نقدم هنا بروتوكولا لفحص عوامل النسخ المحتملة المشاركة في تطوير الخلايا التغصنية (DC) باستخدام نقل الفيروس اللاصق ل shRNA للحصول على خطوط خلايا ضربة قاضية مستقرة لتمايز DC في المختبر .
مقالة منهجية
نقدم هنا بروتوكولا لفحص عوامل النسخ المحتملة المشاركة في تطوير الخلايا التغصنية (DC) باستخدام نقل الفيروس اللاصق ل shRNA للحصول على خطوط خلايا ضربة قاضية مستقرة لتمايز DC في المختبر .
الخلايا التغصنية (DCs) هي خلايا مهمة تقدم المستضدات تربط الاستجابات المناعية الفطرية والتكيفية. والبلدان النامية غير متجانسة ويمكن تقسيمها إلى بلدان متجانسة تقليدية (cDC) وبلدان بلازماسيتويد (pDC). cDCs متخصصة في تقديم المستضدات إلى الخلايا التائية الساذجة وتنشيطها. من ناحية أخرى ، يمكن أن تنتج PDCs كميات كبيرة من الإنترفيرون من النوع الأول (IFN-I) أثناء العدوى الفيروسية. تحدث مواصفات DCs في مرحلة مبكرة من أسلاف DC في نخاع العظم (BM) ويتم تعريفها من خلال شبكة من عوامل النسخ (TFs). على سبيل المثال ، تعبر cDCs بشكل كبير عن ID2 ، بينما تعبر pDCs بشكل كبير عن E2-2. وبما أنه يجري تحديد المزيد والمزيد من المجموعات الفرعية من البلدان النامية، فإن هناك اهتماما متزايدا بفهم أطر عمل محددة تتحكم في تنمية الاعتمادات المستندية. هنا ، أنشأنا طريقة لفحص TFs الحرجة لتمايز DCs في المختبر من خلال توصيل فيروس lenti الذي يحمل الحمض النووي الريبي القصير (shRNA) إلى خط جذعي مكون للدم وخلية سلفية (iHSPCs) مخلدة. بعد الاختيار والتمايز في المختبر ، يتم تحليل إمكانات cDC و pDC لخطوط الخلايا القاضية المستقرة بواسطة قياس التدفق الخلوي. يوفر هذا النهج منصة لتحديد الجينات التي يحتمل أن تحكم مصائر DC من السلف في المختبر.
والبلدان النامية هي المنظم الرئيسي للمناعة الفطرية والتكيفية1. وتصنف البلدان النامية أساسا إلى مجموعتين سكانيتين متميزتين وظيفيا، هما البلدان النامية النامية والبلدان النامية. وعلاوة على ذلك، تتألف البلدان النامية من مجموعتين فرعيتين، هما البلدان النامية من النوع الأول والثاني أو cDC1s و cDC2s، على التوالي2. pDCs ، التي تعبر عن BST2 ، Siglec-H ، والمستويات المتوسطة من CD11c في الفئران3,4 ، هي الخلايا التي يمكن أن تفرز كميات كبيرة من IFN-I أثناء الالتهاب والعدوى الفيروسية 5. نظرا لقدرتها القوية على إنتاج IFN-I ، يشتبه أيضا في أنها تلعب دورا رئيسيا في تطور أمراض المناعة الذاتية ، بما في ذلك الذئبة الحمامية الجهازية (SLE)6. cDC1s ، التي يتم تعريفها من خلال التعبير السطحي ل XCR1 و CD8a و CLEC9A و CD103 في الفئران7 ، متخصصة في تنشيط واستقطاب الخلايا التائية CD8 + السامة للخلايا (CTLs) من خلال العرض المتقاطع للمستضد ، وبالتالي بدء مناعة النوع الأول استجابة لمسببات الأمراض داخل الخلايا والسرطان8,9. من ناحية أخرى ، يمكن ل cDC2s ، التي تعبر عن CD11b و CD172α (المعروفة أيضا باسم Sirpα) في كل من البشر والفئران ، تنشيط خلايا CD4 + T وتعزيز الاستجابة المناعية من النوع الثاني ضد مسببات الحساسية والطفيليات10 ، وكذلك تعديل مناعة النوع الثالث بعد البكتيريا خارج الخلية والتعرف على الميكروبات11,12.
يتم تحديد تنويع DCs بواسطة مجموعة من TFs من الخلايا الجذعية والسلف المكونة للدم (HSPCs) في BM. E2-2 (المشفر بواسطة Tcf4) هو منظم رئيسي للتمايز ووظيفة pDCs13,14. وعلى النقيض من ذلك، فإن مثبط ربط الحمض النووي 2 (ID2) يدفع مواصفات cDC ويمنع تطور PDC من خلال منع نشاط البروتين E15. علاوة على ذلك ، يتطلب تطوير cDC1s IRF8 و BATF3 ، في حين أن التمايز بين cDC2s يعتمد بشكل كبير على IRF416. وقد استكشفت الأعمال الأخيرة عدم تجانس pDCs17 و cDCs ولوائحها النسخية18. ونظرا لتعقيد شبكة الاعتمادات المستندية، هناك حاجة لم تتم تلبيتها لإنشاء منصة لتحديد الأفرقة الفنية الأخرى التي تتحكم في تطوير البلدان النامية ووظائفها.
هنا ، استخدمنا iHSPC الذي تم إنشاؤه عن طريق التعبير عن النقل النووي المنظم لهرمون الاستروجين ل Hoxb8 في خلايا BM (يشار إليها أيضا باسم خلايا Hoxb8-FL)19. يمكن أن تتكاثر iHSPCs وتبقى في مرحلة غير متمايزة في وجود β-estradiol و Flt3 ligand (FL) ، في حين أنها تبدأ في التمايز إلى أنواع DC مختلفة في وجود FL عند سحب β-estradiol19. واستنادا إلى هذه الميزة، يمكننا أن نهدم الجينات ذات الأهمية في مرحلة السلف، تليها دراسة التأثير على التمايز في المختبر بين pDCs و cDCs. لذلك ، هذه الطريقة هي أداة قوية لاكتشاف الجينات التي تنظم تطور ووظيفة DCs.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يتم التعامل مع فيروس lentivirus وفقا لتنظيم قسم الصحة والسلامة البيئية في كلية الطب بجامعة تايوان الوطنية.
1. إعداد خطوط الخلايا الجذعية المكونة للدم والسلف الخالدة (iHSPCs)
2. نقل الفيروسات اللينتيفيرية
3. قياس كفاءة الضربة القاضية عن طريق النسخ العكسي و PCR في الوقت الحقيقي (RT-PCR)
4. التمايز في المختبر لخطوط خلايا iHSPC الضربة القاضية المستقرة
5. تحليل التدفق الخلوي للبلدان النامية المتمايزة
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تظهر خريطة ناقل الفيروس الخفيف pLKO.1-Puro (الشكل 1). بعد تسليم الفيروس اللينتي الذي يعبر عن shRNA ضد LacZ (عنصر تحكم غير مستهدف) و Tcf4 و Id2 في iHSPCs ، كشفت كفاءة الضربة القاضية التي أكدتها RT-qPCR أن التعبير عن Tcf4 قد انخفض في shTcf4 iHSPCs ، مقارنة ب shLacZ iHSPCs (الشكل 2A). ومن ناحية أخرى، لوحظ أيضا انخفاض التعبير عن Id2 في shId2 iHSPCs، مقارنة بمراقبة iHSPCs shLacZ (
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
غالبا ما تستخدم ناقلات الحمض النووي الريبوزي المرسال القائمة على فيروس لينتي لإسكات الجينات عن طريق النقل الفيروسي إلى الخلايا وتسمح بالاندماج المستقر في الجينوم المضيف. ومع ذلك ، يجب النظر في كفاءة النقل المختلفة في أنواع الخلايا المختلفة ، وقد تم اتخاذ عدد من النهج للتغلب على هذه المشكلة.
البوليبرين هو بوليمر متعدد الكوابات يمكنه تحييد الشحنات الموجودة على غشاء الخلية ، وبالتالي تعزيز ربط الفيريون بالخلايا أثناء النقل20. على الرغم من أنها طريقة فعالة لزيادة معدل النق...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وليس لدى صاحبي البلاغ ما يكشفان عنه.
ونحن ممتنون للدعم التقني من الدكتور تز - لينغ تشن. نشكر المرفق الأساسي الوطني للحمض النووي الريبي (أكاديميا سينيكا ، تايوان) على توفير فيروس الحمض النووي الريبي (http://rnai.genmed.sinica.edu.tw). تم دعم هذا العمل من قبل وزارة العلوم والتكنولوجيا ، تايوان (MOST 108-2320-B-002-037-MY3 و MOST 109-2320-B-002-054-MY3).
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| <قوي > الأجسام المضادة < / قوي > | |||
| APC / Cy7 مضاد للفأر CD11c الأجسام المضادة | Biolegend | 117324 | (الاستنساخ: N418) |
| FITC مضاد للماوس / الإنسان CD11b الأجسام المضادة | Biolegend | 101206 | (استنساخ: M1 / 70) |
| PE المضاد للفأر / الإنسان B220 الأجسام المضادة | Biolegend | 103208 | (الاستنساخ: RA3-6B2) |
| <قوي >ثقافة الخلية< / قوي> | |||
| 1.5 مل أنبوب صغير | ExtraGene | TUBE-170-C | |
| 12 بئر صفيحة معالجة بزراعة | الأنسجة Falcon | 353043 | |
| مصل بقري الجنين (FBS) | Corning | 35-010-CV | |
| RPMI 1640 جيبكو متوسط | 11875-085 | ||
| <قوي >كاشف< قوي> | |||
| بيتا استراديول | سيجما ألدريتش | E2758-250MG | |
| β-mercaptoethanol (& beta;-ME) | Sigma-Aldrich | M6250 | |
| FACS عازلة | محلية | الصنع الصيغة: 1xPBS + 0.5٪ FBS + 0.1٪ NaN3< / sub> | |
| Flt3 ligand (FL) | محلي الصنع | ||
| Polybrene | Sigma-Aldrich | TR-1003-G | |
| Puromycin | Invivogen | ant-pr-1 | |
| TRIsure | BIOLINE | BIO-38032 | |
| shRNA (تسلسل Taregt / معرف الاستنساخ) | شركة | ||
| shId2 (GCTTATGTCGAATGATAGCAA/TRCN0000054390) | اتحاد RNAi (TRC) | ||
| shLacZ (CGCGATCGTAATCACCCGAGT / TRCN0000072224) اتحاد | RNAi (TRC) | ||
| shTcf4 (GCTGAGTGATTTACTGGATTT / TRCN0000012094) اتحاد | RNAi (TRC) |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن