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Fluorescence Activated Cell Sorting of Plant Protoplasts

High-resolution, cell type-specific analysis of gene expression greatly enhances understanding of developmental regulation and responses to environmental ...

New York University

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&#x7279;&#x5B9A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x6C2E;&#x53CD;&#x5E94;&#x8C03;&#x89E3;&#x53D1;&#x80B2;&#x53EF;&#x5851;&#x6027;&#x3002;

The organs of multicellular species consist of cell types that must function together to perform specific tasks. One critical organ function is responding to internal or external change. Some cell-specific responses to changes in environmental conditions are known, but the scale of cell-specific responses within an entire organ as it perceives an environmental flux has not been well characterized in plants or any other multicellular organism. Here, we use cellular profiling of five Arabidopsis root cell types in response to an influx of a critical resource, nitrogen, to uncover a vast and predominantly cell-specific response. We show that cell-specific profiling increases sensitivity several-fold, revealing highly localized regulation of transcripts that were largely hidden from previous global analyses. The cell-specific data revealed responses that suggested a coordinated developmental response in distinct cell types or tissues. One example is the cell-specific regulation of a transcriptional circuit that we showed mediates lateral root outgrowth in response to nitrogen via microRNA167, linking small RNAs to nitrogen responses. Together, these results reveal a previously cryptic component of cell-specific responses to nitrogen. Thus, the results make an important advance in our understanding of how multicellular organisms cope with environmental change at the cell level.

Cell-specific nitrogen responses mediate developmental plasticity.

Les organes d&#x26;#39;esp&#xE8;ces multicellulaires sont compos&#xE9;es de types de cellules qui doivent fonctionner ensemble pour accomplir des t&#xE2;ches sp&#xE9;cifiques. Une fonction d&#x26;#39;un organe critique est de r&#xE9;pondre aux changements internes ou externes. Certaines r&#xE9;ponses sp&#xE9;cifiques des cellules &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;volution des conditions environnementales sont connues, mais l&#x26;#39;&#xE9;chelle de la cellule-sp&#xE9;cifiques au sein des r&#xE9;ponses un organe entier car il per&#xE7;oit un flux de l&#x26;#39;environnement n&#x26;#39;a pas &#xE9;t&#xE9; bien caract&#xE9;ris&#xE9; dans les plantes ou tout autre organisme multicellulaire. Ici, nous utilisons le profilage cellulaire de cinq types de cellules d&#x26;#39;Arabidopsis racines en r&#xE9;ponse &#xE0; un afflux d&#x26;#39;une ressource, de l&#x26;#39;azote critique, de d&#xE9;couvrir un vaste et surtout sp&#xE9;cifique &#xE0; la cellule de r&#xE9;ponse. Nous montrons que la cellule-sp&#xE9;cifique de profilage augmente la sensibilit&#xE9; de plusieurs fois, r&#xE9;v&#xE9;lant une r&#xE9;glementation tr&#xE8;s localis&#xE9;e de transcriptions qui ont &#xE9;t&#xE9; en grande partie cach&#xE9;es pr&#xE9;c&#xE9;dentes analyses globales. Les donn&#xE9;es sp&#xE9;cifiques aux cellules a r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; que les r&#xE9;ponses propos&#xE9;es une r&#xE9;ponse coordonn&#xE9;e de d&#xE9;veloppement dans des types cellulaires distincts ou des tissus. Un exemple en est la r&#xE9;glementation sp&#xE9;cifique des cellules d&#x26;#39;un circuit de transcription que nous avons montr&#xE9; l&#x26;#39;excroissance de m&#xE9;diateur de la racine lat&#xE9;rale en r&#xE9;ponse &#xE0; l&#x26;#39;azote par l&#x26;#39;interm&#xE9;diaire microRNA167, reliant les petits ARN &#xE0; des r&#xE9;ponses d&#x26;#39;azote. Ensemble, ces r&#xE9;sultats r&#xE9;v&#xE8;lent une composante d&#xE9;j&#xE0; cryptique de la cellule-r&#xE9;ponses sp&#xE9;cifiques &#xE0; l&#x26;#39;azote. Ainsi, les r&#xE9;sultats font une avanc&#xE9;e importante dans notre compr&#xE9;hension de la fa&#xE7;on dont les organismes multicellulaires face aux changements environnementaux au niveau de la cellule.

Les r&#xE9;ponses d&#x26;#39;azote sp&#xE9;cifiques des cellules m&#xE9;diation plasticit&#xE9; d&#xE9;veloppementale

Die Organe des mehrzelligen Arten sind Zelltypen, die zusammen funktionieren m&uuml;ssen, um bestimmte Aufgaben zu erf&uuml;llen. Eine kritische Organfunktion reagiert auf interne oder externe Ver&auml;nderungen. Einige zellspezifische Reaktionen auf &Auml;nderungen der Umweltbedingungen sind, aber das Ausma&szlig; der zellspezifische Reaktionen innerhalb einer gesamten Orgel bekannt als es wahrnimmt, dass ein &ouml;kologischer Wandel in Pflanzen oder jeder anderen mehrzelligen Organismus nicht gut charakterisiert worden ist. Hier verwenden wir zellul&auml;re Profilerstellung f&uuml;nf Arabidopsis Stamm Zelltypen als Reaktion auf einen Zustrom von eine kritische Ressource, Stickstoff, eine gro&szlig;e und &uuml;berwiegend zellspezifische Antwort aufzudecken. Wir zeigen, dass zellspezifische Profilerstellung erh&ouml;ht Empfindlichkeit siebenmal, aufschlussreiche hoch lokalisierte Verordnung der Transkripte, die gr&ouml;&szlig;tenteils aus fr&uuml;heren globalen Analysen ausgeblendet wurden. Die Zelle-spezifische Daten ergeben Antworten, die ein abgestimmtes Entwicklungsst&ouml;rungen in verschiedene Zelltypen oder Gewebe vorgeschlagen. Ein Beispiel ist die zellspezifische Verordnung einer transkriptionelle Schaltung, die wir verkn&uuml;pfen kleine RNAs mit Stickstoff Antworten zeigte seitliche Wurzel Auswuchs als Reaktion auf Stickstoff &uuml;ber microRNA167, vermittelt. Zusammen zeigen diese Ergebnisse eine zuvor kryptische Komponente zellspezifische Reaktionen auf Stickstoff. Aus diesem Grund werden die Ergebnisse einen bedeutender Fortschritt f&uuml;r unser Verst&auml;ndnis wie Mehrzeller Umweltver&auml;nderungen auf Zellenebene zu bew&auml;ltigen.

Zellspezifische Stickstoff Antworten vermitteln Entwicklungsst&ouml;rungen Plastizit&auml;t.

Gli organi di specie pluricellulari costituiti da tipi di cellule che devono funzionare insieme per eseguire compiti specifici. Una funzione dell&#39;organo critico &egrave; di rispondere ai cambiamenti interni o esterni. Alcune cellule-specifiche risposte ai cambiamenti nelle condizioni ambientali sono noti, ma la scala di risposte delle cellule specifiche all&#39;interno di un organo intero come si percepisce che un flusso ambientale non &egrave; stata ben caratterizzato in piante o qualsiasi altro organismo pluricellulare. Qui, usiamo cellulari profilatura di cinque Arabidopsis radice tipi cellulari in risposta a un afflusso di una risorsa critica, azoto, per scoprire una risposta vasta e principalmente delle cellule specifiche. Vi mostriamo quella sensibilit&agrave; aumenta profilatura delle cellule specifiche several-fold, rivelando regolamento altamente localizzato delle trascrizioni che erano in gran parte nascosto dalla precedente analisi globali. I dati specifici delle cellule hanno rivelato le risposte che ha suggerito una risposta coordinata di sviluppo in tipi distinti delle cellule o tessuti. Un esempio &egrave; il regolamento specifico delle cellule di un circuito di transcriptional che vi abbiamo mostrato da intermediario escrescenza laterale radice in risposta all&#39;azoto tramite microRNA167, che collega il piccolo RNAs alle risposte di azoto. Insieme, questi risultati rivelano un componente precedentemente criptico di cellule specifiche risposte ad azoto. Cos&igrave;, i risultati fanno un avanzamento importante nella nostra comprensione di organismi multicellulari come affrontare i cambiamenti ambientali a livello di cella.

Risposte specifiche cella azoto mediano plasticit&agrave; dello sviluppo.

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&#x7D30;&#x80DE;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x7A92;&#x7D20;&#x5FDC;&#x7B54;&#x304C;&#x767A;&#x9054;&#x53EF;&#x5851;&#x6027;&#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3059;&#x308B;

&#xB2E4;&#xC138;&#xD3EC; &#xB3D9;&#xBB3C;&#xC758; &#xC7A5;&#xAE30;&#xB294; &#xD2B9;&#xC815; &#xC791;&#xC5C5;&#xC744; &#xC218;&#xD589; &#xD558;&#xB824;&#xBA74; &#xD568;&#xAED8; &#xC791;&#xB3D9; &#xD574;&#xC57C; &#xD558;&#xB294; &#xC140; &#xD615;&#xC2DD;&#xC73C;&#xB85C; &#xAD6C;&#xC131; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD558;&#xB098;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC7A5;&#xAE30;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xB0B4;&#xBD80; &#xB610;&#xB294; &#xC678;&#xBD80; &#xBCC0;&#xD654;&#xC5D0; &#xC751;&#xB2F5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD658;&#xACBD; &#xC870;&#xAC74;&#xC758; &#xBCC0;&#xD654;&#xC5D0; &#xC77C;&#xBD80; &#xC140; &#xD2B9;&#xC815; &#xC751;&#xB2F5; &#xC774;&#xB77C;&#xACE0;, &#xC804;&#xCCB4; &#xAE30;&#xAD00; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC140; &#xAD00;&#xB828; &#xC751;&#xB2F5; &#xADDC;&#xBAA8; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xD658;&#xACBD; &#xD50C;&#xB7ED;&#xC2A4; &#xD558;&#xC9C0; &#xC798; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC774; &#xB098; &#xB2E4;&#xB978; &#xB2E4;&#xC138;&#xD3EC; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xD2B9;&#xC9D5; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC778;&#xC2DD;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xAD11;&#xD65C; &#xD558; &#xACE0; &#xC8FC;&#xB85C; &#xC140; &#xD2B9;&#xC815; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xBC1D;&#xD788;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; 5 Arabidopsis &#xB8E8;&#xD2B8; &#xC140; &#xC885;&#xB958;&#xC758; &#xC720;&#xC785;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC790;&#xC6D0;, &#xC9C8;&#xC18C;, &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC774;&#xC804;&#xC758; &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC8FC;&#xB85C; &#xC228;&#xAE34; &#xC131;&#xC801;&#xD45C;&#xC758; &#xBA87;, &#xACF5;&#xAC1C; &#xACE0;&#xB3C4;&#xB85C; &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; &#xB41C; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xC158; &#xC140; &#xAD00;&#xB828; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xC99D;&#xAC00; &#xAC10;&#xB3C4; &#xADF8; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC140; &#xD2B9;&#xC815; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB97C; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC138;&#xD3EC; &#xC720;&#xD615; &#xB610;&#xB294; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC870;&#xC728; &#xB41C; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xD55C; &#xC608;&#xB85C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900; microRNA167&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC9C8;&#xC18C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCE21;&#xBA74; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xD30C;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC744; &#xC911;&#xC7AC; &#xC9C8;&#xC18C; &#xBC18;&#xC751;&#xC5D0; &#xC791;&#xC740; RNAs &#xC5F0;&#xACB0; transcriptional &#xD68C;&#xB85C; &#xC140; &#xAD00;&#xB828; &#xADDC;&#xC81C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD568;&#xAED8;, &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xACB0;&#xACFC; &#xACF5;&#xAC1C; &#xC140; &#xAD00;&#xB828; &#xB2F5;&#xBCC0;&#xC740; &#xC9C8;&#xC18C;&#xC758; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC554;&#xD638;&#xD654; &#xB41C; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xACB0;&#xACFC; &#xC138;&#xD3EC; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD658;&#xACBD; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xB300;&#xCC98; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xB2E4;&#xC138;&#xD3EC; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC774;&#xD574;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC0AC;&#xC804;&#xC744; &#xD655;&#xC778; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC140; &#xBCC4; &#xC9C8;&#xC18C; &#xC751;&#xB2F5; &#xC911;&#xC7AC; &#xBC1C;&#xB2EC;&#xAC00; &#xC18C;&#xC131;.

Los &#xF3;rganos de las especies multicelulares consisten en tipos de c&#xE9;lulas que deben funcionar en conjunto para realizar tareas espec&#xED;ficas. Una funci&#xF3;n del &#xF3;rgano cr&#xED;tico es la respuesta al cambio interno o externo. Algunas de las respuestas celulares espec&#xED;ficas a los cambios en las condiciones ambientales son conocidos, pero la escala de c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de las respuestas dentro de un &#xF3;rgano completo, como lo percibe un flujo de medio ambiente no ha sido bien caracterizado en las plantas o cualquier otro organismo multicelular. Aqu&#xED;, nosotros usamos el perfil celular de cinco tipos de ra&#xED;ces de Arabidopsis de c&#xE9;lulas en respuesta a una afluencia de un recurso cr&#xED;tico de nitr&#xF3;geno, para descubrir un vasto y predominantemente de c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de la respuesta. Se demuestra que las c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de creaci&#xF3;n de perfiles incrementa la sensibilidad en varias veces, dejando al descubierto la regulaci&#xF3;n muy localizada de las transcripciones que se ocultaron en gran medida de los anteriores an&#xE1;lisis globales. Los datos espec&#xED;ficos de la c&#xE9;lula revel&#xF3; las respuestas que sugieren una respuesta coordinada de desarrollo en distintos tipos de c&#xE9;lulas o tejidos. Un ejemplo es la regulaci&#xF3;n de c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de un circuito transcripcional que mostr&#xF3; excrecencia media ra&#xED;z lateral en respuesta a nitr&#xF3;geno a trav&#xE9;s de microRNA167, que une los peque&#xF1;os RNAs a las respuestas de nitr&#xF3;geno. En conjunto, estos resultados ponen de manifiesto un componente hasta ahora cr&#xED;ptica de c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de respuesta a nitr&#xF3;geno. Por lo tanto, los resultados tienen un importante avance en nuestra comprensi&#xF3;n de c&#xF3;mo los organismos multicelulares hacer frente al cambio ambiental a nivel celular.

De c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas de las respuestas de nitr&#xF3;geno Mediar Plasticidad del Desarrollo

&#x62E5;&#x6709;&#x8F83;&#x957F;&#x7684;&#x5BFF;&#x547D;&#x591A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6709;&#x673A;&#x4F53;&#x53D7;&#x5230;&#x5176;&#x751F;&#x5B58;&#x591A;&#x6837;&#x3001; &#x5E38;&#x6570;&#xFF0C;&#x800C;&#x5E38;&#x5E38;&#x6FC0;&#x70C8;&#x7684;&#x5185;&#x56E0;&#x548C;&#x5916;&#x56E0;&#x6311;&#x6218;&#x3002;&#x52A8;&#x7269;&#x548C;&#x690D;&#x7269;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x78E8;&#x635F;&#xFF0C;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x6B63;&#x5E38;&#x7684;&#x751F;&#x7406;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x4E00;&#x90E8;&#x5206;&#xFF0C;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x4E22;&#x5931;&#x5BF9;&#x5929;&#x654C;&#x3001; &#x75BE;&#x75C5;&#x548C;&#x635F;&#x4F24;&#x3002;&#x4E24;&#x56FD;&#x7684;&#x6218;&#x7565;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x5305;&#x62EC;&#x6210;&#x4EBA;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7EF4;&#x6301;&#x6216;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x5206;&#x5316;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x751F;&#x5B58;&#x4E30;&#x5BCC;&#x591A;&#x5F69;&#x7684;&#x4FAE;&#x8FB1;&#x3002;Repatterning &#x673A;&#x5236;&#x901A;&#x5E38;&#x4F1A;&#x90E8;&#x7F72;&#x80DA;&#x80CE;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x4F46;&#x95EE;&#x9898;&#x8FD8;&#x662F;&#x5728;&#x690D;&#x7269;&#x548C;&#x52A8;&#x7269;&#x518D;&#x751F;&#x8C03;&#x7528;&#x80DA;&#x80CE;&#x53D1;&#x751F;&#xFF0C;&#x901A;&#x7528;&#x9635;&#x5217;&#x673A;&#x5236;&#xFF0C;&#x6216;&#x72EC;&#x7279;&#x7684;&#x7535;&#x8DEF;&#x7EC4;&#x6210;&#x7684;&#x65E2;&#x5B9A;&#x9635;&#x5217;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;

&#x6574;&#x4E2A;&#x738B;&#x56FD;&#x5207;&#x7247;&#xFF1A; &#x518D;&#x751F;&#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x548C;&#x52A8;&#x7269;&#x3002;

Multicellular organisms possessing relatively long life spans are subjected to diverse, constant, and often intense intrinsic and extrinsic challenges to their survival. Animal and plant tissues wear out as part of normal physiological functions and can be lost to predators, disease, and injury. Both kingdoms survive this wide variety of insults by strategies that include the maintenance of adult stem cells or the induction of stem cell potential in differentiated cells. Repatterning mechanisms often deploy embryonic genes, but the question remains in both plants and animals whether regeneration invokes embryogenesis, generic patterning mechanisms, or unique circuitry comprised of well-established patterning genes.

Slicing across kingdoms: regeneration in plants and animals.

Les organismes multicellulaires poss&#xE9;dant une dur&#xE9;e de vie relativement longues sont soumis &#xE0; une diversit&#xE9; constante, et souvent intenses d&#xE9;fis intrins&#xE8;ques et extrins&#xE8;ques &#xE0; leur survie. Tissus animaux et v&#xE9;g&#xE9;taux porter dans le cadre de fonctions physiologiques normales et peuvent &#xEA;tre perdus pour les pr&#xE9;dateurs, les maladies et blessures. Les deux royaumes survivre &#xE0; cette grande vari&#xE9;t&#xE9; d&#x26;#39;insultes par des strat&#xE9;gies qui incluent le maintien de cellules souches adultes ou l&#x26;#39;induction de potentiel des cellules souches dans des cellules diff&#xE9;renci&#xE9;es. M&#xE9;canismes reconfiguration d&#xE9;ploient souvent des g&#xE8;nes embryonnaires, mais la question demeure dans les deux plantes et des animaux si la r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration invoque l&#x26;#39;embryogen&#xE8;se, les m&#xE9;canismes de structuration g&#xE9;n&#xE9;riques, ou les circuits uniques compos&#xE9; de g&#xE8;nes de structuration bien &#xE9;tablies.

Trancheuse travers Royaumes: R&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration des plantes et des animaux

Vielzellige Organismen besitzen relativ lange Lebensdauer unterliegen vielf&auml;ltigen, Konstante und oft intensive intrinsische und extrinsische Herausforderungen f&uuml;r ihr &Uuml;berleben. Tierischen und pflanzlichen Geweben verschlei&szlig;en als Teil der normalen physiologischen Funktionen und k&ouml;nnen verloren, Raubtiere, Krankheiten und Verletzungen. Beide K&ouml;nigreiche &uuml;berleben diese Vielzahl von Beleidigungen von Strategien, die die Aufrechterhaltung der adulten Stammzellen oder die Induktion von Stammzellen, die potenzielle in differenzierten Zellen enthalten. Repatterning Mechanismen bereitstellen oft embryonalen Gene, aber in Pflanzen und Tieren bleibt fraglich, ob Erneuerung aufruft Embryogenese, generische Mechanismen, Musterung oder einzigartige Schaltung bestehend aus etablierten Musterung Gene.

&Uuml;ber reiche Aufschneiden: Regenerierung in Pflanzen und Tieren.

Organismi pluricellulari che possiedono relativamente lunghe vita campate sono sottoposti a sfide diverse, costante e spesso intense intrinseche ed estrinseche alla loro sopravvivenza. Tessuti animali e vegetali consumano come parte delle normali funzioni fisiologiche e possono essere persi di predatori, malattie e lesioni. Entrambi i regni sopravvivono questa ampia variet&agrave; di insulti da strategie che includono il mantenimento delle cellule staminali adulte o l&#39;induzione del potenziale delle cellule staminali in cellule differenziate. Meccanismi Repatterning distribuire spesso geni embrionali, ma la questione rimane in animali e piante rigenerazione richiama l&#39;embriogenesi, creazione di serie di meccanismi, generico o circuito unico composto da geni patterning consolidata.

Affettare attraverso regni: rigenerazione in piante e animali.

&#x6BD4;&#x8F03;&#x7684;&#x9577;&#x3044;&#x5BFF;&#x547D;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x591A;&#x7D30;&#x80DE;&#x751F;&#x7269;&#x306F;&#x305D;&#x306E;&#x751F;&#x5B58;&#x306B;&#x3001;&#x591A;&#x69D8;&#x306A;&#x5B9A;&#x6570;&#x3001;&#x3057;&#x3070;&#x3057;&#x3070;&#x5F37;&#x70C8;&#x306A;&#x5185;&#x56E0;&#x6027;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x5916;&#x56E0;&#x6027;&#x306E;&#x8AB2;&#x984C;&#x306B;&#x3055;&#x3089;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x52D5;&#x7269;&#x3084;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x306F;&#x6B63;&#x5E38;&#x306A;&#x751F;&#x7406;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x4E00;&#x90E8;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x7740;&#x7528;&#x3057;&#x3001;&#x6355;&#x98DF;&#x8005;&#x3001;&#x75C5;&#x6C17;&#x3084;&#x3051;&#x304C;&#x306B;&#x5931;&#x308F;&#x308C;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x738B;&#x56FD;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6210;&#x4F53;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x7DAD;&#x6301;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x5206;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x96FB;&#x4F4D;&#x306E;&#x8A98;&#x767A;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x6226;&#x7565;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x4FAE;&#x8FB1;&#x306E;&#x3053;&#x306E;&#x3055;&#x307E;&#x3056;&#x307E;&#x306A;&#x751F;&#x304D;&#x6B8B;&#x308B;&#x3002; Repatterning&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x5834;&#x5408;&#x3001;&#x80DA;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x5C0E;&#x5165;&#x3001;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x554F;&#x984C;&#x306F;&#x3001;&#x518D;&#x751F;&#x304C;&#x80DA;&#x767A;&#x751F;&#x3001;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x5F62;&#x6210;&#x306E;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x5341;&#x5206;&#x306B;&#x78BA;&#x7ACB;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304B;&#x3089;&#x69CB;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x56DE;&#x8DEF;&#x3092;&#x8D77;&#x52D5;&#x3059;&#x308B;&#x304B;&#x3069;&#x3046;&#x304B;&#x3001;&#x690D;&#x7269;&#x3068;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306B;&#x6B8B;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x4E09;&#x56FD;&#x9593;&#x3067;&#x306E;&#x30B9;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#xFF1A;&#x690D;&#x7269;&#x3068;&#x52D5;&#x7269;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x518D;&#x751F;

&#xC0C1;&#xB300;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xAE34; &#xC218;&#xBA85;&#xC744; &#xAC00;&#xC9C4; &#xB2E4;&#xC138;&#xD3EC; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xC0C1;&#xC218;, &#xB2E4;&#xC591; &#xD558; &#xACE0; &#xC790;&#xC8FC; &#xAC15;&#xB82C;&#xD55C; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC0DD;&#xC874;&#xC744; &#xB0B4;&#xC7A5; &#xBC0F; &#xC678;&#xBD80; &#xACFC;&#xC81C;&#xB97C; &#xBC1B;&#xAC8C; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB3D9;&#xBB3C; &#xBC0F; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC870;&#xC9C1; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xC0DD;&#xB9AC; &#xC801; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC758; &#xD55C; &#xBD80;&#xBD84;&#xC73C;&#xB85C; &#xBC16;&#xC73C;&#xB85C; &#xCC29;&#xC6A9; &#xD558; &#xACE0; &#xC721; &#xC2DD; &#xB3D9;&#xBB3C;, &#xC9C8;&#xBCD1; &#xBC0F; &#xC0C1;&#xD574;&#xB85C; &#xC190;&#xC2E4; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB450; &#xC655;&#xAD6D; &#xC804;&#xB7B5; &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654; &#xB41C; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC131;&#xCCB4; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xC720;&#xC9C0; &#xBCF4;&#xC218; &#xB610;&#xB294; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xC720;&#xB3C4; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xBAA8;&#xC695;&#xC774; &#xC0B4;&#xC544;&#xB0A8;&#xC744;. Repatterning &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC740; &#xC885;&#xC885; &#xBC30;&#xC544; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xBC30;&#xD3EC; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xD638;&#xCD9C; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;, &#xD328;&#xD134;&#xD654; &#xC77C;&#xBC18; embryogenesis &#xC5EC;&#xBD80;&#xB97C; &#xC798;-&#xC124;&#xB9BD; &#xD328;&#xD130; &#xB2DD; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xD68C;&#xB85C; &#xAD6C;&#xC131; &#xC9C8;&#xBB38; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xACFC; &#xB3D9;&#xBB3C;&#xC774; &#xB0A8;&#xC544; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC655;&#xAD6D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2AC; &#xB77C;&#xC774; &#xC2F1;: &#xC2DD;&#xBB3C;&#xACFC; &#xB3D9;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C;.

Los organismos multicelulares que poseen ciclos de vida relativamente largos est&#xE1;n sujetos a constantes diversos, ya menudo intensos desaf&#xED;os intr&#xED;nsecos y extr&#xED;nsecos para su supervivencia. Tejidos animales y vegetales llevan a cabo como parte de las funciones fisiol&#xF3;gicas normales y se puede perder a los depredadores, enfermedades y lesiones. Ambos reinos sobrevivir a esta amplia variedad de insultos por parte de las estrategias que incluyen el mantenimiento de las c&#xE9;lulas madre adultas o de la inducci&#xF3;n del potencial de c&#xE9;lulas madre en c&#xE9;lulas diferenciadas. Mecanismos Repatterning a menudo despliegan los genes embrionarios, pero la pregunta sigue siendo en ambas plantas y animales si la regeneraci&#xF3;n invoca la embriog&#xE9;nesis, los mecanismos gen&#xE9;ricos de patrones, o los circuitos &#xFA;nica compuesta de genes del patr&#xF3;n bien establecido.

Cortando trav&#xE9;s de Reinos: La regeneraci&#xF3;n de plantas y animales

&#x77AC;&#x6001;&#x57FA;&#x56E0;&#x6539;&#x9020;&#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x539F;&#x751F;&#x8D28;&#x4F53;&#x662F;&#x690D;&#x7269;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x8BB8;&#x591A;&#x65B9;&#x9762;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x4E00;&#x79CD;&#x7B80;&#x5355;&#x548C;&#x5FEB;&#x901F;&#x7684;&#x6280;&#x672F;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#x540E;&#x751F;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x5229;&#x7528;&#x57FA;&#x4E8E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x68C0;&#x5B9A;&#xFF0C;&#x82E5;&#x8981;&#x67E5;&#x8BE2;&#x4F7F;&#x7528;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7684;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x901A;&#x8DEF;&#x3002;&#x690D;&#x7269;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x5BB6;&#x53EF;&#x53D7;&#x76CA;&#x4E8E;&#x6269;&#x5927;&#x7EC6;&#x80DE;&#x57F9;&#x517B;&#x7528;&#x4E8E;&#x5927;&#x89C4;&#x6A21;&#x57FA;&#x56E0;&#x529F;&#x80FD;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x65B0;&#x5DE5;&#x5177;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5F00;&#x53D1;&#x4E86;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7CFB;&#x7EDF;&#xFF0C;&#x5B83;&#x91C7;&#x7528;&#x8367;&#x5149;&#x9633;&#x6027;&#x9009;&#x62E9;&#x4E0E;&#x6D41;&#x6D41;&#x5F0F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4EEA;&#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x6392;&#x5E8F;&#x5B8C;&#x5168;&#x9694;&#x79BB;&#x5728;&#x8F6C;&#x6362;&#x540E;&#x7684;&#x539F;&#x751F;&#x8D28;&#x4F53;&#x4E2D;&#x7684;&#x53CD;&#x5E94;&#x7684;&#x8367;&#x5149;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x76F8;&#x7ED3;&#x5408;&#x3002;&#x8BE5;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x514B;&#x670D;&#x4E86;&#x8F6C;&#x67D3;&#x7684;&#x7F3A;&#x70B9;&#x539F;&#x751F;&#x8D28;&#x4F53;&#x60AC;&#x6D6E;&#x6DB2;&#x5F80;&#x5F80;&#x662F;&#x5F02;&#x7C7B;&#x6DF7;&#x5408;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#xFF0C;&#x5E76;&#x4E0D;&#x6210;&#x529F;&#x8F6C;&#x53D8;&#x3002;&#x6B64;&#x7F51;&#x5173;&#x517C;&#x5BB9;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x5141;&#x8BB8;&#x4F7F;&#x7528;&#x9AD8;&#x6548;&#x8868;&#x8FBE;&#x57FA;&#x56E0;&#x7535;&#x8DEF;&#x7684;&#x9AD8;&#x901A;&#x91CF;&#x7B5B;&#x9009;&#x3002;&#x7EA2;&#x8272;&#x8367;&#x5149;&#x86CB;&#x767D;&#x7B5B;&#x9009;&#x6807;&#x8BB0;&#x5141;&#x8BB8;&#x5C06;&#x7EB3;&#x5165;&#x8054;&#x5408;&#x5229;&#x7528;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7EFF;&#x8272;&#x8367;&#x5149;&#x86CB;&#x767D; (GFP) &#x7684;&#x5DE5;&#x5177;&#x3002;&#x4F8B;&#x5982;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x79CD;&#x53CC;&#x91CD;&#x7684;&#x8D34;&#x6807;&#x529E;&#x6CD5;&#x5141;&#x8BB8; GFP &#x8BB0;&#x8005;&#x6D41;&#x5F0F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4EEA;&#x5206;&#x6790;&#x57FA;&#x56E0;&#x6D3B;&#x5316;&#x7684;&#x8F6C;&#x5316;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6216;&#x8367;&#x5149;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x7684;&#x6392;&#x5E8F;&#x5206;&#x79BB;&#x548C;&#x7EFF;&#x8272;&#x8367;&#x5149;&#x86CB;&#x767D;&#x6807;&#x8BB0;&#x7684;&#x7279;&#x5B9A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x4EBA;&#x53E3;&#x7684;&#x8FC7;&#x5EA6;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F71;&#x54CD;&#x4E0B;&#x6E38;&#x8003;&#x8BD5;&#x4E2D;&#x660E;&#x793A;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x793A;&#x4F8B;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x65B0;&#x7684;&#x7528;&#x9014;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E00;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x88AB;&#x5E94;&#x7528;&#x5230;&#x7684;&#x751F;&#x957F;&#x7D20;&#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#xFF0C;&#x7814;&#x7A76;&#x5229;&#x7528;&#x7EA2;&#x8272;&#x8367;&#x5149;&#x86CB;&#x767D;/GFP &#x53CC;&#x91CD;&#x8D34;&#x6807;&#x80FD;&#x529B;&#x3002;&#x54CD;&#x5E94;&#x7684;&#x751F;&#x957F;&#x7D20;&#x54CD;&#x5E94;&#x7F51;&#x7EDC;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x5360;&#x4E3B;&#x5BFC;&#x5730;&#x4F4D;&#x7684;&#x6D88;&#x6781;&#x751F;&#x957F;&#x7D20;&#x4FE1;&#x53F7;&#x4F20;&#x8F93;&#x7EC4;&#x4EF6;&#x901A;&#x8FC7;&#x64CD;&#x7EB5;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x91CF;&#x5316;&#x5BF9;&#x751F;&#x957F;&#x7D20;&#x53CD;&#x5E94; DR5::GFP &#x8BB0;&#x8005;&#x57FA;&#x56E0;&#x6FC0;&#x6D3B;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x914D;&#x7F6E;&#x6587;&#x4EF6;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x8F6C;&#x5F55;&#x53D8;&#x5316;&#x5177;&#x4F53;&#x8868;&#x793A;&#x6839;&#x8868;&#x76AE;&#x6807;&#x8BB0;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;

&#x9633;&#x6027;&#x8367;&#x5149;&#x9009;&#x62E9;&#x5728;&#x690D;&#x7269;&#x539F;&#x751F;&#x8D28;&#x4F53;&#x4E2D;&#x5141;&#x8BB8;&#x7CBE;&#x786E;&#x3001; &#x5FEB;&#x901F;&#x548C;&#x6DF1;&#x5165;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

Transient genetic modification of plant protoplasts is a straightforward and rapid technique for the study of numerous aspects of plant biology. Recent studies in metazoan systems have utilized cell-based assays to interrogate signal transduction pathways using high-throughput methods. Plant biologists could benefit from new tools that expand the use of cell culture for large-scale analysis of gene function. We have developed a system that employs fluorescent positive selection in combination with flow cytometric analysis and fluorescence-activated cell sorting to isolate responses in the transformed protoplasts exclusively. The system overcomes the drawback that transfected protoplast suspensions are often a heterogeneous mix of cells that have and have not been successfully transformed. This Gateway-compatible system enables high-throughput screening of genetic circuitry using overexpression. The incorporation of a red fluorescent protein selection marker enables combined utilization with widely available green fluorescent protein (GFP) tools. For instance, such a dual labeling approach allows cytometric analysis of GFP reporter gene activation expressly in the transformed cells or fluorescence-activated cell sorting-mediated isolation and downstream examination of overexpression effects in a specific GFP-marked cell population. Here, as an example, novel uses of this system are applied to the study of auxin signaling, exploiting the red fluorescent protein/GFP dual labeling capability. In response to manipulation of the auxin response network through overexpression of dominant negative auxin signaling components, we quantify effects on auxin-responsive DR5::GFP reporter gene activation as well as profile genome-wide transcriptional changes specifically in cells expressing a root epidermal marker.

Positive fluorescent selection permits precise, rapid, and in-depth overexpression analysis in plant protoplasts.

Transient modification g&#xE9;n&#xE9;tique des protoplastes de plantes est une technique simple et rapide pour l&#x26;#39;&#xE9;tude de nombreux aspects de la biologie v&#xE9;g&#xE9;tale. Des &#xE9;tudes r&#xE9;centes dans les syst&#xE8;mes de m&#xE9;tazoaires ont utilis&#xE9; des cellules &#xE0; base de tests d&#x26;#39;interroger les voies de transduction de signal en utilisant des m&#xE9;thodes &#xE0; haut d&#xE9;bit. Biologistes v&#xE9;g&#xE9;taux pourraient b&#xE9;n&#xE9;ficier de nouveaux outils qui &#xE9;largissent l&#x26;#39;utilisation de la culture cellulaire pour analyse &#xE0; grande &#xE9;chelle de la fonction des g&#xE8;nes. Nous avons d&#xE9;velopp&#xE9; un syst&#xE8;me qui emploie fluorescente s&#xE9;lection positive en combinaison avec l&#x26;#39;analyse par cytom&#xE9;trie en flux et tri cellulaire activ&#xE9; par fluorescence afin d&#x26;#39;isoler les r&#xE9;ponses dans les protoplastes transform&#xE9;s exclusivement. Le syst&#xE8;me permet de surmonter l&#x26;#39;inconv&#xE9;nient que les suspensions de protoplastes transfect&#xE9;s sont souvent un m&#xE9;lange h&#xE9;t&#xE9;rog&#xE8;ne de cellules qui ont et n&#x26;#39;ont pas &#xE9;t&#xE9; transform&#xE9;es avec succ&#xE8;s. Ce syst&#xE8;me de passerelle compatible permet criblage &#xE0; haut d&#xE9;bit des circuits g&#xE9;n&#xE9;tiques utilisant la surexpression. L&#x26;#39;incorporation d&#x26;#39;un marqueur prot&#xE9;ine fluorescente rouge de s&#xE9;lection permet une utilisation combin&#xE9;e avec largement disponibles prot&#xE9;ine fluorescente verte (GFP) outils. Par exemple, une telle approche double &#xE9;tiquetage permet l&#x26;#39;analyse cytom&#xE9;trique de l&#x26;#39;activation du g&#xE8;ne rapporteur GFP express&#xE9;ment dans les cellules transform&#xE9;es ou activ&#xE9; par fluorescence cellulaire tri-m&#xE9;diation d&#x26;#39;isolement et de l&#x26;#39;examen en aval de la surexpression des effets dans une population de cellules GFP-marqu&#xE9;e sp&#xE9;cifique. Ici, comme un exemple, le roman utilise de ce syst&#xE8;me sont appliqu&#xE9;s &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;tude de l&#x26;#39;auxine de signalisation, l&#x26;#39;exploitation de la prot&#xE9;ine fluorescente rouge / GFP capacit&#xE9; de double &#xE9;tiquetage. En r&#xE9;ponse &#xE0; la manipulation du r&#xE9;seau de r&#xE9;ponse auxine par surexpression de l&#x26;#39;auxine dominant n&#xE9;gatif de signalisation composants, on quantifie les effets sur l&#x26;#39;auxine r&#xE9;agissant DR5 :: activation GFP g&#xE8;ne rapporteur ainsi que le profil au niveau du g&#xE9;nome changements de transcription sp&#xE9;cifique dans des cellules exprimant un marqueur racine &#xE9;pidermique.

S&#xE9;lection positive fluorescent Permis pr&#xE9;cis, rapide, et de l&#x26;#39;analyse en profondeur surexpression dans des protoplastes v&#xE9;g&#xE9;taux

Transiente genetische Ver&auml;nderung der Betriebsurformen ist eine einfache und schnelle Technik f&uuml;r das Studium der zahlreichen Aspekte der Pflanzenbiologie. Neuere Studien in indem Systeme haben zellbasierte Assays zum Signaltransduction Bahnen mit Hochdurchsatz-Methoden zu verh&ouml;ren genutzt. Pflanze Biologen, die von neuen Tools profitieren konnten, die die Verwendung von Zellkulturen f&uuml;r gro&szlig; angelegte Analyse der Genfunktion zu erweitern. Wir haben ein System entwickelt, das fluoreszierende positive Auswahl in Kombination mit Flow Cytometric Analyse und Fluoreszenz-aktivierte Zelle Sortieren um Antworten in der transformierten Urformen ausschlie&szlig;lich isolieren besch&auml;ftigt. Das System &uuml;berwindet den Nachteil, das transfected Urform Suspensionen sind oft eine heterogene Mischung aus Zellen, die haben und nicht erfolgreich gewandelt haben. Diese Gateway-kompatibles System erm&ouml;glicht High-Throughput-Screening der genetischen Schaltung mit &Uuml;berexpression. Die Einbeziehung einer roten fluoreszierenden Proteins Selektionsmarker erm&ouml;glicht kombiniert Auslastung mit weithin verf&uuml;gbar gr&uuml;n fluoreszierendes Protein (GFP) Tools. Beispielsweise kann solchen dualen Kennzeichnung Ansatz Cytometric Analyse der GFP-Reporter Genaktivierung ausdr&uuml;cklich in transformierten Zellen oder Fluoreszenz-aktivierte Zelle Sortieren-vermittelte Isolierungs- und nachgelagerte Untersuchung der &Uuml;berexpression Effekte in einer bestimmten Zellpopulation im GFP-gepr&uuml;ft. Ausnutzung der hier, wie beispielsweise neuartige Verwendungen dieses Systems gelten f&uuml;r das Studium der Auxine zu signalisieren, das rot fluoreszierende Protein/GFP-dual-Kennzeichnung-Technik. In Reaktion auf die Manipulation von Auxin Antwort Netzwerk &uuml;ber eine &Uuml;berexpression von dominierenden negativen Auxine Signalling Komponenten quantifizieren wir Auswirkungenauf die Auxine-responsive DR5::GFP Reporter Genaktivierung sowie Profil&auml;nderungen genomweiten transkriptionelle speziell in Zellen, die einen Stamm-epidermale-Marker zum Ausdruck zu bringen.

Positive Fluoreszenz-Auswahl erm&ouml;glicht eine pr&auml;zise, schnelle und gr&uuml;ndliche &Uuml;berexpression Analyse in Betriebsurformen.

Transitoria modificazione genetica dei protoplasti vegetali &egrave; una tecnica semplice e rapida per lo studio di numerosi aspetti della biologia vegetale. Recenti studi nei metazoi sistemi hanno utilizzato cell-based assays per interrogare i vie di trasduzione del segnale mediante metodi di alto-rendimento. I biologi vegetali potrebbero beneficiare di nuovi strumenti che espandono l&#39;uso della coltura delle cellule per l&#39;analisi su larga scala di funzione del gene. Abbiamo sviluppato un sistema che impiega fluorescente selezione positiva in combinazione con analisi citofluorimetriche e fluorescenza-attivato delle cellule ordinamento per isolare esclusivamente risposte ai protoplasti trasformati. Il sistema supera lo svantaggio che transfected protoplasto sospensioni sono spesso un mix eterogeneo di cellule che hanno e non sono state trasformate con successo. Questo sistema compatibile con Gateway consente di high-throughput screening genetico circuiti tramite sovraespressione di. L&#39;incorporazione di un marcatore di selezione proteina fluorescente permette di rosso combinato utilizzo con strumenti ampiamente disponibile proteina fluorescente verde (GFP). Per esempio, un duplice approccio d&#39;etichettatura consente l&#39;analisi cytometric di reporter GFP attivazione genica espressamente in cellule trasformate o isolamento di ordinamento-mediata delle cellule di fluorescenza-attivato e a valle esame degli effetti di sovraespressione in una popolazione specifica delle cellule GFP-contrassegnato. Qui, come esempio, romanzo utilizzi di questo sistema sono applicate allo studio dell&#39;auxina di segnalazione, sfruttando la capacit&agrave; di etichettatura dual rosso proteina fluorescente/GFP. In risposta alla manipolazione della rete auxina risposta attraverso la sovraespressione di segnalazione componenti dominante negativo auxina, noi quantificare gli effetti su auxina-reattiva attivazione di gene di reporter DR5::GFP cos&igrave; come profilo genome-wide transcriptional modifiche specificamente nelle cellule che esprimono un marcatore epidermico radice.

Selezione positiva fluorescenti permette sovraespressione precisa, rapida e approfondita analisi in protoplasti vegetali.

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GFP&#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x306A;&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x3002;

&#x6B63;&#x306E;&#x86CD;&#x5149;&#x30BB;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x690D;&#x7269;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30D7;&#x30E9;&#x30B9;&#x30C8;&#x3067;&#x3001;&#x7CBE;&#x5BC6;&#x8FC5;&#x901F;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x8A73;&#x7D30;&#x306A;&#x904E;&#x5270;&#x767A;&#x73FE;&#x89E3;&#x6790;&#x3092;&#x8A31;&#x53EF;

&#xC2DD;&#xBB3C; protoplasts&#xC758; &#xBCC0;&#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC870;&#xC791; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559;&#xC758; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xCE21;&#xBA74;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC04;&#xB2E8; &#xD558; &#xACE0; &#xC2E0;&#xC18D; &#xD558; &#xAC8C; &#xAE30;&#xC220;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. Metazoan &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCD5C;&#xADFC; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB97C; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC2E0;&#xD638; &#xBCC0;&#xD658; &#xD1B5;&#xB85C;&#xAC00; &#xC138;&#xD3EC; &#xAE30;&#xBC18; &#xBD84;&#xC11D; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xD65C;&#xC6A9;. &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559; &#xB300;&#xADDC;&#xBAA8; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xC138;&#xD3EC; &#xBC30;&#xC591;&#xC758; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xC744; &#xD655;&#xC7A5; &#xD558;&#xB294; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB3C4;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD61C;&#xD0DD;&#xC744; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xD615;&#xAD11; &#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC778; &#xC120;&#xD0DD; &#xD750;&#xB984; cytometric &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F; &#xD615;&#xAD11; &#xD65C;&#xC131; &#xC140; &#xC815;&#xB82C; &#xBCC0;&#xD658; &#xB41C; protoplasts&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xB3C5;&#xC810;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xACA9;&#xB9AC;&#xB97C; &#xD568;&#xAED8; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC744; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xD398; &#xB2E8;&#xC810; &#xADF9;&#xBCF5; &#xC6D0;&#xC0DD; &#xB3D9;&#xBB3C; &#xC815;&#xC9C0;&#xB294; &#xC131;&#xACF5;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xBCC0;&#xD658; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBC0F; &#xC140;&#xC758; &#xB2E4;&#xB978; &#xC720;&#xD615;&#xC758; &#xD63C;&#xD569;. &#xC774; &#xAC8C;&#xC774;&#xD2B8;&#xC6E8;&#xC774; &#xD638;&#xD658; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; overexpression&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD68C;&#xB85C;&#xC758; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xAC80;&#xC5F4; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD615;&#xAD11; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC120;&#xD0DD; &#xB9C8;&#xCEE4; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xBA74; &#xBE68;&#xAC04;&#xC0C9;&#xC758; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xB179;&#xC0C9; &#xD615;&#xAD11; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (GFP) &#xB3C4;&#xAD6C;&#xC640; &#xD568;&#xAED8; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xACB0;&#xD569;. &#xC608;&#xB97C; &#xB4E4;&#xC5B4;, &#xAC19;&#xC740; &#xC774;&#xC911; &#xB808;&#xC774;&#xBE14; &#xC811;&#xADFC; GFP &#xAE30;&#xC790;&#xC758; cytometric &#xBD84;&#xC11D; &#xBCC0;&#xD658; &#xB41C; &#xC140; &#xB610;&#xB294; &#xD615;&#xAD11; &#xD65C;&#xC131; &#xC140; &#xC815;&#xB82C; &#xC911;&#xC7AC; &#xACA9;&#xB9AC; &#xBC0F; &#xD2B9;&#xC815; GFP &#xD45C;&#xC2DC; &#xC140; &#xC778;&#xAD6C; overexpression &#xD6A8;&#xACFC;&#xC758; &#xB2E4;&#xC6B4;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB9BC; &#xC2DC;&#xD5D8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBA85;&#xC2DC;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD65C;&#xC131;&#xD654;&#xB97C; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBE68;&#xAC04; &#xD615;&#xAD11; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;/GFP &#xB4C0;&#xC5BC; &#xB77C;&#xBCA8; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xC545;&#xC6A9; &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC608;&#xB97C; &#xB4E4;&#xC5B4;,&#xC774; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xC18C;&#xC124; auxin &#xC2DC;&#xADF8;&#xB110;&#xB9C1;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xC801;&#xC6A9; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC9C0;&#xBC30;&#xC801;&#xC778; &#xBD80;&#xC815;&#xC801;&#xC778; auxin &#xC2E0;&#xD638; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C; overexpression &#xD1B5;&#xD574; auxin &#xC751;&#xB2F5; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xC758; &#xC870;&#xC791;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xD504;&#xB85C;&#xD544; &#xAC8C;&#xB188; &#xB113;&#xC740; transcriptional &#xBCC0;&#xACBD; &#xC140; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xC0C1;&#xD53C; &#xB9C8;&#xCEE4; &#xD45C;&#xD604;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD2B9;&#xD788; auxin &#xBC18;&#xC751; DR5::GFP &#xB9AC;&#xD3EC;&#xD130; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD65C;&#xC131;&#xD654;&#xC5D0; &#xD6A8;&#xACFC; &#xACC4;&#xB7C9;.

&#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC778; &#xD615;&#xAD11; &#xC120;&#xD0DD; &#xACF5;&#xC7A5; protoplasts&#xC5D0; overexpression, &#xC2E0;&#xC18D;, &#xC815;&#xD655; &#xD558; &#xACE0; &#xAE4A;&#xC774; &#xC788;&#xB294; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

La modificaci&#xF3;n gen&#xE9;tica transitoria de protoplastos de plantas es una t&#xE9;cnica sencilla y r&#xE1;pida para el estudio de numerosos aspectos de la biolog&#xED;a de las plantas. Estudios recientes en los sistemas de metazoos se han utilizado ensayos basados &#x200B;&#x200B;en c&#xE9;lulas para interrogar a las v&#xED;as de transducci&#xF3;n de se&#xF1;ales que utilizan m&#xE9;todos de alto rendimiento. Los bi&#xF3;logos de vegetales podr&#xED;an beneficiarse de las nuevas herramientas que ampl&#xED;an el uso de cultivo celular a gran escala de an&#xE1;lisis de la funci&#xF3;n del gen. Hemos desarrollado un sistema que emplea la selecci&#xF3;n positiva fluorescente en combinaci&#xF3;n con el an&#xE1;lisis de citometr&#xED;a de flujo y activado por fluorescencia de c&#xE9;lulas de clasificaci&#xF3;n para aislar las respuestas en los protoplastos transformados exclusivamente. El sistema supera el inconveniente de que las suspensiones de protoplastos transfectados con frecuencia son una mezcla heterog&#xE9;nea de c&#xE9;lulas que tienen y no se han transformado con &#xE9;xito. Este sistema de puerta de enlace compatible permite selecci&#xF3;n de alto rendimiento de los circuitos gen&#xE9;ticos con la sobreexpresi&#xF3;n. La incorporaci&#xF3;n de un marcador fluorescente de color rojo de selecci&#xF3;n de prote&#xED;nas permite la utilizaci&#xF3;n combinada con una amplia difusi&#xF3;n prote&#xED;na verde fluorescente (GFP) de herramientas. Por ejemplo, un enfoque de doble etiquetado permite a los an&#xE1;lisis de citometr&#xED;a de la activaci&#xF3;n del gen reportero GFP expresa en las c&#xE9;lulas transformadas o de fluorescencia de c&#xE9;lulas activadas por la clasificaci&#xF3;n mediada por el aislamiento y el examen posterior de los efectos de la sobreexpresi&#xF3;n de una poblaci&#xF3;n celular espec&#xED;fica GFP-marcada. Aqu&#xED;, como un ejemplo, nuevos usos de este sistema se aplican al estudio de la auxina se&#xF1;alizaci&#xF3;n, explotando el rojo fluorescente prote&#xED;na / GFP capacidad de etiquetado doble. En respuesta a la manipulaci&#xF3;n de la red de respuesta auxina a trav&#xE9;s de la sobreexpresi&#xF3;n de la auxina dominante negativo componentes de se&#xF1;alizaci&#xF3;n, que cuantificar los efectos de la auxina de respuesta DR5 T&#xED;tulo de la activaci&#xF3;n del gen GFP as&#xED; como el perfil en todo el genoma transcripcional cambios espec&#xED;ficamente en las c&#xE9;lulas que expresan un marcador ra&#xED;z de la epidermis.

Selecci&#xF3;n fluorescente positiva Permite preciso, r&#xE1;pido, y an&#xE1;lisis en profundidad sobre-expresi&#xF3;n en protoplastos de la planta

&#x690D;&#x7269;&#x4F9D;&#x8D56;&#x7EF4;&#x6301;&#x5176;&#x6301;&#x7EED;&#x589E;&#x957F;&#x7684;&#x6839;&#x4E0E;&#x82BD;&#x5C16;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x9F9B;&#x3002;&#x4E0D;&#x8FC7;&#xFF0C;&#x867D;&#x7136;&#x8868;&#x660E;&#x4E86;&#x690D;&#x7269;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x53D1;&#x80B2;&#x53EF;&#x5851;&#x6027;&#xFF0C;&#x5B83;&#x4E0D;&#x662F;&#x77E5;&#x9053;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5DE2;&#x662F;&#x5426;&#x9700;&#x8981;&#x5668;&#x5B98;&#x53D1;&#x751F;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x63A2;&#x8BA8;&#x7684;&#x8303;&#x56F4;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x533A;&#x5206;&#x7EC6;&#x80DE;&#x518D;&#x751F;&#x5668;&#x5B98;&#x6CA1;&#x6709;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5DE2;&#x6D3B;&#x52A8;&#x7684;&#x80FD;&#x529B;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528;&#x5728;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x6839;&#x5C16;&#x518D;&#x751F;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x8DDF;&#x8E2A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x547D;&#x8FD0;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x53CA;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x6062;&#x590D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x663E;&#x793A;&#x8BE5; re-specification &#x4E22;&#x5931;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x8EAB;&#x4EFD;&#x5F00;&#x59CB;&#x5207;&#x9664;&#x5C0F;&#x65F6;&#x5185;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5728;&#x4E00;&#x5929;&#x4E4B;&#x5185;&#x6062;&#x590D;&#x7684;&#x4E13;&#x95E8;&#x7EC6;&#x80DE;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x5173;&#x952E;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x518D;&#x751F;&#x6536;&#x76CA;&#x672A;&#x80FD;&#x4FDD;&#x6301;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5DE2;&#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#x4E0E;&#x690D;&#x7269;&#x4E2D;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x8C03;&#x89E3;&#x5B8C;&#x6574;&#x5668;&#x5B98;&#x518D;&#x751F;&#x7684;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6837;&#x5C5E;&#x6027;&#x5206;&#x6563;&#x5728;&#x690D;&#x7269;&#x5206;&#x751F;&#x7EC4;&#x7EC7;&#xFF0C;&#x5E76;&#x4E0D;&#x9650;&#x4E8E;&#xFF0C;&#x4E0D;&#x8FC7;&#x4F3C;&#x4E4E;&#x662F;&#x4E0D;&#x786E;&#x5B9A;&#x7684;&#x589E;&#x957F;&#x6240;&#x9700;&#x7684;&#x7A9F;&#x9F9B;&#x3002;&#x6574;&#x4E2A;&#x5668;&#x5B98;&#x6CA1;&#x6709;&#x8FC7;&#x6E21;&#x5230;&#x5B9A;&#x578B;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x73AF;&#x5883;&#x8FD9;&#x84C4;&#x70ED;&#x5F0F;&#x7F16;&#x7A0B;&#x6210;&#x4EBA;&#x673A;&#x5173;&#x7684;&#x52A8;&#x7269;&#x6709;&#x6700;&#x8FD1;&#x62A5;&#x544A;&#x7684;&#x7279;&#x5B9A;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x5206;&#x5316;&#x6709;&#x8DA3;&#x7684;&#x76F8;&#x4F3C;&#x4E4B;&#x5904;&#x3002;

&#x5668;&#x5B98;&#x518D;&#x751F;&#x4E0D;&#x9700;&#x8981;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5DE2;&#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x3002;

Plants rely on the maintenance of stem cell niches at their apices for the continuous growth of roots and shoots. However, although the developmental plasticity of plant cells has been demonstrated, it is not known whether the stem cell niche is required for organogenesis. Here we explore the capacity of a broad range of differentiating cells to regenerate an organ without the activity of a stem cell niche. Using a root-tip regeneration system in Arabidopsis thaliana to track the molecular and functional recovery of cell fates, we show that re-specification of lost cell identities begins within hours of excision and that the function of specialized cells is restored within one day. Critically, regeneration proceeds in plants with mutations that fail to maintain the stem cell niche. These results show that stem-cell-like properties that mediate complete organ regeneration are dispersed in plant meristems and are not restricted to niches, which nonetheless seem to be necessary for indeterminate growth. This regenerative reprogramming of an entire organ without transition to a stereotypical stem cell environment has intriguing parallels to recent reports of induced transdifferentiation of specific cell types in the adult organs of animals.

Organ regeneration does not require a functional stem cell niche in plants.

Plantes compter sur le maintien des niches de cellules souches &#xE0; leurs sommets pour la croissance continue des racines et des pousses. Cependant, bien que la plasticit&#xE9; du d&#xE9;veloppement des cellules v&#xE9;g&#xE9;tales a &#xE9;t&#xE9; d&#xE9;montr&#xE9;, on ne sait pas si le cr&#xE9;neau de cellules souches est n&#xE9;cessaire pour l&#x26;#39;organogen&#xE8;se. Ici, nous explorons la capacit&#xE9; d&#x26;#39;un large &#xE9;ventail de diff&#xE9;renciation des cellules de se r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;rer un organe sans que l&#x26;#39;activit&#xE9; d&#x26;#39;une niche de cellules souches. L&#x26;#39;utilisation d&#x26;#39;un syst&#xE8;me de r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration des racines pointe chez Arabidopsis thaliana pour suivre la reprise mol&#xE9;culaire et fonctionnelle des destin&#xE9;es cellulaires, nous montrons que re-sp&#xE9;cification de l&#x26;#39;identit&#xE9; des cellules perdues commence quelques heures apr&#xE8;s l&#x26;#39;excision et que la fonction des cellules sp&#xE9;cialis&#xE9;es est r&#xE9;tabli dans la journ&#xE9;e. Critique d&#x26;#39;un produit de r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration, dans les usines avec des mutations qui ne parviennent pas &#xE0; maintenir la niche de cellules souches. Ces r&#xE9;sultats montrent que les cellules souches des propri&#xE9;t&#xE9;s similaires qui interviennent dans la r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration des organes complets sont dispers&#xE9;s dans les m&#xE9;rist&#xE8;mes de plantes et ne sont pas circonscrites &#xE0; des niches, qui semblent n&#xE9;anmoins &#xEA;tre n&#xE9;cessaire pour la croissance ind&#xE9;termin&#xE9;e. Cette r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration reprogrammation d&#x26;#39;un organe entier sans transition &#xE0; un environnement de cellules souches st&#xE9;r&#xE9;otyp&#xE9;e des parall&#xE8;les intrigants &#xE0; des rapports r&#xE9;cents de la transdiff&#xE9;renciation induite par des types sp&#xE9;cifiques de cellules dans les organes adultes d&#x26;#39;animaux.

La r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration des organes ne n&#xE9;cessite pas une niche souches fonctionnelle cellulaire chez les plantes

Pflanzen st&uuml;tzen sich auf die Aufrechterhaltung der Stammzelle Nischen an ihren Spitzen f&uuml;r das kontinuierliche Wachstum der Wurzeln und Triebe. Aber obwohl die Entwicklungsbiologie Plastizit&auml;t der Pflanzenzellen gezeigt hat, ist nicht bekannt, ob die Stammzelle Nische f&uuml;r Organogenese erforderlich ist. Hier erkunden wir die Kapazit&auml;t eines breiten Spektrums von differenzierten Zellen ein Organs ohne die Aktivit&auml;t der Stammzelle Nische zu regenerieren. Verwenden ein Stamm-Tip-Regenerationsanlage in Arabidopsis Thaliana, um die molekulare und funktionelle Wiederherstellung Schicksale der Zelle zu verfolgen, zeigen wir, dass Re-specification der verlorenen Zelle Identit&auml;ten beginnt innerhalb von Stunden nach Exzision und, dass die Funktion von spezialisierten Zellen innerhalb eines Tages wiederhergestellt wird. Kritisch, verf&auml;hrt Regenerierung Pflanzen mit Mutationen, die nicht die Stammzelle Nische zu pflegen. Diese Ergebnisse zeigen, dass Vorbau-Zelle-wie Eigenschaften, die komplette Organregeneration vermitteln in Anlage Meristems dispergiert sind und Nischen, die dennoch f&uuml;r unbestimmten Wachstum erforderlich scheinen nicht eingeschr&auml;nkt sind. Diese regenerative Neuprogrammierung eines ganzen Organs ohne &Uuml;bergang zu einem Stereotypen Stammzell-Umfeld hat interessante Parallelen zu den j&uuml;ngsten Berichten der induzierten Transdifferenzierung von bestimmten Zelltypen in den Erwachsenen Organen von Tieren.

Organregeneration erfordert keine funktionelle Stammzelle Nische in Pflanzen.

Piante fanno affidamento sul mantenimento delle cellule staminali nicchie a loro apici per la continua crescita di radici e germogli. Tuttavia, anche se &egrave; stata dimostrata la plasticit&agrave; dello sviluppo delle cellule vegetali, non &egrave; noto se la nicchia delle cellule staminali &egrave; necessaria per organogenesi. Qui Esploriamo la capacit&agrave; di una vasta gamma di differenziazione delle cellule di un organo senza l&#39;attivit&agrave; di nicchia delle cellule staminali di rigenerare. Utilizzando un sistema di rigenerazione di radice-punta in Arabidopsis thaliana per monitorare il recupero funzionale e molecolare dei destini di cella, mostriamo che re-specification della cella perduta identit&agrave; inizia entro ore di escissione e che la funzione delle cellule specializzate &egrave; ripristinata entro un giorno. Criticamente, rigenerazione procede in piante con mutazioni che non riescono a mantenere la nicchia delle cellule staminali. Questi risultati mostrano che il gambo-cellula-come propriet&agrave; che mediano organo completa rigenerazione sono dispersi nei Meristemi vegetali e non sono limitati a nicchie, che tuttavia sembrano essere necessari per la crescita indeterminata. Questo rigenerativa riprogrammazione di un organo intero senza transizione verso un ambiente stereotipata della cellula formativa ha paralleli intriganti a rapporti recenti di transdifferenziazione indotta di tipi cellulari specifici negli organi adulti degli animali.

Rigenerazione di organo non richiede una nicchia funzionale delle cellule staminali nelle piante.

&#x690D;&#x7269;&#x306F;&#x6839;&#x3068;&#x82BD;&#x306E;&#x9023;&#x7D9A;&#x7684;&#x306A;&#x6210;&#x9577;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x9802;&#x70B9;&#x306B;&#x3042;&#x308B;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C1;&#x306E;&#x7DAD;&#x6301;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x690D;&#x7269;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x767A;&#x9054;&#x53EF;&#x5851;&#x6027;&#x304C;&#x5B9F;&#x8A3C;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x306F;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C1;&#x306F;&#x3001;&#x5668;&#x5B98;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304B;&#x3069;&#x3046;&#x304B;&#x306F;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C1;&#x306E;&#x6D3B;&#x52D5;&#x306A;&#x3057;&#x306B;&#x81D3;&#x5668;&#x3092;&#x518D;&#x751F;&#x3059;&#x308B;&#x5206;&#x5316;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5E83;&#x7BC4;&#x56F2;&#x306E;&#x5BB9;&#x91CF;&#x3092;&#x63A2;&#x308B;&#x3002;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x904B;&#x547D;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x3068;&#x6A5F;&#x80FD;&#x56DE;&#x5FA9;&#x3092;&#x8FFD;&#x8DE1;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x6839;&#x306E;&#x5148;&#x7AEF;&#x518D;&#x751F;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x5931;&#x308F;&#x308C;&#x305F;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30A2;&#x30A4;&#x30C7;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C6;&#x30A3;&#x306E;&#x518D;&#x4ED5;&#x69D8;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x5207;&#x9664;&#x6570;&#x6642;&#x9593;&#x4EE5;&#x5185;&#x3068;&#x7279;&#x6B8A;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x304C;&#x4E00;&#x65E5;&#x4EE5;&#x5185;&#x306B;&#x5FA9;&#x5143;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304B;&#x3089;&#x59CB;&#x307E;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C1;&#x3092;&#x7DAD;&#x6301;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5931;&#x6557;&#x3057;&#x305F;&#x5909;&#x7570;&#x3092;&#x6709;&#x3059;&#x308B;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x7D76;&#x6EC5;&#x3001;&#x518D;&#x751F;&#x304C;&#x7D9A;&#x884C;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x81D3;&#x5668;&#x518D;&#x751F;&#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3059;&#x308B;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x69D8;&#x306E;&#x6027;&#x8CEA;&#x306F;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x5206;&#x88C2;&#x7D44;&#x7E54;&#x4E2D;&#x306B;&#x5206;&#x6563;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x304A;&#x308A;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x306B;&#x3082;&#x304B;&#x304B;&#x308F;&#x3089;&#x305A;&#x4E0D;&#x78BA;&#x5B9A;&#x306A;&#x6210;&#x9577;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x601D;&#x308F;&#x308C;&#x308B;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C1;&#x306B;&#x9650;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x30B9;&#x30C6;&#x30EC;&#x30AA;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x306E;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x74B0;&#x5883;&#x306B;&#x79FB;&#x884C;&#x305B;&#x305A;&#x306B;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x81D3;&#x5668;&#x306E;&#x66F8;&#x304D;&#x63DB;&#x3048;&#x3053;&#x306E;&#x518D;&#x751F;&#x306F;&#x3001;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x6210;&#x4F53;&#x5668;&#x5B98;&#x306E;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x578B;&#x306E;&#x5206;&#x5316;&#x8A98;&#x5C0E;&#x306E;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x5831;&#x544A;&#x306B;&#x8208;&#x5473;&#x3092;&#x305D;&#x305D;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x985E;&#x4F3C;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x81D3;&#x5668;&#x306E;&#x518D;&#x751F;&#x306F;&#x3001;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x6027;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C1;&#x3092;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3057;&#x307E;&#x305B;&#x3093;

&#xC2DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBFCC;&#xB9AC;&#xC640; &#xC0C8;&#xC2F9;&#xC758; &#xC9C0;&#xC18D;&#xC801;&#xC778; &#xC131;&#xC7A5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; apices &#xD2C8;&#xC0C8; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xC720;&#xC9C0; &#xBCF4;&#xC218;&#xC5D0; &#xC758;&#xC874; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xBC1C;&#xB2EC;&#xAC00; &#xC18C;&#xC131; &#xC785;&#xC99D; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;, &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xC9C0; &#xC54A;&#xB2E4; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC; &#xD2C8;&#xC0C8;&#xB294; organogenesis &#xD544;&#xC694; &#xC5EC;&#xBD80;. &#xC5EC;&#xAE30; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC; &#xD2C8;&#xC0C8; &#xD65C;&#xB3D9; &#xC5C6;&#xC774; &#xC7A5;&#xAE30;&#xB97C; &#xB2E4;&#xC2DC; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xB824;&#xBA74; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654; &#xC140;&#xC758; &#xC6A9;&#xB7C9;&#xC744; &#xD0D0;&#xD5D8;&#xD574; &#xBCF4;&#xC138;&#xC694;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC815;&#xCCB4;&#xC131; &#xC808;&#xB2E8; &#xC2DC;&#xAC04; &#xC774;&#xB0B4;&#xC5D0; &#xC2DC;&#xC791; &#xD558; &#xACE0; &#xC804;&#xBB38;&#xD654; &#xB41C; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5; 1 &#xC77C; &#xB0B4; &#xBCF5;&#xC6D0; &#xC190;&#xC2E4; &#xB41C; &#xC140;&#xC758; &#xD574;&#xB2F9; re-specification&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4; Arabidopsis thaliana &#xB8E8;&#xD2B8; &#xD301; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xCD94;&#xC801; &#xC140; &#xC6B4;&#xBA85;&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xBC0F; &#xAE30;&#xB2A5; &#xD68C;&#xBCF5;. &#xBE44;&#xD310;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC911;&#xC0DD; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC; &#xD2C8;&#xC0C8;&#xB97C; &#xC720;&#xC9C0; &#xD558;&#xC9C0; &#xBABB;&#xD558;&#xB294; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xD568;&#xAED8; &#xC9C4;&#xD589; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xACB0;&#xACFC; &#xC644;&#xC804; &#xD55C; &#xC7A5;&#xAE30; &#xC7AC;&#xC0DD;&#xC744; &#xC911;&#xC7AC; &#xD558;&#xB294; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC; &#xAC19;&#xC740; &#xC18D;&#xC131; &#xACF5;&#xC7A5; meristems&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD84;&#xC0B0; &#xB418;&#xC5B4; &#xC788;&#xB294; &#xBCBD; &#xAC10;, &#xADF8;&#xB7FC;&#xC5D0;&#xB3C4; &#xBD88;&#xAD6C; &#xD558; &#xACE0; &#xBD88;&#xD655;&#xC815; &#xC131;&#xC7A5;&#xC5D0; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xC81C;&#xD55C; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD2C0;&#xC5D0; &#xBC15;&#xD78C; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC; &#xD658;&#xACBD;&#xC73C;&#xB85C;&#xC758; &#xC804;&#xD658; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xACE0; &#xC804;&#xCCB4; &#xC7A5;&#xAE30;&#xC758; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xC7AC;&#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB798;&#xBC0D;&#xC774; &#xB3D9;&#xBB3C;&#xC758; &#xC131;&#xC778; &#xC7A5;&#xAE30;&#xC758; &#xC885;&#xB958;&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; &#xC138;&#xD3EC; &#xC720;&#xB3C4; transdifferentiation&#xC758; &#xCD5C;&#xADFC; &#xBCF4;&#xACE0;&#xC11C;&#xC5D0; &#xD765;&#xBBF8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC720;&#xC0AC;&#xC810; &#xC788;&#xB2E4;.

&#xC7A5;&#xAE30; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC131; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC; &#xD2C8;&#xC0C8;&#xB97C; &#xD544;&#xC694; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Las plantas se basan en el mantenimiento de los nichos de c&#xE9;lulas madre en sus &#xE1;pices para el continuo crecimiento de ra&#xED;ces y brotes. Sin embargo, aunque la plasticidad del desarrollo de c&#xE9;lulas vegetales se ha demostrado, no se sabe si el nicho de c&#xE9;lulas madre es necesario para la organog&#xE9;nesis. Aqu&#xED; se explora la capacidad de una amplia gama de diferenciaci&#xF3;n de las c&#xE9;lulas para regenerar un &#xF3;rgano sin la actividad de un nicho de c&#xE9;lulas madre. El uso de un sistema de regeneraci&#xF3;n de la ra&#xED;z de punta en Arabidopsis thaliana para realizar un seguimiento de la recuperaci&#xF3;n molecular y funcional de destino celular, se muestra que la re-especificaci&#xF3;n de las c&#xE9;lulas perdidas comienza pocas horas despu&#xE9;s de la escisi&#xF3;n y que la funci&#xF3;n de c&#xE9;lulas especializadas que se restablezca en un d&#xED;a. Cr&#xED;ticamente, productos de regeneraci&#xF3;n en las plantas con mutaciones que no logran mantener el nicho de c&#xE9;lulas madre. Estos resultados muestran que las c&#xE9;lulas madre similares a las propiedades que median la regeneraci&#xF3;n de &#xF3;rganos completa se dispersan en meristemos de plantas y no est&#xE1;n restringidos a nichos, que sin embargo parecen ser necesarios para el crecimiento indeterminado. Esta reprogramaci&#xF3;n de regeneraci&#xF3;n de un &#xF3;rgano entero sin transici&#xF3;n a un entorno de c&#xE9;lulas madre estereotipada tiene paralelismos interesantes a los informes recientes de la transdiferenciaci&#xF3;n inducida de tipos espec&#xED;ficos de c&#xE9;lulas en los &#xF3;rganos de los animales adultos.

La regeneraci&#xF3;n de &#xF3;rganos no requiere un nicho de c&#xE9;lulas madre funcional en plantas

&#x52A8;&#x7269;&#x548C;&#x690D;&#x7269;&#x738B;&#x56FD;&#x4F7F;&#x7528;&#x8BB8;&#x591A;&#x76F8;&#x540C;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x5DE5;&#x5177;&#x751F;&#x6210;&#x7EDD;&#x7136;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x591A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x7269;&#x3002;&#x5B66;&#x4E60;&#x5982;&#x4F55;&#x690D;&#x7269;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x738B;&#x56FD;&#x7684;&#x5171;&#x540C;&#x6311;&#x6218;&#x53EF;&#x4EE5;&#x6FC0;&#x53D1;&#x65B0;&#x7684;&#x52A8;&#x7269;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x5BB6;&#x7684;&#x601D;&#x7EF4;&#x65B9;&#x5F0F;&#x3002;&#x672C;&#x8BFB;&#x7269;&#x4ECB;&#x7ECD;&#x4E86;&#x5982;&#x4F55;&#x4F7F;&#x7528;&#x4ECE;&#x5341;&#x5B57;&#x82B1;&#x79D1;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x7684;&#x6742;&#x8349;&#x901A;&#x8FC7;&#x53D1;&#x5C55;&#x95EE;&#x9898;&#x5F00;&#x5C55;&#x5DE5;&#x4F5C;&#x3002;&#x5B83;&#x8FD8;&#x8FDB;&#x884C;&#x6BD4;&#x8F83;&#x548C;&#x5BF9;&#x7167;&#x52A8;&#x7269;&#x548C;&#x690D;&#x7269;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8C03;&#x63A7;&#x5DE5;&#x5177;&#x3002;&#x966A;&#x540C;&#x5E95;&#x6F06;&#x662F;&#x6839;&#x53D1;&#x5C55;&#x4E0E;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x83F2;&#x5229;&#x666E; N.&#x672C;&#x8D39;&#xFF0C;&#x535A;&#x58EB;&#x5B66;&#x4F4D;&#x548C;&#x80AF;&#x5C3C;&#x601D; D.&#x4F2F;&#x6069;&#xFF0C;&#x535A;&#x58EB;&#x5B66;&#x4F4D;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x4EBA;&#x5458;&#x4E2D;&#x7684;&#x5F53;&#x524D;&#x4E3B;&#x9898;&#x7684;&#x8BA8;&#x8BBA;

&#x5E95;&#x6F06;&#x548C;&#x8BBF;&#x8C08;: &#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x57FA;&#x56E0;&#x8C03;&#x63A7;&#x3002;&#x6731;&#x8389; C.&#x57FA;&#x5F17;&#x7684;&#x9762;&#x8BD5;&#x3002;

The animal and plant kingdoms use many of the same molecular tools to build decidedly different multicellular organisms. Learning how plants approach challenges common to both kingdoms can inspire new ways of thinking in the animal biologist. This primer introduces how a weed from the mustard family, Arabidopsis thaliana, has been used to work through developmental problems. It also compares and contrasts gene regulation tools in animals and plants. Accompanying the primer is a discussion of current topics in root development with Arabidopsis researchers Philip N. Benfey, Ph.D., and Kenneth D. Birnbaum, Ph.D.

Primer and interviews: Gene regulation in Arabidopsis thaliana. Interview by Julie C. Kiefer.

Les r&#xE8;gnes animal et v&#xE9;g&#xE9;tal utiliser la plupart des m&#xEA;mes outils mol&#xE9;culaires pour construire d&#xE9;cid&#xE9;ment diff&#xE9;rents organismes multicellulaires. Apprendre comment les plantes aborder les d&#xE9;fis communs aux deux royaumes peuvent inspirer de nouvelles fa&#xE7;ons de penser dans le biologiste animal. Cette amorce introduit comment une mauvaise herbe de la famille de la moutarde, Arabidopsis thaliana, a &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9; pour faire face aux probl&#xE8;mes de d&#xE9;veloppement. Il compare &#xE9;galement les outils et les contrastes de r&#xE9;gulation g&#xE9;nique chez les animaux et les plantes. Accompagnant l&#x26;#39;amorce est une discussion sur des sujets d&#x26;#39;actualit&#xE9; dans le d&#xE9;veloppement des racines avec Arabidopsis chercheurs Philip Benfey N., Ph.D., et Kenneth D. Birnbaum, Ph.D.

Primer et entrevues: r&#xE9;gulation des g&#xE8;nes dans Arabidopsis thaliana. Propos recueillis par Julie C. Kiefer

Die reiche Tier- und Pflanzenwelt verwenden viele der gleichen Diagnostic Tools um dezidiert verschiedenen Vielzeller zu erstellen. Lernen, wie Pflanzen Ansatz, die beide K&ouml;nigreiche gemeinsam Herausforderungen kann neue Wege des Denkens in der tierischen Biologe inspirieren. Diese Grundierung wird eingef&uuml;hrt, wie ein Unkraut aus der Familie der Kreuzbl&uuml;tengew&auml;chse, Arabidopsis Thaliana, benutzt worden ist, um durch Entwicklungsprobleme zu arbeiten. Au&szlig;erdem vergleicht und kontrastiert gen Rechtsetzungsinstrumente bei Tieren und Pflanzen. Begleiten die Grundierung ist eine Diskussion &uuml;ber aktuelle Themen im Stamm-Entwicklung mit Arabidopsis Forscher Philip N. Benfey, Ph.D., und Kenneth D. Birnbaum, Ph.D.

Grundierung und Interviews: Genregulation in Arabidopsis Thaliana. Interview von Julie C. Kiefer.

I regni animale e vegetale utilizzano molti degli stessi strumenti molecolari per costruire organismi pluricellulari decisamente differenti. Apprendimento come approccio piante sfide comuni a entrambi i regni pu&ograve; ispirare nuovi modi di pensare in animali biologo. Questo primer introduce come un erbaccia dalla famiglia senape, Arabidopsis thaliana, &egrave; stato utilizzato per lavorare con problemi dello sviluppo. Confronta e contrappone strumenti regolamento gene negli animali e nelle piante. Che accompagna il primer &egrave; una discussione di argomenti di attualit&agrave; nel sviluppo di radice con ricercatori di Arabidopsis Philip N. Benfey, Ph.d. e Kenneth D. Birnbaum, Ph.d

Primer e interviste: regolazione genica in Arabidopsis thaliana. Intervista di Julie C. Kiefer.

&#x52D5;&#x7269;&#x3068;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x738B;&#x56FD;&#x306F;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x591A;&#x7D30;&#x80DE;&#x751F;&#x7269;&#x3092;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x540C;&#x4E00;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x690D;&#x7269;&#x306F;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x738B;&#x56FD;&#x3078;&#x306E;&#x5171;&#x901A;&#x306E;&#x8AB2;&#x984C;&#x306B;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x5B66;&#x7FD2;&#x3059;&#x308B;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x8005;&#x306B;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x8003;&#x3048;&#x65B9;&#x3092;&#x9F13;&#x821E;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;&#x30A2;&#x30D6;&#x30E9;&#x30CA;&#x79D1;&#x306E;&#x96D1;&#x8349;&#x3001;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x767A;&#x9054;&#x4E0A;&#x306E;&#x554F;&#x984C;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x52D5;&#x4F5C;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x7D39;&#x4ECB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x308C;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x52D5;&#x7269;&#x3084;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306E;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x3092;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x3001;&#x5BFE;&#x6BD4;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30FC;&#x306B;&#x4F34;&#x3044;&#x3001;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x8005;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EA;&#x30C3;&#x30D7;N. Benfey&#x535A;&#x58EB;&#x3001;&#x30B1;&#x30CD;&#x30B9;&#xB7;D.&#xB7;&#x30D0;&#x30FC;&#x30F3;&#x30D0;&#x30A6;&#x30E0;&#x535A;&#x58EB;&#x3068;&#x30EB;&#x30FC;&#x30C8;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x306B;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x30C8;&#x30D4;&#x30C3;&#x30AF;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x305F;&#x3082;&#x306E;&#x3067;&#x3042;&#x308B;

&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30FC;&#x3068;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BF;&#x30D3;&#x30E5;&#x30FC;&#xFF1A;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5236;&#x5FA1;&#x3002;&#x30B8;&#x30E5;&#x30EA;&#x30FC;C.&#x30AD;&#x30FC;&#x30D5;&#x30A1;&#x30FC;&#x306E;&#x30A4;&#x30F3;&#x30BF;&#x30D3;&#x30E5;&#x30FC;

&#xB3D9;&#xBB3C;&#xACFC; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC655;&#xAD6D;&#xC744; &#xBD84;&#xBA85; &#xB2E4;&#xB978; &#xB2E4;&#xC138;&#xD3EC; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xC744; &#xB9CC;&#xB4E4;&#xB824;&#xACE0; &#xB9CE;&#xC740; &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; &#xBD84;&#xC790; &#xB3C4;&#xAD6C;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5B4;&#xB5BB;&#xAC8C; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC811;&#xADFC; &#xB3C4;&#xC804; &#xB450; &#xC655;&#xAD6D;&#xC5D0; &#xACF5;&#xD1B5; &#xD559;&#xC2B5; &#xB3D9;&#xBB3C; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0AC;&#xACE0;&#xC758; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC601;&#xAC10;&#xC744; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xB1CC;&#xAD00; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xBB38;&#xC81C;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC77C;&#xC744; &#xACA8;&#xC790; &#xAC00;&#xC871; Arabidopsis thaliana&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC7A1; &#xCD08; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB41C; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC18C;&#xAC1C; &#xD55C;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C; &#xBE44;&#xAD50; &#xD558; &#xACE0; &#xB300;&#xC870; &#xB3D9;&#xBB3C;&#xACFC; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xADDC;&#xC815; &#xB3C4;&#xAD6C;. Arabidopsis &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC790; &#xD544;&#xB9BD; &#xBD81; &#xC544; &#xC77C; Benfey &#xBC15;&#xC0AC;&#xC640; &#xCF00;&#xB124;&#xC2A4; &#xB514; &#xBE48; &#xBC14; &#xC6C0; &#xBC15;&#xC0AC; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD604;&#xC7AC; &#xC8FC;&#xC81C;&#xC758; &#xD1A0;&#xB860;&#xC740; &#xB1CC;&#xAD00;&#xC744; &#xB3D9;&#xBC18;

&#xB1CC;&#xAD00; &#xBC0F; &#xC778;&#xD130;&#xBDF0;: Arabidopsis thaliana&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC870;&#xC808;. &#xC904;&#xB9AC; C. &#xD0A4;&#xD37C;&#xB85C; &#xC778;&#xD130;&#xBDF0;.

Los reinos animal y vegetal utilizar muchas de las mismas herramientas moleculares para construir organismos multicelulares decididamente diferentes. Aprender c&#xF3;mo las plantas se acercan los desaf&#xED;os comunes a ambos reinos puede inspirar nuevas formas de pensar en el bi&#xF3;logo animal. Este cebador introduce c&#xF3;mo una mala hierba de la familia de la mostaza, Arabidopsis thaliana, se ha utilizado para trabajar a trav&#xE9;s de problemas de desarrollo. Tambi&#xE9;n compara y contrasta las herramientas de regulaci&#xF3;n de genes en animales y plantas. Junto con la cartilla es una discusi&#xF3;n de temas de actualidad en el desarrollo de ra&#xED;ces de Arabidopsis con los investigadores Philip N. Benfey, Ph.D., y Kenneth D. Birnbaum, Ph.D.

Primer y Entrevistas: regulaci&#xF3;n de genes en la Arabidopsis thaliana. Entrevista realizada por Julie C. Kiefer

&#x81EA;&#x52A8;&#x5206;&#x62E3;&#x7684;&#x6D3B;&#x7EBF;&#x866B;&#x4F7F;&#x7528; laFACS&#x3002;

Automated sorting of live C. elegans using laFACS.

Le tri automatis&#xE9; de Live C. Elegans aide LaFACS

Automatische Sortierung von Leben C. Elegans mit LaFACS.

Automatizzato di ordinamento di vivere c. elegans utilizzando laFACS.

LaFACS&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x305F;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;C. elegans&#x306E;&#x81EA;&#x52D5;&#x30BD;&#x30FC;&#x30C8;

&#xC790;&#xB3D9;&#xC73C;&#xB85C; Lafacs&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C; C. elegans&#xC758; &#xC815;&#xB82C;.

Clasificaci&#xF3;n autom&#xE1;tica de C. elegans en vivo Usando LaFACS

&#x5DE5;&#x5382;&#x6B63;&#x5728;&#x4ECE;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x3001; &#x6606;&#x866B;&#x3001; &#x5176;&#x4ED6;&#x4EBA;&#x8EAB;&#x653B;&#x51FB;&#x7684;&#x7834;&#x574F;&#x6216;&#x5220;&#x9664;&#x6B63;&#x6587;&#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x6301;&#x7EED;&#x653B;&#x51FB;&#x3002;&#x518D;&#x751F;&#x662F;&#x690D;&#x7269;&#x4FEE;&#x590D;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x7684;&#x673A;&#x6784;&#x8BA1;&#x5212;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5171;&#x540C;&#x6218;&#x7565;&#x3002;&#x7CBE;&#x901A;&#x4E8E;&#x518D;&#x751F;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x662F;&#x5982;&#x4F55;&#x9002;&#x5E94;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x7684; repatterning &#x7EC4;&#x7EC7;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x7684;&#xFF1F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x65B0;&#x7684;&#x96C7;&#x7528;&#x548C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x547D;&#x8FD0;&#x6807;&#x8BB0;&#x7684;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x6210;&#x50CF;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x673A;&#x6784;&#x5DF2;&#x5BFC;&#x81F4;&#x4E3B;&#x7BA1;&#x8981;&#x518D;&#x751F;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x548C;&#x91CD;&#x5EFA;&#x6A21;&#x5F0F;&#x7684;&#x673A;&#x5236;&#x7684;&#x65B0;&#x89C1;&#x89E3;&#x3002;&#x540E;&#x751F;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x4E2D;&#x65B0;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x7684;&#x540C;&#x65F6;&#xFF0C;&#x5728;&#x6700;&#x8FD1;&#x7684;&#x5DE5;&#x4F5C;&#xFF0C;&#x5728;&#x690D;&#x7269;&#x4E2D;&#x663E;&#x793A;&#x901A;&#x5E38;&#x88AB;&#x8BA4;&#x4E3A;&#x4F9D;&#x8D56;&#x4E8E;&#x53BB;&#x5206;&#x5316;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x518D;&#x751F;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x4E0D;&#x9700;&#x8981;&#x5230;&#x5730;&#x9762;&#x72B6;&#x6001;&#x91CD;&#x65B0;&#x7F16;&#x7A0B;&#x3002;&#x6210;&#x50CF;&#x8DDF;&#x8E2A;&#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x589E;&#x6B96;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x7684;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x6784;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#xFF0C;&#x7ED3;&#x5408;&#x7A81;&#x53D8;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x5206;&#x751F;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x5DF2;&#x63ED;&#x793A;&#x65B0;&#x7684;&#x6700;&#x65E9;&#x7684;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7EBF;&#x7D22;&#x518D;&#x751F;&#x5668;&#x5B98;&#x5F62;&#x6210;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x3002;&#x690D;&#x7269;&#x518D;&#x751F;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x627F;&#x8BFA;&#x662F;&#x63ED;&#x793A;&#x7684;&#x5171;&#x540C;&#x8BBE;&#x8BA1;&#x5C5E;&#x6027;&#x7684;&#x6A21;&#x5F0F;&#x5728;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x80CC;&#x666F;&#x4E0B;&#x7684;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x673A;&#x6784;&#x7684;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x3002;

&#x5EFA;&#x91CD;&#x5EFA;&#xFF1A; &#x5BFB;&#x627E;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x518D;&#x751F;&#x690D;&#x682A;&#x7684;&#x539F;&#x5219;&#x3002;

Plants are under constant attack from insects, microbes, and other physical assaults that damage or remove body parts. Regeneration is one common strategy among plants to repair their body plan. How do organisms that are proficient at regeneration adapt their developmental programs for repatterning tissues? A new body of research employing high-resolution imaging together with cell-fate markers has led to new insights into the tissues competent to regenerate and the mechanisms that re-establish pattern. In parallel to new findings in metazoan systems, recent work in plants shows that regeneration programs commonly thought to rely on dedifferentiated cells do not need to reprogram to a ground state. Imaging studies that track the expression of regulators of the plant's proliferative centers, meristems, in conjunction with mutant analysis have shed new light on the earliest organizational cues during regenerative organ formation. One promise of plant regeneration studies is to reveal the common design attributes of programs that pattern similar organs in different developmental contexts.

Built to rebuild: in search of organizing principles in plant regeneration.

Les plantes sont constamment attaqu&#xE9;s par les insectes, les microbes, et autres agressions physiques qui endommagent ou supprimer des parties du corps. La r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration est une strat&#xE9;gie commune entre les plantes pour r&#xE9;parer leur sch&#xE9;ma corporel. Comment les organismes qui sont comp&#xE9;tents dans la r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration d&#x26;#39;adapter leurs programmes de d&#xE9;veloppement pour les tissus reconfiguration? Un nouvel organisme de recherche employant l&#x26;#39;imagerie haute r&#xE9;solution, avec cellule-sort marqueurs a conduit &#xE0; de nouvelles perspectives dans les tissus &#xE0; se r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;rer comp&#xE9;tentes et les m&#xE9;canismes qui r&#xE9;-&#xE9;tablir le profil de. En parall&#xE8;le &#xE0; de nouvelles d&#xE9;couvertes dans les syst&#xE8;mes de m&#xE9;tazoaires, des travaux r&#xE9;cents dans des usines montre que les programmes de r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration couramment pens&#xE9; &#xE0; s&#x26;#39;appuyer sur les cellules d&#xE9;diff&#xE9;renci&#xE9;es n&#x26;#39;avez pas besoin de reprogrammer &#xE0; un &#xE9;tat fondamental. Les &#xE9;tudes d&#x26;#39;imagerie qui suivent l&#x26;#39;expression de r&#xE9;gulateurs de centres prolif&#xE9;ratifs de l&#x26;#39;usine, les m&#xE9;rist&#xE8;mes, en conjonction avec l&#x26;#39;analyse mutant ont jet&#xE9; un nouvel &#xE9;clairage sur les premiers indices de l&#x26;#39;organisation au cours de la formation des organes de r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration. Une promesse d&#x26;#39;&#xE9;tudes de r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration des plantes est de r&#xE9;v&#xE9;ler les caract&#xE9;ristiques de conception communes de programmes que les organes de motifs similaires dans diff&#xE9;rents contextes de d&#xE9;veloppement.

Construit pour reconstruire: &#xE0; la recherche de principes d&#x26;#39;organisation dans la r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration des v&#xE9;g&#xE9;taux

Pflanzen sind unter st&auml;ndigen Angriffen von Insekten, Mikroben und andere k&ouml;rperliche Angriffe, die Besch&auml;digung oder K&ouml;rperteile zu entfernen. Regeneration ist eine gemeinsame Strategie unter den Pflanzen, deren K&ouml;rper-Plan zu reparieren. Wie passen Organismen, die ge&uuml;bt bei Regenerierung ihrer entwicklungspolitischen Programmen f&uuml;r repatterning Gewebe an? Ein neuer K&ouml;rper der Forschung besch&auml;ftigt hochaufl&ouml;sende Bildgebung zusammen mit der Zelle-Fate-Marker f&uuml;hrte zu neue Einblicke in die Gewebe zu regenerieren und die Mechanismen, die Muster wiederherzustellen. Parallel zum neuen Erkenntnisse in indem Systeme zeigt j&uuml;ngsten Arbeiten in Pflanzen, dass Regenerierung Programme h&auml;ufig gedacht, um auf Liposarkom Zellen verlassen nicht in einem Grundzustand neu programmieren m&uuml;ssen. Imaging-Studien, die den Ausdruck der Regulierungsbeh&ouml;rden der Pflanze proliferative Zentren zu verfolgen, haben Meristems, in Verbindung mit mutant Analyse neue die fr&uuml;hesten Organisatorische Hinweise bei regenerativen Orgel Bildung beleuchten. Ein Versprechen der Pflanze Regenerierung Studien ist, die gemeinsamen Design-Attribute der Programme aufzudecken, die &auml;hnliche Organe in verschiedenen Entwicklungsst&ouml;rungen zusammenh&auml;ngen Muster.

Gebaut, um neu zu erstellen: auf der Suche nach Prinzipien Pflanze Regeneration zu organisieren.

Le piante sono sotto costante attacco da insetti, microbi e altre aggressioni fisiche che danneggiare o rimuovere parti del corpo. Rigenerazione &egrave; una strategia comune tra le piante di riparare loro piano corporeo. Come gli organismi che sono abili a rigenerazione adattare loro programmi di sviluppo per la ristrutturazione dei tessuti? Un nuovo organismo di ricerca che impiegano imaging ad alta risoluzione con marcatori di cella-destino ha portato a nuove intuizioni competenti per rigenerare i tessuti e i meccanismi di ristabilire il modello. Parallelamente alle nuove scoperte nei sistemi di metazoi, recenti lavori in impianti dimostra che comunemente si pensa di fare affidamento sulle cellule dedifferentiated di programmi di rigenerazione non &egrave; necessario riprogrammare a uno stato di terra. Imaging studies che traccia l&#39;espressione di regolatori dei centri proliferativa della pianta, Meristemi, in combinazione con l&#39;analisi di mutanti hanno gettato nuova luce sui primi spunti organizzativi durante la formazione del organo rigenerativa. Una promessa di studi di rigenerazione di piante &egrave; quello di rivelare gli attributi di disegno comuni dei programmi che gli organi simili in differenti contesti dello sviluppo del modello.

Costruito per ricostruire: in cerca di organizzare principi nella rigenerazione di pianta.

&#x690D;&#x7269;&#x304C;&#x640D;&#x50B7;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x8EAB;&#x4F53;&#x306E;&#x90E8;&#x5206;&#x3092;&#x524A;&#x9664;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x6606;&#x866B;&#x3001;&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x4ED6;&#x306E;&#x7269;&#x7406;&#x7684;&#x306A;&#x653B;&#x6483;&#x304B;&#x3089;&#x4E00;&#x5B9A;&#x306E;&#x653B;&#x6483;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x518D;&#x751F;&#x306F;&#x3001;&#x81EA;&#x5206;&#x306E;&#x4F53;&#x306E;&#x8A08;&#x753B;&#x3092;&#x4FEE;&#x5FA9;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x3046;&#x3061;&#x306E;1&#x3064;&#x306E;&#x5171;&#x901A;&#x6226;&#x7565;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x3069;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x518D;&#x751F;&#x306B;&#x7CBE;&#x901A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x751F;&#x7269;&#x306F;repatterning&#x7D44;&#x7E54;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x767A;&#x9054;&#x30D7;&#x30ED;&#x30B0;&#x30E9;&#x30E0;&#x3092;&#x9069;&#x5FDC;&#x3055;&#x305B;&#x308B;&#x306E;&#x3067;&#x3059;&#x304B;&#xFF1F;&#x7D30;&#x80DE;&#x904B;&#x547D;&#x306E;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3068;&#x4E00;&#x7DD2;&#x306B;&#x9AD8;&#x5206;&#x89E3;&#x80FD;&#x30A4;&#x30E1;&#x30FC;&#x30B8;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x308B;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x4F53;&#x304C;&#x518D;&#x751F;&#x3059;&#x308B;&#x6709;&#x80FD;&#x306A;&#x7D44;&#x7E54;&#x3084;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x3092;&#x518D;&#x78BA;&#x7ACB;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306E;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x306B;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x3082;&#x305F;&#x3089;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5F8C;&#x751F;&#x52D5;&#x7269;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x77E5;&#x898B;&#x3068;&#x5E73;&#x884C;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x518D;&#x751F;&#x30D7;&#x30ED;&#x30B0;&#x30E9;&#x30E0;&#x306F;&#x3001;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306B;&#x57FA;&#x5E95;&#x72B6;&#x614B;&#x306B;&#x518D;&#x30D7;&#x30ED;&#x30B0;&#x30E9;&#x30E0;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x306F;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x5206;&#x5316;&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x8003;&#x3048;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5909;&#x7570;&#x4F53;&#x306E;&#x89E3;&#x6790;&#x3068;&#x4F75;&#x305B;&#x3066;&#x3001;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x5897;&#x6B96;&#x30BB;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x3001;&#x5206;&#x88C2;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x8FFD;&#x8DE1;&#x3059;&#x308B;&#x30A4;&#x30E1;&#x30FC;&#x30B8;&#x30F3;&#x30B0;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x518D;&#x751F;&#x5668;&#x5B98;&#x5F62;&#x6210;&#x6642;&#x306E;&#x521D;&#x671F;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x7684;&#x306A;&#x624B;&#x304C;&#x304B;&#x308A;&#x306B;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x5149;&#x3092;&#x5F53;&#x3066;&#x308B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x690D;&#x7269;&#x4F53;&#x518D;&#x751F;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x4E00;&#x3064;&#x306E;&#x7D04;&#x675F;&#x306F;&#x3001;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x767A;&#x9054;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30AD;&#x30B9;&#x30C8;&#x3067;&#x306E;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x540C;&#x69D8;&#x306E;&#x81D3;&#x5668;&#x3059;&#x308B;&#x30D7;&#x30ED;&#x30B0;&#x30E9;&#x30E0;&#x306E;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x30C7;&#x30B6;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x5C5E;&#x6027;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;

&#x7D44;&#x7E54;&#x539F;&#x5247;&#x306E;&#x691C;&#x7D22;&#x3067;&#x306F;&#x690D;&#x7269;&#x4F53;&#x518D;&#x751F;&#x306B;&#xFF1A;&#x518D;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3055;

&#xC2DD;&#xBB3C; &#xACE4;&#xCDA9;, &#xC138;&#xADE0;, &#xBC0F; &#xAE30;&#xD0C0; &#xBB3C;&#xB9AC;&#xC801; &#xD3ED;&#xD589;&#xC744; &#xC190;&#xC0C1; &#xD558;&#xAC70;&#xB098; &#xC2E0;&#xCCB4; &#xBD80;&#xC704;&#xB97C; &#xC81C;&#xAC70; &#xD558;&#xB294; &#xC9C0;&#xC18D;&#xC801;&#xC778; &#xACF5;&#xACA9;&#xC744; &#xBC1B;&#xACE0; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC911;&#xC0DD; &#xADF8;&#xB4E4; &#xBAB8; &#xACC4;&#xD68D;&#xC744; &#xBCF5;&#xAD6C; &#xD558;&#xB294; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC911; &#xD558;&#xB098;&#xC758; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xC804;&#xB7B5; &#xC774;&#xB2E4;. &#xC5B4;&#xB5BB;&#xAC8C; &#xC911;&#xC0DD;&#xC5D0; &#xB2A5;&#xC219; &#xD558;&#xB294; &#xC720;&#xAE30; &#xCCB4; &#xC870;&#xC9C1; repatterning&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB7A8; &#xC801;&#xC751; &#xD569;&#xB2C8;&#xAE4C;? &#xC138;&#xD3EC; &#xC6B4;&#xBA85; &#xB9C8;&#xCEE4; &#xD568;&#xAED8; &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xC774;&#xBBF8;&#xC9D5; &#xACE0;&#xC6A9; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC758; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC2E0;&#xCCB4; &#xC870;&#xC9C1; &#xAD00;&#xD560;&#xC744; &#xB2E4;&#xC2DC; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558; &#xACE0; &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xB2E4;&#xC2DC; &#xC124;&#xC815; &#xD558;&#xB294; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC8FC;&#xB3C4;&#xD558; &#xACE0; &#xC788;&#xB2E4;. Metazoan &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC;&#xB97C; &#xBCD1;&#xB82C;&#xB85C; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCD5C;&#xADFC; &#xC791;&#xD488; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB7A8; dedifferentiated &#xC140;&#xC5D0; &#xC758;&#xC874; &#xC0DD;&#xAC01; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC811;&#xC9C0; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xB97C; &#xC7AC; &#xC124; &#xC815;&#xD560; &#xD544;&#xC694;&#xAC00; &#xC5C6;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xC99D;&#xC2DD; &#xC13C;&#xD130;&#xC758; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130; &#xC2DD; &#xCD94;&#xC801; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB97C; &#xC774;&#xBBF8;&#xC9D5; meristems, &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xBD84;&#xC11D; &#xD568;&#xAED8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xAE30;&#xAD00; &#xD615;&#xC131; &#xB3D9;&#xC548; &#xCD08;&#xAE30; &#xC870;&#xC9C1; &#xB2E8;&#xC11C;&#xC5D0; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xBE5B;&#xC744; &#xBC1C;&#xC0B0; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xC11C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xC0C1;&#xD669;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBE44;&#xC2B7;&#xD55C; &#xC7A5;&#xAE30; &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB7A8;&#xC758; &#xACF5;&#xD1B5;&#xC801;&#xC778; &#xB514;&#xC790;&#xC778; &#xD2B9;&#xC131;&#xC744; &#xACF5;&#xC7A5; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC758; &#xD55C; &#xC57D;&#xC18D;&#xC774;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xB2E4;&#xC2DC; &#xB0B4;&#xC7A5;: &#xAD6C;&#xC131; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC7AC;&#xC0DD;&#xC758; &#xC6D0;&#xB9AC;&#xB97C; &#xCC3E;&#xC544;.

Las plantas est&#xE1;n bajo constante ataque de los insectos, microbios y otras agresiones f&#xED;sicas que da&#xF1;an o eliminan las partes del cuerpo. La regeneraci&#xF3;n es una estrategia com&#xFA;n entre las plantas para reparar su estructura corporal. &#xBF;C&#xF3;mo los organismos que son competentes en la regeneraci&#xF3;n de adaptar sus programas de desarrollo para los tejidos Repatterning? Un nuevo cuerpo de investigaci&#xF3;n que emplea im&#xE1;genes de alta resoluci&#xF3;n, junto con marcadores de destino celular-ha dado lugar a nuevos conocimientos sobre los tejidos para regenerar competentes y los mecanismos que re-establecer patrones. En paralelo a nuevos hallazgos en los sistemas de metazoos, trabajos recientes en las plantas muestra que los programas de regeneraci&#xF3;n com&#xFA;nmente se piensa que confiar en las c&#xE9;lulas indiferenciadas no es necesario para reprogramar a un estado fundamental. Los estudios de im&#xE1;genes que hacen un seguimiento de la expresi&#xF3;n de los reguladores de los centros de proliferaci&#xF3;n de la planta, meristemos, junto con el an&#xE1;lisis de mutantes han arrojado nueva luz sobre las primeras se&#xF1;ales de la organizaci&#xF3;n durante la formaci&#xF3;n de los &#xF3;rganos de regeneraci&#xF3;n. Una de las promesas de los estudios de regeneraci&#xF3;n de la planta es dar a conocer los atributos de dise&#xF1;o comunes de los programas que los &#xF3;rganos de patrones similares en diferentes contextos de desarrollo.

Construido para la reconstrucci&#xF3;n: en busca de los principios de organizaci&#xF3;n en la regeneraci&#xF3;n de plantas

&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x53D7;&#x7CBE;&#x5375;&#x53F8;&#x5B9A;&#x4E49;&#x7684;&#x4E24;&#x4E2A;&#x6839;&#x672C;&#x4E0D;&#x540C;&#x53D1;&#x5C55;&#x57DF;&#xFF0C;&#x4F5C;&#x7528;&#x548C;&#x80DA;&#x3002;&#x6240;&#x751F;&#x6210;&#x8FB9;&#x754C;&#x5206;&#x9694;&#x57DF;&#x7279;&#x5B9A;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x548C;&#x4F5C;&#x7528;&#x6E90;&#x81EA;&#x4FE1;&#x53F7;&#x6307;&#x793A;&#x80DA;&#x751F;&#x6210;&#x6839;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5DE2;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x6839;&#x611F;&#x5E94;&#x5DF2;&#x77E5;&#x9700;&#x8981;&#x6FC0;&#x7D20;&#x751F;&#x957F;&#x7D20;&#x548C;&#x751F;&#x957F;&#x7D20;&#x54CD;&#x5E94;&#x56E0;&#x5B50; MONOPTEROS&#xFF0C;&#x5B83;&#x4ECD;&#x7136;&#x5F88;&#x5927;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x4E0A;&#x96BE;&#x4EE5;&#x6349;&#x6478;&#x5982;&#x4F55;&#x53C2;&#x4E0E;&#x8FD9;&#x4E00;&#x8FDB;&#x7A0B;&#x7684;&#x4E24;&#x4E2A;&#x57DF;&#x6700;&#x521D;&#x6307;&#x5B9A;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8868;&#x660E;&#xFF0C;&#x5F52;&#x7EB3;&#x4F5C;&#x7528;&#x8FB9;&#x754C;&#x7684;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x6240;&#x9700;&#x7684; HANABA TARANU (&#x97E9;) &#x7684;&#x795E;&#x7ECF;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x56E0;&#x7D20;&#x3002;&#x6C49;&#x4EE3;&#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#x5BFC;&#x81F4;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6A21;&#x5F0F;&#xFF0C;&#x63ED;&#x793A;&#x6C49;&#x4EE3;&#x8C03;&#x8282;&#x8F6C;&#x5F55;&#x7684;&#x57FA;&#x5E95;&#x4F5C;&#x7528;&#x534F;&#x8C03;&#x5FC3;&#x5C16;&#x8F6C;&#x53D8;&#x3002;&#x65E9;&#x5728; 8 &#x7EC6;&#x80DE;&#x9636;&#x6BB5;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x800C;&#x5BFC;&#x81F4;&#x751F;&#x957F;&#x7D20;&#x5FC3;&#x5C16;&#x91CD;&#x65B0;&#x5206;&#x914D;&#x53D7;&#x5F71;&#x54CD;&#x5173;&#x952E;&#x751F;&#x957F;&#x7D20;&#x8F6C;&#x8FD0;&#x3002;&#x5F15;&#x4EBA;&#x6CE8;&#x76EE;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x97E9;&#x80DA;&#x80CE;&#x6700;&#x7EC8;&#x5C06;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x72EC;&#x7ACB;&#x7684; MONOPTEROS &#x548C;&#x6807;&#x8BB0;&#x7684;&#x751F;&#x957F;&#x7D20;&#x6700;&#x5927;&#x7684;&#x65B0;&#x8FB9;&#x754C;&#x5468;&#x56F4;&#x80DA;&#x6839;&#x3002;

&#x795E;&#x7ECF;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x56E0;&#x5B50; HANABA TARANU&#xFF0C;&#x987B;&#x5728;&#x80DA;&#x80CE;&#x53D1;&#x80B2;&#x7684;&#x65E9;&#x671F;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x4E2D;&#x5B9A;&#x4F4D;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x8FB9;&#x754C;&#x3002;

Division of the Arabidopsis zygote defines two fundamentally different developmental domains, the proembryo and suspensor. The resulting boundary separates domain-specific gene expression, and a signal originating from the proembryo instructs the suspensor to generate the root stem cell niche. While root induction is known to require the phytohormone auxin and the Auxin Response Factor MONOPTEROS, it has remained largely elusive how the two domains involved in this process are initially specified. Here, we show that the GATA factor HANABA TARANU (HAN) is required to position the inductive proembryo boundary. Mutations in HAN cause a coordinated apical shift of gene expression patterns, revealing that HAN regulates transcription in the basal proembryo. Key auxin transporters are affected as early as the 8 cell stage, resulting in apical redistribution of auxin. Remarkably, han embryos eventually organize a root independent of MONOPTEROS and the suspensor around a new boundary marked by the auxin maximum.

The GATA factor HANABA TARANU is required to position the proembryo boundary in the early Arabidopsis embryo.

Division du zygote d&#x26;#39;Arabidopsis d&#xE9;finit deux fondamentalement diff&#xE9;rents domaines du d&#xE9;veloppement, le pr&#xE9;-embryon et du suspenseur. La limite r&#xE9;sultant s&#xE9;pare l&#x26;#39;expression du g&#xE8;ne sp&#xE9;cifique au domaine, et d&#x26;#39;un signal provenant de la charge du suspenseur proembryon pour g&#xE9;n&#xE9;rer le cr&#xE9;neau de cellule racine tige. Alors que l&#x26;#39;induction racine est connue pour exiger l&#x26;#39;auxine phytohormone auxine et les MONOPTEROS facteur de r&#xE9;ponse, il est rest&#xE9; pratiquement insaisissable comment les deux domaines impliqu&#xE9;s dans ce processus sont initialement pr&#xE9;vue. Ici, nous montrons que le facteur GATA HANABA Taranu (HAN) est n&#xE9;cessaire pour positionner la limite inductive proembryon. Des mutations dans HAN provoquer un changement de coordonn&#xE9;e apicale de profils d&#x26;#39;expression g&#xE9;nique, r&#xE9;v&#xE9;lant que HAN r&#xE9;gule la transcription dans le pr&#xE9;-embryon basale. Principaux transporteurs d&#x26;#39;auxine sont affect&#xE9;s d&#xE8;s le stade 8 cellules, entra&#xEE;nant une redistribution apicale de l&#x26;#39;auxine. Remarquablement, les embryons han &#xE9;ventuellement organiser une racine ind&#xE9;pendante de MONOPTEROS et le suspenseur autour d&#x26;#39;une nouvelle fronti&#xE8;re marqu&#xE9;e par le maximum auxine.

Le GATA Facteur HANABA Taranu est n&#xE9;cessaire pour positionner la fronti&#xE8;re proembryon dans l&#x26;#39;embryon pr&#xE9;coce Arabidopsis

Teilung der Zygote Arabidopsis definiert zwei grundlegend verschiedene Entwicklungsst&ouml;rungen Dom&auml;nen, die proembryo und Aufhaengen. Die resultierende Grenze trennt dom&auml;nenspezifische Genexpression und ein Signal, das aus dem proembryo weist das Aufhaengen die Wurzel Stammzelle Nische zu generieren. W&auml;hrend Wurzel Induktion bekannt ist, dass die Phytohormone Auxin und der Auxin Response Factor MONOPTEROS erfordern, ist es weitgehend tr&uuml;gerisch geblieben wie die beiden Dom&auml;nen an diesem Prozess beteiligten zun&auml;chst angegeben werden. Hier zeigen wir, dass den GATA-Faktor, den HANABA TARANU (HAN) erforderlich ist, um die induktive proembryo Grenze zu positionieren. Mutationen im HAN verursachen eine koordinierte apikale Verschiebung der Genausdruck Muster, aufschlussreich, dass HAN Transkription in den basalen proembryo regelt. Wichtige Auxine Transporter sind bereits in der 8-Zellen, was zu apikale Umverteilung von Auxin betroffen. Bemerkenswerterweise organisieren Han Embryonen schlie&szlig;lich eine Wurzel, die unabh&auml;ngig vom MONOPTEROS und Aufhaengen um eine neue Grenze durch die Auxine maximale gekennzeichnet.

Der GATA-Faktor HANABA TARANU ist erforderlich, die proembryo Grenze im fr&uuml;hen Arabidopsis Embryos zu positionieren.

Divisione dello zigote Arabidopsis definisce due fondamentalmente differenti domini dello sviluppo, il proembryo e suspensor. Il limite risultante separa domain-specific gene expression, e un segnale proveniente dalla proembryo incarica il suspensor per generare la nicchia delle cellule staminali radice. Mentre ad induzione radice &egrave; conosciuto per richiedere l&#39;auxina phytohormone e l&#39;auxina risposta fattore MONOPTEROS, &egrave; rimasto in gran parte inafferrabile come i due domini coinvolti in questo processo sono inizialmente specificati. Qui, ci mostrano che il fattore GATA HANABA TARANU (HAN) &egrave; necessaria per posizionare il confine proembryo induttivo. Mutazioni in HAN causano uno spostamento apicale coordinato dei modelli di espressione genica, rivelando che HAN regola la trascrizione nella basale proembryo. I trasportatori auxina chiave sono influenzati pi&ugrave; presto la fase 8 celle, con conseguente redistribuzione apicale dell&#39;auxina. Notevolmente, gli embrioni han alla fine organizzano una radice indipendente MONOPTEROS e il suspensor intorno a un nuovo limite segnato dall&#39;auxina massimo.

Il fattore GATA HANABA TARANU &egrave; necessario per posizionare il confine proembryo nell&#39;embrione precoce di Arabidopsis.

&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x53D7;&#x7CBE;&#x5375;&#x306E;&#x5206;&#x5272;&#x306F;&#x6839;&#x672C;&#x7684;&#x306B;&#x7570;&#x306A;&#x308B;2&#x3064;&#x306E;&#x767A;&#x9054;&#x9818;&#x57DF;&#x3001;&#x524D;&#x80DA;&#x3068;&#x80DA;&#x67C4;&#x3092;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3001;&#x5883;&#x754C;&#x306F;&#x3001;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x56FA;&#x6709;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x5206;&#x96E2;&#x3057;&#x3001;&#x524D;&#x80DA;&#x306B;&#x7531;&#x6765;&#x3059;&#x308B;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x306F;&#x30EB;&#x30FC;&#x30C8;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C1;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x80DA;&#x67C4;&#x306B;&#x6307;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30EB;&#x30FC;&#x30C8;&#x8A98;&#x5C0E;&#x304C;&#x690D;&#x7269;&#x30DB;&#x30EB;&#x30E2;&#x30F3;&#x30AA;&#x30FC;&#x30AD;&#x30B7;&#x30F3;&#x3068;&#x30AA;&#x30FC;&#x30AD;&#x30B7;&#x30F3;&#x5FDC;&#x7B54;&#x56E0;&#x5B50;&#x30E2;&#x30CE;&#x30D7;&#x30C6;&#x30ED;&#x30B9;&#x3092;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x306F;&#x3053;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;2&#x3064;&#x306E;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x304C;&#x6700;&#x521D;&#x306B;&#x6307;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3001;&#x4E3B;&#x306B;&#x3068;&#x3089;&#x3048;&#x3069;&#x3053;&#x308D;&#x306E;&#x306A;&#x3044;&#x63A8;&#x79FB;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;GATA&#x56E0;&#x5B50;HANABA TARANU&#xFF08;HAN&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x8A98;&#x5C0E;&#x524D;&#x80DA;&#x306E;&#x5883;&#x754C;&#x306B;&#x914D;&#x7F6E;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002; HAN&#x306E;&#x5909;&#x7570;&#x306F;&#x3001;HAN&#x3001;&#x57FA;&#x5E95;&#x524D;&#x80DA;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x8EE2;&#x5199;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306E;&#x5354;&#x8ABF;&#x5C16;&#x30B7;&#x30D5;&#x30C8;&#x3092;&#x5F15;&#x304D;&#x8D77;&#x3053;&#x3059;&#x3002;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x30AA;&#x30FC;&#x30AD;&#x30B7;&#x30F3;&#x8F38;&#x9001;&#x306F;&#x3001;&#x30AA;&#x30FC;&#x30AD;&#x30B7;&#x30F3;&#x306E;&#x5148;&#x7AEF;&#x518D;&#x5206;&#x914D;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3001;8&#x7D30;&#x80DE;&#x671F;&#x306B;&#x306F;&#x65E9;&#x304F;&#x3082;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x9A5A;&#x304F;&#x3079;&#x304D;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3001;&#x85E9;&#x306E;&#x80DA;&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x7D42;&#x7684;&#x306B;&#x30E2;&#x30CE;&#x30D7;&#x30C6;&#x30ED;&#x30B9;&#x306E;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x305F;&#x30EB;&#x30FC;&#x30C8;&#x3068;&#x30AA;&#x30FC;&#x30AD;&#x30B7;&#x30F3;&#x6700;&#x5927;&#x3067;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AF;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x5883;&#x754C;&#x5468;&#x8FBA;&#x306E;&#x80DA;&#x67C4;&#x3092;&#x6574;&#x7406;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

GATA&#x56E0;&#x5B50;HANABA TARANU&#x306F;&#x65E9;&#x671F;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x80DA;&#x3067;&#x306F;&#x524D;&#x80DA;&#x306E;&#x5883;&#x754C;&#x306E;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x3092;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;

Arabidopsis zygote&#xC758; &#xB450; &#xADFC;&#xBCF8;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;, proembryo&#xB97C; &#xC815;&#xC758; &#xD558; &#xACE0; suspensor. &#xACB0;&#xACFC; &#xACBD;&#xACC4; &#xAD6C;&#xBD84; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;-&#xD2B9;&#xC815; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xBC0F; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC; &#xD2C8;&#xC0C8;&#xB97C; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; suspensor&#xB97C; &#xC9C0;&#xC2DC; &#xD558;&#xB294; &#xC2E0;&#xD638;&#xB294; proembryo&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xC0DD;. &#xB3D9;&#xC548; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xC720;&#xB3C4; phytohormone auxin &#xBC0F; Auxin &#xC751;&#xB2F5; &#xC694;&#xC18C; MONOPTEROS &#xC694;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xC9C0;&#xB9CC;, &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xB0A8;&#xC544; &#xC788;&#xB2E4; &#xD06C;&#xAC8C; &#xC560;&#xB9E4;&#xC774; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xB450; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xC9C0;&#xC815; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xCC98;&#xC74C;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; HANABA TARANU (&#xD55C;) &#xC720;&#xB3C4; proembryo &#xACBD;&#xACC4;&#xB97C; &#xBC30;&#xCE58; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; GATA &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD55C; &#xBCC0;&#xC774; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD55C; proembryo&#xB294; &#xAE30;&#xC800;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804;&#xC0AC; &#xC870;&#xC808; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC2DD; &#xD328;&#xD134;&#xC758; &#xC870;&#xC815;&#xB41C; &#xAF2D;&#xB300;&#xAE30; &#xBCC0;&#xD654; &#xBC1C;&#xC0DD;. &#xD0A4; auxin &#xC804;&#xC1A1;&#xAE30; auxin&#xC758; &#xAF2D;&#xB300;&#xAE30; &#xC7AC;&#xBC30;&#xD3EC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC;&#xB85C; 8 &#xC140; &#xBB34;&#xB300; &#xC77C;&#xCC0D; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBC1B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD604;&#xC800; &#xD558; &#xAC8C;, &#xD55C; &#xBC30;&#xC544;&#xB294; &#xACB0;&#xAD6D; MONOPTEROS &#xBC0F; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xACBD;&#xACC4;&#xB294; auxin &#xCD5C;&#xB300; &#xD45C;&#xC2DC; &#xC8FC;&#xC704; suspensor &#xB8E8;&#xD2B8;&#xB97C; &#xAD6C;&#xC131; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

GATA &#xC694;&#xC18C; HANABA TARANU&#xB294; &#xCD08;&#xAE30; Arabidopsis &#xBC30;&#xC544;&#xC5D0;&#xC11C; proembryo &#xACBD;&#xACC4;&#xB97C; &#xBC30;&#xCE58; &#xD574;&#xC57C; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Divisi&#xF3;n del cigoto de Arabidopsis define dos &#xE1;reas de desarrollo fundamentalmente diferentes, el proembri&#xF3;n y suspensor. El l&#xED;mite resultante se separa de dominio espec&#xED;fico de la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica, y una se&#xF1;al procedente de la proembri&#xF3;n instruye al suspensor para generar el v&#xE1;stago ra&#xED;z nicho de c&#xE9;lulas. Mientras que la inducci&#xF3;n de ra&#xED;ces se sabe que requieren la auxina y las fitohormonas auxina Monopteros respuesta Factor, se ha mantenido en gran medida dif&#xED;cil de alcanzar como los dos dominios implicados en este proceso se especific&#xF3; inicialmente. En este sentido, muestran que el factor de GATA HANABA TARANU (HAN) es necesario para colocar el l&#xED;mite de proembri&#xF3;n inductiva. Las mutaciones en HAN causar un cambio coordinado apical de los patrones de expresi&#xF3;n de genes, revelando que HAN regula la transcripci&#xF3;n en el proembri&#xF3;n basal. Principales transportadores de auxina se ven afectados tan pronto como la fase de 8 c&#xE9;lulas, dando lugar a una redistribuci&#xF3;n apical de la auxina. Sorprendentemente, los embriones Han eventualmente organizar una ra&#xED;z independiente de Monopteros y el suspensor en torno a un nuevo l&#xED;mite marcado por la m&#xE1;xima auxina.

El GATA factor HANABA TARANU es necesaria para posicionar la Frontera proembri&#xF3;n en el embri&#xF3;n temprano Arabidopsis

&#x57FA;&#x56E0;&#x91CD;&#x590D;&#x4F1A;&#x5BFC;&#x81F4;&#x9057;&#x4F20;&#x7684;&#x5197;&#x4F59;&#xFF0C;&#x5C4F;&#x853D;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x7A81;&#x53D8;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x589E;&#x52A0;&#x5728;&#x786E;&#x5B9A;&#x9057;&#x4F20;&#x5197;&#x4F59;&#x7684;&#x654F;&#x611F;&#x5EA6;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x53EF;&#x4EE5;&#x63D0;&#x9AD8;&#x6548;&#x7387;&#x7684;&#x53CD;&#x5411;&#x9057;&#x4F20;&#x5B66;&#x548C;&#x501F;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x57FA;&#x56E0;&#x91CD;&#x590D;&#x7684;&#x8FDB;&#x5316;&#x7684;&#x7ED3;&#x679C;&#x3002;&#x673A;&#x5668;&#x5B66;&#x4E60;&#x6280;&#x672F;&#x975E;&#x5E38;&#x9002;&#x5408;&#x5206;&#x7C7B;&#x6210;&#x6A21;&#x578B;&#x7269;&#x79CD;&#x4E2D;&#x7684;&#x5197;&#x4F59;&#x548C;&#x975E;&#x5197;&#x4F59;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x5BF9;&#x57FA;&#x56E0;&#x5BB6;&#x65CF;&#x6210;&#x5458;&#x8DB3;&#x591F;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6570;&#x636E;&#x7684;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x53EF;&#x7528;&#xFF0C;&#x4F8B;&#x5982;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#xFF0C;&#x6B64;&#x5904;&#x4F7F;&#x7528;&#x7684;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x7528;&#x4F8B;&#x3002;

&#x9884;&#x6D4B;&#x4F7F;&#x7528;&#x673A;&#x5668;&#x5B66;&#x4E60;&#x7684;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5197;&#x4F59;&#x3002;

Gene duplication can lead to genetic redundancy, which masks the function of mutated genes in genetic analyses. Methods to increase sensitivity in identifying genetic redundancy can improve the efficiency of reverse genetics and lend insights into the evolutionary outcomes of gene duplication. Machine learning techniques are well suited to classifying gene family members into redundant and non-redundant gene pairs in model species where sufficient genetic and genomic data is available, such as Arabidopsis thaliana, the test case used here.

Predicting genome-wide redundancy using machine learning.

La duplication des g&#xE8;nes peut conduire &#xE0; la redondance g&#xE9;n&#xE9;tique, qui masque la fonction des g&#xE8;nes mut&#xE9;s dans les analyses g&#xE9;n&#xE9;tiques. M&#xE9;thodes pour accro&#xEE;tre la sensibilit&#xE9; &#xE0; identifier la redondance g&#xE9;n&#xE9;tique peut am&#xE9;liorer l&#x26;#39;efficacit&#xE9; de la g&#xE9;n&#xE9;tique inverse et de pr&#xEA;ter des aper&#xE7;us sur les r&#xE9;sultats de l&#x26;#39;&#xE9;volution de la duplication de g&#xE8;nes. Techniques d&#x26;#39;apprentissage machine sont bien adapt&#xE9;s &#xE0; la classification des membres de la famille des g&#xE8;nes dans les paires de g&#xE8;nes redondants et non redondants dans les esp&#xE8;ces mod&#xE8;les o&#xF9; suffisamment de donn&#xE9;es g&#xE9;n&#xE9;tiques et g&#xE9;nomiques sont disponibles, telles que Arabidopsis thaliana, le cas de test utilis&#xE9; ici.

Pr&#xE9;dire l&#x26;#39;&#xE9;chelle du g&#xE9;nome redondance &#xE0; l&#x26;#39;aide Machine Learning

Genduplikation kann genetische Redundanz, f&uuml;hren, die die Funktion des mutierten Gene in genetischen Analysen verbirgt. Methoden um Empfindlichkeit identifizieren genetische Redundanz erh&ouml;hen k&ouml;nnen Effizienz des Reverser und Einblicke in die evolution&auml;re Ergebnisse der Genduplikation verleihen. Maschine Lerntechniken passen gut zu klassifizieren gen Familienmitglieder in redundanter und nicht redundanter gen Paare in Modell-Arten wo ist ausreichende genetische und Genomische Daten verf&uuml;gbar sind, z. B. Arabidopsis Thaliana, den Testfall, der hier verwendet.

Vorhersage genomweiten Redundanz mit Maschinelles Lernen.

Duplicazione genica pu&ograve; portare a ridondanza genetica, che maschera la funzione dei geni mutati nelle analisi genetiche. Metodi per aumentare la sensibilit&agrave; nella identificazione di ridondanza genetica possono migliorare l&#39;efficienza della genetica inversa e prestano intuizioni gli esiti evolutivi di duplicazione genica. Tecniche di apprendimento macchina sono adatti per classificare i membri della famiglia genica in coppie gene ridondanti e non ridondante in specie modello dove sono disponibili, come Arabidopsis thaliana, il caso di test utilizzato qui sufficienti dati di genomici e genetici.

Previsione di ridondanza genome-wide utilizzando machine learning.

&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x91CD;&#x8907;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x89E3;&#x6790;&#x3067;&#x5909;&#x7570;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x3069;&#x306E;&#x30DE;&#x30B9;&#x30AF;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x5197;&#x9577;&#x6027;&#x306B;&#x3064;&#x306A;&#x304C;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x907A;&#x4F1D;&#x7684;&#x5197;&#x9577;&#x6027;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x306B;&#x611F;&#x5EA6;&#x3092;&#x5411;&#x4E0A;&#x3055;&#x305B;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x306F;&#x3001;&#x9006;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x306E;&#x52B9;&#x7387;&#x3092;&#x5411;&#x4E0A;&#x3055;&#x305B;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x91CD;&#x8907;&#x306E;&#x9032;&#x5316;&#x306E;&#x6210;&#x679C;&#x3078;&#x306E;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x8CB8;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6A5F;&#x68B0;&#x5B66;&#x7FD2;&#x6280;&#x8853;&#x306F;&#x3088;&#x304F;&#x305D;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5341;&#x5206;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x3068;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x304C;&#x5229;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x7A2E;&#x3067;&#x5197;&#x9577;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x975E;&#x5197;&#x9577;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30DA;&#x30A2;&#x306B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x306E;&#x30E1;&#x30F3;&#x30D0;&#x30FC;&#x3092;&#x5206;&#x985E;&#x306B;&#x9069;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3001;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x6A5F;&#x68B0;&#x5B66;&#x7FD2;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30EF;&#x30A4;&#x30C9;&#x306A;&#x5197;&#x9577;&#x6027;&#x3092;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3059;&#x308B;

&#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCF5;&#xC81C;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xB9C8;&#xC2A4;&#xD06C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC911;&#xBCF5;&#xC73C;&#xB85C; &#xC774;&#xC5B4;&#xC9C8; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC911;&#xBCF5; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC5D0; &#xAC10;&#xB3C4; &#xC99D;&#xAC00; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95; &#xC5ED;&#xBC29;&#xD5A5; &#xC720;&#xC804;&#xD559;&#xC758; &#xD6A8;&#xC728;&#xC131;&#xC744; &#xD5A5;&#xC0C1; &#xD558; &#xACE0; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC911;&#xBCF5;&#xC758; &#xC9C4;&#xD654; &#xACB0;&#xACFC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xBE4C;&#xB824; &#xC904; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAE30;&#xACC4; &#xD559;&#xC2B5; &#xAE30;&#xBC95; &#xBAA8;&#xB378; &#xC885;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC911;&#xBCF5; &#xBC0F; &#xBE44;&#xC911;&#xBCF5; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC30D;&#xC73C;&#xB85C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC00;&#xC871; &#xAD6C;&#xC131;&#xC6D0;&#xC744; &#xBD84;&#xB958; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC801;&#xD569; &#xCDA9;&#xBD84; &#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; &#xAC8C;&#xB188; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB294; Arabidopsis thaliana, &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB41C; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC0AC;&#xB840; &#xB4F1; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xAE30;&#xACC4; &#xD559;&#xC2B5;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xAC8C;&#xB188; &#xC804;&#xCCB4; &#xC911;&#xBCF5;&#xC744; &#xC608;&#xCE21; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

La duplicaci&#xF3;n de genes puede conducir a la redundancia gen&#xE9;tica, lo que enmascara la funci&#xF3;n de los genes mutados en los an&#xE1;lisis gen&#xE9;ticos. M&#xE9;todos para aumentar la sensibilidad en la identificaci&#xF3;n de redundancia gen&#xE9;tica puede mejorar la eficiencia de la gen&#xE9;tica inversa y dar una visi&#xF3;n de los resultados de la evoluci&#xF3;n de la duplicaci&#xF3;n de genes. Las t&#xE9;cnicas de aprendizaje se adaptan bien a la clasificaci&#xF3;n de los miembros de la familia de genes en los pares de genes redundantes y no redundantes en la especie modelo en suficientes datos gen&#xE9;ticos y gen&#xF3;micos se dispone, como Arabidopsis thaliana, el caso de prueba se utiliza aqu&#xED;.

La predicci&#xF3;n de todo el genoma de redundancia del uso del aprendizaje de la m&#xE1;quina

&#x8981;&#x4E86;&#x89E3;&#x52A8;&#x6001;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#xFF0C;&#x751F;&#x7269;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x5FC5;&#x987B;&#x7ECF;&#x5E38;&#x548C;&#x8F83;&#x957F;&#x7684;&#x65F6;&#x95F4;&#x8FDB;&#x884C;&#x6210;&#x50CF;&#x3002;&#x6839;&#x53D1;&#x5C55;&#x5728;&#x8702;&#x7A9D;&#x7684;&#x51B3;&#x8BAE;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x4E86;&#x89E3;&#x57FA;&#x672C;&#x6A21;&#x5F0F;&#x5F62;&#x6210;&#x4E0E;&#x7EF4;&#x6301;&#x690D;&#x7269;&#x7684;&#x57FA;&#x672C;&#x673A;&#x5236;&#x662F;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x3002;&#x4E0D;&#x5E78;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x786E;&#x4FDD;&#x8FDE;&#x7EED;&#x6807;&#x672C;&#x7684;&#x8BBF;&#x95EE;&#xFF0C;&#x540C;&#x65F6;&#x4FDD;&#x6301;&#x751F;&#x7406;&#x6761;&#x4EF6;&#x548C;&#x9632;&#x6B62;&#x7167;&#x7247;-&#x9020;&#x6210;&#x635F;&#x5BB3;&#xFF0C;&#x6784;&#x6210;&#x5728;&#x79CD;&#x690D;&#x690D;&#x7269;&#x6839;&#x7CFB;&#x7B49;&#x5668;&#x5B98;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x52A8;&#x529B;&#x5B66;&#x6D4B;&#x91CF;&#x7684;&#x4E3B;&#x8981;&#x969C;&#x788D;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x76EE;&#x524D;&#x96C6;&#x6210;&#x5149;&#x5B66;&#x5207;&#x7247;&#x901A;&#x8FC7;&#x8F7B;&#x8D28;&#x677F;&#x6750;&#x8367;&#x5149;&#x663E;&#x5FAE;&#x955C;&#x4E0E;&#x8425;&#x517B;&#x6DB2;&#x683D;&#x57F9;&#xFF0C;&#x4F7F;&#x6211;&#x4EEC;&#x80FD;&#x591F;&#x5728;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#xFF0C;&#x56FE;&#x50CF;&#x5782;&#x76F4;&#x65E5;&#x76CA;&#x589E;&#x957F;&#x7684;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x6839;&#x6BCF;&#x9694;&#x51E0;&#x5206;&#x949F;&#xFF0C;&#x8FDE;&#x7EED;&#x51E0;&#x5929;&#x7684;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5C06;&#x4ECB;&#x7ECD;&#x65B0;&#x578B;&#x81EA;&#x52A8;&#x7684;&#x4F8B;&#x7A0B;&#x6765;&#x8DDF;&#x8E2A;&#x6839;&#x5C16;&#xFF0C;&#x968F;&#x7740;&#x5B83;&#x7684;&#x589E;&#x957F;&#xFF0C;&#x6765;&#x8DDF;&#x8E2A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6838;&#x548C;&#x8BC6;&#x522B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x901A;&#x8FC7;&#x6536;&#x96C6;&#x6570;&#x636E;&#x4E0A;&#x7684;&#x5206;&#x6B67;&#x53CA;&#x6838;&#x52A8;&#x529B;&#x5B66;&#x663E;&#x793A;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x7684;&#x80FD;&#x529B;&#x3002;

&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x7684;&#x751F;&#x957F;&#x4E2D;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x52A8;&#x529B;&#x5B66;&#x5B9A;&#x91CF;&#x6839;&#x8F7B;&#x8D28;&#x677F;&#x6750;&#x955C;&#x3002;

To understand dynamic developmental processes, living tissues have to be imaged frequently and for extended periods of time. Root development is extensively studied at cellular resolution to understand basic mechanisms underlying pattern formation and maintenance in plants. Unfortunately, ensuring continuous specimen access, while preserving physiological conditions and preventing photo-damage, poses major barriers to measurements of cellular dynamics in growing organs such as plant roots. We present a system that integrates optical sectioning through light sheet fluorescence microscopy with hydroponic culture that enables us to image, at cellular resolution, a vertically growing Arabidopsis root every few minutes and for several consecutive days. We describe novel automated routines to track the root tip as it grows, to track cellular nuclei and to identify cell divisions. We demonstrate the system's capabilities by collecting data on divisions and nuclear dynamics.

Quantitation of cellular dynamics in growing Arabidopsis roots with light sheet microscopy.

Pour comprendre les processus dynamiques de d&#xE9;veloppement, les tissus vivants doivent &#xEA;tre imag&#xE9;e fr&#xE9;quemment et pendant de longues p&#xE9;riodes de temps. Le d&#xE9;veloppement des racines est largement &#xE9;tudi&#xE9; &#xE0; la r&#xE9;solution cellulaire pour comprendre les m&#xE9;canismes qui sous-tendent la formation de structures de base et l&#x26;#39;entretien des plantes. Malheureusement, assurer l&#x26;#39;acc&#xE8;s continu sp&#xE9;cimen, tout en pr&#xE9;servant les conditions physiologiques et la pr&#xE9;vention de la photo-dommages, pose des obstacles majeurs &#xE0; des mesures de la dynamique cellulaire dans les organes en croissance tels que les racines des plantes. Nous pr&#xE9;sentons un syst&#xE8;me qui int&#xE8;gre le sectionnement optique par microscopie de fluorescence &#xE0; la lumi&#xE8;re feuille de culture hydroponique qui nous permet de l&#x26;#39;image, &#xE0; une r&#xE9;solution cellulaire, une racine &#xE0; la verticale de plus en plus Arabidopsis toutes les quelques minutes et pendant plusieurs jours cons&#xE9;cutifs. Nous d&#xE9;crivons de nouvelles routines automatis&#xE9;es pour suivre l&#x26;#39;extr&#xE9;mit&#xE9; de la racine &#xE0; mesure qu&#x26;#39;il grandit, pour suivre les noyaux cellulaires et d&#x26;#39;identifier les divisions cellulaires. Nous d&#xE9;montrer les capacit&#xE9;s du syst&#xE8;me en recueillant des donn&#xE9;es sur les divisions et la dynamique nucl&#xE9;aires.

La quantification de la dynamique cellulaires dans Cultivons l&#x26;#39;Roots Arabidopsis par microscopie nappe de lumi&#xE8;re

Um dynamische Entwicklungsprozesse zu verstehen, m&uuml;ssen lebende Gewebe h&auml;ufig und f&uuml;r l&auml;ngere Zeit abgebildet werden. Root-Entwicklung ist bei zellul&auml;ren Aufl&ouml;sung verstehen grundlegende Mechanismen Strukturbildung und Wartung in Pflanzen ausgiebig studiert. Leider stellt einen kontinuierlichen Probe Zugang, unter Wahrung der physiologische Bedingungen und Foto-Sch&auml;den, gr&ouml;&szlig;eren Hindernisse f&uuml;r Messungen der Zellul&auml;re Dynamik in wachsenden Organe z. B. Pflanzenwurzeln. Wir pr&auml;sentieren Ihnen eine System, die integriert optische schneiden durch leichtes Blatt Fluoreszenzmikroskopie mit hydroponischen Kultur, die es uns erm&ouml;glicht, bei zellul&auml;ren Aufl&ouml;sung, einen vertikal wachsenden Arabidopsis-Stamm alle paar Minuten Bild und f&uuml;r mehrere aufeinanderfolgende Tage. Wir beschreiben die neuartige automatisierte Routinen, um die Wurzel-Spitze zu verfolgen, wie es w&auml;chst, um zellul&auml;re Kerne verfolgen und Zellteilungen zu identifizieren. Wir demonstrieren die Systemfunktionen durch das Sammeln von Daten &uuml;ber Gesch&auml;ftsbereiche und atomaren Dynamik.

Quantitative Bestimmung der Zellul&auml;re Dynamik in wachsenden Arabidopsis Wurzeln mit leichten Blatt-Mikroskopie.

Per comprendere i processi di sviluppo dinamici, tessuti viventi devono essere imaged frequentemente e per periodi di tempo prolungati. Lo sviluppo delle radici &egrave; ampiamente studiato al cellulare risoluzione per capire i meccanismi di base sottostante modello formazione e manutenzione di impianti. Purtroppo, garantisce un accesso continuo esemplare, pur mantenendo condizioni fisiologiche e prevenzione del foto-danno, pone importanti barriere per misure della dinamica cellulare in organi come le radici delle piante in crescita. Vi presentiamo un sistema che integra il sezionamento ottico attraverso microscopia di fluorescenza foglio leggero con coltura idroponica che ci permette di immagine, alla risoluzione di cellulari, una radice di Arabidopsis verticalmente crescente ogni pochi minuti e per diversi giorni consecutivi. Descriviamo romanzo routine automatizzate per tenere traccia della punta di radice come cresce, per tenere traccia di nuclei cellulari e per identificare le divisioni delle cellule. Noi dimostrare le capacit&agrave; del sistema attraverso la raccolta di dati sul nucleare dinamica e divisioni.

Quantificazione delle dinamiche cellulari in Arabidopsis radici con microscopia foglio leggero in crescita.

&#x52D5;&#x7684;&#x306A;&#x767A;&#x9054;&#x904E;&#x7A0B;&#x3092;&#x7406;&#x89E3;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x751F;&#x4F53;&#x7D44;&#x7E54;&#x306F;&#x3001;&#x983B;&#x7E41;&#x306B;&#x9577;&#x6642;&#x9593;&#x306E;&#x64AE;&#x50CF;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30EB;&#x30FC;&#x30C8;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x306F;&#x3001;&#x5E83;&#x304F;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x5F62;&#x6210;&#x3068;&#x7DAD;&#x6301;&#x306E;&#x6839;&#x5E95;&#x306B;&#x3042;&#x308B;&#x57FA;&#x672C;&#x7684;&#x306A;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x7406;&#x89E3;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x643A;&#x5E2F;&#x96FB;&#x8A71;&#x306E;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x3067;&#x691C;&#x8A0E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x6B8B;&#x5FF5;&#x306A;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3001;&#x751F;&#x7406;&#x5B66;&#x7684;&#x6761;&#x4EF6;&#x3092;&#x7DAD;&#x6301;&#x3057;&#x3001;&#x5199;&#x771F;&#x306E;&#x640D;&#x50B7;&#x3092;&#x9632;&#x6B62;&#x3057;&#x306A;&#x304C;&#x3089;&#x3001;&#x9023;&#x7D9A;&#x7684;&#x306A;&#x8A66;&#x6599;&#x306E;&#x30A2;&#x30AF;&#x30BB;&#x30B9;&#x3092;&#x78BA;&#x4FDD;&#x3059;&#x308B;&#x306A;&#x3069;&#x3001;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x6839;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x6210;&#x9577;&#x306E;&#x81D3;&#x5668;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x52D5;&#x614B;&#x306E;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x7D50;&#x679C;&#x306B;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x969C;&#x58C1;&#x3092;&#x3082;&#x305F;&#x3089;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x3067;&#x3001;&#x753B;&#x50CF;&#x306B;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x3092;&#x53EF;&#x80FD;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x6C34;&#x8015;&#x683D;&#x57F9;&#x3067;&#x5149;&#x30B7;&#x30FC;&#x30C8;&#x86CD;&#x5149;&#x9855;&#x5FAE;&#x93E1;&#x3001;&#x6570;&#x5206;&#x3054;&#x3068;&#x306B;&#x5782;&#x76F4;&#x306B;&#x6210;&#x9577;&#x3057;&#x3066;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x6839;&#x3092;&#x901A;&#x3063;&#x3066;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x9023;&#x7D9A;&#x3057;&#x305F;&#x200B;&#x200B;&#x65E5;&#x306E;&#x5149;&#x30BB;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x7D71;&#x5408;&#x3057;&#x305F;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3092;&#x63D0;&#x6848;&#x3059;&#x308B;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x305D;&#x308C;&#x304C;&#x5927;&#x304D;&#x304F;&#x306A;&#x308B;&#x306B;&#x3064;&#x308C;&#x3066;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x6838;&#x3092;&#x8FFD;&#x8DE1;&#x3057;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x6839;&#x306E;&#x5148;&#x7AEF;&#x3092;&#x8FFD;&#x8DE1;&#x3059;&#x308B;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x81EA;&#x52D5;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30EB;&#x30FC;&#x30C1;&#x30F3;&#x3092;&#x8A18;&#x8FF0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x90E8;&#x9580;&#x3084;&#x6838;&#x30C0;&#x30A4;&#x30CA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x306B;&#x95A2;&#x3059;&#x308B;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x53CE;&#x96C6;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x306E;&#x80FD;&#x529B;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30E9;&#x30A4;&#x30C8;&#x30B7;&#x30FC;&#x30C8;&#x306E;&#x9855;&#x5FAE;&#x93E1;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x6210;&#x9577;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x6839;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x7D30;&#x80DE;&#x30C0;&#x30A4;&#x30CA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;

&#xB3D9;&#xC801; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xB97C; &#xC774;&#xD574; &#xD558; &#xC0DD;&#xD65C; &#xC870;&#xC9C1; &#xC790;&#xC8FC;&#xC640; &#xC2DC;&#xAC04;&#xC758; &#xC5F0;&#xC7A5;&#xB41C; &#xAE30;&#xAC04;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBA87; &#xAD70;&#xB370; &#xC788;&#xB2E4;. &#xB8E8;&#xD2B8; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xAE30;&#xBCF8; &#xD328;&#xD134; &#xD615;&#xC131; &#xBC0F; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xC9C0; &#xAD00;&#xB9AC; &#xD558;&#xB294; &#xAE30;&#xBCF8; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC774;&#xD574; &#xD558;&#xB294; &#xC138;&#xD3EC; &#xD574;&#xACB0;&#xCC45;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACF5;&#xBD80; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBD88;&#xD589;&#xD788;&#xB3C4;, &#xC131;&#xC7A5; &#xD558;&#xB294; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xBFCC;&#xB9AC; &#xB4F1; &#xC7A5;&#xAE30;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC138;&#xD3EC; &#xC5ED;&#xD559;&#xC758; &#xCE21;&#xC815; &#xD558;&#xB294; &#xC8FC;&#xC694; &#xC7A5;&#xBCBD;&#xC744; &#xD3EC;&#xC988; &#xC0DD;&#xB9AC; &#xC801; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC874; &#xD558; &#xACE0; &#xC0AC;&#xC9C4; &#xC190;&#xC0C1; &#xBC29;&#xC9C0; &#xD558;&#xBA74;&#xC11C; &#xC5F0;&#xC18D; &#xD45C;&#xBCF8; &#xC561;&#xC138;&#xC2A4; &#xBCF4;&#xC7A5;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC744; &#xD1B5;&#xD569; &#xD558;&#xB294; &#xC218;&#xC9C1; &#xC131;&#xC7A5; Arabidopsis &#xB8E8;&#xD2B8; &#xBA87; &#xBD84; &#xB9C8;&#xB2E4; &#xC138;&#xD3EC; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xBBF8;&#xC9C0;&#xB97C; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xC218;&#xACBD; &#xBB38;&#xD654; &#xBC0F; &#xC5F0;&#xC18D; &#xBA70;&#xCE60; &#xB3D9;&#xC548; &#xAC00;&#xBCBC;&#xC6B4; &#xC2DC;&#xD2B8; &#xD615;&#xAD11; &#xD604;&#xBBF8;&#xACBD;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xAD11; &#xB2E8;&#xBA74; &#xC81C;&#xC2DC;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC131;&#xC7A5; &#xD568;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C;, &#xC138;&#xD3EC; &#xD575;&#xC744; &#xCD94;&#xC801; &#xD558; &#xACE0; &#xC138;&#xD3EC; &#xBD84;&#xC5F4;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xD301; &#xCD94;&#xC801; &#xC18C;&#xC124; &#xC790;&#xB3D9;&#xB41C; &#xB8E8;&#xD2F4; &#xC124;&#xBA85;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xBD80;&#xC11C;&#xC640; &#xD575; &#xC5ED;&#xD559;&#xC5D0; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB97C; &#xC218;&#xC9D1; &#xD558; &#xC5EC; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xB77C;&#xC774;&#xD2B8; &#xC2DC;&#xD2B8; &#xD604;&#xBBF8;&#xACBD;&#xC640; Arabidopsis &#xBFCC;&#xB9AC; &#xC131;&#xC7A5; &#xC138;&#xD3EC; &#xC5ED;&#xD559;&#xC758; &#xC815;&#xB7C9;.

Para entender din&#xE1;micos procesos de desarrollo, los tejidos vivos tienen que ser reflejados con frecuencia y durante per&#xED;odos prolongados de tiempo. Desarrollo de la ra&#xED;z est&#xE1; ampliamente estudiado en la resoluci&#xF3;n de celular para comprender los mecanismos b&#xE1;sicos que subyacen a la formaci&#xF3;n de patrones y el mantenimiento en las plantas. Por desgracia, lo que garantiza el acceso continuo de la muestra, mientras que la preservaci&#xF3;n de las condiciones fisiol&#xF3;gicas y la prevenci&#xF3;n de la foto-da&#xF1;o, plantea grandes obst&#xE1;culos para la medici&#xF3;n de la din&#xE1;mica celular en &#xF3;rganos en crecimiento, tales como ra&#xED;ces de las plantas. Se presenta un sistema que integra la secci&#xF3;n &#xF3;ptica a trav&#xE9;s de microscop&#xED;a de fluorescencia con luz de hoja de cultivo hidrop&#xF3;nico que nos permite la imagen, con una resoluci&#xF3;n de celular, una ra&#xED;z creciendo verticalmente Arabidopsis cada pocos minutos y durante varios d&#xED;as consecutivos. Se describen nuevas rutinas automatizadas para realizar un seguimiento de la punta de la ra&#xED;z a medida que crece, para realizar un seguimiento de los n&#xFA;cleos celulares y para identificar las divisiones celulares. Se demuestra la capacidad del sistema mediante la recopilaci&#xF3;n de datos sobre las divisiones y la din&#xE1;mica nuclear.

La cuantificaci&#xF3;n de la din&#xE1;mica de celulares en cultivo las ra&#xED;ces de Arabidopsis con la Microscop&#xED;a de Luz Hoja de

&#x5168;&#x7403;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6D4B;&#x91CF;&#x8D8A;&#x6765;&#x8D8A;&#x591A;&#x5730;&#x5F97;&#x5230;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x51FD;&#x6570;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7C7B;&#x578B;&#x3001; &#x7EC4;&#x7EC7;&#x548C;&#x5176;&#x4ED6;&#x6709;&#x751F;&#x7269;&#x610F;&#x4E49;&#x7684;&#x5750;&#x6807;&#x8303;&#x56F4;&#x5185;&#x7684;&#x7A7A;&#x95F4;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x6570;&#x636E;&#x5E94;&#x4F7F;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7C7B;&#x578B;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x4F46;&#x8FD9;&#x79CD;&#x5206;&#x6790;&#x5F80;&#x5F80;&#x53EF;&#x4EE5;&#x901A;&#x8FC7;&#x566A;&#x58F0;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x76F8;&#x6DF7;&#x6DC6;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5F15;&#x5165;&#x4E00;&#x79CD;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x63AA;&#x65BD;&#x89C4;&#x8303;&#x7528;&#x6765;&#x91CF;&#x5316;&#x4E2D;&#x7684;&#x5B8C;&#x6574;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x4EFB;&#x4F55;&#x7ED9;&#x5B9A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7C7B;&#x578B;&#x548C;&#x4E0D;&#x786E;&#x5B9A;&#x6027;&#x5EA6;&#x91CF;&#x503C; dSpec&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x5BF9;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x7684;&#x566A;&#x58F0;&#x5F71;&#x54CD;&#x7684;&#x63AA;&#x65BD;&#x65B9;&#x9762;&#x7684;&#x4FE1;&#x606F;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528;&#x9F20;&#x6807;&#x5927;&#x8111;&#x3001; &#x690D;&#x7269;&#x6839;&#x548C;&#x4EBA;&#x4F53;&#x767D;&#x8840;&#x7403;&#x4ECE;&#x5168;&#x7403;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6570;&#x636E;&#xFF0C;&#x663E;&#x793A;&#x4E0D;&#x8FC7;&#x662F;&#x975E;&#x5E38;&#x5177;&#x4F53;&#x7684;&#x7279;&#x5B9A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684;&#x53D8;&#x91CF;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x6C34;&#x5E73;&#x89C4;&#x8303;&#x6807;&#x8BC6;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x6837;&#x672C;&#x6765;&#x81EA;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x4EBA;&#x4F7F;&#x7528;&#x65F6;&#xFF0C;dSpec &#x7684;&#x63AA;&#x65BD;&#x5728;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x4E2D;&#x952E;&#x5165;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x53EF;&#x5851;&#x6027;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x505A;&#x6CD5;&#x662F;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x9002;&#x7528;&#x4E8E;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x3001; &#x53D1;&#x80B2;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x3001; &#x80BF;&#x7624;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x548C;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x8BC6;&#x522B;&#x6620;&#x5C04;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6D4B;&#x91CF;&#x3002;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x6B64;&#x7C7B;&#x5E94;&#x7528;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x7684;&#x793A;&#x4F8B;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x663E;&#x793A;&#x89C4;&#x8303;&#x6807;&#x8BC6;&#x4E00;&#x7C7B;&#x65B0;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#xFF0C;&#x540C;&#x65F6;&#x53C8;&#x4E0D;&#x635F;&#x5BB3;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x5C55;&#x793A;&#x53D8;&#x91CF;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x7684;&#x3002;&#x65B9;&#x6CD5;&#x4E3A;&#x91CF;&#x5316;&#x566A;&#x58F0;&#x662F;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x9002;&#x7528;&#x4E8E;&#x8DE8;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x7684;&#x7279;&#x6B8A;&#x6027;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7EDF;&#x4E00;&#x7684;&#x7406;&#x8BBA;&#x6846;&#x67B6;&#x3002;

&#x5728;&#x5608;&#x6742;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x6D4B;&#x91CF;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x6807;&#x8BC6;&#x3002;

Global gene expression measurements are increasingly obtained as a function of cell type, spatial position within a tissue and other biologically meaningful coordinates. Such data should enable quantitative analysis of the cell-type specificity of gene expression, but such analyses can often be confounded by the presence of noise. We introduce a specificity measure Spec that quantifies the information in a gene's complete expression profile regarding any given cell type, and an uncertainty measure dSpec, which measures the effect of noise on specificity. Using global gene expression data from the mouse brain, plant root and human white blood cells, we show that Spec identifies genes with variable expression levels that are nonetheless highly specific of particular cell types. When samples from different individuals are used, dSpec measures genes' transcriptional plasticity in each cell type. Our approach is broadly applicable to mapped gene expression measurements in stem cell biology, developmental biology, cancer biology and biomarker identification. As an example of such applications, we show that Spec identifies a new class of biomarkers, which exhibit variable expression without compromising specificity. The approach provides a unifying theoretical framework for quantifying specificity in the presence of noise, which is widely applicable across diverse biological systems.

Measuring cell identity in noisy biological systems.

Globales mesures d&#x26;#39;expression g&#xE9;nique de plus en plus obtenue en fonction du type de cellule, la position spatiale dans un tissu et d&#x26;#39;autres coordonn&#xE9;es biologiquement significatifs. Ces donn&#xE9;es devraient permettre une analyse quantitative de la sp&#xE9;cificit&#xE9; du type cellulaire de l&#x26;#39;expression g&#xE9;nique, mais ces analyses peuvent souvent &#xEA;tre confondu par la pr&#xE9;sence de bruit. Nous introduisons une mesure Spec sp&#xE9;cificit&#xE9; qui quantifie l&#x26;#39;information contenue dans le profil d&#x26;#39;un g&#xE8;ne d&#x26;#39;expression compl&#xE8;te en ce qui concerne n&#x26;#39;importe quel type cellulaire donn&#xE9;, et une mesure d&#x26;#39;incertitude dSpec, qui mesure l&#x26;#39;effet du bruit sur la sp&#xE9;cificit&#xE9;. Utilisation de donn&#xE9;es mondiales sur l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes du cerveau de la souris, racine de la plante et des globules blancs humains, nous montrons que Spec identifie des g&#xE8;nes avec les niveaux d&#x26;#39;expression variables qui sont n&#xE9;anmoins tr&#xE8;s sp&#xE9;cifique de types cellulaires particuliers. Lorsque des &#xE9;chantillons provenant de personnes diff&#xE9;rentes sont utilis&#xE9;es, dSpec mesure la plasticit&#xE9; des g&#xE8;nes des transcriptionnelle dans chaque type de cellule. Notre approche est largement applicable &#xE0; mapp&#xE9;s mesures d&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes dans la biologie des cellules souches, la biologie du d&#xE9;veloppement, de la biologie du cancer et l&#x26;#39;identification de biomarqueurs. A titre d&#x26;#39;exemple de telles applications, nous montrons que Spec identifie une nouvelle classe de biomarqueurs, qui pr&#xE9;sentent une expression variable sans compromettre la sp&#xE9;cificit&#xE9;. Cette approche fournit un cadre unificateur th&#xE9;orique pour quantifier la sp&#xE9;cificit&#xE9; de la pr&#xE9;sence de bruit, qui est largement applicable dans divers syst&#xE8;mes biologiques.

Mesure de l&#x26;#39;identit&#xE9; cellulaire en Noisy syst&#xE8;mes biologiques

Global-Gen-Ausdruck-Messungen werden zunehmend als eine Funktion der Zelltyp, r&auml;umliche Position innerhalb eines Gewebes und andere biologisch sinnvollen Koordinaten ermittelt. Solche Daten sollten Quantitative Analyse der Zelltyp Besonderheit der Genexpression aktivieren, aber solche Analysen k&ouml;nnen oft durch die Anwesenheit von L&auml;rm zuschanden werden. Wir f&uuml;hren eine Spezifit&auml;t Ma&szlig;nahme Spec, die die Informationen in einem Gen vollst&auml;ndige Ausdruck Profil bez&uuml;glich einer bestimmten Zelltyp und eine Unsicherheit Ma&szlig;nahme dSpec, welches die Auswirkungen von L&auml;rm auf Spezifit&auml;t Ma&szlig;nahmen quantifiziert. Mithilfe der globalen Gen Ausdruck Daten aus Maus Gehirn, Pflanze-Wurzel und menschlichen Leukozyten, zeigen wir, dass Spec identifiziert Gene mit variabler Expressivit&auml;t, die dennoch sehr spezifisch von bestimmten Zelltypen sind. Wenn Proben von verschiedenen Personen verwendet werden, misst dSpec Genen transkriptionelle Plastizit&auml;t in jeder Zellart. Unser Ansatz ist im gro&szlig;en und ganzen f&uuml;r zugeordnete Gen-Ausdruck-Messungen im Stammzellbiologie, Entwicklungsbiologie, Krebs-Biologie und Biomarker-Identifizierung. Als Beispiel f&uuml;r solche Anwendungen zeigen wir, dass Spec eine neue Klasse von Biomarkern, die Variablen Expressivit&auml;t identifiziert ohne Spezifit&auml;t aufweisen. Der Ansatz stellt einen vereinheitlichenden theoretischen Rahmen f&uuml;r quantifizieren Spezifit&auml;t in Anwesenheit von L&auml;rm, die ganz unterschiedliche biologische Systeme &uuml;berall anwendbar ist.

Messung der Zelle Identit&auml;t in laut biologischer Systeme.

Le misurazioni di espressione genica globale si ottengono sempre pi&ugrave; come una funzione del tipo di cellula, la posizione spaziale all&#39;interno di un tessuto e altre coordinate biologicamente significative. Tali dati dovrebbero consentire analisi quantitativa della specificit&agrave; delle cellule-tipo dell&#39;espressione del gene, ma tale analisi possono essere spesso confuso dalla presenza di rumore. Introduciamo una misura di specificit&agrave; Spec che quantifica le informazioni nel profilo di espressione completa di un gene per quanto riguarda qualsiasi tipo di dato delle cellule e un dSpec di misura di incertezza, che misura l&#39;effetto di rumore sulla specificit&agrave;. Utilizzando i dati di espressione genica globale dal cervello del mouse, radice di pianta e cellule bianche del sangue umane, mostriamo che Spec identifica i geni con livelli di espressione variabile che sono comunque altamente specifici di tipi di cellule particolari. Quando vengono utilizzati campioni di individui differenti, dSpec misure plasticit&agrave; trascrizionale dei geni in ogni tipo di cellula. Il nostro approccio &egrave; ampiamente applicabile per le misure di espressione di gene mappato in biologia delle cellule staminali, biologia dello sviluppo, biologia e biomarker identificazione del cancro. Un esempio di tali applicazioni, mostriamo che Spec identifica una nuova classe di biomarcatori, che esibiscono espressione variabile senza compromettere la specificit&agrave;. L&#39;approccio fornisce un quadro teorico unificante per specificit&agrave; misurando in presenza di rumore, che &egrave; ampiamente applicabile attraverso diversi sistemi biologici.

Identit&agrave; cella di misura nei sistemi biologici rumorosi.

&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x306F;&#x3001;&#x307E;&#x3059;&#x307E;&#x3059;&#x7D30;&#x80DE;&#x578B;&#x3001;&#x7D44;&#x7E54;&#x5185;&#x306E;&#x7A7A;&#x9593;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x3084;&#x4ED6;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x306B;&#x610F;&#x5473;&#x306E;&#x3042;&#x308B;&#x5EA7;&#x6A19;&#x306E;&#x95A2;&#x6570;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x578B;&#x7279;&#x7570;&#x6027;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x3092;&#x6709;&#x52B9;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x3057;&#x3070;&#x3057;&#x3070;&#x30CE;&#x30A4;&#x30BA;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6DF7;&#x4E71;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x4EFB;&#x610F;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x306E;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x7279;&#x7570;&#x6027;&#x306E;&#x30CE;&#x30A4;&#x30BA;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x4E0D;&#x78BA;&#x304B;&#x3055;&#x306E;&#x6E2C;&#x5B9A;dSpec&#x3092;&#x3001;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x767A;&#x73FE;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x5185;&#x306E;&#x60C5;&#x5831;&#x3092;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x7279;&#x7570;&#x6027;&#x306E;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x4ED5;&#x69D8;&#x3092;&#x3054;&#x7D39;&#x4ECB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x8133;&#x3001;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x6839;&#x3068;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x767D;&#x8840;&#x7403;&#x304B;&#x3089;&#x3001;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x3066;&#x3001;Spec&#x304C;&#x305D;&#x308C;&#x306B;&#x3082;&#x304B;&#x304B;&#x308F;&#x3089;&#x305A;&#x3001;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x578B;&#x306E;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x306B;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x5909;&#x6570;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x500B;&#x4F53;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x304C;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x5834;&#x5408;&#x3001;dSpec&#x306F;&#x3001;&#x5404;&#x7D30;&#x80DE;&#x578B;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E; &#x26;quot;&#x8EE2;&#x5199;&#x53EF;&#x5851;&#x6027;&#x3092;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306F;&#x3001;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x3001;&#x767A;&#x751F;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x3001;&#x764C;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x306B;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x306B;&#x5E83;&#x304F;&#x9069;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30A2;&#x30D7;&#x30EA;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306E;&#x4F8B;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;Spec&#x304C;&#x7279;&#x7570;&#x6027;&#x3092;&#x640D;&#x306A;&#x3046;&#x3053;&#x3068;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x5909;&#x6570;&#x5F0F;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x69D8;&#x306A;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x9593;&#x3067;&#x5E83;&#x304F;&#x9069;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x30CE;&#x30A4;&#x30BA;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x4E0B;&#x3067;&#x7279;&#x7570;&#x6027;&#x3092;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x7D71;&#x4E00;&#x7684;&#x7406;&#x8AD6;&#x7684;&#x306A;&#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

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Global mediciones de expresi&#xF3;n de genes est&#xE1;n cada vez m&#xE1;s obtuvo como una funci&#xF3;n de tipo celular, la posici&#xF3;n espacial dentro de un tejido y otras coordenadas biol&#xF3;gicamente significativas. Tales datos deber&#xED;an permitir el an&#xE1;lisis cuantitativo de la especificidad de tipo celular de la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica, pero este tipo de an&#xE1;lisis a menudo puede ser confundida por la presencia de ruido. Se introduce una medida de la especificidad de especificaciones que cuantifica la informaci&#xF3;n en el perfil de la expresi&#xF3;n de un gen completo con respecto a cualquier tipo de c&#xE9;lula, y una medida de incertidumbre dSpec, que mide el efecto del ruido sobre la especificidad. Utilizando los datos mundiales de la expresi&#xF3;n de genes del cerebro del rat&#xF3;n, la ra&#xED;z de la planta y las c&#xE9;lulas blancas de la sangre, nos muestran que la especificaci&#xF3;n identifica los genes con los niveles de expresi&#xF3;n variables que sin embargo son muy espec&#xED;ficos de determinados tipos celulares. Cuando las muestras de diferentes individuos se utilizan, dSpec mide la plasticidad de los genes de la transcripci&#xF3;n en cada tipo de c&#xE9;lula. Nuestro enfoque es ampliamente aplicable a las medidas asignadas expresi&#xF3;n de genes en la biolog&#xED;a de c&#xE9;lulas madre, biolog&#xED;a de desarrollo, la biolog&#xED;a del c&#xE1;ncer y la identificaci&#xF3;n de biomarcadores. Como ejemplo de estas aplicaciones, se muestra que Spec identifica una nueva clase de marcadores biol&#xF3;gicos, que presentan una expresi&#xF3;n variable, sin comprometer la especificidad. El enfoque proporciona un marco te&#xF3;rico unificador para la cuantificaci&#xF3;n de la especificidad de la presencia de ruido, que es ampliamente aplicable a trav&#xE9;s de diversos sistemas biol&#xF3;gicos.

Medici&#xF3;n de la identidad de la c&#xE9;lula en Noisy Sistemas Biol&#xF3;gicos

&#x5E95;&#x6816;&#x751F;&#x7269;&#xFF0C;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x6839;&#x53EF;&#x5851;&#x6027;&#x4F7F;&#x690D;&#x7269;&#x6765;&#x89C5;&#x98DF;&#xFF0C;&#x5E76;&#x83B7;&#x5F97;&#x8109;&#x52A8;&#x7684;&#x5730;&#x4E0B;&#x73AF;&#x5883;&#x4E2D;&#x7684;&#x517B;&#x5206;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528;&#x9057;&#x4F20;&#x4E0E;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5B66;&#x4E2D;&#x7684;&quot;&#x62C6;&#x5206;&#x6839;&quot;&#x6846;&#x67B6;--&#x5728;&#x7269;&#x7406;&#x4E0A;&#x9694;&#x79BB;&#x540C;&#x4E00;&#x690D;&#x682A;&#x6839;&#x7CFB;&#x9762;&#x4E34;&#x7740;&#x4E0D;&#x540C;&#x6C2E; (N) &#x73AF;&#x5883; &mdash; &mdash; &#x8C03;&#x67E5;&#x5982;&#x4F55;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x6027;&#x4FE1;&#x53F7;&#x5F71;&#x54CD;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x91CD;&#x7F16;&#x7A0B;&#x548C;&#x6839;&#x53D1;&#x5C55;&#x3002;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x548C;&#x6839;&#x8868;&#x578B;&#x7684;&#x96C6;&#x6210;&#x4F7F;&#x6211;&#x4EEC;&#x80FD;&#x591F;&#x786E;&#x5B9A;&#x57FA;&#x7840;&quot;N &#x7ECF;&#x6D4E;&quot;&#x7684;&#x72EC;&#x7279;&#x673A;&#x5236; &#xFF08;&#x5373;&#xFF0C;N &#x4F9B;&#x5E94;&#x548C;&#x9700;&#x6C42;) &#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x79CD;&#x5236;&#x5EA6;&#x3002;&#x785D;&#x9178;&#x76D0;&#x6709;&#x9650;&#x6761;&#x4EF6;&#x4E0B;&#x690D;&#x7269;&#x6839;&#x7CFB;&#x91C7;&#x53D6;&quot;&#x4E3B;&#x52A8;&#x89C5;&#x98DF;&#x7B56;&#x7565;&quot;&#xFF0C;&#x7279;&#x70B9;&#x662F;&#x4FA7;&#x6839;&#x4EA7;&#x7269;&#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x7EC4;&#x91CD;&#x65B0;&#x7F16;&#x7A0B;&#xFF0C;&#x65E0;&#x8BBA;&#x672C;&#x5730;&#x6216;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x7684;&#x785D;&#x9178;&#x76D0;&#x5265;&#x593A;&#x54CD;&#x5E94;&#x5171;&#x4EAB;&#x7684;&#x6A21;&#x5F0F;&#x3002;&#x76F8;&#x6BD4;&#x4E4B;&#x4E0B;&#xFF0C;&#x5728;&#x785D;&#x9178;&#x76D0;&#x5145;&#x6EE1;&#x6761;&#x4EF6;&#x4E0B;&#xFF0C;&#x690D;&#x7269;&#x6839;&#x7CFB;&#x91C7;&#x53D6;&quot;&#x4F11;&#x7720;&#x7B56;&#x7565;&quot;&#xFF0C;&#x9547;&#x538B;&#x7684;&#x4FA7;&#x6839;&#x4EA7;&#x7269;&#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x7EC4;&#x91CD;&#x65B0;&#x7F16;&#x7A0B;&#xFF0C;&#x65E0;&#x8BBA;&#x672C;&#x5730;&#x6216;&#x8FDC;&#x7AEF;&#x7684;&#x785D;&#x9178;&#x76D0;&#x4F9B;&#x5E94;&#x54CD;&#x5E94;&#x5171;&#x4EAB;&#x7684;&#x6A21;&#x5F0F;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x3002;&#x5BF9;&#x786E;&#x5B9A;&#x7684;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6BD4;&#x8F83;&#x7684;&#x5F02;&#x6784;&#x4E0E;&#x9F50;&#x6B21;&#x62C6;&#x5206;&#x6839; N &#x6CBB;&#x7597;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x6027; N &#x4FE1;&#x53F7;&#x4F5C;&#x51FA;&#x53CD;&#x5E94;&#x7684;&#x524D;&#x54E8;&#x57FA;&#x56E0;&#x88AB;&#x7528;&#x6765;&#x63A2;&#x6D4B;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x53D7;&#x635F;&#x785D;&#x9178;&#x76D0;&#x51CF;&#x5C11;&#x548C;&#x6FC0;&#x7D20;&#x5408;&#x6210;&#x53CA;&#x8FD8;&#x88AB;&#x780D;&#x4E0B;&#x5934;&#x9885;&#x690D;&#x7269;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x7A81;&#x53D8;&#x4F53;&#x7684; N &#x53CD;&#x5E94;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x7EFC;&#x5408;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x786E;&#x5B9A;&#x57FA;&#x56E0;&#x4E0D;&#x540C;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x4FE1;&#x53F7;&#x57FA;&#x7840;&#x690D;&#x7269; N &#x7ECF;&#x6D4E;&#xFF1A; (i) N &#x4F9B;&#x5E94;&#xFF0C;&#x5BF9;&#x5E94;&#x4E8E;&#x957F;&#x9014;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x6027;&#x7684;&#x4FE1;&#x53F7;&#x89E6;&#x53D1;&#x7684;&#x785D;&#x9178;&#x76D0;&#x9065;&#x611F; &#xFF1B;&#x53CA; (ii) N &#x7684;&#x9700;&#x6C42;&#xFF0C;&#x5BF9;&#x62A5;&#x544A;&#x7684;&#x6574;&#x5382;&#xFF0C;&#x785D;&#x9178;&#x76D0;&#x9700;&#x6C42;&#x4EE5;&#x524D;&#x63A8;&#x65AD;&#x7684;&#x785D;&#x9178;&#x76D0;-&#x7EC6;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#x7D20;&#x82BD;&#x6839;&#x4E2D;&#x7EE7;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x7684;&#x4F20;&#x9012;&#x95ED;&#x5305;&#x7684;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x652F;&#x6301;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x5BCC;&#x542B;&#x785D;&#x9178;&#x76D0;&#x7684;&#x4FEE;&#x8865;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x7684;&#x975E;&#x5747;&#x8D28;&#x571F;&#x4E2D;&#x7684;&#x8865;&#x507F;&#x6027;&#x6839;&#x751F;&#x957F;&#x3002;

&#x6C2E;&#x7684;&#x6839;&#x89C5;&#x98DF;&#x7684;&#x7ECF;&#x6D4E;&#x5B66;&#xFF1A; &#x785D;&#x9178;&#x76D0;-&#x7EC6;&#x80DE;&#x5206;&#x88C2;&#x7D20;&#x4E2D;&#x7EE7;&#x548C; N &#x4F9B;&#x5E94;&#x4E0E;&#x9700;&#x6C42;&#x4E0D;&#x540C;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x4FE1;&#x53F7;&#x7684;&#x4F20;&#x9012;&#x95ED;&#x5305;&#x3002;

As sessile organisms, root plasticity enables plants to forage for and acquire nutrients in a fluctuating underground environment. Here, we use genetic and genomic approaches in a "split-root" framework--in which physically isolated root systems of the same plant are challenged with different nitrogen (N) environments--to investigate how systemic signaling affects genome-wide reprogramming and root development. The integration of transcriptome and root phenotypes enables us to identify distinct mechanisms underlying "N economy" (i.e., N supply and demand) of plants as a system. Under nitrate-limited conditions, plant roots adopt an "active-foraging strategy", characterized by lateral root outgrowth and a shared pattern of transcriptome reprogramming, in response to either local or distal nitrate deprivation. By contrast, in nitrate-replete conditions, plant roots adopt a "dormant strategy", characterized by a repression of lateral root outgrowth and a shared pattern of transcriptome reprogramming, in response to either local or distal nitrate supply. Sentinel genes responding to systemic N signaling identified by genome-wide comparisons of heterogeneous vs. homogeneous split-root N treatments were used to probe systemic N responses in Arabidopsis mutants impaired in nitrate reduction and hormone synthesis and also in decapitated plants. This combined analysis identified genetically distinct systemic signaling underlying plant N economy: (i) N supply, corresponding to a long-distance systemic signaling triggered by nitrate sensing; and (ii) N demand, experimental support for the transitive closure of a previously inferred nitrate-cytokinin shoot-root relay system that reports the nitrate demand of the whole plant, promoting a compensatory root growth in nitrate-rich patches of heterogeneous soil.

Nitrogen economics of root foraging: transitive closure of the nitrate-cytokinin relay and distinct systemic signaling for N supply vs. demand.

Comme les organismes sessiles, la plasticit&#xE9; racinaire permet aux plantes de fourrage et d&#x26;#39;acqu&#xE9;rir des &#xE9;l&#xE9;ments nutritifs dans un environnement fluctuant souterraine. Ici, nous utilisons des approches g&#xE9;n&#xE9;tiques et g&#xE9;nomiques dans un &#x26;quot;split-root&#x26;quot; - cadre dans lequel les syst&#xE8;mes racinaires physiquement isol&#xE9;s de la m&#xEA;me plante sont mis au d&#xE9;fi avec de l&#x26;#39;azote diff&#xE9;rente (N) des environnements - d&#x26;#39;enqu&#xEA;ter sur la fa&#xE7;on dont la signalisation syst&#xE9;mique affecte l&#x26;#39;ensemble du g&#xE9;nome et de reprogrammation le d&#xE9;veloppement des racines. L&#x26;#39;int&#xE9;gration des ph&#xE9;notypes du transcriptome et des racines nous permet d&#x26;#39;identifier les m&#xE9;canismes sous-jacents distincts &#x26;quot;&#xE9;conomie N&#x26;quot; (c.-&#xE0;-N offre et la demande) des plantes en tant que syst&#xE8;me. Sous-nitrate de conditions limit&#xE9;es, les racines des plantes adopter une &#x26;quot;actif de recherche de nourriture strat&#xE9;gie&#x26;quot;, caract&#xE9;ris&#xE9; par l&#x26;#39;excroissance lat&#xE9;rale racine et un motif commun de reprogrammation transcriptome, en r&#xE9;ponse &#xE0; soit la privation de nitrate local ou distale. En revanche, dans le nitrate-remplis les conditions, les racines des plantes adopter une &#xAB;strat&#xE9;gie dormante&#xBB;, caract&#xE9;ris&#xE9; par une r&#xE9;pression de l&#x26;#39;excroissance de la racine lat&#xE9;rale et un mod&#xE8;le partag&#xE9; de la reprogrammation du transcriptome, en r&#xE9;ponse &#xE0; l&#x26;#39;offre, soit le nitrate locale ou distale. G&#xE8;nes sentinelles ont r&#xE9;pondu &#xE0; N syst&#xE9;miques de signalisation identifi&#xE9; par l&#x26;#39;ensemble du g&#xE9;nome des comparaisons de traitements h&#xE9;t&#xE9;rog&#xE8;nes vs homog&#xE8;ne split-root N ont &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9;s pour sonder syst&#xE9;miques N r&#xE9;ponses dans mutants d&#x26;#39;Arabidopsis d&#xE9;ficients dans la r&#xE9;duction des nitrates et la synth&#xE8;se des hormones et aussi dans les plantes d&#xE9;capit&#xE9;es. Cette analyse combin&#xE9;e identifi&#xE9; g&#xE9;n&#xE9;tiquement distinctes de signalisation syst&#xE9;mique sous-jacente azote de la plante &#xE9;conomie: (i) N approvisionnement, ce qui correspond &#xE0; une signalisation &#xE0; longue distance syst&#xE9;mique d&#xE9;clench&#xE9;e par la d&#xE9;tection de nitrate, et (ii) la demande N, un support exp&#xE9;rimental pour la fermeture transitive d&#x26;#39;un nitrate pr&#xE9;c&#xE9;demment d&#xE9;duit -cytokinine syst&#xE8;me de relais pousse-racine qui rapporte la demande de nitrate de la plante enti&#xE8;re, la promotion d&#x26;#39;une croissance des racines compensatoire riche en nitrates des plaques de sol h&#xE9;t&#xE9;rog&#xE8;ne.

Economie d&#x26;#39;azote de la racine de butinage: Fermeture transitive du relais de la nitrate-cytokinine et distinct de signalisation syst&#xE9;mique pour alimentation VS N. Demande

Stamm Plastizit&auml;t erm&ouml;glicht als sessile Organismen Pflanzen f&uuml;r Futter und N&auml;hrstoffe in einer schwankenden unterirdische Umgebung zu erwerben. Hier verwenden wir genetische und genomische Ans&auml;tze in einem &quot;Split-Root&quot; Rahmen--in dem k&ouml;rperlich isoliert Root-Systeme von der gleichen Pflanze mit verschiedenen Stickstoff (N)-Umgebungen--herausgefordert werden, zu untersuchen, wie systemische Signalisierung betrifft genomweiten Neuprogrammierung und Root-Entwicklung. Die Integration von Transkriptom und Root Ph&auml;notypen erm&ouml;glicht unterschiedliche Mechanismen &quot;N Wirtschaft&quot; zu identifizieren (d.h. N Angebot und Nachfrage) von Pflanzen als System. Bedingungen Nitrat-begrenzte Annahme Pflanzenwurzeln eine &quot;aktiv-Nahrungssuche Strategie&quot;, zeichnet sich durch seitliche Wurzel Auswuchs und ein gemeinsamer Transkriptom Neuprogrammierung, als Reaktion auf entweder lokal oder distale Nitrat-Entzug. Nitrat-vollgestopft Bedingungen erlassen Pflanzenwurzeln hingegen eine &quot;ruhende Strategy&quot;, zeichnet sich durch eine Unterdr&uuml;ckung der seitliche Wurzel Auswuchs und eine gemeinsame Muster der Transkriptom Neuprogrammierung, als Reaktion auf entweder lokal oder distale Nitrat-Versorgung. Sentinel-Gene, die Reaktion auf systemische N Signalisierung durch genomweiten Vergleiche von heterogenen vs. homogene Split-Wurzel N Behandlungen identifiziert wurden zur systemische N Antworten in Arabidopsis Mutanten beeintr&auml;chtigt in Nitrat-Reduktion und Hormon-Synthese und enthaupteten Pflanzen Pr&uuml;fpunkt. Diese kombinierte Analyse identifiziert genetisch unterschiedliche systemische Signalling zugrunde liegende Anlage N Wirtschaft: (i) N-Versorgung, entsprechend einer weitr&auml;umigen systemische Signalisierung ausgel&ouml;st durch Nitrat Sensorik; und (Ii) N Nachfrage, experimentelle Unterst&uuml;tzung f&uuml;r die transitive ein vorher hergeleiteten Nitrat-Cytokinine Shoot-Staffel Wurzelsystem, das meldet die Nitrat-Nachfrage der Gesamtpflanze, F&ouml;rderung einer kompensatorischen Wurzelwachstum in Nitrat-reiche Flecken von heterogenen Boden.

Stickstoff-&Ouml;konomie der Wurzel Nahrungssuche: transitive H&uuml;lle der Nitrat-Cytokinine Relais und unterschiedliche systemische Signalisierung f&uuml;r N-Versorgung vs. Nachfrage.

Come organismi sessili, plasticit&agrave; radice consente di piante foraggere per e acquisire nutrienti in un ambiente sotterraneo fluttuante. Qui usiamo genetica e approcci genomici in un quadro di &quot;split-radice&quot; - in cui fisicamente isolati sistemi della radice della pianta stessa sono sfidati con ambienti diversi azoto (N) - per indagare su segnalazione come sistemico colpisce lo sviluppo di riprogrammazione e radice di genome-wide. L&#39;integrazione di fenotipi transcriptome e radice ci consente di identificare distinti meccanismi sottostanti &quot;Economia N&quot; (cio&egrave;, N domanda e offerta) di piante come un sistema. In condizioni di nitrato-limited, le radici delle piante adottare una &quot;attivo foraggiamento strategia&quot;, caratterizzata da escrescenze laterali della radice e un modello condiviso di transcriptome riprogrammazione, in risposta alla privazione o nitrato locale o distale. Al contrario, in condizioni di piene di nitrati, le radici delle piante adottare una &quot;strategia dormiente&quot;, caratterizzata da una repressione di escrescenze laterali della radice e un modello condiviso di transcriptome riprogrammazione, in risposta all&#39;alimentazione sia locale o distale nitrato. Sentinella geni rispondendo a sistemica N segnalazione identificato dal genome-wide confronti di eterogenei vs omogenei trattamenti di Spalato-radice N sono stati utilizzati per sonda sistemiche risposte N mutanti di Arabidopsis con problemi nella sintesi dell&#39;ormone e riduzione del nitrato e anche nelle piante decapitati. Questa analisi combinata identificati geneticamente distinte sistemica segnalazione sottostante pianta N economia: fornitura di (i) N, corrispondente a una segnalazione a distanza sistemica innescato dal nitrato di rilevamento; e (ii) N domanda, supporto sperimentale per la chiusura transitiva di un sistema di rel&egrave; precedentemente dedotto nitrato-citochinine shoot-radice che segnala la richiesta di nitrato dell&#39;intera pianta, promuovendo una crescita compensatoria radice nel ricco di nitrato di appezzamenti di terreno eterogeneo.

Economia dell&#39;azoto di foraggiamento radice: chiusura transitiva di nitrato-citochinine rel&egrave; e segnalazione sistemica distinti per la fornitura di N vs domanda.

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&#xCC29; &#xC720;&#xAE30;&#xB85C; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xC18C;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB9C8; &#xCD08; &#xBCC0;&#xB3D9; &#xC9C0; &#xD558; &#xD658;&#xACBD;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC601;&#xC591;&#xBD84;&#xC744; &#xD68D;&#xB4DD; &#xD558;&#xB294; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xACE0; &quot;&#xBD84;&#xD560; &#xB8E8;&#xD2B8;&quot; &#xD504;&#xB808;&#xC784; &#xC6CC;&#xD06C;-&#xB294; &#xAC19;&#xC740; &#xACF5;&#xC7A5;&#xC758; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC744; &#xBB3C;&#xB9AC;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xACA9;&#xB9AC; &#xB41C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC9C8;&#xC18C; (N) &#xD658;&#xACBD;-&#xC5B4;&#xB5BB;&#xAC8C; &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; &#xC2E0;&#xD638;&#xB97C; &#xC870;&#xC0AC; &#xD558; &#xB3C4;&#xC804; &#xD558;&#xB294; genomic &#xC811;&#xADFC;&#xC5D0; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBBF8;&#xCE58;&#xB294; &#xAC8C;&#xB188; &#xB113;&#xC740; &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB798;&#xBC0D; &#xBC0F; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xAC1C;&#xBC1C;. Transcriptome &#xBC0F; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xACE0;&#xAE30; &#xD1B5;&#xD569; &quot;N &#xACBD;&#xC81C;&quot;&#xB97C; &#xAE30;&#xBCF8; &#xACE0;&#xC720; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; (&#xC989;, N &#xACF5;&#xAE09;&#xACFC; &#xC218;&#xC694;) &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC73C;&#xB85C; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC758;. &#xC9C8;&#xC0B0;&#xC5FC;-&#xC81C;&#xD55C; &#xB41C; &#xC870;&#xAC74; &#xD558;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xBFCC;&#xB9AC;&#xB294; &quot;&#xC561;&#xD2F0;&#xBE0C; &#xAD6C;&#xD558;&#xACE0; &#xC804;&#xB7B5; &#xCC44;&#xD0DD;&quot;, &#xCE21;&#xBA74; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xD30C;&#xC0DD;&#xBB3C; transcriptome &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB798;&#xBC0D; &#xC911; &#xB85C;&#xCEEC; &#xB610;&#xB294; &#xC6D0;&#xC2EC; &#xC9C8;&#xC0B0;&#xC5FC; &#xBD80;&#xC871;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xACF5;&#xC720; &#xD328;&#xD134;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD2B9;&#xC9D5;. &#xB300;&#xC870;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC9C8;&#xC0B0;&#xC5FC; &#xCDA9;&#xB9CC; &#xC870;&#xAC74;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xBFCC;&#xB9AC; &#xC804;&#xB7B5;&#xC744; &#xCC44;&#xD0DD; &quot;&#xD734;&#xBA74;&quot;, &#xCE21;&#xBA74; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xD30C;&#xC0DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xC5B5;&#xC555;&#xACFC; transcriptome &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB798;&#xBC0D; &#xC911; &#xB85C;&#xCEEC; &#xB610;&#xB294; &#xC6D0;&#xC2EC; &#xC9C8;&#xC0B0;&#xC5FC; &#xACF5;&#xAE09;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xACF5;&#xC720; &#xD328;&#xD134;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD2B9;&#xC9D5;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xAE30;&#xC885; &#xADE0;&#xC9C8; &#xBD84;&#xD560; &#xB8E8;&#xD2B8; N &#xCE58;&#xB8CC; &#xB300;&#xC758; &#xAC8C;&#xB188; &#xB113;&#xC740; &#xBE44;&#xAD50; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xCCB4;&#xACC4; N &#xC2E0;&#xD638;&#xC5D0; &#xC751;&#xB2F5; &#xD558;&#xB294; &#xC13C; &#xD2F0; &#xB12C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; N &#xC751;&#xB2F5; &#xC7A5;&#xC560;&#xAC00; &#xC788;&#xB294; &#xC9C8;&#xC0B0;&#xC5FC; &#xAC10;&#xC18C;&#xC640; &#xD638;&#xB974;&#xBAAC; &#xD569;&#xC131; &#xBC0F; &#xC798;&#xB9B0;&#xB41C; &#xC2DD;&#xBB3C; Arabidopsis &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774;&#xC5D0; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774; &#xACB0;&#xD569; &#xB41C; &#xBD84;&#xC11D; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCC4;&#xAC1C; &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; &#xC2E0;&#xD638; &#xAE30;&#xBCF8; &#xACF5;&#xC7A5; N &#xACBD;&#xC81C;: (i) N &#xACF5;&#xAE09;, &#xD574;&#xB2F9; &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; &#xC7A5;&#xAC70;&#xB9AC; &#xC2E0;&#xD638; &#xC9C8;&#xC0B0;&#xC5FC; &#xAC10;&#xC9C0;;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC2E4;&#xD589; &#xD558; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; (ii) N &#xC218;&#xC694;, &#xC804;&#xCCB4; &#xC2DD;&#xBB3C;&#xC758; &#xC9C8;&#xC0B0;&#xC5FC; &#xC218;&#xC694;&#xB97C; &#xBCF4;&#xACE0; &#xD558;&#xB294; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC720;&#xCD94; &#xC9C8;&#xC0B0;&#xC5FC; cytokinin &#xCD2C;&#xC601; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xB9B4;&#xB808;&#xC774; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC758; &#xC804;&#xC774;&#xC801; &#xD3D0;&#xC1C4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC801;&#xC778; &#xC9C0;&#xC6D0; &#xD64D;&#xBCF4; &#xBCF4;&#xC0C1; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xC131;&#xC7A5; &#xC720;&#xD615;&#xC774; &#xB2E4;&#xB978; &#xD1A0;&#xC591;&#xC758; &#xC9C8;&#xC0B0;&#xC5FC;&#xC774; &#xD48D;&#xBD80;&#xD55C; &#xD328;&#xCE58;.

&#xB8E8;&#xD2B8; &#xAD6C;&#xD558;&#xACE0;&#xC758; &#xC9C8;&#xC18C; &#xACBD;&#xC81C;&#xD559;: &#xC9C8;&#xC0B0;&#xC5FC; cytokinin &#xB9B4;&#xB808;&#xC774; &#xBC0F; &#xC218;&#xC694; &#xB300; &#xACF5;&#xAE09; N&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xACE0;&#xC720;&#xD55C; &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; &#xC2E0;&#xD638;&#xC758; &#xC804;&#xC774;&#xC801; &#xD3D0;&#xC1C4;.

Mientras que los organismos s&#xE9;siles, la plasticidad de ra&#xED;z permite a las plantas de forraje y adquirir nutrientes en un ambiente subterr&#xE1;neo fluctuante. Aqu&#xED;, nosotros usamos los enfoques gen&#xE9;ticos y gen&#xF3;micos en un &#x26;quot;split-root&#x26;quot; marco - en el que los sistemas de ra&#xED;ces f&#xED;sicamente aislados de la misma planta se enfrentan al reto de nitr&#xF3;geno diferente (N) entornos - para investigar c&#xF3;mo la se&#xF1;alizaci&#xF3;n sist&#xE9;mica afecta a todo el genoma y la reprogramaci&#xF3;n desarrollo de las ra&#xED;ces. La integraci&#xF3;n de los fenotipos del transcriptoma y la ra&#xED;z nos permite identificar los mecanismos que subyacen a distintos &#x26;quot;econom&#xED;a de N&#x26;quot; (es decir, N oferta y la demanda) de las plantas como un sistema. Bajo las condiciones limitadas de nitrato, ra&#xED;ces de las plantas adoptar una &#x26;quot;estrategia activa de b&#xFA;squeda de alimento&#x26;quot;, caracterizada por consecuencia de las ra&#xED;ces laterales y un patr&#xF3;n com&#xFA;n de la reprogramaci&#xF3;n del transcriptoma, en respuesta a la privaci&#xF3;n ya sea local o de nitrato distal. Por el contrario, en repletas de nitrato de condiciones, ra&#xED;ces de las plantas adoptar una &#x26;quot;estrategia latente&#x26;quot;, que se caracteriza por una represi&#xF3;n de derivaci&#xF3;n ra&#xED;z lateral y un patr&#xF3;n compartido de reprogramaci&#xF3;n transcriptoma, en respuesta a cualquiera de suministro local de nitrato o distal. Los genes que responden a Sentinel N sist&#xE9;micas identificadas por la se&#xF1;alizaci&#xF3;n en todo el genoma comparaciones de los tratamientos de ra&#xED;z dividida N heterog&#xE9;neos vs homog&#xE9;nea fueron usados &#x200B;&#x200B;para investigar las respuestas sist&#xE9;micas N en los mutantes de Arabidopsis con deficiencias en la reducci&#xF3;n de los nitratos y la s&#xED;ntesis de hormonas y tambi&#xE9;n en plantas decapitadas. Este an&#xE1;lisis combinado de se&#xF1;alizaci&#xF3;n sist&#xE9;mica identificada gen&#xE9;ticamente distinta que subyace a la planta N econom&#xED;a: (i) el aporte de N, que corresponde a una se&#xF1;alizaci&#xF3;n sist&#xE9;mica de larga distancia activadas por sensores de nitrato, y (ii) la demanda de N, soporte experimental para la clausura transitiva de un nitrato deducido previamente -citocinina tiroteo ra&#xED;z del sistema de retransmisi&#xF3;n que informa de la demanda de nitrato de toda la planta, la promoci&#xF3;n de un crecimiento de las ra&#xED;ces de compensaci&#xF3;n en pa&#xED;ses ricos en nitrato de parches de suelo heterog&#xE9;neo.

Econom&#xED;a de nitr&#xF3;geno de la ra&#xED;z de forrajeo: clausura transitiva de la retransmisi&#xF3;n de nitratos citoquinina y de se&#xF1;alizaci&#xF3;n distinta sist&#xE9;mico para la provisi&#xF3;n de N vs. Demanda

&#x6458;&#x8981;&#xFF1A; &#x690D;&#x7269;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x548C;&#x751F;&#x7269;&#x6280;&#x672F;&#x7684;&#x62A5;&#x544A;&#xFF1A; &#x4ECE;&#x57FA;&#x56E0;&#x5230;&#x7F51;&#x7EDC;&#x4F1A;&#x8BAE;&#xFF0C;&#x5728;&#x51B7;&#x6CC9;&#x6E2F;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x5BA4;&#xFF0C;&#x4E3E;&#x884C; 11 &#x6708; 30 &#x65E5;&#x81F3; 2011 &#x5E74; 12 &#x6708; 3 &#x65E5;&#x3002;

&#x4F4E;&#x6210;&#x672C;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x6253;&#x5F00;&#x4E0D;&#x540C;&#x690D;&#x7269;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x65B0;&#x89C1;&#x89E3;&#x3002;

ABSTRACT: A report on the Plant Genomes and Biotechnology: From Genes to Networks meeting, held at Cold Spring Harbor Laboratory, 30 November to 3 December 2011.

Low-cost sequencing opens new insights into diverse plant genomes.

R&#xC9;SUM&#xC9;: Un rapport sur les g&#xE9;nomes des plantes et la biotechnologie: Des g&#xE8;nes aux r&#xE9;seaux r&#xE9;union, tenue &#xE0; Cold Spring Harbor Laboratory, 30 Novembre to 3 D&#xE9;cembre 2011.

Faible co&#xFB;t de s&#xE9;quen&#xE7;age ouvre de nouvelles perspectives sur les g&#xE9;nomes des plantes diverses

Zusammenfassung: Ein Bericht &uuml;ber die Pflanze Genome und Biotechnologie: von Genen zu Netzwerken treffen, gehalten am Cold Spring Harbor Laboratory, 30. November bis 3. Dezember 2011.

Kosteng&uuml;nstige Sequenzierung er&ouml;ffnet neue Einblicke in vielf&auml;ltige Pflanze Genomen.

ABSTRACT: Una relazione sui genomi vegetali e biotecnologie: dai geni alla riunione di reti, tenuto presso il Cold Spring Harbor Laboratory, 30 novembre al 3 dicembre 2011.

Sequenziamento low cost apre nuove intuizioni genomi di piante diverse.

ABSTRACT&#xFF1A;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x4F1A;&#x8B70;&#x3078;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304B;&#x3089;&#x3001;&#x30B3;&#x30FC;&#x30EB;&#x30C9;&#x30B9;&#x30D7;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x30CF;&#x30FC;&#x30D0;&#x30FC;&#x30E9;&#x30DC;&#x30E9;&#x30C8;&#x30EA;&#x30FC;&#x3001;2011&#x5E74;11&#x6708;30&#x65E5;&#x304B;&#x3089;12&#x6708;3&#x65E5;&#x307E;&#x3067;&#x3067;&#x958B;&#x50AC;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#xFF1A;&#x690D;&#x7269;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3068;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30C6;&#x30AF;&#x30CE;&#x30ED;&#x30B8;&#x30FC;&#x306B;&#x95A2;&#x3059;&#x308B;&#x5831;&#x544A;&#x66F8;&#x3002;

&#x4F4E;&#x30B3;&#x30B9;&#x30C8;&#x306E;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x591A;&#x69D8;&#x306A;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306B;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x958B;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xAC1C;&#xC694;: &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC0F; &#xC0DD;&#xBA85; &#xACF5;&#xD559;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBCF4;&#xACE0;&#xC11C;: 30 11 &#xC6D4; ~ 2011 &#xB144; 12 &#xC6D4; 3 &#xCF5C;&#xB4DC; &#xC2A4;&#xD504;&#xB9C1; &#xD558;&#xBC84; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC18C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xD68C;&#xC758;&#xB97C; &#xAC1C;&#xCD5C;.

&#xC800;&#xAC00; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC5FD;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Article	Year
Cell-specific nitrogen responses mediate developmental plasticity. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America\| PubMed ID: 18180456	2008
Slicing across kingdoms: regeneration in plants and animals. Cell\| PubMed ID: 18295584	2008
Positive fluorescent selection permits precise, rapid, and in-depth overexpression analysis in plant protoplasts. Plant physiology\| PubMed ID: 19168642	2009
Organ regeneration does not require a functional stem cell niche in plants. Nature\| PubMed ID: 19182776	2009
Primer and interviews: Gene regulation in Arabidopsis thaliana. Interview by Julie C. Kiefer. Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists\| PubMed ID: 19653311	2009
Automated sorting of live C. elegans using laFACS. Nature methods\| PubMed ID: 20436474	2010
Built to rebuild: in search of organizing principles in plant regeneration. Current opinion in genetics & development\| PubMed ID: 20537526	2010
The GATA factor HANABA TARANU is required to position the proembryo boundary in the early Arabidopsis embryo. Developmental cell\| PubMed ID: 20643354	2010
Predicting genome-wide redundancy using machine learning. BMC evolutionary biology\| PubMed ID: 21087504	2010
Quantitation of cellular dynamics in growing Arabidopsis roots with light sheet microscopy. PloS one\| PubMed ID: 21731697	2011
Measuring cell identity in noisy biological systems. Nucleic acids research\| PubMed ID: 21803789	2011
Nitrogen economics of root foraging: transitive closure of the nitrate-cytokinin relay and distinct systemic signaling for N supply vs. demand. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America\| PubMed ID: 22025711	2011
Low-cost sequencing opens new insights into diverse plant genomes. Genome biology\| PubMed ID: 22289505	2012

Kenneth D. Birnbaum

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