أجريت جميع التجارب على جميع فيروسات أنفلونزا الطيور A (H5N1) المتاحة في مختبر للسلامة البيولوجية الحيوانية المستوى 3 ومنشأة حيوانية وفقا لبروتوكولات جامعة جنوب الصين الزراعية (CNAS BL0011). تمت الموافقة على جميع مشاريع الأبحاث الحيوانية من قبل اللجنة المؤسسية لرعاية واستخدامه (رمز التعريف 2021f154 ، 29 يوليو 2021) لجامعة جنوب الصين الزراعية. تم تنفيذ جميع الإجراءات الحيوانية وفقا للأنظمة والمبادئ التوجيهية التي وضعتها هذه اللجنة والمعايير الدولية لرعاية. كانت المستخدمة في هذه الدراسة هي البط المنزلي البالغ من العمر 4 أسابيع (Anas platyrhynchos domestica) ، بما في ذلك كل من الذكور والإناث ، وتتراوح أوزان الجسم من 500 إلى 600 جرام.
1. عزل PBMCs البط وإعداد تعليق أحادي الخلية
- اجمع 2 مل من الدم الهباريني من الوريد الوداجي لكل بطة وانقله إلى أنابيب تحتوي على EDTA لمنع التخثر من كل بطة على حدة
- تمييع الدم باستخدام المخفف للعينة المقدم من مجموعة عزل الخلايا الليمفاوية أو PBS. تخلط برفق عن طريق سحب العينة باستخدام ماصة باستور. نسبة التخفيف المعتادة هي 1: 1 للدم إلى المخفف.
- انقل كمية متساوية من محلول فصل الخلايا الليمفاوية إلى أنبوب طرد مركزي مثل الدم المخفف. ضع طبقة من معلق الدم بحذر فوق محلول فصل الخلايا الليمفاوية. قم بالطرد المركزي للخليط عند 400 × جم ، 25 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة ، مع ضبط تسارع الهبوط على 1.
ملاحظة: يجب ألا تقل كمية محلول فصل الخلايا الليمفاوية عن 4 مل. يمكن العثور على مكونات مجموعة محلول فصل الخلايا الليمفاوية في جدول المواد.
- بعد الطرد المركزي ، راقب الطبقات الأربع المميزة في أنبوب الطرد المركزي من أعلى إلى أسفل. الطبقة العليا هي العينة المخففة ، تليها طبقة الخلايا الليمفاوية البيضاء الحليبية الحلبية الحلقية ، ثم محلول الفصل ، وتتكون الطبقة السفلية من خلايا الدم الحمراء.
- استخدم ماصة بعناية لجمع الطبقة الثانية ، طبقة الخلايا الليمفاوية البيضاء الحليبية الحلقية ، ونقلها إلى أنبوب طرد مركزي جديد. أضف 10 مل من محلول التنظيف لخلطه مع الخلايا.
- الطرد المركزي للعينة عند 440 × جم لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة. تخلص من المادة الطافية ، ثم أعد تعليق حبيبات الخلية في 10 مل من وسط RPMI 1640 لعد الخلايا.
- اختياري) لمزيد من تنقية العينة ، بعد الطرد المركزي عند 440 × جم لمدة 5 دقائق ، استخدم المخزن المؤقت لتحلل خلايا الدم الحمراء لإزالة أي خلايا دم مختلطة متبقية.
2. في المختبر H5N1 ثقافة الخلايا التائية الخاصة ب AIV
- قم بشراء بط البطة الصحي البالغ من العمر أسبوعين (شيلدريك) من مزرعة البط وقم بإوائه في عوازل الضغط السلبي. تأكد من أن البط سلبي بالنسبة ل AIV باستخدام فحوصات تثبيط التخثر الدموي (HI) قبل التجربة. يصيب البط البالغ من العمر 4 أسابيع ب H5N1 AIV 1 × 106 ، بجرعة معدية للبيض بنسبة 50٪ [EID50] / 0.2 مل عن طريق الأنف.
- عزل PBMCs الذاكرة من البط المصاب بفيروس H5N1 بعد 28 يوما من الإصابة ، باتباع الطريقة الموضحة في الخطوة 1. عد الخلايا باستخدام مقياس كثافة الدم. قم بتخفيف تعليق الخلية بنسبة 1: 1 مع 0.08٪ تريبان بلو واحسب الخلايا القابلة للحياة (غير الملوثة) يدويا تحت المجهر الضوئي.
ملاحظة: كما دعمت دراستنا المنشورةسابقا 20 ، تعتبر خلايا الدم المحيطية أحادية النواة (PBMCs) المعزولة بعد 28 يوما من الإصابة غنية بخلايا الذاكرة التائية. في هذه المرحلة ، هدأت مرحلة المستجيب ، وتسود مجموعات خلايا الذاكرة.
- اضبط التركيز على 3 × 106 خلايا / مل ، مع ضمان إضافة 1 مل من الوسط إلى كل بئر من اللوحة المكونة من 48 بئرا.
- العدوى المشتركة بين ثنائي الفينيل متعدد الميكروبات المعزولة بفيروس أنفلونزا الطيور H5N1 لتكون بمثابة ناقلات ناقلة من الجنود المدرعة. الجرعة الفيروسية هي وزارة الداخلية = 5. استزراع PBMCs مع الفيروس لمدة ساعة واحدة عند 37 درجة مئوية. رج العبوة برفق باليد كل 15 دقيقة.
- بعد ساعة واحدة من العدوى ، اغسل الخلايا 2x باستخدام PBS لإزالة الجزيئات الفيروسية غير المرتبطة. أعد تعليق PBMCs المغسولة في 1 مل من وسط زراعة الخلايا التائية وقم باحتضان الخلايا العالقة عند 37 درجة مئوية لمدة 5 ساعات.
- الطرد المركزي للخلايا عند 440 × جم لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة. بعد ذلك ، قم بإعادة تعليق الخلايا العارضة للمستضد المحتضنة (APCs) في 100 ميكرولتر من وسط زراعة الخلايا التائية وإضافتها إلى الخلايا المستجيبة. يجب أن تكون نسبة الخلايا العارضة للمستضد إلى الخلايا المستجيبة 1: 5.
- احتضان الخلايا في جو 5٪ من ثاني أكسيد الكربون2 عند 37 درجة مئوية لمدة 14 يوما. كل يومين ، استبدل نصف المادة الطافية لزراعة الخلايا بوسط خلية تائية طازجة عن طريق سحب العينة بعناية لضمان التوزيع المتساوي. تجاهل نصف الوسيط الذي يحتوي على الخلايا ، ثم أضف حجما متساويا من الوسط الجديد.
- في اليوم 7 ، راقب الخلايا تحت المجهر البصري عند 100x.
- أستخدم PBMCs للذاكرة المعالجة ب PBS كمجموعة تحكم غير محفزة.
3. كربوكسي فلوريسين ثنائي الأسيتات السكسينيميديل إستر (CFSE) لمراقبة تكاثر الخلايا التائية
- اضبط كثافة الخلية على 0.5-1 × 107 خلايا / مل وأعد تعليق الخلايا ب 5 مل من PBS بعد الطرد المركزي عند 440 × جم لمدة 5 دقائق.
- تخفيف مخزون 10 ملي مولار إلى 1 ميكرومتر CFSE مع 5 مل من PBS المبرد مسبقا ؛ تعمل في الظلام.
- قم بإمالة أنبوبي الطرد المركزي عند 45 درجة ، وأضف تخفيف CFSE إلى تعليق الخلية باستخدام ماصة باستور ، واخلطها جيدا ، وضعها في حمام مائي 37 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة في الظلام.
- اغسل الخلايا عن طريق تخفيفها في 10 أحجام من PBS المبرد مسبقا الذي يحتوي على 5٪ FBS ، والرواسب عن طريق الطرد المركزي عند 440 × جم لمدة 5 دقائق ، وتخلص من المادة الطافية. كرر الغسيل 2x.
- تحفيز الخلايا المسمى مع CFSE في المختبر وفقا للخطوة 2. عند الانتهاء من مقايسة التكاثر ، قم بحصاد الخلايا وتحليلها عن طريق قياس التدفق الخلوي.
4. تحليل قياس التدفق الخلوي لتكاثر الخلايا التائية CD8 + T و CD4 +
- بعد 7 أيام من الثقافة ، اجمع جميع الخلايا من كل بئر وقسمها إلى أنبوبين للتدفق لتحليلها.
- انقل الخلايا إلى أنبوب طرد مركزي جديد ، وجهاز طرد مركزي عند 440 × جم لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة ، وتخلص من المادة الطافية.
- أضف 100 ميكرولتر من كوكتيل الأجسام المضادة (الفأر المضاد للبط CD8 ، 1:50 أو الفأر المضاد للبط CD4 ، 1:50) واحتضان الخلايا لمدة 30 دقيقة في الظلام عند 4 درجات مئوية.
- انقل الخلايا إلى أنبوب طرد مركزي جديد ، وجهاز طرد مركزي عند 440 × جم لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة ، وتخلص من المادة الطافية.
- أضف 100 ميكرولتر من كوكتيل الأجسام المضادة (الماعز المترافق ب FITC IgG2b ، 1:50) واحتضن الخلايا لمدة 30 دقيقة في الظلام عند 4 درجات مئوية.
- اغسل الخلايا مرة واحدة ب 1 مل من PBS عن طريق الطرد المركزي عند 400 × جم لمدة 5 دقائق عند 4 درجات مئوية. تحليل البيانات باستخدام برنامج FlowJo. يتم عرض استراتيجية البوابات في الشكل التكميلي 1.
5. استجابة الخلايا التائية عن طريق فحوصات التعبير الجيني المميز باستخدام qPCR
- عد الخلايا في نهاية زراعة الخلايا التائية ، واجمعها في أنابيب طرد مركزي سعة 1.5 مل ، وأجهزة الطرد المركزي عند 400 × جم لمدة 5 دقائق. تخلص من المادة الطافية بعناية.
- استخراج الحمض النووي الريبي
ملاحظة: يمكن إجراء الاستخراج في غطاء الدخان أو مقعد فائق النظافة لمنع تلوث الحمض النووي الريبي.
- قم بتحليل الخلايا باستخدام المخزن المؤقت للتحلل الموجود في المجموعة وفقا لتعليمات الشركة المصنعة. انقل العينة المحللة إلى أعمدة مرشح gDNA (الموضوعة مسبقا في أنابيب التجميع) ، وأجهزة الطرد المركزي عند 13,400 × جم لمدة 30 ثانية ، وتجاهل الأعمدة ، وجمع المرشح. أضف 0.5 حجم من الإيثانول المطلق إلى المرشح. تخلط جيدا.
ملاحظة: يعد المحلول الغائم أو الترسيب بعد إضافة الإيثانول أمرا طبيعيا. رج العبوة وانتقل إلى الخطوة التالية.
- نقل الخليط إلى أعمدة الحمض النووي الريبي، جهاز طرد مركزي عند 13,400 × جم لمدة 30 ثانية. تخلص من المرشح ، وأضف 700 ميكرولتر من Buffer RW1 ، وجهاز الطرد المركزي مرة أخرى.
- تخلص من المرشح ، وأضف 700 ميكرولتر من Buffer RW2 (مع الإيثانول المطلق) ، وجهاز الطرد المركزي. تخلص من المرشح ، وأضف 500 ميكرولتر من Buffer RW2 (مع الإيثانول المطلق) ، وجهاز الطرد المركزي لمدة دقيقتين. قم بإزالة العمود بعناية من الأنبوب لتجنب التلوث من المرشح. تأكد من إزالة جميع محاليل الشطف لمنع التداخل في تفاعلات المصب.
- انقل العمود إلى أنبوب تجميع جديد خال من RNase ، وأضف 50-200 ميكرولتر من ddH2O الخالي من RNase ، واتركه في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 دقيقة ، ثم جهاز الطرد المركزي عند 13,400 × جم لمدة 1 دقيقة لإزالة الحمض النووي الريبي. قياس نقاء الحمض النووي الريبي وتركيزه.
ملاحظة: قم بتسخين ddH2O الخالي من RNase إلى 65 درجة مئوية لزيادة الإنتاجية وإجراء شطف ثان إذا لزم الأمر.
- قم بتصنيع (كدنا) باتباع تعليمات المجموعة. قم بتجميع حبلا (كدنا) وفقا لتعليمات الشركة المصنعة ، مع إضافة 5 أضعاف كمية النسخ العكسي. قم بالنسخ العكسي عند 37 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة ، ثم 85 درجة مئوية لمدة 5 ثوان ، وتبرد إلى 4 درجات مئوية.
- قم بإعداد تفاعل تفاعل البوليميراز المتسلسل وفقا لبروتوكول الشركة المصنعة.
- في أنبوب qPCR ، امزج 10 ميكرولتر من مزيج إنزيم تفاعل تفاعل البوليميراز المتسلسل 2x ، و 0.4 ميكرولتر من التمهيدي 1 ، و 0.4 ميكرولتر من التمهيدي 2 ، و 1 ميكرولتر من قالب (كدنا) ، و 8.2 ميكرولتر من ddH2O لعمل مزيج 20 ميكرولتر.
- قم بتشغيل تفاعل البوليميراز المتسلسل في أداة PCR الكمي في الوقت الفعلي باستخدام البرنامج التالي:
المرحلة 1: 95 درجة مئوية لمدة 30 ثانية ، مندوب × 1
المرحلة 2: 95 درجة مئوية لمدة 3 ثوان ، 60 درجة مئوية لمدة 30 ثانية ، مندوب × 35
المرحلة 3: 95 درجة مئوية لمدة 15 ثانية ، 60 درجة مئوية لمدة 60 ثانية ، 95 درجة مئوية لمدة 15 ثانية ، مندوب × 1
6. تلطيخ السيتوكين داخل الخلايا (ICS)
ملاحظة: تم تطوير هذا البروتوكول لتقييم استجابة المستجيب لخلايا CD8 + T الخاصة ب H5N1 عن طريق الكشف عن إفراز IFN-γ داخل الخلايا في البط.
- زراعة الخلايا التائية الخاصة ب H5N1 في المختبر باتباع الإجراء الموضح في الخطوة 2. حصاد جميع الخلايا (من كل بئر) بعد 7 أيام من بدء الزراعة.
- احتضان الخلايا العارضة للمستضد (APCs) كما هو موضح في الخطوة 2. أضف ناقلات الجنود المدرعة المحتضنة و Brefeldin A (1: 1,000) إلى الخلايا المستجيبة واحتضانها لمدة 6 ساعات في حاضنة 39 درجة مئوية.
- انقل الخلايا إلى أنبوب طرد مركزي جديد ، وجهاز طرد مركزي عند 440 × جم لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة ، وتخلص من المادة الطافية.
- أضف 100 ميكرولتر من كوكتيل الأجسام المضادة (الفأر المضاد للبط CD8 ، 1:50) إلى الخلايا واحتضنه لمدة 30 دقيقة في الظلام عند 4 درجات مئوية.
- اغسل الخلايا عن طريق الطرد المركزي عند 400 × جم لمدة 5 دقائق عند 4 درجات مئوية وأعد تعليقها في 1 مل من PBS. أضف كوكتيل الأجسام المضادة (IGG2b المترافق مع الماعز IgG2b ، 1:50) واحتضنه لمدة 30 دقيقة في الظلام عند 4 درجات مئوية.
- اغسل الخلايا مرة أخرى عن طريق الطرد المركزي عند 400 × جم لمدة 5 دقائق عند 4 درجات مئوية. تخلص من المادة الطافية ، وأعد تعليق الخلايا في 100 ميكرولتر من المخزن المؤقت للتثبيت ، واحتضن لمدة 20-25 دقيقة في الظلام عند 4 درجات مئوية.
- اغسل الخلايا مرة أخرى عن طريق الطرد المركزي عند 400 × جم لمدة 5 دقائق عند 4 درجات مئوية. أضف 1 مل من 1x المخزن المؤقت للنفاذية واغسل الخلايا 2x عن طريق الطرد المركزي عند 440 × جم لمدة 5 دقائق عند 4 درجات مئوية.
- تخلص من المادة الطافية ، وأعد تعليق الخلايا في 100 ميكرولتر من المخزن المؤقت للنفاذية ، وأضف الجسم المضاد (Mouse Anti-Duck IFN-γ ، 1:10) إلى الخلايا. بعد التثبيت ونفاذية الغشاء ، احتضن خليط الخلية والأجسام المضادة لمدة 30 دقيقة في الظلام ، واهتز أحيانا أثناء الحضانة عند 4 درجات مئوية.
ملاحظة: محلول النفاذية / الغسيل عبارة عن محلول مخزون 10x ويجب تخفيفه باستخدام PBS قبل الاستخدام.
- اغسل الخلايا مرة أخرى ب 1 مل من PBS عن طريق الطرد المركزي عند 400 × جم لمدة 5 دقائق عند 4 درجات مئوية. أضف 100 ميكرولتر من كوكتيل الأجسام المضادة (الماعز المترافق ب PE IgG3 ، 1: 250) واحتضنه لمدة 30 دقيقة في الظلام عند 4 درجات مئوية.
- تحليل البيانات باستخدام برنامج FlowJo. يتم عرض استراتيجية البوابات في الشكل 1.