-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

AR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

ar

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Neuroscience
في الجسم الحي تصوير الدماغ بالكامل ليرقات الزرد باستخدام المجهر الفلوري ثلاثي الأبعاد
في الجسم الحي تصوير الدماغ بالكامل ليرقات الزرد باستخدام المجهر الفلوري ثلاثي الأبعاد
JoVE Journal
Neuroscience
This content is Free Access.
JoVE Journal Neuroscience
In Vivo Whole-Brain Imaging of Zebrafish Larvae Using Three-Dimensional Fluorescence Microscopy

في الجسم الحي تصوير الدماغ بالكامل ليرقات الزرد باستخدام المجهر الفلوري ثلاثي الأبعاد

Full Text
5,888 Views
06:27 min
April 28, 2023

DOI: 10.3791/65218-v

Eun-Seo Cho1, Seungjae Han1, Gyuri Kim1, Minho Eom1, Kang-Han Lee2, Cheol-Hee Kim2, Young-Gyu Yoon1,3

1School of Electrical Engineering,KAIST, 2Department of Biology,Chungnam National University, 3KAIST Institute for Health Science and Technology

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This article presents a detailed protocol for in vivo whole-brain imaging of larval zebrafish utilizing three-dimensional fluorescence microscopy. The zebrafish model is favored due to its optical transparency and genetic accessibility to study neural computation and activity. The protocol addresses common issues such as motion artifacts and agarose gel aberrations, ensuring high-quality image data acquisition.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Biophysics
  • Imaging Techniques

Background

  • Larval zebrafish are a vital model for neuroactivity studies due to their transparency.
  • Significant challenges include aberrations from agarose gel and motion artifacts during imaging.
  • Current protocols lack detailed steps for effective sample mounting and positioning.
  • High-resolution imaging is critical for understanding neural computation.

Purpose of Study

  • To develop a reproducible protocol for high-quality imaging of zebrafish brain activity.
  • To reduce noise and motion artifacts during imaging sessions.
  • To facilitate the study of neural computation over long periods.

Methods Used

  • The main platform used is three-dimensional fluorescence microscopy.
  • The biological model involves larval zebrafish, prepared and immobilized for imaging.
  • An optimized experimental workflow is instituted to ensure minimal artifacts.
  • Critical steps include precise positioning of the zebrafish and correct imaging parameter adjustments.
  • Visualization of acquired data is achieved using software tools like napari.

Main Results

  • The imaging protocol allows for comprehensive visualization of brain areas, including neuronal structures in the forebrain, midbrain, and hindbrain.
  • Neuronal activity can be captured through time-series imaging, revealing significant insights into neural functions.
  • Clear visibility of all brain regions indicates the protocol's effectiveness.

Conclusions

  • This study demonstrates a novel imaging approach that enhances the understanding of zebrafish neuroactivity.
  • The protocol not only sets a standard for zebrafish imaging but also has implications for broader neural research.
  • Further development of imaging pipelines is anticipated to improve brain mapping and neural computation studies.

Frequently Asked Questions

What are the advantages of using larval zebrafish?
Larval zebrafish are advantageous due to their optical transparency, which allows for clear imaging of neural structures and activities using fluorescence microscopy.
How is the zebrafish prepared for imaging?
Zebrafish are paralyzed and positioned in a solidified agarose gel within a Petri dish to ensure stability during imaging.
What type of data is obtained from this imaging protocol?
The protocol facilitates the acquisition of volumetric structural images and time-series functional imaging of neuronal activity in the zebrafish brain.
How can this method be adapted for other applications?
While focused on brain imaging, the protocol can be adapted for visualizing other organs in larval zebrafish and potentially other transparent models.
What are some limitations of this imaging approach?
Limitations include potential artifacts from the agarose gel and any inevitable movement of the zebrafish during the imaging process.
How does the imaging method improve upon previous protocols?
This method provides a comprehensive, detailed workflow for zebrafish preparation and imaging, addressing gaps in existing protocols that often overlook critical steps.

يظهر هنا بروتوكول لتصوير الدماغ بالكامل في الجسم الحي ليرقات الزرد باستخدام المجهر الفلوري ثلاثي الأبعاد. يتضمن الإجراء التجريبي إعداد العينات والحصول على الصور والتصور.

نحن نعمل على تطوير أنظمة المناعة البصرية والخوارزميات الحسابية لتسجيل وتحليل النشاط العصبي للدماغ بأكمله بدقة مكانية وزمانية عالية. أسماك المختبر هي نموذجي مثالي للبحث. بفضل كل شفافية بصرية وتوافر أدوات وراثية متنوعة ، قد تتدهور جودة الصورة البصرية بسبب الانحراف الناتج عن هلام Agarose المستخدم لتركيب العينات ، وقد تتحرك الأسماك أثناء التسجيل مسببة آثار الحركة في الصور أو تعيق دقة استخراج الإشارة من الصور.

لا توفر البروتوكولات المتاحة للجمهور سوى لمحة موجزة عن الإجراء التجريبي ، وتعيش أجزاء كبيرة من التفاصيل ، مثل تقنيات التركيب الدقيقة لتصلب الأغاروز ، وتحديد المواقع البسيط. لذلك ، هناك حاجة إلى بروتوكول فعال وقابل للتكرار للحصول على بيانات صور عالية الجودة. مع الحد الأدنى من الضوضاء والحركة.

يوفر بروتوكولنا إجراء تجريبيا محسنا وقابلا للتكرار. يتيح هذا البروتوكول تصوير الدماغ بالكامل في الجسم الحي على مدى فترة طويلة وتصورات بيانات التصوير المكتسبة. ركز سير العمل على تصوير الدماغ بالكامل ولكن يمكن تطبيقه بسهولة على تصوير الأعضاء الأخرى لكثير من أسماك الحمار الوحشي لدينا.

هدفنا هو كشف المبادئ الأساسية للحساب العصبي. لذلك سنواصل العمل على خط أنابيب يتضمن تصويرا واسع النطاق للنشاط العصبي والبنية والتحليل الحسابي لمثل هذا من أجل رسم خرائط الدماغ المنهجية.

Explore More Videos

علم الأعصاب العدد 194

Related Videos

يعيش تصوير الدماغ الجنينية اسماك الزرد بواسطة الميكروسكوب متحد البؤر

07:11

يعيش تصوير الدماغ الجنينية اسماك الزرد بواسطة الميكروسكوب متحد البؤر

Related Videos

19.4K Views

التصوير في الجسم الحي لدماغ يرقات الزرد لتصور الخلايا العصبية المخيخية

03:06

التصوير في الجسم الحي لدماغ يرقات الزرد لتصور الخلايا العصبية المخيخية

Related Videos

593 Views

تصوير الأنسجة العميقة لدماغ سمكة الزرد باستخدام مجهر مضان ثلاثي الفوتون

03:22

تصوير الأنسجة العميقة لدماغ سمكة الزرد باستخدام مجهر مضان ثلاثي الفوتون

Related Videos

442 Views

التصوير والإعمار 3D من الهياكل الدماغية في الجنينية اسماك الزرد

08:00

التصوير والإعمار 3D من الهياكل الدماغية في الجنينية اسماك الزرد

Related Videos

15.4K Views

التصوير الهياكل التحت خلوية في الأجنة الحية اسماك الزرد

11:19

التصوير الهياكل التحت خلوية في الأجنة الحية اسماك الزرد

Related Videos

12.5K Views

تصور الدماغ النامية في سمك الحمار الوحشي المعيشة باستخدام Brainbow والوقت الفاصل Confocal التصوير

07:28

تصور الدماغ النامية في سمك الحمار الوحشي المعيشة باستخدام Brainbow والوقت الفاصل Confocal التصوير

Related Videos

9.6K Views

4-التصوير الأبعاد من زيبرافيش كأس البصرية Morphogenesis

07:26

4-التصوير الأبعاد من زيبرافيش كأس البصرية Morphogenesis

Related Videos

3.9K Views

في التصوير الحي لأنسجة الدماغ النشطة بالكامل في يرقات حمار وحشي مستيقظا والأحداث عن طريق إزالة الجمجمة والجلد

05:25

في التصوير الحي لأنسجة الدماغ النشطة بالكامل في يرقات حمار وحشي مستيقظا والأحداث عن طريق إزالة الجمجمة والجلد

Related Videos

5.8K Views

المجهر الفلوري ثلاثي الفوتون للأنسجة العميقة في دماغ الفأر وسمك الزرد السليم

08:26

المجهر الفلوري ثلاثي الفوتون للأنسجة العميقة في دماغ الفأر وسمك الزرد السليم

Related Videos

5.3K Views

4D ضوء ورقة التصوير من تقلص القلب الزرد

07:07

4D ضوء ورقة التصوير من تقلص القلب الزرد

Related Videos

2K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code