$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
تتطلب جميع الخطوات تقنية معهرة، ومواد معقمة، وكواشف، وتنفذ في خزانة سلامة حيوية لتقليل تعرض الموظفين للمواد الخطرة البيولوجية وتلوث المزارع. المواد المستخدمة والمواد المستخدمة مدرجة في جدول المواد.
1. زراعة الخلايا وإنشاء مخزونات الخلايا
- قبل تكوين الخلايا العضوية، كانت تزرع خلايا A549 وMRC-5 على قوارير بلاستيكية معالجة بزراعة الأنسجة القياسية (T75سم 2) حتى تصل إلى حوالي 70٪-80٪ باستخدام وسط النسر المعدل من دولبيكو (DMEM) مع 10٪ مصل بقري جنيني (FBS) و1٪ بنسلين-ستريبتوميسين، ويشار إليه هنا باسم "DMEM الكامل".
- لكل من A549 و MRC-5، قم بالبذور بمقدار 2 × 104 خلايا/سم2، بحجم إجمالي 10 مل DMEM كامل. زراعة الخلايا عند 37 درجة مئوية مع 5٪ ثاني أكسيد الكربونفي بيئة رطبة حتى يصل إلى حوالي 70٪-80٪ من التقاء البعض.
- استبدل وسط الزراعة كل 48 ساعة لضمان أفضل ظروف نمو.
- الزراعة الفرعية عن طريق استنشاق جميع الوسائط من القارورة بمجرد أن تصل إلى 70٪-80٪، ثم تغسل مرة واحدة بمحلول ملحي دافئ مخزن بالفوسفات (PBS)، ثم أضف 4 مل من تريبسين-إيدتا.
- حضن على حرارة 37 درجة مئوية لمدة 5 دقائق وتصور القوارير باستخدام مجهر سbrightfield لضمان الانفصال التام. قم بالتحييد بإضافة 4 مل من DMEM كامل.
- عد الخلايا باستخدام التقنية المختارة، مثل عد الاستبعاد الأزرق التريباني.
- قم بعمل نظام الطرد المركزي في تعليق الخلية عند 200 × g لمدة 5 دقائق.
- استنشق الفائق لترك حبيبة خلية في أسفل الأنبوب المخروطي. أعد تعليق حبيبة الخلية في حجم مناسب من DMEM الكامل عن طريق التفجير بلطف.
- للتجميد، أعد تعليقها في وسط كامل يحتوي على 10٪ DMSO لإنتاج 1 ×10 6 خلايا/مل. لتكوين العضوات، أعد تعليقها للحصول على 1 ×10 6 خلايا/مل.
2. تأسيس وتوصيف نضج نموذج عضوي ثلاثي الأبعاد للأحمر الظهاري-الأرومي الليفي
ملاحظة: يجب إذابة مصفوفة القبو على الثلج طوال الليل وحفظها على الثلج خلال هذه الخطوات. درجات الحرارة الأعلى يمكن أن تسبب تصلب المصفوفة.
- حضر مزيجا بنسبة 2:3 من مصفوفة القبو وDMEM المتقدم. أضف 300 ميكرولتر من هذا المحلول إلى كل بئر من صفيحة مكونة من 24 بئرا، لضمان تغطية قاع كل بئر بشكل متساو. حضن الصفيحة عند حرارة 37 درجة مئوية في حاضنة رطبة لمدة ساعة واحدة للسماح للمصفوفة بالتصلب.
- جهز محلول مصفوفة قاعدة بنسبة 5٪ في DMEM كامل، والذي سيكون وسط الزراعة للعضويات. لكل بئر، اصنع 1.2 مل من هذا المحلول عن طريق تخفيف 60 ميكرولتر من مصفوفة القاعدة في 1,140 ميكرولتر من DMEM الكامل.
- خلال الفترة التي يتصلب فيها خليط مصفوفة القاعدة، اخلط 300,000 خلية A549 مع 30,000 خلية MRC-5 في 200 ميكرولتر من محلول مصفوفة القاعدة بنسبة 5٪ المصنوع ب DMEM كامل كما هو موصوف في الخطوة 2.2.
- بمجرد أن يتصلب خليط القاعدة بنسبة 2:3، يتم استخدام الماصة 200 ميكرولتر من خليط A549/MRC-5 على المصفوفة المجهلة، ثم تعيد صفيحة 24 بئر إلى الحضانة عند حرارة 37 درجة مئوية، مع 5٪ ثاني أكسيد الكربون لمدة 21 يوما للسماح بالنمو والتمايز بين الأعضاء السنيخية.
- تخيل الثقافات تحت المجهر الضوئي لمدة 48 ساعة القادمة. يجب أن تتجمع الخلايا خلال هذه الفترة الزمنية.
- استبدل محلول مصفوفة القبو/DMEM بنسبة 5٪ كل 48 ساعة ب 200 ميكرولتر من الوسط الطازج بنسبة 5٪. لتجنب إزعاج الأعضاء المدمجة في الهيدروجيل، قم بإمالة الصفيحة بلطف حتى يتجمع المحلول القديم على طول جدار البئر قبل الشفط.
- في الأيام 3 و9 و21 من النضج، قم بتصوير الأعضاء بزاوية تكبير موضوعي 10 أضعاف والتقاط أربع صور أو مجالات رؤية تمثيلية لكل بئر. تظهر صور تمثيلية لشكل العضويات المبكر في الأيام 3 و9 و21 في الشكل 1.
- لكل مجال رؤية، عد جميع الأعضاء التي يزيد قطرها عن 50 ميكرومتر. باستخدام المساحة المعروفة من مجال الرؤية، استنتج متوسط العدد الكلي للعضويات العضوية في البئر من متوسط العد لكل حقل، بافتراض أن مساحة سطح صفيحة تضم 24 بئرا تبلغ 1.9 سم².
ملاحظة: يمكن إجراء هذه التحليلات باستخدام برامج تحليل الصور مثل Fiji13.
- يمكن أيضا قياس متوسط قطر ومساحة العضوية للحصول على معلومات كمية حول خصائص نمو العضويات في الزراعة.
3. جمع الأعضاء ثلاثية الأبعاد في الخلايا الليفية الظهارية ثلاثية الأبعاد
ملاحظة: يجب تنفيذ جميع خطوات جمع الأورجينويدات على الجليد.
- بعد 21 يوما من النضج، استنشق المادة الفائقة واغسل بلطف بحوالي 1-2 مل من PBS البارد جدا.
- أضف 1-2 مل من محلول الحصاد العضوي البارد وحضن اللوح عند 2-8 درجة مئوية لمدة 30-90 دقيقة مع هز معتدل.
ملاحظة: أوقف الحضانة عندما ترى العضويات تطفو في قاع البئر.
- راقب الانفصال باستخدام مجهر الحقل المضيء. يعتبر التفكك مكتملا بمجرد أن تختفي مصفوفة القاع في قاع البئر وتصبح الأعضاء معلقة. يمكن استخدام مكشطة الخلايا لتحريك الهيدروجيل المصفوفة العضوية القاعدية بلطف لتسريع العملية.
- اجمع محتويات جميع الآبار في أنبوب مخروطي بسعة 50 مل على الجليد.
- الطرد المركزي عند 500 × جرام لمدة 5 دقائق عند 2-8 درجات مئوية. استنشق السوبرناتانت، وغسل الحبيبة العضوية ب 1-2 مل من PBS البارد جدا، ثم استخدم الطرد المركزي مرة أخرى للحصول على حبيبة. استنشق PBS.
4. تأسيس عضويات الأرومات الليفية المدمجة في الكولاجين ثلاثي الأبعاد وتطبيق الإجهاد الميكانيكي
ملاحظة: استخدم ألواح زراعة رغوة دائرية مع مراسي رغوية متوافقة مع مفاعل حيوي يمدد الخلايا. لوحة الزراعة المستخدمة في هذا البروتوكول لها مساحة نمو ~6.6 سم2.
- حضر محلول يعمل من جل الكولاجين I بسعة 2 ملغ/مل. يجب أن يحتوي المحلول على 1× PBS، 11.4 ملليمولار NaOH، و2 ملغ/لتر كولاجين I، مع تعديل الحجم النهائي باستخدام ماء معقم. حضر 2 مل من محلول الكولاجين I هذا لكل بئر من صفيحة الفوم الدائرية ذات 6 آبار.
- أضف 1 مل من محلول الكولاجين I بسعة 2 ملغ/مل إلى مثبتات الرغوة على أطراف اللوحة، لضمان التشبع الكامل.
ملاحظة: يجب أن تكون مثبتات الرغوة مشبعة تماما بمحلول الكولاجين I لضمان الالتصاق الصحيح. يمكن أن يؤدي التشبع غير الكامل إلى انفصال هلام الكولاجين أثناء تطبيق الإجهاد الميكانيكي، مما يؤدي إلى تقليل الانفعال مقارنة بالهدف المقصود.
- أعد تعليق الحبيبة العضوية في 6 مل من 2 ملغ/مل من كولاجين ذيل الجرذ والماصة 1 مل من التعليق في وسط صفيحة رغوة دائرية ذات 6 آبار، لضمان اختلاط خليط الكولاجين العضوي مع الكولاجين الخالي من العضوية المضاف إلى مراسي الرغوة الدائرية.
ملاحظة: تجنب توليد فقاعات عند إضافة التعليق العضوي إلى كل بئر.
- قم بلمرة الكولاجين-I لمدة ساعة واحدة بترك الصفائح في الحاضنة (37 درجة مئوية، 5٪ ثاني أكسيد الكربون2). بعد البلمرة، يجب أن يبدو الجل عكرا.
- أضف 2 مل من DMEM الكامل فوق عضويات A549/MRC5 المدمجة ثلاثية الأبعاد في الكولاجين وأعد الصفيحة إلى الحاضنة لمدة 24 ساعة.
- استبدل وسط الزراعة ب DMEM + 1٪ FBS وحضنه طوال الليل قبل التعرض للإجهاد الميكانيكي.
5. إعداد المفاعل الحيوي لتمديد الخلايا والتعرض للإجهاد الميكانيكي
- أدخل محطات تحميل في كل بئر من قاعدة القاعدة. تحتوي هذه على ستة أعمدة تحميل قطرها 25 مم، تسمح للغشاء المرن لألواح قطار الأنسجة بالتشوه حولها وتعريض الثقافة ثلاثية الأبعاد لإجهاد متساوي المحور.
- ضع طبقة رقيقة من شحم السيليكون على أعلى أعمدة التحميل.
- ضع حشوات حمراء في أسفل كل صفيحة ذات 6 آبار.
- أدخل الألواح المحضرة في لوحة القاعدة فوق أعمدة التحميل.
- انقل هذا الجهاز إلى حاضنة رطبة بدرجة حرارة 37 درجة مئوية مع 5٪ ثاني أكسيد الكربونوتوصيل وصلات الفصل السريع إلى لوحة الأساس. كرر الخطوات من 5.1 إلى 5.6، مع حذف الوصلات لإنشاء تحكم غير مجهد.
ملاحظة: اختياريا، يمكن تطبيق سدادة ختم الأنبوب، التي تمنع تطبيق الضغط الفراغي في قاع بئر BioFlex واحد، مما يسمح بتوليد ثقافة تحكم غير متجهدة على نفس اللوحة.
- غطها بورقة بليكسي غلاس وأضف ~5-10 أرطال من الوزن لضمان إحكام الإغلاق الكامل.
- شغل ضاغط الهواء وافتح صمام الخروج من ضاغط الهواء.
- شغل مضخة الضغط الفراغية وافتح صمام خزان الضغط المتصل بتدفق خزان التفريغ. تأكد من أن ضغط الفراغ حوالي 90 كيلو باسكال.
- افتح صمام التدفق من ضاغط الهواء الموجود بالقرب من وحدة تحكم المفاعل الحيوي. اضبط الضغط بحيث لا يتجاوز 15 PSI عند منفذ التهوية.
- شغل البرنامج المدمج وضبط معايير الإجهاد الميكانيكي الدوري المطلوب. في هذه الدراسة، تم استخدام نظام بسعة إجهاد 18٪ عند 0.4 هرتز لمدة 24 ساعة. لتكوين ذلك، أنشئ نظاما جديدا، واضبط الحد الأدنى للإطالة إلى 0٪، وأقصى استطالة إلى 18٪، وابدأ البروتوكول.
- راقب الصفيحة والغشاء لضمان أن الحركة مرئية طوال جلسة الإجهاد. يجب أن يكون الغشاء يتشوه حول أعمدة التحميل.
- افحص مصيدة الماء بحثا عن رطوبة بشكل دوري، وراقب شاشة الكمبيوتر لمعرفة مدة التشغيل، والتقدم، والشكل المناسب لنظام الإجهاد.
- افصل تجميع الصفائح الأساسية عند اكتمال نظام الإجهاد، وأعد المزارع المجهدة إلى الحضانة لمدة 24 ساعة قبل تحليلات التوصيف في مرحلة لاحقة.
- قم بإيقاف تشغيل النظام وتفكيكه بترتيب عكسي عند بدء التشغيل: أغلق أو أغلق صمام تدفق ضاغط الهواء، ثم صمام خزان الضغط، مضخة الضغط الفراغي، صمام خروج ضاغط الهواء، وأخيرا ضاغط الهواء بهذا الترتيب.
- اجمع المادة الفائقة بعد 24 ساعة من الحضانة بعد التعرض للإجهاد الميكانيكي. خزن عند -80 درجة مئوية حتى الاستخدام.
6. التوصيف الموركولوجي للعضويات عبر التألق المناعي
- اغسل نموذج جل الكولاجين العضوي ثلاث مرات باستخدام PBS بإضافة 1 مل PBS برفق، مع حضانه لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة.
- استنشق PBS بعناية وكرر عملية الغسل ثلاث مرات إجمالا.
- تثبيت النموذج عن طريق حضانة 2 مل من بارافورمالديهايد 4٪ لمدة ساعة واحدة عند 4 درجات مئوية.
- اغسل النماذج ثلاث مرات باستخدام PBS كما هو موضح أعلاه.
- استخدم مشرطا لقطع مراسي الرغوة الدائرية في الآبار المرنة مع الجل المرفق بلطف وضعه في طبق بتري.
- قم بنفاح الأعضاء عن طريق حضانها ب 2 مل من ترايتون X-100 بنسبة 0.1٪ في PBS لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة.
- اغسل النماذج ثلاث مرات باستخدام PBS.
- حجب الارتباط غير النوعي عن طريق حضنة النماذج ب 3 مل من ألبومين مصل البقري 5٪ (BSA) في PBS لمدة ساعة واحدة في درجة حرارة الغرفة. أزل محلول الانسداد وانتقل إلى الخطوة التالية.
- حضن النماذج طوال الليل عند 4 درجات مئوية مع مزيج تلوين يحتوي على زونولا أوكلودينز-1 (ZO-1) مضاد للإنسان (ZO-1) مرافق مع أليكسا فلور 594 عند تخفيف 1:100، والفالويدين المصاحب مع أليكسا فلور 488 عند تخفيف 1:1000 لتقييم F-actin، والصبغة النووية، DAPI عند تخفيف 1:4000. التخفيف هو 1 مل من 1٪ BSA في PBS. قم بلصق حواف الصفيحة قبل الحضانة عند 4 درجات مئوية.
- استنشق محلول الكوكتيل الملون في اليوم التالي واغسل النماذج ثلاث مرات باستخدام PBS.
- صور باستخدام مجهر كونفوكال وخذ مكدسات Z عند شرائح 5 ميكرومتر من الأعضاء الممثلة بتكبير موضوعي 40x.
- تحليل شدة الفلورة باستخدام برنامج تحليل الصور في فيجي. تطبيع متوسط شدة الفلورة مع مساحة العضوي لضمان المقارنة الدقيقة عبر ظروف بيئية مختلفة.
7. التوصيف الوظيفي للعضويات من خلال اختبار السمية الخلوية ELISA وLDH لديهيدروجيناز اللاكتات
- قم بإذابة المواد الفائقة على الجليد وتقييم إفراز الإنترلوكين-6 (IL-6) والإنترلوكين-8 (IL-8) باستخدام مجموعات ELISA المتوفرة تجاريا وفقا لبروتوكول الشركة المصنعة.
- تقييم إفراز LDH، وهو مؤشر على السمية الخلوية، باستخدام اختبار امتصاص LDH متوفر تجاريا.
- توليد منحنى قياسي باستخدام بروتين LDH المؤتلف بتركيزات نصف لوغاريتمية من 0.5 ميكروغرام إلى 0.5 نانوغرام. استيفاء تركيزات LDH من كل عينة باستخدام المنحنى القياسي.
8. اختياري: عزل العينات لتحليل الحمض النووي الريبي أو البروتين
- بدلا من إضافة 4٪ بارافورمالديهيد لصبغ التلوين المناعي، أضف محلول RLT محضر يحتوي على β-ميركابتوإيثانول بمعدل 10 ميكرولتر لكل 1 مل من RLT.
- استخدم 300 ميكرولتر لكل نموذج واستخدم الماصة للأعلى والأسفل لفصل الخلايا وتحليلها بالكامل.
- انقل الليزات إلى أنبوب طرد مركزي دقيق خال من RNase وضع الأنابيب على الثلج الجاف لتتجمد بسرعة. الانتقال إلى -80 درجة مئوية للتخزين طويل الأمد.
ملاحظة: بدلا من ذلك، يمكن استخدام مخزن RIPA لاستخراج البروتين عن طريق تحضير: 50 ملي مولار Tris-HCl، درجة الحموضة 7.4-7.5؛ 150 مللي مولار NaCl; 1٪ NP-40 أو Triton X-100؛ 0.5٪ ديكوسيكولات الصوديوم؛ 0.1٪ SDS في المياه منزوعة الأيون. مخزن RIPA الجاهز متوفر أيضا تجاريا.
- أضف 200 ميكرولتر لكل نموذج، ثم اضع الحجر على الجليد لمدة 5 دقائق، ثم اجمع الليزات.
- قم بتدوير بحرارة 15,000 × g لمدة 10 دقائق عند 4 درجات مئوية لتكوين حطام خلايا الحبيبات ثم انقله إلى -80 درجة مئوية للتخزين طويل الأمد.