وقد تم القيام بجميع الاعمال الموصوفة في هذا البروتوكول مع الهيكل العضوي المنشا سابقا والعضوية المشتقة من المريض. تم تنفيذ جميع الاعمال الحيوانية وفقا للمبادئ التوجيهية للبحوث مركز الموارد الحيوانية من النصب التذكاري سلون كيتيرنج مركز السرطان (IACUC: 06-07-012). تم جمع جميع الانسجه المستمدة من المرضي وفقا للقواعد والانظمه الخاصة بمركز السرطان التذكاري سلون كيتيرنج (الهجرة: 12001).
1. الاعداد المتوسطة والعازلة
- ذوبان مصفوفة غشاء الطابق السفلي (علي سبيل المثال ، الحاكم) في 4 درجه مئوية بين عشيه وضحيها قبل بدء التجربة. يبقيه علي الجليد اثناء الاستخدام.
- وضع لوحات الثقافة في 37 درجه مئوية لمده 24 ساعة قبل التجارب. وهذا سوف يساعد علي قبة مصفوفة غشاء الطابق السفلي (يشار اليها فيما بعد بالقبة المصفوفة) لتتبلمر. ويوصف الطلاء العضوي في الخطوة 2-1-2.
- اعداد المتوسطة organoid وفقا للبروتوكول المعمول به5.
- اعداد المتوسطة organoid دون أضافه عامل نمو البشرة (EGF ؛ انظر جدول المواد للمكونات). EGF يقمع الإنتاج العابر لل AR ويضفي مقاومه ضد الاندروجين5.
- جهزوا النسر المعدل من دولبيكو (DMEM) بمصل بقري جنيني بنسبه 10%.
ملاحظه: يتم استخدام هذه الوسائط لمنع الهضم الانزيمي مع استبدال التريبسين في الأقسام 2-4.
- اعداد حلول المخدرات وفقا لبروتوكول الشركة المصنعة. ل enzalutamide/mdv3100 (يشار اليها فيما بعد باسم الجيل الثاني المضادة للالاندروجين) ، واعداد حل الأسهم من 100 μM في ثنائي ميثيل سولفوكسيد (DMSO). يمكن تخزين المخزون في-20 درجه مئوية لمده تصل إلى 6 أشهر وليس من الضرورة ان تكون طازجه.
2. العزلة ، والهضم الانزيمي ، وإنشاء الهيكل العضوي
- عزل البروستاتا العضوي من الماوس أو الانسجه البشرية وفقا للبروتوكولات التي سبق إنشاؤها5،7. ويرد أدناه وصف موجز لذلك.
- المفروم والانزيمي هضم انسجه البروستاتا لإنتاج تعليق خليه واحده. في هذه التجربة ، تم استخدام 1 مل من 5 ملغ/مل كولاجيناز النوع الثاني في ADMEM/F12 لهضم 50 ملغ من انسجه البروستاتا.
- جمع الخلايا عن طريق طرد في 300 x ز ل 5 دقيقه ، عد الخلايا ، وأعاده التعليق عليها في مصفوفة غشاء الطابق السفلي ، ولوحه في كثافة المناسبة5،7 في القباب مصفوفة علي لوحات الثقافة العضوية قبل حرارة (الطلاء يتم عرض الأسلوب في الشكل 1ا).
- السماح لقباب لترسيخ وأضافه وسائل الاعلام علي قمم القباب بحيث يتم تغطيتها بالبالكامل.
- تنمو organoids إلى الكمية المطلوبة للتطبيقات المصب. يمكن تحديد رقم الخلية بواسطة أساليب العد القياسية. راجع المقطع الخاص بالتطبيق الخاص بالبروتوكول للحصول علي تفاصيل اضافيه حول الكثافة.
- باستخدام ماصه P1000 ، ارسم المتوسطة والماصة للأعلى وللاسفل لتعطيلها. عندما يتم تعطيل مصفوفة غشاء الطابق السفلي تماما ، نقل تعليق إلى أنبوب مخروطي 15 مل. لا تضع أكثر من 10 القباب لكل واحد 15 مل أنبوب مخروطي الشكل. الطرد المركزي في 300 x g لمده 5 دقائق.
- رسم قباله ماده طافي وغسل بيليه الخلية مع 5 مل من تلفزيوني. الطرد المركزي في 300 x g لمده 5 دقائق.
- رسم قباله ماده طافي وأعاده تعليق بيليه في 4 مل من استبدال التريبسين. هضم ل 5-10 دقيقه مع اهتزاز في 37 درجه مئوية. أضف كميه متساوية من المتوسط العضوي + 10% لمنع استبدال التريبسين. الطرد المركزي في 300 x g لمده 5 دقائق.
- رسم قباله ماده طافي وأعاده التعليق في 1 مل من تلفزيوني.
- تصفيه التعليق مع فلتر 40 μm لضمان تعليق خليه واحده. تحديد رقم الخلية باستخدام مقياس الكريات الدموية أو جهاز العد المكافئ.
ملاحظه: إذا كان الحصول علي خلايا واحده قابله للحياة من الصعب استخدام الفرز تدفق للحصول علي حل خليه واحده.
3. تقييم قدره التشكيل العضوي
ملاحظه: لتحديد النسبة المئوية للخلايا التي يمكن ان تولد organoid ، يمكن اجراء فحص بذر كوكيل لإمكانات الجذعية/السلف. وتعتبر قدره التشكيل العضوي مهمة أيضا لتحديد رقم الخلية البذر لاختبارات الجدوى.
- تمييع تعليق الخلية التي تم الحصول عليها في الخطوة 2.7 إلى 100 خلايا لكل 10 μL من التعليق باستخدام المتوسطة organoid التي تحتوي علي 10 μM رو كيناز المثبط Y-27632.
- نقل 1,100 الخلايا (110 μL من تعليق) إلى أنبوب مخروطي جديد.
- أضافه 285 μL من مصفوفة غشاء الطابق السفلي وأعاده تعليق الخلايا. وهذا سوف يؤدي إلى ~ 70 ٪ تركيز مصفوفة.
ملاحظه: التخفيف من مصفوفة غشاء الطابق السفلي اثناء البذر يقلل إلى حد كبير من الاختلاف في حجم القبه ، الناجمة عن اللزوجة من مصفوفة البروتين.
- خلايا البذور في 35 μL من القباب مصفوفة في درجه حرارة 24 جيدا لوحه ، مما ادي إلى 200 الخلايا/جيدا. لوحه 3-5 نسخ متماثلة لكل عينه (انظر أيضا طريقه الطلاء في الشكل 1ا والخطوة 2-1-2).
- لضمان بقاء الخلايا داخل قبة المصفوفة ، اقلب الصفيحة ووضعها في حاضنه الخلايا لترسيخ مصفوفة غشاء القبو.
- بعد 10 دقيقه ، وأزاله لوحه من الحاضنة وأضافه المتوسطة التي تحتوي علي المثبط رو كيناز.
- تحديث المتوسطة كل يومين. بعد 7 أيام ، وقياس عدد من العضوية. الحفاظ علي مثبطات رو كيناز في وسائل الاعلام في جميع انحاء التجربة.
- عد عدد من العضوية التي أنشئت في القبه وحساب النسبة المئوية من العضوية التي تشكلت من العدد الإجمالي للخلايا مطلي (200 خلايا).
ملاحظه: تختلف نسب التاسيس العضوي من 3%-60% اعتمادا علي نوع الخلية والنمط الجيني.
4. تحديد الاستجابات الدوائية من organoids
- الاستمرار من الخطوة 2.7 ، البذور 1000-10000 الخلايا في قبة مصفوفة. استخدام كفاءه تشكيل organoid وسرعه النمو كوكيل لتحديد رقم الخلية النهائية.
ملاحظه: يتم توفير أرقام الخلايا الموصي بها في الجدول 1. استخدم ثلاثه إلى خمس نسخ متماثلة لكل حاله لكل تحليل. استخدام التركيز النهائي من 70 ٪ مصفوفة غشاء الطابق السفلي للحد من الأخطاء التي تسببها اللزوجة.
- البذور 35 μL من القباب مصفوفة في لوحه 24 جيدا والسماح لقباب يصلب كمافعلت في القسم 3 (انظر أيضا طريقه الطلاء في الشكل 1ا والخطوة 2-1-2). أضافه المتوسطة التي تحتوي علي المثبط رو كيناز والمخدرات المفضلة. ويمكن تطبيق هذه الطريقة علي جميع الادويه ، ولكن في هذا البروتوكول ، ويستخدم الجيل الثاني لمكافحه الاندروجين في 10 μM علي سبيل المثال. لتحديد نصف تركيز المثبطة القصوى (IC50), تنفيذ log10 تزايدي, وكعنصر تحكم, استخدام السيارة التي تم حل المخدرات.
- تحديث المتوسطة كل يومين أو ثلاثه أيام وتحليل organoids في اليوم 7 لتحديد الاستجابة الدوائية للدواء. قد تختلف النقاط الزمنيه بين اختيار التجربة والمخدرات.
ملاحظه: لا يجب ان تكون الorganoids لاجراء هذه الاختبارات.
- للحفاظ علي الهيكل العضوي سليما ، وذلك باستخدام ماصه P1000 ، ورسم المتوسطة وماصه صعودا وهبوطا لتعطيل مصفوفة غشاء الطابق السفلي.
- عندما يتم تعطيل مصفوفة غشاء الطابق السفلي تماما ، نقل التعليق إلى أنبوب مخروطي 15 مل. لا نقل أكثر من 10 القباب مصفوفة لكل 15 مل أنبوب مخروطي الشكل.
- الطرد المركزي في 300 x ز لمده 5 دقائق. رسم قباله ماده طافي ويغسل مع 5 مل من تلفزيوني.
- أعاده التعليق العضوي في 1 مل من تلفزيوني وتعطيل العضوية باستخدام تريلوريشن وماصه الزجاج باستور.
- قياس عدد الأجزاء العضوية. البذور 5 ونسخ متماثلة تحتوي علي 100 أجزاء organoid كما هو موضح في الخطوة 2-1-2.
- اجراء فحص جدوى الخلية علي النحو المبين أدناه في القسم 7.
5. الحمض الريبي النيبالي العزلة من organoids
ملاحظه: الأساليب المتاحة تجاريا المستندة إلى العمود الغلة كميه جيده ونوعيه الحمض الريبي النيبالي. لضمان كميه جيده RNA ، استخدم الحد الأدنى من قبة واحده لكل عينه ؛ ومع ذلك ، ينصح باستخدام ثلاث قباب ، والتي يمكن المصنفة في بئر واحده من 12 لوحه جيدا.
- أضافه [يس-مركبتوايثانول] (1%) إلى الجلوتاثيون تحلل العازلة في مجموعه العزل RNA.
- رسم قباله المتوسطة من القباب غشاء الطابق السفلي التي تحتوي علي organoids وأضافه 750 μL من هذا المخزن المؤقت. ماصه للأعلى وللاسفل باستخدام ماصه P1000. تاكد من ان كل مصفوفة غشاء القبو قد تم حلها
- أضافه 750 μL من 70 ٪ الايثانول وتخلط عن طريق التنضيد. نقل في وقت لاحق 700 μL من الخليط إلى العمود ، الطرد المركزي في 12,000 x ز لمده دقيقه واحده ، وتكرار مع ما تبقي من lysate.
- اجراء يغسل وعلي العمود العلاج DNase وفقا لتعليمات الشركة المصنعة. Elute RNA في 30-50 μL من المياه RNAse خاليه.
- قياس التركيزات باستخدام فلوميتر في OD = 260 نانومتر و 280 نانومتر وتخزين في-80 درجه مئوية أو الاستمرار في التطبيقات المصب.
6. عزل البروتين من organoids
ملاحظه: لعزل البروتين ، واعداد العازلة ريبا القياسية التي تحتوي علي مثبطات الفوسفاتيز والانزيم البروتيني (جدول المواد). ويوصي باستخدام ما لا يقل عن ثلاث قباب ، والتي يمكن المصنفة في واحده 12 جيدا.
- باستخدام ماصه P1000 ، ارسم الوسط من الخلية مع قباب الغشاء السفلي التي تحتوي علي الهيكل العضوي والماصة للأعلى والأسفل لتعطيل مصفوفة غشاء القبو.
- عندما تتعطل تماما ، نقل التعليق إلى أنبوب مخروطي 15 مل. الطرد المركزي في 300 x g لمده 5 دقائق.
- رسم قباله ماده طافي ويغسل مع 5 مل من الجليد الباردة. الطرد المركزي في 300 x g لمده 5 دقائق.
- رسم قباله ماده طافي وأعاده تعليق بيليه في 4 مل من استبدال التريبسين. هضم ل 5-10 دقيقه في حين تهتز في 37 درجه مئوية.
- أضافه حجم متساو من المتوسطة organoid + 10 ٪ FCS لمنع استبدال التريبسين. الطرد المركزي في 300 x g لمده 5 دقائق.
ملاحظه: ما بعد طرد ، لا يجب ان تكون مصفوفة غشاء القبو مرئية في بيليه.
- رسم قباله ماده طافي ويغسل مع 5 مل من الجليد الباردة. رسم قباله ماده طافي وأعاده تعليق بيليه الخلية في 300 μl من المخزن المؤقت تحلل باستخدام pipet P1000 ، ثم نقل إلى أنبوب الطرد المركزي الصغير 1.5 mL.
- احتضان علي الجليد لمده 10 دقيقه وبعد ذلك سوكاتي 2x ل 30 ثانيه كل في المياه المبردة مع درجه حرارة 4 درجه مئوية. وضع الأنبوب مره أخرى علي الجليد واجراء كميات البروتين باستخدام الأساليب القياسية.
- البروتين عن طريق أضافه كبريتات الصوديوم دوديسيل (SDS) التي تحتوي علي صبغ التحميل ويغلي لمده 5 دقائق في 95 درجه مئوية. تخزين لست] في-80 درجه مئوية أو متابعه التطبيقات المتلقية للمعلومات.
7. فحص سلامه الخلايا مع العضوية
ملاحظه: يمكن تقييم قابليه الخلية للبقاء باستخدام مجموعه الفحص المتاحة تجاريا ومقياس الاناره. اعداد المخازن المؤقتة وفقا لإرشادات الشركة المصنعة. ويوصي بخمس نسخ متماثلة لكل حاله: واحد النسخ المتماثل يتكون من 1 35 μL الطابق السفلي غشاء قبة مصفوفة في بئر واحده من لوحه 24 جيدا.
- رسم قباله الوسط من الثقافة العضوية ، وتوخي الحذر لترك القباب مصفوفة سليمه.
- أضافه 65 μL من الاذاعه التلفزيونية وماصه صعودا وهبوطا لتعطيل قبة المصفوفة.
- أضافه 100 μL من الخلية المخزن المؤقت مجموعه الفحص السلامة وأعاده التعليق عن طريق التنضيد.
- احتضان في درجه حرارة الغرفة (RT) لمده 10 دقيقه مع الاهتزاز.
- نقل 100 μL من الخليط إلى لوحه غير شفافة مناسبه لمقياس الاناره وأداء القراءة وفقا لتعليمات الشركة المصنعة لفحص سلامه الخلية عده.
8. تحضير العضو العضوي لتطعيم الدهون
ملاحظه: Organoids هي أيضا قابله لتطعيم تحت الجلد في كل من الكائنات المناعية المعرضة للخطر ، وكذلك ، الفئران ايروني. لضمان ان تكون العضوية المحقونة مميزه في الجسم العضوي ، والتسمية العضوية مع التعبير الدستوري عن فلوكوفيري5. فمن المستحسن اجراء تجربه تجريبية لتطعيم باستخدام 5 × 105 خلايا إلى 2 × 106 خلايا لكل حقنه ، مع زيادات من 5 x 106 خلايا ، وكفاءه التطعيم يختلف بين خطوط organoid.
- باستخدام ماصه P1000 ، ارسم المتوسط والماصة للأعلى وللاسفل لتعطيل مصفوفة غشاء القبو. عندما تتعطل تماما ، نقل التعليق إلى أنبوب مخروطي 15 مل. الطرد المركزي في 300 x g لمده 5 دقائق.
ملاحظه: لا تقم بنقل أكثر من 10 قباب مصفوفة لكل أنبوب مخروطي 15 مل.
- رسم قباله ماده طافي ويغسل مع 5 مل من تلفزيوني. الطرد المركزي في 300 x g لمده 5 دقائق.
- رسم قباله ماده طافي وأعاده تعليق بيليه في 4 مل من استبدال التريبسين. هضم ل 5-10 دقيقه في حين تهتز في 37 درجه مئوية.
- أضف حجما متساويا من المتوسط العضوي + 10% لمنع استبدال التريبسين. الطرد المركزي في 300 x g لمده 5 دقائق.
- رسم قباله ماده طافي وأعاده التعليق في 1 مل من تلفزيوني. تصفيه التعليق مع فلتر 40 μm لضمان تعليق خليه واحده. قياس الخلايا باستخدام الأساليب القياسية.
- تدور وأعاده تعليق الخلايا في المثبطات التلفزيونية + رو إلى تركيز 2 × 106 خلايا لكل 100 μl (انظر الجدول 2 للخلايا تركيزات ورقم الخلية المطلقة اللازمة لتركيزات متفاوتة). استخدام كميه متساوية من مصفوفة غشاء الطابق السفلي لتوليد تعليق 1:1. ضع التعليق علي الثلج.
- حقن الخلايا وفقا للبروتوكولات القياسية ورصد نمو الطعم باستخدام الأساليب القياسية8.