نحن نصف الإجراء للتمايز في المختبر من الخلايا الجذعية الجنينية الماوس في الخلايا العصبية باستخدام طريقة إسقاط شنقا. وعلاوة على ذلك، نقوم بإجراء تحليل phenotypic شامل من خلال RT-qPCR، immunofluorescence، RNA-seq، وتدفق قياس الخلايا.
مقالة منهجية
نحن نصف الإجراء للتمايز في المختبر من الخلايا الجذعية الجنينية الماوس في الخلايا العصبية باستخدام طريقة إسقاط شنقا. وعلاوة على ذلك، نقوم بإجراء تحليل phenotypic شامل من خلال RT-qPCR، immunofluorescence، RNA-seq، وتدفق قياس الخلايا.
نحن نصف الإجراء خطوة بخطوة لزراعة وتمييج الخلايا الجذعية الجنينية الماوس في الأنساب العصبية، تليها سلسلة من المقايسات لتوصيف الخلايا المتمايزة. تم استخدام الخلايا الجذعية الجنينية للفأرة E14 لتشكيل أجسام جنينية من خلال طريقة الإسقاط المعلق ، ثم تم حثها على التفريق إلى خلايا السلف العصبي بواسطة حمض الريتينويك ، وتم تمييزها أخيرا إلى خلايا عصبية. كشفت تجارب النسخ العكسي الكمي البوليميراز المتسلسل (RT-qPCR) وتجارب immunofluorescence أن السلف العصبي والخلايا العصبية تظهر علامات المقابلة (نستين للسلف العصبية والتشخيص العصبي للخلايا العصبية) في اليوم 8 و 12 بعد التمايز، على التوالي. أظهرت تجارب قياس التدفق الخلوي على خط E14 التي تعبر عن مراسل GFP مدفوع من قبل Sox1 أن حوالي 60٪ من الخلايا في اليوم 8 إيجابية GFP ، مما يشير إلى التمايز الناجح لخلايا السلف العصبي في هذه المرحلة. وأخيرا، استخدم تحليل الحمض النووي الريبي-seq لتحليل التغيرات العالمية في النسخ. هذه الأساليب مفيدة لتحليل مشاركة جينات ومسارات محددة في تنظيم انتقال هوية الخلية أثناء التمايز العصبي.
منذ اشتقاقها الأول من كتلة الخلية الداخلية من الكيسات الكيسية الماوسالنامية 1،2، وقد استخدمت الخلايا الجذعية الجنينية الماوس (mESC) كأدوات قوية لدراسة الخلايا الجذعية التجديد الذاتي والتمايز3. وعلاوة على ذلك، فإن دراسة التمايز mESC يؤدي إلى فهم هائل للآليات الجزيئية التي قد تحسن الكفاءة والسلامة في العلاج القائم على الخلايا الجذعية في علاج أمراض مثل الاضطرابات العصبية4. بالمقارنة مع النماذج الحيوانية، يوفر هذا النظام في المختبر العديد من المزايا بما في ذلك البساطة في الممارسة والتقييم، وانخفاض التكلفة في الحفاظ على خطوط الخلايا على النقيض من الحيوانات، وسهولة نسبية في التلاعب الجيني. ومع ذلك، فإن كفاءة وجودة أنواع الخلايا المتمايزة تتأثر في كثير من الأحيان بخطوط مختلفة من mESCs وكذلك طرق التفريق5و6. كما أن المقايسات التقليدية لتقييم كفاءة التمايز تعتمد على الفحص النوعي لجينات العلامات المختارة التي تفتقر إلى القوة، وبالتالي فهي تفشل في فهم التغيرات العالمية في التعبير الجيني.
هنا نهدف إلى استخدام بطارية من المقايسات لتقييم منهجي للتمايز العصبي. باستخدام كل من التحليلات التقليدية في المختبر على علامات مختارة ورنا-seq، ونحن إنشاء منصة لقياس كفاءة التمايز، فضلا عن التغيرات النسخية خلال هذه العملية. استنادا إلى بروتوكولالمنشأةسابقا 7 , أنشأنا الأجسام الجنينية (EBs) من خلال تقنية إسقاط شنقا, تليها التعريفي باستخدام كمية فوقفيزيولوجية من حمض الريتينويك (RA) لتوليد خلايا السلف العصبية (NPCs), التي تم تمييزها في وقت لاحق إلى الخلايا العصبية مع وسيط التعريفي العصبي. لدراسة كفاءة التمايز ، بالإضافة إلى المقايسات التقليدية RT-qPCR والمناعة (IF) ، قمنا بإجراء قياس الخلايا الحمض النووي الريبي والتدفق. وتوفر هذه التحليلات قياسا شاملا لتطور التمايز الخاص بالمرحلة.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. ثقافة mESC
2. EB، المجلس الوطني للصحافه، والتمايز العصبي
3. توصيف mESCs والخلايا المتمايزة
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
كتمثيل لطريقتنا ، قمنا بإجراء تجربة تمايز EB و NPC والخلايا العصبية على خلايا E14. تم استزراع خلايا E14 على γ المشععة MEFs(الشكل 1A)حتى تم تخفيف مجموعة MEF المشععة γ. أكدنا pluripotency من الخلايا E14 من خلال أداء الفوسفاتاز القلوية (ا ف ب)تلطيخ (الشكل 1B)وRT-qPCR في وقت لاحق (انظر أدناه) لعلامات نانوغ و Oct4. ثم تم تحريض خلايا E14 الخالية من ال MEF γ المشعة على التمايز باستخدام البروتوكول المبين في الشكل 2A. باختص...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تم إنشاء طريقة التمايز العصبي للخلايا الجذعية الجنينية الماوس لعقود واستمر الباحثون في تعديل البروتوكولات السابقة أو إنشاء بروتوكولات جديدة لأغراض مختلفة7و10و11. استخدمنا سلسلة من المقايسات لتحليل شامل لكفاءة وتقدم مراحل التمايز من mESCs إلى الخلايا العصبية ، والتي يمكن استخدامها في تحليل تمايز النسب الأخرى من الماوس أو ESCs الإنسان. وعلاوة على ذلك، أثبتت نهجنا أن تكون أدوات مفيدة لتقييم تأثير جينات محددة أو مسارات على التمايز ا...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يعلن المؤلفون أنه لا توجد مصالح مالية متنافسة.
وقد دعم هذا العمل بمنحة من المعاهد القومية للصحة (1R35GM133496-01) إلى Z. Gao. نود أن نشكر الدكتور ريان هوبز على المساعدة في القسم. نشكر المرافق الأساسية لكلية ولاية بنسلفانيا للطب، بما في ذلك علوم الجينوم والمعلوماتية الحيوية، والتصوير المجهري الضوئي المتقدم، وقياس التدفق الخلوي. كما نشكر الدكتور يوكا إيمامورا على المساعدة في تحليل الحمض النووي الريبي.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| 0.05٪ تريبسين + 0.53 ملي مولار EDTA 1X | كورنينج | 25-052-CV | |
| 0.1٪ جيلاتين | سيجما | G1890-100G | محضر في ماء منزوع الأيونات |
| 16٪ بارافورمالدهيد | حراري علمي | 28908 | مخفف في 1X PBS |
| 40-& mu ؛ مصفاة الخلايا m | Falcon | 352340 | |
| Albumax | Thermo Fisher Scientific | 11020021 | |
| AlexaFluor 488 الماعز المضاد للفأر IgG (H + L) | Invitrogen | A11001 | في الساعة 1:500 لمجموعة |
| تلطيخ الفوسفاتيز القلوية IF II | Stemgent | 00-0055 | |
| AzuraQuant Green Fast qPCR Mix LoRox | Azura Genomics | AZ-2105 | |
| مكمل B27 | Thermo Fisher Scientific | 17504044 | |
| BD FACSCanto | BD | 657338 | |
| bFGF | Sigma | 11123149001 | |
| BioAnalyzer مجموعة الحمض النووي عالية الحساسية | Agilent | 5067-4626 | |
| Chir99021 | Cayman Chemicals | 13122 | |
| Chloroform | C298-500 | Fisher كيميائي | |
| DAPI | Invitrogen | R37606 | |
| DMEM | Corning | 10-017-CM | |
| DMEM / F12 متوسط | Thermo Fisher Scientific | 11320033 | |
| EB buffer | Qiagen | 19086 | |
| الإيثانول | 111000200 | Pharmco | مخفف في الماء منزوع الأيونات |
| مصل الأبقار الجنيني | أتلانتا بيولوجيز | S10250 | |
| فيشربراند سوبر فروست بلس شرائح مجهر فيشر | سيانتيفيك | 12-550-15 | |
| نظام التسلسل HiSeq 2500 | Illumina | SY-401-2501 | |
| الأيزوبروبانول | BDH1133-4LG | BDH VWR | تحليلي مخفف في الماء منزوع الأيونات |
| L-Glutamine | Thermo Fisher Scientific | 25030024 | |
| LIF | N / A | N / | A تم جمعها من بادئات MEF الطافية |
| m18srRNA | IDTDNA | N / | A 5'-GCAATTATTCCCCATGAACG-3' 5'-GGCCTCACTAAACCATCCAA-3'MEM |
| الأحماض الأمينية غير الأساسية | Corning | 25-025-Cl | |
| mNanog بادئات | IDTDNA | N / A | 5'-AGGCTTTGGAGACAGTGAGGTG-3' 5'-TGGGTAAGGGTGTTCAAGCACT-3' |
| بادئات mNes | IDTDNA | N / A | 5'-AGTGCCCAGTTCTAGTGGTGTCC-3' 5'-CCTCTAAAATAGAGTGGTGAGGGTTG-3'mNeuroD1 |
| بادئات | IDTDNA | N / A | 5'-CGAGTCATGAGTGGCCCAGCTTA-3' 5'-CCGGGAATAGTGAGAAACTGACGTG-3'mOct4 |
| بادئات | IDTDNA | N / A | 5'-AGATCACTCACATCGCCAATCA-3' 5'- CGCCGGTTACAGAACCATACTC-3'mPax6 |
| بادئات | IDTDNA | N / A | 5'-CTTGGGAAATCCGAGACAGA-3' 5'-CTAGCCAGGTTGCGAAGAAC-3'N2 |
| مكمل | Thermo Fisher Scientific | 17502048 | |
| تم تخفيف الجسم المضاد الأساسي | Millipore | MAB5326 | في الساعة 1:200 ل IF |
| العصبية القاعدية | الحرارية فيشر العلمية | 21103049 | |
| الجسم المضاد الأساسي للخيوط العصبية | DSHB | 2H3 | |
| NEXTflex Illumina Rapid Directional RNA-Seq Library Prep Kit | BioO Scientific | NOVA-5138-07 | |
| PD0325901 | Cayman Chemicals | 13034 | |
| البنسلين / الستربتومايسين | Corning | 30-002-Cl | |
| محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS) | N / A | N / A | محضرة في ماء منزوع الأيونات |
| - كلوريد البوتاسيوم | P217-500G | VWR | |
| - فوسفات البوتاسيوم أحادي القاعدة اللامائي | 0781-500G | VWR | |
| - كلوريد الصوديوم | BP358-10 | الكواشف | |
| - فوسفات الصوديوم ، ثنائي الأساس ، سباعي الهيدرات | SX0715-1 | Milipore | |
| التمهيدي السداسي العشوائي | Thermo Scientific | SO142 | |
| حمض الريتينويك | Sigma | R2625 | المحضر في DMSO |
| بيروفات الصوديوم | Corning | 25-000-Cl | |
| السكروز | Sigma | 84097 | مخفف في 1X PBS |
| SuperScript III Reverse Transcriptase | Invitrogen | 18064022 | |
| Tissue-Tek O.C.T. مركب | ساكورا | 4583 | |
| كاشف العزل TriPure | سيجما ألدريتش | 11667165001 | |
| TruSeq Rapid | Illumina | 20020616 | |
| & beta ؛ -mercaptoethanol | فيشر الكواشف الحيوية | BP176-100 |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن