Name: تغيير طبيعة الكهربائي جل التدرج (DGGE) (فيديو) | JoVE Journal
Uploaded: 2007-02-25T00:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 52 s
Description: تعلم تقنية DGGE لتحليل التنوع الجيني في مجتمعات البكتيريا الحيوية باستخدام تسلسل 16S rRNA. تساعد هذه الطريقة الباحثين على دراسة ديناميكيات المجتمعات الميكروبية بدقة.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

ليس لدى المؤلفين أي تضارب في المصالح للإفصاح عنه.

تغيير طبيعة الكهربائي جل التدرج (dgge)

Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE)

تغيير طبيعة الكهربائي جل التدرج (DGGE)

مرحباً، اسمي سيليست بيترسون، وأنا زميلة في جامعة هارفارد أدرس مجتمعات الغشاء الحيوي الميكروبي. لذا، أقوم بتحليل المجتمعات البكتيرية من خلال فحص تسلسل 16S rRNA وكيفية تغير هذا التسلسل عبر الزمن والمكان. ولتحقيق ذلك، أستخدم تقنية DGGE.هذا ليس تشغيلاً طبيعياً للعين، إذ يجب الحفاظ على درجة حرارة 60 درجة عند التشغيل، كما يجب ضخ المحلول المنظم باستمرار. لذا، سنقوم بتدفئة المحلول المنظم لمدة ساعة تقريباً حتى يصل إلى 60 درجة، ومن ثم يمكننا تشغيل المنشفة. سأقوم الآن بغسل هذه اللوحة بمحلول uc مخفف، مع البحث عن الشوائب، ومن ثم إضاءتها.يمكن لأي شيء من هذا القبيل أن يتسبب في حدوث عدم انتظام. من المهم مسح جميع آثار المياه. لذا، عند تجميع الهلام، سأضع تلك الشريحة على الجانب الخارجي من الهلام.وبذلك سيكون الهلام بين هاتين القطعتين من الزجاج، بينما تكون الشريحة في الخارج ولن تؤثر على الهلام الموجود بينهما. والآن سأقوم بتجميع الهلام في هذه المشابك، ثم أضغطهما معاً وأقوم بإحكامهما عن طريق التدوير جهة اليمين. وكما هو الحال مع أي هلام، من المهم التأكد من أن الجزء السفلي مستوٍ تماماً.ولمنع التسرب، نقوم الآن بقلب الهلام ووضعه هنا ليتم إحكامه باستخدام الحاشية. لذا من المهم عند القيام بذلك أن تكون الصفائح محاذية تماماً للحاشية هنا. بعد ذلك، يتم إدخال هذه المقابض الجانبية والضغط لأسفل لإتمام عملية الإحكام.هذ

denaturing-gradient-gel-electrophoresis-dgge

Research

JoVE Journal

Biology

علم الأحياء

تغيير طبيعة استخدام هلام بولي أكريلاميد الكهربائي لفصل واحد اليوريا الذين تقطعت بهم السبل الحمض النووي الريبي أو تصل إلى حد 500 النيوكليوتيدات. اليوريا في تركيبة مع عينات يبدل طبيعة الحرارة وضيق واحد غير منظمة الهجرة داخل المصفوفة هلام وفقا لوزنها الجزيئي.

تغيير طبيعة جل بولي أكريلاميد الكهربائي اليوريا (PAGE اليوريا)

يوصف بروتوكول الأساسية للانفصال شظايا من الحمض النووي باستخدام الجل الاغاروز الكهربائي.

الاغاروز الكهربائي للهلام لفصل أجزاء الحمض النووي

يوضح هذا الفيديو الفصل القائم على الرحلان الكهربائي ثنائي الأبعاد لألياف الأميلويد المنظفات شبه المتمسخة. تفصل هذه التقنية مجاميع الأميلويد متعددة الأشكال بناء على حجمها غير المتجانس.

الرحلان الكهربائي لجل الاغاروز ثنائي الأبعاد شبه المتغير: تقنية لفصل ألياف الأميلويد متعددة الأشكال بناء على عدم تجانس الحجم

&lt; p class = "jove_content"&gt;في هذا الفيديو ، نوضح طريقة الرحلان الكهربائي للهلام ثنائي الأبعاد التي تفصل البروتينات الفردية عن خليط بروتيني معقد يتم الحصول عليه من أنسجة الورم الورمي الحميد النخامي البشري غير الوظيفي (NFPA). يتم فصل البروتينات بناء على شحنتها الكهربائية في البعد الأول ويتم فصلها بشكل أكبر بناء على الأوزان الجزيئية في البعد الثاني.

الرحلان الكهربائي لجل بولي أكريلاميد ثنائي الأبعاد: تقنية فصل لتحليل البروتينات في خليط البروتين المركب بناء على الشحنة والوزن الجزيئي

لا يزال الكشف السريع والقياس الكمي الموثوق به لأحداث تحرير الحمض النووي الريبي على نطاق الجينوم أمرا صعبا ويعتمدان حاليا على طرق تسلسل الحمض النووي الريبي المباشرة. يستخدم البروتوكول الموصوف هنا الرحلان الكهربائي الهلامي المتدرج في درجة الحرارة الدقيقة (μTGGE) كطريقة بسيطة وسريعة ومحمولة للكشف عن تحرير الحمض النووي الريبي.

نهج غير تسلسلي للكشف السريع عن تحرير الحمض النووي الريبي

هذا الفيديو يوضح بروتوكول لفحص الأوعية الدموية في المختبر الذي يلخص مراحل عديدة من الأوعية الدموية. وتظهر -- الوقت الفاصل بين الصور التي تنتشر من وتشكيل التجويف ، والمتفرعة مفاغرة -- الملامح الرئيسية الأوعية الدموية.

الفحص الأمثل الفايبرين الخرزة جل لدراسة الأوعية الدموية

وصفنا بروتوكولا للالتصنيع الدقيق للجهاز لتوليد ميكروفلويديك التدرج التي يمكن أن تولد التدرجات المكاني والزماني في المكروية محددة جيدا. في هذا النهج ، يمكن استخدام الجهاز لتوليد التدرج ميكروفلويديك لدراسة موجهة الهجرة الخلية ، الجنيني ، التئام الجروح ، وورم خبيث من السرطان.

جهاز لتوليد التدرج ميكروفلويديك لبيولوجيا الخلية

SDD - AGE هو تقنية مفيدة للكشف وتوصيف اميلويد مثل البوليمرات في الخلايا. هنا علينا أن نظهر للتكيف الذي يجعل هذه التقنية قابلة للتطبيقات واسعة النطاق.

الكشف عن تجميع اميلويد بواسطة تغيير طبيعة شبه الكهربائي جل منظفات - Agarose

نحن تصف طريقة لاستخراج الحمض النووي عالية الوزن الجزيئي الجينومية من الكتلة الحيوية العوالق ركزت على 0.22 ميكرون Sterivex المرشحات ، تليها السيزيوم كلوريد كثافة الطرد المركزي لتنقية الانحدار.

استخراج الحمض النووي من 0.22 ميكرومتر Sterivex فلاتر والسيزيوم كلوريد التدرج الكثافة الطرد المركزي

في هذا الفيديو ، وصفنا توصيف المجمعات multiprotein (البلدان المتوسطية الشريكة) من الأزرق الأصلي بولي أكريلاميد الكهربائي للهلام (BN - PAGE). في البعد الأول ، يتم فصل lysates الخلوية مدال بواسطة PAGE - BN لتحديد البلدان المتوسطية الشريكة الفردية. في البعد الثاني SDS - PAGE ، وتنقسم البلدان المتوسطية الشريكة من الاهتمام لتحليل من قبل ناخبيهم immunoblotting.

زرقاء هلام بولي أكريلاميد الأصلية الكهربائي (BN - PAGE) للتحليل من المجمعات Multiprotein Lysates الخليوي

تعلم تقنية DGGE لتحليل التنوع الجيني في مجتمعات البكتيريا الحيوية باستخدام تسلسل 16S rRNA. تساعد هذه الطريقة الباحثين على دراسة ديناميكيات المجتمعات الميكروبية بدقة.

تغيير طبيعة الكهربائي جل التدرج (DGGE)

استكشف المزيد من الفيديوهات