يصف هذا البروتوكول طريقه تنقيه لبروتين الكالسيوم الخالي من العلامات المؤتلف S100A12 والقلة المستحثة بالأيونات لاختبارات تحفيز البويضات البشرية.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
يصف هذا البروتوكول طريقه تنقيه لبروتين الكالسيوم الخالي من العلامات المؤتلف S100A12 والقلة المستحثة بالأيونات لاختبارات تحفيز البويضات البشرية.
في هذا البروتوكول ، ونحن وصف طريقه لتنقيه الإنسان الكالسيوم ملزمه البروتين S100A12 ولها الأيونات الناجمة عن الايونيه من الثقافة القولونية لتحفيز الخلايا المناعية. ويستند هذا البروتوكول علي استراتيجية الفصل اللوني من خطوتين ، والتي تشمل البروتين قبل تنقيه علي عمود اللوني التبادل انيون وخطوه تلميع اللاحقة علي عمود التفاعل مسعور. وتنتج هذه الاستراتيجية S100A12 بروتين عالي النقاء والغلة بتكاليف يمكن التحكم فيها. لاختبارات وظيفية علي الخلايا المناعية بقايا في نهاية المطاف التلوث اندوتوكسين يتطلب الرصد الدقيق والمزيد من الخطوات التنظيف للحصول علي البروتين الخالي من اندوتوكسين. ويمكن استبعاد غالبيه تلوث السمية المعوية من خلال الفصل اللوني لتبادل انيون. لاستنفاد تلوث المتبقية ، يصف هذا البروتوكول خطوه أزاله مع مرشحات الطرد المركزي. اعتمادا علي القوه الأيون المتاحة S100A12 يمكن ان يرتب في homomultimers مختلفه. وللتحقيق في العلاقة بين الهيكل والوظيفة ، يصف هذا البروتوكول أيضا المعالجة الايونيه للبروتين S100A12 التي تليها الوصلات الكيميائية لتحقيق الاستقرار S100A12 قله المواليد وانفصالها اللاحق بالحجم-الاستبعاد اللوني. وأخيرا ، فاننا نقوم بوصف الفحص القائم علي الخلايا الذي يؤكد النشاط البيولوجي للبروتين المنقي ويؤكد التحضير الخالي من LPS.
S100A12 هو بروتين ملزم الكالسيوم الذي يتم إنتاجه في الغالب من قبل المحببات البشرية. يتم الإفراط في البروتين خلال (الجهازية) التهاب ومستويات المصل ، وخاصه في (السيارات) الامراض التهابيه مثل التهاب المفاصل الجهازية الاحداث مجهول الشكل (sJIA) ، حمي البحر الأبيض المتوسط العائلية (FMF) أو مرض كاواساكي (KD) يمكن ان تبلغ عن نشاط المرض والاستجابة للعلاج. اعتمادا علي مستقبلات التعرف علي النمط (PRRs) مثل المستقبلات مثل الحصيلة (TLRs) ، يمكن تنشيط الجهاز المناعي الفطري من الأنماط الجزيئية المرتبطة بالممرض (PAMPs) مثل الليبوكوليساشاريدس (LPS) أو تلف الأنماط الجزيئية المرتبطة (DAMPs; ويطلق عليه أيضا اسم "الاردقائق". DAMPs هي جزيئات الذاتية مثل البروتينات الخلوية ، والدهون أو الأحماض النووية1. ووصفت بشكل جيد وظائف رطبه لأعضاء عائله البروتين كالغرولين ، S100A8/A9 و S100A122، والتي يتم أيضا الإبلاغ عنها للعمل كمعدن ثنائي التكافؤ الأيونات المضادة للميكروبات الببتيدات3،4، 5,6. [دبندينغ ون] ال يتوفر أيون قوه S100A12 علبه, مثل أخرى أعضاء من ال S100 أسره, يرتب داخل [هوميمرمررس] مختلفه وحتى مؤخرا التاثير من [S100A12-اوليغمرايشن] علي [بر]-تفاعل, بشكل خاص TLR4, كان مجهوله.
يتكون البروتين الأحادي الشكل (92 الأحماض الامينيه ، 10.2 كده) من اثنين من الهياكل الحلزونية اللولبية المتصلة بواسطة رابط مرن. و C-الطرفية ef-اليد يحتوي علي الكلاسيكية Ca2 +-ربط عزر في حين ان N-الطرفية ef-اليد يسلك هيكل حلقه موسعه البروتين الخاصة S100 (' الزائفة-ef-اليد ') ويكشف انخفاض Ca2 +-تقارب. Ca2 +-ملزم من قبل S100A12 يمكن ان تحفز علي تغيير المطابقة الرئيسية في البروتينات ' C-المحطة ، مما يؤدي إلى التعرض لرقعه مسعورة علي كل مونومر ويشكل واجهه ديميريشن. وهكذا ، في ظل الظروف الفسيولوجية ، أصغر هيكل رباعي شكلتها S100A12 هو ديمر غير التكافؤ (ما يقرب من 21 كده) فيها مونومرات الفردية في اتجاه مضاد للمتوازي. عندما رتبت كما dimer, وذكرت S100A12 لتنحيه الزنك2 + فضلا عن غيرها من أيونات المعادن ثنائي التكافؤ, علي سبيل المثال, Cu2 + مع تقارب عاليه7. وتنسق هذه الأيونات في واجهه S100A12 ديمر بواسطة الأحماض الامينيه H15 وD25 الوحدة الفرعية واحده وH85 فضلا عن H89 الفرعية الأخرى8,9,10المضادة لمتوازي الأضلاع. في حين ان الدراسات السابقة تقترح ان الزنك2 +-تحميل S100A12 قد تحفز منظمه البروتين إلى الإنسان-الترام (44 كده) ويؤدي إلى زيادة Ca2 +-تقارب11,12, المعايرة الاخيره المعادن دراسات6 تشير Ca2 +-ملزم من قبل S100A12 لزيادة تقارب البروتين إلى الزنك2 +. مره واحده S100A12 EF-الأيدي التي احتلت بالبالكامل من قبل Ca2 +، ويعتقد ca2 + اضافيه للربط بين الدمامل ، مما اثار تشكيل hexamer (حوالي 63 كده). ومن الواضح ان البنية المعمارية للهيكل السداسي الأضلاع مختلفه عن الهيكل الرباعي. ومن المقترح ان يتم تعطيل واجهه رباعيه لتؤدي إلى واجات dimer-dimer الجديدة التي تفيد تشكيل hexamer10. يتم التعبير عن S100A12 بشكل حصري تقريبا من قبل المحببات البشرية حيث تشكل حوالي 5 ٪ من جميع البروتين السيتووليك13. في وظيفته رطبه S100A12 وصفت تاريخيا بأنه ناهض من متعددة ligand مستقبلات للمنتجات النهائية glycation المتقدمة (الغضب) ، ثم وصفت حديثا خارج الخلية المعروفة الغضب البروتين ملزمه (EN-الغضب)14. وان كنا قد أبلغت في وقت سابق S100A12 البيوكيميائية لكل من الغضب و TLR415، ونحن أظهرت مؤخرا الخلايا الاحاديه الإنسان للرد علي التحفيز S100A12 بطريقه تعتمد علي TLR416. وهذا يتطلب ترتيب S100A12 في المرجع المصدق2 +/Zn2 +-المستحثة سداسي الأضلاع هيكل كوارتيراري16.
هنا نحن وصف اجراء تنقيه لS100A12 البشرية المؤتلف والتي يسببها الأيونات لتحفيز الخلايا المناعية16,17. ويستند هذا علي استراتيجية الفصل اللوني من خطوتين ، والتي تتضمن في البداية عمود انيون-تبادل لعزل وتركيز البروتين وأزاله التلوث السائبة (علي سبيل المثال ، اندوتوكسين/ليبووليساشاريدس)18. راتنجات الفصل اللوني للتبادل الأيوني بروتينات منفصلة علي أساس مختلف صافي الرسوم السطحية. للبروتينات الحمضية مثل S100A12 (نقطه ايزوالكتريك من 5.81) ، ونظام العازلة مع درجه الحموضة من 8.5 وقويه انيون-تبادل الراتنج يؤدي إلى فصل جيد. تم التملص من البروتينات المنضمة مع التدرج العازلة عاليه الملح. مع زيادة الأيونات السلبية قوه الايونيه في العازلة التهرب تتنافس مع البروتينات للرسوم علي سطح الراتنج. البروتينات بشكل فردي الوت اعتمادا علي صافي التهمه ونتيجة لذلك ، والمخازن المؤقتة الموصوفة هنا تسمح لعزل وتركيز البروتين S100A12 الإفراط في التعبير. بسبب الجماعات المشحونة سلبا في الليبووليساشاريدس ، ترتبط هذه الجزيئات أيضا إلى راتنجات التبادل انيون. ومع ذلك ، فان ارتفاع الرسوم الصافية يؤدي إلى التملص في وقت لاحق في التدرج عاليه الملح المطبق. وقد تم إدخال الخطوة الثانية من اجراء تنقيه لتلميع الأغراض. وهذا يجعل استخدام قدره ربط الكالسيوم من S100A12 ويزيل الشوائب المتبقية علي عمود التفاعل مسعور. الكالسيوم ملزمه من S100A12 يؤدي إلى تغيير المطابقة والتعرض للبقع مسعور علي سطح البروتين. علي هذا الشرط ، يتفاعل S100A12 مع سطح مسعور من الراتنج. علي الكالسيوم-chelating من قبل أدتا ، يتم عكس هذا التفاعل. في وجود الأيونات ، وخاصه الكالسيوم والزنك ، S100A12 يرتب في الأقليات homomeric. لدراسة هيكل العلاقات وظيفة من القلة المختلفة ، ونحن استقرت ديميريك ، رباعيه الS100A12 والمؤتلف هيكاميرك مع الرابط الكيميائية وفصل المجمعات علي عمود اللوني الاستبعاد الحجم. وأخيرا ، لتحليل الأداء الوظيفي والنشاط البيولوجي للبروتين المنقي والقلة المستحثة بالأيونات ، يمكن مقارنه الإصدار الخلوي من S100A12 و LPS الذي يحفز البويضة الاحاديه.
وقد وصفت طرق مختلفه لتنقيه S100A12 حتى الآن. وعلي سبيل المثال ، نشر جاكسون وآخرون19بروتوكولا بالتنقية عن طريق عمود التبادل انيون والفصل اللوني اللاحق لحجم الاستبعاد. تلميع تنقيه علي عمود الحجم الاستبعاد يؤدي إلى نتائج جيده ، ولكن-بسبب علي سبيل المثال احجام التحميل محدوده-اقل مرونة في قابليه التحجيم. نهج مختلف ، نشرتها قبله وآخرون20، يصف تنقيه البروتين الموسومة عن طريق Ni2 + عمود التقارب كخطوه تنقيه الاولي ، تليها الانقسام الانزيمي لأزاله العلامة والمزيد من خطوات تنقيه. علي النقيض من الدراسات aforecited19،20، يتم تحديد البروتين المنتجة كما هو موضح في هذا البروتوكول للتجارب علي الخلايا المناعية. ولذلك ، فان بقايا التسمم المعوي من الثقافة البكتيرية هو تحد. علي الرغم من انه قد تم وصف النهج المختلفة لأزاله الذيفان المعوي حتى الآن ، لا توجد طريقه موحده تعمل بشكل جيد علي قدم المساواة لأي محلول بروتين معين21،22.
وباختصار ، فان بروتوكولنا يجمع بين مزايا التعبير الخالي من العلامات في نظام بكتيري مع أزاله اندوتوكسين فعاله والغلة العالية من البروتين النقي.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ملاحظه: يرجى الرجوع إلى الجدول التكميلي 1 لاعداد المخازن المؤقتة وحلول الأسهم.
1. البروتين التعبير في كولاي
2. تنقيه البروتين
3. كشف وأزاله السموم الباطنة
4. الربط الكيميائي والانفصال اوليغمير
5. اختبار وظيفي علي الخلايا الاحاديه
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وبعد التنقية المسبقة علي عمود AIEX (الشكل 1ا-ج) وما تلاها من الائتلاف الذي يعتمد علي الكالسيوم (الشكل 2ا ، ب) ، تم الحصول علي بروتين نقي للغاية (الشكل 2c). الاضافه إلى ذلك ، كشفت قياسات السمية المعوية أزاله LPS ناجحه. تم قياس المحتوي LPS بعد AIEX في التخفيف 1:10 فوق حد الكشف عن الفحص ، اي فوق 500 الاتحاد الأوروبي/mL. بعد الترشيح الأول من خلال وحده تصفيه 50 ده ، تم تخفيض محتوي LPS إلى 1 الاتحاد الأور...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
في هذا البروتوكول ، ونحن وصف خاليه من العلامات البكتيرية التعبير عن S100A12 الإنسان وتنقيتها ، فضلا عن الانفصال في مختلف الأيونات الناجمة عن الايونيه لتحفيز الخلايا المناعية. بالمقارنة مع المؤلفات المنشورة علي S100A12 تنقيه البروتين8،23،24، واستخدام عاليه cacl2 (25 ملم) في اللوني التفاعل مسعور هو لمعرفتنا فريدة من نوعها. العديد من البروتوكولات تطبيق تركيزات من 1 إلى 5 ملم لا تنتج البروتين النقي ، ومع ذلك لاحظنا عده مر...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وليس لدي المؤلفين ما يفصحون عنه.
وكانت هذه الدراسة مدعومة بمنح من برنامج البحوث الطبية المبتكرة داخل كليه الطب بجامعه مونستر (KE121201 إلى سي كي) ومؤسسه البحوث المانيه (DFG ، Fo354/3-1 إلى D.F).
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| pET11b ناقلات | Novagen | < / strong> | |
| BL21 (DE3) المختص الإشريكية القولونية < / em> | نيو إنجلاند بيولابس | C2527 | < قوي> ؛ |
| < / قوي> | |||
| 100x الأحماض الأمينية غير الأساسية Merck | K 0293 | ||
| 25٪ HCl | Carl Roth | X897.1 | |
| 4 & ناقص ؛ 20٪ جل بروتين Mini-PROTEAN TGX | BioRad | 4561093 | |
| ملح الصوديوم أمبيسلين | كارل روث | HP62.1 | |
| BS3 (مكرر (سلفوسوكسينيميديل) سوبيرات) - 50 مجم | ThermoFisher Scientific | 21580 | |
| كالسيوم كلوريد ثنائي هيدرات | كارل روث | 5239.1 | |
| Coomassie Briliant Blue R250 Destaining Solution | BioRad | 1610438 | |
| Coomassie Briliant Blue R250 محلول تلطيخ | BioRad | 1610436 | |
| EasySep طقم تخصيب الخلايا الأحادية البشرية | Stemcell | 19059 | طقم عزل الخلايا السالبة المغناطيسية |
| EDTA ثنائي هيدرات ملح ثنائي الصوديوم | كارل روث | 8043.1 | |
| EGTA | Carl Roth | 3054.3 | |
| EndoLISA | Hyglos | 609033 | الكشف عن السموم الداخلية فحص |
| فائق النقاء خال من السموم | الداخلية سيجما-ألدريتش | TMS-011-A | ماء عالي النقاء لتحضير المخازن الخالية من السموم |
| الداخلية EndoTrap red | Hyglos | 321063 | راتنج إزالة السموم |
| الداخلية FBS (معطل حراريا) | Gibco | 10270 | |
| HBSS ، خال من الكالسيوم ، خال من المغنيسيوم | ThermoFisher Scientific | 14175053 | |
| Hepes | كارل روث | 9105 | |
| هيبس (خصية ذيفان داخلي عالية الجودة) | Sigma-Aldrich | H4034 | |
| hTNF-alpha - مجموعة OptEia ELISA | BD | 555212 | |
| IPTG (isopropyl-ß-D-thiogalactopyranosid) | Carl Roth | CN08.1 | |
| L-Glutamine (200 mM) | Merck | K 0282 | |
| LB-Medium | Carl Roth | X968.1 | |
| عديدات السكاريد الدهنية من الإشريكية القولونية < م > O55: B5 | Merck | L6529 | |
| Pancoll ، | PAN Biotech | P04-60500 | (الطرد المركزي المتدرج الكثافة) |
| البنسلين / الستربتومايسين (10.000 وحدة / مل) ميرك | A 2212 | ||
| فينيل سيفاروز عالي الأداء | GE Healthcare | 17-1082-01 | راتنج ل كروماتوغرافيا التفاعل الكارهة للماء |
| Polymyxin B | Invivogen | tlrl-pmb | |
| أقراص مثبطات البروتياز | Roche | 11873580001 | |
| Q Sepharose Fast Flow | GE Healthcare | 17-0510-01 | راتنج لكروماتوغرافيا تبادل الأنيون |
| RoboSep العازلة | Stemcell | 20104 | المخزن المؤقت لفصل الخلايا (القسم 5.1.4) |
| RPMI 1640 متوسط | ميرك | F 1215 | |
| كلوريد الصوديوم (كلوريد الصوديوم) | كارل روث | 3957.2 | |
| هيدروكسيد الصوديوم | كارل روث | P031.1 | |
| تريس بيس | كارل روث | 4855.3 | |
| كلوريد الزنك | كارل روث | T887 | |
| <قوي > مختبر < قوي> | قوي | ||
| 0,45 & الميكرو; مرشح المحقنة | m Merck | SLHA033SS | |
| 14 مل أنابيب مستديرة | BD | 352059 | |
| 2 لتر قارورة Erlenmyer | Carl Roth | LY98.1 | |
| 24 ألواح تعليق بئر | Greiner | 662102 | |
| 5 لتر دورق قياس | Carl Roth | CKN3.1 | |
| 50 مل أنابيب الطرد المركزي المخروطية | Corning | 430829 | |
| 50 مل أنابيب الطرد المركزي عالية السرعة | Eppendorf | 3،01،22،178 | |
| Amicon Ultra-15 وحدة تصفية الطرد المركزي MWCO 3 كيلو دالتون | ميرك | UFC900324 | |
| Amicon Ultra-15 وحدة تصفية الطرد المركزي MWCO 50 kDa | Merck | UFC905024 | |
| طبق ثقافة (100 مم) | Sarstedt | 83.3902 | |
| أنابيب غسيل الكلى | طيف | 132738 | |
| مغناطيس EasySep "The Big Easy" | Stemcell | 18001 | |
| أنابيب تجميع الكسور 5 مل | Greiner | 115101 | |
| فيلم Lumox ، 25 & micro ؛ م ، 305 مم × 40 م | Sarstedt | 94،60،77،316 | فيلم لألواح ثقافة الخلايا |
| الأحادية Spectra / Por غشاء غسيل الكلى (3.5 كيلو دالتون) وحدة | تصفية 132724 | ||
| الطيف | Merck | SCGPT01RE | |
| <قوي > المعدات < / قوي > | |||
| 37 درجة ؛ حاضنة C (مع الاهتزاز) نيو | برونزويك Scientific | Innova 42 | |
| & Auml ؛ جهاز تنقية KTA UPC 10 | GE Healthcare | FPLC System | |
| Fraction | Collector GE Healthcare | Frac-920 | |
| طرد مركزي (مع الدوار A-4-81) | Eppendorf | 5810R | |
| دوار بزاوية ثابتة | Eppendorf | F-34-6-38 | |
| Mini Protean Tetra Cell | BioRad | 1658000EDU | |
| NanoPhotometer | Implen | P330 | |
| Sonicator | Brandelin | UW2070 | |
| قارئ مضان | Tecan | لانهائي M200PRO | |
| مقياس الأس الهيدروجيني | Knick | 765 |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.