$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
نماذج الثقافة العصبية AD: استخدمت هذه الدراسة الخلايا العصبية المشتقة من خلايا ReN السلفية العصبية البشرية [ReN الساذجة (Millipore)] أو خلايا ReN التي تعبر عن طفرات AD العائلية (fAD) في جين بروتين سلائف الأميلويد (APP) (APPSwe / Lon) ، خلايا ReN GA. يلخص نظام الثقافة ثلاثي الأبعاد (3D) ReN-GA أمراض مرض الزهايمر ، وهي التشابك الليفي العصبي (NFTs) الذي يحركها القلة Aβ 23،24. خلايا ReN الساذجة متاحة تجاريا. تم الحصول على خطوط ReN GA من الدكتور دو واي كيم ، أستاذ مشارك ، مستشفى ماساتشوستس العام (MGH) 23،24،25.
بلازميدات التعبير: AKP1 (34-63) وتسلسل استهداف ER لبروتينات Ubc 6 (283-303) المرتبطة مباشرة ب RFP (Mito-RFP-ER يشار إليها باسم MAM 1X) أو تحتوي على رابط 9 أحماض أمينية (Mito-9X-RFP-ER يشار إليه باسم MAM 9X) مصمم لتثبيت MAMs من 6 نانومتر ± 1 نانومتر أو 24 نانومتر + 3 نانومتر عرض الفجوة ، على التوالي15،26 (الشكل 1 أ).
1. التثقيب الكهربائي
- نقل الخلايا بمثبتات MAM (1-2 ساعة)
ملاحظة: اتبع البروتوكول الموصوف من قبل الشركة المصنعة لمجموعة nucleofector (جدول المواد). قبل البدء ، قم بإعداد أطباق ثقافة ذات قاع زجاجي من 6 آبار مغطاة مسبقا ب DMEM / F12 تحتوي على 1٪ Matrigel (يشار إليها من الآن فصاعدا باسم مصفوفة الغشاء القاعدي [BMM]). استخدم 2 مل من BMM لتغليف كل بئر. احتضنها لمدة ساعة واحدة على الأقل عند 37 درجة مئوية. يجب تبريد جميع BMM والوسائط وأطراف الماصات والماصات مسبقا قبل الخلط لمنع BMM من التصلب.
- استنشق خليط BMM. استبدل ب 2 مل من درجة حرارة الغرفة (RT) DMEM / F12 في كل بئر.
- اجمع بين Nucleofector مع الملحق 1 بنسبة 4.5: 1 (82 ميكرولتر: 18 ميكرولتر من نسبة Nucleofector / Supplement ل 100 ميكرولتر من المحلول). لكل تعداء مرغوب فيه ، هناك حاجة إلى 100 ميكرولتر من Nucleofector.
- الحمض النووي الدوامة. ثم أضف 1-5 ميكروغرام من الحمض النووي (لكل معالجة) في أنابيب الطرد المركزي الدقيقة سعة 1 مل لكل تعداد.
- استخدم أكوستاز لحصاد صفيحة من خلايا ReN-GA السليمة.
ملاحظة: خلايا الصفائح في وسائط التمدد (الجدول 1) في أطباق زراعة الأنسجة مقاس 100 مم وانتظر حتى يصل الالتقاء إلى 70-80٪.
- استنشق الوسائط الموجودة واغسلها مرة واحدة باستخدام 10 مل من PBS.
- أضف 1 مل من أكوتاز مباشرة إلى الخلايا واحتضنه لمدة 5-10 دقائق عند 37 درجة مئوية.
- قم بإزاحة الخلايا من الطبق عن طريق النقر برفق على جانب الطبق. تحقق تحت المجهر للتأكد من أن الخلايا مرتخة وتتدفق بحرية.
- قم بتحييد أكوتاز ب 10 مل من DMEM / F12 وانقله إلى أنبوب نظيف سعة 15 مل.
- جهاز الطرد المركزي العدد المطلوب من الخلايا عند 274 × جم لمدة 5 دقائق وشفط المادة الطافية لإزالة الخلايا الميتة. ثم, أعد تعليق الحبيبات في 10 مل من DMEM / F12.
- عد الخلايا لتحديد الكثافة.
ملاحظة: في هذه الدراسة ، تم استخدام عداد خلوي آلي لحساب عدد الخلايا. لكل التثقيب الكهربائي ، هناك حاجة إلى 3-5 × 106 خلايا (على سبيل المثال ، تتطلب 5 علاجات 15-25 × 106 خلايا).
- خذ 10 ميكرولتر من الخلايا العالقة وأضفها إلى الجانب A من غرفة عد الخلايا. ثم أضف 10 ميكرولتر إلى الجانب B.
ملاحظة: أضف تعليق الخلية عن طريق تحريك الماصة بزاوية إلى الجانب. تجنب الفقاعات من خلال عدم تجاوز المحطة الأولى على مكبس الماصة.
- خذ غرفة العد المملوءة إلى عداد الخلايا وأدخل الجانب A في الفتحة الرئيسية في المقدمة.
- بعد الضغط على القياس ، لاحظ عدد الخلايا لكل مل.
- أخرج الغرفة ، واقلبها إلى الجانب B ، وكرر الخطوات 1.1.5.2-1.1.5.3.
- اجمع هذين الرقمين معا ، ثم اقسم على 4 (إذا لم يكن باستخدام Trypan Blue) ، ثم اضرب الرقم في المليلتر من السائل الذي تم تعليق الخلايا فيه للحصول على العدد الإجمالي للخلايا في المعلق.
- جهاز الطرد المركزي العدد المطلوب من الخلايا عند 274 × جم لمدة 5 دقائق وشفط المادة الطافية.
- أعد تعليق الحبيبات في 100 ميكرولتر من مزيج Nucleofector لكل تثقيب كهربائي. (على سبيل المثال ، 500 ميكرولتر ل 5 علاجات).
ملاحظة: يمكن أن يؤدي ترك الخلايا في محلول Nucleofector لمدة تزيد عن 15 دقيقة إلى تقليل قابلية الخلية للحياة والفعالية الإجمالية.
- أضف 100 ميكرولتر من معلق الخلية إلى أحد الأنابيب التي تحتوي على الحمض النووي واخلطها عن طريق سحب العينات.
- انقل خليط الحمض النووي إلى كوفيت كهربائي وأغلقه بالغطاء المرفق. لتجنب تكوين فقاعات، قم بتوجيه الكوفيت لأسفل وقم بتدوير الماصة ببطء.
- حدد برنامج Nucleofector المناسب للجهاز المستخدم. بالنسبة للجهاز المستخدم في هذه الدراسة ، استخدم البرنامج A-033 للتعداد. للتحسين ، جرب جميع برامج Nucleofector الخمسة لتحديد الأنسب لكل نوع من أنواع الخلايا.
ملاحظة: تأكيد التثقيب الكهربائي الناجح هو رغوة مرئية في الجزء العلوي من الخليط.
- على الفور، باستخدام الماصات المعقمة المرفقة، أضف ~ 500 ميكرولتر من DMEM من الصفيحة المكونة من 6 آبار مملوءة مسبقا إلى الكوفيت. تخلط برفق مرة واحدة ثم تنقل الخلايا الكهربائية والوسيط إلى البئر المقابل.
ملاحظة: بعد التثقيب الكهربائي، تكون الخلايا حساسة للغاية، لذا من الضروري نقل الوسائط بسرعة وسحب العينة بعناية.
- كرر الخطوات 1.1.8-1.1.11 لجميع علاجات الحمض النووي المتبقية.
- احتضان الخلايا عند 37 درجة مئوية في وجود ثاني أكسيد الكربون2 (5٪) بين عشية وضحاها.
- في اليوم التالي ، تبادل الوسائط مع وسائط التمايز الجديدة (الجدول 2) واسمح للخلايا بالتمايز لمدة 10 أيام. كل 2-3 أيام ، استبدلها بوسائط جديدة.
2. تصوير الخلايا الحية
- تحضير الخلايا للفحص المجهري للخلايا الحية (30 دقيقة)
- تحضير غرفة الخلية الحية (قبل نقل الخلايا إلى الغرفة)
- تأكد منتوصيل خزان ثاني أكسيد الكربون 2 والمرطب بالغرفة ، وفتح الصمامات ، وملء الخزانات.
- اضبط درجة الحرارة على 37 درجة مئوية ، وثاني أكسيد الكربون2 إلى 5٪ ، والرطوبة على 95٪. (قد يستغرق هذا بعض الوقت حتى تتوازن المستويات).
- ضع صفيحة من 6 آبار تحتوي على خلايا في الغرفة واضبط تركيز المجهر حتى تصبح الخلايا مرئية.
- قم بتشغيل الليزر (جدول المواد).
- لالتقاط إشارة RFP ، قم بإثارة الفلوروفور باستخدام ليزر 594 نانومتر واستخدم انبعاث 570-640 نانومتر. بالنسبة إلى GFP ، استخدم ليزر 488 نانومتر للإثارة وانبعاث 510-540 نانومتر.
- باستخدام مرشح الفلورسنت المدمج ، اضبط شدة الإشارة حتى تتبدد إشارة الخلفية (يجب أن تكون سوداء صلبة تقريبا).
- التقاط فيديو مباشر للمحاور (10 ساعات - 15 ساعة في المجموع)
ملاحظة: تم استخدام مجهر متحد البؤر المقلوب من نيكون C2 Eclipse Ti2 لالتقاط صور الفلورسنت باستخدام برنامج NIS Element AR. استخدم تكبيرا بمعدل 60 ضعفا بدقة 512 بكسل ، والتقاط مقاطع فيديو بمعدل 1 إطار في الثانية لمدة 3 دقائق أنظف من التصوير الوغرافي أنظف.
- ابحث عن خلية تعبر عن أجهزة الاستشعار الحيوية RFP. قم بتصدير صورة للخلية للرجوع إليها لاحقا قبل التقاط مقطع فيديو.
- قم بقص منطقة المسح لتلائم المحور العصبي. يقلل استخدام منطقة مسح أصغر من وقت معالجة المجهر ويجعل إنشاء التصوير الكيموغرافي أسهل بكثير.
- قم بإيقاف تشغيل جميع أجهزة الليزر لمساعدة البرنامج على العمل بسلاسة أكبر. يرجى ملاحظة أنه عند تشغيل البرنامج مع جميع أشعة الليزر نشطة ، لا يتم التقاط جميع الإطارات.
ملاحظة: إشارة الفلورسنت الحمراء من سوما أكثر إشراقا مما هي عليه في المحور العصبي. لذلك ، يتم استبعاد soma لزيادة شدة الإشارة الإجمالية في المحور العصبي. انتقل إلى علامة التبويب قياس الوقت .
- اضبط الفاصل الزمني على 1 إطار في الثانية واضبط الوقت الإجمالي على 181 ثانية.
- انقر فوق تشغيل.
- احفظ هذا الملف كملف .nds (مسمى بشكل صحيح) وكرر العملية ~ 10 مرات لكل مثبتات MAM (MAM 1X أو MAM 9X).
ملاحظة: أنتجت قوة الليزر أحيانا تأثير تبييض ملحوظ على إشارة RFP إذا تم مسحها ضوئيا لفترة طويلة. من المهم مراعاة العمل بسرعة لالتقاط مقاطع الفيديو.
3. المعالجة اللاحقة (7 أيام)
ملاحظة: لتحليل النقل وإنشاء أجهزة الكيموغراف ، تم استخدام وحدات ماكرو Fiji ImageJ. تم تصنيف الحويصلات التي تحركت أقل من 0.1 مم / ثانية على أنها ثابتة. تم حساب تواتر حركة الجسيمات بقسمة عدد الجسيمات التي تتحرك في اتجاه معين (الأمامية ، الرجعية) أو غير المتحركة (الثابتة) على العدد الإجمالي للجسيمات التي تم تحليلها في التصوير الحاربي. تم حساب الوقت الذي تقضيه كل حويصلة في التوقف مؤقتا أو التحرك عن طريق حساب متوسط النسبة المئوية للوقت الذي تقضيه في كل حالة لجميع الحويصلات في كل خلية عصبية تم تحليلها. تم حساب توزيع التردد للسرعة وطول التشغيل باستخدام حويصلات متحركة فقط لكل حالة تجريبية. تم إجراء التحليل على المسالك المحورية 100 مم لمدة 3 دقائق.
- إنشاء مخطط حركي
- افتح ملف .nds في Fiji ImageJ.
- انتقل إلى علامة التبويب صورة وانقر فوق خصائص. سجل نسبة البكسل إلى الميكرون. هذا ضروري للحساب لاحقا.
- انقر فوق ملف > حفظ باسم > Tiff لحفظ الملف ك.tiff في مجلده (سيقوم الماكرو تلقائيا بحفظ كل شيء تم إنشاؤه في هذا المجلد).
- اسحب ماكرو Kymo إلى ImageJ. يتم توفير الرمز في ملف الترميز التكميلي 1. انقر فوق تشغيل.
- لا تضغط على "موافق". قم بالتبديل إلى نافذة MAX_raw. انقر يدويا بزر الماوس الأيسر على طول المحور العصبي وانقر نقرا مزدوجا لإنهاء التتبع.
ملاحظة: تأكد من تتبع المحور العصبي من soma حتى محطة المحور العصبي. بهذه الطريقة ستكون حسابات المقدمات والارتدادية صحيحة.
- اضغط على الأمر T أو إضافة على مدير عائد الاستثمار.
- الآن انقر فوق موافق. سيتم إنشاء جهاز حركي في المجلد الذي تم إنشاؤه مسبقا. (المحور X هو طول المحور العصبي بالميكرون ، والمحور Y هو الوقت بالثواني).
- تتبع الكيموغراف
- اسحب الطابع الاحترافي إلى Fiji Image J (يجب وضعه تلقائيا في المجلد الذي تم إنشاؤه مسبقا).
- اسحب ماكرو المسار إلى الصورة J.
- في المطالبة التالية، انقر فوق موافق. إذا كنت تستأنف العمل من قبل، فأدخل نقطة الرقم للمتابعة منها ثم اضغط على موافق.
- باستخدام أداة Rectangle في لوحة Select ، حدد منطقة بالقرب من منتصف الكيموغراف يبلغ ارتفاعها 60 بكسل وعرضها دائما 100 ميكرومتر. للقيام بذلك ، اقسم 100 على نسبة البكسل إلى الميكرو التي تم تسجيلها في الخطوة 3.1.2.
- بعد تحديد منطقة، اضغط على Ctrl T لإضافة i t إلى عائد الاستثمار وحفظ عائد الاستثمار في المجلد الذي يتم العمل فيه (اضغط على المزيد في قائمة ROI ثم Save).
ملاحظة: سيؤدي عكس المنطقة المحددة بالضغط على Ctrl + Shift + I إلى تسهيل التتبع.
- لتتبع حركة حويصلة فردية ، اضغط مع الاستمرار على Ctrl أثناء النقر بزر الماوس الأيسر من أعلى إلى أسفل.
- للقيام بذلك ، اضغط مع الاستمرار على Ctrl أثناء النقر بزر الماوس الأيمن وستظهر نافذة توضح مكان تتبع المحاور. إذا كان هذا يبدو جيدا، فاضغط على موافق.
- للمتابعة وتحديد حويصلة أخرى، انقر فوق نعم وكرر العملية من الخطوات 3.2.6-3.2.8. بمجرد تتبع كل حويصلة مرئية ، اضغط على لا. سيؤدي هذا تلقائيا إلى حفظ التراكب المتعقب يدويا في نفس المجلد.
- قياس بيانات التصوير الاحترافي
- قم بإنشاء مجلد جديد. اسحب كل ملف نصي تم إنشاؤه إلى المجلد.
- افتح ملف kymograph وسجل الأبعاد.
- اسحب ماكرو القياس إلى الصورة J.
- أدخل نسبة الميكرون إلى البكسل المسجلة مسبقا في PixelScale.
- قم بتغيير الحد الأقصى للسرعة إلى 0.1. (تعتبر الحويصلات التي تتحرك تحت هذا الحد ثابتة).
- أدخل أبعاد الكيموغراف المسجلة مسبقا. سيتم إنشاء ملف الملخص تلقائيا في المجلد النصي الذي تم إنشاؤه. سيحتوي كل تعبئة ملخص على ٪الوقت المقطوعة، والسرعة الإجمالية (ميكرومتر/ثانية)، وإجمالي المسافة، ومتوسط المقطع المقطوعة، وعدد مرات التوقف، وعدد المرات التي تم عكسها. يتم توفير رمز إنشاء بيانات التصوير الحركي وتتبعها وقياسها كملف تشفير تكميلي 1.