تمت الموافقة على جميع التجارب الحيوانية من قبل لجنة رعاية واستخدام الحيوانات المؤسسية في جامعة بكين للطب الصيني (BUCM-2024110107-4103).
جمع المكونات والأهداف النشطة
يتكون YGP من Rehmannia glutinosa، Aconitum carmichaelii، Cinnamomum cassia، Dioscorea opposita، Cornus officinalis، Cuscuta chinensis، Angelica sinensis، Eucommia ulmoides، Cervi Cornus Colla، وLycium barbarum. تم إدخال أسماء هذه الأعشاب في قاعدة بيانات وتحليل أنظمة الطب الصيني التقليدية (TCMSP) لاسترجاع مركباتها. تم فحص المركبات الفعالة باستخدام معايير التوافر الحيوي الفموي (OB ≥ 30٪) ومعايير الشبه الدوائي (DL ≥ 0.18) 19,20,21. تم الحصول على الأهداف المقابلة لكل مركب من TCMSP وتوحيدها على رموز جينية باستخدام قاعدة بيانات UniProt. تم استرجاع الأهداف المتعلقة بالتهاب البروستاتا من قاعدة بيانات GeneCards باستخدام كلمة "التهاب البروستاتا" ككلمة مفتاحية، وتم اختيار جينات ذات درجة ذات صلة أعلى من المتوسط للإدراج في الدراسة.
بناء شبكة تنظيمية لبرنامج YGP ضد التهاب البروستاتا
تم تحديد وتعريف التقاطع بين الأهداف المرتبطة ب YGP ومرتبط بالتهاب البروستاتا كمجموعة من الأهداف العلاجية المحتملة. تم استيراد هذه الأهداف إلى Cytoscape (الإصدار 3.9.1) لبناء شبكة مركبة وهدف مرضية. تم إجراء تحليل طوبولوجيا الشبكة باستخدام إضافة CytoHubba، وتم تحديد المكونات الرئيسية بناء على قيم مركزية الكليك القصوى (MCC)22.
تحليل شبكة تفاعل البروتين والبروتين (PPI)
تم استيراد الأهداف المتداخلة إلى قاعدة بيانات STRING (الإصدار 11.5)، مع تعيين الكائن الحي على الإنسان العاقل. تم تعيين الحد الأدنى لدرجة التفاعل المطلوبة إلى ≥ 0.7، وتم إخفاء العقد غير المتصلة23. تم تصدير بيانات التفاعل بصيغة TSV وعرضها في Cytoscape. تم تحديد جينات المركز أيضا باستخدام إضافة CytoHubba بناء على مركزية الدرجة.
تحليل مسار KEGG وتحليل إثراء GO
تم رفع الأهداف المشتركة إلى منصة Metascape لتحليل مسار موسوعة كيوتو للجينات والجينومات (KEGG). تم تعيين أنواع المدخلات والتحليل على الإنسان العاقل. تم إجراء تحليل إثراء مسار KEGG. تم تصفية المسارات بشكل أكبر بناء على صلتها بالتهاب البروستاتا، كما حددتها الأدبيات المنشورة والتعليقات التوضيحية في قواعد البيانات. تم ترتيب المسارات المتبقية وفقا لقيم Log P الخاصة بها. تم تصور مسارات KEGG الأعلى المثرية باستخدام مخططات الفقاعات.
الالتحام الجزيئي
تم اختيار الأهداف الرئيسية من شبكة PPI بناء على مركزية الدرجة، وتم تحديد المركبات الفعالة من شبكة تنظيم YGP-التهاب البروستاتا بناء على قيم MCC لتحليل الالتحام لاحقا. تم الحصول على هياكل البروتين من قاعدة بيانات AlphaFold لبنية البروتين بصيغة PDB، وتم تحميل هياكل الليغاند من TCMSP بصيغة mol224. تم إجراء الالتحام الجزيئي باستخدام منصة CB-Dock2 الإلكترونيةرقم 25. قبل التحم، كانت هياكل البروتينات تتم معالجتها مسبقا تلقائيا عن طريق إزالة جزيئات الماء، وإضافة ذرات الهيدروجين، وإكمال البقايا المفقودة. تم تسجيل تقارير الربط، وتم إنشاء خرائط حرارة باستخدام GraphPad Prism (الإصدار 10.1.2). تم تصور البنى ثلاثية الأبعاد لمجمعات الليغاند-البروتين ذات أدنى درجات فينا باستخدام كيميراكس، وتم إنشاء مخططات تفاعلية ثنائية الأبعاد باستخدام LigPlus.
تحضير المستخلص المائي من YGP
تم تحضير المكونات العشبية في YGP وفقا لنسبة التركيب التقليدية، بما في ذلك 24 جرام من الجذر المعالج لريهمانيا غلوتينوزا (شوديهوانغ)، 6 جرام من الجذر الجانبي المعالج لأكونيتوم كارميكايلي (فوزي)، 6 جرام من لحاء سيناموموم كاسيا (روغوي)، 12 جرام من جذور ديوسكوريا المقابل (شانياو)، 9 جرام من ثمرة كورنوس أوفيسيناليس (شانزويو)، 12 جرام من بذور Cuscuta chinensis (توزيزي)، 12 جرام من جيلاتين قرون المعالجة من Cervi Cornus colla (Lujiaojia)، 12 جرام من ثمرة Lycium barbarum (غوكي)، 9 جرام من جذر Angelica sinensis (دانغغوي)، و12 جرام من لحاء Eucommia ulmoides (دوجونغ). تم نقع جميع الأعشاب باستثناء Aconitum carmichaelii وCervi Cornus Colla في 6 أضعاف وزنها الكلي للماء المقطر لمدة 30 دقيقة، بينما تم نقع Aconitum carmichaelii بشكل منفصل في 6 أضعاف وزنه من الماء المقطر. تم إخراج أكونيتوم كارميكايلي أولا باستخدام جهاز تسخين كهربائي لمدة ساعة واحدة، وبعد ذلك تضاف الأعشاب المتبقية باستثناء سيرفي كورنوس كولا وتتقط مرتين لمدة ساعة في كل دورة. تم إذابة Cervi Cornus Colla لاحقا في حمام ماء عند 60–70 درجة مئوية حتى تذوب بالكامل وتدمج في المستخلص. بعد التبريد، كان يتم ترشيح المحلول عبر شاش مزدوج الطبقات، ثم يرفع على الكوكوت، ويجمد عند -20 درجة مئوية لمدة 48 ساعة، ثم يزرع بالليوفيبيلات للحصول على مستخلص مسحوق.
نموذج الحيوان وتصميم التجارب
تم تربية ذكور فئران سبراج-داولي (عمرها 8 أسابيع، وزنها 200–220 جرام) في ظروف خالية من الممرضات مع دورة ضوء/ظلام مدتها 12 ساعة وسهولة الوصول إلى الطعام والماء. بعد أسبوع واحد من التكيف، تم تقسيم الفئران عشوائيا إلى ثلاث مجموعات (n = 6 لكل مجموعة): مجموعة الضابطة، النموذج، ومجموعات YGP. تم تحفيز التهاب البروستاتا المزمن عن طريق حقن محلول كاراجينان بنسبة 3٪ داخل البروستاتا26. لفترة وجيزة، تم تخدير الفئران بالأيزوفلوران (3–4٪ للتحفيز و1.5–2٪ للصيانة)، وأجري شق بطني في منتصف الخط لكشف البروستاتا. تم حقن ما مجموعه 25 ميكرولتر من محلول كاراجينان بنسبة 3٪ في كل فص بطني من البروستاتا. تلقت مجموعة الضابطة حقنا داخل البروستاتا بمحلول ملحي طبيعي (محلول ملحي فسيولوجي) فقط. تم إعطاء البنسلين بعد العملية (2.5 ×10 5 يو/كجم) عن طريق العضلات لمدة 3 أيام.
تم تحضير مسحوق المستخلص المحمر من الليوفيل من المحلول الصناعي وأعيد تشكيله في محلول ملحي عادي معقم بنسبة 0.9٪ للحصول على تعليق موحد للجفاف الفموي (10.54 جم/كجم/يوم). تلقت الفئران في مجموعة YGP إعطاءا فمويا لمستخلص YGP (10 مل/كغ)، بينما حصلت مجموعات الضابطة والنماذج على حجم مكافئ 0.9٪ من محلول ملحي طبيعي معقم. بعد 4 أسابيع، تم تخدير الفئران بالبنتوباربيتال الصوديوم (50 ملغ/كجم، حقن داخل الصفاق)، وتم جمع أنسجة البروستاتا بعد التضحية بها وفقا للإرشادات الأخلاقية.
الفحص النسيجي المرضي
تم تثبيت أنسجة البروستاتا في 4٪ بارافورمالديهيد لمدة 24 ساعة، ثم تم تجفيفها عبر الإيثانول الدرج (75٪ كحول لمدة 4 ساعات، 85٪ كحول لمدة ساعتين، 90٪ كحول لمدة ساعتين، 95٪ كحول لمدة ساعة واحدة، إيثانول مطلق لمدة ساعة واحدة)، وتم تطهيرها في الزيلين، ودمج البارافين. ثم خضعت الأقسام (4–5 ميكرومتر) لتلوين انفجارات عالية وفق الإجراءات القياسية27. لفترة وجيزة، تم إزالة البارافين، وإعادة ترطيبها، وصبغها بالهيماتوكسيلين، وتمييزها، وصبغها بالإيوزين. بعد الجفاف والتثبيت، تمت ملاحظة المقاطع تحت المجهر الضوئي لتقييم نسيجي مرضي.
تم تقييم الالتهاب النسيجي المرضي باستخدام نظام تسجيل شبه كمي يعتمد على تسرب الخلايا الالتهابية، وتكاثر الخلايا الليفية، وشكل الأسينار، وحالة الإفراز في الجسم. تم تقييم تسرب الخلايا الالتهابية بأنه 0 (عدم تسلل)، 2 (تسرب خفيف)، 4 (تسرب متوسط)، و6 (تسرب شديد). تم تصنيف تكاثر الأرومات الليفية إلى 0 (غائب)، 1 (خفيف)، 2 (متوسط)، و3 (شديد). تم تقييم شكل التجويف الأكيناري على النحو التالي: 0 (تجويف حزينة كبير)، 1 (حجم تجويف منخفض بشكل متوسط)، 2 (حجم التجويف منخفض بشكل ملحوظ)، و3 (انسداد أو اختفاء الحرابة الأكينارية). تم تقييم حالة الإفراز على النحو التالي: 0 (إفراز وفير)، 1 (إفراز متوسط)، 2 (إفراز قليل)، و3 (غياب الإفراز). تم حساب الدرجة النسيجية الكلية كمجموع لجميع المعايير الأربعة، مع المؤشرات الأعلى التي تشير إلى إصابة نسيج البروستاتا الأكثر شدة والتهاب28.
إليسا
تم شطف أنسجة البروستاتا (100 ملغ) بمحلول ملحي مخزن بالفوسفات البارد (PBS) وتم توحيدها في محلول تحلل مع مكمل مثبطات للبروتيياز. تم حضن التجانسات عند 4 درجات مئوية لمدة 30–120 دقيقة وطرد مركزها عند 5000 × جرام لمدة 15 دقيقة عند 4 درجات مئوية لجمع المواد الفائقة. تم قياس مستويات البروتين في TNF-α وIL-6 باستخدام مجموعات ELISA وفقا لتعليمات الشركة المصنعة. تمت إضافة المعايير والعينات إلى صفائح 96 بئرا وحضنتها عند 37 درجة مئوية، تلتها حضانة متتالية مع الأجسام المضادة البيوتينيلية والإنزيمات المترافقة. بعد الغسيل، أضيف محلول الركيزة لتطوير اللون، وتم إنهاء التفاعل بمحلول الإيقاف. تم قياس الامتصاص عند 450 نانومتر باستخدام قارئ ميكروبلايت. تم حساب تركيزات السيتوكين بناء على منحنيات قياسية.
qRT-PCR
تم استخراج إجمالي الحمض النووي الريبي من أنسجة البروستاتا باستخدام طريقة عمودية وقياسه بقياس الامتصاص عند 260 و280 نانومتر لتقييم النقاء. تم نسخ عينات الحمض النووي الريبي عكسي إلى cDNA عند 42 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة باستخدام مجموعة النسخ العكسي. تم إجراء qRT-PCR باستخدام جهاز دورة حرارية تحت الشروط التالية: إزالة الطبيعة الأولية عند 95 درجة مئوية لمدة 3 دقائق، تليها 40 دورة من 95 درجة مئوية لمدة 10 ثوان و60 درجة مئوية لمدة 30 ثانية. تسلسلات البادئات المستخدمة في هذه الدراسة مدرجة في الجدول التكميلي 1. تم جمع إشارات الفلورة خلال خطوة التلدين/التمديد. تم تطبيع مستويات تعبير TNF-α وIL-6 إلى الجين المرجعي الداخلي GAPDH. تم حساب التعبير الجيني النسبي باستخدام طريقة 2−ΔΔCt .
التحليل الإحصائي
تعرض جميع البيانات كمتوسط ± انحراف معياري (SD). تم إجراء تحليلات إحصائية باستخدام برنامج GraphPad Prism (الإصدار 10.1.2). تم تقييم توزيع البيانات للاستقرار قبل التحليل. تم تحليل الفروقات بين مجموعات متعددة باستخدام تحليل التباين أحادي الاتجاه (ANOVA) تلاه اختبار توكي بعد الوقوع للمقارنات المتعددة. تم اعتبار قيمة p < 0.05 ذات دلالة إحصائية.