$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
لتنقية البروتين المؤتلف المدمجة مع علامة بولي هيستيدين - سلسلة من بقايا الهيستيدين في نهاية واحدة - من محللة الخلية البكتيرية ، أولا ، قم بتخفيف محللة الخلية لمنع انسداد العمود أثناء التشغيل الكروماتوجرافي.
قم بتجميع عمود تقارب يحتوي على كاتيونات النيكل ثنائية التكافؤ التي تم تجميدها على مصفوفة حبة الاغاروز باستخدام حمض النتريلوتريأسيتيك ، وهو عامل مخلب. يربط حمض النتريلوتري أسيتيك كاتيونات النيكل عبر أربعة مواقع تساهمية منسقة ، بينما يظل موقعان على أيون المعدن متاحين للتفاعلات مع علامات بولي هيستيدين في البروتين محل الاهتمام.
قم بموازنة العمود بمخزن مؤقت مناسب لتحسين الظروف للتفاعلات الفعالة بين البروتين المعدني. قم بتحميل محللة الخلية على العمود.
تشكل البروتينات المؤتلفة ، التي تحمل بقايا الهيستيدين الطرفية التي يمكن الوصول إليها ، روابط تنسيق مع كاتيونات النيكل بسبب التقارب العالي لأيون المعدن مع الإيميدازول ، السلسلة الجانبية للهيستيدين ، وترتبط بالمصفوفة. العدد الكبير من الهيستيدين المتتالي في البروتين المؤتلف يقوي ارتباطه بالمصفوفة.
بالمقارنة ، فإن البروتينات التي تفتقر إلى بقايا الهيستيدين لا تلتصق بالعمود وتتدفق من خلالها. اغسل العمود بمخزن مؤقت إيميدازول منخفض التركيز.
يتنافس إيميدازول مع ملوثات البروتين ضعيفة الارتباط والتي قد تكون قد التزمت بشكل غير محدد بالمصفوفة عبر بقايا الهيستيدين في سلسلة عديد الببتيد الخاصة بها ، مما يؤدي إلى إزاحتها وتسهيل الشطف. اغسل العمود بمخزن مؤقت إيميدازول عالي التركيز لفصل البروتينات المؤتلفة ذات العلامات القوية بالهيستيدين من مخلب أيون النيكل ، مما يؤدي إلى تنظيفها في التدفق.
اجمع جزء البروتين المؤتلف المنقى لمزيد من التحليل.
ابدأ هذا البروتوكول بالإفراط في التعبير المحفز عن بروتين موسوم بالهيستيدين كما هو موضح في بروتوكول النص. تحضير 1 ملليلتر من راتنج حمض النيكل والنيتريلوأسيتيك في عمود الجاذبية لتنقية البروتين. في اليوم السابق للاستخدام ، قم بموازنة العمود طوال الليل عند 4 درجات مئوية مع 2 مل من المخزن المؤقت للتوازن.
في اليوم التالي ، أحضر العمود من 4 درجات مئوية إلى درجة حرارة الغرفة ، قبل تحميل المحللة المصفاة ، واتركه يقف لمدة ساعتين إلى ثلاث ساعات تقريبا. ثم أعد تعليق الحبيبات في المخزن المؤقت للتحلل.
قم بإجراء صوتنة للخلايا على الجليد لمدة 10 مرات كل 10 ثوان ، مع التوقف مؤقتا لمدة 30 ثانية بين النبضات. قم بتوضيح المحللة عن طريق الطرد المركزي عند 3080 × جم لمدة 30 دقيقة عند 4 درجات مئوية باستخدام جهاز طرد مركزي دقيق.
قم بإعداد المحللة المصفاة بكميات متساوية من المخزن المؤقت للتحلل ، ثم قم بتطبيق المحللة الموضحة الجاهزة على العمود ، واجمع التدفق. أعد تطبيق تدفق المحللة الموضح على العمود ، واجمع التدفق الثانوي.
ثم اغسل العمود ب 5 ملليلتر من مخزن الغسيل المؤقتة # 1 واجمع التدفق. اغسل العمود مرة أخرى باستخدام 5 ملليلتر من مخزن الغسيل # 2 ، واجمع التدفق. الآن ، ضع 2 مل من محلول الشطف. اجمع التدفق في جزأين من 1 مليلتر لكل منهما.