RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ar
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Meihua Wan1,2, Pouya Amrollahi2,3, Dali Sun4, Christopher Lyon2,3, Tony Y. Hu2,3
1Department of Integrated Traditional Chinese and Western Medicine,West China Hospital of Sichuan University, 2Virginia G. Piper Biodesign Center for Personalized Diagnostics, The Biodesign Institute,Arizona State University, 3School of Biological and Health Systems Engineering,Arizona State University, 4Department of Electrical and Computer Engineering,North Dakota State University
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
ويعوق الترجمة السريرية للخلايا الحيوية المشتقة من الخلايا الاحيائيه المصابة والخبيثة الافتقار إلى طرق التحديد الكمي السريعة والدقيقة. يصف هذا التقرير استخدام صور المجهر منخفضه التكبير في الحقل المظلم لقياس أنواع فرعيه معينه من النوع exosome في المصل الصغير الحجم أو عينات البلازما.
الخلايا المصابة أو الخبيثة في كثير من الأحيان تفرز المزيد من الجذور ، مما يؤدي إلى مستويات مرتفعه من الأورام المصاحبة للمرض في الدورة الدموية. هذه التماثيل لديها القدرة علي ان تكون بمثابه المؤشرات الحيوية لتشخيص الامراض ورصد تطور المرض واستجابه العلاج. ومع ذلك ، فان معظم إجراءات تحليل exosome تتطلب العزلة exosome وتنقيه الخطوات ، والتي عاده ما تستغرق وقتا طويلا وكثيفه العمالة ، التالي من فائده محدوده في الإعدادات السريرية. يصف هذا التقرير الاجراء السريع لتحليل المؤشرات الحيوية المحددة علي الغشاء الخارجي لل exosomes دون الحاجة إلى عزل منفصلة وخطوات تنقيه. في هذه الطريقة ، يتم القبض علي التماثيل علي سطح الشريحة من قبل الأجسام المضادة الخاصة exosomes ومن ثم التهجين مع مجسات الأجسام المضادة جسيمات متناهي-مترافق محدده لمرض. بعد التهجين ، يتم تحديد وفره من السكان exosome الهدف عن طريق تحليل منخفضه التكبير المجهر الحقل المظلم (LMDFM) الصور من جسيمات نانويه منضم. ويمكن اعتماد هذا النهج بسهوله للبحوث والاستخدام السريري لتحليل الاغشيه المرتبطة بالغشاء الحيوي exosome مرتبطة بالمرض.
يتم الإفراج عن التماثيل من معظم أنواع الخلايا وتلعب دورا رئيسيا في الاتصالات من الخلية إلى الخلية ، بما في ذلك العمليات الفيزيولوجيا المرضية المرتبطة بالامراض المختلفة ، لأنها يمكن ان تكون موطنا لأنسجه محدده أو أنواع الخلايا ، وتحتوي علي مجموعه متنوعة من الأحماض النووية ، والبروتينات ، والدهون التي تعكس الخلية الاصليه ويمكن ان تمارس اثارا تنظيميه علي الخلايا المتلقية لها1،2،3،4. غالبا ما تفرز التماثيل في مستويات مرتفعه في الدول المرض ، ويمكن ان تتفاعل مع كل من الخلايا المتجاورة والبعيدة ، ووجدت في تركيز عال نسبيا في الدورة الدموية ، فضلا عن معظم سوائل الجسم الأخرى ، بما في ذلك اللعاب والبول والبنكرياس والصفراء عصير ، وغسل القصبات السائل5، 6،7،8،9،10،11. هذا وفره واستقرار التماثيل في سوائل الجسم البشري ، إلى جانب طبيعتها الغنية بالمعلومات ، يجعلها العلامات الحيوية المثالية لتشخيص الامراض ورصد العلاج.
وهذا يشمل الأورام المشتقة من الورم (TDEs) ، والتي تحتوي علي عوامل الورم محدده أو انتقائية ، والتي يمكن ان تكون بمثابه المؤشرات الحيوية المرض ، بما في ذلك الأورام المرتبطة الورم المصاحبة. TDEs يمكن ان تشارك في أعاده عرض البيئة المجهرية الورم لتسهيل نمو الورم والانبثاث ، وتنظيم الاستجابات المضادة للورم12. زيادة إفراز TDE هو النمط الظاهري الشائع لمعظم أنواع السرطان والعديد من الميزات من البيئة المجهرية الورم ، بما في ذلك نقص الأكسجين ، والحموضة الحمضية ، والتهاب ، ومن المعروف ان تعزيز إفراز exosome. ومن المستغرب ، نظرا لعدد من الخلايا التي تفرز الجذور ، وزيادة في المستوي الإجمالي exosomes يمكن ، في حد ذاته ، تعمل بوصفها العلامات البيولوجية السرطان. علي سبيل المثال ، وجدت دراسة حديثه ان تركيز EV الكلي في عصير الصفراء يميز الخبيثة وغير الخبيثة في المرضي تضيق القناة الصفراوية المشتركة مع 100 ٪ دقه7. وقد تم العثور علي نتائج مماثله مع الدراسات باستخدام سوائل الجسم الأخرى, بما في ذلك البلازما. ومع ذلك ، نظرا لاحتمال الخضوع لاختلاف الموضوع ، وغيرها من العوامل المربكة ، ركزت معظم الدراسات التحقيق في التماثيل البيولوجية كمرض المؤشرات الحيوية علي الكشف عن المؤشرات الحيوية التي ترتبط بشكل انتقائي مع TDEs بدلا من مجموع exosomes ارقام.
ترجمه المؤشرات الحيوية exosome في الممارسة السريرية ، ومع ذلك ، لا يزال تحديا لان معظم التقارير التي أبلغت عنها النهج المقايسة تتطلب وقتا طويلا وإجراءات العزل كثيفه العمالة 13. وتشمل أساليب العزل exosome شعبيه حاليا ultracentrifugation حلول ، والتدرجات الكثافة ، وحجم الاستبعاد ، والامطار المشتركة ، والتقاط التقارب ، ونهج العزلة ميكروفلويديك. Ultracentrifugation حلول هو "المعيار الذهبي" الأسلوب ، والأكثر شيوعا لعزل exosome ، ولكن هذا الاجراء يستغرق وقتا طويلا والنتائج في الضرر exosome والتكتلات غشاء exosome ، وتنتج عينات exosome التي هي ملوثه مع البروتينات والبروتينات الدهنية وغيرها من العوامل التي يمكن ان تؤثر علي التحليلات اللاحقة14. معظم أساليب العزلة exosome ، بما في ذلك التسميد ، لا يمكن فصل التماثيل (30-150 نانومتر) من الحويصلات الصغرى (100-1000 نانومتر) والهيئات ابوتوتيك (100-5000 نانومتر) ، التي تنشا من خلال أليات مختلفه ولها وظائف مختلفه ، نظرا لحجم التداخل بين هذه المجموعات ، وتنوع السكان exosome15. هناك حاجه إلى نهج جديده لتحسين حساسية واستنساخ من اختبارات exosome عن طريق تحسين الانتعاش exosome مع الحد من الضرر exosome والتلوث ، علي الرغم من ان اي اختبارات علي أساس مثل هذه الأساليب سوف تحتاج أيضا إلى ان تكون الأمثل لجعلها مناسبه للترجمة إلى التطبيقات في الإعدادات السريرية.
وقد اقترحت العديد من الدراسات الحديثة لاستخدام منصات متكاملة للتقاط وتحليل التماثيل مباشره من سوائل الجسم. تستخدم هذه الطرق ميكروفلويدريك ، كهربية ، التقاط تقارب ، وطرق أخرى مختلفه للعزل exosome ، والكيمياء الكهربائية ، والرنين البلازمون سطحي السطحية ، وغيرها من الطرق للكشف عن التماثيل الملتقطة. وليس من الواضح مدي جدوى العديد من هذه النهج في البيئات السريرية ، بسبب تعقيدها ، والنفقات ، وانخفاض الانتاجيه أو غيرها من القضايا.
وقد وضعنا الفحص السريع وغير مكلفه التي يمكن استخدامها للقياس الكمي الحساسة والمحددة من التماثيل الاجماليه والأنواع الفرعية المحددة exosomes ، بما في ذلك الامراض المرتبطة بالمبيدات ، مثل TDEs ، والذي يتطلب سوي كميه صغيره من عينه والتي توظف سير عمل مبسطه مناسبه للبيئات السريرية. في هذا الفحص ، يتم تغليف شريحة مع الأجسام المضادة التي تربط اما علامة exosome محدده أو محدده المرض التي أعرب عنها علي سطح exosome من أجل التقاط مباشره التماثيل المستهدفة الموجودة في البلازما حجم صغير أو عينات المصل تطبيقها علي الآبار علي الشريحه. ثم يتم تهجين الجسيمات متناهي الملتقطة مع الأجسام المضادة المترافقة التي تعترف بالعلامات الحيوية للفائدة علي هذه المبيدات الحشرية ، والتي يمكن ان تكون اما مؤشر exosomes عام أو عامل محدد لنوع فرعي exosomes الفائدة. ثم يتم التقاط صور هذه الآبار النموذجية باستخدام مجهر الحقل المظلم (بورصة دبي) وتحليلها لقياس الضوء المتناثر من الجسيمات النانويه المرتبطة بالفوائد الملتقطة في كل عينه جيدا6،16،17. وعلي وجه الخصوص ، فان تصوير عينه كامله بشكل جيد من خلال التكبير المنخفض في سوق دبي السينمائي (LMDFM) يتجنب تحيز الاختيار الذي تم مواجهته بتحليلات عاليه التكبير في سوق دبي السينمائي عندما يجب علي المستخدمين اختيار الحقول التي سيتم التقاطها لتحليل الصور اللاحقة مباشره. تحليل الصور LMDFM يخضع لتشتت الضوء التحف من المخالفات السطحية ، بما في ذلك الخدوش والحطام عينه ، ولكن هذه الخلفية يمكن ان تخفض باستخدام خوارزميه الحد من الضوضاء بسيطه وضعنا لتشغيل علي برنامج تحليل صوره المعاهد القومية للصحة ، ImageJ (https://imagej.nih.gov/ij/). تطبق هذه الخوارزميه أولا عتبه كفاف الإدخال التي يتم استخدامها للكشف عن حدود العينة جيدا لتعريف منطقه الصورة للتحليل اللاحق. ثم يتم تقسيم المنطقة المحددة من قبل هذه المنطقة كفاف إلى اشاره منفصلة موجودة في القناات الحمراء والزرقاء والخضراء من الصورة ويتم طرح القناة الزرقاء من القناة الحمراء لأزاله الاشاره الناشئة عن التحف السطحية والاضاءه متفاوتة من nanorod اشاره.
توضح هذه المقالة كيفيه استخدام هذا الفحص للتحديد الكمي لمستويات exosome الاجماليه أو المحددة بسرعة في عينات البلازما أو المصل.
1-اعداد مجسات جسيمات متناهي
ملاحظه: هذا الفحص يستخدم الوظيفية Nanorods الذهب (AuNRs ؛ 25 نانومتر قطر x 71 nm طول) التي يتم مترافق بالصدفة مع البوليمرات المحايدة (AV) ولها الذروة الرنين البلازما السطحية التي تنتج احمر (641 nm الذروة) اشاره تشتت علي سوق دبي السينمائي الاضاءه.
2. اعداد الشرائح التقاط EV
3. اعداد منحني القياسية
4. معالجه عينات البلازما البشرية أو المصل
5. التقاط وكشف exosome
6. تسجيل صور سوق دبي السينمائي
7. تحليل صور سوق دبي السينمائي
متعددة الآبار البروتين A/G الشرائح المغلفة (الشكل 1A) كانت وظيفية مع الأجسام المضادة لEphA2 ومن ثم تستخدم للتقاط علي وجه التحديد EphA2 التماثيل الايجابيه من عينات المصل من المرضي الذين يعانون من سرطان البنكرياس ودون (1 μl/well) وحضن مع nanorods الذهب مترافق مع الأجسام المضادة لCD9 (الشكل 1B). وقد تم تحليل صور سوق دبي السينمائي للضوء المتناثرة من هذه الجسيمات النانويه باستخدام البرنامج المساعد DSM في ImageJ البرمجيات لقياس المبيدات الموجبة EphA-2 الايجابيه في كل بئر. خوارزميه DSM يحدد تلقائيا حدود عينه جيدا ، وتصفيه الضوضاء من التحف ، ويحسب اشاره متناثرة من كل بئر ، وإخراج هذه المعلومات (الشكل 2). خوارزميه DSM يخفف بقوة التحف تشتت الضوء من الخدوش أو الحطام الموجودة في العينة ويحسن حساسية واستنساخ الكشف عن جسيمات متناهي ويمكن معالجه تلقائيا دفعه من الصور الشريحة لارتفاع الانتاجيه استخدام. تستخدم هذه الخوارزميه الأوامر ImageJ والمعلمات المدخلات من قبل المستخدم لطرح خلفيه الصورة ، وحساب اشاره تشتت من كل بئر ، وإخراج ملف البيانات والصور (الشكل 3). يتم تعريف مناطق الاهتمام من خلال حدود البئر عاليه الكثافة في صوره التقاط باستخدام داله العتبة المحيطة لبرنامج ImageJ الماكرو. تستخدم تحليلات الصور عتبه كفاف محدده مسبقا ومعلمات الصورة لحساب شده تشتت جسيمات متناهي لكل بئر.
كما ذكر في عملنا السابق (معلومات تكميليه من ليانغ وآخرون6) ، exosomes معزولة من الثقافات خليه panc-1 تتميز بالمجهر الكترون الإرسال ولطخه الغربية عرضت نطاق الحجم ، المورفولوجية ، وعلامة البروتين التعبير متسقة مع عينه exosome نقاء عاليه. و PANC-1 exosomes ، أعدت مع نفس الاجراء كما عملنا السابق ، واستخدمت هنا للتحقق من صحة لدينا فحص nPES للقياس الكمي exosomes. استخدم هذا الفحص أضداد مضاده لEphA2 للتقاط عدد كبير من المجموعات الضخمة من السكان الأكثر إفرازا والأضداد ضد بروتين exosomes العام CD9 للكشف عن التماثيل الملتقطة. وأظهرت النتائج التي تم الحصول عليها باستخدام عينات من البروتينات المخففة المتسلسلة PANC-1 ، مع تركيزات بروتينيه تتراوح بين 0.24 إلى 1.2 ميكروغرام/μL ، استنساخ جيده في تكرار الآبار (الشكل 4A) وعلاقة خطيه قويه بين الاستجابة المبعثرة تركيز البروتين exosome (الشكل 4B).
لإثبات التطبيق المحتمل لهذه الطريقة ، تم تحليل عينات المصل من المرضي الذين يعانون من سرطان البنكرياس وبدونه للكشف عن وفره المصل الذي يعبر عن الEphA2 البيولوجية المرتبطة بالسرطان ، وذلك باستخدام أضداد مضاده لEphA2 التقاط مباشره التماثيل الهدف من المصل والجسيمات النانويه مترافق مع الأجسام المضادة لCD9 للكشف عن التماثيل المربوطة. وكشف هذا التحليل ان عينات المصل من مرضي سرطان البنكرياس لديها مستويات اعلي بكثير من EphA2 + exosomes (الشكل 5) من الضوابط الخاصة بهم.

الشكل 1: مخطط القياس الكمي لبرنامج Exosome. (ا) مخطط للشرائح المتعددة الآبار من البروتينات A/G (192 بئر) المستخدمة في هذا الفحص. (ب) يتم الاستيلاء مباشره علي التماثيل المستهدفة من العينات ، بما في ذلك المصل والبلازما ، عن طريق التجميد السطحي علي الأجسام المضادة للتقاط (علي سبيل المثال مكافحه الأضداد EphA2) المنضمة إلى الشريحة ، ثم حضن مع nanorods الذهب مترافق مع كشف الأجسام المضادة (علي سبيل المثال مكافحه الأضداد CD9) قبل تحليل الصورة في سوق دبي السينمائي. يرجى النقر هنا لعرض نسخه أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: القياس الكمي Exosome عن طريق تطبيق خوارزميه DSM إلى صور LMDFM. يتم معالجه الصور ذات التكبير المنخفض مع خوارزميه DSM للقضاء علي اشاره الخلفية والتحف اشاره التي يمكن ان تنشا من الخدوش ، وخلط الفراغات ، والحطام ، والاضاءه عينه متفاوتة للسماح الكشف القوي للاشاره nanorod الذهب ، والتي يرتبط مع تركيز exosome. وقد تم تكييف هذا الرقم باذن من Sun, d. et al. طريقه الحد من الضوضاء لقياس تشتت الضوء جسيمات متناهي في التكبير منخفضه المجهر الحقل المظلم الصور الميدان البعيد. الكيمياء التحليلية. 88 (24) ، 12001-12005 (2016). حقوق التاليف والنشر (2016) الجمعية الكيميائية الامريكيه. يرجى النقر هنا لعرض نسخه أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3: تخطيطي لأوامر خوارزميه DSM والمخرجات. الخطوات المشار اليها تستخدم الأوامر الاصليه من ImageJ ويتم تحديد جميع معلمات الإدخال وفقا لمتطلبات التجارب عبر واجهه المستخدم الرسوميه. وقد تم تكييف هذا الرقم باذن من Sun, d. et al. طريقه الحد من الضوضاء لقياس تشتت الضوء جسيمات متناهي في التكبير منخفضه المجهر الحقل المظلم الصور الميدان البعيد. الكيمياء التحليلية. 88 (24) ، 12001-12005 (2016). حقوق التاليف والنشر (2016) الجمعية الكيميائية الامريكيه. يرجى النقر هنا لعرض نسخه أكبر من هذا الرقم.

الشكل 4: تمثيلي nPES LMDFM الصور وبيانات الإخراج DSM. (ا) صوره lmdfm لفحص npes يحلل تدرج تركيز المكونات الاوليه من panc-1 و (ب) الارتباط الخطي للاشاره البصرية وتركيز exosomes من هذه الشريحة (من اليسار إلى اليمين: 0.24 ، 0.356 ، 0.53 ، 0.80 ، 1.20 ميكروغرام/μl علي التوالي لكل عمود). وتقدم البيانات كما يعني ± SE, n = 6, مع معامل الارتباط بيرسون R2 = 0.99 ومعامل الاختلاف لنسخ متماثلة من كل تركيز < 0.2. يرجى النقر هنا لعرض نسخه أكبر من هذا الرقم.

الشكل 5: اشاره LMDFM منEphA2 + exosomes تماثيل يختلف في المصل من المرضي الذين يعانون من وبدون سرطان البنكرياس. عينات المصل تحليلها من قبل nPES باستخدام مضاد لEphA2 القبض علي الأضداد (المرتبطة بالسرطان) والمضادة لCD9 الأضداد الكشف (علامة exosome العامة) أظهرت فرقا كبيرا في تركيز EphA2 + exosome في عينات المصل من المرضي الذين يعانون من دون سرطان البنكرياس (N = 7/المجموعة). يتم عرض النتائج كمتوسط ± SE. * *p = 0.002 بواسطة مان-ويتني U-اختبار (علي الوجهين). وقد تم تعديل هذا الرقم من [Sun, d. et al. طريقه الحد من الضوضاء لقياس تشتت الضوء جسيمات متناهي في التكبير منخفضه المجهر الحقل المظلم الصور الميدان البعيد. الكيمياء التحليلية. 88 (24) ، 12001-12005 (2016)]. يرجى النقر هنا لعرض نسخه أكبر من هذا الرقم.
ويعلن صاحبا البلاغ انهما لا يملكان مصالح مالية متنافسة.
ويعوق الترجمة السريرية للخلايا الحيوية المشتقة من الخلايا الاحيائيه المصابة والخبيثة الافتقار إلى طرق التحديد الكمي السريعة والدقيقة. يصف هذا التقرير استخدام صور المجهر منخفضه التكبير في الحقل المظلم لقياس أنواع فرعيه معينه من النوع exosome في المصل الصغير الحجم أو عينات البلازما.
وقد دعم العمل في المقام الأول من خلال تمويل البحوث التي تقدمها المعاهد القومية للصحة (U01CA214254 ، R01HD090927 ، R01AI122932 ، R01AI113725 و R21Al126361) ، وجائزه المحقق الشاب في ولاية اريزونا (ABRC).
| تيار Eppendorf Repeater | فيشر Scientific | 05-401-040 | |
| Eppendorf Research plus | Eppendorf | 3120000011 | 0.1 & ndash; 2.5 & micro; L ، رمادي غامق |
| الوظيفي الذهب النانوقضبان | Nanopartz | C12-25-650-TN-DIH-50-1 | في المختبر نيوترافيدين بوليمر وظيفية |
| HulaMixer خلاط عينة | Thermo Fisher Scientific | 15920D | |
| Incu-shaker 10L | Benchmark Scientific | H1010 | |
| مجهر أبحاث مقلوب | نيكون | Ti-DH | مع مكثف المجال المظلم ، وكاميرا DS-Ri2 ، وحامل عالمي Ti-SH-U ، والمرحلة الآلية |
| NIS-Elements | برنامج تصوير مجهر | نيكون | |
| Phosphate Buffered Saline (1X) | GE Healthcare Life Sciences | SH30256.02 | HyClone |
| Protein A / G Treated Glass Substrate Slides | Arrayit Corp. | AGMSM192BC | الركيزة الدقيقة الممتازة |
| Q500 Sonicator | Qsonica، LLC | Q500-110 | مع مسبار قياسي (# 4220) |
| عازلة حجب Superblock | Thermo Scientific | ||
| TWEEN 20 | Sigma Life Sciences | 9005-64-5 |