يقدم هذا البروتوكول دليلا يمكن الوصول إليه لجمع وتخزين وإذابة خلايا الدم أحادية النواة المحيطية المناسبة لتحليلات المصب وسير العمل مثل قياس التدفق الخلوي وتسلسل الحمض النووي الريبي. كما يتم عرض مجموعات معطف البلازما وبافي.
مقالة منهجية
يقدم هذا البروتوكول دليلا يمكن الوصول إليه لجمع وتخزين وإذابة خلايا الدم أحادية النواة المحيطية المناسبة لتحليلات المصب وسير العمل مثل قياس التدفق الخلوي وتسلسل الحمض النووي الريبي. كما يتم عرض مجموعات معطف البلازما وبافي.
تستخدم خلايا الدم أحادية النواة المحيطية (PBMCs) بشكل شائع في الأبحاث الطبية الحيوية على الجهاز المناعي واستجابته للأمراض ومسببات الأمراض. يصف هذا البروتوكول التفصيلي المعدات والإمدادات والخطوات الخاصة بعزل وحجز التبريد وإذابة PBMCs عالية الجودة والقابلة للحياة للغاية من خلايا الدم الكاملة المناسبة لتطبيقات المصب مثل قياس التدفق الخلوي وتسلسل الحمض النووي الريبي. كما يتم وصف بروتوكولات لمعالجة البلازما ومعطف بافي من الدم كله بالتوازي وبالتزامن مع PBMCs. هذا البروتوكول سهل المتابعة خطوة بخطوة ، والذي يستخدم الطرد المركزي المتدرج الكثافة لعزل PBMCs ، مصحوب بقائمة مرجعية بالإمدادات والمعدات وخطوات التحضير. هذا البروتوكول مناسب للأفراد الذين لديهم أي خبرة سابقة في التقنيات المختبرية ويمكن تنفيذه في المختبرات السريرية أو البحثية. نتجت صلاحية الخلايا عالية الجودة وتسلسل الحمض النووي الريبي عن PBMCs التي جمعها المشغلون الذين ليس لديهم خبرة مختبرية سابقة باستخدام هذا البروتوكول.
يوضح هذا البروتوكول طريقة وسير عمل يمكن الوصول إليهما لعزل خلايا الدم أحادية النواة المحيطية (PBMCs) من الدم الكامل. يستهدف هذا البروتوكول بشكل خاص فنيي الأبحاث المبتدئين والطلاب وموظفي المختبرات السريرية بهدف تسهيل جمع وحفظ PBMCs بالتبريد دون الحصول على تدريب مسبق على التقنيات المختبرية.
يستخدم هذا البروتوكول الطرد المركزي لفصل مكونات الدم الكامل حسب الكثافة. يتكون الدم الكامل من أربعة مكونات رئيسية مدرجة بترتيب تناقص الكثافة: خلايا الدم الحمراء / كريات الدم الحمراء (~ 45٪ من الحجم) ، وخلايا الدم البيضاء (<1٪ من الحجم) ، والصفائح الدموية (<1٪ من الحجم) ، والبلازما (~ 55٪ من الحجم) 1،2،3،4،5،6. يمكن تقسيم خلايا الدم البيضاء إلى فئتين بناء على خصائص نفاياتها: مستديرة أو متعددة النواة6. تعرف PBMCs بأنها خلايا الدم البيضاء ذات النوى المستديرة وتتكون من أنواع الخلايا التالية: الخلايا الليمفاوية (الخلايا التائية ، الخلايا البائية ، الخلايا القاتلة الطبيعية) ، الخلايا المتغصنة ، والوحيدات6. تشمل خلايا الدم البيضاء متعددة النوى الخلايا المحببة ، والتي تتكون من أنواع الخلايا التالية: العدلات ، الخلايا القاعدية ، والحمضات6. خلايا الدم البيضاء متعددة النوى أكثر كثافة من PBMCs6. يتم تفصيل كثافات كل مكون من مكونات الدم الكامل في الجدول 1.
في هذا البروتوكول ، يتم جمع الدم الكامل في أنابيب الطرد المركزي المتدرجة الكثافة. تحتوي هذه الأنابيب على وسط تدرج كثافة معبأ مسبقا كثافته 1.077 g/mL. بعد الطرد المركزي ، يتم فصل الخلايا الأكثر كثافة ، بما في ذلك خلايا الدم البيضاء متعددة النوى وكريات الدم الحمراء ، عن PBMCs والصفائح الدموية بواسطة وسط تدرج الكثافة (الشكل 1A)6,7. ثم يتم جمع PBMC وجزء الصفائح الدموية وغسلها وطردها مركزيا لإزالة الصفائح الدموية. يتم جمع PBMCs المنقى الناتج وتخزينه عند -80 درجة مئوية أو في النيتروجين السائل. يمكن إذابة PBMCs المحفوظة بالتبريد بشكل قابل للتطبيق واستخدامها مباشرة في تحليلات المصب أو معالجتها بشكل إضافي لعزل أنواع معينة من الخلايا المكونة.
تم تحسين هذا البروتوكول لتسلسل الحمض النووي الريبي عالي الجودة من PBMCs عالية القابلية للتطبيق. في هذه المقالة ، تم عزل PBMCs وحفظها بالتبريد من المرضى في عيادة خارجية. بعد ذلك ، تم عزل الخلايا الوحيدة من PBMCs بواسطة FACS وتحليلها عبر تسلسل الحمض النووي الريبي. ومع ذلك ، يمكن تكييف البروتوكول على نطاق واسع مع الاحتياجات التجريبية الأخرى مثل زراعة الخلايا ، وتحرير الجينات ، والدراسات الوظيفية خارج الجسم الحي ، وتحليلات الخلية الواحدة ، والتنميط الظاهري عن طريق قياس التدفق الخلوي أو قياس الخلايا حسب وقت الرحلة ، وعزل الحمض النووي / الحمض النووي الريبي أو البروتينات ، والشرائح للكيمياء المناعية ، من بين أمور أخرى8،9،10،11،12،13،14،15 ، 16,17,18.
بالإضافة إلى جمع PBMC من أنابيب الطرد المركزي المتدرجة الكثافة ، يستعرض هذا البروتوكول كيفية جمع البلازما ومعطف بافي عبر الطرد المركزي باستخدام أنبوب EDTA. بعد الطرد المركزي ، يتم فصل الدم الكامل إلى بلازما وكريات الدم الحمراء وطبقة واجهة رقيقة تسمى معطف بافي يحتوي على كريات الدم البيضاء (الشكل 1 ب)6. يستخدم معطف بافي بشكل شائع لاستخراج الحمض النووي والتحليلات الجينومية اللاحقة19,20. تحتوي طبقة البلازما على مكونات خالية من الخلايا في الدم الكامل ويمكن استخدامها لفحوصات العلامات الحيوية21,22.
تمت الموافقة على بروتوكول الدراسة من قبل UCSD وبرنامج حماية الإنسان KUMC ويتوافق مع إعلان هلسنكي. قدم جميع الأفراد موافقة مستنيرة للمشاركة وجمع الدم.
1. المعالجة والحفظ بالتبريد ل PBMCs
2. معالجة معطف البلازما وبافي من أنابيب EDTA
3. ذوبان PBMCs
4. عد الخلايا وصلاحيتها
بعد جمع PBMC والحفظ بالتبريد ، تم تقييم صلاحية PBMCs المذابة ، وحيدات ، والخلايا الليمفاوية من 56 عينة فريدة من خلال قياس التدفق الخلوي باستخدام الكواشف المدرجة في الجدول 4 باتباع تعليمات الشركات المصنعة (الشكل 2A-F). تم تحقيق متوسط ± قابلية SD ل PBMCs ، وحيدات ، والخلايا الليمفاوية من 94 ± 4.0٪ و 98 ± 1.1٪ و 93 ± 5.6٪ على التوالي (الشكل 2G). أسفر قياس الجدوى بواسطة استبعاد Trypan Blue عن متوسط صلاحية 88 ± 7.5٪ وعدد خلايا 2.3 × 106 ± 1.9 × 106. أظهر تحليل قياس التدفق الخلوي أيضا أن الخلايا الوحيدة الحية تشكل 17 ± 5.9٪ والخلايا الليمفاوية تتكون من 53 ± 13.0٪ من إجمالي PBMCs.
بعد ذلك ، تم فرز الخلايا الوحيدة من PBMCs المذابة من 59 عينة فريدة عن طريق قياس التدفق الخلوي وتقديمها لإعداد المكتبة وتسلسل الحمض النووي الريبي كما هو موضح في مكان آخر24. تم تحقيق متوسط ± إجمالي عدد تسلسل SD يبلغ 18.0 ± 16.3 مليون مع محاذاة قراءة 93 ± 6.3٪ و 49.6 ± 1.4٪ محتوى GC (الشكل 3A-B). تم العثور على متوسط نسبة قراءات SD ± تم تعيينها بشكل فريد من 88 ± 3.6٪ مع مجموعة فرعية من 56 عينة فريدة. وتبين هذه المعلمات أن المشغلين الذين لديهم أي مستوى من التدريب المختبري باستخدام هذا البروتوكول يمكن الحصول على هذه البارامترات القابلة للتطبيق بدرجة عالية والمناسبة للتطبيقات النهائية، بما في ذلك تسلسل الحمض النووي الريبي عالي الجودة.
| مكون | كثافة | ذكر |
| البلازما | 1.022 جم / مل إلى 1.026 جم / مل | 1 |
| الصفائح الدمويه | <1.061 جم / مل إلى >1.070 جم / مل | 2 |
| PBMCs | <1.077 جم / مل | 6 |
| العدلات منخفضة الكثافة* | <1.077 جم / مل | 3 |
| الخلايا المحببة (العدلات * ، الخلايا القاعدية ، والحمضات) | >1.077 جم / مل | 6 |
| كريات الدم الحمراء | 1.11 جم / مل | 4 |
الجدول 1: مكونات الدم الكامل مدرجة حسب ترتيب تناقص الكثافة.
| ريجانت / المواد | المبلغ (لكل 6 أنابيب CPT و 1 أنبوب EDTA) | بقشيش | بيانات تحذيرية | ||||||
| أنابيب CPT | 6 | التسمية وفقا لمعرف المريض أو العينة. | |||||||
| أنبوب EDTA | 1 | التسمية وفقا لمعرف المريض أو العينة. | |||||||
| أنبوب مخروطي سعة 50 مل | 2 | بالإضافة إلى معرف المريض أو العينة ، قم بتسمية أنبوب 1 ل PBMCs و 1 للنفايات. | |||||||
| كريوفيال | 39 | الملصق 30 ل PBMCs ، و 8 لبلازما EDTA ، و 1 للمعطف الفاخر. لا يمكن استخدام جميع المبردات. | |||||||
| السيد فروستي | 2 | املأ حتى منتصف الطريق بالإيزوبروبانول وقم بالتبريد المسبق طوال الليل عند -20 درجة مئوية. | الأيزوبروبانول هو مهيج قابل للاشتعال. يحفظ بعيدا عن الشرر / اللهب. تجنب الاستنشاق والتعامل مع القفازات والعناية. | ||||||
| فلافوبيريدول | 100 ميكرولتر من مخزون 1000X | لتحضير مخزون 1000X فلافوبيريدول ، قم بتعليق 5 ملغ فلافوبيريدول في 1.14 مل من DMSO لتركيز 10 مللي مول. القسمة 200 ميكرولتر في حاويات فردية ثم تجميد. للاستخدام ، قم بإذابة القسامات الفردية وقم بتخفيف 1:10 في الماء المقطر الخالي من DNase / RNase ، ثم استخدمه كمحلول 1000X. | فلافوبيريدول هو مصدر إزعاج. تعامل مع القفازات والعناية. | ||||||
| الحل 1 | 50 مل | RPMI المتوسطة. لصنع 50 مل من محلول المخزون ، استخدم 50 مل من RPMI Medium. | |||||||
| الحل 2 | 15 مل | RPMI متوسط + 12.5٪ مصل بشري ألبومين + 1 ميكرومتر فلافوبيريدول. لصنع 50 مل من محلول المخزون ، استخدم 25 مل RPMI متوسطة + 25 مل مصل بشري ألبومين + 50 ميكرولتر 1000X فلافوبيريدول. | فلافوبيريدول هو مصدر إزعاج. تعامل مع القفازات والعناية. | ||||||
| الحل 3 | 15 مل | RPMI متوسط + 11.25٪ مصل بشري ألبومين + 1 ميكرومتر فلافوبيريدول + 10٪ DMSO. لصنع 50 مل من محلول المخزون ، استخدم 22.5 مل RPMI متوسط + 22.5 مل HSA + 5 مل DMSO + 50 ميكرولتر 1000X فلافوبيريدول. | فلافوبيريدول مهيج و DMSO سام ويتم امتصاصه بسهولة من خلال الجلد. تعامل مع القفازات والعناية. | ||||||
الجدول 2: قائمة مرجعية بالكواشف والمواد التي يجب تحضيرها ووضع العلامات عليها لجمع وحفظ PBMCs بالتبريد.
| ريجانت / المواد | المبلغ (لكل 1 مل من قسمة PBMCs المجمدة) | بقشيش | بيانات تحذيرية | |
| الحل 4 | 10 مل | برنامج تلفزيوني + 2 مللي متر EDTA لصنع 50 مل من محلول المخزون ، استخدم 5 مل 10X PBS + 200 ميكرولتر 0.5M EDTA + 44.8 مل ماء مقطر خال من DNase / RNase | ||
| أنبوب مخروطي سعة 50 مل | 3 | بالإضافة إلى معرف المريض أو العينة ، قم بتسمية أنبوب واحد ل PBMCs المجهدة مسبقا ، و 1 ل PBMCs بعد الإجهاد ، و 1 للنفايات. املأ الأنبوب المسمى ب PBMCs الملطخة مسبقا ب 9 مل من المحلول 4 لكل مل من PBMCs المجمدة | ||
| أنبوب 1.5 مل | 1 | لعد الخلايا. تسمية مع المريض أو معرف العينة | ||
| 0.4٪ محلول تريبان الأزرق | 20 ميكرولتر | لعد الخلايا. يمكن إضافته إلى أنبوب 1.5 مل في وقت مبكر من اليوم السابق. | تريبان بلو مادة مسرطنة. تعامل مع القفازات والعناية. | |
الجدول 3: قائمة مرجعية بالكواشف والمواد التي يجب تحضيرها ووضع العلامات عليها لإذابة وحساب PBMCs.
| الكاشف / المواد | المبلغ (لكل مليون خلية) |
| بقعة حية ميتة | 5 ميكرولتر |
| الثقة البشرية FcX | 5 ميكرولتر |
| الأجسام المضادة CD3 | 5 ميكرولتر |
| الأجسام المضادة CD19 | 5 ميكرولتر |
| الأجسام المضادة CD56 | 5 ميكرولتر |
| الأجسام المضادة CD66b | 5 ميكرولتر |
| الأجسام المضادة HLA-DR | 5 ميكرولتر |
| الأجسام المضادة CD14 | 5 ميكرولتر |
| الأجسام المضادة CD16 | 2.5 ميكرولتر |
| الحمض النووي الريبي | 100 الوحدات |
الجدول 4: جدول الكواشف لعزل الخلايا الوحيدة من PBMCs عن طريق قياس التدفق الخلوي.

الشكل 1: مكونات الدم الكامل كما يفصلها الطرد المركزي في أنابيب الطرد المركزي المتدرجة الكثافة أو أنابيب EDTA. (أ) يؤدي الطرد المركزي للدم الكامل في أنابيب الطرد المركزي المتدرجة الكثافة إلى فصل البلازما والصفائح الدموية و PBMCs فوق وسط تدرج الكثافة مع كريات الدم الحمراء متعددة النوى أسفل وسط تدرج الكثافة. (ب) ينتج عن الطرد المركزي للدم الكامل في أنابيب EDTA فصل البلازما في الطبقة العليا ، وكريات الدم الحمراء في الطبقة السفلية ، والغلاف المنتفخ في الواجهة. تم إنشاؤها باستخدام Biorender.com. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: تم تقييم صلاحية PBMCs المذابة المحفوظة بالتبريد عن طريق تلطيخ التدفق الحي / الميت وقياس التدفق الخلوي. (أ) يستبعد الحطام، الذي يشار إليه بعلامة نجمية*، من PBMCs بواسطة بوابات التشتت الأمامية والجانبية. (ب) التحليل الحي / الميت التمثيلي ل PBMCs الكاملة (ج) يتم إغلاق الوحيدات الشاملة على أنها HLA-DR موجبة وسالبة للمستضدات السطحية التالية التي تحمل علامة FITC: CD3 و CD19 و CD56 و CD66b. (د) التحليل التمثيلي الحي / الميت للوحيدات. ه: الخلايا الليمفاوية المسورة بواسطة مولدات الضد السطحية التالية المسماة FITC: CD3 و CD19 و CD56 و CD 66b. (F) التحليل التمثيلي الحي / الميت للخلايا الليمفاوية. (ز) النسبة المئوية لصلاحية كل نوع من الخلايا التي تم قياسها كميا من 56 عينة. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3: جودة تسلسل الحمض النووي الريبي للوحيدات المصنفة من PBMCs المحفوظة بالتبريد. تم تسلسل 56 عينة فريدة وتم إنشاء متوسط ± SD 18.0 ± 16.3 مليون تسلسل إجمالي. (أ) كانت المحاذاة عالية ، حيث تتوافق 92.5٪ ± 6.3٪ من التسلسلات مع الجينوم المرجعي. (ب) كان محتوى GC لهذه التسلسلات 49.6 ± 1.4٪. تم إنشاؤها باستخدام FastQC25. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
فيديو تكميلي 1: عرض توضيحي لكيفية استخدام أجهزة الطرد المركزي الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الملف.
فيديو تكميلي 2: عرض توضيحي لكيفية تشغيل ماصة متعددة الموزعات. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الملف.
تم تنفيذ هذا البروتوكول لجمع PBMC والحفظ بالتبريد بنجاح من قبل الأفراد الذين لديهم أو بدون تدريب مختبري بحثي سابق. في تطبيقنا ، أدى تسلسل FACS و RNA للوحيدات القابلة للحياة للغاية والمنقاة من PBMCs المخزنة إلى تسلسلات عالية الجودة.
تتمثل إحدى نقاط القوة الرئيسية لهذا البروتوكول في إمكانية الوصول إليه. تستخدم التقنية المقدمة في البروتوكول أنابيب معبأة مسبقا بوسط تدرج الكثافة الصلبة. نتيجة لذلك ، يمكن جمع الدم الكامل مباشرة في الأنبوب ثم معالجته على الفور لعزل PBMCs. هناك حاجة إلى عدد صغير نسبيا من الحلول الجاهزة والمعدات المتخصصة ، مما يسهل التعاون بين مختبر الأبحاث ، حيث يمكن تحضير الكواشف ، والمختبر السريري ، حيث يتم جمع العينات ومعالجتها. البروتوكولات المكتوبة والفيديو موجهة نحو المشغلين في أي مستوى من التدريب.
في حين أن هذا البروتوكول يستخدم الدم الكامل الطازج لعزل PBMCs ، وبالتالي ، لديه عائد متوقع مرتفع نسبيا ونقاوة تبلغ >90٪ ، فقد لا يكون مناسبا للتطبيقات التي تتطلب نقاوة عالية بشكل استثنائي تبلغ >98٪ 26,27. علاوة على ذلك ، يمكن أن يكون الحصول على أنابيب الطرد المركزي ذات الكثافة المتدرجة مكلفا ، خاصة إذا كانت هناك حاجة إلى جمع عدد كبير من العينات.
تشمل الطرق البديلة لجمع PBMC استخدام وسط تدرج الكثافة السائلة أو استنفاد المغناطيسية المناعية28,29. باختصار ، يتضمن الأول وضع طبقات من وسط تدرج الكثافة مسبق الصنع تحت الدم الكامل الهيبارين متبوعا بالطرد المركزي. يستخدم هذا الأخير الأجسام المضادة الموسومة مغناطيسيا لتسمية غير PBMCs ، والتي يتم الاحتفاظ بها بعد ذلك في عمود مغناطيسي بينما تمر PBMCs غير المسماة دون أن تتأثر.
بالنسبة للبروتوكول المقدم ، فإن استخدام وسيط تدرج الكثافة السائلة أقل تكلفة ويتطلب مواد أقل بكثير بسبب نقص أنابيب الطرد المركزي المتدرجة الكثافة ؛ يمكن إجراء عزل PBMC في أنبوب قياسي سعة 50 مل8. ومع ذلك ، فإن هذه التقنية أكثر تفصيلا ، ولها وقت معالجة أطول ، وقد تكون عرضة لخطر أكبر لخطأ المستخدم. يجب إضافة الهيبارين بدقة لتجنب الإفراط في التخفيف ويجب وضع وسط تدرج الكثافة بعناية بالكميات الصحيحة لضمان فصل PBMC الجيد26.
بالنسبة إلى البروتوكول المقدم ، فإن استخدام النضوب المغناطيسي المناعي يوفر عائدا ونقاء أعلى ، ومناولة أقل بسبب نقص الطرد المركزي ، ووقت معالجة أسرع ، ويتطلب مواد أقل بكثير30،31،32. ومع ذلك ، فإن الجانب السلبي الرئيسي هو أن هذه الطريقة هي الأكثر تكلفة من بين الطرق الثلاث الموصوفة ، خاصة على نطاق واسع.
في حين أن هذا البروتوكول قوي ، قد تتطلب بعض الخطوات الحاسمة اهتماما إضافيا. في جميع أنحاء البروتوكول ، تأكد من عدم خلط العينات ووضعها في الأنابيب ذات العلامات المناسبة ، خاصة عند العمل مع العديد من المرضى أو الحالات في وقت واحد. بالنسبة للخطوة 1.4 ، تأكد من عدم تجاهل PBMCs ؛ لن تؤدي البلازما الزائدة إلا إلى تقليل تركيز PBMCs ، وهو أمر أقل أهمية في الحفاظ على صلاحية العينة وجودتها. بشكل منفصل ، يشير وجود الرواسب في PBMCs المجمعة إلى أن قطعا من وسط تدرج الكثافة قد تم إزاحتها. ماصة بلطف أكثر في الخطوة 1.5 لمنع هذه المشكلة. في الخطوتين 1.10 و 3.6, تأكد من عدم التخلص من حبيبات خلية الطرد المركزي. يعد العمل السريع أمرا بالغ الأهمية للخطوتين 1.12 و 3.3 حيث يحتوي المحلول 3 على DMSO ، وهو سام للخلايا في درجة حرارةالغرفة 33. من المهم أيضا ملاحظة أن تخزين PBMCs في النيتروجين السائل موصى به على التخزين عند -80 درجة مئوية. ارتبط التخزين طويل الأجل عند -80 درجة مئوية بانخفاض صلاحية الخلية وتغيير التعبير الجيني34,35.
يمكن تكييف هذا البروتوكول وفقا للاحتياجات التجريبية. تهدف إضافة فلافوبيريدول ، وهو مثبط لبوليميراز الحمض النووي الريبي وتوليف الحمض النووي الريبي المرسال ، في المحلولين 2 و 3 إلى منع أي معالجة وضغط ناتج عن قطعة أثرية باستخدام تسلسل الحمض النووي الريبي36. ومع ذلك ، قد يتم حذف فلافوبيريدول إذا كانت الدراسات الوظيفية أو خارج الجسم الحي باستخدام PBMCs مطلوبة.
سوف تصبح البلازما التي يتم جمعها من أنابيب EDTA ملوثة ب EDTA ، وهو عامل مخلبي. نتيجة لذلك ، فإن بلازما EDTA غير مناسبة للمقايسات التي تنطوي على التخثر أو أيونات الكالسيوم 37,38. إذا رغبت في ذلك ، يمكن بدلا من ذلك جمع طبقة البلازما في الأنابيب المتوسطة المتدرجة الكثافة بعد الطرد المركزي في الخطوة 1.4. تحتوي هذه الأنابيب على هيبارين الصوديوم كمضاد للتخثر يمكن إزالته بإضافة الهيباريناز39. والجدير بالذكر أن الهيبارين يثبط النسخ العكسي وتضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل ، مما يجعل البلازما المجمعة غير مناسبة لتجارب تفاعل البوليميراز المتسلسل دون إضافة عامل مانعللهيبارين 40.
لا يتم تخزين معطف بافي الذي تم جمعه من أنابيب EDTA في محلول يحتوي على DMSO أو فلافوبيريدول. DMSO مهم في الحد من تكوين بلورات الجليد وموت الخلايا41. فلافوبيريدول مهم لتثبيط تخليق الحمض النووي الريبي36. وبالتالي ، فإن معطف بافي غير مناسب للتحليلات خارج الجسم الحي والترانسكوبي. إذا رغبت في ذلك ، يمكن تنفيذ الخطوات من 1.6 إلى 1.15 باستخدام معطف بافي الذي تم جمعه من أجل زيادة صلاحية الخلية إلى أقصى حد ومنع تخليق الحمض النووي الريبي.
بينما تم تصميم هذا البروتوكول لتسلسل الحمض النووي الريبي ، فإن التطبيقات المحتملة الإضافية ل PBMCs التي تم جمعها وحفظها بالتبريد باستخدام هذا البروتوكول تشمل زراعة الخلايا ، وتحرير الجينات ، والدراسات الوظيفية خارج الجسم الحي ، وتحليلات الخلية المفردة ، والتنميط الظاهري عن طريق قياس التدفق الخلوي أو قياس الخلايا حسب وقت الرحلة ، وعزل الحمض النووي / الحمض النووي الريبي أو البروتينات ، والشرائح للكيمياء المناعية ، من بين أمور أخرى.
ليس لدى المؤلفين أي مصالح مالية أو غير مالية ذات صلة للكشف عنها.
نود أن نشكر المرضى الذين تطوعوا بموافقتهم ووقتهم وتبرعهم بعينات الدم. كما نعرب عن تقديرنا للدكتور باتريك موريارتي وجولي آن داتون ومارك ماكليلين في المركز الطبي بجامعة كانساس لتعاونهم ولتنفيذ هذا البروتوكول في موقع بعيد. تلقت CY دعما بحثيا من منحة المعاهد الوطنية للصحة 1K08HL150271.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| 1000 & ميكرو; L نصائح | جيلسون | F174501 | ما يقرب من 3 نصائح مطلوبة لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection |
| 15 مل أنبوب | Biopioneeer | CNT-15 | لعقد الحلول 2/3 2 مطلوبة لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection |
| 2 مل Cryovials | Globe Scientific | 3012 | ما يقرب من 40 مبردة مطلوبة لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection |
| 20 & micro ؛ L نصائح | جيلسون | F174201 | للاستخدام في عد الخلايا ؛ يعتمد الحجم المطلوب على طريقة عد الخلايا المستخدمة. هناك حاجة إلى طرف واحد لكل 1 مل من PBMCs المجمدة غير المجمعة ليتم إذابة |
| الجليد 50 مل أنبوب مخروطي | CEM Corporation | 50-187-7683 | 2 مطلوب لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection 3 مطلوب لكل 1 مل من PBMCs المجمدة غير المجمعة ليتم إذابة |
| CD14 Antibody | Biolegend | 325621 | |
| CD16 الأجسام المضادة | Biolegend | 360723 | |
| CD19 الأجسام المضادة | Biolegend | 363007 | |
| CD3 الأجسام المضادة | Biolegend | 300405 | |
| CD56 الأجسام المضادة | Biolegend | 318303 | |
| CD66b الأجسام المضادة | Biolegend | 305103 | |
| مصفاة الخلية | Biopioneeer | DGN258367 | 1 مطلوب لكل 1 مل من PBMCs المجمدة غير المجمعة ليتم إذابة |
| CPT أنبوب تحضير الخلايا أحادية النواة | BD Biosciences | 362753 | 6 أنابيب مطلوبة لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection |
| Cryo Freezer Box | Labware | SB2CC-81 | يحمل 81 أنبوبا 1 مطلوب لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection |
| Cryotube Rack | Fisherbrand | 05-669-45 | يحمل ما يصل إلى 50 مبردا |
| DMSO | Invitrogen | 15575020 | ما يقرب من 2.5 مل مطلوب لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection |
| DNase / RNase | 10977015 | ما يقرب من 2 مل لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection ما يقرب من 9 مل مطلوب لكل 1 مل من PBMCs المجمدة لإزالة الجليد | |
| أنابيب EDTA | BD Biosciences | 366643 | 1 أنبوب مطلوب لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection |
| Flavopiridol | Sigma-Aldrich | F3055-5MG | |
| HLA-DR الأجسام المضادة | Biolegend | 307609 | |
| مصل البشري الألبومين | GeminiBio | 800-120 | ما يقرب من 25 مل مطلوب لكل مريض أو حالة علاج لمجموعة PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection |
| Human Trustain FcX | Biolegend | 422301 | |
| Isopropanol | Sigma-Aldrich | W292912-1KG-K | للاستخدام في |
| طابعة الملصقات | فروستي Phomemo | M110-WH | |
| Live-Dead Stain | Biolegend | 423105 | |
| Mr. Frosty | Thermo Scientific | 5100-0001 | يحمل ما يصل إلى 18 أنبوبا. 2 السيد Frostys المطلوب لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection |
| Multidisdispense Pipette | Brandtech | 705110 | |
| Multidispense Pipette | Tips Brandtech | 705744 | ما يقرب من 3 نصائح مطلوبة لكل مريض / حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection |
| P1000 Pipette | Gilson | F144059M | |
| P20 Pipette | Gilson | F144056M | للاستخدام في عد الخلايا ؛ يعتمد الحجم المطلوب على طريقة عد الخلايا المستخدمة. |
| ملصقات الطابعة | Phomemo | PM-M110-3020 | ما يقرب من 45 ملصقا مطلوبا لكل مريض / حالة علاج لمجموعة PBMC / Plasma / Buffy Coat Collection ما يقرب من 5 ملصقات مطلوبة لكل 1 مل من PBMCs المجمدة غير المجمعة ليتم إذابة الجليد |
| EDTA الخالية من RNase (0.5 م) | Invitrogen | AM9260G | حوالي 40 & micro ؛ L مطلوب لكل 1 مل من PBMCs المجمدة ليتم إذابة |
| PBS خال من RNase (10X) | Invitrogen | AM9625 | ما يقرب من 1 مل مطلوب لكل 1 مل من PBMCs المجمدة ليتم إذابة |
| الجليد RNasin | Promega | N2111 | |
| RPMI | Corning | 10-040-CV | ما يقرب من 80 مل مطلوب لكل مريض أو حالة علاج ل PBMC / Plasma / Buffy Coat |
| Collection Transfer Pipettes | Fisherbrand | 13-711-7M | ما يقرب من 5 مطلوب لكل مريض / حالة علاج لحامل أنبوب جمع PBMC / Plasma / Buffy Coat |
| Endicott-Seymour | 14-781-15 | يحمل ما يصل إلى 80 أنابيب CPT / EDTA |
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن