$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
يعد التنميط والتمايز المناسبين للثغور النباتية أمرا بالغ الأهمية لوظيفتها في عمليتين بيولوجيتين أساسيتين ، التمثيل الضوئي والنتح ، ويتم فرضهما بواسطة مسارات إشارات الببتيد EPF. في أرابيدوبسيس، تتحكم ثلاثة ببتيدات غنية بالسيستين مفرزة، EPF1 و EPF2 و STOMAGEN/EPFL9، في جوانب مختلفة من تطور الثغور ويتم إدراكها بواسطة مكونات مستقبلات سطح الخلية، بما في ذلك كينازات مستقبلات عائلة ERECTA (ER و ERL1 و ERL2) و SERKsو TMM 1،2،3،4،5،6،7،8،9،10 . يؤدي هذا الاعتراف بعد ذلك إلى تقليل تنظيم عوامل النسخ التي تعزز تمايز الثغور من خلال عملية تعتمد على MAPK11. يتم اكتشاف جينات الثغور الأساسية هذه في المقام الأول من خلال الفحص الظاهري للمتحولات التي تظهر عيوب البشرة. تقدم هذه الورقة طرق التنميط الظاهري البسيطة والفعالة نسبيا لتصور الثغور وخلايا البشرة الأخرى ، وهي مطلوبة لتحديد وتوصيف الجينات المحتملة التي تتحكم في أنماط الثغور والتمايز.
عادة ما يتم تحقيق ملاحظة تفاصيل البشرة النباتية باستخدام تقشير البشرة مع أو بدون تلطيخ بصبغة مثل التولويدين الأزرق O (TBO) أو السافرانين12،13،14. ومع ذلك ، فإن التحدي الرئيسي لهذه الطرق هو أنها تتطلب تدريبا متخصصا لتقشير بشرة الأوراق دون تمزيق الأنسجة ومراقبة وتحليل بيانات الزخرفة بعناية مع تجنب الصور الملتقطة من أجزاء مختلفة من الورقة. كما تم استخدام المعالجات الكيميائية لإزالة عينات الأنسجة باستخدام الكواشف مثل محاليل المقاصة القائمة على هيدرات الكلورال على نطاق واسع لمجموعة مختلفة من المواد البيولوجية 8,15 ؛ تولد هذه العلاجات قدرا كبيرا من معلومات النمط الظاهري من خلال توفير صور عالية الجودة ولكنها تتطلب أيضا استخدام مواد كيميائية خطرة (مثل الفورمالديهايد وهيدرات الكلورال). تقدم هذه الورقة أولا طريقة سهلة ومريحة نسبيا للتنميط الظاهري تنتج صورا كافية للتحليل الكمي ولكنها لا تتطلب استخدام مواد كيميائية خطرة وقشور أوراق البشرة لإعداد العينة. تعتبر البشرة الملطخة ب TBO مثالية أيضا لدراسة تطور الثغور لأن نقص trichomes والتدرج التنموي الأصغر في الفلقات يسمح بالتفسير البسيط والقابل للتتبع للأنماط الظاهرية للبشرة.
تنتمي ببتيدات EPF الثغورية إلى مجموعة الببتيدات الغنية بالسيستين الخاصة بالنباتات والتي لها أحجام ناضجة كبيرة نسبيا وروابط ثاني كبريتيد داخل الجزيئات بين بقايا السيستين المحفوظة. يعد الطي المطابق الصحيح أمرا بالغ الأهمية لوظيفتها البيولوجية ، لكن الببتيدات الغنية بالسيستين ، والتي يتم إنتاجها إما عن طريق التخليق الكيميائي أو نظام إعادة التركيب غير المتجانس ، يمكن أن تكون غير نشطة وهي خليط من كل من الببتيدات المطوية وغير المطوية بشكل صحيح3،7،16. وبالتالي ، فإن فحص الببتيدات النشطة بيولوجيا التي لها دور في التحكم في نمو الثغور كان مهمة صعبة للغاية. تصف هذه المخطوطة بالإضافة إلى ذلك مقايسة حيوية لتحديد وتوصيف الببتيدات الثغورية النشطة بيولوجيا بشكل أفضل. في هذه الطريقة ، تزرع شتلات Arabidopsis في صفيحة متعددة الآبار تحتوي على وسائط مع وبدون ببتيدات محتملة لمدة 6-7 أيام. بعد ذلك ، يتم تصور بشرة النبتة باستخدام مجهر متحد البؤر. بشكل عام ، لتصور النشاط البيولوجي للببتيدات المحتملة بوضوح في تطور الثغور ، يتم استخدام الأنماط الجينية التي تنتج المزيد و / أو أقل من خلايا سلالة الثغور ، مثل متحولة epf2 ، التي تنتج المزيد من خلايا البشرة ، وخط STOMAGEN-ami ، الذي يمنح كثافة خلايا البشرة المنخفضة2،4،5 ، بالإضافة إلى مكافحة Arabidopsis من النوع البري (Col-0) للمقايسات الحيوية.
بشكل عام ، يمكن استخدام البروتوكولين المعروضين هنا للتقييم السريع والفعال للأنماط الظاهرية المختلفة للبشرة ولفحص الببتيدات الصغيرة والهرمونات التي لها دور في التحكم في أنماط الثغور وتطورها.