين الركيزة للنقل. إذا لم تكن مستعدة البروتين الركيزة في 1xIB، إعداد إضعاف 1:1 مع 2xIB وإضافة 01:10 وحدة التخزين بحجم البروتين المخفف لهذا المزيج النقل.
  3. تبني رد الفعل في درجة حرارة الغرفة لمدة 10 دقيقة في 80 – 100 µE/م2s الاسمية.
  4. بعد المعالجة الخفيفة، تمييع 8 إضعاف مع ردود فعل 1xIB وأجهزة الطرد المركزي المثلج في 3,200 ز في ميكروسينتريفوجي لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية. تجاهل المادة طافية وريسوسبيند بيليه في 120 ميليلتر من 1xIB.
  5. تعامل مع ثيرموليسين أعلاه في أقسام 5.5 من خلال 5.7. الهضم ثيرموليسين ضروري هنا لتقييم التكامل غشاء ناجحة. أغسل ثيلاكويدس المستردة في ميكروليتر 120 مم 5 يدتا في 1xIB ونقل إلى أنبوب جديد.
  6. الطرد المركزي في 3,200 ز في ميكروسينتريفوجي لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية وريسوسبيند بيليه مرة أخرى في وحدة تخزين مناسبة العازلة x Laemmli 2 وتستكمل مع 10 ملم يدتا. مكان في الغليان حمام الماء لمدة 10 دقيقة قبل التحليل بالحزب الديمقراطي الصربي صفحة.
    ملاحظة: يتم تقييم إدماج ناضجة لهكب (ملهكب) بظهور المنتجات المحمية بحوزتي التدهور (ملهكب-د) حوالي 1.5-2 كاتشين أصغر من ملهكب أونكليفيد17.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

لقياس كمية الركازة نقلها بنجاح، فإنه مفيد لتشمل الممرات "إدخال النسبة المئوية" واحد أو أكثر. واستخدمت البيانات المعروضة أدناه، 10% من رد فعل النقل النهائي دون ثيلاكويدس. هذا "إدخال النسبة المئوية" كما يساعد على تصور حجم الركيزة السلائف. النسبة المئوية تمثل كمية محددة ومعروفة للركيزة التي على الركازة مقارنة نقل ضد ويمكن تحجيمها لأعلى أو أسفل كما يلزم في البداية باستخدام إعداد البروتين. بالإضافة إلى ذلك، فمن المستحسن تحميل أقل من 4 ميكروغرام من مكافئات شيلي في ممر واحد على 0.75 مم polyacryl...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

عزل بلاستيدات الخضراء وثايلاكويد

يمكن أن يؤدي إلى الكسر المفرط في بلاستيدات الخضراء الفقراء العزل ومن ثم ثايلاكويد الفقيرة تسفر عن بعد الانفصال في التدرج. فمن الأفضل مجانسة الأنسجة المقطوع بلطف بضمان أن جميع المواد هي غارقة قبل المزج والنبض في 15 ثانية دورات حتى تجانس تماما. إذا لزم الأمر، استخدم عدة جولات أقصر من المزج مع أنسجة أقل في كل جولة.

التبريد جميع المواد التي تتلامس مع الأنسجة المقطوع يساعد المعايشة معزولة الإبقاء على نشاط يصل إلى ساعتين. من المهم الاحتفاظ ال...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

الكتاب ليس لها علاقة بالكشف عن.

شكر وتقدير

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

وقد أعدت هذه المخطوطة مع التمويل من شعبة العلوم الكيميائية وعلوم الأرض، والعلوم البيولوجية، مكتب 408 من علوم الطاقة الأساسية "إدارة الطاقة الأمريكية" عن طريق المنح دي-SC0017035

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
Pisum sativum< / em> seedsSeedway LLC، Hall، NY8686 - Little Marvel
MiraclothCalbiochem، Gibbstown، NJ475855-1
80٪ AcetoneSigma ، سانت لويس ، MO67-64-1
خلاط بشفرات حادةWaring CommercialBB155S
Polytron 10-35Fischer Sci13-874-617
بيركولسيجما ، سانت لويس ، ميزوريGE17-0891-01
بيكمان J2-MC مع دوار JA 20بيكمان كولتر8043-30-1180
سورفال RC-5B مع دوار HB-4سورفال8327-30-1016
100 ملي مولار ديثيوثريتول (DTT) في 1xIBسيجما ، سانت لويس ، ميزوري12/3/83يمكن تجميدها في حصص للاستخدام المستقبلي
200 ملي مولار MgATP في 1xIBسيجما ، سانت لويس ، ميزوري74804-12-9يمكن تجميدها في حصص للاستخدام المستقبلي
Thermolysin في 1xIB (2 مجم / مل)Sigma ، Saint Louis ، MO9073-78-3يمكن تجميدها في حصص للاستخدام المستقبلي
HEPESSigma ، سانت لويس ، MOH3375
K-TricineSigma ، سانت لويس ، MOT0377
SorbitolSigma ، سانت لويس ، MO50-70-4
كلوريد المغنيسيومسيجما ، سانت لويس ، ميزوري7791-18-6
كلوريد المنغنيزسيجما ، سانت لويس ، ميزوري13446-34-9
EDTAسيجما ، سانت لويس ، ميزوري60-00-4
BSAسيجما ، سانت لويس ، ميزوري9048-46-8
تريسسيجما ، سانت لويس ، ميزوري77-86-1
SDSسيجما ، سانت لويس ، ميزوري151-21-3
جلسرينسيجما ، سانت لويس ، ميزوري56-81-5
بروموفينول بلوسيجما ، سانت لويس ، ميزوري115-39-9
B-MercaptoethanolSigma ، سانت لويس ، ميزوري60-24-2

المراجع

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Ellis, R. Chloroplast protein synthesis: principles and problems. Sub-cellular biochemistry. 9, 237(1983).
  2. Li, H. -m, Chiu, C. -C. Protein transport into chloroplasts. Annual review of plant biology. 61, (2010).
  3. Cline, K., Ettinger, W., Theg, S. M. Protein-specific energy requirements for protein transport across or into thylakoid membranes. Two lumenal proteins are transported in the absence of ATP. Journal of Biological Chemistry. 267 (4), 2688-2696 (1992).
  4. Skalitzky, C. A., et al. Plastids contain a second sec translocase system with essential functions. Plant physiology. 155 (1), 354-369 (2011).
  5. Dabney-Smith, C., Storm, A. Plastid Biology. , Springer. 271-289 (2014).
  6. Kim, S. J., Jansson, S., Hoffman, N. E., Robinson, C., Mant, A. Distinct "assisted" and "spontaneous" mechanisms for the insertion of polytopic chlorophyll-binding proteins into the thylakoid membrane. Journal of Biological Chemistry. 274 (8), 4715-4721 (1999).
  7. Emanuelsson, O., Nielsen, H., Von Heijne, G. C. hloroP. ChloroP, a neural network-based method for predicting chloroplast transit peptides and their cleavage sites. Protein Science. 8 (5), 978-984 (1999).
  8. Emanuelsson, O., Brunak, S., Von Heijne, G., Nielsen, H. Locating proteins in the cell using TargetP, SignalP and related tools. Nature protocols. 2 (4), 953(2007).
  9. Ling, Q., Jarvis, R. Analysis of protein import into chloroplasts isolated from stressed plants. Journal of Visualized Experiments. (117), e54717(2016).
  10. Lo, S. M., Theg, S. M. Photosynthesis Research Protocols. , Springer. 139-157 (2011).
  11. Vernon, L. P. Spectrophotometric determination of chlorophylls and pheophytins in plant extracts. Analytical Chemistry. 32 (9), 1144-1150 (1960).
  12. Knott, T. G., Robinson, C. The secA inhibitor, azide, reversibly blocks the translocation of a subset of proteins across the chloroplast thylakoid membrane. Journal of Biological Chemistry. 269 (11), 7843-7846 (1994).
  13. Yuan, J., Henry, R., McCaffery, M., Cline, K. SecA homolog in protein transport within chloroplasts: evidence for endosymbiont-derived sorting. Science. 266 (5186), 796-798 (1994).
  14. Nohara, T., Nakai, M., Goto, A., Endo, T. Isolation and characterization of the cDNA for pea chloroplast SecA Evolutionary conservation of the bacterial-type SecA-dependent protein transport within chloroplasts. FEBS letters. 364 (3), 305-308 (1995).
  15. Endow, J. K., Singhal, R., Fernandez, D. E., Inoue, K. Chaperone-assisted post-translational transport of plastidic type I signal peptidase 1. Journal of Biological Chemistry. 290 (48), 28778-28791 (2015).
  16. Luirink, J., Sinning, I. SRP-mediated protein targeting: structure and function revisited. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Molecular Cell Research. 1694 (1-3), 17-35 (2004).
  17. Yuan, J., Henry, R., Cline, K. Stromal factor plays an essential role in protein integration into thylakoids that cannot be replaced by unfolding or by heat shock protein. Hsp70. Proceedings of the National Academy of Sciences. 90 (18), 8552-8556 (1993).
  18. Tjalsma, H., van Dijl, J. M. Proteomics-based consensus prediction of protein retention in a bacterial membrane. Proteomics. 5 (17), 4472-4482 (2005).
  19. Widdick, D. A., Eijlander, R. T., van Dijl, J. M., Kuipers, O. P., Palmer, T. A Facile Reporter System for the Experimental Identification of Twin-Arginine Translocation (Tat) Signal Peptides from All Kingdoms of Life. Journal of Molecular Biology. 375 (3), 595-603 (2008).
  20. Yuan, J., Cline, K. Plastocyanin and the 33-kDa subunit of the oxygen-evolving complex are transported into thylakoids with similar requirements as predicted from pathway specificity. Journal of Biological Chemistry. 269 (28), 18463-18467 (1994).
  21. Kirchhoff, H., Borinski, M., Lenhert, S., Chi, L., Büchel, C. Transversal and lateral exciton energy transfer in grana thylakoids of spinach. Biochemistry. 43 (45), 14508-14516 (2004).
  22. Frielingsdorf, S., Jakob, M., Klösgen, R. B. A stromal pool of TatA promotes Tat-dependent protein transport across the thylakoid membrane. Journal of Biological Chemistry. 283 (49), 33838-33845 (2008).
  23. Tu, C. -J., Schuenemann, D., Hoffman, N. E. Chloroplast FtsY, chloroplast signal recognition particle, and GTP are required to reconstitute the soluble phase of light-harvesting chlorophyll protein transport into thylakoid membranes. Journal of Biological Chemistry. 274 (38), 27219-27224 (1999).

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

cpTat cpSec1 cpSRP ysis Percoll

مقالات ذات صلة