وتم جمع عينات المرضى بعد موافقة مجلس استعراض الأخلاقيات في مستشفيي بازل وتوبينغن الجامعيين.
1. البيوتينيليشن من بروتين الانصهار NKG2D
ملاحظة: يتم تنفيذ هذه الخطوة مع مجموعة البيوتينيليشن (انظر جدول المواد)وفقا لتعليمات الشركة المصنعة. يجب تنفيذ هذه الخطوة من البروتوكول على الأقل 24 ساعة قبل تلطيخ. يجب تخزين بروتين الاندماج NKG2D البيوتيني في -20 درجة مئوية.
- إذابة كل من البيوتين، فضلا عن أنابيب البروتين الانصهار NKG2D في درجة حرارة الغرفة (RT).
ملاحظة: إذا كانت الخلايا تحتاج إلى أن تكون عقيمة لمزيد من الاستخدام التجريبي (الحقن في الفئران، مستعمرة تشكيل وحدة المقايسات، الخ)، وإعادة تشكيل البروتين الانصهار تحت غطاء محرك السيارة تدفق صفح لتجنب التلوث. خلاف ذلك، يمكن تنفيذ كل خطوة على مقاعد البدلاء.
- تدور بسرعة أسفل 50μg من بروتين الانصهار NKG2D الليوفيلي. إضافة 500 ميكرولتر من المالحة العازلة بالفوسفات (PBS) لإعادة تشكيل المسحوق ومزيج تماما باستخدام ميببيت P1000.
- إضافة 100 ميكرولتر من بروتين الانصهار NKG2DL إلى أنبوب البيوتين للحصول على تركيز المخزون النهائي من 100 ميكروغرام / مل.
- امزج الحل جيدا عن طريق إعادة تعليق مستمرة مع P100 ميكروبايت.
- احتضان محلول البروتين الانصهار / البيوتين في RT تسيطر عليها لمدة 24 ساعة. بروتين الانصهار جاهز الآن للاستخدام.
2. ذوبان الخلايا الأساسية AML
ملاحظة: تم إذابة ما يقرب من 5,000,000 خلية لوكيمية مجمدة لكل مريض مخزنة في النيتروجين السائل ثم استخدمت للمقاايسات على الفور. تم الحصول على خلايا اللوكيميا وتجميدها كما سبق وصفها15. باختصار، تمت معالجة عينات الدم المحيطية التي تم جمعها من المرضى الذين يعانون من مكافحة غسل الأموال والنسب المئوية العالية لخلايا الانفجار (>90٪ من الانفجارات بين الخلايا أحادية النووية) بفصل تدرج الكثافة للحصول على خلايا أحادية النووية وتم تجميدها بعد ذلك في مصل عجل الجنين (FCS) الذي يحتوي على محلول كبريتيد ثنائي ميثيل (DMSO) بنسبة 10٪). تباينت أعداد الخلايا بشكل كبير بين المرضى الذين ي اعتمادهم على تركيز الكريات البيض في المريض (النطاق: 1,000,000 إلى 30,000,000 خلية لوكيميا لكل مل من الدم).
- متوسط RPMI دافئ مسبقا يحتوي على 10٪ من FCS عند 37 درجة مئوية باستخدام حمام مائي. لكل قارورة من خلايا AML (ما يصل إلى 30,000,000 خلية في 1 مل FCS + 10٪ DMSO)، أضف 10 مل من المتوسطة الدافئة مسبقا إلى أنبوب تفاعل 15 مل.
- إزالة المبردة التي تحتوي على مكافحة غسل الأموال الأولية من تخزين النيتروجين السائل وعلى الفور إذابة الخلايا باستخدام حمام مائي 37 درجة مئوية. تحرك بلطف أنبوب ذهابا وإيابا في الماء، مما يسمح لمحتويات القارورة لتذوب حتى لا يكون هناك سوى الكريستال الجليد الصغيرة اليسار.
- نقل الخلايا المذابة فورا إلى أنبوب متوسطة تحتوي على وشطف القارورة باستخدام 1 مل من المتوسطة.
- الطرد المركزي الخلايا في 300 × ز لمدة 10 دقيقة والتخلص من supernatant دون إزعاج بيليه.
- غسل الخلايا مع 5 مل من المتوسط RPMI تحتوي على 10٪ من FCS والطرد المركزي في 300 × ز لمدة 10 دقيقة.
3. عد الخلايا
- إعادة إنفاق بيليه الخلية في حجم معروف من المتوسط RPMI تحتوي على 10٪ من FCS.
- نقل حجم صغير من تعليق الخلية إلى أنبوب الطرد المركزي الدقيق 1.5 مل وتمييع بنسبة معروفة مع الأزرق تريبان أو أي صبغة بديلة أخرى تسمح بالخلية الحية / التمييز الخلية الميتة.
- استخدم أي جهاز لحساب الخلايا.
- الطرد المركزي الخلايا في 300 × ز لمدة 10 دقيقة والتخلص من supernatant دون إزعاج بيليه.
4. تلطيخ خلايا AML الأولية باستخدام بروتين الاندماج NKG2D البيوتينية
- إعداد العازلة تلطيخ عن طريق استكمال 500 مل برنامج تلفزيوني مع الألبومين مصل البقري (جيش تحرير الشعب) وحمض الإيثيلينديامينتتراستيك (EDTA) إلى تركيز النهائي من 0.07 mM و 2 MM, على التوالي. ضبط درجة الحموضة (7.2-7.4) إذا لزم الأمر.
- إعادة تمركز بيليه الخلية مع تلطيخ العازلة إلى تركيز النهائي من 0.5 × 107 خلايا / مل.
ملاحظة: اختياريا، قبل تلطيخ، يمكن احتضان الخلايا مع عامل حجب (على سبيل المثال hIgG (1μg/ml) لمدة 30 دقيقة في RT أو FcR-منع عامل)..
- نقل 100 ميكرولتر من تعليق الخلية إلى خلية الثقافة 96 جيدا U-أسفل لوحة والطرد المركزي لوحة في 300 × ز لمدة 10 دقيقة. تجاهل supernatant دون إزعاج بيليه.
- إعداد مزيج رئيسي من بروتين الاندماج NKG2D البيوتينية بحيث يتم إعادة إنفاق الخلايا في حجم نهائي قدره 50 ميكرولتر لكل بئر مع تركيز نهائي قدره 10 ميكروغرام / مل لكل بئر.
- إضافة مزيج رئيسي أعدت في الخطوة 4.4 باستخدام ماصة 100 ميكرولتر وإعادة إنفاق الكريات الخلية مع ماصة متعددة القنوات 300 ميكرولتر.
ملاحظة: خفض حجم النهائي وفقا لعدد من الخلايا للحد من كمية البروتين الانصهار اللازمة لتلطيخ.
- احتضان تعليق الخلية لمدة 25 دقيقة في RT أو 50 دقيقة عند 4 درجة مئوية.
- غسل الخلايا بإضافة 200 ميكرولتر من العازلة تلطيخ لكل بئر مع ماصة متعددة القنوات 300 ميكرولتر.
- الطرد المركزي لوحة في 300 × ز لمدة 10 دقيقة والتخلص من supernatant دون إزعاج بيليه.
- كرر الخطوتين 4.7 و4.8.
ملاحظة: يتم تنفيذ تلطيخ الموصوفة هنا في خلية الثقافة 96 جيدا U-أسفل لوحة. لذلك، يتم تنفيذ خطوات الغسيل مرتين بسبب صغر حجم سعة هذه الصفائح. يمكن أيضا إجراء التلطيخ في أنابيب أخرى ويمكن بعد ذلك إجراء خطوات الغسيل مرة واحدة فقط باستخدام حجم أكبر.
- إعداد مزيج رئيسي باستخدام Streptavidin-PE (انظر الجدول 1 لتخفيف) بحيث يتم إعادة إنفاق الخلايا في مجلد نهائي من 50 ميكرولتر.
ملاحظة: إضافة الأجسام المضادة التحديد لنوع الخلية من الفائدة على سبيل المثال CD33، CD34.... ل AML.
- إضافة مزيج رئيسي أعدت في الخطوة 4.10 باستخدام ماصة 100 ميكرولتر وإعادة إنفاق الكريات الخلية مع ماصة متعددة القنوات 300 ميكرولتر.
- احتضان تعليق الخلية لمدة 15 دقيقة في RT أو 30 دقيقة عند 4 درجات مئوية في الظلام.
- غسل الخلايا بإضافة 200 ميكرولتر من العازلة تلطيخ لكل بئر مع ماصة متعددة القنوات 300 ميكرولتر.
- الطرد المركزي لوحة في 300 × ز لمدة 10 دقيقة والتخلص من supernatant دون إزعاج بيليه.
- كرر الخطوتين 4.13 و4.14.
- إعداد حل من العازلة تلطيخ بما في ذلك 7-AAD (7-Aminoactinomycin D, 1:1000) أو أي كاشف للتمييز بين الخلايا الحية والميتة.
- Resuspend الكريات الخلية في 200 ميكرولتر تلطيخ العازلة + 7-AAD أعدت في الخطوة 4.16 في استخدام ميكروبايت متعدد القنوات 300 ميكروسيلتر.
- تحليل الخلايا باستخدام جهاز قياس التدفق الخلوي.
5. تلطيخ واحد أو مجمعة واحدة المضادة NKG2DL الأجسام المضادة
- استخدم تعليق الخلية نفسه كما في الخطوة 4.2.
- نقل 100 ميكرولتر من تعليق الخلية إلى خلية الثقافة 96 جيدا U-أسفل لوحة باستخدام ماصة متعددة القنوات 300 ميكرولتر والطرد المركزي لوحة في 300 × ز لمدة 10 دقيقة. تجاهل supernatant دون إزعاج بيليه.
- إعداد مزيج رئيسي للأجسام المضادة لكل جسم مضاد أولي أو أجسام مضادة مجمعة (انظر الجدول 2 لتخفيف) بحيث يتم إعادة إنفاق الخلايا في حجم نهائي قدره 50 ميكرولتر.
- إضافة مزيج رئيسي أعدت في الخطوة 5.3 باستخدام ماصة 100 ميكرولتر وإعادة إنفاق الكريات الخلية مع ماصة متعددة القنوات 300 ميكرولتر.
- احتضان الخلايا لمدة 25 دقيقة في RT.
- غسل الخلايا بإضافة 200 ميكرولتر من العازلة تلطيخ لكل بئر باستخدام ماصة متعددة القنوات 300 ميكرولتر.
- الطرد المركزي ثقافة الخلية 96 جيدا U-أسفل لوحة في 300 × ز لمدة 10 دقيقة والتخلص من supernatant دون إزعاج بيليه.
- كرر الخطوتين 5.6 و5.7.
- إعداد مزيج رئيسي للأجسام المضادة عن طريق إضافة الأجسام المضادة الثانوية (انظر الجدول 2 لتخفيف) بحيث يتم إعادة إنفاق الخلايا في حجم نهائي قدره 50 ميكرولتر لكل بئر.
- إضافة مزيج رئيسي أعدت في الخطوة 5.9 باستخدام ماصة 100 ميكرولتر وإعادة إنفاق الكريات الخلية مع ماصة متعددة القنوات 300 ميكرولتر.
- حضانة لمدة 15 دقيقة في RT أو 30 دقيقة في 4 درجة مئوية في الظلام.
- غسل بإضافة 200 ميكرولتر من العازلة تلطيخ لكل بئر باستخدام ماصة متعددة القنوات 300 ميكرولتر.
- الطرد المركزي تعليق الخلية في 300 × ز لمدة 10 دقيقة والتخلص من supernatant دون إزعاج بيليه.
- كرر الخطوتين 5.12 و5.13.
- Resuspend الكريات الخلية في 200 ميكرولتر تلطيخ العازلة التي تحتوي على 7-AAD أعدت في الخطوة 4.16.
- تحليل الخلايا باستخدام جهاز قياس التدفق الخلوي كما هو موضح في الخطوة 6.
6. الحصول على البيانات
ملاحظة: تأكد من أن ضوابط الجودة الأسبوعية من تدفق الخلايا يتم تنفيذها لضمان أن أشعة الليزر تعمل بشكل صحيح. للبروتوكول المعروض هنا، يتم تنفيذ عملية السيتومتر والتتبع الأسبوعية (CTS) مع الخرز النسبي للتحقق من أداء الليزر على جميع القنوات. بعد CTS، يتم تسجيل 10,000 الأحداث باستخدام الخرز 8 الذروة كعنصر تحكم داخلي. يجب أن تكون جميع القمم في نفس الوضع داخل بواباتها ومنفصلة بشكل جيد عن بعضها البعض.
- إنشاء تعويض المصفوفة لطرح التداخل الطيفي بين أجهزة الكشف مع الخرز أو مع الخلايا16.
- سجل 10,000 حدث للخلايا غير الملطخة والخرز الملون الوحيد. بالنسبة لضوابط الفلورسينس ناقص واحد (FMO)، سجل 50,000 حدث وسجل العينات الملطخة بالكامل ما يصل إلى 100,000 حدث.
ملاحظة: بدلا من ذلك، يمكن إجراء عينات ملونة واحدة على الخلايا. إذا كان الأمر كذلك، تأكد من أن الخلايا لديها إشارة إيجابية لعلامة المطلوب.
- الحصول على خلية ملونة واحدة أو عينة حبة لكل فلوفور المستخدمة في التجربة للكشف عن كمية التداخل الطيفي. استخدم منشئ التعويض لجهاز قياس التدفق الخلوي لحساب قيم الانسكاب وتطبيق مصفوفة التعويض على جميع العينات المقاسة.
ملاحظة: لا يمكن استخدام الأجسام المضادة الثانوية لإنشاء التعويض باستخدام الخرز إذا تم حساب التعويض بالخرز. اعتمادا على نوع حبات التعويض ، لا يمكن استخدام الأجسام المضادة الثانوية للتعويض مع الخرز.
- بالنسبة لعناصر تحكم FMO والعينات الملطخة الكاملة مع بروتين الاندماج ، أولا ، حدد الخلايا استنادا إلى مبعثرها الأمامي (FSC) والتشتت الجانبي (SSC). بعد استبعاد doublets، بوابة الخلايا على أساس سلبيتها ل7-AAD (PercP-Cy5.5) إشارة لاستبعاد الخلايا الميتة (انظر الخطوة 5.15). تظهر المؤامرة النهائية تعبير CD34 (المحور ص) و NKG2DL (المحور X) على المفردات الحية.
- بالنسبة للأجسام المضادة الوحيدة المضادة ل NKG2DL ، قم بتطبيق نفس الاستراتيجية على العينات ولكن لاحظ أن الإيجابية ليغاند تكمن في Alexa Fluor 488 وليس قناة PE.
- ضبط البوابات وفقا لضوابط FMO لاستراتيجية gating من الخطوة 6.4 و 6.5 (انظر الجدول 3)لضوابط FMO المناسبة لتنفيذ لهذه التجربة: في برنامج التحليل، رسم بوابة على الكسر السلبي. أثناء تسجيل العينة الملطخة بالكامل ، فإن الخلايا فوق البوابة التي تم إنشاؤها مسبقا إيجابية لعلامة التحليل.