يصف هذا البروتوكول مقاهات المراسل لدراسة تنظيم ترجمة الحمض النووي الريبي في البويضات المفردة أثناء النضج في المختبر.
مقالة منهجية
يصف هذا البروتوكول مقاهات المراسل لدراسة تنظيم ترجمة الحمض النووي الريبي في البويضات المفردة أثناء النضج في المختبر.
وقد وصفت جيدا الأحداث المرتبطة النضج النووي البويضات. ومع ذلك ، لا يعرف الكثير عن المسارات والعمليات الجزيئية التي تحدث في السيتوبلازم استعدادا للإخصاب واكتساب التوبيتوتين. أثناء نضوج البويضات، تعتمد التغيرات في التعبير الجيني حصريا على ترجمة وتدهور الحمض النووي الريبي الرسولي الأمومي (mRNAs) بدلا من النسخ. وبالتالي، يلعب تنفيذ البرنامج الترجمي دورا رئيسيا في تأسيس كفاءة نمو البويضات للحفاظ على نمو الجنين. هذه الورقة هي جزء من التركيز على تحديد برنامج ترجمة الحمض النووي الريبي الأمومي الذي يحدث أثناء النضج المتوسط وفي الانتقال من البويضات إلى الزيجوتي. في ورقة الأسلوب هذه، يتم تقديم استراتيجية لدراسة تنظيم ترجمة الحمض النووي الريبي المستهدف أثناء نضوج البويضات في المختبر. هنا، يتم دمج مراسل Ypet إلى المنطقة 3 'غير المترجمة (UTR) من جين الفائدة ومن ثم حقنها في البويضات جنبا إلى جنب مع ترميز ميرنا متعددة الأضلاع ل mCherry للسيطرة على حجم حقن. باستخدام المجهر الفاصل زمنيا لقياس تراكم المراسل، يتم حساب معدلات الترجمة في انتقالات مختلفة أثناء النضج الدموي البويضات. هنا، تم وصف بروتوكولات عزل البويضات وحقنها، وتسجيل الفاصل الزمني، وتحليل البيانات، وذلك باستخدام مراسل Ypet/interleukin-7 (IL-7)-3'UTR كمثال.
تخضع البويضات الثديية الكاملة النمو لتغيرات سريعة استعدادا للإخصاب واكتساب التريبوتين. وهذه التغيرات ضرورية للحفاظ على النمو الجنيني بعد الإخصاب. على الرغم من أن الأحداث المرتبطة بالنضج النووي موصوفة بشكل جيد نسبيا ، إلا أنه لا يعرف الكثير عن العمليات والمسارات الجزيئية في السيتوبلازم البويضات. خلال المراحل النهائية من نضوج البويضات ، تكون البويضات صامتة نسخيا ، ويعتمد التعبير الجيني اعتمادا كليا على ترجمة ميرناوتدهورها 1،2. تركيب البروتينات الحاسمة للكفاءة التنموية، لذلك، يعتمد على برنامج الترجمة في الوقت المناسب من الحمض النووي الريبي طويلة الأجل التي تم توليفها في وقت سابق خلال نمو البويضات1،3. كجزء من التركيز على تعريف هذا البرنامج من ترجمة مرنا الأم المنفذة خلال النضج المطيسي وفي الانتقال البويضات إلى الزيجوتي، تقدم هذه الورقة استراتيجية لدراسة تفعيل وقمع ترجمة الحمض النووي الريبي الأم المستهدفة في البويضات واحدة أثناء النضج المتوسطي في المختبر.
في هذه الطريقة، يتم استنساخ إطار القراءة المفتوحة YPet المنبع من UTR 3 'من نص الاهتمام. بعد ذلك، يتم حقن mRNAs ترميز هذا المراسل في البويضات جنبا إلى جنب مع mRNAs متعددة الأضلاع ترميز mCherry للسيطرة على حجم حقن. يتم قياس تراكم المراسل أثناء النضج الدموي في المختبر باستخدام المجهر الفاصل الزمني. يتم تسجيل تراكم البروتين الفلوري الأصفر (YFP) و mCherry في البويضات الفردية ، ويتم تصحيح إشارات YFP من خلال المستوى الهضب للمشيري المحقون. بعد الحصول على البيانات، يتم حساب معدلات الترجمة لفواصل زمنية مختلفة أثناء النضج الدموي في المختبر عن طريق حساب منحدر المنحنى الذي تم الحصول عليه عن طريق تركيب المنحنى.
ويوفر هذا النهج أداة للتأكد تجريبيا من التغيرات في ترجمة الرنانات الذاتية المختارة. وبالإضافة إلى ذلك، يسهل هذا الأسلوب توصيف العناصر التنظيمية التي تتحكم في الترجمة أثناء النضج البويضي من خلال التلاعب بالعناصر التنظيمية لرابطة الدول المستقلة من 3' UTR من mRNAs الهدف4،5،6. التلاعب في طول ذيل بولي (A) يسمح أيضا نظرة ثاقبة النشاط adenylase / deadenylase في البويضات5. يمكن استخدام موتاجينيسيس من عناصر رابطة الدول المستقلة بالنيابة أو RNA المناعي لدراسة التفاعلات مع cognate الحمض النووي الريبي ملزمة البروتينات6،7. بالإضافة إلى ذلك، يمكن استخدام هذه الطريقة لتحديد المكونات الأساسية لبرنامج الترجمة التي تعتبر حاسمة لكفاءة نمو البويضات من خلال قياس الهدف 3' ترجمة UTR في النماذج المرتبطة بانخفاض جودة البويضات 8و9و10. تقدم ورقة الأسلوب هذه تجربة تمثيلية حيث تم حقن البويضات الناضحة لفئران C57/BL6 البالغة من العمر 21 يوما بالحقن الدقيق مع مراسل Ypet المنصهر في UTR 3 من IL-7. وقد وصفت الإعداد والبروتوكول لحقن البويضات، وتسجيل الفاصل الزمني، وتحليل البيانات.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تمت الموافقة على الإجراءات التجريبية التي تشمل الحيوانات من قبل اللجنة المؤسسية لرعاية الحيوانات واستخدامها في جامعة كاليفورنيا في سان فرانسيسكو (البروتوكول AN182026).
1. إعداد وسائل الإعلام
2. إعداد ترميز مرنا لYpet-3 'UTR و mCherry
3. إجراء تجريبي
ملاحظة: يتم إعطاء نظرة عامة تخطيطية للحقن المجهري البويضات والمجهر الفاصل الزمني اللاحق في الشكل 1.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تم حقن البويضات التي تم القبض عليها من قبل Denuded prophase I لفئران C57/BL6 البالغة من العمر 21 يوما بمزيج مراسل يحتوي على ترميز الحمض النووي الريبي لمراسل Ypet المنصهر في UTR 3 من IL-7 و mRNA ترميز mCherry. تم تسجيل تعبير YFP و mCherry في 39 بويضة ، منها 30 نضجت ، وألقي القبض على 9 في prophase I كتحكم سلبي. تم استبعاد ثلاث بويضات ناضجة للتحليل لأنها إما تأخرت GVBD (N = 2) أو انتقلت في الطبق أثناء التسجيل (N = 1). الشكل 3 يظهر mCherry وتعبير YFP في prophase I والبويضات الناضجة.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تصف الطريقة المقدمة استراتيجية لدراسة تنشيط وقمع ترجمة الحمض النووي الريبي المستهدف في التحولات المختلفة أثناء النضج الدموي في المختبر. IL-7، تم اختيار السيتوكين الصادر عن البويضات التي قد تشارك في الاتصالات الخلية البويضات-الركامية8،13،لغرض وصف هذه الطريقة. ومن المعروف IL-7 أن تترجم على نحو متزايد خلال نضوج البويضات8 ويسمح لتصور جيد للتنشيط الترجمة باستخدام هذه الطريقة. ومع ذلك، إذا حدثت الترجمة بمعدل ثابت طوال التجربة، فإن تراكم...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ولا يعلن صاحبا البلاغ عن وجود تضارب في المصالح.
تم دعم هذا العمل من قبل المعاهد القومية للصحة R01 GM097165، GM116926 ومراكز يونيس كينيدي شرايفر NICHD الوطنية للبحوث التحويلية في الإنجاب والعقم P50 HD055764 لماركو كونتي. 10- وتحظى إنريكو م. دالديلو بدعم من زمالة من مؤسسة لالور، وتحظى ناتاسيا ج. ج. كوسترمانز بدعم من زمالة روبيكون من المنظمة الهولندية للبحث العلمي.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| <قوي> تحضير الوسائط < / قوي > | |||
| مصل الألبومين مسحوق Bioxtra | سيجما ألدريتش | SIAL-A3311 | |
| سيلوستاميد | EMD ميليبور | 231085 | |
| MEM ألفا | جيبكو | 12561-056 | |
| الحد الأدنى من النسر المتوسط الأساسي ؛ | محلول Sigma-Aldrich | M2645 | |
| Penicillin-Streptomycin 100x ، شركة Genesee Scientific Corporation المعقمة المفلترة | (GenClone) | 25-512 | |
| بيكربونات الصوديوم ؛ | JT-Baker | 3506-1 | |
| بيروفات الصوديوم | Gibco | 11360-070 | |
| الماء المقطر عالي النقاء | Invitrogen | 10977-015< | |
| strong> إعداد mRNA الذي يشفر YFP / 3 'UTR و mCherry< / strong> | |||
| Agarose | Apex Biomedical | 20-102QD | |
| كربينيسيلين ملح ثنائي الصوديوم | سيجما-ألدريتش | C1389-1G | |
| Choo-Choo طقم استنساخ | McLab | CCK-20 | |
| CutSmart Buffer (10x) | صبغة تحميل الحمض النووي New England Biolabs | B7204 | |
| (6x) | محلول Thermo Scientific | R0611 | |
| dNTP | New England Biolabs | N0447S | |
| DpnI | New England Biolabs | R0176 | |
| GeneRuler 1 كيلو بايت سلم الحمض النووي | Thermo Fisher | SM1333 | |
| LB Agar Plates مع 100 & micro ؛ جم / مل كاربينيسيلين ، تكنوفا ؛ | Teknova | L1010 | |
| LB متوسط (كبسولات) | MP Biomedicals | 3002-021 | |
| MEGAclear Transcription Clean-Up Kit | Life Technologies Life | AM1908 | |
| MfeI-HF إنزيم تقييد | نيو إنجلاند Biolabs | R3589 | |
| mMESSAGE mMACHINE T7 طقم النسخ | Invitrogen | AM1344 | |
| Phusion الحمض النووي عالي الدقة بوليميراز | نيو إنجلاند بيولابس | M0530 | |
| بولي (أ) طقم مخلفات | Invitrogen | AM1350 | |
| QIAprep Spin Miniprep Kit ؛ | Qiagen | 27106 | |
| QIAquick Gel Extraction Kit | Qiagen | 28704 | |
| S.O.C. متوسط | Thermo Fisher | 15544034 | |
| TAE buffer ؛ | أبيكس بيوميديكال | 20-193 | |
| Ultra Pure Ethidium Bromide | Solution Life Technologies | 15585011< | |
| strong> Ovcyte collection< / قوي > | |||
| تجميع أنبوب الشفاط للماصات الدقيقة المعايرة | Sigma-Aldrich | A5177-5EA | |
| الماصات الدقيقة المعايرة | Drummond Scientific Company | 2-000-025 & nbsp ؛ | |
| PMSG- 5000 | Mybiosource | MBS142665 | |
| PrecisionGlide إبرة 26 جم × 1/2 | د.ب | 305111 | |
| حقنة 1 مل | BD | 309659 | |
| <قوية> حقن دقيق للبويضات < / قوي > | |||
| 35 مم طبق | رقم 0 غطاء | قطر الزجاج 20 مم | غير مصقول | MatTek | P35G-0-20-C | للفحص المجهري بفاصل زمني |
| زجاج البورسليكات مع أداة Sutter الفتيل | BF100-78-10 | ||
| زيت لزراعة الأجنة | Irvine Scientific | 9305 | |
| Petri Dish | Falcon | 351006 | للحقن |
| الدقيق لطبق زراعة الأنسجة | Falcon | 353001 | لحضانة البويضات |
| VacuTip القابضة الشعرية | Eppendorf | 5195000036 | |
| Software | |||
| Biorender | BioRender | إعداد الشكل 1S | |
| MetaMorph، الإصدار 7.8.13.0 | الجزيئية | للفحص المجهري بفاصل زمني ، تحليل ترجمة UTR 3 ' ؛ |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن