يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية

مقالة منهجية

استخراج الحمض النووي والمقارنة بين عينات الذباب الميت القديمة والطازجة

1.4K مشاهدة

⸱

DOI:

10.3791/66737

⸱

مايو 3, 2024

 ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  , 

* These authors contributed equally

في هذه المقالة

إشعار تصحيح

Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice

ملخص

توضح هذه المقالة بروتوكولا لاستخراج الحمض النووي للذبابة الميتة حديثا وقديما باستخدام مجموعة استخراج الحمض النووي الشائعة المعدلة.

الملخص

تم اختيار ما مجموعه خمس عينات من عينات Chrysomya megacephala - ثلاث عينات جديدة ، وعينة واحدة مخزنة في الكحول لمدة 2 سنوات ، وعينة واحدة مخزنة في تخزين جاف مختوم لمدة 2 سنوات محمية من الضوء فقط - للتحقيق فيما إذا كانت مجموعة استخراج الحمض النووي في الدم يمكن أن تستخرج الحمض النووي من الذباب الميت ولتحديد ما إذا كان الكحول يمكن أن يطيل الحفاظ على الحمض النووي للذباب الميت. أولا ، تم استخدام مجموعة استخراج الحمض النووي في الدم لاستخراج الحمض النووي من أنسجة الصدر. بعد ذلك ، تم فحص نقاء الحمض النووي وتركيزه باستخدام قارئ الصفائح الدقيقة ومقياس الفلور. أخيرا ، تم إجراء تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل والرحلان الكهربائي للحمض النووي المستخرج باستخدام بادئات خاصة بالذباب الميتوفيلي الموجودة في تسلسل جين CO I للميتوكوندريا. أظهرت النتائج أن نقاء الحمض النووي لجميع العينات كان أكبر من 2.0. لوحظ أن تركيز الحمض النووي بالترتيب التالي: عينات جديدة > عينات قديمة محفوظة بالكحول > عينات قديمة غير معالجة. كان لجميع العينات نطاقات كهربائية محددة بعد تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل. في الختام ، يمكن استخدام مجموعة استخراج الحمض النووي للدم لاستخراج الحمض النووي من الذباب الميت بنجاح ، وتركيز الحمض النووي لعينات الذباب الطازجة أكبر من تركيز عينات الذباب القديمة. يمكن تخزين الذباب في الكحول لفترة طويلة.

المقدمة

لطالما كان الاستدلال على وقت الوفاة أحد القضايا الرئيسية والصعبة التي يجب حلها في الممارسة القضائية. في ممارسة علم الطب الشرعي ، بالنسبة للقضية الجنائية ، يلعب تحديد فترة ما بعد الوفاة دورا حاسما في استنتاج وقت الجريمة ، وحبس المشتبه به ، وتضييق نطاق التحقيق. تعتمد الطرق التقليدية للاستدلال على وقت الوفاة في المقام الأول على ظواهر ما بعد الوفاة المبكرة ، والتي لا يمكن استخدامها بشكل عام إلا لاستنتاج وقت الوفاة في غضون 24 ساعة. ومع ذلك ، لا يمكن تحديد وقت الوفاة الطويل من خلال ظواهر ما بعد الوفاة. من المسلم به الآن بشكل عام في مجتمع علوم الطب الشرعي أن علم الحشرات الشرعي لديه القدرة على أن يكون وسيلة فعالة للاستدلال على وقت أطول من الوفاة.

س....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

ملاحظة: تم استخدام ما مجموعه خمس عينات من عينات C. megacephala في هذا البروتوكول - ثلاث عينات طازجة (طازجة 1 ، طازجة 2 ، وطازجة 3) ، وعينة واحدة مخزنة في الكحول لمدة عامين (قديم 1) ، وعينة واحدة مخزنة في تخزين جاف مغلق لمدة عامين محميين من الضوء فقط (قديم 2). يجب تسمية العينات وفقا للمتطلبات التجريبية.

1. تخزين العينات العامة والمستحضرات

  1. اختيار العينة وإعدادها
    ملاحظة: تأكد من العمل في غطاء الدخان عند تطبيق أسيتات الإيثيل لتنفيذ الذباب الميت. أخرج السائل من سطح الذبابة قبل الوزن.
    1. عينات طازجة: ضع ثلاث عينات ذباب مجمعة في قوارير الغاز بعد قتلها بأسيتات الإيثيل. قم بوزن العينات وتسميتها باسم Fresh 1....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

استخدمنا قارئ الصفائح الدقيقة لقياس قيم OD260 و OD280 لمحلول الحمض النووي المستخرج ثم حصلنا على قيم OD260 / OD280 لتقييم نقاء الحمض النووي. كان OD260 / OD280 لجميع العينات الطازجة والعينة القديمة 1 أكبر من 2. كان ل OD260 / OD280 للعينة القديمة 2 قيمة قصوى تبلغ 2.187 على الرغم من أن المتوسط كان 1.753 ، وتذبذبت قياساتها الثلاثة بشكل كبير بسبب القيم الصغيرة (≤0.01) لكل من OD280 و OD280 (الجدول 1). بناء على قيمة OD260 التي تم الحصول عليها ، قمنا بتقدير تركيز الحمض النووي. كان تركيز الحمض النووي للعينات الثلا.......

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

استخراج الحمض النووي هو الرابط الأكثر أهمية في التحديد الجزيئي للذباب الميت ، وتؤثر طريقة استخراجه وجودة الحمض النووي المستخرج بشكل مباشر على الكشف اللاحق. في هذه التجربة ، نجحنا في استخراج الحمض النووي من الذباب الميت باستخدام مجموعة دم شائعة ، دون الحاجة إلى شراء مجموعة خاصة لاستخراج الحمض النووي للحشرات ، مما يجعل استخراج الحمض النووي للحشرات أسهل في الإنجاز.

سطح الذباب غني بالكيتين ، خاصة في مراحل اليرقات والعذراء حيث يمكن أن يصل الكيتين للبشرة إلى 60-70٪ ، مما يجعل استخراج الحمض النووي من.......

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

ويعلن صاحبا البلاغ أنه ليس لهما مصالح مالية متنافسة.

شكر وتقدير

يتم دعم هذا العمل من قبل المؤسسة الوطنية للعلوم الطبيعية في الصين (82060341،81560304) ومشروع البحث العلمي لمنصة الابتكار الأكاديمي في مقاطعة هاينان (YSPTZX202134).

....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
المخزن المؤقت AEQiagen172026832شطف الحمض النووي
المخزن المؤقت ALQiagen172028374المخزن
ATLQiagen172028162تحلل الأنسجة
العازلة AW1Qiagen172028760المخزن المؤقت لإزالة البروتين
Buffer AW2Qiagen57203108تحلية المياه العازلة
C1-J-2495Taihe BiotechnologyTW21109216forword التمهيدي
C1-N-2800Taihe BiotechnologyTW21109217التمهيدي العكسي
D2000 سلم الحمض النوويالوقت الحقيقي (بكين) التكنولوجيا الحيويةRTM415قياس موضع العصابات الكهربية
DNeasy Mini Spin العمودQiagen166050343امتصاص الحمض
النووي حاضنة الحمام الجافMiulabDKT200-2Dيستخدم لتسخين
MIX-30S Mini MixerMiulabMUC881206عمل تذبذبي
Proteinase KQiagen172026218تعطيل نوكليازات داخل الخلايا والبروتينات الأخرى
Qubit 3.0 مقياس الفلورالحراري فيشر العلمي2321611188
السرعة الطرد المركزي الدقيقScilogex9013001121معيار أجهزة الطرد المركزي
# 1Thermo Fisher Scientific2342797
Standard # 2Thermo Fisher Scientific2342797
Tanon 3500R Gel ImagerTanon16T5553R-455جل التصوير
Taq Mix ProMonad00007808-140534PCR Mix
Taq Mix ProMonad00007808-140534PCR Mix
Thermo CyclerZhuhai HemaVRB020Aحل عمل PCR العادي
Thermo Fisher Scientific2342797
محلول المؤقت في عمود

المراجع

  1. Amendt, J., Richards, C. S., Campobasso, C. P., Zehner, R., Hall, M. J. Forensic entomology: applications and limitations. Forensic Sci Med Pathol. 7 (4), 379-392 (2011).
  2. Wydra, J., Matuszewski, S. The optimal post-eclosion interval while es....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

تصحيح


Formal Correction: Erratum: DNA Extraction and Comparison Between Old and Fresh Necrophilic Fly Samples
Posted by JoVE Editors on 8/12/2024. Citeable Link.

This corrects the article 10.3791/66737

استكشف المزيد من المقالات

الذباب الرمّام*Chrysomya megacephala*طقم استخلاص الحمض النووي من الدمنقاوة الحمض النوويتركيز الحمض النوويالحفظ بالكحولتضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسلالرحلان الكهربائي للهلامقارئ الأطباق الدقيقة