$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
في هذا البروتوكول، وصيانة الزرد الكبار امتثالا للوائح المحلية الرفق بالحيوان كما أقرته اللجنة المحلية الرفق بالحيوان. وأجريت تجارب على الأجنة وفقا لتوجيهات 2010/63/الاتحاد الأوروبي.
1-إعداد "البكتيريا فقط" وتعليق البكتيريا-الجزئي المجالات الخرز الصغير
ملاحظة: يتم استخدام سلالة RN4220 S. aureus معربا عن البروتين الفلورسنت مشري (S. aureus-مشري). سلالة RN4220 في المذهبة س. هو تحور في أغرا (منظم الجينات الملحق A) منظم الجينات الفوعة34، وذلك قد فوعة منخفضة نسبيا في الطراز الجنين الزرد. ويمكن استخدام سلالات المكوّرات س. الأخرى أو غيرها من الأنواع البكتيرية لأي.
-
يأخذ 4 إلى 5 مستعمرات من البكتيريا المكوّرات س. RN4220 من فول الصويا تريبتيك أجار الثقافة لوحات تستكمل مع 10 ميكروغرام/مل الكلورامفينيكول والثقافة البكتيريا إلى مرحلة النمو منتصف لوغاريتمي في 10 مل مرق الصويا تريبتيك تكملة مع 10 ميكروغرام/مل الكلورامفينيكول في 37 درجة مئوية تحت تهتز.
- خلال الثقافة، وتمييع 100 ميليلتر من تعليق البكتيرية في 900 ميليلتر من الفوسفات العقيمة مخزنة المالحة (PBS) في ومبومو (عرض 1 سم) لقياس كثافة بصرية (OD) في 620 نانومتر (OD620). الثقافة البكتيريا حتى OD620 يصل إلى 0.4 – 0.8.
ملاحظة: عموما يناظر التطوير التنظيمي620 من 0.1 3.0 x 107 زيمبابوي/مل س المذهبة. OD620 من العدوى البكتيريا في منتصف مرحلة النمو لوغاريتمي ما بين 0.4 0.8. قد يلزم فترات زمنية مختلفة لاستزراع أنواع وسلالات من البكتيريا الأخرى.
- إعادة وقف البكتيريا الأعلاف في 1 مل PBS العقيمة والطرد المركزي البكتيريا في س 3,500 ز لمدة 10 دقائق. بعد ذلك يغسل البكتيريا مع أوقات PBS 2 العقيمة، وأخيراً إعادة تعليق البكتيريا في 1.1 مل محلول40 (40من حماية الأصناف النباتية) بوفيدون 4% (w/v) في برنامج تلفزيوني.
- دوامة هذا التعليق البكتيرية وتمييع ميليلتر 100 تعليق في 900 ميليلتر من PBS العقيمة في ومبومو لقياس620 OD. ضبط تركيز تعليق البكتيرية مع الحل40 حماية الأصناف النباتية. وهذا تعليق "للبكتيريا فقط".
- ويمكن اختيار الحيوية بحرية لخلط مع تعليق البكتيرية. وتستخدم في هذه الدراسة، الجزئي المجالات التجارية البوليستيرين (PS) الخرز الصغير (الفلورية الزرقاء، 10 ميكرومتر). لإنشاء تعليق بكتيريا-الجزئي المجالات الخرز الصغير، الطرد المركزي الجزئي المجالات الخرز الصغير لمدة 1 دقيقة في 1,000 ز x، درجة حرارة الغرفة، وتجاهل المادة طافية وإعادة تعليق الجزئي في المجالات الخرز الصغير في تعليق "للبكتيريا فقط" (في حماية الأصناف النباتية40 الحل).
- من أجل حقن جرعات متساوية تقريبا من البكتيريا في الوجود وفي غياب الجزئي المجالات الخرز الصغير، تركيز التعليق الجزئي المجالات الخرز الصغير-البكتيريا يجب أن يكون ثلثا تركيز تعليق "للبكتيريا فقط" (بدون الجزئي المجالات الخرز الصغير). ويتحقق ذلك بتمييع تعليق البكتيريا-الجزئي المجالات الخرز الصغير بحجم 0.5 من حل40 حماية الأصناف النباتية. مزيج أن الإيقاف قبل فورتيكسينج. من المذكرة، هذه النسبة (ثلثي) قد جرى تقييم المذهبة س. كما أنها مناسبة ابيديرميديس س.، ولكن ينصح بالتحقق من ما إذا كانت هذه النسبة ينطبق أيضا على غيرها من الأنواع البكتيرية والأحجام (من 10 ميكرون) أو الأشكال الحيوية (من الجزئي المجالات الخرز الصغير) بالحقن.
- فحص تركيز تعليق "للبكتيريا فقط" والبكتيريا-الجزئي المجالات الخرز الصغير بثقافة الكمية لتخفيف المسلسل إذ وصفها أدناه: نقل 100 ميليلتر من المعلقات إلى 96 لوحة جيدا وتمييع متسلسل بنقل 10 ميليلتر مختبرين تعليق إلى 90 ميليلتر من PBS العقيمة. لوحة مختبرين ميليلتر 10 مكرر من المعلقات غير مخفف والمخفف على ألواح [اغروس]، واحتضان لوحات عند 37 درجة مئوية بين عشية وضحاها، عد المستعمرات وحساب أرقام البكتيريا (الوحدات المكونة للمستعمرة. زيمبابوي).
2-تربية، الحصاد، والحفاظ على الأجنة الزرد
- اتبع الإجراءات العامة وصف سابق35،36 لتربية والحصاد، والحفاظ على الأجنة الزرد، مع إدخال التعديلات المبينة أدناه. عبر أسرة من نوع البرية توفيل زعنفة طويلة (TL) الزرد أو الزرد للسطر المحدد وراثيا (هنا، Mpeg1: كايد) في دبابة مع صافي إضافة إلى حمل الإناث البالغات لإنتاج البيض بعد يضيء الضوء، ثم فصل البالغين من البيض المنتجة.
- جمع الأجنة في اليوم التالي، وتجاهل تلك غير الشفافة التي لا تكون قابلة للتطبيق. تبقى حوالي 60 أجنة كل طبق بتري (100 ملم في القطر) في E3 المتوسطة37 واحتضان عند 28 درجة مئوية. إزالة أجنة ميتة وغير طبيعي، وتحديث المتوسطة E3 يوميا.
3-التحضير للحقن بالإبر
- تعد الإبر ميكروكابيلاري الزجاج للحقن باستخدام أداة ساحبة ميكروبيبيتي. استخدم الإعدادات التالية: الحرارة: 772، سحب: حطي 100،: 200، الوقت: الغاز 40،: 75.
- كسر طرف إبرة مع الملقط في موضع الإبرة فيها قطر خارجي لما يقرب من 20 ميكرومتر (عن 10 ميكرون الجزئي المجالات الخرز الصغير)، استخدام مجهر خفيفة مع شريط مقياس في العين. تجنب الإبر مع حجم فتحه كبيرة جداً، كما أنها سوف تهدد بقاء الأجنة.
ملاحظة: ويمكن اختيار فتح يكون أصغر أو أكبر، تبعاً لحجم وشكل الحيوية بالحقن. في الأدب، أبلغ الحقن باستخدام الإبر مع فتح من حوالي 50 ميكرومتر يسبب انخفاضا كبيرا في بقاء الجنين38.
4-حقن "البكتيريا فقط" أو التعليق الجزئي المجالات الخرز الصغير-البكتيريا في الأجنة الزرد
- حرارة [اغروس] حل (1 – 1.5% (wt) في المياه ديمي) باستخدام فرن ميكروويف وتصب في طبق بتري 100 ملم. ضع قالب بلاستيكية العفن على رأس الحل [اغروس] في طبق بتري لإنشاء المسافات البادئة في [اغروس] لوضع الأجنة في المواقف المناسبة، تسهيل الحقن. احتضان في درجة حرارة الغرفة وإزالة العفن عندما قد وطدت الحل [اغروس].
- في 3 د بعد الإخصاب، وضع الأجنة في طبق بتري 100 ملم تحتوي على 0.02% (w/v) حمض 3-امينوبنزويك (تريكيني) تخدير لهم. بعد 5 دقائق، نقل الأجنة إلى اللوحة [اغروس] مضافين مع E3 المتوسطة التي تحتوي على 0.02% (w/v) تريكيني ومواءمتها في اتجاه واحد للحقن. Mpeg1: خط المعدلة وراثيا كايد أولاً تخدير الأجنة في E3 المتوسطة تحتوي على 0.02% (w/v) تريكيني. ثم حدد الأجنة معربا عن البروتينات الفلورية الخضراء باستخدام مجهر الأسفار ستيريو.
-
تحميل الإبرة مع حوالي 10 ميليلتر من تعليق "للبكتيريا فقط" أو البكتيريا-الجزئي المجالات الخرز الصغير باستخدام تلميح ماصة ميكرولوادير. جبل الإبرة على ميكرومانيبولاتور متصلاً مايكرو-الحاقن. لتستخدم محقن هنا (انظر الجدول للمواد)، استخدام الإعدادات التالية لحقن nL 2 – 3: الضغط: الضغط الخلفي 300 – 350،: 0, الوقت: 2 مللي ثانية.
ملاحظة: تعتمد إعدادات مايكرو-الحاقن على محقن المستخدمة. إعدادات حاقن قد تحتاج إلى تعديل لحقن البكتيريا مختلطة مع الحيوية مع أحجام أو أشكال أخرى.
- استخدام الإبر مع فتح نفسه لحقن تعليق "للبكتيريا فقط" ووقف البكتيريا-الجزئي المجالات الخرز الصغير. إذا كان الإبرة مكسورة أو انسداد، دائماً تغيير إبرة جديدة لمزيد من الحقن.
- إدراج الإبرة في النسيج العضلي للأجنة تحت مجهر خفيفة (الشكل 1)، بزاوية من 45-60 درجة مئوية بين الإبرة والجسم للأجنة. ضبط موضع الإبرة في الأنسجة بلطف أنها تتحرك جيئة وذهابا. حقن الأجنة باستخدام دواسة قدم متصلاً مايكرو-الحاقن.
- بعد حقن البكتيريا الفلورسنت، نقاط الأجنة لعدوى ناجحة تحت مجهر fluorescence ستيريو. تجاهل السلبية الأجنة وسجل (لا البكتيريا الفلورسنت مرئية أو لا تظهر الجزئي الفلورسنت المجالات الخرز الصغير). الحفاظ على الأجنة على حدة في E3 المتوسطة في لوحات 48-جيدا. قم بتحديث في المتوسط يوميا.
5. سحق الأجنة والتهديف المجهرية، والثقافة كمية من البكتيريا
- نقاط جميع أجنة مجهريا لوجود البكتيريا الفلورية استخدام مجهر الأسفار ستيريو، البدء فورا بعد الحقن، وفي كل يوم بعد ذلك حتى الأجنة يتم اختيارها عشوائياً للثقافة الكمية.
- عشوائياً تحديد الأجنة المصابة حية قليلة (5 إلى 6 في هذه الدراسة) بعد الحقن بوقت قصير ونقلها على حدة إلى microtubes مل 2 منفصلة باستخدام النصائح العقيمة. إزالة المتوسطة وتغسل الأجنة بلطف مع PBS العقيمة مرة واحدة وإضافة 100 ميليلتر من PBS العقيمة.
- إضافة الخرز الزركونيا العقيمة 2 – 3 (قطرها 2 ملم) لكل قنينة وسحق الأجنة في الخالطون باستخدام (انظر الجدول للمواد) 3,500 لفة في الدقيقة لمدة 30 س. الثقافة هوموجيناتي كيفا وكما هو موضح في الخطوة 1، 3.
ملاحظة: الخالطون أخرى قد تتطلب إعدادات مختلفة.
- عشوائياً اختيار أجنة متعددة في الأيام اللاحقة بعد الحقن لثقافة الكمية وفقا للخطوة 5.3.
6-الأسفار مجهرية من تطور الإصابة وتسلل خلية استفزاز في الأجنة الزرد
- تخدير الأجنة كما هو موضح في الخطوة 4، 2. "الماصة؛" 500 ميليلتر حل السليلوز الميثيل PBS-2% (wt) في طبق بتري يحتوي على المتوسطة E3 مع 0.02% (w/v) تريكيني. وضع الأجنة في الحل الميثيل السليلوز وإبقائها مستقيمة وأفقية.
ملاحظة: يستخدم الميثيل السليلوز الحل "غراء"، الذي سبب لها اللزوجة، يمكن مؤقتاً تجميد الأجنة في اتجاه أفضل للتصوير.
- استخدام مجهر الأسفار ستيريو مزودة بمرشحات للأجنة الصورة الفردية ضمن إعدادات الأمثل مماثلة (مثل، كثافة والكسب، والتعرض الوقت) في التكبير 160 x ميدان مشرق، مشري، والبروتينات الفلورية الخضراء (التجارة والنقل)، والأشعة فوق البنفسجية . قم بتعيين المستوى البؤري مثل الأنسجة الأضرار الناجمة عن الحقن في التركيز، باستخدام عامل التصفية حقل مشرق. تعيين عمق المكدس Z بحجم 10 ميكرون، وخطوة في 5 ميكرومتر، الذي يسمح بتسجيل الصور على التوالي 3.
- صورة فردية الأجنة مرة واحدة يوميا من الحقن بعد ح 5 حتى 3 أيام بعد الحقن. استبعاد أجنة ميتة (لا ضربات القلب أو الجنين جزئيا المتدهورة) لمواصلة التصوير والتحليل. الحفاظ على الأجنة على حدة في E3 المتوسطة في لوحات 48-جيدا. قم بتحديث في المتوسط يوميا.
7-التحليل الكمي لكثافة Fluorescence تطور العدوى وتسلل خلية تسبب استخدام كائن ي ملف المشروع "الزرد-إيمونوتيست"
- تحميل "الزرد-إيمونوتيست"، ودليل تفصيلي من الارتباط: < https://sils.fnwi.uva.nl/bcb/objectj/examples/zebrafish/MD/zebrafish-immunotest.htmL>، كما هو موضح في دراسة سابقة33. باختصار، فتح الصور للتحليل مع "الزرد-إيمونوتيست"، يعمل بموجب برنامج مجاني "صورة ج." في كل صورة تم تحميلها، يدوياً علامة الحقن استناداً إلى تلف الأنسجة الملحوظ للأجنة.
ملاحظة: يستخدم الموقع ملحوظة "الزرد-إيمونوتيست" كنقطة المركز للكشف عن ذروة الأسفار على مسافة 50 ميكرومتر. ثم يتم استخدام ذروة fluorescence تم الكشف عنها كمركز لمنطقة موحدة (قطرها 100 ميكرومتر) لقياس الأسفار.
- انقر فوق "حساب" في القائمة "كائن ي" لتشغيل قياس الفلورسنت لقنوات متعددة، إذا كان ذلك ممكناً، لكل الصور تلقائياً. تصدير البيانات وتحليلها بطرق الاختبار الإحصائية المناسبة.