RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ar
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
نقدم بروتوكولات مفصلة لإجراء تجارب انعراج الأشعة السينية ذات الزاوية الصغيرة باستخدام عضلات العضلات الهيكلية للماوس سليمة. مع توافر نماذج الماوس المعدلة وراثيا على نطاق واسع للأمراض البشرية، يمكن لهذه المنصة التجريبية أن تشكل سرير اختبار مفيد لتوضيح الأساس الهيكلي لأمراض العضلات الوراثية
وكانت نماذج الماوس المعدلة وراثيا أدوات هامة لدراسة العلاقة بين النمط الجيني والنمط الظاهري للأمراض البشرية بما في ذلك أمراض العضلات الهيكلية. وقد ثبت أن العضلات الهيكلية للماوس تنتج أنماط انعراج عالية الجودة بالأشعة السينية على خطوط الحزمة المتزامنة من الجيل الثالث مما يوفر فرصة لربط التغييرات على مستوى النمط الجيني بالأنماط الظاهرية الوظيفية في الصحة والمرض عن طريق تحديد العواقب الهيكلية للتغيرات الوراثية. ونقدم بروتوكولات مفصلة لإعداد العينات، وجمع أنماط الأشعة السينية، واستخراج البارامترات الهيكلية ذات الصلة من أنماط الأشعة السينية التي قد تساعد في توجيه التجارب الراغبة في إجراء مثل هذه التجارب لأنفسهم.
Synchrotron زاوية صغيرة الأشعة السينية الانعراج هو الأسلوب المفضل لدراسة هيكل نانومتر مقياس من التعاقد بنشاط الاستعدادات العضلات في ظل الظروف الفسيولوجية. الأهم من ذلك، يمكن الحصول على المعلومات الهيكلية من الاستعدادات العضلات الحية أو البشرة في تزامن مع البيانات الفسيولوجية، مثل قوة العضلات والتغيرات طول. كان هناك اهتمام متزايد في تطبيق هذه التقنية لدراسة الأساس الهيكلي لأمراض العضلات الموروثة التي لها أساسها في الطفرات نقطة في البروتينات ساركوميريك. وكان مجتمع الفيزياء الحيوية العضلات نشطة جدا في توليد نماذج الماوس المعدلة وراثيا لهذه الظروف الأمراض البشرية التي يمكن أن توفر أسرة اختبار مثالية للدراسات الهيكلية. وقد أشارت المنشوراتالأخيرة من مجموعتنا 1،2،3 وغيرها4،5 أن أنماط الأشعة السينية من الماوس الموسعة رقمي longus (EDL) وعضلات السولوس يمكن أن توفر جميع معلومات الانعراج المتاحة من الكائنات الحية النموذجية أكثر تقليدية مثل الضفدع والأرنب psoas العضلات الهيكلية. ميزة إعداد العضلات الهيكلية الماوس هو سهولة تشريح وأداء الأغشية الأساسية سليمة، والتجارب الفسيولوجية العضلات كلها. أبعاد العضلات تشريح لديها كتلة كافية لإنتاج أنماط العضلات مفصلة للغاية في أوقات التعرض الأشعة السينية قصيرة جدا (~ مللي ثانية لكل إطار) على الجيل الثالث من شعاع الأشعة السينية.
تتكون أنماط انعراج الأشعة السينية العضلية من الانعكاسات الاستوائية، والانعكاسات الميرية، فضلا ً عن انعكاسات خط الطبقة. نسبة الكثافة الاستوائية (نسبة كثافة انعكاسات 1,1 و1,0 الاستوائية، I 11/I10)،ترتبط ارتباطا وثيقا بعدد الجسور المتقاطعة المرفقة، وهو ما يتناسب مع القوة المتولدة في العضلات الهيكلية للماوس 2.يمكن استخدام الانعكاسات meridional التي تقرير الدورات داخل خيوط سميكة ورقيقة لتقدير خيوط القابلية للتوسعة 1،3،6،7. دعات إنعراج سمات لا على ال [مووند] والاتّلاو الاستواء طبقة خطوط, أيّ ينشأ من ال تقريبا [هلّيكلّي] يؤمر [موسين] رؤوس على السطح من سميكة خيوط عمود فقريّ [أس ولّ س] ال تقريبا [هلّيكلّي] يؤمر خيوط رقيقة. كثافة خطوط طبقة الموسين ترتبط ارتباطا وثيقا بدرجة ترتيب رؤساء myosin في ظل ظروف مختلفة2،8. كل هذه المعلومات يمكن استخدامها دراسة سلوكيات البروتينات الساركوميريك في الموقع في الصحة والمرض.
وقد تم تاريخيا أنعراج الأشعة السينية Synchrotron من العضلات من قبل فرق من الخبراء المتخصصين للغاية ولكن التقدم في التكنولوجيا وتوافر أدوات جديدة للحد من البيانات تشير إلى أن هذا ليس دائما هو الحال. وBioCAT Beamline 18ID في مصدر الفوتون المتقدم، مختبر أرغون الوطني لديها الموظفين وأجهزة الدعم المخصصة لإجراء تجارب الانعراج بالأشعة السينية العضلات التي يمكن أن تساعد الوافدين الجدد إلى الميدان البدء في استخدام هذه التقنيات. يختار العديد من المستخدمين التعاون رسميا مع موظفي BioCAT، ولكن عددا متزايدا من المستخدمين يجدون أنهم يستطيعون القيام بالتجارب وتحليل أنفسهم مما يقلل من العبء على موظفي خط الحزمة. الهدف الرئيسي من هذه الورقة هو توفير التدريب الذي يوفر للتجارب المحتملة مع المعلومات التي يحتاجونها لتخطيط وتنفيذ التجارب على نظام العضلات الهيكلية الماوس إما في خط الحزمة BioCAT أو في غيرها من خطوط الحزم تدفق عالية حول العالم حيث هذه التجارب سيكون من الممكن.
تمت الموافقة على جميع بروتوكولات التجارب الحيوانية من قبل معهد إلينوي للتكنولوجيا المؤسسية لرعاية الحيوانات واستخدامها لجنة (بروتوكول 2015-001، تاريخ الموافقة: 3 نوفمبر 2015) واتبع المعاهد الوطنية للصحة "دليل لرعاية واستخدام الحيوانات المختبرية"9 .
1. التحضير قبل التجربة
2. إعداد العضلات
3. الأشعة السينية الانعراج
ملاحظة: الوصف التالي هو لتجارب الانعراج بالأشعة السينية التي أجريت باستخدام أداة انعراج الأشعة السينية الزاوية الصغيرة على خط الحزمة BioCAT 18ID في مصدر الفوتون المتقدم، مختبر أرغون الوطني ولكن يمكن استخدام أساليب مماثلة على خطوط الحزمة الأخرى مثل ID 02 في ESRF (فرنسا) وBL40XU في SPring8 (اليابان). يتم تشغيل Beamline 18ID في طاقة شعاع الأشعة السينية الثابتة من 12 كيلوفولت (الطول الموجي 0.1033 نانومتر) مع تدفق الحوادث من ~ 1013 فوتونفي الثانية في شعاع كامل.
4. علاج العضلات بعد التجربة
تقلص الكزاز متساوي القياس. أي نوع من التجارب الميكانيكية العضلات الكلاسيكية، مثل تقلصات متساوي القياس أو متساوي التوتر، يمكن أن يؤديها مع اكتساب في وقت واحد من أنماط الأشعة السينية. الشكل 1 A يظهر الإعداد التجريبي للتجارب الميكانيكية والأشعة السينية. ويرد في الشكل 1باءأثر قوة مثال لتقلص الكزاز متساوي القياس. عقدت العضلات في يستريح لمدة 0.5 s قبل تفعيلها لمدة 1 s. يتوقف التسجيل الميكانيكي 1 s بعد التحفيز. تم جمع أنماط الأشعة السينية بشكل مستمر في جميع أنحاء البروتوكول في وقت التعرض 1 مللي ثانية في 500 هرتز.
أنماط انعراج الأشعة السينية. يمكن لنمط انعراج الأشعة السينية للعضلات أن يعطي معلومات هيكلية عن دقة النانومتر من الهياكل الموجودة داخل الساركومر. تتكون أنماط انعراج الأشعة السينية العضلية من أربعة أرباع مكافئة مقسومة على خط الاستواء وخط الطول. وينشأ النمط الاستوائي من التعبئة الخيوط العضلية داخل السركومر عمودي على محور الألياف، في حين أن الأنماط الميرية تقرير المعلومات الهيكلية من خيوط العضلات على طول محور العضلات. وتسمى الانعكاسات المتبقية ليست على خط الاستواء أو خط الطول خطوط الطبقة. خطوط طبقة (على سبيل المثال، ملامح المسمى MLL4 و ALL6 في الشكل 2A)تنشأ من الترتيب شبه حلزوني من الوحدات الفرعية الجزيئية داخل myosin التي تحتوي على خيوط سميكة والأكتين التي تحتوي على خيوط رقيقة. خطوط الطبقة المستندة إلى myosin قوية وحادة في أنماط من العضلات يستريح (الشكل 2A)، في حين خطوط طبقة المستندة إلى الأكتين هي أكثر بروزا في أنماط من العضلات المتعاقدة (الشكل 2B). أنماط الفرق التي تم الحصول عليها عن طريق طرح نمط يستريح من نمط التعاقد (الشكل2C)يمكن تسليط الضوء على التغيرات الهيكلية أثناء تطوير القوة في العضلات صحية ومريضة. باتباع هذه التغيرات الهيكلية على مقياس الوقت الملي ثانية من الأحداث الجزيئية أثناء تقلص العضلات، وأنماط الانعراج بالأشعة السينية يمكن أن تكشف عن معلومات هيكلية كبيرة (الشكل2D).
تحليل البيانات باستخدام MuscleX. وفيما يلي مثال على تحليل الانعكاسات الاستوائية باستخدام روتين "خطالاستواء" في حزمة MuscleX (الشكل 3). MuscleX هو حزمة برامج تحليل مفتوحة المصدر تم تطويرها في BioCAT13. نسبة الكثافة الاستوائية (I1,1/I1,0)هي مؤشر على قرب الموسين من الأكتين في العضلات يستريح (الشكل3A)، في حين أنها ترتبط ارتباطا وثيقا بعدد الجسور المتقاطعة المرفقة في التعاقد ( الشكل 3B)مورين العضلات والهيكل العظمي2. نسبة الكثافة, أنا1,1/I1,0, حوالي 0.47 في العضلات يستريح وحوالي 1.2 في تقلص العضلات. المسافة بين انعكاس 1,0 اثنين (2 * S1,0) يرتبط عكسيا إلى تباعد بين خيوط. الوثائق التفصيلية وكتيبات MuscleX متاحة على الانترنت13.

الشكل 1 إعداد التجارب الميكانيكية والأشعة السينية والبروتوكول. (أ) يتم تركيب العضلات على نهاية واحدة إلى هوك داخل الغرفة التجريبية والطرف الآخر إلى محرك مزدوج وضع / قوة محول. هو أمسكت بين اثنان [كبتون] فيلم نافذات أن يسمح ال [إكس-ريس] أن يمرّ كلّيّا. تمتلئ الغرفة مع حل رينجر مع الأكسجين 100٪ طوال التجربة. (ب) البروتوكول الميكانيكي لتجارب الأشعة السينية على العضلات أثناء تقلص الكزاز. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2 أنماط انعراج الأشعة السينية EDL. EDL العضلات نمط الانعراج بالأشعة السينية من يستريح (أ) والتعاقد (B) العضلات. (ج) نمط الفرق بين نمط الراحة والتعاقد. المنطقة الزرقاء تشير إلى كثافة عالية في نمط الراحة، في حين أن المنطقة الصفراء تمثل كثافة عالية في نمط التعاقد. (D) نمط انعراج الأشعة السينية من التعرض 1 مللي ثانية مع عضلة EDL. MLL1 = أول خط طبقة myosin من الدرجة الأولى; MLL4 = خط طبقة myosin من أجل رابع; ALL1 = خط طبقة أكتين من الدرجة الأولى ALL6 = خط طبقة أكتين من الدرجة السادسة؛ ALL7 = خط طبقة أكتين الترتيب السابع; Tm = انعكاس تروبوموسين (المشار إليه من قبل مربع أبيض)؛ M3 = انعكاس meridional من الدرجة الثالثة؛ M6 = انعكاس meridional النظام السادس. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3 تحليل البيانات من الأنماط الاستوائية باستخدام MuscleX. وطرحت الخلفية لمحة عن نسبة الكثافة الاستوائية (في حين أن المنطقة) والطلبات الخمسة الأولى (الخطوط الخضراء) كانت مناسبة لحساب كثافة كل ذروة. الرجاء النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
ويعلن صاحبا البلاغ أنهما ليس لديهما مصالح مالية متنافسة.
نقدم بروتوكولات مفصلة لإجراء تجارب انعراج الأشعة السينية ذات الزاوية الصغيرة باستخدام عضلات العضلات الهيكلية للماوس سليمة. مع توافر نماذج الماوس المعدلة وراثيا على نطاق واسع للأمراض البشرية، يمكن لهذه المنصة التجريبية أن تشكل سرير اختبار مفيد لتوضيح الأساس الهيكلي لأمراض العضلات الوراثية
استخدم هذا البحث موارد من مصدر الفوتون المتقدم، وهو مكتب مستخدم علمي تابع لوزارة الطاقة الأميركية يعمل لمكتب العلوم التابع لوزارة الطاقة من قبل مختبر أرغون الوطني بموجب العقد رقم. DE-AC02-06CH11357. وقد تم دعم هذا المشروع بمنحة P41 GM103622 من المعهد الوطني للعلوم الطبية العامة التابع للمعاهد الوطنية للصحة. تم توفير استخدام كاشف بيلاتوس 3 1M بمنحة 1S10OD018090-01 من NIGMS. والمحتوى هو مسؤولية المؤلفين فقط ولا يعكس بالضرورة الآراء الرسمية للمعهد الوطني للعلوم الطبية العامة أو المعاهد الوطنية للصحة.
| # 5 ملقط | WPI | 500342 | |
| 4/0 خياطة جراحية | Braintree Sci | SUT-S 108 | |
| حجر الهواء حوض | السمك uxcell | حجر هواء عادي من متجر للحيوانات الأليفة سيكون جيدا | |
| CaCl2< / sub> | Sigma-Aldrich | C5670 | |
| CCD كاشف | Rayonix Inc | مارس 165 بيانات CCD | |
| نظام الاستحواذ | Aurora Scientific Inc | 610A | |
| مركب المطاط | الصناعيDow Corning | Sylgard 184 | |
| Glucose | Sigma-Aldrich | G8270 | |
| HEPES | Sigma-Aldrich | H3375 | |
| كاشف عد الفوتون عالي الدقة | Dectris Inc | EIGER X 500K | |
| محفز تيار ثنائي الطور عالي الطاقة | Aurora Scientific Inc | 701 | |
| مقص القزحية | WPI | 501263-G | |
| KCl | Sigma-Aldrich | P9541 | |
| MgSO4< / sub> | Sigma-Aldrich | M7506 | |
| مقص صغير | WPI | 503365 | |
| محول محرك / قوة | Aurora Scientific Inc | 300C-LR | |
| NaCl | سيجما ألدريتش | S9888 | |
| طبق بتري | سيجما ألدريتش | CLS430167 | |
| كاشف عد الفوتون | Dectris Inc | Pilatus 3 1M | |
| أسلاك الفولاذ المقاوم للصدأ | McMaster-carr | 8908K21 | |
| خياطة ربط ملقط | WPI | 504498 | |
| نظام قياس طول ساركومير الفيديو | Aurora Scientific Inc | 900 ب |