$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
تمت الموافقة على جميع التجارب على الحيوانات وإجراءات الرعاية من قبل اللجنة المؤسسية لرعاية واستخدام الحيوان في مركز جوسلين للسكري.
1. فحص sgRNAs الفعالة في الخلايا المستزرعة
ملاحظة: لجعل الفحص فعالا من حيث التكلفة ، قبل تعبئة sgRNAs في جزيئات AAV ، نوصي باختبار sgRNAs مختلفة في الخلايا المستزرعة عبر نظام قائم على lentivirus لتعبير Cas9 / sgRNA (الشكل 1) واختيار sgRNAs التي تعطي أعلى كفاءة ضربة قاضية للتجارب في الجسم الحي .
- تصميم كريسبر-كاس9 sgRNA
- صمم sgRNAs باستخدام أدوات عبر الإنترنت ، مثل أداة تصميم sgRNA الواسعة (https://portals.broadinstitute.org/gppx/crispick/public) 20,21 ، وأداة CRISPOR عبر الإنترنت (http://crispor.tefor.net/)22 ، وغيرها من الأدوات المتاحة.
- أدخل أسماء الجينات أو تسلسلات هدف الحمض النووي في مربع اسم الجين ، وحدد NGG كشكل مجاور للفضاء الأولي (PAM) ل SpCas9 لإنشاء تسلسلات sgRNA المحتملة.
- حدد sgRNAs ذات الكفاءة العالية المتوقعة على الهدف والنشاط المنخفض خارج الهدف. على سبيل المثال ، يوصى باستخدام sgRNAs بدرجة خصوصية لا تقل عن 50 على مخرج CRISPOR. من بين sgRNAs المحددة التي تجتاز المرشح ، اختر تلك ذات درجات الكفاءةالعالية 23.
ملاحظة: بشكل عام ، يتم اختيار ثلاثة أو أربعة sgRNAs لضمان تحديد sgRNAs الفعالة.
- بناء بلازميد كريسبر-كاس9 sgRNA
- توليف أزواج sgRNA oligo التي تشفر 20 تسلسلا مستهدفا من النوكليوتيدات (nt) مع نتوءات (5 'و 3') من موقع تقييد BsmBI (الجدول 1) من خلال منصة تخليق الحمض النووي.
- أزواج oligo الملدنة Ligate مع ناقل lentiCRISPR v2 الخطي BsmBI.
- قم بتحويل منتج الربط إلى سلالة Stbl3 E. coli ، وتأكد من إدخال sgRNA بواسطة تسلسل Sanger DNA باستخدام التمهيدي الأمامي U6.
ملاحظة: انظر إجراء الاستنساخ المفصل في بروتوكول Addgene بعنوان LentiCRISPRv2 و lentiGuide-Puro: CRISPR / Cas9 العدسي ودليل واحد RNA24.
- إنتاج جزيئات الفيروسات العدسية
- حوالي 24 ساعة قبل النقل ، لوحة 7 × 105 خلايا HEK-293 في 4 مل من وسط النمو الكامل في لوحة زراعة الأنسجة 6 سم.
- أضف 15 ميكرولتر من كاشف النقل LT1 إلى 250 ميكرولتر من الوسط الخالي من المصل ، واحتضانه في درجة حرارة الغرفة لمدة 5 دقائق.
- قم بإعداد كوكتيل نقل لكل sgRNA وفقا للجدول 2 في 250 ميكرولتر من الوسط الخالي من المصل. امزج كاشف النقل المحضر في الخطوة 1.3.2 مع كوكتيل البلازميد ، واحتضانه لمدة 20-30 دقيقة في درجة حرارة الغرفة.
- استبدل وسط النمو الكامل ب 3.5 مل من وسط النمو الطازج لخلايا HEK-293 ، ثم أضف خليط كاشف نقل الحمض النووي بالتنقيط إلى خلايا HEK-293 المزروعة في 3.5 مل من وسط النمو الجديد.
- بعد 12-15 ساعة من النقل ، قم بتغيير الوسط لإزالة كاشف النقل ، واستبدله ب 4 مل من وسط النمو الطازج.
- بعد 24 ساعة من الحضانة ، اجمع وسط زراعة الخلايا الذي يحتوي على جزيئات عدسية فيروسية ، وقم بتصفية الوسط من خلال مرشح 0.45 ميكرومتر لإزالة أي خلايا HEK-293. قد يتم تخزين الفيروسات في 4 درجات مئوية لبضعة أيام. للتخزين طويل الأجل ، يجب تجميد الفيروسات عند -80 درجة مئوية.
ملاحظة: اتبع إرشادات السلامة الأحيائية عند تحضير جزيئات الفيروسات العدسية ، واعمل في بيئة (على سبيل المثال ، BL2 +) مناسبة للتعامل مع فيروس العدس. انظر الإجراء المفصل لإعداد فيروس العدس في بروتوكول Addgene بعنوان pLKO.1 - ناقل استنساخ TRC (https://www.addgene.org/protocols/plko/#G).
- عدوى الخلايا preadipocytes البنية وتحديد ضربة قاضية بوساطة sgRNA
- لوحة 1 × 106 خلايا برياديبو بنية خالدة للفأر في 1 مل من وسط طازج يحتوي على 8 ميكروغرام / مل بوليبرين لكل بئر في صفيحة 6 آبار.
ملاحظة: في هذه الدراسة ، تم إنشاء الخلايا البنية الخالدة باستخدام مستضد SV40 T25. يتم استزراع الخلايا البني في DMEM عالي الجلوكوز مع 10٪ FBS.
- أضف 1 مل من محلول الجسيمات الفيروسية العدسية من الخطوة 1.3 لإصابة الخلايا. الحفاظ على بئر واحد غير مصاب من الخلايا بالتوازي لتكون بمثابة التحكم في اختيار المضادات الحيوية.
- التغيير إلى وسط جديد بعد 24 ساعة من الإصابة. أضف المضادات الحيوية المقابلة (على سبيل المثال ، بوروميسين بتركيز نهائي قدره 1 ميكروغرام / مل) إلى الوسط لقتل الخلايا غير المصابة واختيار الخلايا المصابة. التغيير إلى وسط جديد يحتوي على المضاد الحيوي المحدد كل يوم حتى تموت جميع خلايا التحكم غير المصابة.
- جمع البروتين من الخلايا المصابة بالفيروس ، وتحديد كفاءة ضربة قاضية من sgRNAs عن طريق تحليل لطخة الغربية. اتبع إجراء النشاف الغربي المفصل في إسلامي ولوجان26. نظرا لاختلاف معدل الدوران بين البروتينات ، اختبر نقاطا زمنية متعددة (على سبيل المثال ، من اليوم 6 إلى اليوم 12 بعد الإصابة بالفيروس) لمراقبة فقدان إشارة البروتين.
ملاحظة: إذا لم يتوفر جسم مضاد يتعرف على البروتين المشفر بواسطة الجين محل الاهتمام ، فيمكن بدلا من ذلك استخدام تسلسل سانجر لتحديد كفاءة تحرير الجينوم لكل sgRNA. باختصار ، قم بتضخيم الحمض النووي الجينومي باستخدام الاشعال التي تحيط بالمنطقة المستهدفة ب sgRNA لتوليد مضخمات PCR بطول ~ 700 bp. يفضل أن يكون موقع الاستراحة المتوقع ~ 200 نقطة أساس في اتجاه مجرى النهر من موقع بدء التسلسل. بعد ذلك ، قم بإخضاع منتج PCR لتسلسل سانجر. قم بتحليل نتائج التسلسل باستخدام الأدوات عبر الإنترنت ، مثل تتبع Indels بواسطة DEcomposition (TIDE) ، لتحديد تردد indels الصغيرة الناتجة عن كل sgRNA في مجموعة من الخلايا27.
2. بناء البلازميد AAV-sgRNA
ملاحظة: في هذه الخطوة ، يتم استنساخ sgRNAs الفعالة المحددة من الشاشة أعلاه في ناقل pAAV-U6-BbsI-gRNA-CB-EmGFP28 (الشكل 2). في غضون ذلك ، يتم أيضا استنساخ sgRNA غير المستهدف (على سبيل المثال ، TCTGATAGCGTAGGAGTGAT29) الذي لا يتعرف على أي تسلسل في جينوم الفأر في نفس المتجه ليكون بمثابة عنصر تحكم غير محرر.
- خطي pAAV-U6-BbsI-gRNA-CB-EmGFP العمود الفقري باستخدام BbsI ، والذي يولد نتوءات متطابقة مع oligos.
- اربط أزواج oligo الملدنة بناقل pAAV الخطي ، وتأكد من إدخالات sgRNA كما هو موضح في الخطوة 1.2.
ملاحظة: يتم تطبيق إجراء استنساخ lentiCRISPRv2-sgRNA أيضا على بناء البلازميد AAV-sgRNA.
3. تغليف AAV
- قم بتعبئة متجهات AAV التي تم إنشاؤها في القسم 2 في النمط المصلي AAV 8. قم بإعداد AAV عالي العيار وفقا للبروتوكولالسابق 30 ، أو اطلب خدمة تغليف AAV من النوى الفيروسية أو الخدمات التجارية. تمييع عيار الفيروس إلى 1 × 1013 نسخة جينوم / مل.
ملاحظة: يتم تعبئة جينوم AAV2 المعدل الذي يعبر عن sgRNA في النمط المصلي AAV 8. تم اختيار هذا النمط المصلي بسبب كفاءته العالية للأنسجة الدهنية18,31. لمنع الاستجابة المناعية التي تسببها الملوثات ، مثل حطام الخلايا وكميات صغيرة من المكونات المتوسطة ، يلزم AAV فائق النقاء للحقن في الجسم الحي. يمكن تحقيق التنقية الفائقة عن طريق تدرجات اليوديكسانول والطرد المركزيالفائق 30.
4. إعداد الفئران Ucp1 Cre / Cas9
- قم بشراء سلالة الماوس Ucp1-Cre (انظر جدول المواد) التي تعبر عن Cre recombinase تحت سيطرة مروج Ucp1. قم بشراء الفئران ROSA26-floxed STOP-Cas932 متماثلة الزيجوت (انظر جدول المواد) ، حيث يتم تنظيم التعبير عن Cas9 بطريقة تعتمد على Cre recombinase.
- اعبر هذه السلالات لتوليد فئران Ucp1-Cre / Cas9 ، كما هو موضح سابقا16,17. احتفظ بجميع الفئران في غرفة يتم التحكم في درجة حرارتها ورطوبتها (23 درجة مئوية ، رطوبة 30٪) في دورة 12 ساعة من الضوء والظلام (تضيء الأنوار في الساعة 6:30 صباحا ؛ تنطفئ الأنوار في الساعة 6:30 مساء) مع حرية الوصول إلى حمية تشاو والماء.
- عالج الفئران الناتجة Ucp1-Cre / Cas9 باستخدام AAVs التي تحمل إما sgRNA للتحكم أو sgRNA التي تستهدف الجين محل الاهتمام من خلال الطريقة الموضحة أدناه. في هذه الدراسة ، تم استخدام ذكور الفئران Ucp1-Cre / Cas9 البالغة من العمر 12-15 أسبوعا والتي تزن حوالي 30 جم.
5. جراحة لحقن AAV في BAT في الفئران
- تخدير الفئران مع الاستنشاق المستمر من 2.5 ٪ إيزوفلوران للتحريض والصيانة.
- تليين كلتا العينين لمنع الجفاف. بعد ذلك ، أعط المسكنات (بانامين ، 2.5 مجم / كجم من وزن الجسم [BW] ، الحقن تحت الجلد ، انظر جدول المواد) للفئران لتقليل ومنع الألم والضيق بعد العملية الجراحية.
- حلق فرو الفأر في المنطقة بين الكتفين باستخدام ماكينة حلاقة وعقم المنطقة الجراحية بثلاث جولات متناوبة على الأقل من مقشر قائم على اليود أو الكلورهيكسيدين متبوعا بنسبة 70٪ من الإيثانول. ثم ضع ستائر جراحية معقمة حول موقع الشق.
- شق الجلد بين لوح الكتف باستخدام مشرط (الشكل 3A-B) ، ثم قشر الجلد المحلوق لكشف الأنسجة الدهنية على الرقبة باستخدام مقص جراحي (الشكل 3C-D). يعتمد حجم الشق على حجم الجسم ، ولكن بشكل عام ، يجب أن يكون الشق حوالي 2 سم لفضح الأنسجة الدهنية في المنطقة بين الكتفين.
- قطع الأنسجة الدهنية على الحدود بين المنطقة البعيدة من الأنسجة الدهنية والعضلات باستخدام شق واحد (الشكل 3E-F). يجب أن يكون حجم الشق حوالي 1 سم لفتح المدخل فقط لإدخال المقص الجراحي للتقشير الحاد للأنسجة الدهنية.
- باستخدام اليد المهيمنة ، قشر الأنسجة الدهنية بصراحة وعموديا بمقص جراحي لفضح BAT أثناء قرص الأنسجة الدهنية ، بما في ذلك BAT ، باليد غير المهيمنة (الشكل 3G). استخدم وريد Sultzer كمعلم للإشارة إلى موقع BAT الدقيق.
ملاحظة: تم تعريض أفضل التقنيات المتاحة في الشكل 3H بالكامل لغرض عرض توضيحي للصورة. قد يتسبب التشريح الزائد في تلف أعصاب BAT المحيطة. قد يؤدي الاتجاه غير الصحيح للمقص إلى الإضرار بالعضلات المحيطة ووريد سولتزر الذي يستنزف BAT وقد يؤدي إلى نزيف زائد.
- لكل فأر ، قم بحقن 40 ميكرولتر من AAV ببطء في كل من فصوص BAT (20 ميكرولتر لكل فص واحد من BAT) باستخدام إبرة حادة (32 جم ، انظر جدول المواد) متصلة بحقنة هاملتون (100 ميكرولتر ، انظر جدول المواد ؛ 100 ميكرولتر ، انظر جدول المواد ؛ الشكل 3I). تحقق من نجاح الحقن كما هو موضح في عدم وجود تسرب من موقع الحقن أثناء إعطاء AAV.
ملاحظة: تم الكشف عن أفضل التقنيات المتاحة في الشكل 3I بالكامل لغرض عرض الصورة. يتم تحديد حجم محلول AAV الذي سيتم إعطاؤه في فص BAT حسب حجم BAT للماوس المستلم. لقد قررنا أن 20 ميكرولتر من محلول AAV مناسب لفص BAT واحد يزن حوالي 0.05 جم في ماوس C57BL6 / J عادي يزن 30 جم. إذا لزم الأمر ، قد يلزم تركيز المحلول الفيروسي لتحقيق الحجم المطلوب.
- تأكد من عدم وجود نزيف من BAT المحقونة أو الأنسجة المحيطة. اضغط على شاش منقوع بمحلول بيروكسيد الهيدروجين (انظر جدول المواد) على موقع نزيف للإرقاء.
- ضع الأنسجة الدهنية المكشوفة مرة أخرى إلى وضعها الطبيعي. قم بخياطة حافة الأنسجة الدهنية والعضلات باستخدام خيط حيدة قابل للامتصاص 5-0 (الشكل 3J). خياطة الجلد المفتوح مع 5-0 خيوط مضفر مغلفة vicryl غير مصبوغة (الشكل 3K-L).
ملاحظة: يصف الشكل 4 خطوات خياطة الأنسجة الدهنية والعضلات المقشرة.
- الحفاظ على الحيوانات على وسادة التدفئة بعد الجراحة حتى الشفاء التام. تزويد الحيوانات بإمكانية الوصول إلى الطعام والماء والفراش الوافر للتعشيش. راقبهم بانتظام بحثا عن أي علامات ضيق أو مرض لمدة 7 أيام من الشفاء قبل بداية التجربة.
- تأكد من كفاءة حذف الجينات المستهدفة عن طريق تحليل اللطخة الغربية في BAT المقطعة من الفئران ، كما هو الحال في Sugimoto et al.16.