$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
جنين ذبابة الفاكهة هو نموذج قوي ومناسب لدراسة الأسئلة الأساسية في البيولوجيا الخلوية والكائنات الحية. بساطته النسبية ، وعلم الوراثة القوي ، وصغر حجمه يجعلها نظاما ممتازا لتصوير كل من العمليات الخلوية والتنمية. هنا ، يتم تكييف بروتوكول الحقن المجهري القياسي لتمكين استخدام FP في الأجنة. يسمح هذا النهج بالتصوير الفلوري لهياكل خلوية محددة دون الحاجة إلى فلوروفورات مشفرة وراثيا ، مما يفتح العديد من الخلفيات الجينية للتصوير. يمكن أن يؤدي الجمع بين أصباغ متعددة بالإضافة إلى البروتينات المختارة بشكل استراتيجي ذات العلامات الفلورية إلى فتح تصوير مباشر متعدد القنوات يمتد عبر مجموعة كاملة من الضوء المرئي.
الخطوات الحاسمة في البروتوكول:
يستخدم هذا البروتوكول BODIPY 493/503 لتسمية LDs. يمكن بسهولة تكييف هذا النهج لوضع علامة على الهياكل الخلوية الأخرى. بالنسبة لتحليل الصور اللاحق ، فإن أحد أهم العوامل هو نسبة الإشارة إلى الضوضاء ، أي سطوع الصبغة مقارنة بإشارة الخلفية. تم تصوير الليزوسومات بنجاح (LysoTracker Red ، 1 mM) ، وكذلك الميتوكوندريا (Mitoview 633 ، 200 μM) ، و ER (متعقب ER Green ، 10 μM) ، والأنابيب الدقيقة (SiR tubulin ، 200 nM في DMSO) ، كما هو موضح في الشكل 2 ، الشكل 3 ، الشكل 4 ، الشكل 5. بالإضافة إلى ذلك ، فإن حويصلات صفار البيض هي ذاتية الفلورسنت وتعطي ضوءا أزرق عند إثارة الأشعة فوق البنفسجية (الصورة باستخدام 405 نانومتر كطول موجي للإثارة (الشكل 6)). بالنسبة للأصباغ الأخرى ، تهدف إلى أن يكون تركيز الصبغة 100-1000x مما هو مطلوب لتلطيخ الخلايا المستزرعة الحية ؛ هذا مشابه لتركيز محلول المخزون الذي سيتم تخفيفه في وسائط زراعة الخلايا. نظرا لأن هذا البروتوكول يدعو إلى حقن 100 fL وجنين ذبابة الفاكهة هو تقريبا 9 nL في الحجم18 ، فإن تركيزات الصبغة هذه ستصل في المتوسط إلى تركيز جنيني داخلي أقل من 1/100th مما هو موجود في وسائط زراعة الخلايا. مؤقتا ، سيكون التركيز المحلي أعلى في موقع الحقن ، وهو الأكثر ملاءمة ل FPs التي لا تنتشر بشكل جيد (أي أصباغ الميتوكوندريا و SiR-tubulin). بالنسبة لهذه FPs ، ابدأ بالتركيزات العالية الموصى بها ؛ إذا لوحظ موت غير متوقع ، فقم بالتخفيف على التوالي مرتين حتى يتم التوصل إلى حل وسط مقبول بين البقاء على قيد الحياة وقوة الإشارة.
عند الحقن المشترك لأصباغ متعددة ، يجب أن تكون كلتا الصبغتين إما في نفس المذيب ، أو يجب أن تكون كل من المذيبات والأصباغ متوافقة مع الخليط (لا ينصح بتركيزات الكحول التي تتجاوز ~ 10٪).
تعد جودة الإبر ضرورية لنجاح هذا الإجراء ، حيث يجب أن يكون الطرف جيدا قدر الإمكان. خلاف ذلك ، يمكن أن يؤدي الضرر الناجم عن جرح الحقن إلى الإضرار بالتطور اللاحق للجنين. نظرا لاختلاف مجتذبات الإبرة التجارية ، من المهم اتباع اقتراحات الشركة المصنعة وتجربة معلمات سحب متعددة حتى يتم تحقيق الشكل المطلوب. من الأهمية بمكان تنفيذ خطوة مراقبة الجودة 1.1.3 لأن العمل مع طرف إبرة متصدع أو خشن أو كبير التجويف سيجعل الحقن الناجح أكثر صعوبة أو حتى مستحيلا.
يحتاج الجنين إلى التجفيف جزئيا بحيث يمكن إضافة كميات إضافية من السائل أثناء الحقن. إذا كان الجنين غير جاف ، فلن تدخل الإبرة بسهولة ، وسوف ينفث السيتوبلازم مع اختراق الإبرة أو عند حقن المحلول. إذا كان الجنين مجففا بشكل مفرط ، فسيبدو مفرغا ولن يتطور بشكل صحيح. يعتمد وقت التجفيف الدقيق على الظروف المحلية ، على سبيل المثال ، رطوبة الهواء ، ويمكن أن يتغير من يوم لآخر. ويجب تحديده تجريبيا لكل دورة.
تعتمد قدرة الجنين على البقاء على قيد الحياة بعد الحقن المجهري بشكل حاسم على جودة الإبرة ، والتجفيف المناسب ، والحد من حجم الحقن إلى أقل من 1 pL (من الناحية المثالية 100 fL). طالما تم تحسين هذه المعلمات ، لا تظهر سمية كبيرة عند حقن الأصباغ الموصوفة بالتركيزات الموصى بها. إذا نجت الأجنة من خطوات التجفيف والحقن ، فإنها عادة ما تتطور بنجاح جيد في امتداد النطاق الجرثومي ، باستثناء مجسات الأنابيب الدقيقة و ER التي تسببت في عيوب الخلوية بمستويات عالية (حقن 100 fL من تركيز المخزون لكل منهما). لم يجد الاختبار أي عيوب تنموية واضحة عندما تم حقن DMSO والماء ومخاليط الاثنين بالكميات الموصى بها ، مع معدل بقاء الجنين من خلال تمديد النطاق الجرثومي بنسبة ~ 75٪ أو أكثر. تسببت أحجام الحقن التي تزيد عن 1 pL في حدوث عيوب وأجنة تم حقنها بأحجام ~ 4 pL تم تطويرها لمدة تقل عن 1 ساعة. لذلك ، يجب أن تبقى أحجام الحقن منخفضة ، مما يعني أن تركيزات الصبغة يجب أن تكون عالية.
بشكل عام ، يوصى بالحقن على طول الحافة الجانبية للجنين لأن ذلك يؤدي إلى أقل ضرر. ومع ذلك ، قد يلزم تعديل موقع الحقن اعتمادا على الخصائص المنتشرة ل FPs المستخدمة. ينتشر BODIPY 493/503 و LysoTracker بشكل أسرع عبر الجنين بأكمله من Lipid Spot 610 (صبغة أخرى لتمييز LDs) ، في حين أن SiR-Tubulin و Mitoview 633 لا ينتشران بالكامل عبر الجنين (التصوير في وقت متأخر من 7 ساعات بعد الحقن). وبالتالي ، قد يكون الحقن في أو بالقرب من موقع الاهتمام ضروريا. عند الحقن في المناطق الأمامية أو الخلفية ، يوصى باستخدام إبرة دقيقة بشكل خاص.
يعتمد الحصول على الصور على الفحص المجهري البؤري لتقسيم العضيات الصغيرة وجميع مكونات الهيكل الخلوي وحلها بصريا. لن تنجح التقنيات التي تتطلب تحليل العديد من الصور (مثل STORM أو PALM) لأن المحتويات الجنينية في حالة حركة ولم يتم تحسين الفلوروفورات للتبديل الضوئي. يفتقر المجهر Epifluorescence إلى الدقة الجانبية والمحورية لصنع معظم العضيات والهياكل الخلوية الأصغر. لهذه الأسباب ، يوصى بشدة باستخدام المجهر البؤري أو استخدام تقنية ورقة الضوء.
تعتمد قابلية تحليل الصور للتكرار بشكل كبير على بيانات التصوير المتسقة. للحصول على أكبر فرصة للنجاح ، يلزم تحسين تقنية الحقن والحصول على الصور. إن إنشاء وممارسة تقنية تكون فيها الصبغة (الصبغات) ذات الأهمية ، وموقع الحقن ، وعمر الجنين ، وحجم الحقن ، وإعداد الاكتساب كلها متسقة ستولد أقوى البيانات لتحليل الصور.
التعديلات واستكشاف الأخطاء وإصلاحها في الطريقة
يوضح هذا البروتوكول طريقة لتحليل التدفق الأكبر ل LDs في أجنة مرحلة الانقسام باستخدام قياس سرعة صورة الجسيمات. يمكن استخدام نفس النهج للعضيات الأخرى ، ومراحل النمو الأخرى ، وطرق التحليل الأخرى. على سبيل المثال، يوضح الشكل 2 تحليل LDs والعضيات الحمضية المتدفقة في المراحل المخلوية من التكوين الجنيني، والتي تم تصورها عن طريق الحقن المشترك BODIPY 493/503 و LysoTracker Red. وقد تحقق مزيد من التصوير الناجح لحركة LD في الأجنة حتى 7 ساعات بعد الإخصاب؛ تحتفظ هذه الأجنة بجرح الحقن ولكنها قادرة على التطور لعدة ساعات.
تم استخدام البيانات التي تم جمعها باستخدام هذا البروتوكول لقياس سرعة صورة الجسيمات ، ولكن تتوفر العديد من تقنيات التحليل الأخرى. على سبيل المثال ، يمكن استخدام برامج تتبع الجسيمات مثل تلك الموجودة في ImageJ أو Imaris أو التتبع اليدوي للحصول على سرعات واتجاهات الهياكل المتحركة. لاحظ أن معظم برامج التتبع هذه مصممة للعمل مع البيانات من أنظمة زراعة الخلايا المستوية ولا تتكيف دائما بشكل جيد مع هياكل 3D مثل جنين ذبابة الفاكهة . وعلاوة على ذلك، ومن أجل توليد أفضل بيانات تتبع الجسيمات جودة، ستحتاج إلى تصوير طائرات Z متعددة؛ يجب أن يكون هذا ممكنا إذا كانت أوقات اكتساب مكدس الصور أقل من ~ 2 ثانية. يجب أن يكون هذا المعيار قابلا للوصول إليه على قرص الدوران ، وورقة الضوء الشبكية ، والأنظمة البؤرية الحديثة للمسح بالليزر. ومع ذلك ، فإن جدوى تتبع الجسيمات للعضيات الوفيرة مثل LDs والميتوكوندريا والليزوسومات منخفضة لأن كمية الإشارة الإيجابية في مجال الرؤية مرتفعة للغاية بالنسبة لطرق التتبع الحالية. قد يكون من الممكن تتبع الهياكل الأقل وفرة مثل النوى أو حويصلات صفار البيض. يعمل PIV لتحليل التدفق بشكل جيد مع LDs والعضيات الحمضية في مراحل الانقسام لأن كلا العضيتين تتحركان بحرية. ترتبط العضيات مثل النوى و ER والميتوكوندريا بهياكل خلوية أخرى وبالتالي لا تتحرك بحرية ولا تتناسب مع تحليل البرامج الذي يفترض حرية الحركة. يجب على المحقق اختيار التقنيات الأنسب للعضية المثيرة للاهتمام.
خلال مرحلتي الأديم الأرومي المخلوي والخلوي ، تتحرك LDs (وكذلك بعض العضيات الأخرى) على طول الأنابيب الدقيقة الموجهة شعاعيا5. لذلك من الممكن العثور على مناظر مقطعية مستعرضة (كما هو الحال في الشكل 5) حيث تكون الأنابيب الدقيقة المفردة في بؤرة التركيز لمسافات طويلة ، مما يسمح بتتبع الجسيمات في 2D. نظرا لأن هذه الطائرات البصرية عميقة داخل الجنين ، فإن قوة الإشارة الإجمالية تتضاءل ، ويتم تقليل نسبة الإشارة إلى الضوضاء.
لتحليل التتبع ، يمكن أن يكشف التصوير في أسرع وقت ممكن عن تفاصيل حاسمة للحركة وبالتالي للآلات المتحركة. على سبيل المثال ، حركة قطرات الدهون هي مزيج من حالتين متحركتين ، حركة بطيئة قصيرة (~ 200 نانومتر / ثانية ؛ متوسط مسافة السفر ~ 100 نانومتر) وحركة سريعة طويلة (~ 450 نانومتر / ثانية ؛ متوسط مسافة السفر ~ 1000 نانومتر)19 ؛ وبالتالي ، إذا تم التقاط الصور كل ثانية أو حتى أقل تكرارا ، تصبح الحالة البطيئة القصيرة غير قابلة للاكتشاف. ومع ذلك ، فإن التصوير المتكرر يحفز أيضا تبييض الفلوروفور والسمية الضوئية. لذلك ، يجب تعديل ظروف التصوير اعتمادا على السؤال الدقيق الذي يجب معالجته.
قيود الطريقة
اعتمادا على الصبغة المطلوبة ، يمكن أن تكون الطريقة محدودة بالتوافق بين ذوبان الصبغة وسمية محلول الحقن. من الصعب التعامل مع الكحوليات مثل الأيزوبروبانول والإيثانول داخل إبرة بسبب انخفاض لزوجتها ويبدو أنها تتلف المكونات الخلوية وتقتل الجنين.
كما أن هذه الطريقة ليست مناسبة تماما لتصور الخطوات الأولى في تكوين الأجنة لأن الأمر يستغرق أكثر من 30 دقيقة لإعداد الأجنة للحقن. في درجة حرارة الغرفة ، تكون دورات الخلية الأولية للجنين ~ 10 دقائق فقط لكل منها ؛ لذلك ، حتى لو اختار المرء بويضة مخصبة حديثا في الخطوة 5.2.3 ، فإن دورات الخلايا القليلة الأولى ستكتمل بالفعل بحلول الوقت الذي يكون فيه الجنين جاهزا للتصوير.
الإضاءة مع الضوء في نطاق الأشعة فوق البنفسجية / الزرقاء هي أكثر سمية للضوء بكثير من الأطوال الموجية الأطول. في ظل هذه الظروف (على سبيل المثال ، لمتابعة حويصلات صفار البيض ذاتية الفلورسنت ؛ الشكل 6) ، يتعين على المرء الحد من وقت التصوير (مما يؤدي إلى سلسلة زمنية أقصر) أو استخدام طاقة ليزر أقل (مما يؤدي إلى انخفاض نسبة الإشارة إلى الضوضاء).
بعد التجميع الخلوي ، تميل الأصباغ التي يتم حقنها في موقع معين إلى الانتشار بشكل سيئ ، حيث يجب أن تجتاز العديد من أغشية الخلايا. هذا يحد من منطقة الملاحظة في مراحل النمو اللاحقة.
أهمية الطريقة فيما يتعلق بالطرق القائمة / البديلة
يمكن تصور حركة LDs وغيرها من العضيات المحتوية على الدهون في الأجنة المبكرة باستخدام الفلوروفورات المشفرة وراثيا ، والتقنيات الخالية من الملصقات ، وإدخال FPs. يمكن تحقيق هذا الأخير عن طريق اختراق غشاء vitelline12 أو نهج الحقن المجهري الذي تمت مناقشته هنا.
الفلوروفورات المشفرة وراثيا هي علامات متعددة الاستخدامات تكون مستوياتها عادة قابلة للتكرار بشكل كبير من جنين إلى جنين. ومع ذلك ، لديهم عوائد كمية أقل وتبييض بسهولة أكبر من FPs. عادة ، فهي متوفرة فقط في إصدار واحد أو اثنين من الإصدارات الموسومة (على سبيل المثال ، GFP أو mCherry) ، مما يحد من اختيار الهياكل التي يمكن تصويرها في وقت واحد. من ناحية أخرى ، غالبا ما توجد FPs في مجموعة كبيرة ومتنوعة ؛ على سبيل المثال ، تتوفر العديد من الأصباغ الخاصة بقطرات الدهون مع أطياف الانبعاثات من Autodot في طيف الأشعة فوق البنفسجية / الزرقاء إلى Lipidtox و LipidSpot 610 في الطيف الأحمر البعيد. يمكن أيضا تطبيق FPs مباشرة على أي سلالة من الاهتمامات ، وبالتالي لا تتطلب بناء سلالة ، على سبيل المثال ، إدخال علامة العضية المطلوبة في سلالة متحولة من الاهتمام. وهذه الميزة واضحة بشكل خاص عندما يتم تصنيف هياكل متعددة في وقت واحد؛ بدلا من الصلبان المستهلكة للوقت التي تمتد عبر أجيال متعددة ، يمكن تحقيق ذلك في يوم واحد عن طريق خلط الأصباغ ذات الصلة وتقديمها في نفس الوقت. أخيرا ، إذا كان سيتم فحص العمليات الخلوية باستخدام تثبيط دوائي ، فيمكن إدخال الأدوية والأصباغ معا.
الطرق الخالية من الملصقات هي طرق قوية جدا للكشف عن هياكل خلوية محددة. على سبيل المثال ، يمكن اكتشاف LDs على وجه التحديد في الأجنة المبكرة عن طريق المجهر التوافقي الثالث20 أو عن طريق المجهر21 لفقدان الفيمتو ثانية المحفز من الفيمتو ثانية. مثل FPs ، يمكن تطبيق هذه الأساليب في أي خلفية وراثية ، ولأنها لا تسبب التبييض ، فمن المحتمل أن تسمح بالحصول على الصور بشكل أسرع. ومع ذلك ، فإنها تقتصر عادة على عضيات محددة ، وبالتالي لا تدعم في حد ذاتها التصوير متعدد الإرسال ؛ كما أنها تتطلب مجاهر متخصصة.
هناك استراتيجيتان عامتان لإدخال جزيئات صغيرة في الأجنة. أحدهما هو نهج الحقن المجهري المستخدم هنا. والآخر هو العلاج الكيميائي (التربين) لاختراق غشاء الفيتيلين. النهج الأخير12 أقل مشاركة من الحقن المجهري ، ولكنه أيضا أكثر تنوعا من جنين إلى جنين. بالإضافة إلى ذلك ، بعد النفاذية ، يتم اختراق الحماية التي يوفرها غشاء vitelline ويكون الجنين المناسب متاحا للوسط الخارجي ، مما يجعل من الصعب إبقائه على قيد الحياة. الحقن المجهري أقل احتمالا بكثير لإخراج التطور الجنيني عن مساره من النفاذية. ومع ذلك ، يوصى بالنفاذية إذا كان هناك حاجة إلى مراقبة العديد من الأجنة في وقت واحد ، على سبيل المثال ، لأغراض فحص الأدوية. لمتابعة حركة الهياكل الخلوية والحصول على سلسلة صور قابلة للتكرار مناسبة لتحليل الصور ، فإن الحقن المجهري هو الطريقة المفضلة.
أهمية والتطبيقات المحتملة للطريقة في مجالات بحثية محددة
جنين ذبابة الفاكهة هو نظام نموذجي مهم لدراسة العديد من العمليات الخلوية البيولوجية والتنموية1،5،6. وقد ساهم وسم العضيات بالبروتينات الفلورية إسهاما كبيرا في فهم كيفية تطور الجنين المبكر، وكيفية حركة العضيات المختلفة، وكيف يتم تعديل هذا الاتجار من الناحية التنموية والوراثية. ومع ذلك ، فإن ميلها إلى التبييض وتحديات توليد سلالات يتم فيها تصنيف عضيات متعددة بألوان مختلفة تحد من تطبيق هذا النهج. إن استخدام FPs التي يتم إدخالها عن طريق الحقن المجهري يحل العديد من هذه التحديات ويمكن حتى دمجه مع البروتينات الموسومة بالفلورسنت. تسمح هذه التقنية بتصوير عضيات متعددة وهياكل خلايا ومكونات هيكلية خلوية في أي خلفية وراثية. ونتيجة لذلك، يمكن مقارنة العديد من الأنماط الجينية عن طريق التصوير الحي، مما يجعل من الممكن تحديد تأثير الطفرات على الاتجار بالعضيات المتعددة.
يوضح هذا البروتوكول نهج حقن FP لأجنة ذبابة الفاكهة الميلانوغاستر ، ولكن من حيث المبدأ ، ينطبق هذا النهج على أي بيض حشرات تم إنشاء تقنيات الحقن المجهري لها ، بما في ذلك الأنواع الأخرى من ذبابة الفاكهة ، الصراصير22 ، وحشرات المن23.