فك رموز الآثار الهيكلية لتفعيل الطفرات الجسدية EGFR مع محاكاة الديناميات الجزيئية
10K مشاهدة
•
استشهد بها 7
•
15:05 دقيقة
•
مايو 20, 2020
DOI :10.3791/61125-v
مايو 20, 2020
•10K مشاهدة
1Structural Bioinformatics Laboratory, Biochemistry, Faculty of Science and Engineering, Åbo Akademi University, 2Medicity Research Laboratories and Institute of Biomedicine, University of Turku, 3Turku Bioscience Centre, University of Turku and Åbo Akademi University, 4Department of Oncology and Radiotherapy, University of Turku and Turku University Hospital
والهدف من هذا البروتوكول هو استخدام محاكاة الديناميات الجزيئية لدراسة التغيرات الهيكلية الديناميكية التي تحدث نتيجة لتنشيط الطفرات من بروتين كيناز EGFR.
Chapters in this video
0:04
Introduction
0:47
Structure Preparation
4:12
System Setup
5:17
Molecular Dynamics Simulation
7:15
Visual Inspection Analysis
8:29
Root-Mean Square Deviation (RMSD) and Root-Mean Square Fluctuation (RMSF) Analysis
9:58
Hydrogen Bond Analysis
10:57
Free Energy Calculations
12:25
Representative Results: Molecular Dynamics Simulation of EGFR Somatic Mutations
14:23
Conclusion
Related Videos
حقوق الطبع والنشر © 2026 MyJoVE Corporation. جميع الحقوق محفوظة.