$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
في هذا البروتوكول التفصيلي خطوة بخطوة ، يتم عرض منصة موحدة لصنع فيروس AAV عالي الجودة وعالي الجودة مع CF10 في بيئة معملية أبحاث واسعة النطاق. بالمقارنة مع أطباق زراعة الخلايا التقليدية ، يوفر CF10 طريقة ملائمة لزراعة كميات كبيرة من الخلايا وإنتاج فيروس AAV (الشكل 1). تم اختبار العديد من ظروف المزرعة لتحديد ما إذا كانت الخلايا في البيئة المثلى يمكن أن تعزز الإنتاج الفيروسي. أظهر DMEM منخفض الجلوكوز المكمل ب 10 mM HEPES و 2٪ FBS أفضل إنتاج AAV.
تم اختبار العديد من البروتوكولات لتنقية AAVs. معظم الإجراءات لها غلة منخفضة من الفيروس وشوائب قفيصة AAV. هنا ، تم تطوير بروتوكول تنقية منقح ، يجمع بين AAV من كل من كريات الخلايا ووسائط الاستزراع (الشكل 2). لقد وجدنا أن 80٪ من AAV كانت في الخلايا ، و 20٪ أخرى من AAV كانت في وسائط الثقافة ، والتي تم إفرازها من الخلايا. تمت معالجة كلا الجزأين من AAV باستخدام DNase لإزالة الحمض النووي الحر. تم استخدام ديوكسي كولات الصوديوم لمزيد من إطلاق AAV من الخلايا. ثم تم استخراج AAVs باستخراج الكلوروفورم متبوعا بتقسيم مائي على مرحلتين. سمحت هذه الخطوات بإزالة معظم ملوثات البروتين. AAV لا يزال قابل للذوبان في مرحلة كبريتات الأمونيوم.
تمت إزالة الملوثات المتبقية باستخدام الطرد المركزي الفائق المتدرج لليوديكسانول المتقطع (الشكل 3 أ). كان التدرج مفيدا أيضا في إزالة قفيصات AAV الفارغة ، خاصة مع الجولة الثانية من الطرد المركزي الفائق التدرج اليوديكسانول.
تم تحديد نقاء فيروس AAV عن طريق تلطيخ الفضة. عندما تم الحصول على ثلاثة نطاقات رئيسية تتوافق مع بروتين قفيصة AAV ، VP1 و VP2 و VP3 ، بنقاوة أكبر من 90٪ ، كان فيروس AAV مناسبا للاستخدام في الجسم الحي (الشكل 3B). تم الوصول إلى نسبة القفيصة الكاملة AAV إلى القفيصة الفارغة بواسطة TEM (الشكل 3C). فقط قفيصة كاملة مع إدخال جين التحوير من شأنه أن يسمح بالتعبير عن الجينات المحورة في الأنسجة المستهدفة. يمكن أن يؤدي جزء كبير من القفيصة الفارغة أيضا إلى استجابة مناعية لقفيصة AAV. تعد فحوصات الجودة هذه ضرورية لكل فيروس AAV يتم إنتاجه وتنقيته قبل الاستخدام.

الشكل 1: رسم تخطيطي لإنتاج AAV بواسطة طريقة النقل الثلاثي للخلايا HEK293T. الرجاء الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 2: رسم تخطيطي لتنقية AAV. الرجاء الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.

الشكل 3: تنقية AAV عن طريق الطرد المركزي الفائق التدرج اليوديكسانول والتحقق من نقاء فيروس AAV. (أ) طبقات تدرج اليوديكسانول وموضع الإبرة للحصاد. (ب) جل تمثيلي يقيم محتوى القفيصة ونقاوتها. M: علامة جزيئية. R: مرجع AAV6 قفيصة كاملة ؛ S1: قفيصة AAVDJ مصنوعة داخليا مع جولة واحدة من الطرد المركزي الفائق ؛ S2: قفيصة AAVDJ مصنوعة داخليا مع جولتين من الطرد المركزي الفائق ؛ S3: قفيصة AAV6 مصنوعة داخليا. ج: صورة المجهر الإلكتروني ل AAV. الفيروس الذي تم جمعه بعد التنقية. تظهر القفيصات الفيروسية التي تحتوي على جينوم فيروسي على شكل أشكال سداسية بيضاء متجانسة ، بينما تظهر القفيصات الفارغة على شكل أشكال سداسية ذات حافة بيضاء ولكن مركزها مظلم. شريط المقياس: 100 نانومتر. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الجدول 1: حاسبة PEI لتغليف AAV. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الجدول.
الجدول 2: مخطط حجم خام AAV-PEG-Sulfate. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الجدول.
الجدول 3: تحضير تدرج اليوديكسانول. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الجدول.
الجدول 4: تحضير الجولة الثانية من تدرج اليوديكسانول. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الجدول.
الجدول 5: بادئات المعايرة بالتحليل الحجمي AAV. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الجدول.
الملف التكميلي 1: تركيبات المخازن المؤقتة المستخدمة للدراسة. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الملف.