نوفمبر 14, 2025
يوضح هذا البروتوكول بالتفصيل منهجية للكشف عن mRNA متعدد الإرسال باستخدام قياس الخلايا الكتلية لتصوير البروتين في أقسام الأنسجة المضمنة بالبارافين الثابت للفورمالين.
نركز على علم الأحياء الخاص لفهم الآليات الجزيئية لسرطان المبيض بشكل أعمق على أمل إيجاد أهداف علاجية جديدة ومؤشرات حيوية للتنبؤ ببقاء المرضى. من التحديات الحالية في IMC تشريح البروتين ذو الوفرة المنخفضة، والعمل المسؤول في التحقق من الأجسام المضادة والمعايرة، بالإضافة إلى التصنيف المعقد والمستهلك للوقت أثناء التحليل. ابدأ بإزالة السائل الزائد من شرائح FFPE المحضرة.
أخرج صينية التحكم بالرطوبة من الفرن، وضع حامل الشريحة داخل الصينية. ثم قم بتدوير مضخم RNA-ISH 3 بشكل كامل، وأضف كمية كافية من المادة لتغطية كل جزء من النسيج على الشرائح. أغلق الصينية، وأدخلها في فرن التهجين لمدة 30 دقيقة عند 40 درجة مئوية.
أثناء الحضانة، حضر خليط الأوليغونيوكليوتيدات المعدنية عن طريق تخفيف كل أوليغو بنسبة واحد إلى 15. قم بمزج الأوليغو المعدني في دوامة جيدا، واتركه في درجة حرارة الغرفة حتى الاستخدام الإضافي. الآن، أزل صينية التحكم بالرطوبة من الفرن.
أخرج حامل الشرائح من الصينية، وأعد الصينية إلى الفرن. ثم ضع الشرائح في حامل شفاف تم غسله مسبقا بماء خال من النوكليز. اغسل الشرائح في طبقة غسيل مع تحريك خفيف لمدة دقيقتين.
بعد إزالة السائل الزائد من الشرائح، أخرج صينية التحكم في الرطوبة من الفرن، وضع حامل الشرائح في الصينية. أضف الأوليجونكليوتيدات المعدنية المختلطة التي تم تحضيرها مسبقا لتغطية كل جزء من الأنسجة بالكامل. الآن، أغلق الصينية تماما، وأدخلها في فرن التهجين لمدة 45 دقيقة على درجة حرارة 40 درجة مئوية.
أخرج صينية التحكم في الرطوبة من فرن التهجين، وأخرج حامل السلايد، وأعد الصينية الفارغة إلى الفرن. لحجب مواقع الارتباط غير المحددة، أضف كمية كافية من حاجز العزل لتغطية كل جزء من الأنسجة في الشريحة بالكامل، وحضن الشرائح في درجة حرارة الغرفة لمدة 30 دقيقة. أثناء حضن الشرائح، حضر خليط الأجسام المضادة عن طريق تخفيف الأجسام المضادة باستخدام مخزن تخفيف الأجسام المضادة.
بعد انتهاء فترة الحضانة، تخلص من الحاجز من شرائح الأنسجة، ووزع كمية كافية من خليط الأجسام المضادة المحضر مسبقا لتغطية أقسام الأنسجة بالكامل. ثم ضع السلايدات في غرفة رطوبة، وحضنها طوال الليل عند درجة حرارة أربع درجات مئوية. لتحضير محلول تداخل إيريديوم جديد، قم بتخفيفه بنسبة 1 إلى 2,000 من محلول مخزون بسعة 500 ميكرومول باستخدام TBS خال من RNase.
ضع الشرائح في حامل شرائح شفاف تم غسله مسبقا بماء خال من النوكليز، واغسل الشرائح في مخزن TBS-T مع تحريك خفيف لمدة خمس دقائق. ثم، لصبغ الشرائح، أضف محلول الإيريديوم المعد للعمل، وحضن لمدة خمس دقائق في درجة حرارة الغرفة. بعد ذلك، ضع الشرائح في حامل شرائح شفاف تم غسله مسبقا بماء خال من النوكليز.
اغسل الشرائح مرتين في مخزن TBS-T مع تحريك خفيف لمدة خمس دقائق. ثم اغمس السلايدات بسرعة في ماء مقطر مرتين لمنع تبلور الملح الناتج عن TBS على الأنسجة. جفف الشرائح تحت غطاء كيميائي لمدة 10 دقائق، وخزنها عند أربع درجات مئوية حتى تحصل على الصورة.
حمل الشريحة المعدة في غرفة الاستئصال في نظام قياس خلوية الكتلة التصويرية. التقط صورة بانوراما للشريحة لتحديد المنطقة المعنية. باستخدام برنامج التقاط الصور، حدد المناطق المطلوبة ذات الاهتمام على صورة البانوراما.
طبق قالب الاستحواذ على برنامج اقتناء الصور. وقم بضبط قوة الليزر بناء على نوع العينة. الآن، ابدأ عملية الاستئصال بالليزر.
قس كمية كل نظير باستخدام الكاشف، الذي يحول البيانات إلى شكل رقمي للتحليل. تم تقييم حالة تنشيط خلايا CD8 التائية باستخدام الكشف المشترك للجرانزيم B على مستويات mRNA والبروتين، إلى جانب إيجابية الإنترفيرون-غاما. أظهرت الأرومة الليفية المرتبطة بالسرطان أنها تعبر عن بروتين MFAP5 وmRNA POSTN، وكلاهما مؤشر على عدوانية الأرومات الليفية المرتبطة بالسرطان.
أظهرت خلية T من CD4 أنها تعبر معا عن رنا IL17A وIL6، بما يتوافق مع هوية خلايا TH17. لوحظ أن خلايا CD4 T تعبر عن mRNA من IL13. تم عرض خلايا ورمية إيجابية للكيراتين وإيجابية CD47 بالقرب من خلية تائية CD8.
أظهرت خلية تائية نشطة من CD8 تعبير عن بروتين CD25. لوحظ تلوين mRNA مماثل ل THBS2 و CD47 بين البروتوكولات المتوافقة مع المعادن والبروتوكولات الموسومة بالفلورية.
اعرض النص الكامل واحصل على الوصول إلى آلاف الفيديوهات العلمية
يفصل هذا البروتوكول منهجية للكشف المتعدد عن mRNA باستخدام قياس التدفق الخلوي الكتلي للتصوير البروتيني في مقاطع نسيجية مثبتة بالفورمالين ومطمورة في البارافين. وينصب التركيز على فهم الآليات الجزيئية لسرطان المبيض لتحديد أهداف علاجية ومؤشرات حيوية جديدة.
إن دمج الكشف المتعدد لـ mRNA مع التصوير الكتلي للخلايا البروتينية يتيح إجراء تحليل مكاني متزامن للترانسكريبتوم والبروتيووم في مقطع نسيجي واحد، مما يعزز من عملية تقليل المخاطر الآلية والتحقق من الأهداف في أبحاث اكتشاف الأورام. ويتجاوز هذا النهج ثنائي الوسائط القيود المرتبطة بالكشف المعتمد على الأجسام المضادة فقط وتداخل الأطياف الفلورية، مما يوفر ثقة تنبؤية أعلى في تحديد المؤشرات الحيوية والأهداف العلاجية. وتدعم هذه الطريقة قرارات المحافظ الاستثمارية المعدلة حسب المخاطر من خلال تقديم رؤى جزيئية كمية ومحددة مكانياً، وهي رؤى بالغة الأهمية في مراحل الاكتشاف المبكر والأبحاث الانتقالية.
يربط سير العمل ثنائي النمط هذا بين مراحل الاكتشاف المبكر، والتحقق من الهدف، والبحوث الانتقالية من خلال تمكين رسم الخرائط الجزيئية الشاملة في مقاطع الأنسجة المثبتة بالفورمالين والمطمورة في البارافين (FFPE).