يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية

مقالة منهجية

في المختبر إعادة تشكيل الهيكل الخلوي للأكتين داخل حويصلات يونيلاميلار العملاقة

4.1K مشاهدة

⸱

DOI:

10.3791/64026

⸱

أغسطس 25, 2022

 ,  , 
1Department of Biomedical Engineering, Yale University, 2Systems Biology Institute, Yale University, 3Department of Physics, Yale University

في هذه المقالة

ملخص

في هذه المخطوطة، نوضح التقنيات التجريبية لتغليف الهيكل الخلوي F-actin في حويصلات دهنية عملاقة أحادية الصفيحة (وتسمى أيضا الجسيمات الشحمية)، وطريقة تشكيل طبقة F-actin تحاكي القشرة الحيوية في النشرة الداخلية للغشاء الشحمي.

الملخص

يتوسط الهيكل الخلوي للأكتين ، وهو الآلية الميكانيكية الرئيسية في الخلية ، العديد من الأنشطة الخلوية الفيزيائية الأساسية ، بما في ذلك تشوه الخلية والانقسام والهجرة والالتصاق. ومع ذلك ، فإن دراسة ديناميكيات وبنية شبكة الأكتين في الجسم الحي معقدة بسبب التنظيم الكيميائي الحيوي والجيني داخل الخلايا الحية. لبناء نموذج الحد الأدنى الخالي من التنظيم الكيميائي الحيوي داخل الخلايا ، يتم تغليف الأكتين داخل حويصلات أحادية الصفيحة العملاقة (GUVs ، وتسمى أيضا الجسيمات الشحمية). الجسيمات الشحمية المحاكاة الحيوية بحجم الخلية وتسهل نظرة كمية على الخصائص الميكانيكية والديناميكية لشبكة الهيكل الخلوي ، مما يفتح طريقا قابلا للتطبيق للبيولوجيا التركيبية من أسفل إلى أعلى. لتوليد الجسيمات الشحمية للتغليف ، يتم استخدام طريقة المستحلب المقلوب (يشار إليها أيضا باسم طريقة نقل المستحلب) ، والتي تعد واحدة من أنجح التقنيات لتغليف المحاليل المعقدة في الجسيمات الشحمية لإعداد أنظمة محاكاة الخلايا المختلفة. باستخدام هذه الطريقة ، يضاف مزيج من البروتينات ذات الأهمية إلى المخزن المؤقت الداخلي ، والذي يتم استحلابه لاحقا في محلول زيت معدني يحتوي على الدهون الفوسفاتية لتشكيل قطرات دهنية أحادية الطبقة. يتم إنشاء الجسيمات الشحمية المطلوبة من قطرات الدهون أحادية الطبقة التي تعبر واجهة الدهون / الزيت والماء. تمكن هذه الطريقة من تغليف بوليمرات الأكتين المركزة في الجسيمات الشحمية مع مكونات الدهون المطلوبة ، مما يمهد الطريق لإعادة تكوين شبكة الهيكل الخلوي التي تحاكي بيولوجيا في المختبر .

المقدمة

يلعب الهيكل الخلوي للأكتين دورا أساسيا في بناء البنية داخل الخلايا للخلية من خلال تنسيق الانقباض على المستوى الجزيئي وتوليد القوة1،2،3. ونتيجة لذلك ، فإنه يتوسط العديد من الأنشطة الخلوية الأساسية ، بما في ذلك تشوه الخلايا4,5 ، والانقسام6 ، والهجرة 7,8 ، والالتصاق9. اكتسبت إعادة تشكيل شبكات الأكتين في المختبر اهتماما هائلا في السنوات الأخيرة10،11،12،13،14،15،16،17. الهدف من إعادة التشكيل هو بناء نموذج الحد الأدنى من الخلية الخالية من التنظيم الكيميائي الحيوي المعقد الموجود داخل الخلايا الحية. وهذا يوفر بيئة يمكن التحكم فيها للتحقيق في أنشطة محددة داخل الخلايا ويسهل تحديد وتحليل المكونات المختلفة للهيكل الخلوي الأكتين18،19. علاوة على ذلك ، فإن تغليف شبكات الأكتين في المختبر داخل حويصلات أحادية الصفائح العملاقة الفوسفاتية (GUVs ، الجسيمات الشحمية) يوفر مساحة محصورة ولكنها قابلة للتشوه مع حدود شبه منفذة. إنه يحاكي البيئة الفسيولوجية والميكانيكية الدقيقة لآلات الأكتين داخل الخلية9،20،21،22.

من بين الطرق المختلفة لإعداد الجسيمات الشحمية ، تعد طريقة ترطيب فيلم الدهون (المعروفة أيضا باسم طريقة التورم) واحدة من أقدم التقنيات23. يرطب فيلم الدهون الجاف مع إضافة المخازن المؤقتة ، ويشكل فقاعات غشائية تصبح في النهاية حويصلات24. لإنتاج حويصلات أكبر ذات عائد أعلى ، تقوم طريقة محسنة تتقدم من طريقة ترطيب الفيلم ، والمعروفة باسم طريقة التكوين الكهربائي25 ، بتطبيق مجال كهربائي AC لتعزيز عملية الترطيب بكفاءة26. القيود الرئيسية لهذه الطرق القائمة على الترطيب لتغليف الأكتين هي أن لديها كفاءة تغليف منخفضة للبروتينات عالية التركيز ، وهي متوافقة فقط مع تركيبات دهنية محددة24. تقنية المستحلب المقلوب ، في المقابل ، لديها قيود أقل على مكونات الدهون وتركيزات البروتين20،27،28،29. في هذه الطريقة ، يضاف مزيج من البروتينات للتغليف إلى المخزن المؤقت المائي الداخلي ، والذي يتم استحلابه لاحقا في محلول زيت معدني يحتوي على الدهون ، مما يشكل قطرات أحادية الطبقة من الدهون. ثم تعبر قطرات الدهون أحادية الطبقة من خلال واجهة أخرى للدهون / الزيت والماء من خلال الطرد المركزي لتشكيل حويصلات دهنية ثنائية الطبقة (الجسيمات الشحمية). وقد أثبتت هذه التقنية أنها واحدة من أنجح الاستراتيجيات لتغليف الأكتين24,30. بشكل منفصل ، هناك بعض طرق أجهزة الموائع الدقيقة ، بما في ذلك النفث النبضي31,32 ، وطرد الغشاء العابر 33 ، وطريقة cDICE 34. أوجه التشابه بين طريقة المستحلب المقلوب وطريقة الموائع الدقيقة هي مذيب الدهون (الزيت) المستخدم وإدخال واجهة الدهون / الزيت والماء لتشكيل النشرة الخارجية للجسيمات الشحمية. على النقيض من ذلك ، يتطلب توليد الجسيمات الشحمية بطريقة الموائع الدقيقة إعداد أجهزة الموائع الدقيقة ويرافقه زيت محبوس بين منشوري الطبقة الثنائية ، الأمر الذي يتطلب خطوة إضافية لإزالة الزيت35.

في هذه المخطوطة، استخدمنا تقنية المستحلب المقلوب لإعداد الجسيمات الشحمية التي تغلف شبكة F-actin المبلمرة كما كانت تستخدم سابقا22. تم وضع خليط البروتين للتغليف لأول مرة في مخزن مؤقت مع ظروف غير بلمرة للحفاظ على الأكتين في شكله الكروي (G). تم تنفيذ العملية برمتها عند 4 درجات مئوية لمنع بلمرة الأكتين المبكرة ، والتي تم تشغيلها لاحقا عن طريق السماح للعينة بالدفء إلى درجة حرارة الغرفة. بمجرد الوصول إلى درجة حرارة الغرفة ، يتبلمر الأكتين في شكله الخيطي (F). يمكن إضافة مجموعة متنوعة من البروتينات المرتبطة بالأكتين إلى المحلول العازل المائي الداخلي لدراسة وظائف البروتين وخصائصه ، وبالتالي ، توفير المزيد من الأفكار حول تفاعله مع شبكة الأكتين وسطح الغشاء. يمكن أيضا تطبيق هذه الطريقة على تغليف البروتينات المختلفة ذات الأهمية36 والأشياء الكبيرة (الجسيمات الدقيقة ، السباحين الدقيقين ذاتي الدفع ، إلخ) بالقرب من حجم الجسيمات الشحمية النهائية 28,37.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

1. إعداد المخازن المؤقتة ومحاليل البروتين

  1. قم بإعداد المخزن المؤقت الداخلي المائي غير البلمرة (INP) بحجم إجمالي قدره 5 مل عن طريق خلط 0.1 mM CaCl 2 و 10 mM HEPES (الرقم الهيدروجيني 7.5) و 1 mM DTT و 0.5 mM Dabco و 320 mM sucrose و0.2 mM ATP.
  2. تحضير مزيج البروتين (PM) عن طريق إضافة البروتينات إلى مخزن INP العازل عند 4 درجات مئوية مع التركيزات التالية: 11.2 ميكرومتر غير الفلورسنت G-actin ، 2.8 μM المسمى بالفلورسنت الأكتين ، و 0.24 μM Arp2/3 (جدول المواد). لتشكيل طبقة F-actin ، أضف 100 نانومتر جيلسولين ، و 4 ميكرومتر كوفلين ، و 2.2 ميكرومتر VCA-His إلى PM. كتجربة تحكم ، استبدل PM بصبغة فلورسنت 100 ميكروغرام / مل (جدول المواد).
  3. قم بإعداد المخزن المؤقت للبلمرة الداخلية المائية (IP) (مائي) بحجم إجمالي قدره 5 مل عن طريق خلط 100 ملليمتر KCl و 4 ملليمتر MgCl2 و 10 ملم HEPES (درجة الحموضة 7.5) و 1 ملليمتر DTT و 0.5 ملليمتر دابكو و 10 ملليمتر ATP و 80 ملليمتر سكروز .
  4. قم بإعداد المخزن المؤقت النهائي (FB) عن طريق خلط المخزن المؤقت INP (الذي يحتوي على PM) والمخزن المؤقت IP بنسبة حجم 1: 1 لإنتاج المحلول المائي الداخلي بحجم إجمالي قدره 30 ميكرولتر سيتم تغليفه داخل الجسيمات الشحمية.
  5. قم بإعداد المخزن المؤقت الخارجي المائي (OB) بحجم إجمالي قدره 150 ميكرولتر عن طريق خلط 10 mM HEPES (الرقم الهيدروجيني 7.5) ، 50 mM KCl ، 2mM MgCl 2 ،0.2 mM CaCl2 ، 2mM ATP ، 1 mM DTT ، 0.5 mM Dabco ، 212 mM glucose ، و 0.1 mg / mL β-casein.
    ملاحظة: يمكن ضبط الأسمولية ل OB مع الجلوكوز لضمان أن يكون الضغط الأسموزي ل OB أكبر قليلا من ضغط FB (20-60 mOsm). يجب أن تكون كثافة FB أعلى قليلا من OB.

2. تحضير الجسيمات الشحمية على أساس تقنيات المستحلب المقلوب

  1. تحضير خليط الدهون والزيت
    1. أضف 100 ميكرولتر من 25 ملغم / مل L-α-phosphatidylcholine (كمبيوتر البيض غير الفلوري ، ويسمى أيضا EPC ، بما في ذلك 1٪ DHPE) في قارورة زجاجية. تبخر الكلوروفورم بغاز الأرجون ، تاركا طبقة دهنية صلبة جافة (2.5 ملغ) في قاع القارورة.
      1. لتشكيل طبقة F-actin ، أضف 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-{[n(5-amino-1-carboxypentyl) iminodiacetic acid] succinyl} ملح النيكل (DOGS-NTA-Ni) بنسبة 10: 1 من EPC إلى DOGS-NTA-Ni واخلطه قبل تبخر الكلوروفورم.
    2. أضف 2 مل من الزيت المعدني وقم بسونيك خليط الدهون والزيوت في درجة حرارة الغرفة في الحمام لمدة 1 ساعة لإعادة تعليق الدهون.
      ملاحظة: يمكن الاحتفاظ بخليط الدهون والزيت بعد الصوتنة لمدة 1 أسبوع عند 4 درجات مئوية. يقترح إعادة الصوتنة قبل الاستخدام.
  2. قم بإعداد مستحلب Final Buffer in Oil (FB / oil) لإعداد قطرات دهنية أحادية الطبقة تحتوي على البروتين محل الاهتمام.
    1. إلى 100 ميكرولتر من خليط زيت الدهون المأخوذ في أنبوب بلاستيكي ، أضف 10 ميكرولتر من FB. تأكد من أن FB في قطرة واحدة.
    2. باستخدام حقنة زجاجية ، اسحب خليط الدهون والزيت و FB وقم بشفطه بلطف لأعلى ولأسفل عدة مرات لاستحلابه ؛ ارسم كمية صغيرة من خليط زيت الدهون أولا ، ثم قطرة FB عن طريق وضع طرف المحقنة في محيط القطيرة لتقسيمها إلى قطرات صغيرة. كرر الطموح لأعلى ولأسفل حتى يتم تشكيل مستحلب أبيض وغائم.
  3. ضع 30 ميكرولتر من OB في أنبوب بلاستيكي منفصل. ضع 30 ميكرولتر من خليط الدهون والزيت فوق OB واتركه لمدة 10 دقائق تقريبا لتطوير طبقة أحادية الدهون في الواجهة.
    ملاحظة: إذا تم شحن الدهون أو تم دمج البروتين ، فيجب تمديد مدة هذه الخطوة38.
  4. تحضير الجسيمات الشحمية
    1. أضف بعناية 50 ميكرولتر من مستحلب FB / الزيت (الخطوة 2.2) إلى مرحلة الزيت العليا للأنبوب من الخطوة 2.3.
    2. جهاز طرد مركزي للأنبوب البلاستيكي عند 100 × جم لمدة 15 دقيقة عند 4 درجات مئوية. قم بتغيير الوقت وسرعة الطرد المركزي لتحسين تكوين الجسيمات الشحمية.
      ملاحظة: بعد الطرد المركزي ، يجب أن تكون مرحلة الزيت العلوية واضحة ، ويجب أن يكون OB السفلي (الذي يحتوي على الجسيمات الشحمية) غائما قليلا.
    3. قم بإزالة مرحلة الزيت بعناية بواسطة الماصة. استنشق حجما إضافيا إذا لزم الأمر. تأكد من عدم وضع طرف الماصة على جانب الأنبوب لتجنب إنشاء غضروف مفصلي من الزيت فوق مرحلة الجسيمات الشحمية.
    4. باستخدام ماصة جديدة ، قم بلصق طرف الماصة ببطء في المرحلة السفلية المتبقية وقم بشفط الحجم المائي لجمع الجسيمات الشحمية.
      ملاحظة: من الأفضل أن تفقد الحجم بدلا من دمج الزيت. سيؤدي إدراج الزيت إلى تمزق الجسيمات الشحمية ، وسيتم إطلاق المكونات الداخلية في المخزن المؤقت الخارجي. قطع طرف ماصة للحد من القص.

3. المراقبة المجهرية

  1. صب 100 ميكرولتر من OB في بئر غرفة الحضانة (لوحة من 4 آبار تحتوي على أغطية مستديرة 12 مم). قم بإيداع الجسيمات الشحمية التي تم جمعها بلطف (الخطوة 2.4.4) في OB ، ثم ضع غطاء آخر أعلى الغرفة.
    ملاحظة: يحتوي OB على الكازين β لتخميل سطح الزجاج وتقليل الالتصاق بين الجسيمات الشحمية20.
  2. راقب الجسيمات الشحمية باستخدام مجهر متحد البؤرة باستخدام هدف غمر الزيت 63x. استخدم خطوط ليزر 488 نانومتر و 647 نانومتر و 561 نانومتر لمراقبة الدهون المصنفة بالفلورسنت ، وصبغة الفلورسنت المغلفة ، والأكتين المغطى المسمى بالفلورسنت ، على التوالي. التقط الإطارات المثيرة للاهتمام واحفظ الصور بتنسيق TIFF.
  3. معالجة الصور وتحليلها في ImageJ/Fiji39. بالنسبة للمستخدمين الجدد ل ImageJ/Fiji، يتوفر برنامج تعليمي عبر الإنترنت (انظر جدول المواد).
    1. افتح ملف TIFF باستخدام برنامج ImageJ/Fiji.
    2. انتقل إلى الصورة > ضبط سطوع/تباين >. اضبط سطوع الصورة وتباينها إلى المقياس المطلوب عن طريق ضبط إعدادات الحد الأدنى والحد الأقصى ومنزلقي السطوع والتباين .
    3. انقر على أداة تحديد المستطيل في شريط الأدوات وحدد منطقة الاهتمام (ROI). انتقل إلى صورة > اقتصاص لاقتصاص عائد الاستثمار.
    4. انتقل إلى تحليل > تعيين المقياس. في النافذة المنبثقة، أدخل 1.0 في حقل نسبة أبعاد البكسل وقم بتعيين μm كوحدة الطول. في الحقل المسافة بالبكسل، أدخل عرض الصورة بالبكسل. في الحقل "المسافة المعروفة"، أدخل عرض الصورة الحقيقي بالميكرون.
    5. لقياس حجم الجسيم الشحمي، باستخدام أداة التحديد البيضاوي في شريط الأدوات، ارسم دائرة على طول حافة الجسيم الشحمي. انتقل إلى تحليل > قياس لقياس مساحة الدائرة ، والتي يمكن من خلالها حساب قطر الجسيم الشحمي.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

يتم توضيح إعداد الجسيمات الشحمية على أساس تقنية المستحلب المقلوب بيانيا وتخطيطيا في الشكل 1.

أولا ، تم إعداد الجسيمات الشحمية الفارغة (العارية) (قطرها ~ 5-50 ميكرومتر) التي كانت تتكون من الدهون الفوسفاتية (EPC) والدهون الفلورية (DHPE). تم تغليف صبغة فلورسنت ساطعة حمراء بعيدة داخل الجسيمات الشحمية العارية كتجربة تحكم. يمكن تحديد ما إذا كانت الطبقة الأحادية الدهنية قد تشكلت بنجاح في محيط القطرة من خلال مراقبة قطرات الدهون أحادية الطبقة التي تتضمن صبغة الفلورسنت في ا...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

تحدد العديد من الخطوات الرئيسية نجاح العائد العالي من الجسيمات الشحمية أثناء عملية التحضير. لإذابة فيلم الدهون تماما في الزيت ، يجب أن تكون العينة صوتية حتى يختفي فيلم الدهون في الجزء السفلي من القارورة الزجاجية تماما. بعد الصوتنة ، يجب تخزين خليط زيت الدهون بين عشية وضحاها في درجة حرارة الغرفة تحت ظروف مظلمة حتى تتفرق جزيئات الدهون29 أخرى. يمكن تخزين الخليط في 4 درجات مئوية لمدة تصل إلى أسبوع. عند تحضير مستحلب FB / الزيت مع قطرات دهنية أحادية الطبقة تحتوي على بروتين مثير للاهتمام ، يجب ضخ خليط ال...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

ويعلن صاحبا البلاغ عدم وجود تضارب في المصالح.

شكر وتقدير

نحن نقر بتمويل ARO MURI W911NF-14-1-0403 إلى M.P.M. ، والمعاهد الوطنية للصحة (NIH) R01 1R01GM126256 إلى M.P.M. ، والمعاهد الوطنية للصحة (NIH) U54 CA209992 ، و NIH RO1 GM126256 ، و NIH U54 CA209992 ، وجامعة ميشيغان / Genentech ، و SUBK00016255 و Human Frontiers Science Program (HFSP) رقم المنحة RGY0073/2018 إلى M.P.M. أي رأي أو نتائج أو استنتاجات أو توصيات يتم التعبير عنها في هذه المواد هي آراء المؤلفين (المؤلفين) ولا تعكس بالضرورة وجهات نظر ARO أو NIH أو HFSP. وتقر س. س. بالمناقشات المثمرة مع ف. ياداف و س. موريسان و س. أميري.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
1،2-dioleoyl-sn-glycero-3- {[n (5-amino-1-carboxypentyl) iminodiacetic acid] succinyl} ملح النيكل (DOGS-NTA-Ni)   ؛أفانتي بولر ليبيدز231615773دهون النيكل
1،4-ديازابيسيكلو [2.2.2] أوكتانسيجماD27802-25Gبروتين الأكتين DABCO
(>99٪ نقي): الهيكل الخلوي للعضلات الهيكلية للأرانبIncAKL99-Dغير الفلورية G-actin
بروتين الأكتين (الرودامين): الهيكل الخلوي للعضلات الهيكلية للأرانبAR05المسمى بالفلورسنت الأكتين
الأدينوزين 5 ′-triphosphate هيدرات ملح ثنائي الصوديومSigmaA2383-10GATP
Alexa Fluor 647 صبغةThermoFisherصبغة الفلورسنت
Andor iQ3Andor Technologiesبرامج التحكم والاستحواذ على المجهر متحد البؤر
Arp2 / 3 مركب البروتين: الهيكل الخلوي لدماغ الخنازير، IncRP01P-AArp 2/3
ثنائي هيدرات كلوريد الكالسيومسيجما10035048CaCl2< / sub>
Chamlide Chambers (4 آبار لغطاء دائري 12 مم)حضانةQuorum Technologies
بروتين Cofilin: الهيكلالخلوي المؤتلف البشري ، IncCF01-Ccofilin
المجهر متحد البؤر (63 مرة; هدف الغمر بالزيت)Andor TechnologiesLEICA DMi8
D- (+) -GLUCOSE BIOXTRASigmaG7528الجلوكوز
DithiothreitolDOT Scientific DSD11000-10
DTT بروتين الجيلسولين: Homo Sapiens ReampinantCytoelelton، IncHPG6gelsolin
Hamilton 1750 Gastight حقنة ، 500 & micro ؛ L ، إبرة أسمنتية ، 22 جم ، طرف مخروطي 2 بوصةحقنة زجاجية Cole-ParmerUX-07940-53
HEPESAmericanBio7365-45-9
ImageJ / Fijihttps://imagej.net/tutorials/
L-alpha-PhosphatidylcholineAvanti Polar Lipids Inc.97281442EPC
كلوريد المغنيسيومسيجما7786303MgCl2< / sub>
زيت معدني ، كاشف حيوي ، للبيولوجيا الجزيئية ، زيت خفيفسيجما8042475زيت معدني
N-WASP جزء WWA (aa400 & ndash ؛ 501 ، VCA-His)VCA-He يتم تنقية باستخدام بروتوكول المختبر. يمكن توفير البروتوكول بناء على طلبات معقولة
أوريغون جرين 488 1،2-ديهيكساديكانويل-sn-جلسيرو-3-فوسفويثانولامين (أوريغون جرين 488 DHPE)ثيرمو فيشرO12650DHPE
كلوريد البوتاسيومسيجما7447407KCl
السكروزسيجما57-50-1السكروز
بيتا الكازين من حليب الأبقارسيجماC6905-250MG
شركة ، غرفة

المراجع

  1. Murrell, M., Oakes, P. W., Lenz, M., Gardel, M. L. Forcing cells into shape: the mechanics of actomyosin contractility. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 16 (8), 486-498 (2015).
  2. Stricker, J., Falzone, T., Gardel, M. L. Mechanics of the F-actin cytoskeleton. Journal of Biomechanics. 43 (1), 9-14 (2010).
  3. Linsmeier, I., et al. Disordered actomyosin networks are sufficient to produce cooperative and telescopic contractility. Nature Communications. 7 (1), 1-9 (2016).
  4. Yousafzai, M., Yadav, V., Amiri, S., Errami, Y., Murrell, M. Active regulation of pressure and volume defines an energetic constraint on the size of cell aggregates. Physical Review Letters. 128 (4), 048103(2022).
  5. Simon, C., et al. Actin dynamics drive cell-like membrane deformation. Nature Physics. 15 (6), 602-609 (2019).
  6. Munro, E., Nance, J., Priess, J. R. Cortical flows powered by asymmetrical contraction transport PAR proteins to establish and maintain anterior-posterior polarity in the early C. elegans embryo. Developmental Cell. 7 (3), 413-424 (2004).
  7. Bray, D., White, J. Cortical flow in animal cells. Science. 239 (4842), 883-888 (1988).
  8. Beaune, G., et al. Spontaneous migration of cellular aggregates from giant keratocytes to running spheroids. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115 (51), 12926-12931 (2018).
  9. Murrell, M. P., et al. Liposome adhesion generates traction stress. Nature Physics. 10 (2), 163-169 (2014).
  10. Lee, G., et al. Myosin-driven actin-microtubule networks exhibit self-organized contractile dynamics. Science Advances. 7 (6), (2021).
  11. Anderson, S., Garamella, J., Adalbert, S., McGorty, R., Robertson-Anderson, R. Subtle changes in crosslinking drive diverse anomalous transport characteristics in actin-microtubule networks. Soft Matter. 17 (16), 4375-4385 (2021).
  12. Janson, M. E., et al. Crosslinkers and motors organize dynamic microtubules to form stable bipolar arrays in fission yeast. Cell. 128 (2), 357-368 (2007).
  13. McCall, P. M., MacKintosh, F. C., Kovar, D. R., Gardel, M. L. Cofilin drives rapid turnover and fluidization of entangled F-actin. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116 (26), 12629-12637 (2019).
  14. Köhler, S., Schaller, V., Bausch, A. R. Structure formation in active networks. Nature Materials. 10 (6), 462-468 (2011).
  15. Koenderink, G. H., et al. An active biopolymer network controlled by molecular motors. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106 (36), 15192-15197 (2009).
  16. Seara, D. S., et al. Entropy production rate is maximized in non-contractile actomyosin. Nature Communications. 9 (1), 1-10 (2018).
  17. Tabatabai, A. P., et al. Detailed balance broken by catch bond kinetics enables mechanical-adaptation in active materials. Advanced Functional Materials. 31 (10), 2006745(2021).
  18. Murrell, M. P., Gardel, M. L. F-actin buckling coordinates contractility and severing in a biomimetic actomyosin cortex. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109 (51), 20820-20825 (2012).
  19. Murrell, M., Gardel, M. L. Actomyosin sliding is attenuated in contractile biomimetic cortices. Molecular Biology of the Cell. 25 (12), 1845-1853 (2014).
  20. Murrell, M., et al. Spreading dynamics of biomimetic actin cortices. Biophysical Journal. 100 (6), 1400-1409 (2011).
  21. Liu, A. P., et al. Membrane-induced bundling of actin filaments. Nature Physics. 4 (10), 789-793 (2008).
  22. Pontani, L. -L., et al. Reconstitution of an actin cortex inside a liposome. Biophysical Journal. 96 (1), 192-198 (2009).
  23. Reeves, J. P., Dowben, R. M. Formation and properties of thin-walled phospholipid vesicles. Journal of Cellular Physiology. 73 (1), 49-60 (1969).
  24. Litschel, T., Schwille, P. Protein reconstitution inside giant unilamellar vesicles. Annual Review of Biophysics. 50, 525-548 (2021).
  25. Angelova, M. I., Dimitrov, D. S. Liposome electroformation. Faraday Discussions of the Chemical Society. 81, 303-311 (1986).
  26. Limozin, L., Sackmann, E. Polymorphism of cross-linked actin networks in giant vesicles. Physical Review Letters. 89 (16), 168103(2002).
  27. Pautot, S., Frisken, B. J., Weitz, D. Production of unilamellar vesicles using an inverted emulsion. Langmuir. 19 (7), 2870-2879 (2003).
  28. Natsume, Y., et al. Preparation of giant vesicles encapsulating microspheres by centrifugation of a water-in-oil emulsion. Journal of Visualized Experiments. (119), e55282(2017).
  29. Chiba, M., Miyazaki, M., Ishiwata, I. s Quantitative analysis of the lamellarity of giant liposomes prepared by the inverted emulsion method. Biophysical Journal. 107 (2), 346-354 (2014).
  30. Fujii, S., et al. Liposome display for in vitro selection and evolution of membrane proteins. Nature Protocols. 9 (7), 1578-1591 (2014).
  31. Funakoshi, K., Suzuki, H., Takeuchi, S. Formation of giant lipid vesiclelike compartments from a planar lipid membrane by a pulsed jet flow. Journal of the American Chemical Society. 129 (42), 12608-12609 (2007).
  32. Okushima, S., Nisisako, T., Torii, T., Higuchi, T. Controlled production of monodisperse double emulsions by two-step droplet breakup in microfluidic devices. Langmuir. 20 (23), 9905-9908 (2004).
  33. Ota, S., Yoshizawa, S., Takeuchi, S. Microfluidic formation of monodisperse, cell-sized, and unilamellar vesicles. Angewandte Chemie International Edition. 48 (35), 6533-6537 (2009).
  34. Bashirzadeh, Y., Wubshet, N., Litschel, T., Schwille, P., Liu, A. P. Rapid encapsulation of reconstituted cytoskeleton inside giant unilamellar vesicles. Journal of Visualized Experiments. (177), (2021).
  35. Deshpande, S., Caspi, Y., Meijering, A. E., Dekker, C. Octanol-assisted liposome assembly on chip. Nature Communications. 7 (1), 1-9 (2016).
  36. Bashirzadeh, Y., Liu, A. P. Encapsulation of the cytoskeleton: towards mimicking the mechanics of a cell. Soft Matter. 15 (42), 8425-8436 (2019).
  37. Vutukuri, H. R., et al. Active particles induce large shape deformations in giant lipid vesicles. Nature. 586 (7827), 52-56 (2020).
  38. Lemière, J., Carvalho, K., Sykes, C. Methods in Cell Biology. 128, Elsevier. 271-285 (2015).
  39. Schindelin, J., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nature Methods. 9 (7), 676-682 (2012).
  40. Liman, J., et al. The role of the Arp2/3 complex in shaping the dynamics and structures of branched actomyosin networks. Proceedings of the National Academy of Sciencesof the United States of America. 117 (20), 10825-10831 (2020).
  41. Sun, Y., Leong, N. T., Wong, T., Drubin, D. G. A Pan1/End3/Sla1 complex links Arp2/3-mediated actin assembly to sites of clathrin-mediated endocytosis. Molecular Biology of the Cell. 26 (21), 3841-3856 (2015).
  42. Bretschneider, T., et al. Dynamic actin patterns and Arp2/3 assembly at the substrate-attached surface of motile cells. Current Biology. 14 (1), 1-10 (2004).
  43. Goley, E. D., et al. An actin-filament-binding interface on the Arp2/3 complex is critical for nucleation and branch stability. Proceedings of the National Academy of Sciencesof the United States of America. 107 (18), 8159-8164 (2010).
  44. Svitkina, T. M., Borisy, G. G. Arp2/3 complex and actin depolymerizing factor/cofilin in dendritic organization and treadmilling of actin filament array in lamellipodia. The Journal of Cell Biology. 145 (5), 1009-1026 (1999).
  45. Kelleher, J. F., Atkinson, S. J., Pollard, T. D. Sequences, structural models, and cellular localization of the actin-related proteins Arp2 and Arp3 from Acanthamoeba. The Journal of Cell Biology. 131 (2), 385-397 (1995).
  46. Prehoda, K. E., Scott, J. A., Mullins, R. D., Lim, W. A. Integration of multiple signals through cooperative regulation of the N-WASP-Arp2/3 complex. Science. 290 (5492), 801-806 (2000).
  47. Delatour, V., et al. Arp2/3 controls the motile behavior of N-WASP-functionalized GUVs and modulates N-WASP surface distribution by mediating transient links with actin filaments. Biophysical Journal. 94 (12), 4890-4905 (2008).
  48. Izdebska, M., Zielińska, W., Hałas-Wiśniewska, M., Grzanka, A. Involvement of actin and actin-binding proteins in carcinogenesis. Cells. 9 (10), 2245(2020).
  49. Schäfer, E., Kliesch, T. -T., Janshoff, A. Mechanical properties of giant liposomes compressed between two parallel plates: impact of artificial actin shells. Langmuir. 29 (33), 10463-10474 (2013).
  50. Whittenton, J., et al. Evaluation of asymmetric liposomal nanoparticles for encapsulation of polynucleotides. Langmuir. 24 (16), 8533-8540 (2008).
  51. Levine, R. M., Pearce, T. R., Adil, M., Kokkoli, E. Preparation and characterization of liposome-encapsulated plasmid DNA for gene delivery. Langmuir. 29 (29), 9208-9215 (2013).
  52. Moga, A., Yandrapalli, N., Dimova, R., Robinson, T. Optimization of the inverted emulsion method for high-yield production of biomimetic giant unilamellar vesicles. ChemBioChem. 20 (20), 2674-2682 (2019).
  53. Vale, R. Reconstituting the Cytoskeleton. , Academic Press. (2014).
  54. Pardee, J. D., Spudich, J. A. Mechanism of K+-induced actin assembly. The Journal of Cell Biology. 93 (3), 648-654 (1982).
  55. Zimmerle, C. T., Frieden, C. Effect of pH on the mechanism of actin polymerization. Biochemistry. 27 (20), 7766-7772 (1988).
  56. Wegner, A. M., et al. N-wasp and the arp2/3 complex are critical regulators of actin in the development of dendritic spines and synapses. Journal of Biological Chemistry. 283 (23), 15912-15920 (2008).
  57. Blanchoin, L., et al. Direct observation of dendritic actin filament networks nucleated by Arp2/3 complex and WASP/Scar proteins. Nature. 404 (6781), 1007-1011 (2000).
  58. Römer, W., et al. Actin dynamics drive membrane reorganization and scission in clathrin-independent endocytosis. Cell. 140 (4), 540-553 (2010).
  59. Popova, A. V., Hincha, D. K. Effects of flavonol glycosides on liposome stability during freezing and drying. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Biomembranes. 1858 (12), 3050-3060 (2016).
  60. Harrigan, P., Madden, T., Cullis, P. Protection of liposomes during dehydration or freezing. Chemistry and Physics of Lipids. 52 (2), 139-149 (1990).
  61. Szoka, F., Papahadjopoulos, D. Comparative properties and methods of preparation of lipid vesicles (liposomes). Annual Review of Biophysics and Bioengineering. 9 (1), 467-508 (1980).
  62. Campillo, C., et al. Unexpected membrane dynamics unveiled by membrane nanotube extrusion. Biophysical Journal. 104 (6), 1248-1256 (2013).
  63. Deng, N. -N., Yelleswarapu, M., Huck, W. T. Monodisperse uni-and multicompartment liposomes. Journal of the American Chemical Society. 138 (24), 7584-7591 (2016).
  64. Ricketts, S. N., Ross, J. L., Robertson-Anderson, R. M. Co-entangled actin-microtubule composites exhibit tunable stiffness and power-law stress relaxation. Biophysical journal. 115 (6), 1055-1067 (2018).
  65. Sheung, J. Y., et al. Motor-driven restructuring of cytoskeleton composites leads to tunable time-varying elasticity. ACS Macro Letters. 10 (9), 1151-1158 (2021).
  66. Falzone, T. T., Blair, S., Robertson-Anderson, R. M. Entangled F-actin displays a unique crossover to microscale nonlinearity dominated by entanglement segment dynamics. Soft Matter. 11 (22), 4418-4423 (2015).
  67. Francis, M. L., et al. Non-monotonic dependence of stiffness on actin crosslinking in cytoskeleton composites. Soft Matter. 15 (44), 9056-9065 (2019).
  68. Yadav, V., et al. Filament nucleation tunes mechanical memory in active polymer networks. Advanced Functional Materials. 29 (49), 1905243(2019).
  69. Murrell, M., Thoresen, T., Gardel, M. Methods in Enzymology. 540, Elsevier. 265-282 (2014).

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

الوسوم

طريقة المستحلب المقلوبتغليف الليبوزوماتإعادة تشكيل الهيكل الخلويالمجهر البؤريديناميكيات شبكة الأكتينمعقد ARP2/3الوسم الفلورينموذج الخلية الاصطناعية
في المختبر إعادة تشكيل الهيكل الخلوي للأكتين داخل حويصلات يونيلاميلار العملاقة
تواصل معنا
أوصِ به للمكتبة

الخصوصية

شروط الاستخدام

السياسات

حقوق الطبع والنشر © 2026 MyJoVE Corporation. جميع الحقوق محفوظة.