RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ar
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
يستخدم هذا البروتوكول في إنشاء وصيانة الصراصير الأمريكية الغنوتوبيوتية(Periplaneta americana)عن طريق تعقيم حالات البيض (oothecae) قبل الفقس. تحتوي هذه الحشرات الغنوبية على بطانات البلاتاباكتيريا المنقولة رأسيا ولكن لديها أحشاء محورية.
الحيوانات الغنوتوبيوتية هي أداة قوية لدراسة الضوابط على بنية الميكروبيوم ووظيفته. هنا هو بروتوكول لإنشاء وصيانة الصراصير الأمريكية الغنوتوبيوتك(Periplaneta أمريكانا). ويشمل هذا النهج عمليات فحص العقم المدمجة للتحقق من الجودة المستمرة. تعرف الحشرات الغنوتوبيوتية هنا بأنها صراصير لا تزال تحتوي على إندوسيمبيونت المنقول رأسيا(Blattabacterium)ولكنها تفتقر إلى الميكروبات الأخرى التي تتواجد عادة على سطحها وفي الجهاز الهضمي. لهذا البروتوكول، تتم إزالة حالات البيض (oothecae) من مستعمرة الأسهم (غيرsterile) وتعقيم السطح. وبمجرد جمعها وتعقيمها، يتم احتضان الأوثيكاي عند 30 درجة مئوية لمدة 4-6 أسابيع تقريبا على أجار ضخ الدماغ والقلب (BHI) حتى يفقس أو تتم إزالته بسبب التلوث. يتم نقل الحوريات المفقسة إلى قارورة Erlenmeyer تحتوي على أرضية BHI ومياه معقمة وطعام فئران معقم. لضمان أن الحوريات ليست الميكروبات السكنية التي لا تستطيع أن تنمو على BHI في ظروف معينة، يستخدم تدبير إضافي لمراقبة الجودة تقييد تعدد الأشكال طول جزء (RFLP) لاختبار الميكروبات غير التكافلية. يمكن تلقيح الحوريات الغنوتوبيوتية المتولدة باستخدام هذا النهج مع المجتمعات الميكروبية البسيطة أو المعقدة واستخدامها كأداة في دراسات ميكروبيوم الأمعاء.
وقد أثبتت الحيوانات الغنوتوبيوتية لتكون أدوات لا تقدر بثمنلدراساتالميكروبيوم 1،2،3. سمحت الحيوانات الخالية من الجراثيم والمحددة النباتات باختزال التفاعلات بين المضيف والميكروب ، بما في ذلك الاستجابات المناعية المضيفة ، ونضوج ظهارة الأمعاء ، والتمثيل الغذائي المضيف1و4و5و6و7. وقد ساعدت الحيوانات الغنوتوبيوتية تلقيح مع مجتمع مبسط أيضا في فهم أكثر اكتمالا للتفاعلات الميكروبات والميكروبات في المجتمع الأمعاء، وتحديدا في كشف عبر التغذية والعلاقات العدائية8،9،10،11. النظام النموذجي المفضل الحالي للدراسات في ميكروبيوم الأمعاء الثديية هو نموذج المورين. وفي حين أن هذا النظام كان حيويا في الاكتشافات المبينة أعلاه، فإن أحد أوجه القصور الرئيسية هو التكلفة التي ينطوي عليها الأمر. 10 - ومن الضروري توفير معدات متخصصة وفنيين مدربين تدريبا عاليا لإنشاء مرفق للكائنات الحية والاحتفاظ به. هذا، في تركيبة مع الرعاية الإضافية التي يجب أن تعطى لكل جانب من جوانب الحفاظ على الحيوانات الغنوتوبيوتك، يسبب الغنوتوبيوتك لتكلفة عشر إلى عشرين مرة أكثر من تربية نموذج حيواني قياسي12. بسبب ارتفاع التكاليف، قد يكون العديد من الباحثين غير قادرين على تحمل نموذج مورين الغنوتوبيوتك. بالإضافة إلى ذلك، في حين أن نماذج مورين قد يكون الخيار الأكثر قبولا على نطاق واسع للدراسات التي تتطلع إلى ترجمة إلى صحة الإنسان، لا تزال هناك العديد من الاختلافات الفسيولوجية والمورفولوجية بين أحشاء الإنسان والفأر13. من الواضح أنه لا يوجد نموذج فريد يكفي للإجابة على العدد المتزايد من الأسئلة المتعلقة بالجوانب العديدة لميكروبيوم الأمعاء.
نماذج الحشرات هي بديل أرخص بسبب انخفاض تكلفة الصيانة بالمقارنة مع أنواع الثدييات. وقد أدت البحوث الواسعة النطاق الخالية من الجراثيم والكائنات الحية في مجموعة متنوعة من أنواع الحشرات إلى تطوير نماذج متعددة شائعة الاستخدام. البعوض و Drosophila هي نماذج شائعة للعمل الخالي من الجراثيم نظرا لأهميتها للأمراض العالمية وقابلية المسالك الوراثية14،15. نظام نموذج آخر الناشئة هو أن نحلة العسل(Apis mellifera)، نظرا لاهميتها في التلقيح والبحوث الاجتماعية16. ومع ذلك ، فإن العديد من هذه الحشرات شائعة الاستخدام تفتقر إلى التعقيد التصنيفي الذي شوهد في مجتمعات الأمعاء الثديية17، مما يحد من قدرتها على نمذجة التفاعلات ذات الترتيب الأعلى. ليس فقط التنوع الكلي للميكروبات الموجودة في أمعاء الصراصير الأمريكية أكثر تشابها مع الثدييات ، ولكن العديد من الميكروبات الموجودة في القناة الهضمية للصرصور تنتمي إلى العائلات والفيرلا التي توجد عادة في ميكروبيوتا الأمعاء من الثدييات والبشر18. كما أن الحشرة الخلفية للصرصور مماثلة وظيفيا للأمعاء الغليظة للثدييات ، لأنها غرفة تخمير مكتظة بالبكتيريا للمساعدة في استخراج العناصر الغذائية19،20. وأخيرا ، فإن الطبيعة الشاملة للصراصير تسمح بتنوع أنظمة النظام الغذائي التي لن تكون ممكنة مع المتخصصين في النظام الغذائي.
الصراصير الأمريكية يمكن أن تكون نظاما نموذجيا مفيدا لفهم المجتمعات الميكروبية في الأمعاء في الكائنات الحية العليا ، ولكن وضع الصرصور كآفة يجعل هذا النظام مناسبا لمكافحة الآفات21. تساعد الاستفادة من المعرفة الأساسية لتأثير مجتمع الأمعاء على صحة الصرصور وعلم وظائف الأعضاء في تطوير تقنيات جديدة لإدارة الآفات.
الهدف من هذه الطريقة هو تحديد وصف شامل لإنشاء وصيانة الصراصير الأمريكية الغنوتوبيوتية(Periplaneta americana)، ولكن يمكن استخدام هذا البروتوكول لتوليد حوريات أي صرصور أوفيباروس. وهو يتضمن طريقة لجمع فعالة وغير الباضعة من oothecae ناضجة ، وتقنية غير تدميرية لرصد الحالة الغنوتوبيوتية للحشرات22،23،24. في حين أن الطرق السابقة لتحقيق وصيانة الصراصير الغنوتوبيوتك تصف جمع ootheca23،24،25،26،27، يتم تفسير نضج ootheca إما من حيث الإشارات الخاصة بالأنواع (في Blattella germanica22،24،25)، أو لم يتم وصفها صراحة27،28، مما يجعل التنفيذ صعبا على أولئك غير المألوفين مع النظام. منذ الطريقة الموصوفة هنا يستخدم oothecae انخفض بشكل طبيعي، خطأ إزالة البيض قبل الأوان غائبة. يحتوي هذا البروتوكول على أساليب تعتمد على الثقافة ومستقلة عن الثقافة لمراقبة الجودة ، ولا تتطلب الطريقة المعتمدة على الثقافة التضحية بالحشرات. وأخيرا ، تجمع هذه الطريقة معلومات من دراسات صرصور غنوتبيوتك متعددة لإنشاء بروتوكول شامل واحد مع جميع المعلومات اللازمة لتحقيق الصراصير الغنوتوبيوتية والحفاظ عليها.
1. إعداد المواد
2. مجموعة من oothecae
3. تنظيف أوثيكاي
4. تعقيم واحتضان oothecae
5. الحفاظ على الحوريات الغنوتوبيوتية
6. مراقبة الجودة من العقم
7. تتبع العقيم للنمو الحورية
يتم إعداد خزانات المخزون كما هو موضح في الشكل 1. يتم التعرف على الإناث "الحوامل" من قبل ootheca تعلق على البطن الخلفي، كما هو في الصورة في الشكل 2. حضانة oothecae على أجار BHI يسمح لمراقبة الجودة الغنوتوبيوتية بطريقة غير تدميرية. في بعض الحالات، والتعقيم غير ناجحة، ويظهر النمو حول oothecae كما هو الحال في الشكل 3B. وينبغي إزالة هذه oothecae والتخلص منها. في أيدينا، لوحظ متوسط معدل فشل 10٪ للتعقيم (ن = 51). يفقس oothecae في المتوسط 34 يوما بعد التعقيم دون نمو على المتوسط ، كما رأينا في الشكل 3A. لقد لاحظنا معدلات فقس نموذجية من 41٪ (ن = 46) لتعقيم، غير ملوثة oothecae، بمتوسط 11 حورية لكل ootheca. يتم نقل الحوريات أكبر إلى قوارير BHI مغطاة احباط، كما هو الحال في الشكل 4. احباط يمنع التلوث، والحوريات لديها مساحة للنمو. RFLP من rDNA 16S من حورية متجانسة يستخدم لتأكيد الحالة الغنوتوبيوتية. وقد لوحظ الحوريات الغنوتوبيوتية تنمو بمعدل أبطأ من نظيراتها غير العقيمة، كما هو ممثل الشكل 5. يعرض الشكل 6 نتائج الحشرات الغنوتوبيوتية الناجحة وكذلك الحوريات القياسية (غير النجمية).
وفي حين أن هذا الاختبار لم يحدد التلوث بعد في غياب نتيجة إيجابية للثقافة، فقد تم تنفيذ هذه الخطوة بشكل روتيني خلال التجارب الحرجة لاستبعاد وجود ميكروبات حساسة للأوكسجين أو سريعة الثبات. لوحظ تباطؤ النمو في الصراصير الغنوتوبيوتك بالمقارنة مع الحشرات القياسية / غير النجمية.

الشكل 1: إعداد ثقافة مخزون الصراصير.
ويمكن رؤية أنابيب من الورق المقوى مكدسة في الطرف البعيد من الخزان. الطعام والماء على حد سواء بالقرب من الجزء الأمامي من الخزان. تمت إزالة غطاء من القماش القطني وشريط مرن للرؤية. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: صرصور أمريكي "حامل".
يشير السهم إلى ootheca. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3: صور الحوريات الغنوتوبيوتية بنجاح فقست وتعقيمها دون جدوى oothecae على الميول BHI.
تم تعقيم Oothecae واحتضانها كما هو موضح في هذا البروتوكول. (أ)عدم وجود نمو ميكروبي على الميل BHI يشير إلى أن الحشرات خالية من الكائنات الحية القابلة للزرع. (ب)Oothecae على slants التي تؤدي إلى تشكيل مستعمرة ينبغي التخلص منها كما الملوثة. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 4: جهاز تربية غنوتوبوتيك.
يتم الاحتفاظ بالحشرات في قوارير معقمة مغطاة بغطاء احباط لمنع التلوث. يتم تعقيم الحاوية الثانوية (الغطاء الأخضر) مع تبييض 2٪ يليه الإيثانول بنسبة 70٪. لا يتم تقييد تدفق الهواء في الحاوية الثانوية. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 5: بيانات معدل النمو التمثيلي التي تقارن أطوال الجسم من الحوريات الغنوتوبيوتية وغير النجمية. تم تغذية كلتا المجموعتين من الحشرات بنظام غذائي القوارض المكواة تلقائيا. يتم الاحتفاظ الحشرات الغنوتوبيوتية (هنا: ن = 105) على BHI كما هو موضح. تعيش الحشرات غير النجمية (هنا: n = 50) في قوارير مع فراش خشبي معبف تلقائيا مع أطباق صغيرة للمياه. تنمو الحوريات غير النجمية بمعدل متوسط قدره 0.059 مم في اليوم، في حين تنمو الحوريات الغنوتوبيوتية بمعدل 0.028 مم/يوم (p < 0.0001). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 6: صورة هلامية تمثيلية لنتائج RFLP لمراقبة الجودة.
تم هضم أمبليكونات الجينات كاملة 16S مع RsaI. تم استخراج الحمض النووي لPCR من الحوريات المتجانسة في برنامج تلفزيوني 1x. تتوافق ممرات "G nymph" مع الحوريات الغنوتوبيوتية ، في حين تتوافق ممرات "conv nymph" مع نظيراتها التقليدية غير النجمية. استنادا إلى هضم تقييد الظاهري، و endosymbiont (Blattabacterium) ومن المتوقع أن يكون العصابات في أحجام 402 نقطة أساس، 206 نقطة أساس، و 163 نقطة أساس، مع مسحة من العصابات بين 163 نقطة أساس و 148 نقطة أساس. يجب أن تظهر الحشرة الغنوتوبيوتية نمط ربط Blattabacterium فقط. ومن المتوقع أن يكون المجتمع البكتيري المختلط مسحة من العصابات مع أحجام مختلفة، وصفت هنا "شظايا البكتيرية الأخرى 16S". يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
ولا يوجد لدى صاحبي البلاغ تضارب في المصالح يكشفان عنه.
يستخدم هذا البروتوكول في إنشاء وصيانة الصراصير الأمريكية الغنوتوبيوتية(Periplaneta americana)عن طريق تعقيم حالات البيض (oothecae) قبل الفقس. تحتوي هذه الحشرات الغنوبية على بطانات البلاتاباكتيريا المنقولة رأسيا ولكن لديها أحشاء محورية.
وقد دعم هذا المنشور المعهد الوطني للعلوم الطبية العامة التابع للمعاهد الوطنية للصحة تحت رقم الجائزة R35GM133789. المحتوى هو فقط مسؤولية المؤلفين ولا يمثل بالضرورة وجهة النظر الرسمية للمعاهد الوطنية للصحة. يود المؤلفون الاعتراف بجوزي داير لتتبع معدلات التعقيم ومعدلات الفقس ومعدلات نمو الصراصير الغنوتوبيوتك.
| 2X ماستر ميكس | نيو إنجلاند BioLabs | M0482 | OneTaq MasterMix |
| فئران قابلة للتعقيم تشاو | زيجلر | NIH-31 طقم | استخراج الحمض النووي البكتيري الأوتوماتيكي|
| المعدل أوميغا بيو تيك | D-3350 | E.Z.N.A. مجموعة الحمض النووي البكتيرية ؛ يشمل الليزوزيم ، الخرز الزجاجي ، البروتيناز K ، المخازن المؤقتة (البروتيناز K ، الربط ، الغسيل ، التخفيف) ، أعمدة الحمض النووي ، | |
| مؤقت | ربط أنبوب جمع 2 ملأوميغا بيو تيك | PD099 | مدرج في مجموعة استخراج الحمض النووي البكتيري من أوميغا بيوتيك (المخزن المؤقت "HBC") |
| مرق تسريب الدماغ والقلب (BHI) | منتجات الأبحاث الدولية | B11000 | |
| مناديل مهمة دقيقة | KimWipe | JS-KCC-34155-PK | KimWipes |
| طقم تنقية الحمض النووي | أوميغا بيو تيك | D6492 | E.Z.N.A. دورة نقية كيت; يمكن أيضا استخدام D6493 ؛ يتضمن المخازن المؤقتة (تنقية ، غسيل ، تخفيف) |
| عازلة الشطف | Omega Bio-Tek | PDR048 | المدرجة في مجموعة استخراج الحمض النووي البكتيرية من Omega Biotek |
| الخرز الزجاجي | أوميغا Bio-Tek | n / a | المدرجة في مجموعة استخراج الحمض النووي البكتيرية من Omega Biotek |
| فرن التهجين | UVP | 95-0330-01 | نستخدم فرن تهجين للتسخين المسبق للشطف المؤقت ، ولكن من المحتمل أيضا أن يكون الحمام المائي تستخدم |
| خزانة السلامة البيولوجية ذات التدفق الصفحي | NuAire، Inc. | يشير بروتوكولNU-425-400 | إلى هذا باسم "غطاء التدفق الصفحي" للإيجاز |
| ليزوزيم | أوميغا بيو تيك | ن / أ | المدرج في مجموعة استخراج الحمض النووي البكتيرية من أوميغا بيوتيك |
| محلول مخزون حمض البيراسيتيك (32٪) | سيجما ألدريتش | 269336 | |
| الفازلين | الفازلين | ن / أ | |
| بروتيناز K العازلة | أوميغا بيو تيك | PD061 | مضمنة في مجموعة استخراج الحمض النووي البكتيري من Omega Biotek ("TL buffer") |
| عازلة تنقية | Omega Bio-Tek | PDR042 | المدرجة في مجموعة CyclePure من Omega Biotek (المخزن المؤقت "CP") |
| تتضمن RsaI | New England BioLabs | R0167 | CutSmart (الهضم) المخزن |
| الثانوية | N / a | n / a | وعاء بلاستيكي بغطاء (مثل Kritter Keeper) يعمل بشكل جيد لهذا (25 سم طول × 15 سم عرض × 22 سم ارتفاع) ؛ يجب أن تكون كبيرة بما يكفي لتناسب SLANTS BHI وأنابيب الاختبار |
| الطيف الضوئي | ThermoFisher | ND-2000 | معلومات الكتالوج مخصصة ل NanoDrop2000 |
| شاكر حراري | Eppendorf | EP5386000028 | Thermomixer R |
| Tris-EDTA | Fisher | BP1338-1 | 10 نانومتر تريس ، 1 ملي مولار EDTA ، درجة الحموضة 8 |
| عازلة الغسيل | أوميغا Bio-Tek | PDR044 | مدرجة في مجموعة استخراج الحمض النووي البكتيري من أوميغا بيوتيك (المخزن المؤقت "غسل الحمض النووي") الفراش |
| الخشبي | بي جيه مورفي فورست برودكتس | ساني شيبس |