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Single Read and Paired End mRNA-Seq Illumina Libraries from 10 Nanograms Total RNA

Whole transcriptome sequencing by mRNA-Seq is now used extensively to perform global gene expression, mutation, allele-specific expression and other ...

Morgridge Institute for Research

Puces d&#39;oligonucl&eacute;otides sp&eacute;cifiques du virus peut fournir une m&eacute;thode de d&eacute;pistage dans les &eacute;chantillons pour la pr&eacute;sence ou l&#39;absence d&#39;une grande vari&eacute;t&eacute; de virus en m&ecirc;me temps. Virus de l&#39;influenza sont id&eacute;ales pour l&#39;&eacute;valuation de ces puces &agrave; cause de leur g&eacute;n&eacute;tique et diversit&eacute; de l&#39;h&ocirc;te et la disponibilit&eacute; d&#39;une base de donn&eacute;es &eacute;tendue de s&eacute;quence. Une collection de 476 oligonucl&eacute;otides sp&eacute;cifiques du virus de la grippe a &eacute;t&eacute; rep&eacute;r&eacute;e sur des lames de verre comme sondes. L&#39;ARN viral ont &eacute;t&eacute; inverse, transcrit et amplifi&eacute; par PCR, et les produits sont &eacute;tiquet&eacute;s avec les colorants cyanine. La pr&eacute;sence de virus et de leurs identit&eacute;s ont &eacute;t&eacute; d&eacute;termin&eacute;es par hybridation. Les intensit&eacute;s de fluorescence des taches d&#39;oligonucl&eacute;otides ont &eacute;t&eacute; hautement reproductible au sein de chaque diapositive et satisfaisante proportionnelle entre les exp&eacute;riences. Toutefois, l&#39;intensit&eacute; des taches de sonde enti&egrave;rement compl&eacute;mentaires aux s&eacute;quences cibles variait de fond &agrave; saturation. Les variations ne sont pas corr&eacute;l&eacute; avec la composition en bases, s&eacute;quence de nucl&eacute;otides ou structures secondaires internes. Par cons&eacute;quent, seuils pour d&eacute;terminer si l&#39;hybridation &agrave; un endroit devait &ecirc;tre jug&eacute;e positif ont &eacute;t&eacute; affect&eacute;s individuellement. Consid&eacute;rant seulement positif taches de sondes seraient monosp&eacute;cifique d&#39;esp&egrave;ces de virus de la grippe, sous-type, source de l&#39;h&ocirc;te ou segment de g&egrave;ne, cette m&eacute;thode fait des identifications correctes &agrave; l&#39;esp&egrave;ce, sous-type d&#39;h&eacute;magglutinine et niveaux de segment de g&egrave;ne. Sondes de sous-type de la neuraminidase (NA) monosp&eacute;cifiques &eacute;taient insuffisamment diversifi&eacute;s sur l&#39;attribution de sous-type NA confiante. Sondes dans le sch&eacute;ma d&#39;identification comportant les points positifs de polyspecific donnent les m&ecirc;mes r&eacute;sultats. Dans l&#39;ensemble, les r&eacute;sultats d&eacute;montrent le potentiel d&#39;hybridation oligonucleotide microarray-bas&eacute;e pour la d&eacute;tection de virus multiples.

La d&eacute;tection mol&eacute;culaire et l&#39;identification du virus de la grippe par l&#39;hybridation oligonucleotide microarray.

&#x75C5;&#x6BD2;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x82AF;&#x7247;&#x6280;&#x672F;&#x53EF;&#x80FD;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7684;&#x540C;&#x65F6;&#x68C0;&#x67E5;&#x5B58;&#x5728;&#x5404;&#x79CD;&#x5404;&#x6837;&#x7684;&#x75C5;&#x6BD2;&#x6837;&#x672C;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x6D41;&#x611F;&#x75C5;&#x6BD2;&#x662F;&#x7406;&#x60F3;&#x7684;&#x8BC4;&#x4EF7;&#x8FD9;&#x79CD;&#x82AF;&#x7247;&#x7531;&#x4E8E;&#x5176;&#x9057;&#x4F20;&#x548C;&#x4E3B;&#x673A;&#x591A;&#x6837;&#x6027;&#x548C;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x6570;&#x636E;&#x5E93;&#x7684;&#x53EF;&#x7528;&#x6027;&#x3002;476 &#x6D41;&#x611F;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x7684;&#x96C6;&#x5408;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x63A2;&#x6D4B;&#x5668;&#x53D1;&#x73B0;&#x73BB;&#x7483;&#x5E7B;&#x706F;&#x7247;&#x4E0A;&#x3002;&#x75C5;&#x6BD2; Rna &#x88AB;&#x53CD;&#x5411;&#x8F6C;&#x5F55;&#x548C;&#x805A;&#x5408;&#x9176;&#x94FE;&#x53CD;&#x5E94;&#xFF0C;&#x6269;&#x589E;&#xFF0C;&#x4EA7;&#x54C1;&#x90FD;&#x6807;&#x6709;&#x83C1;&#x67D3;&#x6599;&#x3002;&#x75C5;&#x6BD2;&#x548C;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x7684;&#x8EAB;&#x4EFD;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x5B9A;&#x7684;&#x6742;&#x4EA4;&#x3002;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x70B9;&#x7684;&#x8367;&#x5149;&#x5F3A;&#x5EA6;&#x662F;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x53EF;&#x91CD;&#x73B0;&#x5185;&#x6BCF;&#x4E00;&#x5F20;&#x5E7B;&#x706F;&#x7247;&#x548C;&#x8BD5;&#x9A8C;&#x4E4B;&#x95F4;&#x4EE4;&#x4EBA;&#x6EE1;&#x610F;&#x5730;&#x6BD4;&#x4F8B;&#x3002;&#x4F46;&#x662F;&#xFF0C;&#x5BF9;&#x76EE;&#x6807;&#x5E8F;&#x5217;&#x5B8C;&#x5168;&#x4E92;&#x8865;&#x7684;&#x63A2;&#x9488;&#x70B9;&#x7684;&#x5F3A;&#x5EA6;&#x80CC;&#x666F;&#x5404;&#x4E0D;&#x76F8;&#x540C;&#x9971;&#x548C;&#x5EA6;&#x3002;&#x53D8;&#x5316;&#x5E76;&#x4E0D;&#x4E0E;&#x57FA;&#x7EC4;&#x6210;&#x3001; &#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x5E8F;&#x5217;&#x6216;&#x5185;&#x90E8;&#x4E8C;&#x7EA7;&#x7ED3;&#x6784;&#x76F8;&#x5173;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x9608;&#x503C;&#x786E;&#x5B9A;&#x662F;&#x5426;&#x5E94;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x79EF;&#x6781;&#x5224;&#x65AD;&#x6742;&#x4EA4;&#x5230;&#x73B0;&#x573A;&#x88AB;&#x5355;&#x72EC;&#x6307;&#x6D3E;&#x3002;&#x8003;&#x8651;&#x5230;&#x53EA;&#x6709;&#x79EF;&#x6781;&#x4ECE;&#x63A2;&#x6D4B;&#x5668;&#x9884;&#x8BA1;&#x8FD9;&#x5C06;&#x6D41;&#x611F;&#x75C5;&#x6BD2;&#x79CD;&#x7C7B;&#x3001; &#x5B50;&#x7C7B;&#x578B;&#x3001; &#x4E3B;&#x673A;&#x6E90;&#x6216;&#x57FA;&#x56E0;&#x7247;&#x6BB5;&#xFF0C;&#x6B64;&#x65B9;&#x6CD5;&#x4E3A; monospecific &#x70B9;&#x4F5C;&#x51FA;&#x6B63;&#x786E;&#x6807;&#x8BC6;&#x5728;&#x7269;&#x79CD;&#x3001; &#x8840;&#x51DD;&#x7D20;&#x4E9A;&#x578B;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x6BB5;&#x6C34;&#x5E73;&#x3002;Monospecific &#x795E;&#x7ECF;&#x6C28;&#x9178;&#x9176; (NA) &#x5B50;&#x7C7B;&#x578B;&#x63A2;&#x6D4B;&#x5668;&#x662F;&#x4E0D;&#x591F;&#x591A;&#x6837;&#xFF0C;&#x5141;&#x8BB8;&#x6709;&#x4FE1;&#x5FC3; NA &#x5B50;&#x7C7B;&#x578B;&#x8D4B;&#x503C;&#x3002;&#x7EB3;&#x5165;&#x79EF;&#x6781;&#x70B9;&#x4ECE; polyspecific &#x7684;&#x6807;&#x8BC6;&#x65B9;&#x6848;&#x63A2;&#x8BA8;&#x4E86;&#x76F8;&#x4F3C;&#x7684;&#x7ED3;&#x679C;&#x3002;&#x603B;&#x4F53;&#x800C;&#x8A00;&#xFF0C;&#x7ED3;&#x679C;&#x8BC1;&#x660E;&#x591A;&#x75C5;&#x6BD2;&#x68C0;&#x6D4B;&#x82AF;&#x7247;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x6742;&#x4EA4;&#x6280;&#x672F;&#x7684;&#x6F5C;&#x529B;&#x3002;

&#x5206;&#x5B50;&#x68C0;&#x6D4B;&#x4E0E;&#x6D41;&#x611F;&#x75C5;&#x6BD2;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x6742;&#x4EA4;&#x6280;&#x672F;&#x9274;&#x5B9A;&#x3002;

Microarrays of virus-specific oligonucleotides may provide a method of screening samples for the presence or absence of a large variety of viruses simultaneously. Influenza viruses are ideal for evaluating such microarrays because of their genetic and host diversity, and the availability of an extensive sequence database. A collection of 476 influenza virus-specific oligonucleotides was spotted onto glass slides as probes. Viral RNAs were reverse transcribed and amplified by PCR, and the products were labeled with cyanine dyes. The presence of viruses and their identities were determined by hybridization. The fluorescence intensities of oligonucleotide spots were highly reproducible within each slide and satisfactorily proportional between experiments. However, the intensities of probe spots completely complementary to target sequences varied from background to saturation. The variations did not correlate with base composition, nucleotide sequence, or internal secondary structures. Therefore, thresholds for determining whether hybridization to a spot should be judged as positive were assigned individually. Considering only positive spots from probes predicted to be monospecific for influenza virus species, subtype, host source, or gene segment, this method made correct identifications at the species, hemagglutinin subtype, and gene segment levels. Monospecific neuraminidase (NA) subtype probes were insufficiently diverse to allow confident NA subtype assignment. Incorporating positive spots from polyspecific probes into the identification scheme gave similar results. Overall, the results demonstrate the potential of microarray-based oligonucleotide hybridization for multiple virus detection.

Molecular detection and identification of influenza viruses by oligonucleotide microarray hybridization.

Molekulare Erkennung und Identifizierung von Influenzaviren durch Oligonukleotid-Mikroarray-Hybridisierung.

Microarray di oligonucleotidi specifici per il virus pu&ograve; fornire un metodo di screening contemporaneamente campioni per la presenza o l&#39;assenza di una grande variet&agrave; di virus. Virus influenzali sono ideali per valutare tali microarrays a causa della loro genetica e diversit&agrave; di host e la disponibilit&agrave; di un database esteso di sequenza. Una collezione di 476 oligonucleotidi di specifici per il virus influenzale &egrave; stata avvistata su vetrini come sonde. RNAs virale erano inverso trascritto e amplificato mediante PCR, e i prodotti sono stati etichettati con cianina coloranti. La presenza di virus e le loro identit&agrave; sono stati determinati tramite l&#39;ibridazione. Le intensit&agrave; di fluorescenza di macchie del oligonucleotide sono stati soddisfacentemente proporzionale tra esperimenti e altamente riproducibile all&#39;interno di ciascuna diapositiva. Tuttavia, l&#39;intensit&agrave; delle macchie sonda completamente complementari alle sequenze bersaglio varia da sfondo alla saturazione. Le variazioni di non correlare con composizione base, sequenza nucleotidica o strutture secondarie interne. Pertanto, le soglie per determinare se l&#39;ibridazione ad un posto dovrebbe essere giudicato come positivo sono state assegnate individualmente. Solo considerando positivi macchie da sonde predisse essere monocolturali per specie di virus dell&#39;influenza, sottotipo, origine dell&#39;host o segmento di gene, questo metodo fatto corrette identificazioni presso la specie, sottotipo emagglutinina e livelli di segmento del gene. Sonde di sottotipo monocolturali neuraminidasi (NA) erano sufficientemente diversificate per consentire l&#39;assegnazione di sottotipo NA fiducioso. Incorporando i punti positivi da polispecifico sonde nel regime di identificazione ha dato risultati simili. Nel complesso, i risultati dimostrano il potenziale dell&#39;ibridazione del oligonucleotide basata su microarray per la rilevazione dei virus pi&ugrave;.

Rilevazione molecolare e identificazione del virus dell&#39;influenza di ibridazione di microarray di oligonucleotidi.

&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x7279;&#x7570;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9; &#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306F;&#x540C;&#x6642;&#x306B;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x5927;&#x304D;&#x3044;&#x5909;&#x5316;&#x306E;&#x6709;&#x7121;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x3092;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3059;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30A4;&#x30F3;&#x30D5;&#x30EB;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B6; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DB;&#x30B9;&#x30C8;&#x306E;&#x591A;&#x69D8;&#x6027;&#x3068;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9; &#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x53EF;&#x7528;&#x6027;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x6700;&#x9069;&#x3067;&#x3059;&#x3002;476 &#x30A4;&#x30F3;&#x30D5;&#x30EB;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B6; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F;&#x30B9;&#x30E9;&#x30A4;&#x30C9; &#x30AC;&#x30E9;&#x30B9;&#x306B;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9; Rna &#x8EE2;&#x5199;&#x3057;&#x3001;PCR &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5897;&#x5E45;&#x9006;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x3057;&#x3001;&#x88FD;&#x54C1;&#x30B7;&#x30A2;&#x30CB;&#x30F3;&#x8272;&#x7D20;&#x3067;&#x6A19;&#x8B58;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x30A2;&#x30A4;&#x30C7;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C6;&#x30A3;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x306F;&#x4EA4;&#x914D;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x86CD;&#x5149;&#x5F37;&#x5EA6;&#x306F;&#x5404;&#x30B9;&#x30E9;&#x30A4;&#x30C9;&#x5185;&#x518D;&#x73FE;&#x6027;&#x306E;&#x9AD8;&#x3044;&#x3068;&#x6E80;&#x8DB3;&#x306E;&#x3044;&#x304F;&#x5B9F;&#x9A13;&#x9593;&#x6BD4;&#x4F8B;.&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6; &#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C8; &#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306B;&#x5B8C;&#x5168;&#x306B;&#x88DC;&#x8DB3;&#x306E;&#x5F37;&#x5EA6;&#x306E;&#x80CC;&#x666F;&#x304B;&#x3089;&#x5F69;&#x5EA6;&#x3092;&#x5909;&#x5316;&#x3055;&#x305B;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30D0;&#x30EA;&#x30A8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x57FA;&#x672C;&#x7D44;&#x6210;&#x3001;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30BB;&#x30AB;&#x30F3;&#x30C0;&#x30EA;&#x306E;&#x5185;&#x90E8;&#x69CB;&#x9020;&#x3068;&#x306F;&#x76F8;&#x95A2;&#x3057;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C8;&#x3078;&#x306E;&#x4EA4;&#x914D;&#x3092;&#x6B63;&#x306E;&#x5024;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5224;&#x65AD;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3079;&#x304D;&#x304B;&#x3069;&#x3046;&#x304B;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x3057;&#x304D;&#x3044;&#x5024;&#x304C;&#x500B;&#x5225;&#x306B;&#x5272;&#x308A;&#x5F53;&#x3066;&#x3089;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x7A2E;&#x3001;&#x30D8;&#x30DE;&#x30B0;&#x30EB;&#x30C1;&#x30CB;&#x30F3; &#x30B5;&#x30D6;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30BB;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8; &#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3067;&#x306E;&#x6B63;&#x3057;&#x3044;&#x8B58;&#x5225;&#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C8;&#x7E41;&#x8302;&#x30A4;&#x30F3;&#x30D5;&#x30EB;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B6; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x7A2E;&#x3001;&#x30B5;&#x30D6;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x3001;&#x30DB;&#x30B9;&#x30C8; &#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30BB;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3057;&#x305F;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6;&#x304B;&#x3089;&#x4F5C;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x80AF;&#x5B9A;&#x7684;&#x306A;&#x306E;&#x307F;&#x3092;&#x8003;&#x616E;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x7E41;&#x8302;&#x30CE;&#x30A4;&#x30E9;&#x30DF;&#x30CB;&#x30C0;&#x30FC;&#x30BC; (NA) &#x30B5;&#x30D6;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7; &#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6;&#x306F;&#x81EA;&#x4FE1;&#x306E; NA &#x306E;&#x30B5;&#x30D6;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x306E;&#x5272;&#x308A;&#x5F53;&#x3066;&#x3092;&#x8A31;&#x53EF;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x306B;&#x306F;&#x4E0D;&#x5341;&#x5206;&#x591A;&#x69D8;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x3002;Polyspecific &#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x80AF;&#x5B9A;&#x7684;&#x306A;&#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x8FBC;&#x3080;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6;&#x8B58;&#x5225;&#x30B9;&#x30AD;&#x30FC;&#x30E0;&#x306B;&#x540C;&#x69D8;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x305F;&#x3002;&#x5168;&#x4F53;&#x7684;&#x306B;&#x307F;&#x3066;&#x3001;&#x7D50;&#x679C;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9; &#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x4EA4;&#x914D;&#x8907;&#x6570;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x691C;&#x51FA;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x5206;&#x5B50;&#x691C;&#x51FA;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9; &#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306E;&#x4EA4;&#x914D;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30A4;&#x30F3;&#x30D5;&#x30EB;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B6; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x8B58;&#x5225;&#x3002;

&#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xAD00;&#xB828; oligonucleotides Microarrays&#xB294; &#xB3D9;&#xC2DC;&#xC5D0; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC; &#xC720;&#xBB34;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC744; &#xAC80;&#xC0AC; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC778;&#xD50C;&#xB8E8;&#xC5D4;&#xC790; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xB294; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC720;&#xC804; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xADF8;&#xB7EC;&#xD55C; microarrays &#xBC0F; &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC131;&#xACFC; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xBCA0;&#xC774;&#xC2A4;&#xC758; &#xAC00;&#xC6A9;&#xC131;&#xC744; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC774;&#xC0C1;&#xC801;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. 476 &#xC778;&#xD50C;&#xB8E8;&#xC5D4;&#xC790; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xAD00;&#xB828; oligonucleotides &#xCEEC;&#xB809;&#xC158; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C;&#xB85C; &#xC720;&#xB9AC; &#xC2AC;&#xB77C;&#xC774;&#xB4DC;&#xC5D0; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; RNAs &#xBCC0;&#xD558;&#xAC8C; &#xD558; &#xACE0;, PCR&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC99D;&#xD3ED; &#xC5ED;&#xBC29;&#xD5A5; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC81C;&#xD488; cyanine &#xC5FC;&#xB8CC;&#xB85C; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xBC0F; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC815;&#xCCB4;&#xC131;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xB294; &#xAD50; &#xC7A1;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xACB0;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4;. Oligonucleotide &#xBA85;&#xC18C;&#xC758; &#xD615;&#xAD11; &#xAC15;&#xB3C4; &#xB192;&#xC740; &#xAC01; &#xC2AC;&#xB77C;&#xC774;&#xB4DC; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC7AC;&#xD604; &#xD558; &#xACE0; &#xB9CC;&#xC871; &#xC2A4;&#xB7FD;&#xAC8C; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xBE44;&#xB840; &#xD588;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; &#xBA85;&#xC18C; &#xC644;&#xC804;&#xD788; &#xBCF4;&#xC644; &#xB300;&#xC0C1; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC758; &#xB18D;&#xB3C4; &#xCC44;&#xB3C4; &#xBC30;&#xACBD;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C;. &#xAE30;&#xBCF8; &#xAD6C;&#xC131;, &#xB274;&#xD074;&#xB808;&#xC624;&#xD2F0;&#xB4DC; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xB610;&#xB294; &#xB0B4;&#xBD80; &#xBCF4;&#xC870; &#xAD6C;&#xC870; &#xBCC0;&#xC774; &#xAD00;&#xB828; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC558;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xAD50; &#xC7A1; &#xC790;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD310;&#xB2E8; &#xD574;&#xC57C; &#xC5EC;&#xBD80;&#xB97C; &#xD655;&#xC778; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD55C; &#xC784;&#xACC4;&#xAC12;&#xC744; &#xAC1C;&#xBCC4;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC9C0;&#xC815; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC778;&#xD50C;&#xB8E8;&#xC5D4;&#xC790; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC885;, &#xD558;&#xC704; &#xD615;&#xC2DD;, &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC6D0;&#xBCF8; &#xB610;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC138;&#xADF8;&#xBA3C;&#xD2B8;,&#xC774; &#xBC29;&#xBC95;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; monospecific &#xC608;&#xC0C1; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD00;&#xAD11; &#xBA85;&#xC18C; &#xB9CC;&#xB4E0; &#xC885;, &#xC870;&#xB958; &#xD558;&#xC704; &#xC720;&#xD615; &#xBC0F; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC138;&#xADF8;&#xBA3C;&#xD2B8; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC62C;&#xBC14;&#xB978; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC778;&#xB9CC; &#xACE0;&#xB824; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Monospecific &#xC751;&#xC9D1; (NA) &#xD558;&#xC704; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; &#xC790;&#xC2E0;&#xAC10; &#xC5C6;&#xC74C; &#xD558;&#xC704; &#xD560;&#xB2F9; &#xC218; &#xC788;&#xB3C4;&#xB85D; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xCDA9;&#xBD84; &#xD588;&#xB2E4;. Polyspecific&#xC5D0;&#xC11C; &#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC778; &#xBA85;&#xC18C; &#xD1B5;&#xD569; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xCCB4;&#xACC4;&#xC5D0; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; &#xBE44;&#xC2B7;&#xD55C; &#xACB0;&#xACFC; &#xC8FC;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C;, &#xACB0;&#xACFC; oligonucleotide microarray&#xC5D0; &#xAE30;&#xCD08;&#xB97C; &#xB454; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xAC80;&#xCD9C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD50; &#xC7A1;&#xC758; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC744; &#xC785;&#xC99D;.

&#xBD84;&#xC790; &#xAC80;&#xCD9C; &#xBC0F; oligonucleotide microarray &#xAD50; &#xC7A1; &#xD558; &#xC5EC; &#xC778;&#xD50C;&#xB8E8;&#xC5D4;&#xC790; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xC758; &#xC2DD;&#xBCC4;.

Microarrays de oligonucle&oacute;tidos espec&iacute;ficos de virus puede proporcionar un m&eacute;todo de detecci&oacute;n de muestras de la presencia o ausencia de una gran variedad de virus al mismo tiempo. Virus de la gripe son ideales para evaluar tales microarrays debido a su gen&eacute;tica y diversidad de anfitri&oacute;n y la disponibilidad de una base de datos extensa de la secuencia. Una colecci&oacute;n de 476 oligonucle&oacute;tidos espec&iacute;ficos virus de la gripe fue descubierta en portaobjetos como sondas. RNAs virales eran inversas transcrito y amplificado por PCR, y los productos fueron etiquetados con tintes de Cianina. La presencia de virus y sus identidades se determinaron mediante hibridaci&oacute;n. Las intensidades de fluorescencia de manchas del oligonucle&oacute;tido fueron altamente reproducible dentro de cada diapositiva y satisfactoriamente proporcional entre experimentos. Sin embargo, las intensidades de puntos de sondeo totalmente complementarias a las secuencias de destino variaron entre fondo y saturaci&oacute;n. Las variaciones no se correlacion&oacute; con la composici&oacute;n de base, secuencia de nucle&oacute;tidos o estructuras secundarias internas. Por lo tanto, los umbrales para determinar si se debe juzgar la hibridaci&oacute;n a un lugar como positivos fueron asignados individualmente. S&oacute;lo considerando puntos de sondas sea monoespec&iacute;ficas para especies del virus de la gripe, subtipo, host fuente o segmento de gen, este m&eacute;todo hacen identificaciones correctas en la especie, subtipo de hemaglutinina y gene segmento niveles positivos. Sondas de subtipo monoespec&iacute;ficas neuraminidasa (NA) eran suficientemente diversas para permitir la asignaci&oacute;n de subtipo NA confianza. Incorporar los puntos positivos de polyspecific sondas en el esquema de identificaci&oacute;n dieron resultados similares. En general, los resultados demuestran el potencial de hibridaci&oacute;n de oligonucle&oacute;tidos basadas en microarray para la detecci&oacute;n de virus m&uacute;ltiples.

Detecci&oacute;n molecular e identificaci&oacute;n del virus de la gripe por hibridaci&oacute;n de oligonucle&oacute;tidos microarray.

&#x4E3A;&#x8BC6;&#x522B;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x673A;&#x5236;&#x7EF4;&#x6301;&#x7684; EBV &#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x4E0A;&#x76AE;&#x764C;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x6D4B;&#x91CF;&#x7684;&#x5B9E;&#x8D28;&#x4E0A;&#x6240;&#x6709;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C; 31 &#x6FC0;&#x5149;&#x6355;&#x83B7;&#x7684;&#x96C6;&#x5408;&#x4E2D;&#x7684;&#x6240;&#x6709;&#x6F5C;&#x5728; EBV &#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x3001; &#x95F4;&#x9F3B;&#x54BD;&#x764C; (&#x5168;&#x56FD;&#x4EBA;&#x5927;) &#x7EC4;&#x7EC7;&#x6837;&#x672C;&#x548C; 10 &#x6B63;&#x5E38;&#x9F3B;&#x54BD;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x3002;&#x5168;&#x7403;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x8C31;&#x663E;&#x7136;&#x6709;&#x522B;&#x4E8E;&#x6B63;&#x5E38;&#x5065;&#x5EB7;&#x4E0A;&#x76AE;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x80BF;&#x7624;&#x3002;(EBNA1&#x3001; EBNA2&#x3001; EBNA3A&#x3001; EBNA3B&#x3001; LMP1 &#x548C; LMP2A&#xFF09; &#x7684;&#x516D;&#x4E2A;&#x75C5;&#x6BD2;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x662F;&#x76F8;&#x4E92;&#x5173;&#x8054;&#x548C;&#x5F3A;&#x70C8;&#x53CD;&#x6BD4;&#x4E0E;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5927;&#x5B50;&#x96C6;&#x7684;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x5176;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x4E0E;&#x589E;&#x52A0; EBV &#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6700;&#x5BC6;&#x5207;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x5F53;&#x4E2D;&#x591A;&#x4E2A; MHC I &#x7C7B; HLA &#x57FA;&#x56E0;&#x53C2;&#x4E0E;&#x8C03;&#x8282;&#x901A;&#x8FC7;&#x6297;&#x539F;&#x63D0;&#x5448;&#x7684;&#x514D;&#x75AB;&#x53CD;&#x5E94;&#x3002;&#x4E00;&#x7C7B; HLA &#x8868;&#x8FBE; EBV &#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x548C;&#x6291;&#x5236;&#x808C;&#x7403;&#x86CB;&#x767D;&#x91CD;&#x94FE;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5173;&#x8054;&#x610F;&#x5473;&#x7740;&#x8981;&#x4E48;&#x76F4;&#x63A5;&#x6291;&#x5236;&#x6297;&#x539F;&#x663E;&#x793A;&#x662F;&#x7531; EBV&#xFF0C;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x80BF;&#x7624;&#x7EC6;&#x80DE;&#x514D;&#x75AB;&#x9003;&#x9038;&#x548C; &#xFF08;&#x6216;&#xFF09; &#x80BF;&#x7624;&#x6291;&#x5236;&#x7684;&#x6F14;&#x793A;&#x6587;&#x7A3F;&#x4E0E;&#x9009;&#x5B9A;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#xFF0C;&#x5176;&#x80FD;&#x591F;&#x7EF4;&#x6301;&#x8F83;&#x9AD8;&#x6C34;&#x5E73;&#x7684; EBV &#x91C7;&#x53D6; EBV &#x764C;&#x57FA;&#x56E0;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x80BF;&#x7624;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x884C;&#x52A8;&#x7684;&#x6700;&#x5927;&#x4F18;&#x52BF;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x6E05;&#x695A;&#x5730;&#x53CD;&#x6620;&#x51FA;&#x8FD9;&#x79CD;&#x80BF;&#x7624;&#x4FC3;&#x8FDB;&#xFF0C;&#x663E;&#x793A;&#x653E;&#x677E;&#x7BA1;&#x5236;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x86CB;&#x767D;&#x53C2;&#x4E0E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x51CB;&#x4EA1; (BCL2 &#x76F8;&#x5173;&#x86CB;&#x767D; A1 &#x548C; Fas &#x51CB;&#x4EA1;&#x6291;&#x5236;&#x5206;&#x5B50;)&#xFF0C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x68C0;&#x67E5;&#x70B9; &#xFF08;AKIP&#xFF0C;SCYL1 &#x548C;&#x4E07;&#x5E74;&#xFF09;&#xFF0C;&#x548C;&#x8F6C;&#x79FB; &#xFF08;&#x57FA;&#x8D28;&#x91D1;&#x5C5E;&#x86CB;&#x767D;&#x9176; 1) &#x5168;&#x56FD;&#x4EBA;&#x5927; EBV &#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x5BC6;&#x5207;&#x76F8;&#x5173;&#x3002;

&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x8868;&#x8FBE;&#x5206;&#x6790;&#x63ED;&#x793A;&#x4E86; EBV &#x76F8;&#x5173;&#x6291;&#x5236;&#x7684; MHC I &#x7C7B;&#x5728;&#x9F3B;&#x54BD;&#x764C;&#x4E2D;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;

To identify the molecular mechanisms by which EBV-associated epithelial cancers are maintained, we measured the expression of essentially all human genes and all latent EBV genes in a collection of 31 laser-captured, microdissected nasopharyngeal carcinoma (NPC) tissue samples and 10 normal nasopharyngeal tissues. Global gene expression profiles clearly distinguished tumors from normal healthy epithelium. Expression levels of six viral genes (EBNA1, EBNA2, EBNA3A, EBNA3B, LMP1, and LMP2A) were correlated among themselves and strongly inversely correlated with the expression of a large subset of host genes. Among the human genes whose inhibition was most strongly correlated with increased EBV gene expression were multiple MHC class I HLA genes involved in regulating immune response via antigen presentation. The association between EBV gene expression and inhibition of MHC class I HLA expression implies that antigen display is either directly inhibited by EBV, facilitating immune evasion by tumor cells, and/or that tumor cells with inhibited presentation are selected for their ability to sustain higher levels of EBV to take maximum advantage of EBV oncogene-mediated tumor-promoting actions. Our data clearly reflect such tumor promotion, showing that deregulation of key proteins involved in apoptosis (BCL2-related protein A1 and Fas apoptotic inhibitory molecule), cell cycle checkpoints (AKIP, SCYL1, and NIN), and metastasis (matrix metalloproteinase 1) is closely correlated with the levels of EBV gene expression in NPC.

Genome-wide expression profiling reveals EBV-associated inhibition of MHC class I expression in nasopharyngeal carcinoma.

D&#39;identifier les m&eacute;canismes mol&eacute;culaires par quels cancers &eacute;pith&eacute;liaux associ&eacute;s &agrave; EBV sont maintenues, nous avons mesur&eacute; l&#39;expression d&#39;essentiellement tous les g&egrave;nes humains et tous les g&egrave;nes d&#39;EBV latents dans une collection de 31 laser-captur&eacute;, &eacute;chantillons de tissus pour le carcinome du nasopharynx (NPC) microdissected et 10 tissus nasopharyng&eacute;s normaux. Profils d&#39;expression g&eacute;nique global distinguent clairement les tumeurs de l&#39;&eacute;pith&eacute;lium normal sain. Niveaux d&#39;expression des six g&egrave;nes virales (EBNA1, EBNA2, EBNA3A, EBNA3B, LMP1 et LMP2A) ont &eacute;t&eacute; corr&eacute;l&eacute;s entre eux et fortement inversement corr&eacute;l&eacute;es avec l&#39;expression d&#39;un large sous-ensemble de g&egrave;nes de l&#39;h&ocirc;te. Parmi les g&egrave;nes humains dont l&#39;inhibition est plus fortement corr&eacute;l&eacute;e avec une expression g&eacute;nique accrue EBV ont &eacute;t&eacute; multiples MHC classe I g&egrave;nes HLA impliqu&eacute; dans la r&eacute;gulation du syst&egrave;me immunitaire par l&#39;interm&eacute;diaire de pr&eacute;sentation de l&#39;antig&egrave;ne. L&#39;association entre l&#39;expression des g&egrave;nes EBV et inhibition du CMH de classe I expression de HLA implique qu&#39;afficher antig&egrave;ne est inhib&eacute;e soit directement par l&#39;EBV, facilitant l&#39;&eacute;vasion immunitaire par les cellules tumorales, et/ou que les cellules tumorales avec pr&eacute;sentation inhib&eacute;e sont s&eacute;lectionn&eacute;s pour leur capacit&eacute; de soutenir des niveaux plus &eacute;lev&eacute;s d&#39;EBV pour profiter au maximum des actions de promotion de la tumeur induite par l&#39;oncog&egrave;ne EBV. Nos r&eacute;sultats refl&egrave;tent clairement telle promotion tumorale, montrant que la d&eacute;r&eacute;glementation des prot&eacute;ines cl&eacute;s impliqu&eacute;s dans l&#39;apoptose (prot&eacute;ine BCL2 A1 et FLB mol&eacute;cule inhibitrice apoptotic), contr&ocirc;le du cycle cellulaire (AKIP, SCYL1 et NIN), et m&eacute;tastase (matrix metalloproteinase 1) est &eacute;troitement corr&eacute;l&eacute; avec les niveaux d&#39;expression de g&egrave;ne EBV dans NPC.

L&#39;expression du g&eacute;nome profilage r&eacute;v&egrave;le associ&eacute;s &agrave; EBV inhibition de MHC classe I expression dans le carcinome du nasopharynx.

Die molekularen Mechanismen von identifizieren welche EBV-assoziierten epithelialen Tumoren sind gepflegt, wir den Ausdruck im Wesentlichen aller menschlichen Gene und alle latent EBV-Gene in einer Auflistung von 31 Laser erfasst, Microdissected Nasopharynxkarzinom (NPC) Gewebeproben und 10 normale Nasen-Rachen-Gewebe gemessen. Global-Gen-Ausdruck-Profile werden Tumoren deutlich vom normalen gesunden Epithel unterschieden. Stufen der sechs virale Gene (EBNA1 EBNA2, EBNA3A, EBNA3B, LMP1 und LMP2A) waren untereinander korreliert und umgekehrt stark korreliert mit dem Ausdruck der eine gro&szlig;e Teilmenge der Host-Gene. Unter den menschlichen Genen, deren Hemmung am st&auml;rksten mit erh&ouml;hten EBV-Genexpression korreliert wurde, wurden mehrere haupthistokompatibilit&auml;tskomplex HLA-Gene regulieren die Immunantwort &uuml;ber Antigen-Pr&auml;sentation beteiligt. Die Zuordnung zwischen EBV-Genexpression und Hemmung der MHC Klasse I HLA Ausdruck impliziert, dass die Antigen-Display entweder direkt durch EBV, Erleichterung immun ausweichen von Tumorzellen, und/oder, dass Tumorzellen mit gehemmter Pr&auml;sentation f&uuml;r ihre F&auml;higkeit, h&ouml;here Ebenen des EBV aufrechtzuerhalten ausgew&auml;hlt sind, maximale EBV Onkogen-vermittelte Tumor-F&ouml;rderung Aktionen nutzen gehemmt wird. Unsere Daten spiegeln deutlich diese Tumor-F&ouml;rderung, zeigen, dass die Deregulierung der wichtigsten Proteine beteiligt Apoptosis (BCL2-related Protein A1 und Fas Apoptotic hemmendes Molek&Atilde;&frac14;l), Zellzyklus Checkpoints (AKIP, SCYL1 und NIN), und Metastasierung (Matrix-Metalloproteasen 1) ist eng korreliert mit dem Niveau des EBV-Genexpression in NPC.

Genomweiten Ausdruck Profilerstellung zeigt EBV-assoziierter Hemmung der MHC Klasse I Ausdruck in Nasopharynxkarzinom.

Per identificare i meccanismi molecolari da cui tumori epiteliali associate all&#39;EBV sono mantenute, abbiamo misurato l&#39;espressione di sostanzialmente tutti i geni umani e di tutti i geni latenti di EBV in una raccolta di 31 laser-catturato, campioni di tessuto microdissected carcinoma nasofaringeo (NPC) e 10 tessuti normali nasofaringei. Profili di espressione genica globale chiaramente distinguono i tumori da normale epitelio sano. I livelli di espressione di geni virali sei (EBNA1, EBNA2, EBNA3A, EBNA3B, LMP1 e LMP2A) sono stati correlati tra loro e fortemente inversamente correlati con l&#39;espressione di un grande sottoinsieme dei geni di host. Tra i geni umani cui inibizione &egrave; stata pi&ugrave; fortemente correlata con aumentata espressione di gene di EBV sono stati pi&ugrave; MHC di classe I geni HLA coinvolto nella regolazione della risposta immunitaria tramite presentazione dell&#39;antigene. L&#39;associazione tra l&#39;espressione di gene EBV e inibizione di MHC di classe I espressione HLA implica che display antigene &egrave; inibito o direttamente da EBV, agevolare l&#39;evasione immune dalle cellule del tumore, o che le cellule tumorali con presentazione inibito sono selezionate per la loro capacit&agrave; di sostenere pi&ugrave; alti livelli di EBV per trarre il massimo vantaggio delle azioni di promozione tumorale mediata del oncogene EBV. I nostri dati riflettono chiaramente tale promozione tumorale, mostrando che la deregolamentazione delle proteine chiave coinvolti nell&#39;apoptosi (proteine correlate a BCL2 A1 e molecola inibitoria apoptotic Fas), Checkpoint del ciclo cellulare (AKIP, SCYL1 e NIN), e metastasi (matrix metalloproteinase 1) sono strettamente correlato con i livelli di espressione di gene di EBV in NPC.

Genome-wide expression profiling rivela associate all&#39;EBV inibizione di MHC di classe I espressione nel carcinoma nasofaringeo.

&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x5206;&#x5B50;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x3069;&#x306E; EBV &#x6E96;&#x306E;&#x4E0A;&#x76AE;&#x764C;&#x7DAD;&#x6301;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x672C;&#x8CEA;&#x7684;&#x306B;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B6;&#x30FC;&#x6355;&#x7372; 31 &#x306E;&#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x5185;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684; EBV &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3001;microdissected &#x9F3B;&#x54BD;&#x982D;&#x764C; (NPC) &#x7D44;&#x7E54;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB; 10 &#x6B63;&#x5E38;&#x9F3B;&#x54BD;&#x982D;&#x7D44;&#x7E54;&#x3092;&#x8A08;&#x6E2C;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x306F;&#x901A;&#x5E38;&#x306E;&#x5065;&#x5EB7;&#x306A;&#x4E0A;&#x76AE;&#x304B;&#x3089;&#x816B;&#x760D;&#x3092;&#x660E;&#x78BA;&#x306B;&#x533A;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;(EBNA1&#x3001;EBNA2&#x3001;EBNA3A&#x3001;EBNA3B&#x3001;LMP1 &#x3068; LMP2A&#xFF09; &#x306E;&#x516D;&#x3064;&#x306E;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x306E;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x81EA;&#x4F53;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x76F8;&#x95A2;&#x3055;&#x308C;&#x5F37;&#x304F;&#x53CD;&#x6BD4;&#x4F8B;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x30B5;&#x30D6;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x5F0F;&#x3068;&#x76F8;&#x95A2;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x8907;&#x6570;&#x306E; MHC &#x30AF;&#x30E9;&#x30B9; I &#x306E; HLA &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x305D;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x6700;&#x3082;&#x5F37;&#x304F;&#x5897;&#x52A0;&#x306E; eb &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3068;&#x76F8;&#x95A2;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x4E2D;&#x306B;&#x3044;&#x305F;&#x30D7;&#x30EC;&#x30BC;&#x30F3;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x6297;&#x539F;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x514D;&#x75AB;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Eb &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3068;&#x6291;&#x5236; MHC &#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9; I &#x306E; HLA &#x5F0F;&#x6297;&#x539F;&#x8868;&#x793A;&#x3069;&#x3061;&#x3089;&#x304B;&#x76F4;&#x63A5;&#x514D;&#x75AB;&#x56DE;&#x907F;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x816B;&#x760D;&#x7D30;&#x80DE;&#x3084;&#x816B;&#x760D;&#x7D30;&#x80DE;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3057;&#x305F;&#x30D7;&#x30EC;&#x30BC;&#x30F3;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F; EBV &#x304C;&#x3093;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x305F;&#x816B;&#x760D;&#x3092;&#x63A8;&#x9032;&#x3059;&#x308B;&#x6D3B;&#x52D5;&#x3092;&#x6700;&#x5927;&#x306B;&#x6D3B;&#x7528;&#x3059;&#x308B; EBV &#x306E;&#x9AD8;&#x3044;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x7DAD;&#x6301;&#x3059;&#x308B;&#x80FD;&#x529B;&#x3067;&#x9078;&#x629E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x4FC3;&#x9032;&#x3059;&#x308B; eb &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6291;&#x5236;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x610F;&#x5473;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x898F;&#x5236;&#x7DE9;&#x548C; (BCL2 &#x95A2;&#x9023;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA; A1 &#x3068; Fas &#x30A2;&#x30DD;&#x30C8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30B9;&#x6291;&#x5236;&#x5206;&#x5B50;) &#x306E;&#x30A2;&#x30DD;&#x30C8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30B9;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x7D30;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x30C1;&#x30A7;&#x30C3;&#x30AF;&#x30DD;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8; (AKIP&#x3001;SCYL1&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30CB;&#x30F3;) &#x3068;&#x8EE2;&#x79FB; (&#x30DE;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x30E1;&#x30BF;&#x30ED;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30A2;&#x30FC;&#x30BC; 1) &#x306F; NPC &#x306E; eb &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3068;&#x5BC6;&#x63A5;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x816B;&#x760D;&#x4FC3;&#x9032;&#x3092;&#x53CD;&#x6620;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Eb &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x95A2;&#x9023;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5E83;&#x3044;&#x8868;&#x73FE;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x963B;&#x5BB3;&#x306E; MHC &#x30AF;&#x30E9;&#x30B9; I &#x4E0A;&#x54BD;&#x982D;&#x764C;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x767A;&#x73FE;&#x3002;

&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBD84;&#xC790; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xB294; EBV &#xC5F0;&#xAD00; &#xB41C; &#xC0C1;&#xD53C; &#xC554; &#xBCF8;&#xC9C8;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC640; 31 &#xB808;&#xC774;&#xC800; &#xC810;&#xB839;&#xC758; &#xCEEC;&#xB809;&#xC158;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC7A0;&#xC7AC; EBV &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;, microdissected nasopharyngeal &#xC554; (NPC) &#xC870;&#xC9C1; &#xC0D8;&#xD50C; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; 10 &#xC815;&#xC0C1; nasopharyngeal &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; &#xCE21;&#xC815; &#xC720;&#xC9C0; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xC9C4; &#xC2DD; &#xD504;&#xB85C;&#xD544;&#xC740; &#xBA85;&#xD655; &#xD558; &#xAC8C; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xAC74;&#xAC15; &#xD55C; &#xC0C1;&#xD53C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC885;&#xC591;&#xC744; &#xAD6C;&#xBCC4;. 6 &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xC720;&#xC804;&#xC790; (EBNA1, EBNA2, EBNA3A, EBNA3B, LMP1, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; LMP2A)&#xC758; &#xC2DD; &#xC218;&#xC900; &#xC790;&#xC2E0; &#xB4E4; &#xC0C1;&#xAD00; &#xB418;&#xC5C8;&#xACE0; &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD070; &#xD558;&#xC704; &#xC9D1;&#xD569; &#xC2DD;&#xC73C;&#xB85C; &#xAC15;&#xB825; &#xD558; &#xAC8C; &#xBC18;&#xBE44;&#xB840; &#xC0C1;&#xAD00;. &#xC5EC;&#xB7EC; MHC &#xD074;&#xB798;&#xC2A4; I HLA &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD588;&#xB2E4; &#xB204;&#xAD6C;&#xC758; &#xC800;&#xD574;&#xB294; EBV &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xC99D;&#xAC00;&#xC640; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4;&#xAC00; &#xAC00;&#xC7A5; &#xAC15;&#xB825; &#xD558; &#xAC8C; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC911;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD56D; &#xC6D0; &#xC81C;&#xC2DC;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xBA74;&#xC5ED; &#xBC18;&#xC751; &#xC870;&#xC808;&#xC5D0; &#xAD00;&#xC5EC; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. EBV &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xBC0F; &#xC5B5;&#xC81C; MHC&#xC758; &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD00; &#xD074;&#xB798;&#xC2A4; I HLA &#xC2DD; &#xD56D; &#xC6D0; &#xD45C;&#xC2DC;&#xB294; EBV, &#xC885;&#xC591; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBA74;&#xC5ED; &#xD68C;&#xD53C; &#xB610;&#xB294; EBV oncogene &#xC911;&#xC7AC; &#xC885;&#xC591; &#xD64D;&#xBCF4; &#xC791;&#xC5C5;&#xC744; &#xCD5C;&#xB300; &#xD65C;&#xC6A9; &#xD558; &#xC885;&#xC591; &#xC138;&#xD3EC; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD504;&#xB808; &#xC820; &#xD14C;&#xC774; &#xC158; EBV&#xC758; &#xB192;&#xC740; &#xC218;&#xC900;&#xC744; &#xC720;&#xC9C0; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xB2A5;&#xB825;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC120;&#xD0DD; &#xC6A9;&#xC774; &#xD558; &#xAC8C; &#xD558; &#xC5EC; &#xC9C1;&#xC811; &#xC800;&#xD574; &#xD558;&#xAC70;&#xB098; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC744; &#xC758;&#xBBF8; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB294; &#xBA85;&#xD655; &#xD558; &#xAC8C; &#xC138;&#xD3EC; &#xC8FC;&#xAE30; &#xAC80;&#xC0AC;&#xC810; (AKIP, SCYL1, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB2CC;), apoptosis (BCL2 &#xAD00;&#xB828; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; a 1&#xC640; Fas apoptotic &#xC5B5;&#xC81C; &#xBD84;&#xC790;)&#xC5D0; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC8FC;&#xC694; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xADDC;&#xC81C; &#xC644;&#xD654; &#xBC0F; &#xC804;&#xC774; (&#xB9E4;&#xD2B8;&#xB9AD;&#xC2A4; metalloproteinase 1) &#xBC00;&#xC811; &#xD558; &#xAC8C; &#xC804;&#xC778;&#xB300;&#xC5D0;&#xC11C; EBV &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xC218;&#xC900;&#xC758; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xB294; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC885;&#xC591; &#xC2B9;&#xC9C4; &#xBC18;&#xC601;.

&#xAC8C;&#xB188; &#xB113;&#xC740; &#xC2DD; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xBC1D;&#xD600; EBV &#xC5F0;&#xAD00; &#xB41C; &#xC5B5;&#xC81C;&#xC758; MHC &#xD074;&#xB798;&#xC2A4; I nasopharyngeal &#xC554; &#xC885;&#xC5D0; &#xC2DD;.

Para identificar los mecanismos moleculares por los que los c&aacute;nceres epiteliales EBV-asociado se mantienen, medimos la expresi&oacute;n de genes humanos esencialmente todas y todos los genes de EBV latentes en una colecci&oacute;n de 31 capturados l&aacute;ser, muestras de tejido microdissected carcinoma nasofar&iacute;ngeo (NPC) y 10 tejidos nasofar&iacute;ngeos normales. Perfiles de expresi&oacute;n g&eacute;nica global claramente distinguen tumores del epitelio sano normal. Los niveles de expresi&oacute;n de genes virales seis (EBNA1, EBNA2, EBNA3A, EBNA3B, LMP1 y LMP2A) fueron correlacionados entre s&iacute; y fuertemente inversamente correlacionados con la expresi&oacute;n de un gran subconjunto de genes de anfitri&oacute;n. Entre los genes humanos cuya inhibici&oacute;n se correlacion&oacute; m&aacute;s fuertemente con la mayor expresi&oacute;n de gene de EBV fueron m&uacute;ltiples MHC de clase I los genes HLA implicados en la regulaci&oacute;n de la respuesta inmune mediante la presentaci&oacute;n del ant&iacute;geno. La asociaci&oacute;n entre la expresi&oacute;n del gene de EBV e inhibici&oacute;n de MHC de clase I expresi&oacute;n HLA implica que pantalla de ant&iacute;geno o se inhibe directamente por EBV, facilitar la evasi&oacute;n inmune por c&eacute;lulas tumorales, o que las c&eacute;lulas del tumor con presentaci&oacute;n inhibido son seleccionadas por su capacidad mantener los niveles m&aacute;s altos de EBV para aprovechar al m&aacute;ximo de tumor-promover acciones de EBV oncog&eacute;n-mediada. Nuestros datos reflejan claramente tal promoci&oacute;n tumoral, demostrando que la desregulaci&oacute;n de las prote&iacute;nas claves implicadas en la apoptosis (prote&iacute;na relacionada con BCL2 A1 y mol&eacute;cula inhibidora de apoptosis Fas), puestos de control de ciclo celular (AKIP, SCYL1 y NIN), y met&aacute;stasis (1 de la metaloproteinasa de la matriz) se correlaciona estrechamente con los niveles de la expresi&oacute;n g&eacute;nica de EBV en NPC.

Expresi&oacute;n del genoma perfilado revela EBV-asociado inhibici&oacute;n de MHC de clase I expresi&oacute;n en el carcinoma nasofar&iacute;ngeo.

&#x4E9A;&#x785D;&#x80FA;&#x4EE3;&#x8C22;&#x3001; DNA &#x4FEE;&#x590D;&#x3001; &#x514D;&#x75AB;&#x53CD;&#x5E94;&#x57FA;&#x56E0;&#x591A;&#x6001;&#x6027;&#x5DF2;&#x4E0E;&#x9F3B;&#x54BD;&#x764C; (&#x5168;&#x56FD;&#x4EBA;&#x5927;) &#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E;&#x53C2;&#x4E0E;&#x5168;&#x56FD;&#x4EBA;&#x5927;&#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x533A;&#x57DF;&#x3002;&#x4E3A;&#x9610;&#x660E;&#x4EBA;&#x5927;&#x75C5;&#x56E0;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FDB;&#x884C;&#x8BC4;&#x4F30; 31 &#x4EBA;&#x5927;&#x548C;&#x4F7F;&#x7528;&#x597D;&#x5F97;&#x591A;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; U133 &#x52A0;&#x4E0A; 2.0 &#x6570;&#x7EC4; 10 &#x6B63;&#x5E38;&#x9F3B;&#x54BD;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x6807;&#x672C;&#x4E2D;&#x7684;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6A21;&#x5F0F;&#x3002;&#x4E8B;&#x5148;&#x6211;&#x4EEC;&#x4E13;&#x6CE8;&#x4E8E;&#x5728;&#x4E94;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x901A;&#x8DEF;&#x548C;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x3002;&#x5185;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x7387;&#x9884;&#x5148;&#x5217;&#x8868;&#x548C;&#x6574;&#x4F53;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x4E86;&#x4F7F;&#x7528;&#x7684;&#x5F15;&#x5BFC;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x6574;&#x4F53;&#x7684; 7.6%&#x7684;&#x63A2;&#x9488;&#x96C6;&#x5F55;&#x3002;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x6D77;&#x62D4;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x7387;&#x5185; DNA &#x4FEE;&#x590D; (13.7%&#xFF1B;P = 0.01&#xFF09; &#x548C;&#x4E9A;&#x785D;&#x80FA;&#x4EE3;&#x8C22; (17.5%&#xFF1B;P = 0.04) &#x9014;&#x5F84;&#x3002;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x63A2;&#x5934;&#x8BBE;&#x7F6E;&#x5185; DNA &#x4FEE;&#x590D;&#x9014;&#x5F84;&#x662F;&#x4E00;&#x8D2F;&#x5916;&#x6E90; &#xFF08;93%&#xFF09;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684; PRKDC&#x3001; &#x589E;&#x6B96;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6838;&#x6297;&#x539F;&#x548C; CHEK1 &#x7684;&#x5F3A;&#x70C8;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x63A2;&#x5934;&#x8BBE;&#x7F6E;&#x5185;&#x4E9A;&#x785D;&#x80FA;&#x4EE3;&#x8C22;&#x901A;&#x8DEF;&#x662F;&#x4E00;&#x8D2F; underexpressed &#xFF08;100%&#xFF09;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684; NQ01&#x3001; CYP2B6 &#x548C; CYP2E1 &#x7684;&#x5F3A;&#x70C8;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x589E;&#x52A0;&#x7387;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x6CA1;&#x6709;&#x660E;&#x663E;&#x8BC1;&#x636E;&#x663E;&#x793A;&#x662F;&#x770B;&#x5230;&#x5185;&#x514D;&#x75AB;/&#x708E;&#x75C7;&#x9014;&#x5F84;&#x3002;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x7387;&#x663E;&#x8457;&#x62AC;&#x9AD8;&#x6307;&#x51FA;&#x4E3A;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 4p15.1-4q12 (13.0%&#xFF1B;P = 0.04&#xFF09; &#xFF1B;&#x9AD8;&#x6548;&#x8868;&#x8FBE;&#x548C; underexpression &#x90FD;&#x662F;&#x660E;&#x663E; (38%&#x548C; 62%&#xFF0C;&#x5206;&#x522B;)&#x3002;&#x63D0;&#x5347;&#x7387;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x5BF9;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 14q32 &#x6307;&#x51FA; &#xFF08;11.3%&#xFF1B;P = 0.06) &#x4E0E;&#x4E00;&#x8D2F;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0; underexpression &#xFF08;100%&#xFF1B;P &lt; 0.0001)&#x3002;&#x665A;&#x671F;&#x80BF;&#x7624;&#x4E2D;&#x6392;&#x9664;&#x65F6;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5F71;&#x54CD;&#x662F;&#x76F8;&#x4F3C;&#x7684;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x4E9A;&#x785D;&#x80FA;&#x6D3B;&#x5316;&#x548C; DNA &#x4FEE;&#x590D;&#x91CD;&#x8981;&#x5728;&#x5168;&#x56FD;&#x4EBA;&#x6C11;&#x4EE3;&#x8868;&#x5927;&#x4F1A;&#x3002;&#x8868;&#x8FBE;&#x5BF9;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 14q32 &#x4E00;&#x81F4;&#x4E0B;&#x8C03;&#x8868;&#x660E;&#x8FD9;&#x4E00;&#x5730;&#x533A;&#x7684;&#x6742;&#x5408;&#x4E22;&#x5931;&#x3002;

&#x57FA;&#x56E0;&#x53C2;&#x4E0E; DNA &#x4FEE;&#x590D;&#x548C;&#x4E9A;&#x785D;&#x80FA;&#x4EE3;&#x8C22;&#x548C;&#x90A3;&#x4E9B;&#x4F4D;&#x4E8E;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 14q32 &#x662F;&#x6C34;&#x5E73;&#x53CA;&#x9F3B;&#x54BD;&#x764C;&#x3002;

Polymorphisms in nitrosamine metabolism, DNA repair, and immune response genes have been associated with nasopharyngeal carcinoma (NPC). Studies have suggested chromosomal regions involved in NPC. To shed light on NPC etiology, we evaluated host gene expression patterns in 31 NPC and 10 normal nasopharyngeal tissue specimens using the Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array. We focused on genes in five a priori biological pathways and chromosomal locations. Rates of differential expression within these prespecified lists and overall were tested using a bootstrap method. Differential expression was observed for 7.6% of probe sets overall. Elevations in rate of differential expression were observed within the DNA repair (13.7%; P = 0.01) and nitrosamine metabolism (17.5%; P = 0.04) pathways. Differentially expressed probe sets within the DNA repair pathway were consistently overexpressed (93%), with strong effects observed for PRKDC, PCNA, and CHEK1. Differentially expressed probe sets within the nitrosamine metabolism pathway were consistently underexpressed (100%), with strong effects observed for NQ01, CYP2B6, and CYP2E1. No significant evidence of increases in rate of differential expression was seen within the immune/inflammatory pathway. A significant elevation in rate of differential expression was noted for chromosome 4p15.1-4q12 (13.0%; P = 0.04); both overexpression and underexpression were evident (38% and 62%, respectively). An elevation in the rate of differential expression on chromosome 14q32 was observed (11.3%; P = 0.06) with a consistent pattern of gene underexpression (100%; P < 0.0001). These effects were similar when excluding late-stage tumors. Our results suggest that nitrosamine activation and DNA repair are important in NPC. The consistent down-regulation of expression on chromosome 14q32 suggests loss of heterozygosity in this region.

Genes involved in DNA repair and nitrosamine metabolism and those located on chromosome 14q32 are dysregulated in nasopharyngeal carcinoma.

Polymorphismes dans le m&eacute;tabolisme de nitrosamine, r&eacute;paration de l&#39;ADN et les g&egrave;nes de r&eacute;ponse immunitaire ont &eacute;t&eacute; associ&eacute;s &agrave; carcinome du nasopharynx (NPC). Des &eacute;tudes ont sugg&eacute;r&eacute; des r&eacute;gions chromosomiques impliqu&eacute;es dans le NPC. Pour faire la lumi&egrave;re sur l&#39;&eacute;tiologie de la PNC, nous avons &eacute;valu&eacute; les profils d&#39;expression g&eacute;nique h&ocirc;te &agrave; NPC 31 10 &eacute;chantillons de tissu nasopharyng&eacute; normal utilisant le Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 tableau. Nous nous sommes concentr&eacute;s sur les g&egrave;nes dans cinq a priori voies biologiques et localisation chromosomique. Taux d&#39;expression diff&eacute;rentielle dans ces pr&eacute;d&eacute;termin&eacute;e des listes et dans l&#39;ensemble ont &eacute;t&eacute; test&eacute;s &agrave; l&#39;aide d&#39;une m&eacute;thode de bootstrap. Expression diff&eacute;rentielle a &eacute;t&eacute; observ&eacute;e dans l&#39;ensemble 7,6 % des ensembles de sonde. &Eacute;l&eacute;vations des cours d&#39;expression diff&eacute;rentielle ont &eacute;t&eacute; observ&eacute;es dans la r&eacute;paration de l&#39;ADN (13,7 % ; P = 0,01) et le m&eacute;tabolisme de nitrosamine (17,5 % ; P = 0,04) voies. Sonde diff&eacute;rentiellement exprim&eacute; d&eacute;finit dans la voie de r&eacute;paration de l&#39;ADN ont &eacute;t&eacute; syst&eacute;matiquement surexprim&eacute;e (93 %), avec forts effets observ&eacute;s pour PRKDC, PCNA et CHEK1. Sonde diff&eacute;rentiellement exprim&eacute; d&eacute;finit dans la voie du m&eacute;tabolisme nitrosamine &eacute;taient constamment underexpressed (100 %), avec forts effets observ&eacute;s pour CYP2E1, CYP2B6 et NQ01. Aucune preuve significative de l&#39;augmentation des taux d&#39;expression diff&eacute;rentielle a &eacute;t&eacute; observ&eacute;e dans la voie immunitaires et inflammatoires. Une &eacute;l&eacute;vation significative des cours d&#39;expression diff&eacute;rentielle a &eacute;t&eacute; not&eacute;e pour le chromosome 4p15.1-4q12 (13,0 % ; P = 0,04) ; tant la surexpression et underexpression &eacute;taient &eacute;vidents (38 % et 62 %, respectivement). Une &eacute;l&eacute;vation du taux d&#39;expression diff&eacute;rentielle sur le chromosome 14 q 32 a &eacute;t&eacute; observ&eacute;e (11,3 % ; P = 0,06) avec un mod&egrave;le coh&eacute;rent d&#39;underexpression g&egrave;ne (100 % ; P &lt; 0,0001). Ces effets sont similaires lorsque, &agrave; l&#39;exclusion des tumeurs de stade avanc&eacute;. Nos r&eacute;sultats sugg&egrave;rent que l&#39;activation de la nitrosamine et r&eacute;paration de l&#39;ADN sont importants dans NPC. La r&eacute;gulation &agrave; la baisse uniforme d&#39;expression sur le chromosome 14 q 32 sugg&egrave;re perte d&#39;h&eacute;t&eacute;rozygotie dans cette r&eacute;gion.

Les g&egrave;nes impliqu&eacute;s dans la r&eacute;paration de l&#39;ADN et le m&eacute;tabolisme de nitrosamine et ceux situ&eacute;s sur le chromosome 14 q 32 sont dysr&eacute;gulation dans le carcinome du nasopharynx.

Polymorphismen in Nitrosamin-Stoffwechsel, DNA-Reparatur und Immunantwort Gene wurden Nasopharynxkarzinom (NPC) zugeordnet. Studien haben vorgeschlagen, dass chromosomale Regionen NPC beteiligt. Um Aufschluss &uuml;ber die &Auml;tiologie der NPC, werteten wir Host Genausdruck Muster in 31 NPC und 10 normale Nasen-Rachen-Gewebeproben mit dem Affymetrix menschlichen Genom U133 Plus 2.0 Array. Vornherein konzentrierten wir uns auf Gene in f&uuml;nf biologischen Bahnen und chromosomale Standorte. Differentielle Ausdruck innerhalb dieser Listen Men&uuml;befehls und insgesamt wurden getestet mit einer bootstrap Methode. Differentielle Ausdruck wurde insgesamt 7,6 % der Sonde Sets beobachtet. Erhebungen im Bereich der differenziellen Ausdruck wurden beobachtet innerhalb der DNA-Reparatur (13,7 %; P = 0,01) und Nitrosamin-Stoffwechsel (17,5 %; P = 0.04) Wege. Differentiell exprimierten Sonde legt innerhalb der DNA-Reparatur-Weg konsequent &uuml;berexprimiert (93 %), wurden mit starken Effekte f&uuml;r PRKDC, PCNA und CHEK1 beobachtet. Differentiell exprimierten Sonde setzt innerhalb der Nitrosamin-Stoffwechsel-Weg konsequent underexpressed (100 %), wurden mit starken Effekten f&uuml;r NQ01, CYP2B6 und CYP2E1 beobachtet. Keine deutlichen Anzeichen Erh&ouml;hungen der differenziellen Ausdruck wurde innerhalb der immunen/entz&uuml;ndliche Weg gesehen. Eine bedeutende Erhebung im Rate der differenziellen Ausdruck f&uuml;r Chromosom 4p15.1-4q12 (13,0 %; erw&auml;hnt P = 0.04); sowohl die Underexpression als auch die &Uuml;berexpression waren offensichtlich (38 % und 62 %, beziehungsweise). H&ouml;he der Rate der differenziellen Ausdruck auf Chromosom 14q32 beobachtet wurde (11,3 %; P = 0,06) mit einem einheitlichen Muster von Gen-Underexpression (100 %; P &lt; 0,0001). Diese Effekte waren &auml;hnlich, beim Sp&auml;tstadium Tumoren ausschlie&szlig;en. Unsere Ergebnisse legen nahe, dass Nitrosamin-Aktivierung und DNA-Reparatur in NPC wichtig sind. Die konsequente Herunterregulation des Ausdrucks auf Chromosom 14q32 schl&auml;gt Verlust der Heterozygotie in dieser Region.

Gene in die DNA-Reparatur beteiligt und Nitrosamin-Stoffwechsel und befindet sich auf Chromosom 14q32 sind defekten in Nasopharynxkarzinom.

Polimorfismi nel metabolismo nitrosamina, riparazione del DNA e geni di risposta immunitaria sono stati associati con carcinoma nasofaringeo (NPC). Studi hanno suggerito che regioni cromosomiche coinvolte in NPC. Per fare luce sull&#39;eziologia NPC, abbiamo valutato host gene expression patterns in 31 NPC e 10 campioni di tessuto rinofaringeo normale utilizzo Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 matrice. Ci siamo concentrati sui geni in cinque a priori percorsi biologici e le posizioni cromosomiche. Tariffe di espressione differenziale all&#39;interno di questi specificata liste e nel complesso sono stati testati utilizzando un metodo bootstrap. Espressione differenziale &egrave; stata osservata per il 7,6% dei set di sonda in generale. Sono stati osservati aumenti nel prezzo dell&#39;espressione differenziale all&#39;interno della riparazione del DNA (13,7%; P = 0.01) e metabolismo nitrosamina (17,5%; P = 0,04) percorsi. Sonda differenzialmente espresso imposta all&#39;interno del percorso di riparazione del DNA sono stati costantemente overexpressed (93%), con forti effetti osservati per PRKDC, PCNA e CHEK1. Sonda differenzialmente espresso imposta all&#39;interno del percorso del metabolismo nitrosamina erano costantemente underexpressed (100%), con forti effetti osservati per NQ01, CYP2B6 e CYP2E1. Nessuna prova significativa dell&#39;aumento nel tasso di espressione differenziale &egrave; stato visto all&#39;interno del percorso immunitario/infiammatorio. Un&#39;elevazione significativa nel tasso di espressione differenziale &egrave; stata notata per cromosoma 4p15.1-4q12 (13,0%; P = 0,04); sia sovraespressione e underexpression erano evidenti (38% e il 62%, rispettivamente). Un&#39;elevazione del tasso di espressione differenziale sul cromosoma 14q32 &egrave; stata osservata (11,3%; P = 0,06) con un modello coerenza di underexpression gene (100%; P &lt; 0.0001). Questi effetti erano simili, se si escludono i tumori di stadio avanzato. I nostri risultati suggeriscono che l&#39;attivazione nitrosamina e riparazione del DNA sono importanti in NPC. La coerente down-regulation dell&#39;espressione sul cromosoma 14q32 suggerisce perdita di eterozigosi in questa regione.

Geni coinvolti nella riparazione del DNA e metabolismo nitrosamina e quelli situati sul cromosoma 14q32 sono in carcinoma nasofaringeo.

&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x30BD;&#x30A2;&#x30DF;&#x30F3;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x3001;DNA &#x4FEE;&#x5FA9;&#x3068;&#x514D;&#x75AB;&#x5FDC;&#x7B54;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x591A;&#x578B;&#x306F;&#x4E0A;&#x54BD;&#x982D;&#x764C; &#xFF08;NPC&#xFF09; &#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x9818;&#x57DF; NPC &#x306E;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;NPC &#x306E;&#x75C5;&#x56E0;&#x3092;&#x89E3;&#x660E;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;31 &#x306E; NPC &#x3068;&#x3001;&#x30A2;&#x30D5;&#x30A3;&#x30E1;&#x30C8;&#x30EA;&#x30AF;&#x30B9;&#x4EBA;&#x9593;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0; U133 &#x30D7;&#x30E9;&#x30B9; 2.0 &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F; 10 &#x306E;&#x9F3B;&#x54BD;&#x982D;&#x306E;&#x6B63;&#x5E38;&#x7D44;&#x7E54;&#x6A19;&#x672C;&#x306E;&#x30DB;&#x30B9;&#x30C8;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50; 5 &#x306E;&#x5148;&#x9A13;&#x7684;&#x306B;&#x7126;&#x70B9;&#x3092;&#x5F53;&#x3066;&#x3066;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3068;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x306E;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x3002;&#x5DEE;&#x52D5;&#x5F0F;&#x5185;&#x3067;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30EC;&#x30FC;&#x30C8; &#x30EA;&#x30B9;&#x30C8;&#x4E8B;&#x524D;&#x306B;&#x5B9A;&#x3081;&#x3001;&#x5168;&#x4F53;&#x7684;&#x306B;&#x30D6;&#x30FC;&#x30C8;&#x30B9; &#x30C8;&#x30E9;&#x30C3;&#x30D7;&#x6CD5;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5DEE;&#x52D5;&#x5F0F;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6; &#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E; 7.6% &#x3092;&#x5168;&#x4F53;&#x7684;&#x306B;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6A19;&#x9AD8;&#x5DEE;&#x52D5;&#x5F0F;&#x306E;&#x7387;&#x3067;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5185; DNA &#x4FEE;&#x5FA9; (13.7%;P = 0.01&#xFF09; &#x3068;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x30BD;&#x30A2;&#x30DF;&#x30F3;&#x4EE3;&#x8B1D; (17.5%;P = 0.04) &#x7D4C;&#x8DEF;&#x3002;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6; DNA &#x4FEE;&#x5FA9;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x5185;&#x3067;&#x4E00;&#x8CAB;&#x3057;&#x3066;&#x30D2;&#x30C8;&#x30A2;&#x30F3;&#x30AE;&#x30AA;&#x30C6;&#x30F3;&#x30B7;&#x30CE;&#x30FC;&#x30B2;&#x30F3;&#x3092;&#x904E;&#x5270;&#x767A;&#x73FE; &#xFF08;93 &#xFF05;&#xFF09; &#x3092; PRKDC&#x3001;PCNA&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073; CHEK1 &#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5F37;&#x3044;&#x52B9;&#x679C;&#x8A2D;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6; &#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x30BD;&#x30A2;&#x30DF;&#x30F3;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x5185;&#x3067;&#x4E00;&#x8CAB;&#x3057;&#x3066; underexpressed &#xFF08;100 &#xFF05;&#xFF09; &#x3092; NQ01&#x3001;CYP2B6&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073; CYP2E1 &#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5F37;&#x3044;&#x52B9;&#x679C;&#x8A2D;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x514D;&#x75AB; &#xFF0F; &#x708E;&#x75C7;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x5185;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x7387;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x8A3C;&#x62E0;&#x306F;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;.&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 4p15.1-4q12 &#xFF08;13.0 &#xFF05;; &#x5DEE;&#x52D5;&#x5F0F;&#x306E;&#x7387;&#x3067;&#x6709;&#x610F;&#x306A;&#x4E0A;&#x6607;&#x304C;&#x8A8D;&#x3081;&#x3089;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;P = 0.04);&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x904E;&#x5270;&#x767A;&#x73FE;&#x3068; underexpression &#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F; (38%, 62%&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;)&#x3002;(11.3%; &#x5DEE;&#x52D5;&#x5F0F;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 14q32 &#x4E0A;&#x306E;&#x7387;&#x306E;&#x4E0A;&#x6607;&#x304C;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;P = 0.06) &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50; underexpression (100%; &#x306E;&#x4E00;&#x8CAB;&#x6027;&#x306E;&#x3042;&#x308B;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x3092;&#x6301;&#x3064;P &lt; 0.0001&#xFF09;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x5F8C;&#x671F;&#x6BB5;&#x968E;&#x306E;&#x816B;&#x760D;&#x3092;&#x9664;&#x5916;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x304D;&#x306B;&#x4F3C;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x30BD;&#x30A2;&#x30DF;&#x30F3;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3068; DNA &#x4FEE;&#x5FA9;&#x304C; NPC &#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x5506;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 14q32 &#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x4E00;&#x8CAB;&#x3057;&#x305F;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3;&#x5236;&#x5FA1;&#x306F;&#x3053;&#x306E;&#x5730;&#x57DF;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30D8;&#x30C6;&#x30ED;&#x63A5;&#x5408;&#x6027;&#x306E;&#x640D;&#x5931;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50; DNA &#x4FEE;&#x5FA9;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x30BD;&#x30A2;&#x30DF;&#x30F3;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x3068;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 14q32 &#x4E0A;&#x306B;&#x3042;&#x308B;&#x3082;&#x306E;&#x6765;&#x3059;&#x9F3B;&#x54BD;&#x982D;&#x764C;&#x306E;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

Nitrosamine &#xBB3C;&#xC9C8; &#xB300;&#xC0AC;, DNA &#xBCF5;&#xAD6C; &#xBC0F; &#xBA74;&#xC5ED; &#xBC18;&#xC751; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; polymorphisms nasopharyngeal &#xC554; (NPC)&#xC640; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB41C;. &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC601;&#xC5ED; NPC&#xC5D0; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC81C;&#xC548; &#xD588;&#xB2E4;. NPC &#xBCD1; &#xC778;&#xC5D0; &#xBE5B;&#xC744; &#xBC1C;&#xC0B0; &#xD558; &#xAC8C; 31 NPC&#xC640; 10 &#xC815;&#xC0C1; nasopharyngeal &#xC870;&#xC9C1; &#xD45C;&#xBCF8; Affymetrix &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188; U133 &#xD50C;&#xB7EC;&#xC2A4; 2.0 &#xBC30;&#xC5F4;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xD638;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC9C4; &#xC2DD; &#xD328;&#xD134; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC120;&#xD5D8;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; 5 &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xC9D1;&#xC911; &#xC0DD;&#xBB3C;&#xD559; &#xD1B5;&#xB85C; &#xBC0F; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC704;&#xCE58;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD;&#xC758; &#xC694;&#xAE08; &#xBAA9;&#xB85D; prespecified &#xBC0F; &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xBD80;&#xD2B8;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB7A9; &#xBA54;&#xC11C;&#xB4DC;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB97C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; &#xC138;&#xD2B8;&#xC758; 7.6%&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xAD00;&#xCC30; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD;&#xC758; &#xACE0;&#xB3C4; &#xAD00;&#xCC30; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC558;&#xB2E4; &#xB0B4; DNA &#xC218;&#xB9AC; (13.7%; P = 0.01) nitrosamine &#xB300;&#xC0AC; (17.5%; P = 0.04) &#xACBD;&#xB85C;. &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xCC28;&#xB3D9; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; &#xC124;&#xC815; DNA &#xBCF5;&#xAD6C; &#xD1B5;&#xB85C; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC77C;&#xAD00; &#xB418; &#xAC8C; overexpressed (93%), PRKDC, PCNA, &#xBC0F; chek1&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD00;&#xCC30; &#xD558;&#xB294; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xD6A8;&#xACFC;. &#xCC28;&#xB3D9; &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; &#xC124;&#xC815; nitrosamine &#xBB3C;&#xC9C8; &#xB300;&#xC0AC; &#xD1B5;&#xB85C; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC9C0;&#xC18D;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; underexpressed (100%), NQ01, CYP2B6, &#xBC0F; CYP2E1 &#xAD00;&#xCC30; &#xD558;&#xB294; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xD6A8;&#xACFC;. &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD; &#xC728;&#xC758; &#xC99D;&#xAC00;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC99D;&#xAC70;&#xAC00; &#xBA74;&#xC5ED;/&#xC5FC;&#xC99D; &#xC131; &#xD1B5;&#xB85C; &#xB0B4; &#xBCF4;&#xC600;&#xB2E4;. &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD;&#xC758; &#xC18D;&#xB3C4;&#xC5D0; &#xC0C1;&#xB2F9;&#xD55C; &#xC0C1;&#xC2B9; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 4p15.1 4q12 (13.0%;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC9C0;&#xC801; &#xD588;&#xB2E4; P = 0.04); overexpression&#xC640; underexpression &#xB458; &#xB2E4; &#xBD84;&#xBA85; &#xD588;&#xB2E4; (38%&#xC640; 62%, &#xAC01;&#xAC01;). &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 14q32&#xC5D0; &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD;&#xC758; &#xC18D;&#xB3C4; &#xC0C1;&#xC2B9; (11.3%; &#xAD00;&#xCC30; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4; P = 0.06) &#xC720;&#xC804;&#xC790; underexpression (100%;&#xC758; &#xC77C;&#xAD00; &#xB41C; &#xD328;&#xD134;&#xC73C;&#xB85C; P &lt; 0.0001). &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD6A8;&#xACFC; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC758; &#xC885;&#xC591;&#xC744; &#xC81C;&#xC678; &#xD558;&#xBA74; &#xC720;&#xC0AC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; nitrosamine &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xBC0F; DNA &#xC218;&#xB9AC; NPC&#xC5D0;&#xC11C; &#xC911;&#xC694; &#xD558;&#xB2E4;&#xB294; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 14q32&#xC5D0; &#xC2DD;&#xC758; &#xC77C;&#xAD00; &#xB41C; &#xB2E4;&#xC6B4; &#xADDC;&#xC81C; &#xC81C;&#xC548; heterozygosity&#xC774;&#xC774; &#xC9C0;&#xC5ED;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xC190;&#xC2E4;.

&#xC720;&#xC804;&#xC790; DNA &#xC218;&#xB9AC; &#xBC0F; nitrosamine &#xC2E0;&#xC9C4; &#xB300;&#xC0AC;&#xC640; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 14q32&#xC5D0; &#xC704;&#xCE58;&#xD55C; dysregulated nasopharyngeal &#xC554; &#xC885;&#xC5D0;&#xB294;.

Polimorfismos en el metabolismo de nitrosamina, reparaci&oacute;n del ADN y los genes de respuesta inmune se han asociado con el carcinoma nasofar&iacute;ngeo (NPC). Los estudios han sugerido que las regiones cromos&oacute;micas implicadas en NPC. Para arrojar luz sobre la etiolog&iacute;a de la APN, se evaluaron los patrones de expresi&oacute;n g&eacute;nica anfitri&oacute;n en NPC 31 y 10 muestras de tejido nasofar&iacute;ngea normal utilizando la Affymetrix humano genoma U133 Plus 2.0 matriz. Nos centramos en genes en cinco a priori v&iacute;as biol&oacute;gicas y localizaciones cromos&oacute;micas. Tarifas de expresi&oacute;n diferencial dentro de estos preespecificaron listas y en general fueron analizadas usando un m&eacute;todo bootstrap. Expresi&oacute;n diferencial se observ&oacute; 7.6% de sonda conjuntos en general. Se observaron elevaciones de tasa de expresi&oacute;n diferencial en la reparaci&oacute;n de ADN (13,7%; P = 0,01) y el metabolismo de nitrosamina (17,5%; P = 0,04) v&iacute;as. Sonda expresado diferencialmente establece dentro de la v&iacute;a de reparaci&oacute;n del ADN fueron constantemente sobreexpresado (93%), con fuertes efectos observados para PRKDC, PCNA y CHEK1. Sonda expresado diferencialmente establece dentro de la v&iacute;a de metabolismo de nitrosamina fueron constantemente underexpressed (100%), con fuertes efectos observados para NQ01 y CYP2B6 CYP2E1. Evidencia significativa de aumentos en la tasa de expresi&oacute;n diferencial fue considerada dentro de la v&iacute;a inmune inflamatorio. Se observ&oacute; una elevaci&oacute;n significativa en la tasa de expresi&oacute;n diferencial de cromosoma 4p15.1-4q12 (13.0%; P = 0,04); sobreexpresi&oacute;n y la subexpresi&oacute;n eran evidentes (38% y 62%, respectivamente). Se observ&oacute; una elevaci&oacute;n en la tasa de expresi&oacute;n diferencial en cromosoma 14q32 (11,3%; P = 0,06) con un patr&oacute;n constante de subexpresi&oacute;n de gene (100%; P &lt; 0.0001). Estos efectos fueron similares cuando excluyendo tumores en estadios finales. Nuestros resultados sugieren que la activaci&oacute;n de nitrosamina y reparaci&oacute;n del ADN son importantes en NPC. La constante abajo-regulaci&oacute;n de la expresi&oacute;n en 14q32 cromosoma sugiere p&eacute;rdida de heterocigosidad en esta regi&oacute;n.

Genes implicados en la reparaci&oacute;n del ADN y el metabolismo de nitrosamina y los situados en el cromosoma 14q32 son dysregulated en el carcinoma nasofar&iacute;ngeo.

&#x4EBA;&#x7C7B;&#x4E73;&#x5934;&#x72B6;&#x7624;&#x75C5;&#x6BD2; (HPV) &#x662F;&#x4E0E;&#x51E0;&#x4E4E;&#x6240;&#x6709;&#x5BAB;&#x9888;&#x764C;&#xFF0C;20%&#x81F3; 30%&#x7684;&#x5934;&#x90E8;&#x548C;&#x9888;&#x90E8;&#x764C;&#x75C7; (HNC) &#x548C;&#x5176;&#x4ED6;&#x764C;&#x75C7;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;HNCs &#x4E5F;&#x51FA;&#x73B0;&#x5728;&#x4EBA;&#x4E73;&#x5934;&#x7624;&#x75C5;&#x6BD2;&#x9634;&#x6027;&#x60A3;&#x8005;&#xFF0C;&#x56E0;&#x4E3A;&#x8FD9;&#x79CD;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684;&#x764C;&#x75C7;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x72EC;&#x7279;&#x7684;&#x673A;&#x4F1A;&#xFF0C;&#x6765;&#x5B9A;&#x4E49;&#x800C;&#x4E0D;&#x662F;&#x5728;&#x540C;&#x4E00;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x4E2D;&#x4EA7;&#x751F;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x4E73;&#x5934;&#x7624;&#x75C5;&#x6BD2;&#x9634;&#x6027;&#x764C;&#x75C7;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x4E73;&#x5934;&#x7624;&#x75C5;&#x6BD2;&#x9633;&#x6027;&#x7684;&#x5F02;&#x540C;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5C06;&#x4ECB;&#x7ECD; 84 HNCs&#x3001; &#x5BAB;&#x9888;&#x764C;&#x548C;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x91C7;&#x7528;&#x6FC0;&#x5149;&#x6355;&#x83B7;&#x663E;&#x5FAE;&#x5207;&#x5272;&#x6280;&#x672F;&#xFF0C;&#x4E30;&#x5BCC;&#x7684;&#x6837;&#x54C1;&#x6E90;&#x6027;&#x80BF;&#x7624;&#x4E0E;&#x6B63;&#x5E38;&#x7684;&#x4E0A;&#x76AE;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x7AD9;&#x70B9;&#x5339;&#x914D;&#x6B63;&#x5E38;&#x4E0A;&#x76AE;&#x6837;&#x672C;&#x7684;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x8868;&#x8FBE;&#x8C31;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x5206;&#x6790;&#x63ED;&#x793A; HPV(+) HNCs &#x548C;&#x5BAB;&#x9888;&#x764C;&#x5728;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6A21;&#x5F0F;&#x4E0D;&#x540C;&#xFF0C;&#x4F46;&#x5171;&#x4EAB;&#x4E0E; HPV(-) HNCs &#x76F8;&#x6BD4;&#x5F88;&#x591A;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5171;&#x4EAB;&#x66F4;&#x6539;&#x7684;&#x4E00;&#x4E9B;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x90A3;&#x6837;&#xFF0C;&#x4F46;&#x662F;&#x8BB8;&#x591A;&#x5176;&#x4ED6;&#x56FD;&#x5BB6;&#x90FD;&#x6CA1;&#x6709;&#x3002;&#x503C;&#x5F97;&#x6CE8;&#x610F;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;HPV(+) HNCs &#x548C;&#x5BAB;&#x9888;&#x764C;&#x88AB;&#x53D1;&#x73B0;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x7684;&#x5B50;&#x96C6;&#x4E0D;&#x540C;&#x548C;&#x8F83;&#x5927;&#x7684;&#x6BD4;&#x5728; HPV(-) HNC &#x4E2D;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x4E0A;&#x8C03;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;HPV(+) &#x764C;&#x6297;&#x539F;&#x777E;&#x4E38;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x901A;&#x5E38;&#x8868;&#x793A;&#x4EC5;&#x5728;&#x51CF;&#x6570;&#x5206;&#x88C2;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x3002;&#x8BB8;&#x591A;&#xFF0C;&#x867D;&#x7136;&#x4E0D;&#x662F;&#x6240;&#x6709;&#x7684; HPV(+) HNC &#x4E0E; HPV(-) HNC &#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x533A;&#x522B;&#x662F;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x4E73;&#x5934;&#x7624;&#x75C5;&#x6BD2;&#x548C;&#x5C24;&#x5176;&#x662F;&#x75C5;&#x6BD2;&#x6027;&#x7684; E6 &#x548C; E7 &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x76F4;&#x63A5;&#x540E;&#x679C;&#x3002;&#x8FD9;&#x5305;&#x62EC;&#x777E;&#x4E38;&#x7279;&#x5B9A;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x4E0E;&#x4EBA;&#x4E73;&#x5934;&#x7624;&#x75C5;&#x6BD2;&#x764C;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x65B0;&#x578B;&#x534F;&#x4F1A;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x539F;&#x53D1;&#x6027;&#x80BF;&#x7624;&#x4E3A; HPV(+) &#x548C; HPV(-) &#x764C;&#x75C7;&#x65E9;&#x671F;&#x68C0;&#x6D4B;&#x63D0;&#x4F9B;&#x65B0;&#x578B;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x548C;&#x5F3A;&#x8C03;&#x9488;&#x5BF9; E6 &#x548C; E7 &#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x5355;&#x72EC;&#x6216;&#x8054;&#x5408;&#x4E0E;&#x8F90;&#x5C04;&#x548C;/&#x6216;&#x4F20;&#x7EDF;&#x7684;&#x5316;&#x7597;&#xFF0C;HPV(+) &#x764C;&#x75C7;&#x6CBB;&#x7597;&#x7684;&#x6F5C;&#x5728;&#x4EF7;&#x503C;&#x3002;

&#x5728;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x7684;&#x57FA;&#x672C;&#x5DEE;&#x5F02;&#x653E;&#x677E;&#x7BA1;&#x5236;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x4E73;&#x5934;&#x7624;&#x75C5;&#x6BD2;&#x9633;&#x6027;&#x548C;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x4E73;&#x5934;&#x7624;&#x75C5;&#x6BD2;&#x9634;&#x6027;&#x5934;/&#x9888;&#x548C;&#x5BAB;&#x9888;&#x764C;&#x3002;

Human papillomaviruses (HPV) are associated with nearly all cervical cancers, 20% to 30% of head and neck cancers (HNC), and other cancers. Because HNCs also arise in HPV-negative patients, this type of cancer provides unique opportunities to define similarities and differences of HPV-positive versus HPV-negative cancers arising in the same tissue. Here, we describe genome-wide expression profiling of 84 HNCs, cervical cancers, and site-matched normal epithelial samples in which we used laser capture microdissection to enrich samples for tumor-derived versus normal epithelial cells. This analysis revealed that HPV(+) HNCs and cervical cancers differed in their patterns of gene expression yet shared many changes compared with HPV(-) HNCs. Some of these shared changes were predicted, but many others were not. Notably, HPV(+) HNCs and cervical cancers were found to be up-regulated in their expression of a distinct and larger subset of cell cycle genes than that observed in HPV(-) HNC. Moreover, HPV(+) cancers overexpressed testis-specific genes that are normally expressed only in meiotic cells. Many, although not all, of the hallmark differences between HPV(+) HNC and HPV(-) HNC were a direct consequence of HPV and in particular the viral E6 and E7 oncogenes. This included a novel association of HPV oncogenes with testis-specific gene expression. These findings in primary human tumors provide novel biomarkers for early detection of HPV(+) and HPV(-) cancers, and emphasize the potential value of targeting E6 and E7 function, alone or combined with radiation and/or traditional chemotherapy, in the treatment of HPV(+) cancers.

Fundamental differences in cell cycle deregulation in human papillomavirus-positive and human papillomavirus-negative head/neck and cervical cancers.

Virus du papillome humain (VPH) est associ&eacute; &agrave; presque tous les cancers du col ut&eacute;rin, 20 &agrave; 30 % de la t&ecirc;te et les cancers de cou (CTC) et d&#39;autres cancers. Parce que HNCs aussi surviennent chez des patients HPV-n&eacute;gatif, ce type de cancer offre une occasion unique de d&eacute;finir les similitudes et les diff&eacute;rences de HPV-positifs contre les cancers HPV-n&eacute;gatif r&eacute;sultant dans le m&ecirc;me tissu. Nous d&eacute;crivons ici, profilage de l&#39;expression du g&eacute;nome de 84 HNCs, cancers du col ut&eacute;rin et appari&eacute;s site &eacute;pith&eacute;liales &eacute;chantillons normaux dans lequel nous utilis&eacute; microdissection de saisie de laser pour enrichir les &eacute;chantillons pour d&eacute;riv&eacute;es de tumeurs par rapport aux cellules &eacute;pith&eacute;liales normales. Cette analyse a r&eacute;v&eacute;l&eacute; que HPV(+) HNCs et cancers du col ut&eacute;rin diff&egrave;rent dans leurs modes d&#39;expression du g&egrave;ne encore partagent de nombreux changements par rapport aux HPV(-) HNCs. Certains de ces changements partag&eacute;s ont &eacute;t&eacute; pr&eacute;dits, mais beaucoup d&#39;autres ne le sont pas. Notamment, HPV(+) HNCs et cancers du col ut&eacute;rin se sont av&eacute;r&eacute;s pour &ecirc;tre r&eacute;gul&eacute;e dans leur expression d&#39;un sous-ensemble distinct et plus grande du cycle cellulaire de g&egrave;nes que celui observ&eacute; dans la HPV(-) HNC. Par ailleurs, les cancers HPV(+) surexprim&eacute; g&egrave;nes sp&eacute;cifiques des testicules qui sont normalement exprim&eacute;es que dans les cellules m&eacute;iotiques. Beaucoup, mais pas tous, des diff&eacute;rences entre HPV(+) HNC et HPV(-) HNC hallmark &eacute;taient une cons&eacute;quence directe du VPH et en particulier la virales E6 et E7 oncog&egrave;nes. Ce chiffre comprend une nouvelle association des oncog&egrave;nes de VPH avec l&#39;expression des g&egrave;nes sp&eacute;cifiques des testicules. Ces constatations dans les tumeurs humaines primaires fournissent de nouveaux biomarqueurs pour la d&eacute;tection pr&eacute;coce des cancers HPV(+) et HPV(-) et mettent l&#39;accent sur la valeur potentielle du ciblage fonction E6 et E7, seule ou combin&eacute;e avec rayonnement et/ou la chimioth&eacute;rapie traditionnelle, dans le traitement de cancers HPV(+).

La d&eacute;r&eacute;glementation des diff&eacute;rences fondamentales dans le cycle cellulaire humain papillomavirus positif et humain papillomavirus n&eacute;gative t&ecirc;te/cou et cancers du col ut&eacute;rin.

Menschliche Papillomaviren (HPV) sind fast alle Geb&auml;rmutterhalskrebs, 20 % bis 30 % an Kopf und Hals-Tumoren (HNC) und andere Krebsarten zugeordnet. Da HNCs auch HPV-negativen Patienten entstehen, bietet diese Art von Krebs einzigartige M&ouml;glichkeiten, &Auml;hnlichkeiten und Unterschiede der HPV-positiven gegen HPV-negativen Tumoren entstehen im gleichen Gewebe zu definieren. Hier beschreiben wir, genomweiten Expression profiling von 84 HNCs, Geb&auml;rmutterhalskrebs und Website passende normalen epithelialen Beispiele in denen wir Laser Capture Microdissection eingesetzt, um Proben f&uuml;r anzureichern Tumor abgeleitete gegen&uuml;ber normalen Epithelzellen. Diese Analyse ergab, dass HPV(+) HNCs und Geb&auml;rmutterhalskrebs unterschieden sich in ihrer Muster der Genexpression noch viele &Auml;nderungen im Vergleich zu HPV(-) HNCs geteilt. Einige dieser freigegebenen &Auml;nderungen wurden vorhergesagt, aber viele andere nicht. Insbesondere wurden HPV(+) HNCs und Geb&auml;rmutterhalskrebs gefunden oben-geregelt in ihren Ausdruck einer gesonderten und gr&ouml;&szlig;ere Teilmenge von Zellzyklus Gene als das in HPV(-) HNC beobachtet werden. Dar&uuml;ber hinaus Pleuramesotheliom HPV(+) Krebsarten Hoden-spezifischen Gene, die normalerweise nur in meiotischen Zellen exprimiert werden. Viele, waren zwar nicht alle, der Markenzeichen Unterschiede zwischen HPV(+) HNC und HPV(-) HNC eine direkte Folge von HPV und insbesondere der viralen E6 und E7 Onkogene. Dazu geh&ouml;rte eine neuartige Vereinigung HPV Onkogene mit Hoden-spezifische Genexpression. Diese Erkenntnisse in menschlichen Prim&auml;rtumoren bieten neuartige Biomarker f&uuml;r die Fr&uuml;herkennung von HPV(+) und HPV(-) Krebsarten und betonen den potenziellen Wert des Zielens der E6 und E7-Funktion, allein oder in Kombination mit Bestrahlung und/oder herk&ouml;mmliche Chemotherapie bei der Behandlung von Krebserkrankungen HPV(+).

Grunds&auml;tzliche Unterschiede im Zellzyklus Deregulierung in menschliche Papillomavirus-Positive und menschliche Papillomavirus-Negative Kopf-und Nacken und Geb&auml;rmutterhalskrebs.

Papillomavirus umano (HPV) sono associati con quasi tutti i tumori della cervice uterina, 20% al 30% di testa e collo tumori (HNC) e di altri tumori. Perch&eacute; HNCs sorgono anche in pazienti HPV negativo, questo tipo di cancro offre opportunit&agrave; uniche per definire le somiglianze e le differenze di HPV-positivi contro HPV negativo tumori derivanti del tessuto stesso. Qui, descriviamo genome-wide expression profiling di 84 HNCs, tumori della cervice uterina e campioni epiteliali normale corrispondenza sito in cui abbiamo utilizzato microdissection del laser per arricchire i campioni per tumore derivato rispetto a cellule epiteliali normali. Questa analisi ha rivelato che HNCs HPV(+) e tumori cervicali differiscono nel loro pattern di espressione genica ancora condiviso molti cambiamenti rispetto al HNCs HPV(-). Alcuni di questi cambiamenti condivisi sono stati previsti, ma molti altri non lo erano. In particolare, HPV(+) HNCs e tumori della cervice uterina sono stati trovati per essere up-regolati nella loro espressione di un sottoinsieme distinto e pi&ugrave; grande del ciclo delle cellule geni rispetto a quello osservato in HNC HPV(-). Inoltre, HPV(+) tumori overexpressed testicolo specifici geni che vengono espressi normalmente solo nelle cellule meiotic. Molti, anche se non tutte, delle differenze tra HNC HPV(+) e HPV(-) HNC hallmark erano una diretta conseguenza di HPV e in particolare il virali E6 ed E7 oncogeni. Questo includeva una romanzo associazione degli oncogeni HPV con l&#39;espressione di gene specifico del testicolo. Questi risultati in tumori umani primari forniscono nuovi biomarcatori per la diagnosi precoce dei tumori HPV(+) e HPV(-) e sottolineano il valore potenziale di targeting funzione E6 ed E7, da sola o combinata con radiazioni e/o chemioterapia tradizionale, nel trattamento dei tumori HPV(+).

Differenze fondamentali nel ciclo cellulare deregulation in human papillomavirus-positivo e umano papillomavirus-negativi testa/collo e tumori della cervice uterina.

&#x30D2;&#x30C8; &#x30D1;&#x30D4;&#x30ED;&#x30FC;&#x30DE; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9; (HPV) &#x306F;&#x3001;&#x307B;&#x307C;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x5B50;&#x5BAE;&#x9838;&#x764C;&#x3001;&#x982D;&#x3068;&#x9838;&#x90E8;&#x306E;&#x764C; (HNC) &#x306E; 20 &#xFF5E; 30% &#x3068;&#x4ED6;&#x306E;&#x764C;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;HNCs &#x306F;&#x307E;&#x305F; HPV &#x9670;&#x6027;&#x4F8B;&#x3067;&#x767A;&#x751F;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x3067;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x306E;&#x764C;&#x306E;&#x985E;&#x4F3C;&#x70B9;&#x3068; HPV &#x967D;&#x6027;&#x306E;&#x9055;&#x3044;&#x3068;&#x540C;&#x3058;&#x7D44;&#x7E54;&#x3067;&#x3067;&#x304D;&#x305F;&#x764C;&#x3067;&#x3082; HPV &#x9670;&#x6027;&#x3092;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3059;&#x308B;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x6A5F;&#x4F1A;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5E83;&#x3044;&#x8868;&#x73FE;&#x306E; 84 HNCs&#x3001;&#x5B50;&#x5BAE;&#x9838;&#x304C;&#x3093;&#x3068;&#x306F;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x30EC;&#x30FC;&#x30B6;&#x30FC; &#x30AD;&#x30E3;&#x30D7;&#x30C1;&#x30E3; &#x30EC;&#x30FC;&#x30B6;&#x30FC;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30C0;&#x30A4; &#x30BB;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x8A66;&#x6599;&#x3092;&#x8C4A;&#x304B;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x816B;&#x760D;&#x7531;&#x6765;&#x5BFE;&#x6B63;&#x5E38;&#x4E0A;&#x76AE;&#x7D30;&#x80DE;&#x4F7F;&#x7528;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x4E00;&#x81F4;&#x6B63;&#x5E38;&#x4E0A;&#x76AE;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB; &#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x3067;&#x306F;&#x3001;HPV(+) HNCs &#x3068;&#x5B50;&#x5BAE;&#x9838;&#x304C;&#x3093;&#x305D;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x3067;&#x7570;&#x306A;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x307E;&#x3060; HPV(-) HNCs &#x3068;&#x306B;&#x6BD4;&#x3079;&#x3066;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x3092;&#x5171;&#x6709;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5171;&#x6709;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x306E;&#x4E00;&#x90E8;&#x304C;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x304C;&#x3001;&#x4ED6;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x3067;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x7279;&#x306B;&#x3001;HPV(+) HNCs &#x3068;&#x5B50;&#x5BAE;&#x9838;&#x304C;&#x3093;&#x30A2;&#x30C3;&#x30D7;&#x898F;&#x5236;&#x3088;&#x308A; HPV(-) HNC &#x3067;&#x89B3;&#x5BDF;&#x7D30;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x306F;&#x3063;&#x304D;&#x308A;&#x3068;&#x3088;&#x308A;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x30B5;&#x30D6;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x8868;&#x73FE;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x898B;&#x3064;&#x304B;&#x308A;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3067;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;HPV(+) &#x306E;&#x764C;&#x306E;&#x307F;&#x6E1B;&#x6570;&#x5206;&#x88C2;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x901A;&#x5E38;&#x7CBE;&#x5DE3;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x904E;&#x5270;&#x767A;&#x73FE;&#x3002;&#x591A;&#x304F;&#x306F;&#x3001;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x3044;&#x304C;&#x3001;HPV(+) HNC &#x3068; HPV(-) HNC &#x306E;&#x30DB;&#x30FC;&#x30EB;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AF;&#x306E;&#x9055;&#x3044;&#x306E; HPV &#x306E;&#x7279;&#x306B;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E; E6 &#x3068; E7 &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x76F4;&#x63A5;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3060;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x3001;&#x7CBE;&#x5DE3;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE; HPV &#x306E;&#x304C;&#x3093;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x65B0;&#x898F;&#x306E;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3092;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x8ABF;&#x67FB;&#x7D50;&#x679C;&#x306E;&#x4E3B;&#x306A;&#x3072;&#x3068;&#x816B;&#x760D;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B; HPV(+) &#x3068; HPV(-) &#x306E;&#x764C;&#x306E;&#x65E9;&#x671F;&#x767A;&#x898B;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x65B0;&#x898F;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3001;E6 &#x3068; E7 &#x95A2;&#x6570;&#x3001;&#x5358;&#x72EC;&#x3067;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x653E;&#x5C04;&#x304A;&#x3088;&#x3073;/&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x4F1D;&#x7D71;&#x7684;&#x306A;&#x5316;&#x5B66;&#x7642;&#x6CD5;&#x3001;HPV(+) &#x764C;&#x306E;&#x6CBB;&#x7642;&#x3068;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x3066;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3068;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x4FA1;&#x5024;&#x3092;&#x5F37;&#x8ABF;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x7D30;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x306E;&#x6839;&#x672C;&#x7684;&#x306A;&#x9055;&#x3044;&#x4EBA;&#x9593;&#x30D2;&#x30C8;&#x30D1;&#x30D4; &#x30ED;&#x30FC;&#x30DE; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x967D;&#x6027;&#x3068;&#x4EBA;&#x9593;&#x30D2;&#x30C8;&#x30D1;&#x30D4; &#x30ED;&#x30FC;&#x30DE; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x9670;&#x6027;&#x982D;&#x9838;&#x90E8;&#x3068;&#x5B50;&#x5BAE;&#x9838;&#x764C;&#x306E;&#x898F;&#x5236;&#x7DE9;&#x548C;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xC778;&#xAC04; papillomaviruses (HPV)&#xB294; &#xAC70;&#xC758; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xC790; &#xAD81; &#xACBD;&#xBD80; &#xC554;, &#xBA38;&#xB9AC;&#xC640; &#xBAA9; &#xC554; (HNC)&#xC758; 20% ~ 30% &#xBC0F; &#xAE30;&#xD0C0; &#xC554;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. HNCs &#xC790; &#xAD81; &#xC74C;&#xC218;&#xAC00; &#xD658;&#xC790;&#xB3C4; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558;&#xAE30; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xC554; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC720;&#xD615;&#xC758; &#xC720;&#xC0AC;&#xC131;&#xACFC; &#xAC19;&#xC740; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558;&#xB294; &#xC790; &#xAD81; &#xC74C;&#xC218;&#xAC00; &#xC554; &#xB300; HPV &#xC591;&#xC131;&#xC758; &#xCC28;&#xC774; &#xC815;&#xC758; &#xD558; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xAE30;&#xD68C;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xAC8C;&#xB188; &#xB113;&#xC740; &#xC2DD; 84 HNCs, &#xC790; &#xAD81; &#xACBD;&#xBD80; &#xC554;&#xACFC; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xB808;&#xC774;&#xC800; &#xCEA1;&#xCC98; &#xAE30;&#xC815;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC744; &#xD48D;&#xBD80; &#xD558; &#xAC8C; &#xC885;&#xC591; &#xD30C;&#xC0DD; &#xB41C; &#xC815;&#xC0C1; &#xC0C1;&#xD53C; &#xC138;&#xD3EC; &#xB300; &#xC815;&#xC0C1;&#xC758; &#xC0C1;&#xD53C; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC744; &#xC77C;&#xCE58; &#xD558;&#xB294; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC758; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C; &#xC124;&#xBA85;. &#xC774; &#xBD84;&#xC11D; &#xACF5;&#xAC1C; HPV(+) HNCs &#xBC0F; &#xC790; &#xAD81; &#xACBD;&#xBD80; &#xC554; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xD328;&#xD134;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC544;&#xC9C1; HPV(-) Hncs&#xC5D0; &#xBE44;&#xD574; &#xB9CE;&#xC740; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xACF5;&#xC720; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xACF5;&#xC720; &#xBCC0;&#xD654;&#xC758; &#xC77C;&#xBD80; &#xC608;&#xCE21; &#xD588;&#xB2E4;, &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xB9CE;&#xC740; &#xC0AC;&#xB78C;&#xB4E4;&#xC774; &#xC544;&#xB2C8;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xD2B9;&#xD788;, HPV(+) HNCs &#xBC0F; &#xC790; &#xAD81; &#xACBD;&#xBD80; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC; &#xC8FC;&#xAE30; &#xC720;&#xC804;&#xC790; HPV(-) HNC&#xC5D0; &#xAD00;&#xCC30; &#xD558;&#xB294; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xD655;&#xC2E4; &#xD558; &#xACE0; &#xB354; &#xD070; &#xD558;&#xC704; &#xC9D1;&#xD569;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;&#xC5D0;&#xAE4C;&#xC9C0; &#xADDC;&#xC81C; &#xB420;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, HPV(+) &#xC554; overexpressed &#xACE0;&#xD658; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790; meiotic &#xC140;&#xC5D0;&#xB9CC; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD45C;&#xD604; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB9CE;&#xC740; &#xACBD;&#xC6B0;, &#xBE44;&#xB85D; &#xC804;&#xBD80;&#xB294; &#xC544;&#xB2C8;, HPV(+) HNC&#xC640; HPV(-) HNC&#xC758; &#xD2B9;&#xC9D5; &#xCC28;&#xC774;&#xC810;&#xC758; &#xD588;&#xB2E4; HPV&#xC640; &#xD2B9;&#xD788; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; E6 &#xBC0F; E7 oncogenes &#xC9C1;&#xC811;&#xC801;&#xC778; &#xACB0;&#xACFC;. &#xACE0;&#xD658; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xACFC; HPV oncogenes &#xC18C;&#xC124; &#xD611;&#xD68C; &#xD3EC;&#xD568;. &#xAE30;&#xBCF8; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC885;&#xC591;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; HPV(+) &#xBC0F; HPV(-) &#xC554;&#xC758; &#xC870;&#xAE30; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC0DD;&#xCCB4;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558; &#xACE0; E6 &#xBC0F; E7 &#xD568;&#xC218;, &#xD63C;&#xC790; &#xB610;&#xB294; &#xBC29;&#xC0AC;&#xC120; &#xBC0F; HPV(+) &#xC554;&#xC758; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804;&#xD1B5;&#xC801;&#xC778; &#xD654;&#xD559; &#xC694;&#xBC95;&#xACFC; &#xACB0;&#xD569; &#xB41C; &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C;&#xC758; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xAC00;&#xCE58;&#xB97C; &#xAC15;&#xC870;.

&#xC138;&#xD3EC; &#xC8FC;&#xAE30;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADFC;&#xBCF8;&#xC801;&#xC778; &#xCC28;&#xC774; deregulation &#xC778;&#xAC04; &#xC720; &#xB450; &#xC885; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC591;&#xC131; &#xBC0F; &#xC778;&#xAC04; &#xC720; &#xB450; &#xC885; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC74C;&#xC218;&#xAC00; &#xBA38;&#xB9AC;/&#xBAA9; &#xBC0F; &#xC790; &#xAD81; &#xACBD;&#xBD80; &#xC554;.

Virus del papiloma humanos (VPH) se asocian casi todos c&aacute;nceres cervicales, 20% al 30% de c&aacute;nceres de cuello (HNC) y cabeza y otros tipos de c&aacute;ncer. Porque HNCs tambi&eacute;n se presentan en pacientes VPH negativos, este tipo de c&aacute;ncer ofrece oportunidades &uacute;nicas para definir similitudes y diferencias de VPH positivos frente a c&aacute;nceres VPH negativos que se presenta en el tejido mismo. Describimos aqu&iacute;, perfil de la expresi&oacute;n del genoma de 84 HNCs, c&aacute;nceres de cuello uterino y muestras epiteliales normales mismo sitio en que utilizamos l&aacute;ser captura microdisecci&oacute;n para enriquecer las muestras para tumor derivado frente a las c&eacute;lulas epiteliales normales. Este an&aacute;lisis revel&oacute; que HPV(+) HNCs y c&aacute;nceres de cuello uterino difer&iacute;an en sus patrones de expresi&oacute;n g&eacute;nica pero comparten muchos cambios en comparaci&oacute;n con HPV(-) HNCs. Algunos de estos cambios compartidos se predijo, pero muchos otros no lo eran. En particular, HPV(+) HNCs y c&aacute;nceres de cuello uterino fueron encontrados para ser regulada para arriba en su expresi&oacute;n de un subconjunto distinto y m&aacute;s grande de genes del ciclo celular que el observado en HPV(-) HNC. Por otra parte, HPV(+) c&aacute;ncer sobreexpresa genes espec&iacute;ficos de test&iacute;culo que normalmente se expresan s&oacute;lo en las c&eacute;lulas mei&oacute;ticas. Muchos, aunque no todos, de las diferencias de sello entre HPV(+) HNC y HPV(-) HNC fueron una consecuencia directa del VPH y en particular la virales E6 y E7 oncogenes. Esto incluy&oacute; una asociaci&oacute;n nueva de oncogenes HPV con la expresi&oacute;n de genes espec&iacute;ficos de test&iacute;culo. Estos resultados en tumores primarios humanos proporcionan nuevos biomarcadores para la detecci&oacute;n temprana de c&aacute;ncer de HPV(+) y HPV(-) y enfatizan el valor potencial de apuntar la funci&oacute;n E6 y E7, sola o combinada con radiaci&oacute;n o la quimioterapia tradicional, en el tratamiento de los c&aacute;nceres HPV(+).

Diferencias fundamentales en el ciclo celular desregulaci&oacute;n en humano papillomavirus-positivo y humano papillomavirus negativo cabeza/cuello y c&aacute;nceres de cuello uterino.

&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x5C5E;&#x6027;&#x548C;&#x6742;&#x4EA4;&#x6280;&#x672F;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x660E;&#x786E;&#x5173;&#x7CFB;&#x7684;&#x4FE1;&#x53F7;&#x5F3A;&#x5EA6; &#xFF08;&#x6052;&#x6307;&#xFF09; &#x80FD;&#x591F;&#x5E2E;&#x52A9;&#x82AF;&#x7247;&#x8BBE;&#x8BA1;&#x3001; &#x6570;&#x636E;&#x89C4;&#x8303;&#x5316;&#x548C;&#x771F;&#x6B63;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x77E5;&#x8BC6;&#x53D1;&#x73B0;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8981;&#x6F84;&#x6E05;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E2D;&#x5305;&#x542B;&#x8D85;&#x8FC7; 300 &#x4E07;&#x63A2;&#x6D4B;&#x5668;&#x4ECE; 48 &#x9AD8;&#x5BC6;&#x5EA6;&#x82AF;&#x7247;&#x7684;&#x4E24;&#x4E2A;&#x82AF;&#x7247;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x6570;&#x636E;&#x7684;&#x5173;&#x7CFB;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#xFF0C;&#x7194;&#x5316;&#x6E29;&#x5EA6; (T(m)) &#x5DF2;&#x5BF9;&#x6052;&#x6307;&#x6700;&#x660E;&#x663E;&#x7684;&#x6548;&#x679C;&#x867D;&#x7136;&#x957F;&#x5EA6;&#x4E3A;&#x7814;&#x7A76;&#x957F;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x5F88;&#x5C0F;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528;&#x7EBF;&#x6027;&#x6A21;&#x578B;&#x7684;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x5F71;&#x54CD;&#x5206;&#x6790;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x63A2;&#x6D4B;&#x5668;&#x7684;&#x51F8;&#x51FA;&#x4E24;&#x7AEF;&#x8D21;&#x732E;&#x66F4;&#x591A;&#x5230;&#x6052;&#x6307;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x5728;&#x4E13;&#x95E8;&#x8BBE;&#x8BA1;&#x7684;&#x901A;&#x8FC7;&#x5BA1;&#x5B9A;&#x7684;&#x6813;&#x7CFB;&#x7684;&#x7ED3;&#x675F;&#x5339;&#x914D;&#x7247;&#x6BB5;&#x6ED1;&#x52A8;&#x548C;&#x6269;&#x5C55;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x7684;&#x8BC1;&#x636E;&#x3002;&#x6052;&#x6307;&#x5E8F;&#x5217;&#x76F8;&#x4F3C;&#x6027; (SeqS) &#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x4E0D;&#x5927;&#x4E0E;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x7684;&#x5176;&#x4ED6;&#x5C5E;&#x6027;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528;&#x56DE;&#x5F52;&#x548C;&#x56DE;&#x5F52;&#x6811;&#x5206;&#x6790;&#xFF0C;&#x4F18;&#x5148;&#x8003;&#x8651;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x5C5E;&#x6027;&#x57FA;&#x4E8E;&#x5176;&#x5BF9;&#x6052;&#x6307;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x8BA8;&#x8BBA;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x53D1;&#x73B0;&#xFF0C;&#x4E0D;&#x5E26;&#x504F;&#x89C1;&#x7684;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x8BBE;&#x8BA1;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x8BBE;&#x8BA1;&#x7684;&#x957F;&#x77ED;&#x4E0D;&#x4E00;&#x7684;&#x7B49;&#x6E29;&#x63A2;&#x6D4B;&#x5668;&#x662F;&#x53EF;&#x884C;&#x7684;&#x6218;&#x7565;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x51CF;&#x5C11;&#x504F;&#x89C1;&#x5E8F;&#x5217;&#xFF0C;&#x867D;&#x7136;&#x9009;&#x62E9;&#x5BF9;&#x65BD;&#x52A0;&#x9650;&#x5236;&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x7684;&#x5176;&#x4ED6;&#x5C5E;&#x6027;&#x4E5F;&#x662F;&#x5FC5;&#x4E0D;&#x53EF;&#x5C11;&#x7684;&#x3002;

&#x5BE1;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x5C5E;&#x6027;&#x548C;&#x6742;&#x4EA4;&#x4FE1;&#x53F7;&#x5F3A;&#x5EA6;&#x4ECE;&#x7F57;&#x6C0F;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x6570;&#x636E;&#x96C6;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5173;&#x7CFB;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x3002;

Well-defined relationships between oligonucleotide properties and hybridization signal intensities (HSI) can aid chip design, data normalization and true biological knowledge discovery. We clarify these relationships using the data from two microarray experiments containing over three million probes from 48 high-density chips. We find that melting temperature (T(m)) has the most significant effect on HSI while length for the long oligonucleotides studied has very little effect. Analysis of positional effect using a linear model provides evidence that the protruding ends of probes contribute more than tethered ends to HSI, which is further validated by specifically designed match fragment sliding and extension experiments. The impact of sequence similarity (SeqS) on HSI is not significant in comparison with other oligonucleotide properties. Using regression and regression tree analysis, we prioritize these oligonucleotide properties based on their effects on HSI. The implications of our discoveries for the design of unbiased oligonucleotides are discussed. We propose that isothermal probes designed by varying the length is a viable strategy to reduce sequence bias, though imposing selection constraints on other oligonucleotide properties is also essential.

A study of the relationships between oligonucleotide properties and hybridization signal intensities from NimbleGen microarray datasets.

Des relations bien d&#xE9;finies entre les propri&#xE9;t&#xE9;s d&#x26;#39;oligonucl&#xE9;otides et des intensit&#xE9;s de signaux d&#x26;#39;hybridation (HSI) peut faciliter la conception de la puce, la normalisation des donn&#xE9;es et vrai de d&#xE9;couverte de connaissances biologiques. Nous clarifier ces relations en utilisant les donn&#xE9;es provenant de deux exp&#xE9;riences sur biopuces contenant plus de trois millions de sondes de 48 puces de haute densit&#xE9;. Nous constatons que la temp&#xE9;rature de fusion (T (m)) a l&#x26;#39;effet le plus significatif sur la dur&#xE9;e tout en HSI pour les oligonucl&#xE9;otides longs &#xE9;tudi&#xE9;s a tr&#xE8;s peu d&#x26;#39;effet. Analyse de l&#x26;#39;effet de position en utilisant un mod&#xE8;le lin&#xE9;aire fournit la preuve que les extr&#xE9;mit&#xE9;s saillantes des sondes de contribuer plus que les extr&#xE9;mit&#xE9;s attach&#xE9;s &#xE0; HSI, qui est ensuite valid&#xE9; par un glissement match de fragment sp&#xE9;cialement con&#xE7;u et l&#x26;#39;extension des exp&#xE9;riences. L&#x26;#39;impact de la similarit&#xE9; de s&#xE9;quence (SeqS) sur HSI n&#x26;#39;est pas significative en comparaison avec d&#x26;#39;autres propri&#xE9;t&#xE9;s d&#x26;#39;oligonucl&#xE9;otides. En utilisant la r&#xE9;gression et l&#x26;#39;analyse par arbre de r&#xE9;gression, nous avons la priorit&#xE9; &#xE0; ces propri&#xE9;t&#xE9;s d&#x26;#39;oligonucl&#xE9;otides en fonction de leurs effets sur HSI. Les implications de nos d&#xE9;couvertes pour la conception d&#x26;#39;oligonucl&#xE9;otides impartiales sont discut&#xE9;s. Nous proposons que les sondes isothermes con&#xE7;us en faisant varier la longueur est une strat&#xE9;gie viable pour r&#xE9;duire le biais de la s&#xE9;quence, tout en imposant des contraintes sur les propri&#xE9;t&#xE9;s de s&#xE9;lection d&#x26;#39;oligonucl&#xE9;otides d&#x26;#39;autres est &#xE9;galement essentiel.

Une &#xE9;tude sur les relations entre les propri&#xE9;t&#xE9;s d&#x26;#39;oligonucl&#xE9;otides et des intensit&#xE9;s de signaux d&#x26;#39;hybridation des ensembles de donn&#xE9;es de puces &#xE0; ADN NimbleGen

Klar definierte Beziehungen zwischen Oligonukleotid-Eigenschaften und Hybridisierung signalisieren, dass die Intensit&auml;ten (HSI) Chipdesign, Datennormalisierung und wahre biologische Wissensentdeckung helfen k&ouml;nnen. Wir kl&auml;ren diese Beziehungen mit die Daten aus zwei Microarray Experimente mit mehr als 3 Millionen Sonden aus 48 High-Density-Chips. Wir finden die Schmelztemperatur (T(m)) hat die wichtigste Auswirkungen auf die HSI L&auml;nge f&uuml;r die langen Oligonucleotides studierte sehr wenig Wirkung. Analyse der positionellen Effekt mit ein lineares Modell liefert Hinweise darauf, dass die &uuml;berstehenden Enden der Sonden tragen mehr als gefesselte enden, HSI, der weiter von speziell validiert wird Schiebe-Fragment &uuml;bereinstimmen und Erweiterung Experimente. Die Auswirkungen der Reihenfolge &Auml;hnlichkeit (SeqS) auf HSI spielt keine Rolle, im Vergleich zu anderen Oligonukleotid-Eigenschaften. Mit Regression und Regressionsanalyse Baum, priorisieren wir diese Oligonukleotid-Eigenschaften basierend auf deren Auswirkungen auf die HSI. Die Auswirkungen unserer Entdeckungen f&uuml;r die Gestaltung der unvoreingenommene Oligonukleotide werden diskutiert. Wir schlagen isothermische Sonden entworfen durch Variation der L&auml;nge ist eine tragf&auml;hige Strategie zur Verringerung der Sequenz Voreingenommenheit, obwohl Auswahl Auflagen bei anderen Oligonukleotid-Eigenschaften auch unerl&auml;sslich ist.

Eine Studie &uuml;ber die Beziehungen zwischen Oligonukleotid-Eigenschaften und Hybridisierung Signal Intensit&auml;ten aus NimbleGen Microarray Datasets.

Ben definite relazioni tra le propriet&agrave; del oligonucleotide e ibridazione segnalano di intensit&agrave; (HSI) pu&ograve; aiutare la progettazione dei chip, normalizzazione dati e conoscenza biologica vera scoperta. Chiarire questi rapporti utilizzando i dati da due esperimenti di microarray contenente oltre 3 milioni di sonde da 48 chip ad alta densit&agrave;. Troviamo che temperatura di fusione (T(m)) ha l&#39;effetto pi&ugrave; significativo su HSI mentre lunghezza per i oligonucleotides lunghi studiato ha un effetto molto limitato. Analisi dell&#39;effetto posizionale utilizzando un modello lineare forniscono la prova che le estremit&agrave; sporgenti delle sonde contribuiscano pi&ugrave; che finisce legati a HSI, che viene ulteriormente convalidato da specificamente progettato abbinare frammento scorrevole ed esperimenti di estensione. L&#39;impatto della somiglianza di sequenza (SeqS) su HSI non &egrave; significativa rispetto ad altre propriet&agrave; del oligonucleotide. Utilizzando la regressione e l&#39;analisi di regressione ad albero, assegnare priorit&agrave; queste propriet&agrave; del oligonucleotide basate sui loro effetti su HSI. Vengono discusse le implicazioni delle nostre scoperte per la progettazione dei oligonucleotides imparziale. Proponiamo che sonde isotermiche progettate variando la lunghezza &egrave; una valida strategia per ridurre il bias di sequenza, anche se imporre vincoli di selezione su altre propriet&agrave; del oligonucleotide &egrave; anche essenziale.

Uno studio delle relazioni tra le propriet&agrave; del oligonucleotide e intensit&agrave; del segnale di ibridazione da NimbleGen microarray DataSet.

&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D1;&#x30C6;&#x30A3;&#x3068;&#x306E;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306E;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x5F37;&#x5EA6;&#xFF08;HSI&#xFF09;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x660E;&#x78BA;&#x306B;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x95A2;&#x4FC2;&#x306F;&#x3001;&#x30C1;&#x30C3;&#x30D7;&#x8A2D;&#x8A08;&#x3001;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x6B63;&#x898F;&#x5316;&#x3068;&#x771F;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x306A;&#x77E5;&#x8B58;&#x767A;&#x898B;&#x3092;&#x652F;&#x63F4;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x79C1;&#x9054;&#x306F;48&#x306E;&#x9AD8;&#x5BC6;&#x5EA6;&#x30C1;&#x30C3;&#x30D7;&#x304B;&#x3089;300&#x4E07;&#x4EBA;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x4E8C;&#x3064;&#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x5B9F;&#x9A13;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x9577;&#x3044;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x9577;&#x3055;&#x306F;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x52B9;&#x679C;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x306A;&#x304C;&#x3089;&#x3001;&#x878D;&#x89E3;&#x6E29;&#x5EA6;&#xFF08;T&#xFF08;M&#xFF09;&#xFF09;&#x304C;HSI&#x306B;&#x6700;&#x3082;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x308F;&#x304B;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7DDA;&#x5F62;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x52B9;&#x679C;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6;&#x306E;&#x7A81;&#x51FA;&#x672B;&#x7AEF;&#x306F;&#x3001;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x7279;&#x5225;&#x306B;&#x8A2D;&#x8A08;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B9;&#x30E9;&#x30A4;&#x30C9;&#x5F0F;&#x306E;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C1;&#x30D5;&#x30E9;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x3068;&#x62E1;&#x5F35;&#x5B9F;&#x9A13;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x691C;&#x8A3C;&#x3055;&#x308C;&#x305F;HSI&#x306B;&#x30C6;&#x30B6;&#x30FC;&#x304C;&#x7D42;&#x4E86;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x3088;&#x308A;&#x591A;&#x304F;&#x3092;&#x8CA2;&#x732E;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; HSI&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x985E;&#x4F3C;&#x6027;&#x306E;&#x5F71;&#x97FF;&#xFF08;SEQS&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x4ED6;&#x306E;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x3068;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x3066;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x306F;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x56DE;&#x5E30;&#x3068;&#x56DE;&#x5E30;&#x30C4;&#x30EA;&#x30FC;&#x5206;&#x6790;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;HSI&#x306B;&#x53CA;&#x307C;&#x3059;&#x5F71;&#x97FF;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D1;&#x30C6;&#x30A3;&#x3092;&#x512A;&#x5148;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x516C;&#x5E73;&#x306A;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x8A2D;&#x8A08;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E;&#x767A;&#x898B;&#x306E;&#x610F;&#x5473;&#x304C;&#x8AAC;&#x660E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x4ED6;&#x306E;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x306B;&#x9078;&#x629E;&#x306E;&#x5236;&#x7D04;&#x3092;&#x8AB2;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x3082;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x9577;&#x3055;&#x3092;&#x5909;&#x5316;&#x3055;&#x305B;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8A2D;&#x8A08;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x7B49;&#x6E29;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D6;&#x306F;&#x3001;&#x914D;&#x5217;&#x30D0;&#x30A4;&#x30A2;&#x30B9;&#x3092;&#x6E1B;&#x3089;&#x3059;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5B9F;&#x884C;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x6226;&#x7565;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x63D0;&#x6848;&#x3059;&#x308B;&#x3002;

NimbleGen&#x793E;&#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D1;&#x30C6;&#x30A3;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306E;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x5F37;&#x5EA6;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x95A2;&#x4FC2;&#x306E;&#x8003;&#x5BDF;

Oligonucleotide &#xC18D;&#xC131; &#xBC0F; &#xAD50; &#xC7A1;&#xC5D0; &#xAD00;&#xACC4;&#xB97C; &#xC798; &#xC815;&#xC758; &#xB41C; &#xC2E0;&#xD638; &#xAC15;&#xB3C4; (HSI) &#xCE69; &#xC124;&#xACC4;, &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xD45C;&#xC900;&#xD654; &#xBC0F; &#xC9C4;&#xC815;&#xD55C; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xD559;&#xC801; &#xC9C0;&#xC2DD; &#xBC1C;&#xACAC; &#xB3C4;&#xC6C0;&#xC774; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; 48 &#xACE0;&#xBC00;&#xB3C4; &#xCE69;&#xC5D0;&#xC11C; 3 &#xBC31;&#xB9CC; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; microarray &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xAD00;&#xACC4;&#xB97C; &#xBA85;&#xD655;&#xD788;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xCC3E;&#xB294; &#xADF8; &#xC6A9;&#xC735; &#xC628;&#xB3C4; (&#xAE38;&#xC774; &#xAE34; oligonucleotides &#xACF5;&#xBD80;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD6A8;&#xACFC;&#xAC00; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xAC70;&#xC758; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; T(m)) HSI&#xC5D0; &#xAC00;&#xC7A5; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xD6A8;&#xACFC;&#xAC00; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC120;&#xD615; &#xBAA8;&#xB378;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC704;&#xCE58; &#xD6A8;&#xACFC; &#xBD84;&#xC11D; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; &#xD280;&#xC5B4;&#xB098;&#xC628; &#xB05D; &#xAE30;&#xC5EC; &#xC18D;&#xBC15; &#xB418; &#xB05D;&#xC744; &#xAD6C;&#xCCB4;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC124;&#xACC4; &#xD558; &#xC5EC; &#xAC80;&#xC99D; &#xCD94;&#xAC00; HSI &#xC77C;&#xCE58; &#xC870;&#xAC01; &#xC2AC;&#xB77C;&#xC774;&#xB529; &#xBCF4;&#xB2E4;&#xB294; &#xB354; &#xB9CE;&#xC740; &#xBC0F; &#xD655;&#xC7A5; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xC99D;&#xAC70;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. HSI&#xC5D0; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC720;&#xC0AC;&#xC131; (SeqS)&#xC758; &#xC601;&#xD5A5; &#xB2E4;&#xB978; oligonucleotide &#xC18D;&#xC131;&#xC5D0; &#xBE44;&#xD574; &#xC911;&#xC694; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD68C;&#xADC0; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xBC0F; &#xD68C;&#xADC0; &#xB098;&#xBB34; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;, &#xC6B0;&#xB9AC; HSI&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xD6A8;&#xACFC;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; oligonucleotide &#xC18D;&#xC131;&#xC744; &#xC6B0;&#xC120; &#xC21C;&#xC704;. &#xD3B8;&#xACAC;&#xB41C; oligonucleotides&#xC758; &#xB514;&#xC790;&#xC778;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC758; &#xC758;&#xBBF8;&#xB97C; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xBE44;&#xB85D; &#xB2E4;&#xB978; oligonucleotide &#xC18D;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC120;&#xD0DD; &#xC81C;&#xC57D;&#xC744; &#xBD80;&#xACFC; &#xB610;&#xD55C; &#xD544;&#xC218;&#xC801; &#xC774;&#xB2E4; &#xB4F1;&#xC628;&#xC120; &#xD504;&#xB85C;&#xBE0C; &#xAE38;&#xC774; &#xBCC0;&#xD654;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC124;&#xACC4; &#xB41C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBC14;&#xC774;&#xC5B4;&#xC2A4;&#xB97C; &#xC904;&#xC774;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC2E4;&#xD589; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xC804;&#xB7B5;&#xC740; &#xC81C;&#xC548; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Oligonucleotide &#xC18D;&#xC131;&#xACFC; NimbleGen microarray &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD50; &#xC7A1; &#xC2E0;&#xD638; &#xAC15;&#xB3C4; &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xAD00;&#xACC4;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;.

Relaciones bien definidas entre las propiedades de oligonucle&#xF3;tidos y la intensidad de la se&#xF1;al de hibridaci&#xF3;n (HSI) puede ayudar en el dise&#xF1;o de chips, la normalizaci&#xF3;n de datos y el descubrimiento de cierto conocimiento biol&#xF3;gico. Aclaramos estas relaciones utilizando los datos de dos experimentos de microarrays que contienen m&#xE1;s de tres millones de sondas de alta densidad de 48 fichas. Encontramos que la temperatura de fusi&#xF3;n (T (m)) tiene el efecto m&#xE1;s significativo en la longitud, mientras que HSI para los oligonucle&#xF3;tidos estudiado durante mucho tiempo tiene muy poco efecto. An&#xE1;lisis del efecto de posici&#xF3;n utilizando un modelo lineal proporciona evidencia de que los extremos salientes de las sondas contribuyen m&#xE1;s que los extremos atados a HSI, que se ve validada por deslizamiento espec&#xED;ficamente dise&#xF1;ado fragmento partido y extensi&#xF3;n experimentos. El impacto de la similitud de secuencias (SEQs) en HSI no es significativo en comparaci&#xF3;n con otras propiedades de oligonucle&#xF3;tidos. Utilizando la regresi&#xF3;n y el an&#xE1;lisis de &#xE1;rbol de regresi&#xF3;n, se da prioridad a estas propiedades de oligonucle&#xF3;tidos basados &#x200B;&#x200B;en sus efectos sobre la HSI. Las implicaciones de nuestros descubrimientos para el dise&#xF1;o de oligonucle&#xF3;tidos opiniones se discuten. Proponemos que las sondas isot&#xE9;rmicas dise&#xF1;adas por la variaci&#xF3;n de la longitud es una estrategia viable para reducir el sesgo de la secuencia, a pesar de la imposici&#xF3;n de restricciones de selecci&#xF3;n en las propiedades de oligonucle&#xF3;tidos otros es tambi&#xE9;n esencial.

Un estudio de las relaciones entre las propiedades de oligonucle&#xF3;tidos y intensidades de hibridaci&#xF3;n de se&#xF1;ales de datos de microarrays de NimbleGen

&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x654F;&#x611F;&#x7684;&#x57FA;&#x4E8E;&#x82AF;&#x7247;&#x7684;&#x7A0B;&#x5E8F;&#xFF0C;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x516B;&#x4E2A; Microrna (Mirna) &#x663E;&#x793A;&#x9C81;&#x68D2; 31 &#x6FC0;&#x5149;-&#x6355;&#x83B7;-&#x95F4;&#x9F3B;&#x54BD;&#x764C; (&#x56FD;&#x5BB6;&#x7B79;&#x5907;&#x59D4;&#x5458;&#x4F1A;) &#x548C; 10 &#x4E2A;&#x6B63;&#x5E38;&#x5065;&#x5EB7;&#x9F3B;&#x54BD;&#x4E0A;&#x76AE;&#x6837;&#x672C;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x5C24;&#x5176;&#x662F;&#xFF0C;&#x7C73;&#x5C14;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9;-29 c &#x8868;&#x793A;&#x7684;&#x4E94;&#x5206;&#x4E4B;&#x4E00;&#x5728;&#x6B63;&#x5E38;&#x7684;&#x4E0A;&#x76AE;&#x7EC6;&#x80DE;&#x80BF;&#x7624;&#x4E2D;&#x7684;&#x7EA7;&#x522B;&#x3002;&#x5728;&#x5168;&#x56FD;&#x4EBA;&#x5927;&#x80BF;&#x7624;&#xFF0C;&#x8F83;&#x4F4E;&#x7684;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9;-29 c &#x7EA7;&#x522B;&#x66F4;&#x9AD8;&#x7684;&#x591A;&#x4E2A; mRNAs &#x5176; 3&#39; &#x5F02;&#x5E38;&#x53EF;&#x4EE5;&#x8DE8;&#x8D8A;&#x8BB8;&#x591A;&#x810A;&#x690E;&#x52A8;&#x7269;&#x4FDD;&#x5B88;&#x7684;&#x76EE;&#x6807;&#x5E8F;&#x5217;&#x5728;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9;-29 c &#x5173;&#x8054;&#x8D77;&#x6765;&#x3002;&#x5728;&#x57F9;&#x517B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x5F15;&#x5165;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9;-29 c &#x7684;&#x4E0B;&#x8C03;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684; mRNA &#x6C34;&#x5E73;&#x548C;&#x6291;&#x5236;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x8367;&#x5149;&#x7D20;&#x9176;&#x8F7D;&#x4F53;&#x5177;&#x6709; 3&#39; &#x5F02;&#x5E38;&#x7684;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F16;&#x7801;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x51E0;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x6D4B;&#x8BD5;&#xFF0C;&#x53D8;&#x5F02;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9;-29 c &#x7684;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x76EE;&#x6807;&#x7AD9;&#x70B9;&#x4E2D; 3&#39; UTR &#x5E9F;&#x9664;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9;-29 c &#x8BF1;&#x5BFC;&#x8367;&#x5149;&#x7D20;&#x9176;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x6700;&#x786E;&#x5B9A;&#x7684;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9; 29 c &#x9488;&#x5BF9;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F16;&#x7801;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5916;&#x57FA;&#x8D28;&#x86CB;&#x767D;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x591A;&#x4E2A;&#x80F6;&#x539F;&#x548C;&#x5C42;&#x7C98;&#x8FDE;&#x86CB;&#x767D; gamma1 &#x4E0E;&#x80BF;&#x7624;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6D78;&#x6DA6;&#x548C;&#x8F6C;&#x79FB;&#x6F5C;&#x5728;&#x3001; &#x7A81;&#x51FA;&#x7279;&#x70B9;&#x7684;&#x4EBA;&#x5927;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x786E;&#x5B9A;&#x516B;&#x4E2A; Mirna &#x8868;&#x8FBE;&#x5728;&#x5168;&#x56FD;&#x4EBA;&#x5927;&#x548C;&#x8BC1;&#x660E;&#x53C2;&#x4E0E;&#x4E00;&#x4E2A;&#x8C03;&#x8282;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8F6C;&#x79FB;&#x3002;

MicroRNA 29 c &#x662F;&#x9F3B;&#x54BD;&#x764C;&#xFF0C;&#x5411;&#x4E0A;&#x8C03;&#x8282;&#x57FA;&#x56E0;&#x7F16;&#x7801;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5916;&#x57FA;&#x8D28;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x4E0B;&#x8C03;&#x3002;

Using highly sensitive microarray-based procedures, we identified eight microRNAs (miRNAs) showing robust differential expression between 31 laser-capture-microdissected nasopharyngeal carcinomas (NPCs) and 10 normal healthy nasopharyngeal epithelial samples. In particular, miRNA mir-29c was expressed at one-fifth the levels in tumors as in normal epithelium. In NPC tumors, the lower mir-29c levels correlated with higher levels of multiple mRNAs whose 3' UTRs can bind mir-29c at target sequences conserved across many vertebrates. In cultured cells, introduction of mir-29c down-regulated these genes at the level of mRNA and inhibited expression of luciferase encoded by vectors having the 3' UTRs of these genes. Moreover, for each of several genes tested, mutating the mir-29c target sites in the 3' UTR abrogated mir-29c-induced inhibition of luciferase expression. Most of the mir-29c-targeted genes identified encode extracellular matrix proteins, including multiple collagens and laminin gamma1, that are associated with tumor cell invasiveness and metastatic potential, prominent characteristics of NPC. Thus, we identify eight miRNAs differentially expressed in NPC and demonstrate the involvement of one in regulating genes involved in metastasis.

MicroRNA 29c is down-regulated in nasopharyngeal carcinomas, up-regulating mRNAs encoding extracellular matrix proteins.

&Agrave; l&#39;aide de proc&eacute;dures de puces tr&egrave;s sensibles, nous avons identifi&eacute; huit microARN (miARN) montrant robuste expression diff&eacute;rentielle entre 31 laser-capture-microdissected des carcinomes nasopharyng&eacute;s (PNJ) et 10 sains nasopharyng&eacute;s &eacute;pith&eacute;liales &eacute;chantillons normaux. En particulier, les miARN mir - 29 &deg; c a &eacute;t&eacute; exprim&eacute; au cinqui&egrave;me niveau dans les tumeurs comme dans l&#39;&eacute;pith&eacute;lium normal. Dans les tumeurs de la PNC, les niveaux inf&eacute;rieurs de mir - 29 &deg; c en corr&eacute;lation avec des niveaux plus &eacute;lev&eacute;s de plusieurs ARNm dont 3&#39; UTR peut lier mir - 29 &deg; c lors de s&eacute;quences cibles conserv&eacute;es &agrave; travers de nombreux vert&eacute;br&eacute;s. Dans les cellules cultiv&eacute;es, introduction de mir - 29 c diminu&eacute;es ces g&egrave;nes au niveau de l&#39;ARNm et inhib&eacute;e d&#39;expression de la lucif&eacute;rase cod&eacute;e par vecteurs ayant la 3&#39; UTR de ces g&egrave;nes. En outre, pour chacun de plusieurs g&egrave;nes test&eacute;s, le mir - 29 c la mutation sites cibles dans la r&eacute;gion 3&#39; UTR abrog&eacute;e inhibition de l&#39;expression de la lucif&eacute;rase induite par le mir-29 c. La plupart des g&egrave;nes cibl&eacute;s mir-29c identifi&eacute;s codent pour des prot&eacute;ines de matrice extracellulaire, y compris plusieurs collag&egrave;nes et laminine gamma1, associ&eacute;s &agrave; envahissant de cellules de tumeur m&eacute;tastatique potentiels, des caract&eacute;ristiques et des NPC. Ainsi, nous identifier huit miARN diff&eacute;rentiellement exprim&eacute;s en NPC et d&eacute;montrer l&#39;implication de l&#39;un dans la r&eacute;gulation des g&egrave;nes impliqu&eacute;s dans les m&eacute;tastases.

MicroARN 29c est diminu&eacute;es des carcinomes nasopharyng&eacute;s, up-r&eacute;gulation des ARNm codant des prot&eacute;ines de la matrice extracellulaire.

Mit hochempfindliche Microarray-basierte Verfahren, haben wir acht MicroRNAs (MiRNAs) zeigen robuste differentielle Ausdruck zwischen 31 Laser-Erfassung-Microdissected Nasen-Rachen-Karzinome (NPCs) und 10 normale gesunde Nasen-Rachen-epitheliale Proben identifiziert. Insbesondere wurde auf ein F&uuml;nftel der Ebenen in Tumoren wie in normalen Epithel MiRNA Mir - 29 c ausgedr&uuml;ckt. In NPC-Tumoren korreliert die unteren Mir - 29 c-Ebenen mit einem h&ouml;heren mehrere mRNAs deren 3&#39;-UTRs Mir - 29 c zur Ziel-Sequenzen, die in vielen Wirbeltieren konserviert binden k&ouml;nnen. In kultivierten Zellen unten-geregelt Einf&uuml;hrung von Mir - 29 c dieser Gene auf der Ebene der mRNA und gehemmter Ausdruck der Luciferase kodiert durch Vektoren mit 3&#39; UTRs dieser Gene. Dar&uuml;ber hinaus f&uuml;r mehrere Gene getestet, mutiert die Mir - 29 c Ziel-Sites in der 3&#39; UTR geabschafft Mir-29 c-induzierte Hemmung der Luciferase-Expression. Die meisten der Mir-29 c-gezielt Gene identifiziert codieren extrazellul&auml;ren Matrix Proteinen, einschlie&szlig;lich mehrerer kollagene und Laminin gamma1, die Tumor Zelle Invasivit&auml;t und metastasiertem potenzielle, markante Merkmale der NPC zugeordnet sind. So wir acht MiRNAs differenziell ausgedr&uuml;ckt in NPC zu identifizieren und die Einbeziehung eines bei der Regulierung von Genen, die in Metastase zu demonstrieren.

MicroRNA 29 c ist unten-geregelt im Nasen-Rachen-Karzinome, bis zur Regelung mRNAs codieren Proteine der extrazellul&auml;ren Matrix.

Utilizzando procedure basate su microarray altamente sensibili, abbiamo individuato otto microRNA (miRNAs) mostrando robusta espressione differenziale tra 31 cattura-laser-microdissected Carcinoma nasofaringeo (NPC) e 10 sani rinofaringei epiteliali campioni normali. In particolare, miRNA mir-29 c &egrave; stata espressa a un quinto livello in tumori come nel normale epitelio. Nei tumori NPC, i pi&ugrave; bassi livelli di mir-29 c correlata con livelli pi&ugrave; elevati di mRNA multipli cui UTRs 3&#39; possibile associare mir-29 c a bersaglio sequenze conservate in molti vertebrati. In cellule in coltura, introduzione di mir-29 c gi&ugrave;-regolato questi geni a livello di mRNA e inibito espressione della luciferasi codificato da vettori avendo 3&#39; UTRs di questi geni. Inoltre, per ciascuno dei diversi geni testati, mutando la destinazione c mir-29 siti nel 3&#39; UTR abrogata mir-29 c-indotta di inibizione dell&#39;espressione della luciferasi. La maggior parte dei mir-29 c-mirati geni identificati codificano proteine di matrice extracellulare, compreso pi&ugrave; collageni e laminina gamma1, che sono associate con invasivit&agrave; delle cellule tumorali e caratteristiche prominenti, potenziale metastatiche di NPC. Cos&igrave;, noi identificare otto miRNAs differenzialmente espressi in NPC e dimostrare il coinvolgimento di uno nella regolazione dei geni coinvolti nella metastasi.

MicroRNA 29C &egrave; down-regolato in carcinomi nasofaringei, up-regolazione mRNA codificano per proteine della matrice extracellulare.

&#x9AD8;&#x611F;&#x5EA6;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4; &#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B8;&#x30E3;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x5805;&#x7262;&#x306A;&#x5DEE;&#x52D5;&#x5F0F; 31 &#x30EC;&#x30FC;&#x30B6;&#x30FC; &#x30AD;&#x30E3;&#x30D7;&#x30C1;&#x30E3; microdissected &#x4E0A;&#x54BD;&#x982D;&#x764C; (Npc) &#x3068; 10 &#x901A;&#x5E38;&#x5065;&#x5EB7;&#x306A;&#x9F3B;&#x54BD;&#x982D;&#x4E0A;&#x76AE;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x9593;&#x3092;&#x793A;&#x3059; 8 &#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; Rna &#xFF08;Mirna&#xFF09; &#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x7279;&#x306B;&#x3001;miRNA &#x30DF;&#x30FC;&#x30EB; 29 c 5 &#x5206;&#x306E; 1 &#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x6B63;&#x5E38;&#x4E0A;&#x76AE;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x816B;&#x760D;&#x3067;&#x767A;&#x73FE;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;.NPC &#x306E;&#x816B;&#x760D;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x4E0B;&#x4F4D;&#x306E;&#x30DF;&#x30FC;&#x30EB; 29 c &#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x305D;&#x306E; 3&#39; UTRs &#x30DF;&#x30FC;&#x30EB; 29 c &#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x810A;&#x690E;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x8907;&#x6570;&#x306E; Mrna &#x306E;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x9AD8;&#x3044;&#x76F8;&#x95A2;&#x3002;&#x57F9;&#x990A;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;&#x30DF;&#x30FC;&#x30EB; 29 c &#x306E;&#x7D39;&#x4ECB;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3; - &#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E; mRNA &#x306E;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x6291;&#x5236;&#x5F0F; 3&#39; UTRs &#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x30D9;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30EB;&#x30B7;&#x30D5;&#x30A7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x898F;&#x5236;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x3001;&#x30DF;&#x30FC;&#x30EB; 29 c &#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x5909;&#x7570;&#x306E;&#x5404;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3067; 3&#39; UTR &#x30EB;&#x30B7;&#x30D5;&#x30A7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x30DF;&#x30FC;&#x30EB; 29 c &#x8A98;&#x5C0E;&#x963B;&#x5BB3; abrogated&#x3002;&#x8B58;&#x5225;&#x30DF;&#x30FC;&#x30EB; 29 c &#x6A19;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306F;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x7D30;&#x80DE;&#x4FB5;&#x8972;&#x6027;&#x3068;&#x8EE2;&#x79FB;&#x6027;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x8457;&#x540D;&#x306A;&#x7279;&#x6027;&#x306E; NPC &#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x30B3;&#x30E9;&#x30FC;&#x30B2;&#x30F3;&#x53CA;&#x3073;&#x30E9;&#x30DF;&#x30CB;&#x30F3; gamma1 &#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x7D30;&#x80DE;&#x5916;&#x30DE;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005; 8 miRNAs &#x306E;&#x5168;&#x4EBA;&#x4EE3;&#x3067;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306B;&#x8868;&#x73FE;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x3001;&#x8EE2;&#x79FB;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x898F;&#x5236;&#x3059;&#x308B; 1 &#x3064;&#x306E;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

29 C &#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; Rna &#x306F;&#x3001;&#x4E0A;&#x54BD;&#x982D;&#x764C;, &#x30A2;&#x30C3;&#x30D7;&#x3092;&#x898F;&#x5236;&#x3059;&#x308B; Mrna &#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x5916;&#x30DE;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3;&#x898F;&#x5236;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#xB9E4;&#xC6B0; &#xBBFC;&#xAC10;&#xD55C; microarray &#xAE30;&#xBC18; &#xC808;&#xCC28;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;, 8 microRNAs (miRNAs) &#xD398;&#xC774;&#xC9C0; 31 &#xB808;&#xC774;&#xC800; &#xCEA1;&#xCC98; microdissected nasopharyngeal carcinomas (NPCs)&#xC640; 10 &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xAC74;&#xAC15; &#xD55C; nasopharyngeal &#xC0C1;&#xD53C; &#xC0D8;&#xD50C; &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD; &#xD30C;&#xC545;. &#xD2B9;&#xD788;, &#xBBF8;&#xB974; &#xBBF8;&#xB974;-29 c &#xC815;&#xC0C1; &#xC0C1;&#xD53C;&#xC640; &#xAC19;&#xC774; &#xC885;&#xC591;&#xC758; 5 &#xBD84;&#xC758; 1 &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD45C;&#xD604; &#xD588;&#xB2E4;. NPC &#xC885;&#xC591;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBBF8;&#xB974;-29 c &#xC800;&#xC218;&#xC900;&#xC758; 3&#39; Utr &#xB9CE;&#xC740; &#xCC99;&#xCD94; &#xB3D9;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; &#xBCF4;&#xC874; &#xB300;&#xC0C1; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBBF8;&#xB974;-29 c&#xB97C; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC5EC;&#xB7EC; Mrnas&#xC758; &#xC0C1;&#xBD80;&#xC640; &#xC0C1;&#xAD00; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xBC30;&#xC591;&#xB41C; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0; &#xB3C4;&#xC785; &#xBBF8;&#xB974;-29 c &#xB2E4;&#xC6B4; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774;&#xD2B8; &#xB41C; mRNA &#xC218;&#xC900;&#xACFC; &#xB370;&#xB294; 3&#39; Utr&#xC774;&#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xBCA1;&#xD130;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC778;&#xCF54;&#xB529;&#xB41C; &#xB8E8;&#xC2DC;&#xD398;&#xB77C;&#xC544;&#xC81C;&#xC758; &#xC800;&#xD574; &#xD45C;&#xD604;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790;. &#xB610;&#xD55C;, &#xAC01; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8;, &#xBBF8;&#xB974; 29 c &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774; &#xB300; &#xD55C; &#xB300;&#xC0C1; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xB294; 3&#39; UTR &#xBBF8;&#xB974; 29 c &#xC720;&#xBC1C; &#xC5B5;&#xC81C; &#xB8E8;&#xC2DC;&#xD398;&#xB77C;&#xC544;&#xC81C; &#xC2DD;&#xC758; &#xD3D0;&#xC9C0;. &#xB300;&#xBD80;&#xBD84; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xBBF8;&#xB974; 29 c &#xD0C0;&#xAC9F; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC138;&#xD3EC; &#xC678; &#xAE30;&#xC9C8; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;, &#xC5EC;&#xB7EC; &#xCF5C;&#xB77C;&#xAC90; &#xBC0F; laminin gamma1&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xC885;&#xC591; &#xC138;&#xD3EC; &#xCE68;&#xC785; &#xBC0F; NPC&#xC758; &#xC804;&#xC774;&#xC131; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778;, &#xC800;&#xBA85;&#xD55C; &#xD2B9;&#xC131;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB41C; &#xC778;&#xCF54;&#xB529;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xC6B0;&#xB9AC; 8 miRNAs &#xCC28;&#xB3D9; NPC &#xB2E8;&#xC704;&#xB85C; &#xD30C;&#xC545; &#xD558; &#xACE0; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC804;&#xC774;&#xC5D0; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0;&#xC758; &#xCC38;&#xC5EC;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

MicroRNA 29 c &#xB2E4;&#xC6B4; nasopharyngeal carcinomas, &#xCD5C;&#xB300; &#xC870;&#xC808; mRNAs &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xC138;&#xD3EC; &#xC678; &#xAE30;&#xC9C8; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADDC;&#xC81C; &#xC774;&#xB2E4;.

Utilizando procedimientos basados en microarray altamente sensibles, se identificaron ocho microRNAs (miRNAs) mostrando robusta expresi&oacute;n diferencial entre 31 l&aacute;ser-captura-microdissected carcinomas nasofar&iacute;ngeos (PNJ) y muestras epiteliales nasofar&iacute;ngeas sanas normales 10. En particular, miRNA mir - 29C fue expresado en una quinta parte de los niveles en los tumores como en el epitelio normal. En tumores NPC, los niveles m&aacute;s bajos de mir - 29C correlacionan con niveles m&aacute;s altos de los mRNAs m&uacute;ltiples cuyo genoma 3&#39; puede enlazar mir - 29C en secuencias Diana conservadas a trav&eacute;s de muchos vertebrados. En c&eacute;lulas cultivadas, introducci&oacute;n de mir - 29C regula estos genes en los niveles de mRNA y expresi&oacute;n inhibido de luciferasa codificada por vectores tener los 3&#39; genoma de estos genes. Por otra parte, para cada uno de los varios genes probados, mutando el mir - c 29 sitios de destino en el 3&#39; UTR abrogado mir-29 c-inducida por la inhibici&oacute;n de la expresi&oacute;n de la luciferasa. La mayor&iacute;a de los genes orientada a mir-29C identificados codifica prote&iacute;nas de matriz extracelular, incluyendo m&uacute;ltiples col&aacute;genos y gamma1 laminina, que se asocian a la invasi&oacute;n de c&eacute;lulas tumorales y caracter&iacute;sticas prominentes, potenciales metast&aacute;sicas de NPC. As&iacute;, identificamos ocho miRNAs expresados diferencialmente en NPC y demostrar la implicaci&oacute;n de uno en la regulaci&oacute;n de genes implicados en met&aacute;stasis.

MicroRNA 29C es regula en carcinomas nasofar&iacute;ngeos, mRNAs para arriba-regulaci&oacute;n que codifican las prote&iacute;nas de matriz extracelular.

Epstein-Barr Virus (EBV) encodes multiple microRNAs (miRNAs) from two primary transcripts, BHRF1 and the BARTs. The expression of BHRF1 miRNAs is dependent on the type of viral latency, whereas the BART miRNAs are expressed in cells during all forms of latency. It is not known how these miRNAs are otherwise regulated, though. We have used quantitative, stem-loop, real-time PCR to measure the expression of EBV's miRNAs and found them to differ nearly 50- and 25-fold among all tested cell lines and among EBV-positive Burkitt's lymphomas, respectively. In addition, the expression of individual BART miRNAs within a cell can differ by 50-fold or more despite the fact these miRNAs are likely transcribed together as a single primary transcript. These measurements are illuminating: they indicate that few of EBV's miRNAs are expressed at levels comparable to those of cellular miRNAs in most cell lines and therefore likely function interdependently.

The microRNAs of Epstein-Barr Virus are expressed at dramatically differing levels among cell lines.

&#x7231;&#x6CFC;&#x65AF;&#x5766;-&#x5DF4;&#x5C14;&#x75C5;&#x6BD2; &#xFF08;EBV&#xFF09; &#x5BF9;&#x591A;&#x4E2A; Microrna (Mirna) &#x4ECE;&#x4E24;&#x4E2A;&#x4E3B;&#x8981;&#x7684;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#xFF0C;BHRF1 &#x548C; BARTs &#x8FDB;&#x884C;&#x7F16;&#x7801;&#x3002;BHRF1 Mirna &#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x662F;&#x4F9D;&#x8D56;&#x4E8E;&#x7C7B;&#x578B;&#x7684;&#x75C5;&#x6BD2;&#x6F5C;&#x4F0F;&#x671F;&#xFF0C;&#x800C; BART Mirna &#x5728;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x8868;&#x793A;&#x671F;&#x95F4;&#x6240;&#x6709;&#x5F62;&#x5F0F;&#x7684;&#x6EDE;&#x540E;&#x65F6;&#x95F4;&#x3002;&#x5B83;&#x4E0D;&#x77E5;&#x9053;&#x5982;&#x4F55;&#x8FD9;&#x4E9B; Mirna &#x5426;&#x5219;&#x76D1;&#x7BA1;&#xFF0C;&#x4E0D;&#x8FC7;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7528;&#x5B9A;&#x91CF;&#x3001; &#x5E72;&#x5FAA;&#x73AF;&#xFF0C;&#x5B9E;&#x65F6;&#x8367;&#x5149;&#x5B9A;&#x91CF; PCR &#x6765;&#x8861;&#x91CF; EBV &#x7684; Mirna &#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x5E76;&#x53D1;&#x73B0;&#x5176;&#x4E0D;&#x540C;&#x8FD1; 50-&#x548C;&#x4E8C;&#x5341;&#x4E94;&#x500D;&#x548C; EBV &#x9633;&#x6027;&#x4F2F;&#x57FA;&#x7279;&#x6C0F;&#x6DCB;&#x5DF4;&#x7624;&#x4E4B;&#x95F4;&#x6240;&#x6709;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x884C;&#x5206;&#x522B;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x5728;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x5185;&#x7684;&#x4E2A;&#x522B; BART Mirna &#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x53EF;&#x4EE5;&#x76F8;&#x5DEE; 50-fold &#x6216;&#x66F4;&#x591A;&#xFF0C;&#x5C3D;&#x7BA1;&#x8FD9;&#x4E9B; Mirna &#x662F;&#x53EF;&#x80FD;&#x4E00;&#x8D77;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x5355;&#x4E2A;&#x4E3B;&#x8C08;&#x8BDD;&#x5168;&#x6587;&#x8F6C;&#x5F55;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6D4B;&#x91CF;&#x7ED3;&#x679C;&#x662F;&#x7167;&#x660E;&#xFF1A; &#x5B83;&#x4EEC;&#x8868;&#x660E;&#x5F88;&#x5C11;&#x6709; EBV &#x7684; Mirna &#x4F9D;&#x5B58;&#x5728;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x7EC6;&#x80DE;&#x682A;&#x548C;&#x56E0;&#x6B64;&#x53EF;&#x80FD;&#x529F;&#x80FD;&#x7EC6;&#x80DE; Mirna &#x76F8;&#x82E5;&#x6C34;&#x5E73;&#x91CC;&#x8868;&#x793A;&#x3002;

&#x7231;&#x6CFC;&#x65AF;&#x5766;-&#x5DF4;&#x5C14;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684; Microrna &#x8868;&#x8FBE;&#x5728;&#x5927;&#x5927;&#x4E0D;&#x540C;&#x7EA7;&#x522B;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x884C;&#x3002;

Virus d&#39;Epstein - Barr (EBV) encode multiples microARN (miARN) de deux transcrits primaires, BHRF1 et le Barth. L&#39;expression de BHRF1 miARN est d&eacute;pendante du type de latence virale, tandis que les miARN de BART est exprim&eacute;es dans les cellules au cours de toutes les formes de latence. On ne sait pas comment ces miARN est par ailleurs r&eacute;glement&eacute;es, cependant. Nous avons utilis&eacute; quantitative, tige-boucle, PCR en temps r&eacute;el pour mesurer l&#39;expression des miARN du EBV et a constat&eacute; qu&#39;elles diff&egrave;rent presque 50 et 25 fois parmi toutes les lign&eacute;es cellulaires test&eacute;es et les lymphomes du lymphome de Burkitt EBV positif, respectivement. En outre, l&#39;expression des miARN de BART individuels au sein d&#39;une cellule peut diff&eacute;rer par 50 fois ou plus, malgr&eacute; le fait que ces miARN est probablement transcrit ensemble comme un seul transcrit primaire. Ces mesures sont allum&eacute;s : ils indiquent que peu des miARN du EBV sont exprim&eacute;s &agrave; des niveaux comparables &agrave; ceux des miARN cellulaires dans la plupart des lign&eacute;es de cellules et donc probablement fonction interd&eacute;pendante.

Les micro-ARN du Virus Epstein - Barr est exprim&eacute;es sous forme radicalement diff&eacute;rents niveaux entre les lign&eacute;es cellulaires.

Epstein - Barr-Virus (EBV) kodiert mehrere MicroRNAs (MiRNAs) aus zwei prim&auml;re Abschriften, BHRF1 und die BARTs. Der Ausdruck der BHRF1 MiRNAs ist abh&auml;ngig vom Typ der virale Latenz, w&auml;hrend der BART MiRNAs in Zellen bei allen Formen der Latenz ausgedr&uuml;ckt werden. Es ist nicht bekannt, wie diese MiRNAs anders, aber reguliert werden. Wir haben verwendet quantitative, Stem-Loop, Echtzeit-PCR zur Messung des Ausdrucks der EBV die MiRNAs und fand sie fast 50 - und 25 - 8-fach unter allen getesteten Zelllinien und den EBV-positiv Burkitt-Lymphome, bzw. abweichen. Dar&uuml;ber hinaus kann der Ausdruck der individuellen BART MiRNAs innerhalb einer Zelle unterscheiden sich durch 50-fold oder mehr, trotz der Tatsache, die diese MiRNAs wahrscheinlich zusammen als eine einzelne prim&auml;re Transkript transkribiert werden. Diese Messungen sind aufschlussreich: sie zeigen, dass nur wenige der EBV die MiRNAs Argumentationskette auf Ebenen vergleichbar mit denen der zellul&auml;ren MiRNAs in den meisten Zelllinien und daher wahrscheinlich Funktion ausgedr&uuml;ckt werden.

Die MicroRNAs des Epstein - Barr-Virus werden in ausgedr&uuml;ckt drastisch unterschiedlichem unter Zelllinien.

Virus di Epstein - Barr (EBV) codifica pi&ugrave; microRNA (miRNAs) da due trascrizioni primarie, BHRF1 e il BARTs. L&#39;espressione di miRNAs BHRF1 &egrave; dipendente dal tipo di latenza virale, considerando che i miRNAs BART sono espressi nelle cellule durante tutte le forme di latenza. Non &egrave; noto come questi miRNAs sono diversamente regolati, per&ograve;. Abbiamo usato quantitativa, gambo-ciclo, PCR in tempo reale per misurare l&#39;espressione di miRNAs di EBV e li ha trovati a differire quasi 50 - e 25 volte tra tutte le linee cellulari testate e tra i linfomi di Burkitt EBV-positivi, rispettivamente. Inoltre, l&#39;espressione dei singoli BART miRNAs all&#39;interno di una cella pu&ograve; differire da 50 volte o pi&ugrave;, nonostante il fatto che questi miRNAs sono probabilmente trascritto insieme come una singola trascrizione primaria. Queste misurazioni sono illuminanti: essi indicano che alcuni dei miRNAs di EBV sono espressi a livelli paragonabili a quelle dei cellulari miRNAs nella maggior parte delle linee cellulari e quindi probabile funzione interdipendente.

I microRNA del Virus Epstein - Barr &egrave; espresse a livelli notevolmente differenti tra le linee di cellule.

&#x30A8;&#x30D7;&#x30B9;&#x30BF;&#x30A4;&#x30F3;&#x30D0;&#x30FC; &#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9; &#xFF08;EBV&#xFF09; 2 &#x3064;&#x306E;&#x4E3B;&#x306A;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3; &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x3001;BHRF1 &#x3068;&#x3001;&#x30BB;&#x30F3;&#x30C8;&#x30D0;&#x30FC;&#x30C4;&#x304B;&#x3089;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; Rna &#xFF08;Mirna&#xFF09; &#x3092;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30D0;&#x30FC;&#x30C8; miRNAs &#x5F85;&#x6A5F;&#x6642;&#x9593;&#x4E2D;&#x306B;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;&#x767A;&#x73FE;&#x306B;&#x5BFE;&#x3057; BHRF1 miRNAs &#x306E;&#x5F0F;&#x306F;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x6F5C;&#x4F0F;&#x306E;&#x7A2E;&#x985E;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x308C;&#x306F;&#x3069;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E; miRNAs &#x305D;&#x308C;&#x4EE5;&#x5916;&#x306E;&#x5834;&#x5408;&#x3082;&#x898F;&#x5236;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x304C;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B; EBV &#x306E; miRNAs &#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x3057;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x304C;&#x307B;&#x307C; 50 &#x301C; &#x3068; 25 &#x500D;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8; &#x30BB;&#x30EB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x3068; EBV &#x967D;&#x6027;&#x30D0;&#x30FC;&#x30AD;&#x30C3;&#x30C8; &#x30EA;&#x30F3;&#x30D1;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x5224;&#x660E;&#x3059;&#x308B;&#x30EA;&#x30A2;&#x30EB;&#x30BF;&#x30A4;&#x30E0; PCR &#x5B9A;&#x91CF;&#x3001;&#x5E79;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x30BB;&#x30EB;&#x5185;&#x306E;&#x500B;&#x3005; &#x306E; BART miRNAs &#x306E;&#x8868;&#x73FE; 50-fold &#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x8907;&#x6570;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E; miRNAs &#x306F;&#x4E00;&#x7DD2;&#x306B;&#x3001;&#x5358;&#x4E00;&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30EA; &#x30C8;&#x30E9;&#x30F3; &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x8EE2;&#x5199;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x4E8B;&#x5B9F;&#x306B;&#x3082;&#x304B;&#x304B;&#x308F;&#x3089;&#x305A;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x7570;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x3092;&#x7167;&#x5C04;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#xFF1A; &#x5F7C;&#x3089;&#x306F; EBV &#x306E; miRNAs &#x306E;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E; miRNAs &#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x9AD8;&#x3044;&#x95A2;&#x6570;&#x3067;&#x306B;&#x5339;&#x6575;&#x3059;&#x308B;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3042;&#x3063;&#x3066;&#x8868;&#x73FE;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30A8;&#x30D7;&#x30B9;&#x30BF;&#x30A4;&#x30F3; &#x2010; &#x30D0;&#x30FC;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; Rna &#x3067;&#x8868;&#x73FE;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x57F9;&#x990A;&#x7D30;&#x80DE;&#x9593;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x5287;&#x7684;&#x306B;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x3002;

&#xC5E1; &#xC2A4;&#xD0C0;&#xC778;-&#xBC14; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; (EBV) &#xB450; &#xAE30;&#xBCF8; &#xC0AC;&#xBCF8;, bhrf1&#xC640;&#xB294; &#xBC14;&#xD2B8;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5EC;&#xB7EC; Micrornas&#xB97C; (miRNAs)&#xC744; &#xC778;&#xCF54;&#xB529;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. BHRF1 Mirnas&#xC758; &#xC2DD; &#xBC14;&#xD2B8; Mirnas&#xB294; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xD615;&#xD0DC;&#xC758; &#xB300;&#xAE30; &#xC2DC;&#xAC04; &#xB3D9;&#xC548; &#xC140;&#xC5D0; &#xD45C;&#xC2DC; &#xD558;&#xB294; &#xBC18;&#xBA74; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xB300;&#xAE30; &#xC2DC;&#xAC04;, &#xC885;&#xB958;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xB2EC;&#xB77C; &#xC9D1;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5B4;&#xB5BB;&#xAC8C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; Mirnas&#xB294; &#xB2EC;&#xB9AC; &#xADDC;&#xC81C;, &#xADF8;&#xB7FC;&#xC5D0;&#xB3C4; &#xBD88;&#xAD6C; &#xD558; &#xACE0; &#xBAA8;&#xB978;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; EBV&#xC758; Mirnas&#xC758; &#xC2DD;&#xC744; &#xCE21;&#xC815; &#xD558; &#xC5EC; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC774; &#xB2E4; &#xAC70;&#xC758; 50-&#xACE0; 25 &#xBC30; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC140; &#xC120; &#xC911; &#xACE0; EBV &#xC591;&#xC131; Burkitt lymphomas &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; &#xAC01;&#xAC01; &#xBC1C;&#xACAC; &#xC2E4;&#xC2DC;&#xAC04; PCR &#xC904;&#xAE30; &#xB8E8;&#xD504; &#xC591;&#xC801;. &#xB610;&#xD55C;, &#xC140; &#xB0B4; &#xAC1C;&#xBCC4; &#xBC14;&#xD2B8; Mirnas&#xC758; &#xC2DD; 50-fold &#xB610;&#xB294; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; miRNAs &#xD655;&#xB960;&#xC774; &#xD568;&#xAED8; &#xB2E8;&#xC77C; &#xAE30;&#xBCF8; &#xB300; &#xBCF8;&#xC73C;&#xB85C; &#xBCC0;&#xD558;&#xAC8C; &#xD558;&#xB294; &#xC0AC;&#xC2E4;&#xC5D0;&#xB3C4; &#xBD88;&#xAD6C; &#xD558; &#xACE0; &#xB354; &#xB9CE;&#xC740; &#xB2E4;&#xB97C; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xCE21;&#xC815;&#xC740; &#xC870;&#xBA85;: EBV&#xC758; Mirnas&#xC758; &#xBA87;&#xBA87; &#xC218;&#xC900; &#xADF8; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xC140; &#xB77C;&#xC778; &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC774; &#xD568;&#xC218;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC140;&#xB8F0;&#xB7EC; Mirnas&#xC758; &#xBE44;&#xAD50;&#xC5D0;&#xC11C; interdependently &#xD45C;&#xD604; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC5E1; &#xC2A4;&#xD0C0;&#xC778;-&#xBC14; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xC758; Micrornas&#xC5D0;&#xC11C; &#xD45C;&#xD604; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xADF9;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC218;&#xC900;&#xC758; &#xC140; &#xB77C;&#xC778; &#xC911;.

Virus de Epstein - Barr (EBV) codifica m&uacute;ltiples microRNAs (miRNAs) de dos transcripciones primarias, BHRF1 y los BARTs. La expresi&oacute;n de miRNAs BHRF1 depende en el tipo de latencia viral, mientras que los miRNAs BART se expresan en c&eacute;lulas durante todas las formas de latencia. No se sabe c&oacute;mo estos miRNAs son otra manera reguladas, aunque. Hemos utilizado cuantitativa, v&aacute;stago-lazo, PCR en tiempo real para medir la expresi&oacute;n de miRNAs de EBV y encontr&oacute; que diferencian respectivamente casi 50 - y 10.25 doblez entre todas las l&iacute;neas de celular probado y linfomas de Burkitt EBV-positivo,. Adem&aacute;s, la expresi&oacute;n de miRNAs de BART individuales dentro de una c&eacute;lula puede diferir por ha o m&aacute;s, a pesar de que estos miRNAs es probable que transcribe juntos como una sola transcripci&oacute;n primaria. Estas mediciones son esclarecedores: indican que pocos de miRNAs de EBV se expresan en niveles comparables a los de miRNAs celular en la mayor&iacute;a de las l&iacute;neas celulares y por lo tanto probable funci&oacute;n independientemente.

Los microRNAs de Virus de Epstein - Barr se expresan en dram&aacute;ticamente diferentes niveles entre l&iacute;neas celulares.

(ES) &#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x80DA;&#x80CE;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8868;&#x73B0;&#x51FA;&#x6BD4;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x4F53;&#x7EC6;&#x80DE;&#x77ED; G(1) &#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x9636;&#x6BB5;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5BA1;&#x67E5;&#x4E30;&#x5BCC;&#x3001; &#x4EBA;&#x7C7B; ES &#x7EC6;&#x80DE;&#x6D53;&#x7F29; microRNA&#xFF0C;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9; 92b&#xFF0C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x5206;&#x5E03;&#x4E2D;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B; ES &#x7684;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9; 92b &#x4E2D;&#x66F4;&#x591A;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x7ED3;&#x679C;&#x5728; G(1) &#x9636;&#x6BB5;&#x548C;&#x8F83;&#x5C0F;&#x7684;&#x6570;&#x5B57;&#x5728; S &#x671F;&#x3002;&#x76F8;&#x53CD;&#xFF0C;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9; 92b &#x5206;&#x5316;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x5728; G1 &#x671F;&#xFF0C;S &#x671F;&#x589E;&#x52A0;&#x7684;&#x6B21;&#x6570;&#x7ED3;&#x679C;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x6570;&#x76EE;&#x51CF;&#x5C11;&#x3002;p57&#xFF0C;&#x5176;&#x4EA7;&#x54C1;&#x5411; S &#x671F;&#x8FDB;&#x5C55;&#x6291;&#x5236; G(1) &#x57FA;&#x56E0;&#x662F;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9; 92b &#x9884;&#x6D4B;&#x6307;&#x6807;&#x4E4B;&#x4E00;&#x3002;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9; 92b &#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x80DA;&#x80CE;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x589E;&#x52A0; p57 &#x86CB;&#x767D;&#x6C34;&#x5E73;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5206;&#x5316;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5728;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9; 92b &#x8868;&#x8FBE;&#x51CF;&#x5C11; p57 &#x86CB;&#x767D;&#x6C34;&#x5E73;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9; 92b &#x6291;&#x5236;&#x4E00;&#x79CD;&#x8367;&#x5149;&#x7D20;&#x9176;&#x8BB0;&#x8005;&#x6784;&#x9020;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x5305;&#x542B;&#x7684;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9; 92b &#x79CD;&#x5B50;&#x5E8F;&#x5217;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x76EE;&#x6807;&#x7684; p57 &#x57FA;&#x56E0; 3&#39; &#x975E;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x533A;&#x7684;&#x4E00;&#x90E8;&#x5206;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8868;&#x660E;&#xFF0C;&#x7C73;&#x5C14;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9;-92b &#x76F4;&#x63A5;&#x6C34;&#x5E73; G (1) /S &#x68C0;&#x67E5;&#x7AD9;&#x57FA;&#x56E0; p57 &#x7684;&#x75C5;&#x6BD2;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE; 2009&#x5E74; &#xFF1B; 27:1524-1528&#x5E74;&#x3002;

MicroRNA 92b &#x63A7;&#x5236; G1/S &#x68C0;&#x67E5;&#x70B9;&#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x80DA;&#x80CE;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E2D;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0; p57&#x3002;

Human embryonic stem (ES) cells exhibit a shorter G(1) cell cycle phase than most somatic cells. Here, we examine the role of an abundant, human ES cell-enriched microRNA, miR-92b, in cell cycle distribution. Inhibition of miR-92b in human ES cells results in a greater number of cells in the G(1) phase and a lower number in the S phase. Conversely, overexpression of miR-92b in differentiated cells results in a decreased number of cells in G1 phase and an increased number in S-phase. p57, a gene whose product inhibits G(1) to S-phase progression, is one of the predicted targets of miR-92b. Inhibition of miR-92b in human ES cells increases p57 protein levels, and miR-92b overexpression in differentiated cells decreases p57 protein levels. Furthermore, miR-92b inhibits a luciferase reporter construct that includes part of the 3' untranslated region of the p57 gene containing the predicted target of the miR-92b seed sequence. Thus, we show that the miRNA miR-92b directly downregulates protein levels of the G(1)/S checkpoint gene p57. STEM CELLS 2009;27:1524-1528.

MicroRNA 92b controls the G1/S checkpoint gene p57 in human embryonic stem cells.

Souches embryonnaires humaines (ES) cellules pr&#xE9;sentent une plus courte G (1) phase du cycle cellulaire de la plupart des cellules somatiques. Ici, nous examinons le r&#xF4;le d&#x26;#39;une abondante, ES enrichie en cellules microARN humains, miR-92b, dans la distribution du cycle cellulaire. L&#x26;#39;inhibition de miR-92b dans les cellules souches embryonnaires humaines en r&#xE9;sulte un plus grand nombre de cellules dans le G (1) de phase et un nombre inf&#xE9;rieur dans la phase S. A l&#x26;#39;inverse, la surexpression de miR-92b dans les r&#xE9;sultats des cellules diff&#xE9;renci&#xE9;es en une diminution du nombre de cellules en phase G1 et une augmentation du nombre dans la phase S. p57, un g&#xE8;ne dont le produit inhibe G (1) &#xE0; S-phase de progression, est l&#x26;#39;un des objectifs pr&#xE9;vus de miR-92b. L&#x26;#39;inhibition de miR-92b dans les cellules souches embryonnaires humaines augmente la teneur en prot&#xE9;ines p57, et miR-92b surexpression dans des cellules diff&#xE9;renci&#xE9;es diminue la teneur en prot&#xE9;ines p57. Par ailleurs, miR-92b inhibe une construction rapporteur de la lucif&#xE9;rase qui inclut une partie de la r&#xE9;gion 3 &#x26;#39;non traduite du g&#xE8;ne p57 contenant la cible pr&#xE9;vue de la s&#xE9;quence miR-92b semences. Ainsi, nous montrons que le miARN miR-92b r&#xE9;gule &#xE0; la baisse directement les taux de prot&#xE9;ines de la G (1) / g&#xE8;ne p57 S checkpoint. CELLULES SOUCHES 2009; 27:1524-1528.

MicroRNA 92b Contr&#xF4;le Gene G1 / S P57 Checkpoint en cellules souches embryonnaires humaines

Menschliche embryonale Stammzellen (ES) weisen eine k&uuml;rzere G(1) Zellzyklus-Phase als die meisten K&ouml;rperzellen. Hier untersuchen wir die Rolle der eine reiche, menschliche ES Zelle angereicherten MicroRNA, MiR-92b, Zellzyklus-Distribution. Hemmung der MiR-92b in menschlichen ES Zellen f&uuml;hrt zu einer gr&ouml;&szlig;eren Anzahl von Zellen in der G(1)-Phase und eine geringere Anzahl in der S-Phase. Umgekehrt f&uuml;hrt eine &Uuml;berexpression von MiR-92b in differenzierten Zellen einer reduzierten Anzahl von Zellen in der G1-Phase und eine erh&ouml;hte Anzahl in S-Phase. P57, ein Gen, dessen Produkt G(1) bis zum Fortschreiten der S-Phase, hemmt, geh&ouml;rt zu den prognostizierten Ziele von MiR-92b. Hemmung der MiR-92b in den menschlichen ES Zellen erh&ouml;ht p57-Protein-Ebene, und MiR-92b &Uuml;berexpression in differenzierten Zellen verringert p57-Protein-Ebene. MiR-92b hemmt dar&uuml;ber hinaus ein Luciferase Reporter-Konstrukt, das in der 3&#39; un&uuml;bersetzte Region des Gens p57 mit vorhergesagten vorbei der MiR-92b Saatgut-Sequenz enth&auml;lt. So zeigen wir, dass die MiRNA-MiR-92b direkt Downregulates Protein-Ebene von der G (1) / s Pr&uuml;fpunkt gen p57. STAMMZELLEN-2009; 27:1524-1528.

MicroRNA 92b steuert die G1/S Pr&uuml;fpunkt gen p57 in humanen embryonalen Stammzellen.

Le cellule staminali embrionali umane (ES) esibiscono una fase del ciclo cellulare g (1) pi&ugrave; breve rispetto la maggior parte delle cellule somatiche. Qui, si esamina il ruolo di un abbondante, umano ES arricchito cella microRNA, miR-92b, nella distribuzione del ciclo cellulare. Inibizione di miR-92b in human ES cells risultati in un numero maggiore di cellule nella fase g (1) e un numero inferiore in fase S. Al contrario, sovraespressione di miR-92b in cellule differenziate provoca una riduzione del numero di cellule in fase G1 e un aumento del numero nella fase S. P57, un gene il cui prodotto inibisce g (1) alla progressione di fase S, &egrave; uno degli obiettivi previsti di miR-92b. Inibizione di miR-92b in cellule ES umane aumenta i livelli di proteina p57 e miR-92b sovraespressione in cellule differenziate diminuisce i livelli di proteina p57. Inoltre, miR-92b inibisce un costrutto di reporter luciferasi che comprende parte della regione 3&#39; non tradotta del gene p57 contenente la destinazione prevista della sequenza miR-92b seme. Cos&igrave;, ci mostrano che il miRNA miR-92b sottoregola direttamente livelli di proteina del G (1) /S checkpoint gene p57. CELLULE STAMINALI 2009; 27:1524-1528.

MicroRNA 92b controlla il p57 G1/S checkpoint genica in cellule staminali embrionali umane.

&#x30D2;&#x30C8;&#x80DA;&#x6027;&#x5E79;&#xFF08;ES&#xFF09;&#x7D30;&#x80DE;&#x306F;&#x3001;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x4F53;&#x7D30;&#x80DE;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x77ED;&#x3044;G&#xFF08;1&#xFF09;&#x7D30;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x306E;&#x4F4D;&#x76F8;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x5206;&#x5E03;&#x306E;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;ES&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x5BCC;&#x3080;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;RNA&#x306E;miR-92b&#x3068;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x307E;&#x3059;&#x3002; G&#xFF08;1&#xFF09;&#x76F8;&#x3068;S&#x76F8;&#x306E;&#x4F4E;&#x3044;&#x6570;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x3088;&#x308A;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x30D2;&#x30C8;ES&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3067;&#x306F;miR-92b&#x3068;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x3002;&#x9006;&#x306B;&#x3001;G1&#x671F;&#x3068;S&#x671F;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x6570;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x6570;&#x306E;&#x6E1B;&#x5C11;&#x306B;&#x5206;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3067;&#x306F;miR-92b&#x3068;&#x306E;&#x904E;&#x5270;&#x767A;&#x73FE;&#x3002; P57&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x88FD;&#x54C1;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3059;&#x308B;G&#xFF08;1&#xFF09;S-&#x76F8;&#x3078;&#x306E;&#x9032;&#x884C;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x3001;&#x306E;miR-92b&#x3068;&#x306E;&#x4E88;&#x6E2C;&#x76EE;&#x6A19;&#x306E;&#x4E00;&#x3064;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30D2;&#x30C8;ES&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;&#x306E;miR-92b&#x3068;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x306F;&#x3001;p57&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x5897;&#x52A0;&#x3057;&#x3001;&#x5206;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x7D30;&#x80DE;&#x3067;&#x306E;miR-92b&#x3068;&#x904E;&#x5270;&#x767A;&#x73FE;&#x306F;&#x3001;p57&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3055;&#x305B;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x306E;miR-92b&#x3068;&#x306F;&#x3001;miR-92b&#x3068;&#x30B7;&#x30FC;&#x30C9;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x4E88;&#x6E2C;&#x76EE;&#x6A19;&#x3092;&#x542B;&#x3080;P57&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;3 &#x26;#39;&#x975E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x9818;&#x57DF;&#x306E;&#x4E00;&#x90E8;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x30EB;&#x30B7;&#x30D5;&#x30A7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B3;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C8;&#x30E9;&#x30AF;&#x30C8;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3059;&#x308B;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306F;&#x3001;miRNA&#x306E;miR-92b&#x3068;&#x304C;&#x76F4;&#x63A5;G&#xFF08;1&#xFF09;/ S&#x30C1;&#x30A7;&#x30C3;&#x30AF;&#x30DD;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;P57&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30C8;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x7D30;&#x80DE;&#x3092;2009&#x5E74;STEM; 27:1524-1528&#x3002;

microRNA&#x306E;92B&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x80DA;&#x6027;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;G1 / S&#x30C1;&#x30A7;&#x30C3;&#x30AF;&#x30DD;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;P57&#x3092;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30FC;&#x30EB;

&#xC778;&#xAC04; &#xBC30;&#xC544; &#xC904;&#xAE30; (ES&#xC758;) &#xC138;&#xD3EC;&#xB294; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xCCB4;&#xC138;&#xD3EC; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xB354; &#xC9E7;&#xC740; G(1) &#xC138;&#xD3EC; &#xC8FC;&#xAE30; &#xB2E8;&#xACC4; &#xC804;&#xC2DC;. &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0;&#xC11C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xD48D;&#xBD80; &#xD558; &#xACE0;, &#xC778;&#xAC04;&#xC758; ES &#xC138;&#xD3EC; &#xB18D;&#xCD95; microRNA, &#xC138;&#xD3EC; &#xC8FC;&#xAE30; &#xBD84;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBBF8;&#xB974; 92b &#xC5ED;&#xD560; &#xAC80;&#xC0AC;. S &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBBF8;&#xB974;-92b &#xC778;&#xAC04;&#xC758; ES&#xC5D0;&#xC758; &#xC800;&#xD574; &#xC138;&#xD3EC; G(1) &#xB2E8;&#xACC4;&#xC640; &#xB0AE;&#xC740; &#xC22B;&#xC790;&#xB97C; &#xC140;&#xC758; &#xB354; &#xB9CE;&#xC740; &#xC218;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBC18;&#xB300;&#xB85C;, &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654; &#xB41C; &#xC140;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBBF8;&#xB974;-92b overexpression &#xC140;&#xC758; &#xAC10;&#xC18C; &#xC218; g 1 &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; S &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC218;&#xB97C; &#xC99D;&#xAC00; &#xBC1C;&#xC0DD;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. p57, &#xC81C;&#xD488; G(1) S &#xC0C1; &#xC9C4;&#xD589;&#xC744; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD558;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xBBF8;&#xB974; 92b &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; &#xB300;&#xC0C1; &#xC911; &#xD558;&#xB098;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBBF8;&#xB974;-92b &#xC778;&#xAC04;&#xC758; ES &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0; &#xC5B5;&#xC81C; p57 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC218;&#xC900;&#xC774; &#xC99D;&#xAC00; &#xD558; &#xACE0; &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654; &#xB41C; &#xC140;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBBF8;&#xB974; 92b overexpression &#xAC10;&#xC18C; p57 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC218;&#xC900;. &#xB610;&#xD55C;, &#xBBF8;&#xB974; 92b &#xC5B5;&#xC81C; &#xB8E8;&#xC2DC;&#xD398;&#xB77C;&#xC544;&#xC81C; &#xAE30;&#xC790; &#xAD6C;&#xBB38; &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; &#xBBF8;&#xB974; 92b &#xC528;&#xC557; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC758; &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; &#xB300;&#xC0C1; p57 &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; 3&#39; &#xB9DE;&#xC774; &#xC9C0;&#xC5ED; &#xC77C;&#xBD80;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xB294; &#xBBF8;&#xB974; &#xBBF8;&#xB974; 92b &#xC9C1;&#xC811; G (1) /S &#xAC80;&#xC0AC;&#xC810; &#xC720;&#xC804;&#xC790; p57 downregulates &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC218;&#xC900;. &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC; 2009; 27:1524-1528 &#xB144; 4 &#xC6D4;.

MicroRNA 92b &#xC778;&#xAC04; &#xBC30;&#xC544; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; G1/S &#xAC80;&#xC0AC;&#xC810; &#xC720;&#xC804;&#xC790; p57&#xC744; &#xC81C;&#xC5B4;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Madre embrionarias humanas (ES) las c&#xE9;lulas presentan una menor G (1) fase del ciclo celular que la mayor&#xED;a de las c&#xE9;lulas som&#xE1;ticas. Aqu&#xED;, examinamos el papel de un abundante, ES humana enriquecida con c&#xE9;lulas microARN, miR-92b, en la distribuci&#xF3;n del ciclo celular. La inhibici&#xF3;n de la miR-92b en humanos c&#xE9;lulas embrionarias resulta en un mayor n&#xFA;mero de c&#xE9;lulas en el G (1) de fase y un n&#xFA;mero menor en la fase S. Por el contrario, la sobreexpresi&#xF3;n de miR-92b en los resultados de c&#xE9;lulas diferenciadas en una disminuci&#xF3;n del n&#xFA;mero de c&#xE9;lulas en fase G1 y un n&#xFA;mero cada vez mayor en la fase S. P57, un gen cuyo producto inhibe G (1) a la fase S progresi&#xF3;n, es uno de los objetivos previstos de MIR-92b. La inhibici&#xF3;n de la miR-92b en c&#xE9;lulas madre embrionarias humanas aumenta los niveles de prote&#xED;na p57, y miR-92b sobreexpresi&#xF3;n en c&#xE9;lulas diferenciadas disminuye los niveles de prote&#xED;na p57. Por otra parte, el miR-92b inhibe un constructo reportero de la luciferasa, que incluye parte de la regi&#xF3;n 3 &#x26;#39;no traducida del gen P57 contiene el objetivo previsto de la secuencia de miR-92b de la semilla. Por lo tanto, nos muestran que el miR-92b miARN directamente regula a la baja los niveles de prote&#xED;na de la G (1) / S gen P57 puesto de control. C&#xC9;LULAS MADRE 2009; 27:1524-1528.

MicroARN 92b Controla Gene el G1 / S P57 Checkpoint en c&#xE9;lulas estaminales embrionarias humanas

Microrna (Mirna) posttranscriptionally &#x901A;&#x8FC7;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x5288;&#x88C2;&#x6216;&#x4EE5;&#x5176;&#x5B83;&#x65B9;&#x5F0F;&#x9547;&#x538B;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x8C03;&#x8282;&#x6709;&#x9488;&#x5BF9;&#x6027;&#x7684;&#x4FE1;&#x4F7F; Rna (mRNAs)&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x68C0;&#x6D4B; m/&#x7C73;&#x5C14;&#x901A;&#x8FC7;&#x5236;&#x5B9A;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x6A21;&#x578B;&#xFF0C;&#x4F7F;&#x7528;&#x7531; Mirna &#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x673A;&#x5236;&#x7684;&#x52A8;&#x673A;&#x662F;&#x9488;&#x5BF9;&#x667A;&#x4ECE;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x6570;&#x636E;&#x4E2D;&#x7684;&#x5173;&#x7CFB;&#x95EE;&#x9898;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5EFA;&#x6A21;&#x7684;&#x91CD;&#x70B9;&#x662F;&#x5EFA;&#x8BBE;&#x3001; &#x6D3B;&#x52A8;&#x548C;&#x8C03;&#x89E3;&#x7684; RNA &#x8BF1;&#x5BFC;&#x6C89;&#x9ED8;&#x590D;&#x5408;&#x7269; &#xFF08;RISCs&#xFF09; &#x6709;&#x9488;&#x5BF9;&#x6027;&#x7684; mRNA &#x5288;&#x7684;&#x4E3B;&#x7BA1;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8868;&#x73B0;&#x51FA;&#x56DE;&#x5F52;&#x6A21;&#x578B;&#x901A;&#x878D; RISC &#x4E30;&#x5EA6;&#x548C;&#x63A7;&#x5236;&#x5176;&#x4ED6;&#x8C03;&#x89E3;&#x56E0;&#x7D20;&#x9002;&#x5408;&#x8868;&#x8FBE;&#x8C31;&#x7684;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x76EE;&#x6807;&#x5BF9;&#x5927;&#x5927;&#x4F18;&#x4E8E;&#x6A21;&#x578B;&#x57FA;&#x4E8E; m/&#x7C73;&#x5C14;&#x8868;&#x8FBE;&#x5F0F;&#x672C;&#x8EAB;&#xFF0C;&#x5E76;&#x53EF;&#x80FD;&#x5BFC;&#x81F4;&#x8BA1;&#x7B97;&#x76EE;&#x6807;&#x5BF9;&#x9884;&#x6D4B;&#x6BD4;&#x90A3;&#x4E9B;&#x57FA;&#x4E8E;&#x8FB9;&#x9645;&#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x66F4;&#x4E3A;&#x654F;&#x611F;&#x7684;&#x6838;&#x67E5;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x6A21;&#x578B;&#x662F;&#x5B8C;&#x5168;&#x72EC;&#x7ACB;&#x7684;&#x5916;&#x6E90;&#x7ED3;&#x679C;&#x4ECE;&#x57FA;&#x4E8E;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x8BA1;&#x7B97;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x56E0;&#x4E3A;&#x5B83;&#x4EEC;&#x90FD;&#x9002;&#x5408;&#x4F7F;&#x7528;&#x4F5C;&#x4E3A; m/&#x7C73;&#x5C14;&#x76EE;&#x6807;&#x5BF9;&#x5173;&#x7CFB;&#xFF0C;&#x7279;&#x522B;&#x662F;&#x5728;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x8868;&#x8FBE;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x5408;&#x8D44;&#x6599;&#x4E3B;&#x8981;&#x6216;&#x6B21;&#x8981;&#x6765;&#x6E90;&#x3002;

&#x963F;&#x8033;&#x6208;&#x82F1;&#x96C4;&#x8868;&#x8FBE;&#x548C; RISC microRNA &#x76EE;&#x6807;&#x8BC6;&#x522B;&#x4E2D;&#x7684;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x96C6;&#x7684;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x4F7F;&#x7528;&#x3002;

MicroRNAs (miRNAs) posttranscriptionally regulate targeted messenger RNAs (mRNAs) by inducing cleavage or otherwise repressing their translation. We address the problem of detecting m/miRNA targeting relationships in homo sapiens from microarray data by developing statistical models that are motivated by the biological mechanisms used by miRNAs. The focus of our modeling is the construction, activity, and mediation of RNA-induced silencing complexes (RISCs) competent for targeted mRNA cleavage. We demonstrate that regression models accommodating RISC abundance and controlling for other mediating factors fit the expression profiles of known target pairs substantially better than models based on m/miRNA expressions alone, and lead to verifications of computational target pair predictions that are more sensitive than those based on marginal expression levels. Because our models are fully independent of exogenous results from sequence-based computational methods, they are appropriate for use as either a primary or secondary source of information regarding m/miRNA target pair relationships, especially in conjunction with high-throughput expression studies.

Statistical use of argonaute expression and RISC assembly in microRNA target identification.

MicroARN (miARN) r&eacute;glemente posttranscriptionally cibl&eacute;es ARN messagers (ARNm) en induisant des clivage ou sinon r&eacute;primer leur traduction. Nous abordons le probl&egrave;me de d&eacute;tection m/miRNA ciblant les relations chez homo sapiens de microarray data en d&eacute;veloppant des mod&egrave;les statistiques qui sont motiv&eacute;s par les m&eacute;canismes biologiques utilis&eacute;s par les miARN. L&#39;objectif de notre mod&eacute;lisation est la construction, l&#39;activit&eacute; et la m&eacute;diation de RNA-induced silencing complexes (internautes) comp&eacute;tentes pour le clivage ARNm cibl&eacute;s. Nous d&eacute;montrons que les mod&egrave;les de r&eacute;gression accommodant abondance RISC et d&#39;autres facteurs de m&eacute;diation entrent les profils d&#39;expression des paires de cibles connus nettement mieux que les mod&egrave;les bas&eacute;s sur des expressions m/miRNA seules et conduisent &agrave; des pr&eacute;dictions de paire de calcul cible qui sont plus sensibles que ceux bas&eacute;s sur les niveaux d&#39;expression marginale, les v&eacute;rifications. Nos mod&egrave;les sont enti&egrave;rement ind&eacute;pendants des r&eacute;sultats exog&egrave;nes de s&eacute;quence ax&eacute;e sur les m&eacute;thodes de calcul, elles sont appropri&eacute;es pour une utilisation comme une source primaire ou secondaire de l&#39;information concernant les relations de couple m/miRNA cible, en particulier en conjonction avec des &eacute;tudes d&#39;expression du haut d&eacute;bit.

Utilisation statistique d&#39;expression de l&#39;argonaute et assemblage RISC dans l&#39;identification des cibles micro-ARN.

MicroRNAs (MiRNAs) Regeln posttranscriptionally gezielte Messenger-RNAs (mRNAs), indem Sie induzierende Spaltung oder sonst Unterdr&uuml;ckung ihrer &Uuml;bersetzung. Wir habe das Problem der Erkennung von m/MiRNA auf Beziehungen in Homo Sapiens von Microarray Daten durch die Entwicklung von statistischer Models, die durch die biologischen Mechanismen von MiRNAs verwendet motiviert sind. Im Mittelpunkt unserer Modellierung ist der Bau, Aktivit&auml;t und Vermittlung der RNA-induced silencing komplexe (H&uuml;rden) f&uuml;r gezielte mRNA Spaltung zust&auml;ndig. Wir zeigen, dass die Regression modelliert entgegenkommend RISC-F&uuml;lle und controlling f&uuml;r andere vermittelnden Faktoren passen die Ausdruck-Profile der bekannten Ziel-Paare deutlich besser als Modelle basierend auf m/MiRNA Ausdr&uuml;cke allein, und f&uuml;hren zu &Uuml;berpr&uuml;fungen der computational Ziel paar Vorhersagen, die empfindlicher als solche auf Basis von marginalen Stufen sind. Da unsere Modelle vollkommen unabh&auml;ngig von exogenen Ergebnisse von Sequenz-basierte Berechnungsmethoden sind, sind sie f&uuml;r die Verwendung als eine prim&auml;re oder sekund&auml;re Quelle von Informationen &uuml;ber m/MiRNA Ziel paar Beziehungen, besonders in Verbindung mit hohem Durchsatz Ausdruck Studien geeignet.

Statistische Verwendung von Argonaute Meinungs- und Versammlungsfreiheit der RISC MicroRNA deiner Identifizierung.

MicroRNA (miRNAs) regola posttranscriptionally mirati RNA messaggero (mRNA) da indurre il clivaggio o altrimenti reprimere la loro traduzione. Affrontiamo il problema di individuare relazioni in homo sapiens da dati di microarray di targeting attraverso lo sviluppo di modelli statistici che sono motivati dai meccanismi biologici utilizzati da miRNAs m/miRNA. Il focus del nostro modeling &egrave; la costruzione, l&#39;attivit&agrave; e la mediazione di RNA-induced silenziamento complessi (Ch&igrave;) competente per la scissione di mRNA bersaglio. Dimostriamo che regressione modelli accomodante abbondanza RISC e controllo di altri fattori di mediazione montare i profili di espressione di coppie di destinazione noto sostanzialmente migliore rispetto ai modelli basati su espressioni m/miRNA da solo e portare a verifiche delle previsioni di coppia destinazione computazionale che sono pi&ugrave; sensibili rispetto a quelli basati su livelli di espressione marginale. Perch&eacute; i nostri modelli sono completamente indipendenti dei risultati esogeni da metodi computazionali basate sulla sequenza, sono appropriati per l&#39;utilizzo come una fonte primaria o secondaria di informazioni riguardanti m/miRNA target coppia relazioni, soprattutto in collaborazione con studi di espressione high-throughput.

Uso statistico di argonaute espressione e assembly RISC nell&#39;identificazione di target di microRNA.

&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; Rna &#xFF08;Mirna&#xFF09; &#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x7D5E;&#x3063;&#x305F;&#x306E;&#x30E1;&#x30C3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B8;&#x30E3;&#x30FC; Rna &#xFF08;Mrna&#xFF09; &#x80F8;&#x306E;&#x8C37;&#x9593;&#x3092;&#x8A98;&#x767A;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x305D;&#x308C;&#x4EE5;&#x5916;&#x306E;&#x5834;&#x5408;&#x3001;&#x7FFB;&#x8A33;&#x3092;&#x6291;&#x5236;&#x3059;&#x308B; posttranscriptionally &#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306E; m/miRNA &#x30DB;&#x30E2;&#x30B5;&#x30D4;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B9; &#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4; &#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x304B;&#x3089;&#x95A2;&#x4FC2; miRNAs &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x52D5;&#x6A5F;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3092;&#x958B;&#x767A;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x691C;&#x51FA;&#x3059;&#x308B;&#x554F;&#x984C;&#x306B;&#x5BFE;&#x51E6;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x7126;&#x70B9;&#x306F;&#x3001;&#x5EFA;&#x8A2D;&#x3001;&#x30A2;&#x30AF;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D3;&#x30C6;&#x30A3;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073; RNA &#x8A98;&#x8D77;&#x30B5;&#x30A4;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x932F;&#x4F53; (risc &#x5185;&#x8535;&#xFF09; &#x6A19;&#x7684; mRNA &#x306E;&#x958B;&#x88C2;&#x4E3B;&#x52D9;&#x306E;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x3001;&#x56DE;&#x5E30;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A; RISC &#x53CE;&#x5BB9;&#x3068;&#x4ED6;&#x5A92;&#x4ECB;&#x8981;&#x56E0;&#x3092;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x3066; m/miRNA &#x5F0F;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x3082;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x925B;&#x304C;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x9650;&#x754C;&#x5F0F;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x3088;&#x308A;&#x9AD8;&#x611F;&#x5EA6;&#x8A08;&#x7B97;&#x5BFE;&#x8C61;&#x30DA;&#x30A2;&#x4E88;&#x6E2C;&#x5F0F;&#x306E;&#x691C;&#x8A3C;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x304F;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x5927;&#x5E45;&#x306B;&#x512A;&#x308C;&#x3066;&#x65E2;&#x77E5;&#x306E;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x30DA;&#x30A2;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306F;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x8A08;&#x7B97;&#x65B9;&#x6CD5;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x5916;&#x56E0;&#x6027;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x5B8C;&#x5168;&#x306B;&#x72EC;&#x7ACB;&#x306A;&#x306E;&#x3067;&#x3001;&#x5F7C;&#x3089;&#x306F;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30EA;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30BB;&#x30AB;&#x30F3;&#x30C0;&#x30EA;&#x306E;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x306E;&#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30CF;&#x30A4;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x767A;&#x73FE;&#x7814;&#x7A76;&#x3068;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x3066;&#x3092;&#x4E2D;&#x5FC3;&#x306B;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x30DA;&#x30A2;&#x306E; m/miRNA &#x306E;&#x95A2;&#x4FC2;&#x306B;&#x95A2;&#x3059;&#x308B;&#x60C5;&#x5831;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x4F7F;&#x7528;&#x306B;&#x9069;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30A2;&#x30EB;&#x30B4;&#x30CE;&#x30FC;&#x30C8;&#x5F0F;&#x3068; RISC &#x30A2;&#x30BB;&#x30F3;&#x30D6;&#x30EA; &#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; Rna &#x6A19;&#x7684;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x306E;&#x7D71;&#x8A08;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x3002;

Posttranscriptionally MicroRNAs (miRNAs) &#xBD84;&#xC5F4;&#xC744; &#xC720;&#xB3C4; &#xD558;&#xAC70;&#xB098; &#xADF8;&#xB807;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC73C;&#xBA74; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xBC88;&#xC5ED;&#xC744; &#xC5B5;&#xC555; &#xD558; &#xC5EC; &#xD0C0;&#xAC9F;&#xB41C; &#xBA54;&#xC2E0;&#xC800; RNAs (mRNAs)&#xB97C; &#xC870;&#xC808; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; m/&#xBBF8;&#xB974; Mirnas&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xD559;&#xC801; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC88C;&#xC6B0; &#xB418;&#xB294; &#xD1B5;&#xACC4; &#xBAA8;&#xB378;&#xC744; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558; &#xC5EC; microarray &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD638;&#xBAA8; &#xC0AC;&#xD53C;&#xC5D4;&#xC2A4;&#xC758; &#xAD00;&#xACC4;&#xB97C; &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C; &#xAC80;&#xC0C9;&#xC758; &#xBB38;&#xC81C;&#xB97C; &#xD574;&#xACB0; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xBAA8;&#xB378;&#xB9C1;&#xC758; &#xCD08;&#xC810;&#xC740; &#xAC74;&#xC124; &#xD65C;&#xB3D9;&#xACFC; RNA &#xC720;&#xB3C4; silencing &#xB2E8;&#xC9C0;&#xC758; (RISCs) &#xD0C0;&#xAC9F;&#xB41C; mRNA &#xBD84;&#xC5F4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD00;&#xD560; &#xC911;&#xC7AC;. &#xD68C;&#xADC0; &#xBAA8;&#xB378; &#xC218;&#xC6A9; RISC &#xD48D;&#xBD80; &#xD558; &#xACE0; &#xD63C;&#xC790;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xD55C;&#xACC4; &#xC2DD; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xADF8; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xB354; &#xBBFC;&#xAC10;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xACC4;&#xC0B0; &#xB300;&#xC0C1; &#xC30D; &#xC608;&#xCE21;&#xC758; &#xAC80;&#xC99D;&#xC5D0; m/&#xBBF8;&#xB974; &#xC2DD;&#xC744; &#xAE30;&#xBC18;&#xC73C;&#xB85C; &#xD558;&#xB294; &#xBAA8;&#xB378; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xC2E4;&#xC9C8;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xB354; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; &#xB300;&#xC0C1; &#xC30D; &#xC2DD; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xC5D0; &#xB9DE;&#xAC8C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC911;&#xC7AC; &#xC694;&#xC778;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC81C;&#xC5B4; &#xC2DC;&#xC5F0; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xBAA8;&#xB378; exogenous &#xACB0;&#xACFC; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xAE30;&#xBC18; &#xACC4;&#xC0B0; &#xBC29;&#xBC95;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC644;&#xC804;&#xD788; &#xB3C5;&#xB9BD;&#xC801; &#xC774;&#xAE30; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0;, &#xADF8;&#xB4E4;&#xC740; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xC2DD; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC640; &#xD568;&#xAED8;&#xC5D0; &#xD2B9;&#xD788; m/&#xBBF8;&#xB974; &#xB300;&#xC0C1; &#xC30D; &#xAD00;&#xACC4;&#xC5D0; &#xAD00;&#xD55C; &#xC815;&#xBCF4; &#xC911; &#xC8FC; &#xB610;&#xB294; &#xBCF4;&#xC870; &#xC6D0;&#xBCF8;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xAE30;&#xC5D0; &#xC801;&#xD569; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xD1B5;&#xACC4; &#xD65C;&#xC6A9; argonaute &#xD45C;&#xD604;&#xACFC; microRNA &#xB300;&#xC0C1; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC5D0; RISC &#xC5B4;&#xC148;&#xBE14;&#xB9AC;.

MicroRNAs (miRNAs) posttranscriptionally regular dirigida mensajero ARN (mRNAs) por inducci&oacute;n escote o de lo contrario, reprimiendo su traducci&oacute;n. Abordamos el problema de detectar m/miRNA dirigidos a relaciones en homo sapiens de datos de microarrays mediante el desarrollo de modelos estad&iacute;sticos que est&aacute;n motivados por los mecanismos biol&oacute;gicos utilizados por miRNAs. El foco de nuestro modelo es la construcci&oacute;n, actividad y mediaci&oacute;n de RNA-inducida silenciamiento complejos (riesgos) competentes para escote de mRNA espec&iacute;ficos. Demostramos que modelos de regresi&oacute;n complaciente abundancia RISC y controlar otros factores de mediaci&oacute;n adecuado a los perfiles de expresi&oacute;n de pares destino conocido substancialmente mejores que los modelos basados en expresiones de m/miRNA solas y conducen a la verificaci&oacute;n de las predicciones de par de destino computacional que son m&aacute;s sensibles que los basados en niveles de expresi&oacute;n marginal. Porque nuestros modelos son totalmente independientes de ex&oacute;genos resultados de m&eacute;todos computacionales basados en la secuencia, son apropiados para su uso como una fuente primaria o secundaria de informaci&oacute;n con respecto a m/miRNA blanco par relaciones, especialmente en conjunci&oacute;n con los estudios de expresi&oacute;n de alto rendimiento.

Uso estad&iacute;stico de argonaute expresi&oacute;n y reuni&oacute;n RISC en la identificaci&oacute;n de objetivos de microARN.

Pr&#xE9;paration d&#x26;#39;une biblioth&#xE8;que de s&#xE9;quen&#xE7;age Illumina pour analyse d&#x26;#39;expression g&#xE9;nique (ARNm-Seq) n&#xE9;cessite des quantit&#xE9;s de microgramme de l&#x26;#39;ARN total &#xE0; partir ou &#xE0; base de PCR d&#x26;#39;amplification. Nous d&#xE9;crivons ici un protocole bas&#xE9; sur T7 ARN lin&#xE9;aire d&#x26;#39;amplification qui n&#x26;#39;introduit pas de biais significatif, ne n&#xE9;cessite que 10 ng d&#x26;#39;ARN total, et g&#xE9;n&#xE8;re un directionnel, pleinement repr&#xE9;sentatif, l&#x26;#39;ensemble de la transcription d&#x26;#39;ARNm-Seq Illumina biblioth&#xE8;que qui est tr&#xE8;s coh&#xE9;rente &#xE0; travers plus de trois ordres de magnitude de l&#x26;#39;ARN d&#x26;#39;entr&#xE9;e.

Une grande coh&#xE9;rence, pleinement repr&#xE9;sentatif ARNm-Seq biblioth&#xE8;ques de dix nanogrammes d&#x26;#39;ARN total

Vorbereitung einer Illumina Sequenzierung Bibliothek Genexpressionsanalyse (mRNA-Seq) erfordert Mikrogramm Mengen beginnen, total RNA oder PCR-basierten Verst&auml;rkung. Hier beschreiben wir ein Protokoll basierend auf T7 linearen RNA-Amplifikation, die erhebliche Verzerrungen f&uuml;hrt keine ein und erfordert nur 10 ng Gesamt RNA generiert eine direktionale, v&ouml;llig repr&auml;sentativ, ganze-Transcript mRNA-Seq-Illumina-Bibliothek, die &uuml;ber mehr als drei Gr&ouml;&szlig;enordnungen von Input RNA sehr konsistent ist.

H&ouml;chst konsistente, v&ouml;llig repr&auml;sentativ mRNA-Seq-Bibliotheken aus zehn Nanogramm total RNA.

Preparazione di una libreria di sequenziamento Illumina per analisi di espressione genica (mRNA-Seq) richiede quantit&agrave; microgrammi di partenza RNA totale o amplificazione di PCR-based. Qui descriviamo un protocollo basato sull&#39;amplificazione lineare di RNA T7 che non introduce significative bias, richiede solo 10 ng RNA totale e genera una libreria dei Illumina direzionale, pienamente rappresentativo, intera-trascrizione mRNA-Seq che &egrave; altamente coerenza in tutto oltre tre ordini di grandezza di input RNA.

Altamente coerente, pienamente rappresentativo mRNA-Seq librerie da dieci nanogrammi di RNA totale.

&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x5206;&#x6790; &#xFF08;mRNA Seq&#xFF09; &#x5236;&#x5907;&#x7684;&#x7167;&#x6392;&#x80F6;&#x7247;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x5E93;&#x9700;&#x8981;&#x542F;&#x52A8;&#x603B; RNA &#x6216;&#x57FA;&#x4E8E; PCR &#x6269;&#x589E;&#x7684;&#x5FAE;&#x514B;&#x91CF;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x5C06;&#x4ECB;&#x7ECD;&#x57FA;&#x4E8E; T7 &#x7EBF;&#x6027;&#x7684; RNA &#x6269;&#x589E;&#xFF0C;&#x4E0D;&#x5F15;&#x5165;&#x91CD;&#x5927;&#x504F;&#x5DEE;&#x3001; &#x8981;&#x6C42;&#x53EA;&#x6709; 10 &#x5434;&#x603B; RNA&#xFF0C;&#x5E76;&#x751F;&#x6210;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5B9A;&#x5411;&#x3001; &#x5145;&#x5206;&#x4EE3;&#x8868;&#x6027;&#x3001; &#x6574;&#x4E2A;&#x8C08;&#x8BDD;&#x7684; mRNA Seq &#x7167;&#x6392;&#x80F6;&#x7247;&#x5E93;&#xFF0C;&#x5B83;&#x5728;&#x4E09;&#x4E2A;&#x6570;&#x91CF;&#x7EA7;&#x7684;&#x8F93;&#x5165; RNA &#x662F;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x4E00;&#x81F4;&#x7684;&#x534F;&#x8BAE;&#x3002;

&#x9AD8;&#x5EA6;&#x4E00;&#x81F4;&#x3001; &#x5177;&#x6709;&#x5145;&#x5206;&#x4EE3;&#x8868;&#x6027;&#x7684; mRNA Seq &#x56FE;&#x4E66;&#x9986;&#x4ECE;&#x5341;&#x7EB3;&#x514B;&#x7684;&#x603B; RNA&#x3002;

Preparation of an Illumina sequencing library for gene expression analysis (mRNA-Seq) requires microgram amounts of starting total RNA or PCR-based amplification. Here we describe a protocol based on T7 linear RNA amplification that does not introduce significant bias, requires only 10 ng total RNA, and generates a directional, fully representative, whole-transcript mRNA-Seq Illumina library that is highly consistent across over three orders of magnitude of input RNA.

Highly consistent, fully representative mRNA-Seq libraries from ten nanograms of total RNA.

&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x89E3;&#x6790;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30A4;&#x30EB;&#x30DF;&#x30CA;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#xFF08;mRNA&#x306E;SEQ&#xFF09;&#x306E;&#x8ABF;&#x88FD;&#x5168;RNA&#x307E;&#x305F;&#x306F;PCR&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x5897;&#x5E45;&#x3092;&#x958B;&#x59CB;&#x3059;&#x308B;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30B0;&#x30E9;&#x30E0;&#x91CF;&#x3092;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6709;&#x610F;&#x306A;&#x30D0;&#x30A4;&#x30A2;&#x30B9;&#x3092;&#x5C0E;&#x5165;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x305B;&#x3093;T7&#x30EA;&#x30CB;&#x30A2;RNA&#x5897;&#x5E45;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x304F;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30B3;&#x30EB;&#x3092;&#x8A18;&#x8FF0;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x308F;&#x305A;&#x304B;10 ng&#x306E;&#x30C8;&#x30FC;&#x30BF;&#x30EB;RNA&#x3092;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3057;&#x3001;3&#x6841;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x306B;&#x308F;&#x305F;&#x3063;&#x3066;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x306B;&#x4E00;&#x8CAB;&#x6027;&#x306E;&#x3042;&#x308B;&#x65B9;&#x5411;&#x3001;&#x5B8C;&#x5168;&#x306B;&#x4EE3;&#x8868;&#x3059;&#x308B;&#x3001;&#x5168;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#x306E;mRNA-Seq&#x306F;&#x30A4;&#x30EB;&#x30DF;&#x30CA;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x5165;&#x529B;RNA&#x306E;&#x5927;&#x304D;&#x3055;&#x3002;

&#x30C8;&#x30FC;&#x30BF;&#x30EB;RNA&#x306E;10&#x30CA;&#x30CE;&#x30B0;&#x30E9;&#x30E0;&#x304B;&#x3089;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x4E00;&#x8CAB;&#x3057;&#x305F;&#x3001;&#x5B8C;&#x5168;&#x306B;&#x4EE3;&#x8868;mRNA&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;

&#xC9C4; &#xC2DD; &#xBD84;&#xC11D; (mRNA Seq) Illumina&#xC758; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xB97C; &#xB300;&#xBE44;&#xD55C; &#xADF8;&#xB7A8; &#xCD1D; RNA &#xB610;&#xB294; &#xC99D;&#xD3ED; PCR &#xAE30;&#xBC18; &#xC2DC;&#xC791; &#xC591;&#xC758; &#xD544;&#xC694; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xBC14;&#xC774;&#xC5B4;&#xC2A4;&#xB97C; &#xC18C;&#xAC1C; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;&#xB9CC; 10 ng &#xCD1D; RNA&#xB97C; &#xC694;&#xAD6C; &#xD558; &#xACE0;, &#xC785;&#xB825; RNA&#xC758; 3 &#xBC30;&#xB098; &#xB192;&#xC740; &#xC77C;&#xAD00;&#xC131; &#xC788;&#xB294; &#xBC29;&#xD5A5;, &#xC644;&#xBCBD; &#xD558; &#xAC8C; &#xB300;&#xD45C;, &#xC804;&#xCCB4; &#xC131;&#xC801;&#xD45C; mRNA-Seq Illumina &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC; &#xC0DD;&#xC131; T7 &#xC120;&#xD615; RNA &#xC99D;&#xD3ED; &#xAE30;&#xBC18; &#xD504;&#xB85C;&#xD1A0;&#xCF5C; &#xC124;&#xBA85;.

&#xC804;&#xCCB4; RNA&#xC758; 10 nanograms&#xC5D0;&#xC11C; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xC77C;&#xAD00; &#xB418; &#xACE0; &#xC644;&#xBCBD; &#xD558; &#xAC8C; &#xB300;&#xD45C; mRNA-Seq &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;.

Preparaci&#xF3;n de una biblioteca de secuenciaci&#xF3;n de Illumina para el an&#xE1;lisis de expresi&#xF3;n g&#xE9;nica (mRNA-seq) requiere de cantidades de microgramos de RNA total de partida o de amplificaci&#xF3;n de PCR-based. Aqu&#xED; se describe un protocolo basado en T7 lineal de amplificaci&#xF3;n del ARN que no introduce un sesgo significativo, requiere s&#xF3;lo 10 ng de ARN total, y genera una direccional, plenamente representativo de todo el transcrito de ARNm-Sec biblioteca de Illumina que es muy consistente a trav&#xE9;s de m&#xE1;s de tres &#xF3;rdenes de magnitud de ARN de entrada.

Article	Year
Molecular detection and identification of influenza viruses by oligonucleotide microarray hybridization. Journal of clinical microbiology\| PubMed ID: 14532180	2003
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Fundamental differences in cell cycle deregulation in human papillomavirus-positive and human papillomavirus-negative head/neck and cervical cancers. Cancer research\| PubMed ID: 17510386	2007
A study of the relationships between oligonucleotide properties and hybridization signal intensities from NimbleGen microarray datasets. Nucleic acids research\| PubMed ID: 18385155	2008
MicroRNA 29c is down-regulated in nasopharyngeal carcinomas, up-regulating mRNAs encoding extracellular matrix proteins. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America\| PubMed ID: 18390668	2008
The microRNAs of Epstein-Barr Virus are expressed at dramatically differing levels among cell lines. Virology\| PubMed ID: 19217135	2009
MicroRNA 92b controls the G1/S checkpoint gene p57 in human embryonic stem cells. Stem cells (Dayton, Ohio)\| PubMed ID: 19544458	2009
Statistical use of argonaute expression and RISC assembly in microRNA target identification. PLoS computational biology\| PubMed ID: 19779550	2009
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Srikumar Sengupta

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