عزل الحمض النووي الميكروبي للبراز: دراسة تأثير الإثراء البيئي على تنوع الميكروبيوم في نموذج ورم الفئران

- يشير الإثراء البيئي ، أو EE ، إلى التعديلات في معايير السكن للحصول على آثار مفيدة على الأمراض المختلفة مثل السرطان. في الفأر الحامل للورم ، ينشط EE جهاز المناعة ويقلل الالتهاب ، مما يحسن في النهاية ميكروبات الأمعاء ويحسن معدل البقاء على قيد الحياة. لدراسة التغيرات في ميكروبات الأمعاء ، أضف الكمية المطلوبة من محلول تحلل البراز في أنبوب يحتوي على براز الفأر.

الطرد المركزي العينة ونقل المادة الطافية إلى أنبوب طرد مركزي دقيق جديد. أضف المخزن المؤقت لتحلل كلوريد الجوانيدينيوم الذي يفسد DNase و RNase. بعد ذلك ، أضف الإيثانول وانقل العينة إلى عمود دوران السيليكا.

يساعد الإيثانول الحمض النووي على الارتباط بالسيليكا. الطرد المركزي العينة. الآن ، انقل العمود إلى أنبوب طرد مركزي دقيق جديد وأضف مخزن مؤقت للشطف إلى العمود لتصفية الحمض النووي.

الطرد المركزي العينة وتجاهل العمود. انقل العينة إلى أنبوب PCR وقم بتشغيل تفاعل البوليميراز المتسلسل لتضخيم الحمض النووي. قم بتحميل الحمض النووي على هلام الاغاروز وقم بإجراء الرحلان الكهربائي لتحديد حجم الحمض النووي الميكروبي. في البروتوكول التالي ، سنقوم بعزل الحمض النووي من البراز لتحليل تأثير كفاءة الطاقة على ميكروبات القولون في الفأر الورمي.

- استخدم مجموعة تجارية لعزل الحمض النووي الميكروبي من البراز باتباع بروتوكول الكشف عن مسببات الأمراض في البراز.