January 18th, 2012
يسين كيناز كرر ريتش 2 هو كيناز متعددة المجالات الكبيرة ، والطفرات التي هي السبب الأكثر شيوعا الجينية لمرض الشلل الرعاش. وقد أثبت تحليل للنشاط هذا البروتين كيناز ليكون أداة حاسمة في فهم البيولوجيا واختلال وظيفي في هذا البروتين. في هذه الورقة ، في المختبر معايرة النشاط كيناز من LRRK2 وصفها مجموعة من المسوخ والخمسين ، وتوفير نظام تجريبي لدراسة الفسفرة من ركائز المفترضة وضعف إمكانات LRRK2 في المرض.
الهدف العام من هذا الإجراء هو فحص نشاط كيناز تكرار كيناز غني بالليوسين الثاني. يتم تحقيق ذلك عن طريق تحضير خليط فحص كيناز أولا مع LA اثنين المؤتلف وركيزة البروتين الأساسية المايلين. بعد ذلك ، يضاف الراديو المسمى TP ويتم تحضين الخليط لمدة ساعة واحدة.
ثم يتم تغيير طبيعة البروتينات وفصلها على هلام بولي أكريلاميد وإخضاعها لطخة غربية. أخيرا ، يتعرض الغشاء لشاشة فوسفو ويتم قياس النشاط. في النهاية ، يمكن الحصول على نتائج تظهر أن LA two نشط وكيف تغير الطفرات نشاطها من خلال الفسفرة التلقائية وفسفرة MBP.
يعدالعرض المرئي لهذه الطريقة أمرا بالغ الأهمية حيث يصعب تعلم الخطوات المشعة بسبب احتياطات السلامة التي يجب اتخاذها. قبل البدء في هذا الإجراء ، ارجع إلى البروتوكول المكتوب المتعلق بالاستخدام السليم للنظائر المشعة والتخلص منها لمنع انتشار النشاط الإشعاعي. تحضير جميع مخاليط التفاعل في أنابيب عينة سعة 1.5 ملليلتر مع أغطية لولبية تحتوي على حلقة O.
ابدأ الاختبار عن طريق إذابة البروتين من النوع البري LA ، بالإضافة إلى المتغيرات على الجليد. ثم اخلطي المكونات التالية على الثلج. 10 نانومولار من كيناز ، 0.5 ميكروغرام لكل مليلتر ، بروتين المايلين الأساسي 0.5 ميكرولتر من 10 أضعاف المخزن المؤقت للكيناز ، وماء كاف لرفع الحجم إلى 50 ميكرولترا.
بعد إعداد منطقة العمل و / أو الموظفين للعمل مع النشاط الإشعاعي ، اضبط كتل التسخين على 30 درجة مئوية و 100 درجة مئوية على التوالي. قم بإزالة 32 PATP من الفريزر 20 درجة مئوية تحت الصفر. امسح الجزء الخارجي من الحاوية قبل استخدامها وقم بمسح خلف شاشة البرسبيكس.
باستخدام عداد جيجر ، قم بتقييم النشاط الإشعاعي ل 32 PATP لكل تفاعل على الجليد. أضف ميكرولتر واحد من 32 PATP و 10 ميكرومولار من البرد. أ TP استخدم لكل أليف للخلط جيدا.
ثم نبضالطرد المركزي التفاعلات لإحضار السائل إلى قاع الأنبوب ، وبالتالي تقليل مخاطر التلوث. بعد ذلك ، قم بإزالة 15 ميكرولتر كنقطة زمنية صفرية وقم بإنهاء التفاعل بإضافة خمسة ميكرولترات من أربعة أضعاف المخزن المؤقت لعينة SDS. ثم قم بتغيير طبيعة الكمية عند 100 درجة مئوية لمدة 10 دقائق.
احتضان العينة المتبقية عند 30 درجة مئوية لمدة 60 دقيقة. ثم قم بإزالة كمية ثانية سعة 50 ميكرولتر. أضف أربع مرات عينة عازلة وحاضنة 100 درجة مئوية لمدة 10 دقائق.
لحل التفاعلات على صفحة SDS ، قم بتحميل 20 ميكرولترا من كل عينة على 10. حسنا ، أربعة إلى 12٪ من جل أكريلاميد بولي بيس جنبا إلى جنب مع حارة من معيار البروتين. قم بتشغيل الجل باستخدام مماسح تعمل بمخزن مؤقت عند 160 فولت لمدة 90 دقيقة أو حتى تصل مقدمة DIA إلى نهاية الجل.
انقل البروتين إلى غشاء PVDF عند 25 فولت لمدة 16 ساعة وفقا للخطوات الموضحة في البروتوكول المكتوب. بمجرد أن يجف الغشاء ، ضعه بين صفيحتين من أسيتات السليلوز وقم بتعريضه إما لشاشة فوسفورية أو فيلم أشعة سينية للكشف عن التعرض للبروتين المليء بالإشعاع. يمكن أن يمتد الوقت من عدة ساعات إلى أكثر من أسبوع اعتمادا على النشاط المحدد للنظائر المشعة المستخدمة وحركية الإنزيم للتفاعل.
إذا كنت تستخدم شاشة فوسفو ، فحفظ الصورة عبارة عن ملف TIFF عالي الدقة أو صورة نقطية للفيلم. استخدم ماسحا ضوئيا لسطح المكتب لمسح الفيلم ضوئيا أولا. استخدم الصورة J لتحليل الصور هنا.
نتائج الفحص التي أجريت باستخدام قبرة من النوع البري الثاني بالإضافة إلى كيناز مفرط النشاط G 2 0 1 9 S و D 1 99 4 تباين كيناز ميت مع بروتين المايلين الأساسي كصولجان الفوسفات كما هو موضح ، يمكن رؤية الفسفرة التلقائية للقبرة الثانية عند حوالي 200 كيلودالتون مع نطاقات متعددة تمثل MBP الفسفوري المرئي من 20 إلى 40 كيلودالتون. لاحظ عدم وجود فسفرة تلقائية في D 1 90 94 a lan a way وزيادة الفسفرة بسبب طفرة G 2 0 1 9 s. قد يكون الفسفرة المتبقية ل MVP في ممر كيناز الميت ناتجا عن الاستئصال غير الكامل لنشاط كيناز قبرة اثنين بواسطة D 1 99 4 A متحولة أو قد تعكس وجود كينازات ملوثة ضئيلة في التفاعل.
لا تنس أن العمل مع الإشعاع يمكن أن يكون خطيرا للغاية ويجب دائما استخدام تدابير وقائية ، مثل التدريع عند إجراء مثل هذا.
توضح هذه الدراسة طريقة لتحليل نشاط كيناز ليورسين ريتش ريتريت كيناز 2 (LRRK2)، وهو لاعب رئيسي في مرض باركنسون. يتضمن البروتوكول خطوات لتحضير خليط التحليل، الحضانة، وتحليل النتائج من خلال الغربلة الغربية.
Assaying LRRK2 kinase activity provides a direct readout of target engagement and functional impact of disease-associated mutations, supporting early-stage target validation in neurodegenerative disease programs. Quantitative measurement of autophosphorylation and substrate phosphorylation enables mechanistic de-risking by linking genetic variants to enzymatic output, informing go/no-go decisions in LRRK2-focused discovery pipelines. This assay format supports preclinical continuity by establishing a reproducible biochemical framework for evaluating inhibitor potency and selectivity across mutant and wild-type LRRK2.
The LRRK2 kinase assay fits within the discovery continuum from target validation through lead identification to preclinical evaluation, providing a functional bridge between genetic insight and biochemical mechanism.