يقدم هنا بروتوكول لاستخدام نظام CRISPR-Cas9 للحد من إنتاج البروتين في الدماغ نحل العسل الكبار لاختبار خصوصية الأجسام المضادة.
مقالة منهجية
* These authors contributed equally
يقدم هنا بروتوكول لاستخدام نظام CRISPR-Cas9 للحد من إنتاج البروتين في الدماغ نحل العسل الكبار لاختبار خصوصية الأجسام المضادة.
الكتلة بانتظام Interspaced يكرر Palindromic قصيرة (CRISPR)/CRISPR المرتبطة البروتين 9 (Cas9) هو أسلوب تحرير الجينات المستخدمة على نطاق واسع في دراسات وظيفة الجينات. نحن نستخدم هذه الطريقة في هذه الدراسة للتحقق من خصوصية الأجسام المضادة التي وضعت ضد الحشرة GABAA مستقبلات مقاومة subldrin (RDL) ومستقبلات الغلوتامات ميتابوتروبيك mGlutR1 (mGluRA). تم إنشاء الأجسام المضادة في الأرانب ضد الببتيدات المترافقة المحددة لذباب الفاكهة(Drosophila melanogaster)وكذلك لنحل العسل(أبيس mellifera). استخدمنا هذه الأجسام المضادة في أقسام الدماغ نحل العسل لدراسة توزيع المستقبلات في أدمغة نحل العسل. تم تنقية الأجسام المضادة ضد الببتيد واختبارها مع النبلة المناعية والطريقة الكلاسيكية للببتيد مع مترافقات الببتيد لإظهار أن الأجسام المضادة محددة لاقتران الببتيد المقابلة التي أثيرت ضدها. هنا قمنا بتطوير تقنية CRISPR-Cas9 لاختبار للحد من أهداف البروتين في الدماغ 48 ساعة بعد حقن CRISPR-Cas9 مع دليل الحمض النووي المصممة للمستقبلات المقابلة. يمكن أيضًا استخدام طريقة CRISPR-Cas9 في التحليلات السلوكية في النحل البالغ عندما تحتاج جينة واحدة أو عدة جينات إلى تعديل.
نظام CRISPR/Cas9 الذي تم اكتشافه مؤخرًا هو أداة قوية تم استخدامها لتغيير الحمض النووي الجينومي في أنظمة النماذج والكائنات الحية المختلفة. وقد عجلت البحوث الطبية الحيوية والاختراقات التكنولوجية الكبرى من خلال جعل تعديل الجينوم أكثر كفاءة وقوة من الأساليب السابقة1. الأصلي إلى S. pyogenes البكتيريا، ونظام يعتمد على Endonuclease Cas9، الذي يؤدي النشاط إلى فواصل تقطعت بهم السبل مزدوجة (DSBs) في الحمض النووي، ورنا دليل (gRNA) الذي يوجه البروتين Cas9 إلى موقع محدد، تعتمد على تسلسل2. يمكن إصلاح الفواصل المزدوجة التي تم إنشاؤها بواسطة CRISPR/Cas9 عن طريق الانضمام النهائي غير المتماثل (NHEJ) ، وهي عملية عرضة للخطأ يمكن أن تؤدي إلى تحولات إطارية ، أو إصلاح مباشر للهومولوجيا عند وجود قالب متبرع. وgRNA نفسها تتكون من مجموعة محددة الهدف CRISPR RNA (crRNA) وإعادة تنشيط شامل (tracrRNA) والتي يمكن توليفها كيميائيا وتسليمها مع تنقية Cas9 nuclease كمركب ribonucleoprotein (RNP)2،3. يمكن وضع العلامات الفلورية من gRNA أو Cas9 nuclease تسمح للكشف والتصور داخل الخلايا من المكونات الجزيئية عن طريق المجهر الفلوري4.
في عملنا الحالي، نستفيد من نظام CRISPR-Cas9 لتقليل مستويات البروتين في أدمغة نحل العسل البالغين. درسنا مستقبلات الغلوتامات الميتاتروبيك (mGluR) ومكافحة mGlutR1 مستقبلات الأجسام المضادة وGABAA مستقبلات الفرعية RDL والأجسام المضادة RDL. طورنا طريقة بسيطة لتقليل كمية البروتين في دماغ نحل العسل البالغ واستخدمناه لدفع اختبارات إضافية للأجسام المضادة التي تم تطويرها ضد البروتينات المقابلة. رصد مضان كريسبر-كاس9 سمح لنا بتقدير المناطق والخلايا المشاركة في الحد من البروتين.
باستخدام هذه الطريقة ، قمنا أيضًا بتوصيف الأجسام المضادة لـ mGlutR1 التي تم صنعها في الأرانب ضد الببتيد المترافق. الجينوم نحل العسل ترميز AmGlura حفظ عالية (اسمه mGlutR1 وفقا لتسمية NCBI) مستقبلات الغلوتامات المستقلب5. يحتوي جين نحل العسل mGlutR1 على أربعة متغيرات توقع لصق وفقا لقاعدة بيانات NCBI. وقد أفيد أنه يتم التعبير عنها في الجهاز العصبي المركزي (CNS) من كل من مراحل النحل pupal والكبار وتشارك في تكوين الذاكرة على المدى الطويل5. الأجسام المضادة التي وضعت ضد mGlutR1 يمكن أن تكون أداة أساسية لدراسة نظام الجلوتامات في عملية التعلم والذاكرة في نحل العسل.
في دراساتنا، كما تميزنا الأجسام المضادة RDL المتقدمة في الأرانب المحصنة مع الببتيدات مترافقة من apis mellifera RDL مستقبلات الوحدة الفرعية. جين نحل العسل Rdl، AmRdl (XM_006565102.3، قاعدة بيانات NCBI)، وقد 14 المتغيرات لصق المتوقعة. تم الإبلاغ عن جزء مستنسخ جزئيًا في قاعدة بيانات NCBI AF094822.1. تتم دراسة وظيفة مستقبلات RDL وعلم وظائف الأعضاء بشكل جيد في الحشرات6،7،8، بما في ذلك نحل العسل9،10،11. يمكن أن تكون الأجسام المضادة التي تم تطويرها ضد مضادات RDL أداة أساسية لدراسة نظام GABAergic في عملية التعلم والذاكرة في نحل العسل.
دراسة سابقة عن دور أوكتوبامين ومستقبلات الثيامين المستخدمة RNAi حقنها في الدماغ مع اختبار لاحق لكمية البروتين من قبل لطخة الغربية12,13. ومع ذلك ، RNAi لديها بعض القيود الهامة. هناك فقط فترة زمنية قصيرة بعد حقن RNAi التي يحدث فيها انخفاض البروتين13. تم استخدام CRISPR-Cas9 مؤخرًا في أجنة نحل العسل لحذف أو تعديل الجينات في الحيوان بأكمله14،15،16. أبلغنا عن استخدام CRISPR-Cas9 لتقليل كمية البروتين في نحل العسل البالغ. طورنا هذا النهج لنحل العسل بسبب القدرة على الزوجان من الدراسات السلوكية للتعلم والذاكرة في ظل ظروف المختبر الخاضعة للرقابة17.
في العمل الحالي ، قمنا بتطوير أجسام مضادة ضد اثنين من المستقبلات واختبرناها على أقسام الدماغ نحل العسل الكبار بعد أن تم تخفيض البروتين عن طريق حقن CRISPR-Cas9. وفي الوقت نفسه، أنشأنا تصميمًا تجريبيًا يسمح باستخدام الطريقة للتجارب السلوكية.
البروتوكول الموصوف هنا يتبع المبادئ التوجيهية لرعاية الحيوانات من جامعة ولاية أريزونا.
1. مجموع عزل البروتين من أدمغة أبيس mellifera
ملاحظة: استخدام Apis mellifera العالم الجديد كارنيولان الآكلون من عمر غير معروف لهذه التجربة.
2. الغربية النشاف19
3. الإجراءات الكيميائية المناعية
4. اختبار RDL وmGlutR1 التعبير البروتين من قبل الكيمياء المناعية (القسم 3) في الدماغ نحل العسل بعد حقن نظام CRISPR-Cas9 المقابلة
5. حقن الإجراء
6. qPCR المستندة إلى الإنزال فحص لتقييم تعديل الجينوم RDL الحمض النووي 48 H بعد CRISPR Cas9 RNPRDLmix حقن
و
7. القياس الكمي النسبي للRDL RNA 48 H بعد حقن RNPRDLmix
8. qPCR القائم على إسقاط فحص لتقييم الحمض النووي الجينوم المعدلة 48 H بعد حقن RNPmGlutR1mix
و
9. quantification mGlutR1 RNA 48 ح بعد حقن RNPmGlutR1mix
اختبارات الأجسام المضادة لـ RDL
تم إنتاج الأجسام المضادة ضد الببتيد RDL مترافق كما هو موضح في الشكل 1A. الخطوة الأولى في توصيف الأجسام المضادة لـ RDL هي التحقق من تجانس البروتين المستخرج من دماغ النحل باستخدام لطخة غربية مع الأجسام المضادة لـ RDL والماعز المسمى HRP IgG الأجسام المضادة الثانوية(الشكل 1A، إدراج). واعترفت كل من الأجسام المضادة لـ RDL بالنطاق الموجود عند 50-60 كيلو متر (سهم) ، وهو ما يعادل الوزن المقدر للبروتينات isoform للوحدة الفرعية RDL. لإثبات أن الأجسام المضادة لـ RDL تعرفت على الببتيد في شرائح الدماغ ، استخدمنا عنصر تحكم preadsorption(الشكل 1B ، C). عندما كانت الأجسام المضادة تسبق الببتيدات المترافقة ، كان تلطيخ المقطع غائبًا. وقد أظهر ذلك أن الأجسام المضادة لـ RDL تعرفت على الببتيد المترافق الذي تربيت عليه. من أجل إثبات أن الأجسام المضادة لـ RDL تتعرف على البروتين في أنسجة الدماغ الثابتة ، استخدمنا CRISPR-Cas9 لضرب جين RDL الذي ينتج بروتين RDL في الخلايا. الشكل 1D1-3، يظهر أقسام الدماغ النحل الأمامية التحكم التي كانت تحمل علامة على الأجسام المضادة RDL. لم يتم حقن هذه النحلة مع RDL-CRISPR-Cas9 RNP. في الشكل 1D1، المضادة لتسميات RDL neuropils في القسم الأمامي من الدماغ النحل. نفس القسم الأمامي في الشكل 1D2 يظهر عدم وجود الفلورسينس من ATTO550، لأنه لم يتم حقن مجمع RDL-CRISPR-Cas9.
يوضح الشكل 1E1-E3 قسم ًا دماغيًا من نحلة تم حقنها بـ RDL-CRISPR-Cas 9 ثم تتم معالجتها بنفس كمية الأجسام المضادة مثل دماغ التحكم في الشكل 1D1-D3. تم تخفيض تلطيخ المضادة لـ RDL بشكل ملحوظ في الدماغ كله 48 ساعة بعد الحقن، وتوزيع تلطيخ ATTO550 في الدماغ(الشكل 1E2)يظهر نجاح حقن RDL-CRISPR-Cas 9 في أوتشيلي وسيط النحل. الخلايا المتناثرة متعددة من الدماغ يحمل ATTO550. حقن ناجحة من RDL-CRISPR-Cas 9 خفضت التعبير البروتين بالمقارنة مع السيطرة(الشكل 1E1-3). من ثمانية أدمغة النحل الملطخة بالمناعة ، كان دماغ واحد فقط على مستوى عال من توزيع RDL-CRISPR-Cas9 في خلايا جسم الفطر ، بروتوسيديربروم ، وفص الهوائي ، في حين أن الأدمغة الأخرى كان تلطيخ الخلية مع ATTO550 في calyx الجسم الفطر ، المجمع المركزي ، ولكن ليس فص الهوائي. من المهم أن نلاحظ أنه في هذه النحل، والحد من مضاد لـ RDL المناعة لم يكن دراماتيكيا كما هو الحال في الدماغ هو مبين في الشكل 1E1.
بعد ذلك، لتقدير مستوى GDNA RDL المعدلة في النحل 48 ساعة بعد حقن RDL-CRISPR-Cas9، قمنا بإجراء اختبار إنزال qPCR، حيث تم تصميم مسبار الإنزال ليتناسب مع منطقة واحدة من RDL gRNAs. في هذه التجارب، في أدمغة النحل التي تم حقنها بـ RDL-CRISPR-Cas 9، كان الانخفاض النسبي للفلورية يتوافق مع عدد الحمض النووي المعدل في العينات. في اختباراتنا كانت المنطقة المقابلة لهذا الدليل في gDNA في 12 النحل حقن مع RDL-CRISPR-Cas9 64 ٪ ± (متوسط ± 30 ٪ SD) مقارنة مع gDNA في النحل غير حقن(الشكل 3A).
بعد ذلك ، لتقدير مستوى الحمض النووي الريبي RDL في النحل 48 ساعة بعد الحقن ، قمنا بإجراء qRT-PCR في مجموعة منفصلة من النحل(الشكل 3B). قارنا مستوى RDL RNA من RDL-CRISPR-Cas 9 النحل المحقون (n = 19) مع مستوى الحمض النووي الريبي في النحل التي لم يتم حقنها (ن = 12). في هذه التجارب، كان الانخفاض النسبي للمرنا RDL 59٪ ± (متوسط ± 15٪ SE) مقارنة مع مستوى الحمض النووي الريبي في النحل غير حقن. عندما فحصنا مستوى الحمض النووي الريبي RDL في كل النحل على حدة، فقط 13 النحل من أصل 19 النحل أظهرت انخفاضا كبيرا من الحمض النووي الريبي. وتشير هذه البيانات إلى أن حقن RDL-CRISPR-Cas9 من خلال أوتشيلي قد لا تصل دائما إلى عدد كبير من خلايا الدماغ, مما يؤكد البيانات مع RDL الملطخة بالمناعة RDL-CRISPR-Cas9 حقن النحل. في هذه الاستعدادات، كان نحلة واحدة فقط من أصل 8 RDL CRISP-Cas9 في العديد من خلايا الدماغ (جسم الفطر، بروتوسيريروم، وفص الهوائي) مقارنة مع أدمغة النحل الأخرى، حيث تركز توزيع RDL-CRISPR-Cas9 في الخلايا في بروتوسيسبروم (فطر الجسم calyx والمجمع المركزي) ولكن ليس الفص الهوائي(الشكل 4A-D).
اختبارات الأجسام المضادة mGlutR1
استخدمنا الأجسام المضادة mGlutR1 المنتجة في أرنب ضد الببتيدات مترافق ة محددة لdrosophila melanogaster (الشكل 2A). تسلسل هذا الببتيد يظهر هوية 94٪ مع الببتيد النحل (CLSDKTRFDYFARTVPPD) الشكل 2A. أولاً، فحصنا الأجسام المضادة ضد بروتين دماغ النحل باستخدام النفخ المناعي. تم فصل تجانس دماغ النحل بنسبة 10٪ SDS-PAGE ونقل كهربائيا من إلى غشاء النيتروسليلوز وملطخة بمكافحة mGlutR1. يظهر الإدراج في الشكل 2A نطاقين مع الأوزان المقدرة (103 و 83 كيلو د) المقابلة لاثنين من isoforms. عندما اختبرنا هذا الجسم المضاد على أدمغة نحل العسل ، وجدنا أنها تسمي ملامح عصبية وخلايا في أقسام دماغ النحل كما هو موضح في الشكل 2B، D. بعد preadsorption من الأجسام المضادة لmGlutR1 مع الببتيد مغلوت-mGlutR1، اختفى تلطيخ محددة في شريحة الدماغ النحل(الشكل 2C). وهذا يؤكد أن الأجسام المضادة mGlutR1 التعرف على الببتيد(الشكل 2C). بعد ذلك ، قمنا بحقن مزيج من mGlutR1-CRISPR-Cas9 في ocelli المتوسط واستخدمنا noguideRNA التحكم. في النحل السيطرة (ن = 7) ، لم يتركز الفلورمنس من ATTO550 في الخلايا. وكان بعض العقول الفلورية المتناثرة ATTO550 الوسم. وهكذا، فإن إعداد السيطرة في الشكل 2D1-3 يظهر تلطيخ مكافحة mGlutR1 في الدماغ ولكن ليس الفلورATAT550. عندما تم حقن mGlutR1-CRISPR-Cas9 في أوتشيلي وتناولها العديد من الخلايا، تم تخفيض مستوى الفلورمنس من الأجسام المضادة الثانوية بشكل كبير في المنطقة التي تلتقط mGlutR1RNP وظيفية(الشكل 2E1-3). تم رصد النحل لمدة 48 ساعة ، وتم العثور على نبواحد من كل حالة تجريبية ميتة. وهكذا، في هذه التجربة، فحصنا سبعة نالات تحكم وثمانية نالات CRISPR-Cas9. وكان جميع النحل حقن مع CRISPR-Cas9 الخلايا التي أخذت في mGlutR1-CRISPR-Cas9. وكانت معظم هذه الخلايا في calyx الجسم الفطر, مجمع مركزي, وprotocerebrum الخلفي. أظهر اثنان فقط من النحل من أصل سبعة ATTO550 الوسم في العديد من الخلايا في الجسم الفطر، مجمع مركزي، والفص الهوائي. ويرد مثال على واحدة من هذه النحل في الشكل 2E. وكان الحد من مستوى تلطيخ mGlutR1 في هذه الاستعدادات كبيرة. النحل الخمسة الأخرى لديها ATTO550 الوسم المقابلة للتسليم الناجح للmGlutR1 CRISPR-Cas9 في الجسم الفطر وprotocerebrum الخلفي ولكن ليس في فصوص الهوائي.
بعد ذلك ، لتقدير مستوى mGlutR1 gDNA المعدلة في النحل 48 ساعة بعد الحقن ، قمنا بإجراء اختبار الإنزال القائم على qPCR ، حيث تم تصميم مسبار الإنزال ليكون في المنطقة بالقرب من دليل mGlutR1. في هذه التجارب، في أدمغة النحل حقن مع mGlutR1-CRISPR-Cas 9، وكان التعديل النسبي لgDNA في 12 النحل 59٪ ± (متوسط ± 33 ٪ SD) مقارنة مع gDNA في النحل غير حقن(الشكل 3A).
كما تم تأكيد هذه النتائج من خلال اختبارات qRT-PCR في مجموعة مختلفة من النحل، حيث قدرنا مستويات الحمض النووي الريبي mGlutR1 باستخدام qRT-PCR في النحل 48 ساعة بعد الحقن مع RNPmGlutR1mix(الشكل 3B). قارنا مستوى mGlutR1 RNA من النحل المغلور 1-CRISPR-Cas9 حقن النحل (ن = 6) مع مستويات الجيش الملكي النيبالي في النحل التي لم يتم حقنها (ن = 6). في هذه التجارب، كان الانخفاض النسبي للmGlutR1 مرنا في النحل حقن 53٪ ± (متوسط ± 18٪ SE) مقارنة مع النحل غير حقن(الشكل 3B).
يظهر القسم من أربعة نحلات مختلفة عبرت عن RNP RDL-CRISPR-Cas9 في خلية كينيون من جسم الفطر في الشكل 4A-D. سبيل المثال نحلة مع ATTO550 الفلورسينس في الجسم الفطر والفص الهوائي هو مبين في الشكل 4E، F.
| ادله | تسلسل | gRNA | RNP |
| [guideRNA: tracrRNA] | [gRNA:Cas9 Nuclease] | ||
| RDL_Guide1 | ACCGTAACGCGACCCCCGCT | GRDL1 | RRDL1 |
| RDL_Guide2 | AACGTCGCGACTTGACGT | GRDL2 | RRDL2 |
| RDL_Guide3 | CCATGACGAAACACGTGCCC | GRDL3 | RRDL3 |
| mGlu_Guide 1 | CGAAAGTATCTGACGGGT | GMGL1 | RMGL1 |
| mGlu_Guide 2 | TTCAACGAGAGCAGTTCAT | GMGL2 | RMGL2 |
| mGlu_Guide 3 | GCAACGTCGGTAGGAGTGA | GMGL3 | RMGL3 |
الجدول 1: تسلسل النيوكليوتيدات من الأدلة المصممة لRDL و mGlutR1.

الشكل 1: توصيف الأجسام المضادة لـ RDL. (أ)التخطيطي للوحدة الفرعية RDL، حيث تشير الدوائر الوردية إلى توطين الببتيد 2 (CVNEKQQYHIATATTTSIRI-amide) في N-terminus والببتيد 1 (CVRFKVHDPKSKGGTL-amide داخل الخلايا) في C-terminus. إدراج في A يظهر العصابات في اللطخة الغربية من مقتطفات الدماغ نحل العسل معالجتها مع الأجسام المضادة لRDL المقابلة (واحد مع مكافحة RDL pep1 ومكافحة RDL pep2). كل مناعي يظهر الحجم الظاهر للبروتين ~ 50-60 كيلو د، المقابلة للأوزان المقدرة من isoform مختلفة من الوحدات الفرعية RDL. (B, C) Preadsorption من الأجسام المضادة لRDL مع الببتيد مترافق 1. الصورة في C يظهر انخفاض في تلطيخ في القسم عندما كانت الأجسام المضادة preincubated مع الببتيد مترافق 1. الجسم على شكل مروحة (FB) والجسم الإهليلجي (eb) هي هياكل مركزية معقدة في الدماغ. M = الفص الميديا من الجسم الفطر. (D1-3) مكافحة RDL تلطيخ عنصر تحكم, غير حقن قسم الدماغ النحل بعد 48 ح. الأخضر يشير إلى التشكيل الجانبي المضادة RDL إيجابية في الدماغ. (د2) لم يتم حقن هذه النحلة ولا تحتوي على ATTO550 الفلورسينس. (د3) الصور المدمجة من D1 و D3. (E1-3) حقن RDL-CRISPR-Cas9 خفضت المضادة لRDL تلطيخ بعد 48 ح.(E2)ATTO550 الفلورسينفية في نواة الخلية وأشار نجاح RDL-CRISPR-Cas9 التسليم. (E3) الصورة المدمجة لمكافحة RDL (الأخضر) وATTO550 (الأحمر). مقياس شريط = 100 ميكرون (B-E). يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: توصيف الأجسام المضادة mGlutR1. (أ)التخطيطي لـ GCPR mGluR الذي يظهر ببتيد الغرانوغاستر Drosophila المستخدم للتحصين. للمقارنة، يظهر الببتيد ميللايفرا أبيس أدناه. تشير الدائرة إلى تعريب الببتيد في المنتصف N من مجال مستقبلات mGlutR1 خارج الخلية. إدراج في ألف يظهر أن الأجسام المضادة لmGlutR1 المعترف بها اثنين من العصابات في اللطخة الغربية من أدمغة النحل ~ 103 kD و ~ 83 kD التي تتوافق مع الأوزان المقدرة من isoforms المعروفة. (B, C) السيطرة المسبقة على الأجسام المضادة mGlutR1 المضادة في قسمين متتاليين من الكبيبات الفص الهوائي. صورة لمكافحة mGlutR1 في المقطع الكبيبات الهوائي في C يظهر الحد من تلطيخ نتيجة للاحتضان المسبق للببتيد المضادة mGlutR1 مع الأجسام المضادة mGlutR1. هذا الإجراء يسبب الجسم المضاد للتعجيل من الحل، الذي يلغي تلطيخ بالمقارنة مع B (السيطرة، وعدم وجود الببتيد في precontrolon). (D1)يظهر تلطيخ مكافحة mGlutR1 في شريحة الدماغ النحل بعد حقن التحكم في ocellus المتوسط. تفتقر هذه الحقنة إلى mGlutR1 gRNA التي تمكن من هدم مستقبلات mGlutR1 بواسطة CRISPR-Cas9 ، وبالتالي لم يتم تقليل تلطيخ الأجسام المضادة لـ mGlutR1 (الخضراء). (د2) عدم وجود ATTO550 الفلوريشير إلى عدم وجود وظيفة CRISPR-Cas9 في الدماغ. (د3) دمج الصور المضادة mGlutR1 وATTO550. (E1-E3)تظهر تلطيخ مكافحة mGlutR1 في قسم الدماغ حيث تم ضرب mGlutR1 بشكل دائم أسفل 48 ساعة بعد الحقن مع mGlutR1-CRISPR-Cas 9 في ocellus المتوسط. وهكذا ، يتم تقليل تلطيخ في هذا الدماغ إلى حد كبير بسبب خروج المغلوب الناجح من mGlutR1 في العديد من الخلايا. (E2) ATTO550 تلطيخ في العديد من نواة الخلية في أدمغة النحل يشير إلى أن حقن mGlut1-CRISPR-Cas 9 كان ناجحا. (E3) صورة مدمجة من ATTO550 (أحمر) ومكافحة mGlutR1 (الأخضر). مقياس شريط = 10 ميكرون (B, C); 100 ميكرومتر (D, E). يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3: تقييم gDNA المعدلة والتعبير عن مرنا من RDL وmGlutR1 مرنا في أدمغة النحل 48 ساعة بعد الحقن مع 345 nL من RPN CRISPR-Cas9 المقابلة. (أ)تم حساب اختبار فحص الإنزال المستند إلى qPCR لتقييم كمية الحمض النووي الصبغي مع منطقة تعديل باستخدام طريقة 2-ΟΟCt وتطبيعها ضد السيطرة ، والأدمغة غير المحقونة. يتم التعبير عن البيانات على أنها متوسط + SD.(B)تم استخدام اختبار TheqRT-PCR لتقييم كمية مرنا في كريسبر-كاس9 النحل عن طريق الحقن وغير المحقون. تم استخدام AmActin كجين مرجعي. تم حساب التعبير الجيني النسبي باستخدام طرق2 -ΟΟCt وتطبيع ضد السيطرة، والعقول غير المحقونة. يتم التعبير عن البيانات على أنها تعني + SE. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 4: مثال على توزيع RNP CRISPR-Cas9 في أدمغة النحل عن طريق ATTO550 الفلورية. (A-D) أقسام الدماغ من أربعة النحل المختلفة التي عبرت عن RNP RDL-CRISPR-Cas9 في خلية كينيون من الجسم الفطر. (E, F) مثال على اثنين من العقول 48 ساعة بعد الحقن مع RNPmGlutR1 CRISPR-Cas9. مقياس شريط = 150 ميكرون (A-F). يرجى الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
توصيف مكافحة RDL ومكافحة mGlutR1
أولا، نحن تتميز المضادة لمكافحة RDL ومكافحة mGlutR1 بواسطة المناعة والامتزاز قبل على شرائح من أدمغة نحل العسل الثابتة. تم إجراء كل جسم مضاد للتعرف على جميع أشكال النظائر المعروفة ، ويظهر التحليل الغربي أنهم يعترفون بالعصابات التي تتوافق مع أوزانهم الجزيئية المتوقعة. بعد ذلك ، تم حظر كلا الأجسام المضادة من قبل الببتيد المترافق الذي تم إنتاجهما على أقسام الدماغ نحل العسل.
كان أحد الأهداف الأولى في دراستنا هو إثبات أن الأجسام المضادة المنتجة ضد الببتيد المترافق محددة خاصة ببروتينها في أنسجة الدماغ الثابتة. ولهذا الغرض، استفدنا من نظام كريسبر - كاس9. قمنا بتصميم أدلة محددة لـ HONEYbee RDL و mGlutR1 واستخدمنا كل واحد منهم لصنع CRISPR-Cas9 المسمى مع مسبار الفلورسنت ATTO550. لكل مستقبلات، ونحن حقن خليط من ثلاثة مختلفة CRISPR-Cas9 ribonucleoproteins في ocelli للحد من كمية البروتين المستهدف في الدماغ نحل العسل الكبار عن طريق القضاء على الجين المقابلة في الخلايا التي اتخذت لدينا تصميم نظام Cas9. في دراستنا، أنجزنا هذه الخطوة.
واحدة من الخطوات الحاسمة الأولى لنجاح هذه التجارب هو تصميم دليل مناسب RNAs. نوصي بتصميم ما يصل إلى خمسة أدلة RNAs ، وتقع في البداية والوسط ونهاية التسلسل الجيني. في عملنا الأولي، اختبرناها في مجموعات مختلفة على ثلاثة إلى خمسة نحل. حاولنا أيضا تركيزات مختلفة من الحقن، فضلا عن مرات بعد الحقن، وخلائط مختلفة من RNP في الحقن. قمنا بتشريح الأدمغة ومعالجتها باستخدام الأجسام المضادة المضادة لـ RDL ومكافحة mGlutR1. في هذه الاختبارات الأولية، أنشأنا المزيج المناسب، وقت ما بعد الحقن، فضلا عن تركيز وكمية CRISPR-Cas9 للحقن. وكانت هذه الاختبارات الأولية هي الأساس لإعداد التجارب التي وصفناها بالتفصيل هنا.
كان الهدف مزدوجًا: 1) أن نثبت في النحلة أن تلطيخ الأجسام المضادة لدينا قد انخفض بعد العلاج باستخدام CRISPR-Cas9 و 2) للعمل من خلال أفضل الظروف التجريبية للدراسات السلوكية. وهكذا، ونحن نظهر أنه إذا كان العديد من نواة الخلية تحتوي على CRISPR-Cas9 48 ساعة بعد الحقن، والحد من المضادة لRDL والمضادة لmGlutR1 تلطيخ كبير. بالإضافة إلى ذلك، أن يدل على أن الأجسام المضادة اختبارها تعترف على وجه التحديد بروتين mGlut1 وRDL في إعداد الدماغ نحل العسل وأنه يمكن استخدامها لدراسات التعريب في الدماغ نحل العسل.
الإعداد التجريبي CRISPR-Cas9 للدراسة السلوكية
بعد ذلك ، قمنا بإعداد التجارب بحيث يمكن استخدام CRISPR-Cas9 في الدراسات السلوكية. تم جمع ثمانية أو تسعة نحل عسل للتحكم والعلاجات التجريبية. تم اختبارها سلوكيا قبل وبعد الحقن، ومن ثم تم تجهيز أدمغتهم لATTO550 و / أو الكيمياء المناعية لتحديد مناطق الدماغ التي أظهرت انخفاضا في البروتين المستهدف. هنا من الضروري أن نلاحظ أن عدد النحل المأخوذ لمجموعة واحدة من التجارب كان يقتصر على ما لا يزيد عن 8-9 النحل للسيطرة والظروف التجريبية. وبهذه الطريقة يمكن اختبار كلا الشرطين في نفس اليوم. أيضا، مرة واحدة ونحن إعداد مخاليط CRISPR-Cas9 للحقن، ونحن أبدا تجميدها. لم يتغير خليط CRISPR-Cas9 في الفعالية عند استخدامه لمدة 3 أيام متتالية وأبقى عند 4-8 درجة مئوية. ومع ذلك، لم نختبره بعد 3 أيام.
كما وصفنا في قسم النتائج لكلا المجموعتين من الحقن التجريبية ولكل من الأجسام المضادة، وأظهرت ثلاثة فقط من النحل من 16 اختبار توزيع كبير ATTO550 في الجسم الفطر، بروتوسيدبروم، وفصوص الهوائي. في جميع النحل الأخرى ، كان توزيع CRISPR-Cas9 يقتصر على جسم الفطر ، والمجمع المركزي ، و / أو البروتوسيدبرومي الخلفي. من الضروري أن نفهم لأي دراسات سلوكية أن استخدام طريقة الحقن هذه سيتم تقييد الحد من البروتين المستهدف فقط إلى جسم الفطر في معظم النحل. لن يمتد إلى الفص الهوائي أو العقدة تحت المريء. وبالتالي ، فإن تقنية الحقن التي نستخدمها مناسبة لدراسة تأثير الحد من المستقبلات في جسم الفطر والمجمع المركزي في التجارب السلوكية ، في حين أن طريقة مختلفة لإدخال CRISPR-Cas9 ستكون أكثر ملاءمة لدراسة مناطق الدماغ الأخرى.
في الختام، أظهرت دراستنا التطبيق الناجح لCRISPR-Cas9 كتحكم لتلطيخ الأجسام المضادة في الدماغ. لكل من الأجسام المضادة (المضادة RDL ومكافحة mGlutR1) ، عندما كان من شأن الاستفادة من mGlutR1 - CRISPR - Cas9 أو RDL - CRISPR - Cas9 ناجحة ، كما انخفض مستوى تلطيخ الأجسام المضادة المقابلة بشكل كبير. أيضا، من الضروري أن نلاحظ أن الحقن في أوتشيلي أدى إلى توزيع CRISPR-Cas9 في الدماغ التي لم تكن متجانسة. تفاوت التوزيع من منطقة صغيرة تحيط بجسم أوتشيلي والفطر إلى العديد من الخلايا في الدماغ كله. كان من المرجح أن يكون اختلاف mGlutR1-أو RDL-CRISPR-Cas9 من قبل الخلايا بسبب الاختلاف في الحقن. تظهر بياناتنا أن نظام CRISPR-Cas9 يعمل في نحل العسل ، ولكن طريقة الحقن تحتاج إلى تحسين للحد من تباين تناول CRISPR-Cas9 عبر أدمغة النحل الفردية. ضمن هذه القيود ، أصبح من الممكن الآن استخدام هذه التقنية للتلاعب بالجينات في النحل البالغ للتجارب السلوكية.
وليس لدى صاحبي البلاغ ما يكشفان عنه.
وقد دعم هذا العمل الجوائز التالية التي منحت هاوووووووووووووووووووووووووووووووووووووووووووووو المعاهد الوطنية للصحة (R01 GM113967)؛ مختبر أفكار NSF (1556337). تم تصميم الببتيد والأجسام المضادة لDmGlura في المختبر الدكتور سيرج بيرمان (مرسيليا، لوميني، فرنسا) عندما تم دعم IS من قبل برنامج d'Urgence FRM/Postdocs UFP20060306548 من مؤسسة من أجل لا Recherche Medicale. نحن ممتنون لدانييلا Junqueira Marosi وأليكس هاانتر من تكنولوجيا الحمض النووي المتكاملة (IDT) للمساعدة في تصميم أدلة RDL واختبارات الإنزال qPCR.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| حمض الخليك | سيجما ألدريتش | A6283_100 مل | النشاف الغربي |
| أكريلاميد مكرر أكريلاميد | بيو راد | 500 مل 1610156 | النشاف الغربي |
| Agarose | Sigma-Aldrich | A0169-250g | يستخدم مع الماء المقطر لإصلاح دماغ نحل العسل في كتل |
| Alexa Fluor 488 AffiniPure F (ab') 2< / sub> جزء حمار مضاد للأرانب IgG (H + L) | جاكسون مختبرات الأبحاث | 711-546-152 | جسم مضاد ثانوي للكشف عن الأجسام المضادة الأولية من الأرانب |
| Alt-R CRISPR-cas9 tracrRNA-5'ATTO | IDT | 1075934 | مع دليل الحمض النووي الريبي المصمم ، فإنه يخلق gRNA |
| Alt-R S.p. Cas9 nuclease V3 | IDT | 1081058 | إنزيم يستخدم لصنع البروتين النووي الريبي لنظام كريسبر |
| الأمونيوم بيرسولفات | Bio-RAD | 10 جم 1610700 | النشاف الغربي |
| الأجسام المضادة ل mGlutR1 | Covalab (فرنسا) / 21st Century Biochemical | التي تميز بها المؤلفون في هذه الورقة | المستخدمة للحضانة الأولية ل mGlut 1 في نحل العسل |
| الأجسام المضادة ل RDL | الكيمياء الحيوية في القرن الحادي | التي تميزها المؤلفون في هذه الورقة | المستخدمة في الحضانة الأولية ل RDL في نحل العسل |
| أبروتينين | سيجما ألدريتش | Y0001154 | مثبط البروتياز |
| مقص باراكير قزحية 7 مم شفرة نقطة حادة | أدوات الدقة العالمية | 14128-G | تستخدم لتشريح دماغ نحل |
| العسل بنزاميد | سيجما ألدريتش | 12072 | مثبط البروتياز |
| الشفرة (قابل للكسر) لحامل الشفرة | أداة العلوم الدقيقة | 10050-00 | تشريح للنشاف الغربي |
| حامل الشفرة والقاطع | أداة العلوم الدقيقة | 15309 | تشريح للنشاف الغربي |
| الشعيرات الدموية الزجاجية البورسليكات | العالمية أدوات الدقة | 1B100 F | لإجراء الحقن |
| الركيزة للكشف عن اللطخة الغربية الكيميائية | Bio-Rad | 1705062 | النشاف الغربي |
| الكلوروفورم | سيجما ألدريتش | 472476-50 مل | عزل الحمض النووي |
| الريبي Dithiothreitol | Bio-Rad | 1610611 | النشاف الغربي |
| مجموعة الحمض النووي السهلة | QIAGEN | 69504 | استخراج الحمض النووي مجموعة |
| خالية من الحمض | INVITROGEN | AM1907 | تستخدم لإزالة الحمض النووي |
| Eppendorf Research plus ماصة ، 3 عبوات | Sigma-Aldrich | Z683884 | |
| Falcon 24 Well Polystyrene Multiwell | Falcon | 351147 | Multiwell |
| كبسولات تضمين القاع المسطح ، مجهر إلكتروني البولي إيثيلين | سلة العلوم | 70021 | لأقسام الدماغ |
| ملقط دومون # 5 (زوج) | أداة العلوم الدقيقة | 11254-20 | لتشريح دماغ نحل العسل من الرأس |
| ملقط دومون #5S (زوج) | أداة العلوم الدقيقة | 11252-00 | لتنظيف الدماغ من القصبة الهوائية قبل تشريح |
| التعبير الجيني الرئيسي مزيج | تقنيات الحمض النووي المتكاملة | 1055770 | إسقاط |
| qPCRغلوتارالديهايد | EMS | 16220 | يستخدم لتحضير اقترانات الببتيد للتحكم في امتصاص البيسرين |
| Glycerol | Sigma-Aldrich | G5516-500 مل | النشاف الغربي ، تضمين الوسائط |
| Glycine | Bio-Rad | 1610718 | النشاف الغربي |
| مختبرات شبكة النايلون المصفاة الكارهة للماء | Spectrum | 145910 | لقاع السلة لأقسام الدماغ |
| الأيزوبروبيل الكحول | سيجما ألدريتش | I9030-50mL | عزل الحمض النووي الريبي |
| ثقب المفتاح ليمبيت الهيموسيانين | سيجما-ألدريتش | H7017 | المستخدمة لتحضير المترافقات للتحكم |
| المجهر متحد البؤر LSM800 | Zeiss | ||
| mGlu_Guide 1 | IDT | دليل RNA المصمم ل CRISPR-Cas 9. استهداف تسلسلات الجينوم mGlutR1 | |
| mGlu_Guide 2 | IDT | دليل RNA المصمم ل CRISPR-Cas 9. استهدف تسلسل الجينوم mGlutR1 | |
| mGlu_Guide 3 | IDT | دليل RNA المصمم ل CRISPR. الهدف mGlutR1 تسلسل الجينوم | |
| الميثانول | سيجما ألدريتش | 34860 | النشاف الغربي |
| 96 بئر PCR صفيحة دقيقة | النظام الحيوي | التطبيقي 4346907 | qPCR مقايسة السقوط و qRT-PCR |
| 384-well PCR microplate | Sigma-Aldrich | Z374911 | qRT-PCR |
| الزيوت المعدنية | Sigma-Aldrich | M5904_500mL | لإجراء الحقن |
| موديل p87 المشتعلة براون Micropipette مجتذب | Sutter Instrument Co. | تحضير الشعيرات الدموية | |
| Mowiol 4-88 | Sigma-Aldrich | 81381 | لتضمين الحل |
| Nanoliter 2000 | World Precision Instruments جهاز | حقن | |
| مصل الحمار العادي | مختبرات أبحاث | AB_2337258 جاكسون | عامل حجب للكيمياء المناعية |
| مصل الماعز غير المناعي | Invitrogen | 50-062Z 100 مل | عامل حجب للنشاف المناعي |
| المخزن المؤقت الخالي من Nuclease | IDT 1072570 | المخزن المؤقت الخالي من Nuclease والذي يستخدم في تحضير حقن CRISPR-Cas9 | |
| ماء خال من Nuclease | IDT | AM9337 | - ماء خال من النوكلياز يستخدم في تحضير نظام CRISPR-Cas 9 |
| OrbitalShaker Mp4 | Genemate | ||
| Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | 158127-500 جم | يستخدم مع PBS لصنع مثبت لأدمغة النحل |
| فينيل ميثيل سلفونيل فلوريد (PMSF) | سيجما ألدريتش | P7626-250 مجم | مثبط البروتياز |
| عازلة الفوسفات الملحية | سيجما-ألدريتش | P4417-100TAB | يستخدم مع بارافورمالديهايد كمثبت ؛ عازلة للأجسام المضادة |