هنا ، نقدم البروتوكول الأول للتسلل الفراغي الموضعي للدراسات في الجسم الحي للتحول الوراثي للنباتات كبيرة الحجم. باستخدام هذه المنهجية ، حققنا لأول مرة التحول العابر للكاكاو بوساطة Agrobacterium في النبات.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
هنا ، نقدم البروتوكول الأول للتسلل الفراغي الموضعي للدراسات في الجسم الحي للتحول الوراثي للنباتات كبيرة الحجم. باستخدام هذه المنهجية ، حققنا لأول مرة التحول العابر للكاكاو بوساطة Agrobacterium في النبات.
عابر في تحول النبات هو بديل سريع وفعال من حيث التكلفة للتحول الوراثي للنبات. تعتمد معظم بروتوكولات التحول في النبات على استخدام التحول بوساطة Agrobacterium. ومع ذلك ، فإن البروتوكولات المستخدمة حاليا موحدة للنباتات الصغيرة الحجم بسبب القيود المادية والاقتصادية لإخضاع النباتات كبيرة الحجم للمعالجة الفراغية. يقدم هذا العمل بروتوكولا فعالا للتسلل الزراعي الموضعي القائم على الفراغ المخصص للنباتات كبيرة الحجم. لتقييم فعالية الطريقة المقترحة ، اختبرنا استخدامها في نباتات الكاكاو ، وهي أنواع نباتية استوائية متمردة على التحول الجيني. سمح بروتوكولنا بتطبيق ما يصل إلى 0.07 ميجا باسكال فراغ ، مع التكرار ، على جزء جوي موضعي من أوراق الكاكاو ، مما يجعل من الممكن إجبار تسلل Agrobacterium إلى المساحات بين الخلايا للأوراق المرفقة. نتيجة لذلك ، حققنا عابر بوساطة Agrobacterium في تحويل النبات لأوراق الكاكاو المرفقة التي تعبر عن نظام مراسل RUBY. هذا هو أيضا أول Agrobacterium بوساطة في تحول النبات العابر للكاكاو. سيسمح هذا البروتوكول بتطبيق طريقة الترشيح الزراعي القائمة على الفراغ على الأنواع النباتية الأخرى ذات القيود المماثلة في الحجم ويفتح الباب أمام توصيف الجينات في النبات في الأنواع الخشبية الكبيرة الحجم المتمردة.
تعد طرق التحول الوراثي للنبات ضرورية لاختبار الوظائف البيولوجية للجينات وهي مفيدة بشكل خاص اليوم نظرا للعدد الكبير من الجينات غير المميزة المتوقعة في عصر ما بعد الجينوم1. يمكن استخدام هذه الطرق للحصول على خطوط محولة بالكامل أو للتعبير عن الجينات بشكل عابر. يحدث التحول المستقر عندما يصبح الحمض النووي الأجنبي الذي تناوله المضيف مدمجا بشكل كامل ولا رجعة فيه في جينوم المضيف ، ويتم نقل التعديلات الجينية إلى الأجيال اللاحقة. يحدث التعبير العابر ، المعروف باسم التحول العابر ، من النسخ المتعددة من T-DNA المنقولة بواسطة Agrobacterium إلى الخلية ، والتي لم يتم دمجها في الجينوم المضيف ، ويبلغ ذروته بعد 2-4 أيام من الإصابة2.
تجدر الإشارة إلى أن مقايسات التعبير العابر غالبا ما تكون كافية للتوصيف الوظيفي للجينات ويمكن أن تقدم العديد من المزايا على التحول المستقر. على سبيل المثال ، لا يتطلب التحول العابر إجراءات تجديد قائمة على زراعة الأنسجة. ميزة أخرى هي أنه متوافق مع التحليل الوظيفي للجينات في النبات ، وتوجد العديد من الأمثلة الناجحة للبروتوكولات الموحدة جيدا لأنواع النباتات النموذجية ، مثل Arabidopsis thaliana3 و Nicotiana benthamiana4 ، ولكنها لا تزال محدودة في الأنواع غير النموذجية5.
يعتمد تطوير المقايسات العابرة على توافر طرق فعالة لنقل الجينات. لهذا ، تعتمد الأساليب الأكثر شيوعا على تسلل Agrobacterium ، والذي يستفيد من قدرة Agrobacterium الفريدة على نقل الحمض النووي إلى الخلايا النباتية6. أداة أخرى مفيدة لهذه التحليلات هي استخدام جينات المراسل ، مثل البروتينات الفلورية الخضراء (GFP) ، β-glucuronidase (GUS) ، luciferase ، أو RUBY ، وكلها تستخدم لتتبع أحداث التحول. من بين أنظمة المراسلين هذه ، يعد RUBY حاليا أسهل تصور ويعتمد على تحويل التيروزين إلى betalains من خلال ثلاثة تفاعلات خطوة إنزيمية. على عكس أنظمة المراسلة الأخرى ، يمكن ملاحظة betalains الناتجة بسهولة كأصباغ ذات ألوان زاهية على الأنسجة النباتية المحولة دون الحاجة إلى معدات متطورة أو متفاعلات إضافية7.
عند التسلل إلى تعليق Agrobacterium في الفضاء بين الخلايا لميزوفيل الأوراق ، فإن الخطوة الأكثر أهمية للعدوى الزراعية الناجحة هي التغلب على الحاجز المادي الذي تفرضه بشرة البشرة للأوراق8. بينما بالنسبة لبعض النباتات ، فإن تدرج الضغط الناتج عن حقنة بدون إبرة (حقنة تسلل زراعي) يكفي لتسلل زراعي فعال ، كما يحدث في Nicotiana benthamiana9 ، قد تتطلب الأنواع النباتية الأخرى تدرجا أكبر للضغط مثل الذي تم إنشاؤه بمساعدة مضخات التفريغ10. في العمليات بمساعدة الفراغ ، يحدث التسلل الزراعي في خطوتين. في الأول ، يعمل الفراغ على إخضاع المادة النباتية لضغط منخفض ، مما يجبر على إطلاق الغازات من المساحات الهوائية المتوسطة من خلال الثغور والجروح. ثم ، خلال مرحلة إعادة الضغط ، يتسلل تعليق Agrobacterium إلى المساحات بين الخلايا عبر الثغور والجروح11.
بالمقارنة مع تسلل المحاقن ، يسمح التسلل الفراغي بتكرار استخدام أعلى وقابلية للتكرار والقدرة على التحكم في الضغط والمدة في كل مرحلة من مراحل عملية التسلل10. في أوراق الأنواع النباتية المختلفة مثل السبانخ (Spinacia oleracea)12 ، الفاوانيا (نبات خشبي معمر) (Paeonia ostii)13 ، واللوبيا (Vigna unguiculata)14 ، حققت بروتوكولات التسلل الزراعي الفراغي معدل تسلل أعمق من تسلل المحاقن. وبالمثل ، في الطماطم (Lycopersicon esculentum)15 ، والجربرة (Gerbera hybrida)16 ، أنتج التسلل الزراعي الفراغي إسكاتا جينيا أقوى وأكثر اتساقا من تسلل المحاقن. ميزة إضافية للتسلل الفراغي هي انخفاض الاعتماد على النمط الوراثي ، مقارنة بتسلل المحاقن ، والذي لوحظ مؤخرا في ثلاثة أنواع من الحمضيات (Fortunella obovata ، Citrus limon ، و C. grandis)17. ومع ذلك ، عند محاولة تطبيق التسلل الزراعي الفراغي على النباتات الكبيرة جدا بحيث لا يمكن وضعها في المجففات ، يمكن أن يكون حجم غرف التفريغ قيدا ، كما يحدث عادة مع النباتات الخشبية الاستوائية.
أدناه ، نصف بروتوكولا يتغلب على القيود المكانية لغرف التفريغ ، ويختبر فائدته في التحول العابر لأوراق الكاكاو. نقدم أول طريقة تسلل فراغ موضعية للكاكاو ، والتي لا تتطلب معدات إضافية وحتى تسمح باستخدام نفس المجففات المختبرية المستخدمة في تسلل المصنع بأكمله ، ولكن مع تكيف بسيط يسمح بالوصول إلى جزء من النبات داخل غرفة التفريغ ، مما يسمح باستخدامه في مراحل مختلفة من تطوير المصنع. لاختبار فائدة طريقة التسلل الفراغي الموضعية المقترحة ، اخترنا الكاكاو كوكيل لأنواع النباتات الاستوائية ذات الأوراق الكبيرة التي يصعب تحويلها. باستخدام طريقة التسلل الموضعية هذه ، أبلغنا مؤخرا عن أول تعبير عابر في النبات في الأفوكادو عن طريق التسلل الفراغي بوساطة Agrobacterium مع ظروف تم تحسينها مسبقا للأوراق المنفصلة18 ، وهنا نبلغ عن أول تعبير عابر في النبات في الكاكاو.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. ثقافة أجروباكتريوم توميفاسينس
2. اختيار النبات
3. إعداد غرفة فراغ
4. تسلل الفراغ
5. حضانة الأوراق المتسللة

الشكل 1: أوراق الكاكاو مراحل النمو. (أ-ه) مراحل النمو25. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: تكوين غرفة الفراغ ومكوناتها. غرفة التفريغ عبارة عن مجفف متصل بمقياس فراغ. يتم قطع الحشية / الحلقة O بحيث يكون لها فتحة حيث سيتم وضع الفرع. (أ) مقياس الفراغ ، (ب) الغطاء ، (ج) الحشية / الحلقة O ، (د) صمام الضغط ، (ه) المجفف ، (و) الخرطوم. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3: في نظام التسلل الزراعي فراغ بلانتا . لتجنب خسائر الفراغ أثناء عملية التسلل ، من الأهمية بمكان تأمين الفرع بالمجفف والحشية / الحلقة O بمادة انطباع السيليكون. (أ) نبات الكاكاو، (ب) غرفة التفريغ، (ج) مادة انطباع السيليكون، (د) الأوراق المغمورة على معلق Agrobacterium ، (ه) مضخة التفريغ. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يقدم هذا البروتوكول طريقة فعالة للتسلل الزراعي للنباتات الخشبية كبيرة الحجم. باستخدام هذا البروتوكول ، تمكنا من تحقيق ضغط فراغ يبلغ -0.07 ميجا باسكال ، مما أدى إلى تسلل فعال وموضعي لأوراق الكاكاو. في الشكل 4 ، نلاحظ عملية إعداد نظام التسلل ، وفي الشكل 5 ، التكوين النهائي.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
في هذا العمل ، قدمنا بروتوكول تسلل زراعي فعال ومنخفض التكلفة للتحول العابر للنباتات الخشبية في النبات ، باستخدام نباتات الكاكاو كمثال. بالنظر إلى القيد المعروف الذي تمثله بشرة الأوراق لتحويل الأنسجة النباتية ، ركزنا على تطوير استراتيجية لتسهيل التسلل الزراعي عن طريق الفراغ في النباتات الخشبية ، والتي عادة ما تكون متمردة على هذا الإجراء.
كان ضغط الفراغ الذي تم تحقيقه داخل غرفة التفريغ ممكنا فقط بسبب الختم الفعال وملء الفجوات الصغيرة التي تم إنشاؤها بين المجفف ، وفرع الشجرة ، والحشية / ...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ليس لدى المؤلفين أي تضارب في المصالح للإعلان.
نشكر ليك. خيسوس فوينتيس غونزاليس ونستور إيفان روبلز أوليفاريس لمساعدتهما في تصوير لقطات الفيديو. نعترف بالهدايا السخية التي قدمتها الدكتورة أنطونيا جوتيريز مورا من CIATEJ (نباتات الكاكاو Theobroma ). كما نشكر CIATEJ و Laboratorio Nacional PlanTECC ، المكسيك ، على دعم المرافق. 1135375 وأجرى المعهد دراسات ماجستير بتمويل من المجلس الوطني للإنسانيات والعلوم والتكنولوجيا في المكسيك (CONAHCYT). تعترف RUL بالدعم المقدم من المجلس الحكومي للعلوم والتكنولوجيا في خاليسكو (COECYTJAL) ، وأمانة الابتكار العلمي والتكنولوجيا (SICYT) ، خاليسكو ، المكسيك (منحة 7270-2018).
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| 35S: RUBY< / em> البلازميد | Addgene | 160908 | http://n2t.net/addgene:160908 ; RRID: Addgene_160908 |
| 1 مم كوفيت التثقيب الكهربائي | Thermo Fisher Scientific ؛ | FB101 | Fisherbrand مجفف التجميد الكهربائي بالإضافة |
| مجفف | بيل آرت SP SCIENCEWARWE | F42400-2121 | |
| مجفف التجميد | LABCONCO | 700402040 | |
| K2< / sub>HPO4< / sub> | Sigma Aldrich | P8281-500G | لمتوسط YM أضف 0.38 جم / لتر |
| السليم للبكتيريا الزراعية المختصة | بالكهرباء الولايات المتحدة الأمريكية | 1285-12 | https://intactgenomics.com/product/lba4404-electrocompetent-agrobacterium/ |
| Mannitol | Sigma Aldrich | 63560-250G-F | بالنسبة لمتوسط YM ، أضف 10 جم / لتر |
| MES | Sigma Aldrich | PHG0003 | (ل LB و YM ووسط إعادة التعليق) أضف 1.95 جم / لتر (10 ملم) MgCl |
| 2< / sub> | Sigma Aldrich | M8266 | لمتوسط إعادة التعليق أضف 0.952 جم / لتر (10 ملم) |
| MgSO4& middot; 7H2< / sub>0 | Sigma Aldrich | 63138-1KG | لمتوسط YM أضف 0.204 جم / لتر |
| جهاز التثقيب الكهربائي MicroPulser | Biorad ؛ | 165-2100 | |
| كلوريد الصوديوم | كارال | 60552 | للرطل المتوسط أضف 5 جم / لتر ؛ بالنسبة لمتوسط YM ، أضف 0.1 جم / لتر |
| NanoDrop One Microvolume UV-Vis Spectrophotometer | Thermo Fisher Scientific ؛ | 13-400-518 | |
| رئيس سيليكون انطباع المواد | كولتين | 60019938 | |
| ريفامبيسين ؛ | Gold-Bio | R-120-1 | (100 مجم / مل) |
| مسدس مادة انطباع السيليكون | Andent | TBT06 | |
| Spectinomycin | Gold-Bio | S-140-SL10 | (100 مجم / مل) |
| ستربتومايسين | جولد-بيو | S-150-SL10 | (100 مجم / مل) |
| هضم إنزيمي التريبتون من الكازين | سيجما ألدريتش | 95039-1KG-F | لمتوسط LB أضف 10 جم / لتر |
| خميرة استخراج | MCD LAB | 9031 | لمتوسط LB أضف 5 جم / لتر ؛ بالنسبة لمتوسط YM ، أضف 0.4 جم / لتر |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.