a-lectin-hplc-method-to-enrich-selectively-glycosylated-peptides-from

A Lectin HPLC Method to Enrich Selectively-glycosylated Peptides from Complex Biological Samples

Glycans are an important class of post-translational modifications. Typically found on secreted and extracellular molecules, glycan structures signal the ...

Buck Institute for Age Research

&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x662F;&#x5DF2;&#x77E5;&#x5728;&#x8BB8;&#x591A;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x626E;&#x6F14;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x89D2;&#x8272;&#x3002;&#x5728;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x78B0;&#x649E;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x89E3;&#x79BB; (CID) &#x662F;&#x6700;&#x5E38;&#x89C1;&#x7684;&#x5206;&#x79BB;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x6F84;&#x6E05;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x548C;&#x8FDE;&#x63A5;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;CID &#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7F3A;&#x70B9;&#x662F;&#x4E0B;&#x964D;&#x7684;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x548C;&#x6548;&#x7387;&#x7684;&#x63D0;&#x9AD8;&#x8D28;&#x91CF;&#x4E0E;&#x89E3;&#x79BB;&#x3002;&#x5728;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x6210;&#x529F;&#x5730;&#x6267;&#x884C;&#x7EA2;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x79BB; (IRMPD) &#x4E0A; 39 O &#x94FE;&#x63A5;&#x9ECF;&#x86CB;&#x767D;&#x578B;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6; alditols &#xFF08;&#x4E2D;&#x6027;&#x548C;&#x9634;&#x79BB;&#x5B50;&#xFF09;&#x3002;&#x51E0;&#x79CD;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684; CID &#x548C; IRMPD &#x8C31;&#x4E5F;&#x4F5C;&#x4E86;&#x6BD4;&#x8F83;&#x3002;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x53D6;&#x5F97;&#x4E86;&#x51E0;&#x4E4E;&#x76F8;&#x540C;&#x7684;&#x7247;&#x6BB5;&#x79BB;&#x5B50;&#x5BF9;&#x5E94;&#x4E8E;&#x6700;&#x4F4E;&#x7684;&#x80FD;&#x91CF;&#x788E;&#x7247;&#x901A;&#x9053;&#x3002;CID &#x548C; IRMPD &#x8C31;&#x540C;&#x6837;&#x63D0;&#x51FA;&#x4E86;&#x7ED3;&#x6784;&#x6027;&#x7684;&#x56FE;&#x6848;&#xFF0C;&#x53EF;&#x4EE5;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7684;&#x8054;&#x7CFB;&#x4FE1;&#x606F;&#xFF0C;&#x7279;&#x8272;&#x788E;&#x88C2;&#x3002;&#x591A;&#x7EA7;&#x7684; CID &#xFF08;MS(3) &#x6216; MS(4)) &#x901A;&#x5E38;&#x9700;&#x8981;&#x5B8C;&#x5168;&#x5E8F;&#x5217;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#xFF0C;&#x800C; IRMPD &#x7684;&#x540C;&#x4E00;&#x79CD;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x4EA7;&#x751F;&#x7684;&#x7247;&#x6BB5;&#x79BB;&#x5B50;&#x5BF9;&#x5E94;&#x635F;&#x5931;&#x7684;&#x6B8B;&#x7559;&#x7684;&#x7B2C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5230;&#x6700;&#x540E;&#x4E00;&#x4E2A;&#x6B8B;&#x7559;&#x5728;&#x5355;&#x7EA7;&#x4E32;&#x8054;&#x8D28;&#x8C31; (MS(2))&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x5B83;&#x663E;&#x793A;&#x7684; IRMPD &#x788E;&#x7247;&#x6548;&#x7387;&#x968F;&#x7740;&#x89C4;&#x6A21;&#x65E5;&#x76CA;&#x6269;&#x5927;&#xFF0C;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x3002;

&#x7EA2;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x79BB;&#x6FB3;&#x94FE;&#x63A5;&#x9ECF;&#x86CB;&#x767D;&#x578B;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x3002;

Oligosaccharides are known to play important roles in many biological processes. In the study of oligosaccharides, collision-induced dissociation (CID) is the most common dissociation method to elucidate the sequence and connectivity. However, a disadvantage of CID is the decrease in both the degree and efficiency of dissociation with increasing mass. In the present study, we have successfully performed infrared multiphoton dissociation (IRMPD) on 39 O-linked mucin-type oligosaccharide alditols (both neutral and anionic). CID and IRMPD spectra of several oligosaccharides were also compared. They yielded nearly identical fragment ions corresponding to the lowest energy fragmentation pathways. The characteristic fragmentations of structural motifs, which can provide the linkage information, were similarly presented in both CID and IRMPD spectra. Multistage of CID (MS(3) or MS(4)) is commonly needed to completely sequence the oligosaccharides, while IRMPD of the same compounds yielded the fragment ions corresponding to the loss of the first residue to the last residue during a single-stage tandem MS (MS(2)). Finally, it is shown that the fragmentation efficiency of IRMPD increases with the increasing size of oligosaccharides.

Infrared multiphoton dissociation of O-linked mucin-type oligosaccharides.

Oligosaccharides sont connus pour jouer un r&ocirc;le important dans de nombreux processus biologiques. Dans l&#39;&eacute;tude des oligosaccharides, dissociation induite par collision (DIC) est la m&eacute;thode la plus courante dissociation pour &eacute;lucider la s&eacute;quence et la connectivit&eacute;. Cependant, un inconv&eacute;nient du CID est la diminution dans le degr&eacute; et l&#39;efficacit&eacute; de la dissociation avec l&#39;augmentation de masse. Dans la pr&eacute;sente &eacute;tude, nous avons r&eacute;alis&eacute; avec succ&egrave;s dissociation multiphotonique infrarouge (DMPIR) sur 39 alditols d&#39;oligosaccharides O-li&eacute;s de type mucine (anioniques et neutres). On a aussi compar&eacute;s les spectres CID et DMPIR de plusieurs oligosaccharides. Ils ont donn&eacute; presque identique de fragments ioniques correspondant pour les voies de fragmentation plus basses &eacute;nergie. Les fragmentations caract&eacute;ristiques des motifs structurels, qui peuvent fournir les informations de liaison, ont &eacute;t&eacute; pr&eacute;sent&eacute;es de la m&ecirc;me fa&ccedil;on dans les spectres CID et DMPIR. Plusieurs &eacute;tapes du CID (MS(3) ou MS(4)) est g&eacute;n&eacute;ralement n&eacute;cessaire pour s&eacute;quencer compl&egrave;tement les oligosaccharides, alors que les ions fragments correspondant &agrave; la perte du r&eacute;sidu premier jusqu&#39;au dernier r&eacute;sidu au cours d&#39;un seule &eacute;tape tandem MS (MS(2)) DMPIR des m&ecirc;mes compos&eacute;s. Enfin, il est d&eacute;montr&eacute; que l&#39;efficacit&eacute; de la fragmentation de la DMPIR augmente avec la taille croissante des oligosaccharides.

Dissociation multiphotonique infrarouge des oligosaccharides O-li&eacute;s de type mucine.

Infrarot-Mehrphotonen-Dissoziation von O-verkn&#xFC;pften Oligosaccharide Mucin-Typ.

Gli oligosaccaridi sono noti a giocano un ruolo importante in molti processi biologici. Nello studio di oligosaccaridi, dissociazione indotta da collisione (CID) &egrave; il metodo pi&ugrave; comune di dissociazione per delucidare la sequenza e la connettivit&agrave;. Tuttavia, uno svantaggio del CID &egrave; la diminuzione in entrambi i gradi e l&#39;efficienza della dissociazione con l&#39;aumento di massa. Nel presente studio, abbiamo eseguito con successo dissociazione infrarossa multifotonica (IRMPD) su 39 alditols oligosaccaride legato O mucina-tipo (neutri e anionici). CID e IRMPD spettri di oligosaccaridi diversi sono stati anche rispetto. Hanno reso gli ioni frammento quasi identici corrispondente per le vie di frammentazione di energia pi&ugrave; basse. La frammentazione caratteristici motivi strutturali, in grado di fornire le informazioni di collegamento, allo stesso modo sono stati presentati negli spettri sia CID e IRMPD. Multistadio del CID (MS(3) o MS(4)) &egrave; comunemente dovuto completamente sequenza oligosaccaridi, mentre IRMPD dei composti stessi ha reso gli ioni frammento corrispondente alla perdita del primo residuo all&#39;ultimo residuo durante un singolo stadio tandem MS (MS(2)). Infine, si &egrave; dimostrato che l&#39;efficienza di frammentazione di IRMPD aumenta con la crescente dimensione di oligosaccaridi.

Dissociazione infrarossa multifotonica di oligosaccaridi legato O mucina-tipo.

&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x904E;&#x7A0B;&#x3067;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x518D;&#x751F;&#x3059;&#x308B;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;, &#x885D;&#x7A81;&#x8A98;&#x8D77;&#x89E3;&#x96E2; (CID) &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3068;&#x63A5;&#x7D9A;&#x6027;&#x3092;&#x89E3;&#x660E;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x3082;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x306E;&#x89E3;&#x96E2;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;CID &#x306E;&#x6B20;&#x70B9;&#x306E;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x3068;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5897;&#x52A0;&#x3068;&#x89E3;&#x96E2;&#x306E;&#x52B9;&#x7387;&#x4F4E;&#x4E0B;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;39 O &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF; &#x30E0;&#x30C1;&#x30F3;&#x578B;&#x7CD6;&#x9396; alditols &#x4E0A; &#xFF08;&#x4E2D;&#x7ACB;&#x3068;&#x30A2;&#x30CB;&#x30AA;&#x30F3;&#x6027;&#xFF09; &#x306E;&#x8D64;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x96E2; (IRMPD) &#x304C;&#x6B63;&#x5E38;&#x306B;&#x5B9F;&#x884C;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E;&#x30B7;&#x30C9;&#x3068; IRMPD &#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x3082;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5F7C;&#x3089;&#x306F;&#x307B;&#x307C;&#x540C;&#x3058;&#x30D5;&#x30E9;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8; &#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x306E;&#x6700;&#x4F4E;&#x30A8;&#x30CD;&#x30EB;&#x30AE;&#x30FC;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306B;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B;&#x3082;&#x305F;&#x3089;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B8;&#x60C5;&#x5831;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3001;&#x69CB;&#x9020;&#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x306E;&#x7279;&#x5FB4;&#x7684;&#x306A;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x540C;&#x69D8;&#x306B; CID &#x3068; IRMPD &#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x306E;&#x767A;&#x8868;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;CID &#x306E;&#x591A;&#x6BB5; (MS(3) &#x307E;&#x305F;&#x306F; MS(4)) &#x304C;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x5FC5;&#x8981;&#x540C;&#x3058;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306E; IRMPD &#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x6B8B;&#x6E23;&#x306E;&#x640D;&#x5931;&#x306B;&#x306F;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x6B8B;&#x6E23; (MS(2)) 1 &#x6BB5;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0; MS &#x306E;&#x4E2D;&#x306B;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B;&#x30D5;&#x30E9;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8; &#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x304C;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x304C;&#x5B8C;&#x5168;&#x306B;&#x3001;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x3092;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x51E6;&#x7406;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3002;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x3001;IRMPD &#x306E;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x52B9;&#x7387;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x306E;&#x30B5;&#x30A4;&#x30BA;&#x3092;&#x5897;&#x52A0;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

O &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF; &#x30E0;&#x30C1;&#x30F3;&#x578B;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x8D64;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x96E2;&#x306E;&#x53CD;&#x5FDC;&#x3002;

Oligosaccharides &#xB9CE;&#xC740; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xD559;&#xC801; &#xACFC;&#xC815;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Oligosaccharides &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCDA9;&#xB3CC;&#xC744; &#xC774;&#xC6A9;&#xD55C; &#xBD84;&#xB9AC; (CID) &#xC21C;&#xC11C;&#xC640; &#xC5F0;&#xACB0; &#xD558;&#xB294; &#xAC00;&#xC7A5; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xBD84;&#xB9AC; &#xBC29;&#xBC95;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, CID&#xC758; &#xB2E8;&#xC810;&#xC740; &#xC815;&#xB3C4; &#xC9C8;&#xB7C9;&#xC744; &#xC99D;&#xAC00; &#xD568;&#xAED8; &#xBD84;&#xB9AC; &#xD6A8;&#xC728;&#xC5D0; &#xAC10;&#xC18C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD604;&#xC7AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xC6B0;&#xB9AC; 39 O &#xC5F0;&#xACB0; mucin &#xD615; &#xC62C;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB2F9; alditols (&#xC911;&#xB9BD;&#xACFC; &#xC74C;&#xC774;&#xC628;)&#xC5D0; &#xC801;&#xC678;&#xC120; multiphoton &#xBD84;&#xB9AC; (IRMPD)&#xB97C; &#xC131;&#xACF5;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC218;&#xD589; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xB7EC; oligosaccharides&#xC758; CID &#xBC0F; IRMPD &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC; &#xBE44;&#xAD50;&#xB3C4; &#xD588;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB4E4;&#xC740; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB0AE;&#xC740; &#xC5D0;&#xB108;&#xC9C0; &#xC870;&#xAC01;&#xD654; &#xACBD;&#xB85C; &#xD574;&#xB2F9; &#xD558;&#xB294; &#xAC70;&#xC758; &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; &#xC870;&#xAC01; &#xC774;&#xC628;&#xC744; &#xC5BB;&#xC9C0; &#xBABB;&#xD588;&#xB2E4;. &#xB9C1;&#xD06C; &#xC815;&#xBCF4;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;, &#xAD6C;&#xC870; &#xBAA8;&#xD2F0;&#xD504;&#xC758; &#xD2B9;&#xC131; fragmentations &#xB9C8;&#xCC2C;&#xAC00;&#xC9C0;&#xB85C; CID &#xBC0F; IRMPD &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC5D0; &#xC81C;&#xC2DC; &#xD588;&#xB2E4;. CID&#xC758; &#xB2E4;&#xB2E8;&#xACC4; (MS(3) &#xB610;&#xB294; MS(4))&#xC740; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xC644;&#xC804;&#xD788; &#xAC19;&#xC740; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C;&#xC758; IRMPD &#xD574;&#xB2F9; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xC794;&#xB958;&#xBB3C;&#xC758; &#xC190;&#xC2E4; &#xD558; &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9; &#xC794;&#xC5EC;&#xBB3C; &#xB2E8; &#xD611;&#xB3D9; MS &#xB3D9;&#xC548; (MS(2)) &#xC870;&#xAC01; &#xC774;&#xC628;&#xC744; &#xAD74;&#xBCF5; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; oligosaccharides, &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;. &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C;, IRMPD&#xC758; &#xC870;&#xAC01;&#xD654; &#xD6A8;&#xC728; oligosaccharides&#xC758; &#xC99D;&#xAC00; &#xD06C;&#xAE30;&#xB85C; &#xC99D;&#xAC00; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;.

O &#xC5F0;&#xACB0; mucin &#xD615; oligosaccharides&#xC758; &#xC801;&#xC678;&#xC120; multiphoton &#xBD84;&#xB9AC;.

Oligosac&aacute;ridos se saben que desempe&ntilde;an un papel importante en muchos procesos biol&oacute;gicos. En el estudio de oligosac&aacute;ridos, disociaci&oacute;n inducida por colisi&oacute;n (CID) es el m&eacute;todo m&aacute;s com&uacute;n de la disociaci&oacute;n para aclarar la secuencia y la conectividad. Sin embargo, una desventaja del CID es la disminuci&oacute;n en el grado y la eficiencia de la disociaci&oacute;n con el aumento de la masa. En el presente estudio, hemos realizado con &eacute;xito infrarroja multifot&oacute;n disociaci&oacute;n (IRMPD) en 39 tipo mucina vinculados O oligosac&aacute;rido alditols (neutrales y ani&oacute;nicos). Tambi&eacute;n se compararon los espectros CID y IRMPD de varios oligosac&aacute;ridos. Rindieron iones casi id&eacute;ntico fragmento correspondiente a las v&iacute;as de fragmentaci&oacute;n de energ&iacute;a m&aacute;s bajas. Las caracter&iacute;sticas fragmentaciones de motivos estructurales, que pueden proporcionar la informaci&oacute;n de vinculaci&oacute;n, del mismo modo se presentaron en espectros tanto CID y IRMPD. Multifase de CID (MS(3) o MS(4)) es com&uacute;nmente necesario secuenciar completamente los oligosac&aacute;ridos, mientras que IRMPD de los mismos compuestos rindi&oacute; los iones fragmento correspondiente a la p&eacute;rdida del primer residuo hasta el &uacute;ltimo residuo durante un sola etapa t&aacute;ndem MS (MS(2)). Finalmente, se muestra que la eficiencia de la fragmentaci&oacute;n de IRMPD aumenta con el aumento de tama&ntilde;o de oligosac&aacute;ridos.

Disociaci&oacute;n multifot&oacute;n infrarroja de oligosac&aacute;ridos tipo mucina O vinculados.

Fredericamycin (FDM) A&#x3001; pentadecaketide &#x5177;&#x6709;&#x72EC;&#x7279;&#x624B;&#x6027;&#x87BA;&#x73AF;&#x78B3;&#x4E2D;&#x5FC3;&#xFF0C;&#x901A;&#x8FC7;&#x8FDE;&#x63A5;&#x56F4;-&#x7F9F;&#x57FA;&#x4E09;&#x73AF;&#x82B3;&#x70C3;&#x4E2D;&#x95F4;&#x76F8;&#x9694;&#x4E24;&#x5957;&#x5C55;&#x54C1;&#x70C8;&#x6027;&#x6BD2;&#x6027;&#x548C;&#x5DF2;&#x7ECF;&#x56E0;&#x5176;&#x65B0;&#x9896;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x4F53;&#x7CFB;&#x7ED3;&#x6784;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B0;&#x578B;&#x6297;&#x764C;&#x836F;&#x7269;&#x94C5;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x3002;Fdm &#x57FA;&#x56E0;&#x7C07;&#x88AB;&#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x4E3A; 33 kb DNA &#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x7070;&#x8272;&#x94FE;&#x9709;&#x83CC; ATCC 49344&#xFF0C;&#x548C;&#x5176;&#x53C2;&#x4E0E; FDM A &#x751F;&#x7269;&#x5408;&#x6210;&#x5747;&#x8BC1;&#x5B9E;&#x4E86;&#x57FA;&#x56E0;&#x5931;&#x6D3B;&#x3001; &#x4E92;&#x8865;&#x53CA;&#x5F02;&#x6E90;&#x8868;&#x8FBE;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x3002;Fdm &#x7FA4;&#x96C6;&#x7531; 28 &#x5F00;&#x653E;&#x9605;&#x8BFB;&#x6846;&#x67B6; &#xFF08;ORFs&#xFF09;&#x3001; &#x7F16;&#x7801;&#x7C7B;&#x578B;&#x4E8C;&#x805A;&#x916E;&#x5408;&#x9176; (PK) &#x548C;&#x88C1;&#x7F1D;&#x9176;&#x4EE5;&#x53CA;&#x51E0;&#x4E2A;&#x76D1;&#x7BA1;&#x548C;&#x62B5;&#x6297;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7EC4;&#x6210;&#x3002;FDM PK &#x7279;&#x8272;&#x4E0E;&#x8FC4;&#x4ECA;&#x4E0D;&#x89C1;&#x7684;&#x4E32;&#x8054;&#x5728;&#x5176;&#x6D3B;&#x52A8;&#x7F51;&#x7AD9;&#xFF0C;KSbeta &#x4E9A;&#x57FA;&#x548C;&#x622A;&#x7136;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x5341;&#x516D;&#x8FDB;&#x5236;&#x3001; &#x6EB4;&#x6216; decaketide PKSs&#x3001; KSbeta &#x548C;&#x4E13;&#x7528;&#x7684; phosphopantetheinyl &#x8F6C;&#x79FB;&#x9176;&#x7684;&#x534A;&#x80F1;&#x6C28;&#x9178; KSalpha &#x4E9A;&#x5355;&#x4F4D;&#x3002;FDM PK &#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x7814;&#x7A76;&#x53EF;&#x4EE5;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7C7B;&#x578B; II &#x7684; PK &#x5982;&#x4F55;&#x63A7;&#x5236;&#x94FE;&#x957F;&#x5EA6;&#x4EE5;&#x82B3;&#x9999;&#x65CF;&#x805A;&#x916E;&#x751F;&#x7269;&#x5408;&#x6210;&#x7684;&#x65B0;&#x89C1;&#x89E3;&#x3002;Fdm &#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;fdm &#x7FA4;&#x96C6;&#x4E2D; S.&#x7070;&#x8272;&#x4F53;&#x5185;&#x8868;&#x5F81;&#x548C; fdm &#x7FA4;&#x96C6;&#x5728;&#x94FE;&#x9709;&#x83CC;&#x9EC4;&#x9CDD;&#x7684;&#x5F02;&#x6E90;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x53EF;&#x7528;&#x6027;&#x8BBE;&#x7F6E;&#x8981;&#x8C03;&#x67E5; FDM A &#x751F;&#x7269;&#x5408;&#x6210;&#x548C;&#x5DE5;&#x7A0B;&#x5E08; FDM &#x751F;&#x7269;&#x5408;&#x6210;&#x673A;&#x68B0;&#x751F;&#x4EA7;&#x7684;&#x65B0;&#x578B; FDM A &#x884D;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x9636;&#x6BB5;&#x3002;

&#x514B;&#x9686;&#x3001; &#x6D4B;&#x5E8F;&#x3001; &#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x4ECE;&#x7070;&#x8272;&#x94FE;&#x9709;&#x83CC; fredericamycin &#x751F;&#x7269;&#x5408;&#x6210;&#x57FA;&#x56E0;&#x7C07;&#x7684;&#x5F02;&#x6E90;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;

Fredericamycin (FDM) A, a pentadecaketide featuring two sets of peri-hydroxy tricyclic aromatic moieties connected through a unique chiral spiro carbon center, exhibits potent cytotoxicity and has been studied as a new type of anticancer drug lead because of its novel molecular architecture. The fdm gene cluster was localized to 33-kb DNA segment of Streptomyces griseus ATCC 49344, and its involvement in FDM A biosynthesis was proven by gene inactivation, complementation, and heterologous expression experiments. The fdm cluster consists of 28 open reading frames (ORFs), encoding a type II polyketide synthase (PKS) and tailoring enzymes as well as several regulatory and resistance proteins. The FDM PKS features a KSalpha subunit with heretofore unseen tandem cysteines at its active site, a KSbeta subunit that is distinct phylogenetically from KSbeta of hexa-, octa-, or decaketide PKSs, and a dedicated phosphopantetheinyl transferase. Further study of the FDM PKS could provide new insight into how a type II PKS controls chain length in aromatic polyketide biosynthesis. The availability of the fdm genes, in vivo characterization of the fdm cluster in S. griseus, and heterologous expression of the fdm cluster in Streptomyces albus set the stage to investigate FDM A biosynthesis and engineer the FDM biosynthetic machinery for the production of novel FDM A analogues.

Cloning, sequencing, analysis, and heterologous expression of the fredericamycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces griseus.

Fredericamycin (FDM) A, un pentadecaketide avec deux ensembles de peri-hydroxyl&eacute;es fractions aromatiques tricycliques connect&eacute;es via un centre de carbone unique spiro chiraux, expositions cytotoxicit&eacute; puissante et a &eacute;t&eacute; &eacute;tudi&eacute;e comme un nouveau type de m&eacute;dicament anticanc&eacute;reux plomb en raison de sa nouvelle architecture mol&eacute;culaire. Le groupe de g&egrave;nes de fdm a &eacute;t&eacute; localis&eacute; &agrave; segment d&#39;ADN-33KO de Streptomyces griseus ATCC 49344 et son implication dans la biosynth&egrave;se de la FDM A a &eacute;t&eacute; prouv&eacute;e par les exp&eacute;riences d&#39;expression h&eacute;t&eacute;rologue, compl&eacute;mentation et l&#39;inactivation de g&egrave;nes. Le cluster de fdm comprend 28 ouvert lecture cadres (ORF), codant une type II polyk&eacute;tide synthase (PKS) et l&#39;adaptation des enzymes ainsi que plusieurs r&egrave;glements et prot&eacute;ines de r&eacute;sistance. Le PKS FDM dispose d&#39;une sous-unit&eacute; KSalpha avec cyst&eacute;ines jusqu&#39;alors invisible en tandem &agrave; son site actif, une sous-unit&eacute; de KSbeta qui se distingue sur le plan phylog&eacute;n&eacute;tique KSbeta hexa-, octa-, ou decaketide comparativement et une transf&eacute;rase phosphopantetheinyl d&eacute;di&eacute;. Une &eacute;tude plus approfondie de la PKS FDM pourrait fournir nouvel aper&ccedil;u de la fa&ccedil;on dont un type II PKS contr&ocirc;le longueur de la cha&icirc;ne de biosynth&egrave;se de polyk&eacute;tides aromatiques. La disponibilit&eacute; des g&egrave;nes fdm, caract&eacute;risation in vivo du cluster fdm chez S. griseus et expression h&eacute;t&eacute;rologue du cluster fdm chez Streptomyces albus a pr&eacute;par&eacute; le terrain pour enqu&ecirc;ter sur la biosynth&egrave;se de la FDM A et le m&eacute;canisme de biosynth&egrave;se FDM pour la production de nouveaux analogues de FDM A l&#39;ing&eacute;nieur.

Clonage, s&eacute;quen&ccedil;age, analyse et expression h&eacute;t&eacute;rologue du groupe de g&egrave;nes de biosynth&egrave;se de fredericamycin de Streptomyces griseus.

Fredericamycin (FDM) A, ein Pentadecaketide mit zwei Gruppen von Peri-hydroxy trizyklischen aromatische Adsorptionseigenschaften, verbunden durch eine einzigartige chirale Spiro-Kohlenstoff-Zentrum, Exponate potente Zytotoxizit&auml;t und ist als ein neuartiges Krebsmedikament f&uuml;hren wegen ihrer neuartige molekulare Architektur studiert worden. Das Fdm-gen-Cluster wurde um 33-kb-DNA-Segments von Streptomyces Griseus ATCC 49344 lokalisiert, und sein Engagement im FDM A Biosynthese erwies sich durch Gen-Inaktivierung, Erg&auml;nzung und heterologe Expression Experimente. Der Fdm-Cluster besteht aus 28 offene Rahmen (ORFs) lesen, Codierung einer Typ II Polyketide Synthase (PKS) und Schneiderei, Enzyme sowie mehrere regulatorischen und Widerstand Proteine. Die FDM PKS verf&uuml;gt &uuml;ber eine KSalpha-Untereinheit mit bisher ungesehene Tandem Cysteine am Standort aktiv, eine KSbeta-Untereinheit, die sich phylogenetisch aus KSbeta Hexa-, Octa-oder Decaketide PKSs und eine dedizierte Phosphopantetheinyl-Transferase unterscheidet. Weitere Untersuchungen der FDM PKS konnte einen neuen Einblick in wie ein Typ II PKS Kettenl&auml;nge in aromatischen Polyketid-Biosynthese steuert. Die Verf&uuml;gbarkeit der Fdm-Gene, in-vivo Charakterisierung der Fdm-Cluster in S. Griseus und heterologe Expression der Fdm-Cluster in Streptomyces Albus Voraussetzungen die zu untersuchen FDM A Biosynthese und Ingenieur die biosynthetischen FDM-Maschinen f&uuml;r die Herstellung von neuartigen FDM A-Analoga.

Klonierung, Sequenzierung, Analyse und heterologe Expression von der Fredericamycin-biosynthetischen gen-Cluster aus Streptomyces Griseus.

Fredericamycin (FDM) A, un pentadecaketide con due set di peri-idrossi moiety aromatici triciclici collegato attraverso un centro di carbonio unico spiro chirali, esibisce citotossicit&agrave; potente ed &egrave; stata studiata come un nuovo tipo di droga anticancro piombo a causa del suo romanzo architettura molecolare. Cluster fdm gene &egrave; stato localizzato al segmento di DNA 33-kb di Streptomyces griseus ATCC 49344, e il suo coinvolgimento nella biosintesi di FDM A &egrave; stata dimostrata da esperimenti di espressione eterologa, complementazione e inattivazione del gene. Il cluster fdm &egrave; costituito da 28 open reading frame (ORF), codifica un tipo II polyketide synthase (PKS) e sartoria enzimi come pure diverse normative e proteine delle resistenza. La FDM PKS dispone di una subunit&agrave; KSalpha con cisteine tandem finora invisibili al suo sito attivo, una subunit&agrave; KSbeta distinto filogeneticamente da KSbeta di hexa-, octa-o decaketide PKSs e una transferasi dedicato phosphopantetheinyl. Ulteriori studi la FDM PKS potrebbero fornire nuova intuizione come un tipo II PKS controlla lunghezza catena nella biosintesi di polyketide aromatico. La disponibilit&agrave; dei geni fdm, caratterizzazione in vivo del cluster fdm in S. griseus e l&#39;espressione eterologa del cluster fdm in Streptomyces albus imposta la fase di indagare biosintesi FDM A e l&#39;ingegnere di macchina per la produzione di nuovi analoghi A FDM biosintetico FDM.

Clonazione, sequenziamento, analisi ed espressione eterologa del cluster fredericamycin gene biosintetico da Streptomyces griseus.

Fredericamycin &#xFF08;FDM&#xFF09; &#x306F;&#x3001;2 &#x3064;&#x306E;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3068;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x30AD;&#x30E9;&#x30EB; &#x30B9;&#x30D4;&#x30ED;&#x70AD;&#x7D20;&#x30BB;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066;&#x63A5;&#x7D9A;&#x30DA;&#x30EA; &#x30D2;&#x30C9;&#x30ED;&#x30AD;&#x30B7;&#x4E09;&#x74B0;&#x7CFB;&#x82B3;&#x9999;&#x65CF;&#x90E8;&#x5206;&#x306E;&#x7279;&#x9577; pentadecaketide &#x5F37;&#x529B;&#x306A;&#x7D30;&#x80DE;&#x6BD2;&#x6027;&#x3092;&#x5C55;&#x793A;&#x3057;&#x3001;&#x6297;&#x764C;&#x6027;&#x306E;&#x85AC;&#x5264;&#x306E;&#x925B;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x305D;&#x306E;&#x65B0;&#x898F;&#x5206;&#x5B50;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AD;&#x30C6;&#x30AF;&#x30C1;&#x30E3;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x7814;&#x7A76;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Fdm &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30D7;&#x30C8;&#x8ABF;&#x88FD;&#x3057;, 49344, 33 kb DNA &#x30BB;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306B;&#x30ED;&#x30FC;&#x30AB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30BA;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3001;FDM A &#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x3078;&#x306E;&#x95A2;&#x4E0E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x4E0D;&#x6D3B;&#x5316;&#x3001;&#x88DC;&#x5B8C;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x7570;&#x7A2E;&#x767A;&#x73FE;&#x5B9F;&#x9A13;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8A3C;&#x660E;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;Fdm &#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC; &#x30FB; &#x30D5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30E0; (ORFs) &#x3092;&#x8AAD;&#x3093;&#x3067;&#x3001;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7; II &#x30DD;&#x30EA;&#x30B1;&#x30BF;&#x30A4;&#x30C9;&#x5408;&#x6210;&#x9175;&#x7D20; (PKS) &#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x9175;&#x7D20;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x306A;&#x304F;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x898F;&#x5236;&#x4ED5;&#x7ACB;&#x3066;&#x30AA;&#x30FC;&#x30D7;&#x30F3; 28 &#x62B5;&#x6297;&#x6027;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x304B;&#x3089;&#x6210;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;FDM PKS KSalpha &#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3068;&#x3053;&#x308C;&#x307E;&#x3067;&#x76EE;&#x306B;&#x898B;&#x3048;&#x306A;&#x3044;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0; &#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30A4;&#x30F3;&#x6D3B;&#x6027;&#x90E8;&#x4F4D;&#x3001;&#x7CFB;&#x7D71;&#x767A;&#x751F;&#x306E;&#x30D8;&#x30AD;&#x30B5;&#x3001;octa &#x307E;&#x305F;&#x306F; decaketide Pks&#x3001;KSbeta &#x3068;&#x5C02;&#x7528;&#x306E;&#x30D1;&#x30F3;&#x30C6;&#x30C6;&#x30A4;&#x30F3;&#x304B;&#x3089;&#x533A;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x308B; KSbeta &#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3067;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;FDM PKS &#x306E;&#x3055;&#x3089;&#x306A;&#x308B;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7; II PKS &#x82B3;&#x9999;&#x65CF;&#x30DD;&#x30EA;&#x30B1;&#x30C1;&#x30C9;&#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x9396;&#x9577;&#x3092;&#x5236;&#x5FA1;&#x3059;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Fdm &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;, S. &#x30B0;&#x30EA;&#x30BC;&#x30A6;&#x30B9;&#x306E; fdm &#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E; in vivo &#x306E;&#x30AD;&#x30E3;&#x30E9;&#x30AF;&#x30BF;&#x30EA;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3068; fdm &#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x5185;&#x653E;&#x7DDA;&#x83CC;&#x30A2;&#x30EB;&#x30D0;&#x30B9;&#x306E;&#x7570;&#x7A2E;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x53EF;&#x7528;&#x6027; FDM A &#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x3092;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3057;&#x3001;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B8;&#x30CB;&#x30A2;&#x306E; FDM &#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x6A5F;&#x68B0;&#x5C0F;&#x8AAC; FDM A &#x985E;&#x7E01;&#x4F53;&#x306E;&#x751F;&#x7523;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x30B9;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B8;&#x3092;&#x8A2D;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3001;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x3001;&#x5206;&#x6790;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073; fredericamycin &#x751F;&#x5408;&#x6210;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC; &#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30D7;&#x30C8;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x7570;&#x7A2E;&#x767A;&#x73FE;&#x3002;

Fredericamycin (FDM), peri-hydroxy tricyclic &#xC544;&#xB85C;&#xB9C8; moieties &#xACE0;&#xC720; &#xD0A4; &#xB784; &#xC2A4;&#xD53C;&#xB85C; &#xD0C4;&#xC18C; &#xC13C;&#xD130;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; &#xB450; &#xC138;&#xD2B8;&#xB97C; &#xAC16;&#xCD98; pentadecaketide &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xC138;&#xD3EC; &#xB3C5;&#xC131;&#xC744; &#xC804;&#xC2DC; &#xD558; &#xACE0; &#xADF8; &#xC18C;&#xC124; &#xBD84;&#xC790; &#xAD6C;&#xC870; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xD56D; &#xC554; &#xC81C; &#xC57D;&#xBB3C; &#xB9AC;&#xB4DC;&#xC758; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC720;&#xD615;&#xC73C;&#xB85C; &#xACF5;&#xBD80; &#xD558;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4;. Fdm &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xB294; 33 kb DNA &#xC138;&#xADF8;&#xBA3C;&#xD2B8; Streptomyces griseus ATCC 49344, &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; &#xBC0F; FDM A &#xC0DD; &#xD569;&#xC131;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xADF8;&#xAC83;&#xC758; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBE44;&#xD65C;&#xC131;&#xD654;, &#xBCF4;&#xC644;&#xC131;, &#xBC0F; &#xBD84;&#xB9AC; &#xC2DD; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC785;&#xC99D; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. Fdm &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130; 28 &#xC5F4;&#xB824;&#xC788;&#xB294; &#xB3C5;&#xC11C; &#xD504;&#xB808;&#xC784; (ORFs) &#xC720;&#xD615; II polyketide synthase (PKS) &#xC778;&#xCF54;&#xB529;&#xACFC; &#xD6A8;&#xC18C; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xAC00;&#xC9C0; &#xADDC;&#xC815;&#xC5D0; &#xB9DE;&#xCD94;&#xC5B4; &#xC800;&#xD56D; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xAD6C;&#xC131; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. FDM PKS&#xC758; &#xD65C;&#xC131; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;, hexa, octa &#xB610;&#xB294; decaketide PKSs, KSbeta &#xBC0F; &#xC804;&#xC6A9;&#xB41C; phosphopantetheinyl&#xACFC; phylogenetically &#xB2E4;&#xB978; KSbeta &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC9C0;&#xAE08;&#xAE4C;&#xC9C0; &#xBCF4;&#xC774;&#xC9C0; &#xC54A;&#xB294; &#xD611;&#xB3D9; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD14C;&#xC778;&#xACFC; KSalpha &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704; &#xAE30;&#xB2A5;. FDM PKS&#xC758; &#xCD94;&#xAC00; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xC720;&#xD615; II PKS &#xC544;&#xB85C;&#xB9C8; polyketide &#xC0DD; &#xD569;&#xC131;&#xC5D0; &#xCCB4;&#xC778; &#xAE38;&#xC774; &#xC81C;&#xC5B4; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. S. griseus&#xC5D0; fdm &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xC758; in vivo &#xD2B9;&#xC131; &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F; Streptomyces albus&#xC5D0;&#xC11C; fdm &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xC758; &#xBD84;&#xB9AC; &#xC2DD;&#xC744; fdm &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xAC00;&#xC6A9;&#xC131; FDM A &#xC0DD; &#xD569;&#xC131;&#xC744; &#xC870;&#xC0AC; &#xD558; &#xACE0; &#xC18C;&#xC124; FDM A analogues&#xC758; &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; FDM &#xC0DD; &#xD569;&#xC131; &#xAE30;&#xACC4; &#xAE30;&#xC220;&#xC790;&#xC5D0; &#xBB34;&#xB300;&#xB97C; &#xC124;&#xC815;.

&#xBCF5;&#xC81C;, &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1;, &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F; Streptomyces griseus&#xC5D0;&#xC11C; fredericamycin &#xC0DD; &#xD569;&#xC131; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xC758; &#xBD84;&#xB9AC; &#xC2DD;.

Fredericamycin (FDM) A, un pentadecaketide con dos juegos de peri-hidroxis moieties arom&aacute;ticos tric&iacute;clicos conectados a trav&eacute;s de un centro de carbono &uacute;nico spiro quirales, exhibe la citotoxicidad potente y se ha estudiado como un nuevo tipo de medicamento contra el plomo debido a su novedosa arquitectura molecular. El racimo del gene fdm fue localizado a 33 kb segmento de ADN de Streptomyces griseus ATCC 49344, y su participaci&oacute;n en la bios&iacute;ntesis de la FDM A fue probada por la inactivaci&oacute;n del gen, complementaci&oacute;n y experimentos de expresi&oacute;n heter&oacute;loga. El racimo de fdm consiste en 28 abierto Leer Marcos (ORFs), codificaci&oacute;n un tipo II polyketide synthase (PKS) y enzimas, as&iacute; como varios reguladores de sastrer&iacute;a y prote&iacute;nas de la resistencia. La FDM PKS cuenta con una subunidad KSalpha con ciste&iacute;nas t&aacute;ndem hasta ahora invisible en su sitio activo, una subunidad de KSbeta que es distinta filogen&eacute;ticamente KSbeta de hexa-, octa- o decaketide PKSs y una dedicado phosphopantetheinyl transferasa. Otro estudio de la FDM PKS podr&iacute;a proporcionar la nueva penetraci&oacute;n en c&oacute;mo un tipo II PKS controla la longitud de la cadena en bios&iacute;ntesis Polic&eacute;tido arom&aacute;tico. La disponibilidad de los genes de la fdm, caracterizaci&oacute;n in vivo de la fdm del racimo en S. griseus y expresi&oacute;n heter&oacute;loga de la fdm del racimo en Streptomyces albus prepar&oacute; el terreno para investigar la bios&iacute;ntesis de la FDM A e Ingeniero la maquinaria biosint&eacute;tica de FDM para la producci&oacute;n de an&aacute;logos de la FDM A novela.

Clonaci&oacute;n, secuenciaci&oacute;n, an&aacute;lisis y expresi&oacute;n heter&oacute;loga del cluster fredericamycin genes biosint&eacute;ticos de Streptomyces griseus.

&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x662F;&#x5176;&#x4E2D;&#x4E00;&#x4E2A;&#x6700;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x7C7B;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x53CA;&#x5176;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x7269;&#x7684;&#x4FEE;&#x6539;&#xFF0C;&#x4F46;&#x7CD6;&#x7684;&#x9274;&#x5B9A;&#x5F88;&#x56F0;&#x96BE;&#xFF0C;&#x56E0;&#x4E3A;&#x5176;&#x5206;&#x652F;&#x7684;&#x673A;&#x6784;&#x548C;&#x4F17;&#x591A;&#x7684;&#x5F02;&#x6784;&#x4F53;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x63CF;&#x8FF0;&#x4E86;&#x4E00;&#x79CD;&#x7B97;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x79F0;&#x4E3A; O-&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x7ED3;&#x6784;&#xFF0C;&#x901A;&#x8FC7;&#x81EA;&#x52A8;&#x5206;&#x6790;&#x788E;&#x7247;&#x8D28;&#x8C31;&#x7684; CartoonistTwo&#x3002;CartoonistTwo &#x540E;&#x4EE5;&#x524D;&#x7CD6;&#x8BC6;&#x522B;&#x8F6F;&#x4EF6;&#xFF0C;&#x4E3B;&#x8981;&#x662F;&#x5728;&#x5176;&#x8BC4;&#x5206;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#xFF0C;&#x63D0;&#x9AD8;&#x4E86;&#xFF0C;&#x53EF;&#x4EE5;&#x66F4;&#x6210;&#x529F;&#x533A;&#x5206;&#x5927;&#x91CF;&#x7684;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x7ED3;&#x6784;&#x3002;CartoonistTwo &#x8BBE;&#x8BA1;&#x548C;&#x4E0E;&#x8D28;&#x8C31;&#x4EEA;&#x8D28;&#x8C31;&#x6D4B;&#x8BD5;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x81EA;&#x52A8;&#x6821;&#x6B63;&#x548C;&#x5BF9;&#x4E8E;&#x8FD9;&#x79CD;&#x6570;&#x636E;&#xFF0C;&#x5C24;&#x5176;&#x662F;&#x8C03;&#x8C10;&#x7684;&#x9AD8;&#x5CF0;&#x9009;&#x62E9;&#x4F46;&#x4EBA;&#x4EEC;&#x53EF;&#x4EE5;&#x8F7B;&#x677E;&#x5730;&#x9002;&#x5E94;&#x788E;&#x7247;&#x8C31; (MS2 &#x6216; MSn) &#x5411;&#x4ECE;&#x5176;&#x4ED6;&#x6587;&#x4E66;&#x7C7B;&#x578B;&#x3002;&#x4ECE;&#x975E;&#x6D32;&#x722A;&#x87FE;&#x5375;&#x679C;&#x51BB; 34 &#x8568;&#x7C7B; CID MSn &#x8D28;&#x8C31;&#x4EEA;&#x8C31;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x7684;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x96C6;&#xFF0C;CartoonistTwo &#x7ED9;&#x624B;&#x52A8;&#x786E;&#x5B9A;&#x7ED3;&#x6784;&#x5206;&#x914D;&#x6216;&#x8005;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6216;&#x7B2C;&#x4E8C;&#x4E2A;&#x5F97;&#x5206;&#x6700;&#x9AD8;&#x8D85;&#x8FC7; 90%&#x7684;&#x65F6;&#x95F4;&#x3002;50%&#x4EE5;&#x4E0A;&#x7684;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5149;&#x8C31;&#xFF0C;CartoonistTwo &#x9009;&#x62E9;&#x540C;&#x610F;&#x624B;&#x52A8;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E00;&#x4E2A;&#x552F;&#x4E00;&#x6700;&#x9AD8;&#x8BC4;&#x5206;&#x7ED3;&#x6784;&#x3002;

&#x4ECE;&#x788E;&#x7247;&#x8C31;&#x6FB3;&#x7CD6;&#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x81EA;&#x52A8;&#x786E;&#x5B9A;&#x3002;

Glycosylation is one of the most important classes of post-translational protein modifications, but the identification of glycans is difficult because of their branched structures and numerous isomers. We describe an algorithm called CartoonistTwo that proposes structures for O-linked glycans by automatically analyzing fragmentation mass spectra. CartoonistTwo improves upon previous glycan identification software primarily in its scoring function, which can more successfully distinguish among a number of similar structures. CartoonistTwo was designed and tested with FTICR mass spectra, and includes automatic recalibration and peak selection especially tuned for such data, yet it can be easily adapted to fragmentation spectra (MS2 or MSn) from other instrument types. On a validated test set of 34 SORI-CID MSn FTICR spectra from Xenopus egg jelly, CartoonistTwo gave the manually determined structural assignment either the first or second highest score over 90% of the time. And for over 50% of these spectra, CartoonistTwo selected a unique highest scoring structure that agreed with the manually determined one.

Automatic determination of O-glycan structure from fragmentation spectra.

La glycosylation est une des classes plus importantes des modifications prot&eacute;iques post-traduction, mais l&#39;identification des glycanes est difficile en raison de leurs structures ramifi&eacute;es et nombreux isom&egrave;res. Nous d&eacute;crivons un algorithme appel&eacute; CartoonistTwo qui propose des structures pour O-glycanes en analysant automatiquement les spectres de masse de fragmentation. CartoonistTwo am&eacute;liore pr&eacute;c&eacute;dentes du logiciel d&#39;identification de glycane principalement dans sa fonction de notation, qui peuvent plus correctement distinguer parmi un certain nombre de structures similaires. CartoonistTwo a &eacute;t&eacute; con&ccedil;u et test&eacute; avec les spectres de masse FTICR et comprend un recalibrage automatique et s&eacute;lection de pointe sp&eacute;cialement optimis&eacute;e pour ces donn&eacute;es, mais il peut &ecirc;tre facilement adapt&eacute; aux spectres de fragmentation (MS2 ou MSn) des autres types d&#39;instrument. Sur un ensemble de test valid&eacute; des spectres de SORI-CID MSn FTICR 34 de Xenopus oeuf gel&eacute;e, CartoonistTwo a donn&eacute; l&#39;affectation structurelle d&eacute;termin&eacute;e manuellement soit le premier ou le deuxi&egrave;me score le plus &eacute;lev&eacute; plus de 90 % du temps. Et pour plus de 50 % de ces spectres, CartoonistTwo a choisi une structure unique de cotation plus &eacute;lev&eacute;e qui a convenu avec celle d&eacute;termin&eacute;e manuellement.

D&eacute;termination automatique de la structure des O-glycanes de spectres de fragmentation.

Glykosylierung ist eine der wichtigsten Klassen des Proteins POSTTRANSLATIONELLE Modifikationen, aber die Identifizierung der Glykane ist schwierig, weil ihre verzweigten Strukturen und zahlreiche Isomere. Wir beschreiben einen Algorithmus namens CartoonistTwo, die Strukturen f&uuml;r O-chromosomale Glykane schl&auml;gt, durch Fragmentierung Massenspektren automatisch zu analysieren. CartoonistTwo verbessert zur&uuml;ck Glykan-Identifikation-Software vor allem in ihrer scoring-Funktion, die mehr erfolgreich eine Reihe von &auml;hnlichen Strukturen unterscheiden k&ouml;nnen. CartoonistTwo wurde entwickelt und getestet mit FTICR Massenspektren umfasst automatische Rekalibrierung und Gipfel-Auswahl, die vor allem f&uuml;r solche Daten abgestimmt, doch es leicht angepasst werden, um Fragmentierung Spektren (MS2 oder MSn) aus anderen Instrument sein kann. Auf validierten Test Set 34 SORI-CID MSn FTICR Spektren von Xenopus Ei Gelee gab CartoonistTwo der manuell zielstrebig strukturellen Zuordnung entweder die erste oder zweite h&ouml;chste Punktzahl &uuml;ber 90 % der Zeit. Und mehr als 50 % des diese Spektren, CartoonistTwo eine einzigartige h&ouml;chste erzielte Struktur, die mit dem manuell zielstrebig vereinbart.

Automatische Ermittlung der O-Glykan-Struktur von Fragmentierung Spektren.

Glicosilazione &egrave; una delle pi&ugrave; importanti classi di modifiche alberino-di traduzione della proteina, ma l&#39;identificazione dei glicani &egrave; difficile a causa delle loro strutture ramificate e numerosi isomeri. Descriviamo un algoritmo chiamato CartoonistTwo che propone strutture per O-linked glicani analizzando automaticamente spettri di massa di frammentazione. CartoonistTwo migliora precedente software di identificazione glycan principalmente nella sua funzione di punteggio, che pu&ograve; pi&ugrave; correttamente distinguere fra un certo numero di strutture simili. CartoonistTwo &egrave; stato progettato e testato con spettri di massa FTICR e comprende la ritaratura automatica e selezione di picco specialmente sintonizzati per tali dati, ma pu&ograve; essere facilmente adattato a spettri di frammentazione (MS2 o MSn) da altri tipi di strumento. Su un set di test validati di spettri di SORI-CID MSn FTICR 34 da gelatina di uovo di Xenopus, CartoonistTwo diede l&#39;assegnazione strutturale determinato manualmente il punteggio pi&ugrave; alto o primo o secondo oltre il 90% del tempo. E per oltre il 50% di questi spettri, CartoonistTwo selezionato un&#39;unica struttura pi&ugrave; alta punteggio che ha accettato con quella determinata manualmente.

Determinazione automatica della struttura O-glycan dagli spettri di frammentazione.

&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x7FFB;&#x8A33;&#x5F8C;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306E;&#x6700;&#x3082;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x306E; 1 &#x3064;&#x3067;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x5206;&#x5C90;&#x69CB;&#x9020;&#x3068;&#x591A;&#x6570;&#x306E;&#x7570;&#x6027;&#x4F53;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x304C;&#x56F0;&#x96E3;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x81EA;&#x52D5;&#x7684;&#x306B;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x8CEA;&#x91CF;&#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3067;&#x7CD6;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x63D0;&#x6848;&#x3059;&#x308B; CartoonistTwo &#x3068;&#x547C;&#x3070;&#x308C;&#x308B;&#x30A2;&#x30EB;&#x30B4;&#x30EA;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x8A18;&#x8FF0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;CartoonistTwo &#x5411;&#x4E0A;&#x4EE5;&#x524D;&#x306E;&#x7CD6;&#x9396;&#x540C;&#x5B9A;&#x30BD;&#x30D5;&#x30C8;&#x30A6;&#x30A7;&#x30A2;&#x4E3B;&#x306B;&#x305D;&#x306E;&#x30B9;&#x30B3;&#x30A2;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x95A2;&#x6570;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x6B63;&#x5E38;&#x306B;&#x985E;&#x4F3C;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x6570;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x533A;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;CartoonistTwo &#x8A2D;&#x8A08;&#x3057; FTICR &#x8CEA;&#x91CF;&#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x3068;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x3055;&#x308C;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB; (MS2 &#x307E;&#x305F;&#x306F; MSn) &#x4ED6;&#x306E;&#x697D;&#x5668;&#x306E;&#x7A2E;&#x985E;&#x304B;&#x3089;&#x7C21;&#x5358;&#x306B;&#x9069;&#x5FDC;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3001;&#x307E;&#x3060;&#x81EA;&#x52D5;&#x518D;&#x6821;&#x6B63;&#x3068;&#x7279;&#x306B;&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x5834;&#x5408;&#x306F;&#x3001;&#x8ABF;&#x6574;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30D4;&#x30FC;&#x30AF;&#x9078;&#x629E;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30A2;&#x30D5;&#x30EA;&#x30AB;&#x30C4;&#x30E1;&#x30AC;&#x30A8;&#x30EB;&#x5375;&#x30BC;&#x30EA;&#x30FC;&#x304B;&#x3089; 34 &#x66FD;&#x5229; CID MSn FTICR &#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x306E;&#x691C;&#x8A3C;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x96C6;&#x5408;&#x3067;&#x306F;&#x3001;CartoonistTwo &#x306F;&#x3069;&#x3061;&#x3089;&#x304B;&#x6700;&#x521D;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x7B2C; 2 &#x6700;&#x3082;&#x9AD8;&#x3044;&#x30B9;&#x30B3;&#x30A2;&#x306F;&#x6642;&#x9593;&#x306E; 90 &#xFF05; &#x4EE5;&#x4E0A;&#x624B;&#x52D5;&#x3067;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x5272;&#x308A;&#x5F53;&#x3066;&#x3092;&#x4E0E;&#x3048;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x306E; 50 &#xFF05; &#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E; CartoonistTwo &#x306E;&#x9078;&#x629E;&#x306F;&#x624B;&#x52D5;&#x3067;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3082;&#x306E;&#x3068;&#x5408;&#x610F;&#x3057;&#x305F;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x6700;&#x9AD8;&#x306E;&#x30B9;&#x30B3;&#x30A2;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x3002;

O &#x578B;&#x7CD6;&#x9396;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x81EA;&#x52D5;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3002;

Glycosylation &#xB2E2; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC218;&#xC815; &#xC791;&#xC5C5;&#xC758; &#xAC00;&#xC7A5; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xD074;&#xB798;&#xC2A4; &#xC911; &#xD558;&#xB098;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xBD84;&#xAE30; &#xAD6C;&#xC870; &#xBC0F; &#xC218;&#xB9CE;&#xC740; &#xC131;&#xCCB4; glycans &#xC2DD;&#xBCC4; &#xC5B4;&#xB835;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; O &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; glycans&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC790;&#xB3D9;&#xC73C;&#xB85C; &#xC870;&#xAC01;&#xD654; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC744; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558; &#xC5EC; &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; Cartoonisttwo&#xB97C; &#xD638;&#xCD9C; &#xD558;&#xB294; &#xC54C;&#xACE0;&#xB9AC;&#xC998;&#xC744; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Cartoonisttwo&#xB294; &#xB354; &#xC131;&#xACF5;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xAD6C;&#xBD84;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBE44;&#xC2B7;&#xD55C; &#xAD6C;&#xC870; &#xC218; &#xC911; &#xC774;&#xC804; glycan &#xC2DD;&#xBCC4; &#xC18C;&#xD504;&#xD2B8;&#xC6E8;&#xC5B4; &#xC8FC;&#xB85C; &#xADF8; &#xC810;&#xC218; &#xB9E4;&#xAE30;&#xAE30; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xD5A5;&#xC0C1; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. CartoonistTwo &#xC124;&#xACC4;&#xB294; FTICR &#xC9C8;&#xB7C9; &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC27D;&#xAC8C; &#xC801;&#xC751; &#xC870;&#xAC01;&#xD654; &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC; (MS2 &#xB610;&#xB294; MSn) &#xB2E4;&#xB978; &#xC545;&#xAE30; &#xC885;&#xB958;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC544;&#xC9C1; &#xC790;&#xB3D9; recalibration &#xD2B9;&#xD788; &#xADF8;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC870;&#xC815; &#xB41C; &#xD53C;&#xD06C; &#xC120;&#xD0DD; &#xD3EC;&#xD568;. Xenopus &#xB2EC;&#xAC40; &#xC824;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; 34 &#xC18C;&#xB9AC; CID MSn FTICR &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC758; &#xC720;&#xD6A8;&#xD55C; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0; CartoonistTwo &#xC900; &#xC218;&#xB3D9;&#xC73C;&#xB85C; &#xACB0;&#xC815;&#xB41C; &#xAD6C;&#xC870; &#xD560;&#xB2F9; &#xD558;&#xAC70;&#xB098; &#xCCAB; &#xBC88;&#xC9F8; &#xB610;&#xB294; &#xB450; &#xBC88;&#xC9F8; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB192;&#xC740; &#xC810;&#xC218;&#xB294; &#xC2DC;&#xAC04;&#xC758; 90% &#xC774;&#xC0C1;. &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC758; 50% &#xC774;&#xC0C1;&#xC744; CartoonistTwo &#xC120;&#xD0DD; &#xC218;&#xB3D9;&#xC73C;&#xB85C; &#xACB0;&#xC815;&#xB41C; &#xD55C; &#xB3D9;&#xC758; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xCD5C;&#xACE0; &#xB4DD;&#xC810; &#xAD6C;&#xC870;.

O glycan &#xAD6C;&#xC870; &#xC870;&#xAC01;&#xD654; &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xC790;&#xB3D9; &#xACB0;&#xC815;.

Glicosilaci&oacute;n es una de las clases m&aacute;s importantes de las modificaciones post-traduccionales de la prote&iacute;na, pero la identificaci&oacute;n de glicanos es dif&iacute;cil debido a sus estructuras ramificadas y numerosos is&oacute;meros. Se describe un algoritmo llamado CartoonistTwo que propone estructuras para glycans vinculados O analizando autom&aacute;ticamente los espectros de masas de fragmentaci&oacute;n. CartoonistTwo mejora software de identificaci&oacute;n de glicanos anterior principalmente en su funci&oacute;n de puntuaci&oacute;n, que pueden m&aacute;s con &eacute;xito distinguir entre un n&uacute;mero de estructuras similares. CartoonistTwo fue dise&ntilde;ado y probado con espectros de masas FTICR e incluye recalibraci&oacute;n autom&aacute;tica y selecci&oacute;n pico especialmente dise&ntilde;ado para tales datos, pero puede ser f&aacute;cilmente adaptado a los espectros de fragmentaci&oacute;n (MS2 o MSn) de otros tipos de instrumentos. En un conjunto de pruebas validadas de espectros de SORI-CID MSn FTICR 34 de Xenopus huevo jalea, CartoonistTwo dio la asignaci&oacute;n estructural determinada manualmente el puntaje m&aacute;s alto ya sea primero o segundo m&aacute;s del 90% del tiempo. Y m&aacute;s del 50% de estos espectros, CartoonistTwo hab&iacute;a seleccionado una estructura &uacute;nica de puntuaci&oacute;n m&aacute;s alta que de acuerdo con una determinada manualmente.

Determinaci&oacute;n autom&aacute;tica de la estructura O-glicanos de espectros de fragmentaci&oacute;n.

Glycomic &#x65B9;&#x6CD5;&#x7684;&#x5236;&#x5B9A;&#x662F;&#x4E3A;&#x4E86;&#x901A;&#x8FC7;&#x8FC5;&#x901F;&#x5206;&#x6790;&#x5168;&#x7403;&#x53D1;&#x5E03;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x8BC6;&#x522B;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x4E3A;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x7684;&#x6807;&#x8BB0;&#x3002;&#x5728;&#x4E0A;&#x6E05;&#x6DB2;&#x4E2D;&#x627E;&#x5230;&#x68DA;&#x764C;&#x75C7;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D; &#xFF08;&#x6216;&#x57F9;&#x517B;&#x57FA;&#xFF09; &#x7684;&#x57F9;&#x517B;&#x7EC6;&#x80DE;&#x3002;&#x5728;&#x6B64;&#x65B9;&#x6CD5;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x4F7F;&#x7528; &beta;-&#x6D88;&#x9664;&#x6761;&#x4EF6;&#x5176;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x542B;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x68DA;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;&#x7531;&#x57FA;&#x8D28;&#x8F85;&#x52A9;&#x6FC0;&#x5149;&#x89E3;&#x5438;/&#x7535;&#x79BB;&#x5085;&#x91CC;&#x53F6;&#x53D8;&#x6362;&#x79BB;&#x5B50;&#x56DE;&#x65CB;&#x5171;&#x632F;&#x8D28;&#x8C31;&#x6CD5; (&#x9A6C;&#x5C14;&#x8FEA;-&#x8D28;&#x8C31;&#x4EEA;-MS) &#x76D1;&#x63A7;&#xFF0C;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;&#x56E0;&#x4E3A;&#x8840;&#x6E05;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x8FD8;&#x4F1A;&#x53D1;&#x73B0;&#x68DA;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x7CD6;&#x5206;&#x6790;&#x4EE5;&#x89C2;&#x5BDF;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x6807;&#x8BB0;&#x3002;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x5BF9;&#x4E00;&#x7EC4;&#x6709;&#x9650;&#x7684;&#x60A3;&#x8005;&#x548C;&#x6B63;&#x5E38;&#x8840;&#x6E05;&#x6837;&#x672C;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x6570;&#x636E;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x7814;&#x7A76;&#xFF0C;&#x786E;&#x5B9A;&#x6F5C;&#x5728;&#x7CD6;&#x6807;&#x8BB0;&#x5728;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x80FD;&#x591F;&#x8BC1;&#x660E;&#x7684;&#x6240;&#x6709;&#x60A3;&#x8005;&#x81F3;&#x5C11; 15 &#x72EC;&#x7279;&#x8840;&#x6E05;&#x7CD6;&#x6307;&#x6807;&#x5B58;&#x5728;&#x4F46;&#x6CA1;&#x6709;&#x4E86;&#x6B63;&#x5E38;&#x4EBA;&#x3002;&#x8981;&#x786E;&#x5B9A;&#x7CD6;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#xFF0C;&#x4E00;&#x4E9B;&#x79BB;&#x5B50;&#x662F;&#x5B64;&#x7ACB;&#x548C;&#x8FDB;&#x884C;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x4F7F;&#x7528;&#x7EA2;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x79BB; (IRMPD)&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x4E3B;&#x8981;&#x4F18;&#x70B9;&#x662F;&#x7CD6;&#x5BA1;&#x67E5;&#x76F4;&#x63A5;&#x4ECE;&#x75C5;&#x4EBA;&#x7684;&#x8840;&#x6E05;&#xFF0C;&#x800C;&#x65E0;&#x9700;&#x83B7;&#x5F97;&#x764C;&#x75C7;&#x6D3B;&#x68C0;&#x6807;&#x672C;&#x6216;&#x51C0;&#x5316;&#x7CD6;&#x5316;&#x86CB;&#x767D;&#x4ECE;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6807;&#x672C;&#x3002;

&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x7684;&#x6F5C;&#x5728;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x7684;&#x53D1;&#x73B0;&#x8840;&#x6E05;&#x4E2D;&#x7CD6;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

A glycomic approach is developed to identify oligosaccharide markers for ovarian cancer by rapidly profiling globally released oligosaccharides. Glycoproteins shed by cancer cells are found in the supernatant (or conditioned media) of cultured cells. In this approach, shed glycoproteins are profiled for their oligosaccharide content using beta-elimination conditions. Changes in glycosylation are monitored by matrix-assisted laser desorption/ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry (MALDI-FTICR-MS). Because shed glycoproteins would also be found in serum, similar glycan profiling was performed to observe potential oligosaccharide markers. Oligosaccharide profiling data on a limited set of patient and normal serum samples were studied to determine potential glycan markers in ovarian cancer. We were able to demonstrate the presence of at least 15 unique serum glycan markers in all patients but absent in normal individuals. To determine the structure of the glycan biomarkers, a number of the ions were isolated and further analyzed using infrared multiphoton dissociation (IRMPD). One major advantage of this approach is that glycans are examined directly from patient sera without the need to obtain cancer biopsy specimens or to purify glycosylated proteins from these specimens.

Profiling of glycans in serum for the discovery of potential biomarkers for ovarian cancer.

Une approche glycomic est mis au point pour identifier des marqueurs d&#39;oligosaccharide pour cancer de l&#39;ovaire par profilage rapidement lib&eacute;r&eacute;s dans le monde des oligosaccharides. Glycoprot&eacute;ines r&eacute;pandu par les cellules canc&eacute;reuses sont trouvent dans le surnageant (ou conditionn&eacute; m&eacute;dias) des cellules en culture. Dans cette approche, hangar glycoprot&eacute;ines sont profil&eacute;es pour leur teneur en oligosaccharides b&ecirc;ta &eacute;limination-conditions d&#39;utilisation. Changements dans la glycosylation sont surveill&eacute;es par d&eacute;sorption-ionisation de laser assist&eacute;e par matrice Fourier transform ion cyclotron resonance spectrom&eacute;trie de masse (MALDI-FTICR-MS). Parce que les glycoprot&eacute;ines hangar se trouveraient &eacute;galement dans le s&eacute;rum, profilage de glycane similaire a &eacute;t&eacute; r&eacute;alis&eacute; afin d&#39;observer les marqueurs oligosaccharide potentiels. Donn&eacute;es de profilage oligosaccharide sur un nombre limit&eacute; d&#39;&eacute;chantillons de s&eacute;rum de patient et normal ont &eacute;t&eacute; &eacute;tudi&eacute;es afin de d&eacute;terminer les marqueurs potentiels de glycan dans le cancer de l&#39;ovaire. Nous avons pu d&eacute;montrer la pr&eacute;sence d&#39;au moins 15 marqueurs de glycane s&eacute;rum unique chez tous les patients, mais absent chez les individus normaux. Pour d&eacute;terminer la structure des biomarqueurs glycan, un certain nombre des ions ont &eacute;t&eacute; isol&eacute; et plus analys&eacute; &agrave; l&#39;aide de dissociation multiphotonique infrarouge (DMPIR). Un avantage majeur de cette approche est que les glycanes sont examin&eacute;s directement &agrave; partir de s&eacute;rums de patients sans avoir besoin d&#39;obtenir cancer de biopsie ou de purifier des prot&eacute;ines glycosyl&eacute;es de ces sp&eacute;cimens.

Profilage des glycanes dans le s&eacute;rum pour la d&eacute;couverte de biomarqueurs potentiels pour le cancer de l&#39;ovaire.

Ein Glycomic Ansatz ist entwickelt, um die Oligosaccharid-Marker f&uuml;r Eierstockkrebs zu identifizieren, durch schnell weltweit ver&ouml;ffentlichten Oligosaccharide Profilerstellung. Glykoproteine, die Schuppen von Krebszellen findet man in den &uuml;berstand (oder konditioniert Medien) der kultivierten Zellen. Bei diesem Ansatz sind Schuppen Glykoproteine f&uuml;r ihre Oligosaccharid-Inhalt anhand der Beta-Beseitigung profiliert. &Auml;nderungen in der Glykosylierung werden von Matrix-unterst&uuml;tzte Laser-Desorption/Ionisation-Fourier Transform Ion Zyklotron-Resonanz Massenspektrometrie (MALDI-FTICR-MS) &uuml;berwacht. Da Schuppen Glykoproteine auch im Serum gefunden werden w&uuml;rde, war &auml;hnlich Glykan-Profilerstellung durchgef&uuml;hrt, um potentielle Oligosaccharid-Marker zu beobachten. Oligosaccharid Profilerstellungsdaten auf eine beschr&auml;nkte Zahl von Patienten und normalen Serumproben wurden untersucht, um potentielle Glykan-Marker bei Eierstockkrebs zu bestimmen. Wir konnten das Vorhandensein von mindestens 15 einzigartige Serum-Glykan-Marker bei allen Patienten zu demonstrieren, aber abwesend in den normalen Einzelpersonen. Um die Struktur der Glykan-Biomarker zu ermitteln, wurden eine Anzahl von Ionen isoliert und mit Infrarot multiphoton Dissoziation (IRMPD) weiter analysiert. Ein gro&szlig;er Vorteil dieses Ansatzes ist, da&szlig; Glykane direkt vom Patientenserum ohne die Notwendigkeit, um Krebs Biopsie Proben oder glykosylierter Proteine aus diesen Proben reinigen gepr&uuml;ft werden.

Profilerstellung von Glykane im Serum f&uuml;r die Entdeckung der potenzielle Biomarker f&uuml;r Eierstockkrebs.

Un approccio glycomic &egrave; sviluppato per identificare i marcatori oligosaccaride per il cancro ovarico mediante profilatura rapidamente rilasciati globalmente oligosaccaridi. Glicoproteine capannone da cellule tumorali si trovano nel surnatante (o condizionata media) di cellule in coltura. In questo approccio, capannone glicoproteine sono profilate per il loro contenuto di oligosaccaride utilizzando condizioni di beta-eliminazione. Cambiamenti nella glicosilazione sono monitorati da matrix-assisted laser desorbimento/ionizzazione Fourier transform ione risonanza ciclotronica (MALDI-FTICR-MS). Perch&eacute; capannone glicoproteine vuoi essere trovate anche nel siero, profilatura glycan simile &egrave; stata eseguita per osservare potenziali markers oligosaccaride. Dati di profilazione oligosaccaride su un set limitato di campioni di siero del paziente e normale sono stati studiati per determinare potenziali markers glycan nel carcinoma ovarico. Siamo stati in grado di dimostrare la presenza di almeno 15 marcatori di glycan siero unico in tutti i pazienti, ma assente in individui normali. Per determinare la struttura dei biomarcatori glycan, un certo numero di ioni sono stato isolato e ulteriormente analizzato utilizzando dissociazione infrarossa multifotonica (IRMPD). Uno dei principali vantaggi di questo approccio &egrave; che glicani vengono esaminate direttamente dal siero dei pazienti senza la necessit&agrave; di ottenere il cancro campioni bioptici o per purificare le proteine glicosilate da questi campioni.

Profilatura dei glicani in siero per la scoperta di potenziali biomarcatori per cancro ovarico.

&#x30A4;&#x30F3;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30DE;&#x30C6;&#x30A3;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9; &#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306F;&#x6025;&#x901F;&#x306B;&#x4E16;&#x754C;&#x7684;&#x306B;&#x30EA;&#x30EA;&#x30FC;&#x30B9;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x3092;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x7CD6;&#x9396;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x958B;&#x767A;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x764C;&#x7D30;&#x80DE;&#x3092;&#x6D41;&#x3059;&#x4E0A;&#x6F84;&#x307F;&#x3092;&#x767A;&#x898B; &#xFF08;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30A8;&#x30A2;&#x30B3;&#x30F3; &#x30E1;&#x30C7;&#x30A3;&#x30A2;&#xFF09; &#x57F9;&#x990A;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x5C0F;&#x5C4B;&#x306E;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30D9;&#x30FC;&#x30BF;&#x9664;&#x53BB;&#x6761;&#x4EF6;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x81EA;&#x5206;&#x306E;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30F3;&#x30C4;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7CD6;&#x9396;&#x5909;&#x5316;&#x30DE;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x652F;&#x63F4;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B6;&#x30FC;&#x8131;&#x96E2;/&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x5316;&#x30D5;&#x30FC;&#x30EA;&#x30A8;&#x5909;&#x63DB;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3; &#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x5171;&#x9CF4;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790; &#xFF08;MALDI FTICR MS) &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x76E3;&#x8996;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5C0F;&#x5C4B;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x304C;&#x8840;&#x6E05;&#x306B;&#x3082;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3060;&#x308D;&#x3046;&#x306E;&#x3067;&#x3001;&#x4F3C;&#x305F;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x7CD6;&#x9396;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3092;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3059;&#x308B;&#x884C;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0; &#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x60A3;&#x8005;&#x3068;&#x6B63;&#x5E38;&#x8840;&#x6E05;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x306E;&#x9650;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x7CD6;&#x9396;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x305F;&#x3002;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x60A3;&#x8005;&#x306E;&#x5C11;&#x306A;&#x304F;&#x3068;&#x3082; 15 &#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x8840;&#x6E05;&#x7CD6;&#x9396;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x6B20;&#x5E2D;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x305F;&#x500B;&#x4EBA;&#x3067;&#x306F;&#x901A;&#x5E38;&#x3002;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x6570;&#x306E;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x306E;&#x5206;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3068;&#x8D64;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x96E2; (IRMPD) &#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x3066;&#x5206;&#x6790;&#x3092;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x5229;&#x70B9;&#x306E; 1 &#x3064;&#x306F;&#x3001;&#x60A3;&#x8005;&#x306E;&#x8840;&#x6E05;&#x4E2D;&#x764C;&#x751F;&#x691C;&#x3092;&#x53D6;&#x5F97;&#x3057;&#x305F;&#x308A;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x8A66;&#x6599;&#x304B;&#x3089;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x6D44;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x306A;&#x304F;&#x304B;&#x3089;&#x76F4;&#x63A5;&#x7CD6;&#x9396;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x767A;&#x898B;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x8840;&#x6E05;&#x4E2D;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3002;

Glycomic &#xC811;&#xADFC; &#xC138;&#xACC4;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xCD9C;&#xC2DC; &#xB41C; oligosaccharides &#xAE09;&#xC18D; &#xD558; &#xAC8C; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xD558; &#xC5EC; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC62C;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB2F9; &#xB9C8;&#xCEE4;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xAC1C;&#xBC1C;. Glycoproteins &#xC554; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xCC3D; &#xACE0;&#xB294; &#xC0C1;&#xCF8C;&#xD55C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCC3E;&#xC744; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; (&#xB610;&#xB294; &#xBBF8;&#xB514;&#xC5B4; &#xB2E8;&#xB828;) &#xBC30;&#xC591;&#xB41C; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758;. &#xC774; &#xBC29;&#xBC95;&#xC5D0;&#xC11C;&#xB294; &#xCC3D; &#xACE0; glycoproteins&#xB294; &#xBCA0;&#xD0C0; &#xC81C;&#xAC70; &#xC870;&#xAC74;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC62C;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB2F9; &#xCF58;&#xD150;&#xCE20;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1;. &#xB9E4;&#xD2B8;&#xB9AD;&#xC2A4; &#xBCF4;&#xC870; &#xB808;&#xC774;&#xC800; &#xD0C8; &#xCC29;/&#xC774;&#xC628;&#xD654; &#xD478;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xBCC0;&#xD658; &#xC774;&#xC628; &#xC0AC;&#xC774;&#xD074; &#xB85C;&#xD2B8; &#xB860; &#xACF5;&#xBA85; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; (MALDI MS FTICR)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; glycosylation&#xC758; &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xBAA8;&#xB2C8;&#xD130;&#xB9C1;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCC3D; &#xACE0; glycoproteins &#xC138;&#xB7FC;&#xB3C4; &#xCC3E;&#xC744; &#xAC83; &#xC774;&#xB2E4;, &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xC62C;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB2F9; &#xB9C8;&#xCEE4;&#xB97C; &#xAD00;&#xCC30; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC218;&#xD589;&#xD55C; &#xBE44;&#xC2B7;&#xD55C; glycan &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1;. &#xD658;&#xC790;&#xC640; &#xC815;&#xC0C1; &#xD608; &#xCCAD; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC758; &#xC81C;&#xD55C; &#xB41C; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB97C; &#xC62C;&#xB9AC;&#xACE0; &#xB2F9; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554;&#xC5D0; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; glycan &#xD45C;&#xC2DD;&#xC744; &#xD655;&#xC778; &#xD558; &#xACF5;&#xBD80;&#xB97C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xD658;&#xC790;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC801;&#xC5B4;&#xB3C4; 15 &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xD608; &#xCCAD; glycan &#xB9C8;&#xCEE4;&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xB97C; &#xC124;&#xBA85; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC;, &#xACB0; &#xC11D; &#xC218; &#xC788;&#xC5C8;&#xB2E4; &#xC77C;&#xBC18; &#xAC1C;&#xC778;&#xC5D0;. Glycan &#xC0DD;&#xCCB4;&#xC758; &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xACB0;&#xC815; &#xD558;&#xB294; &#xC774;&#xC628; &#xC218; &#xACE0;&#xB9BD; &#xB410;&#xB2E4; &#xB354; &#xC801;&#xC678;&#xC120; multiphoton &#xBD84;&#xB9AC; (IRMPD)&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558; &#xACE0;. &#xC774; &#xBC29;&#xBC95;&#xC758; &#xC8FC;&#xC694; &#xC7A5;&#xC810; &#xC911; &#xD558;&#xB098;&#xB294; glycans &#xAD6C;&#xD558;&#xB294; &#xC554; &#xC0DD; &#xAC80; &#xD45C;&#xBCF8; &#xB610;&#xB294;&#xC774; &#xD45C;&#xBCF8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2F9;&#xD654; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xC21C;&#xD654; &#xD558;&#xB294; &#xD544;&#xC694; &#xC5C6;&#xC774; &#xD658;&#xC790; &#xC138;&#xB77C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC9C1;&#xC811; &#xAC80;&#xC0AC; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Glycans &#xB09C;&#xC18C; &#xC554;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xBC14;&#xC774;&#xC624; &#xB9C8;&#xCEE4;&#xC758; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xD608; &#xCCAD;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1;.

Un enfoque de glycomic est&aacute; desarrollado para identificar marcadores de oligosac&aacute;ridos para c&aacute;ncer de ovario r&aacute;pidamente perfilando oligosac&aacute;ridos lanzados a nivel mundial. Glicoprote&iacute;nas derramada por las c&eacute;lulas cancerosas se encuentran en el sobrenadante (o condicionada a los medios de comunicaci&oacute;n) de las c&eacute;lulas cultivadas. En este enfoque, vertiente glicoprote&iacute;nas se perfilan por su contenido de oligosac&aacute;ridos beta-eliminaci&oacute;n las condiciones de uso. Cambios en la glicosilaci&oacute;n son monitoreados por l&aacute;ser asistida por matriz desorci&oacute;n/ionizaci&oacute;n Fourier transform ion ciclotr&oacute;n resonancia espectrometr&iacute;a de masas (MALDI-FTICR-MS). Porque tambi&eacute;n se encontrar&iacute;an vertiente glicoprote&iacute;nas en suero, perfiles de glicanos similar fue realizada para observar posibles marcadores de oligosac&aacute;ridos. Oligosac&aacute;rido perfiladoras los datos en un conjunto limitado de las muestras de suero de pacientes y normales fueron estudiados para determinar posibles marcadores de glicanos en c&aacute;ncer de ovario. Hemos sido capaces de demostrar la presencia de al menos 15 marcadores de glicanos de suero &uacute;nico en todos los pacientes pero ausente en los individuos normales. Para determinar la estructura de los biomarcadores de glicanos, varios de los iones fueron aislados y adem&aacute;s analizaron infrarroja multifot&oacute;n disociaci&oacute;n (IRMPD). Una ventaja importante de este enfoque es que se examinan glycans directamente en el suero del paciente sin la necesidad de obtener c&aacute;ncer de espec&iacute;menes de la biopsia o para purificar prote&iacute;nas glicosiladas de estos ejemplares.

Perfiles de glicanos en suero para el descubrimiento de biomarcadores potenciales para el c&aacute;ncer ov&aacute;rico.

&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x6F84;&#x6E05;&#x4ECD;&#x7136;&#x662F;&#x4E00;&#x9879;&#x91CD;&#x5927;&#x6311;&#x6218;&#x3002;&#x8D28;&#x8C31;&#x63D0;&#x4F9B;&#x7ED3;&#x6784;&#x6F84;&#x6E05;&#x57FA;&#x4E8E;&#x4E32;&#x8054;&#x8D28;&#x8C31;&#x5FEB;&#x901F;&#x548C;&#x65B9;&#x4FBF;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x79BB;&#x5B50;&#x901A;&#x5E38;&#x662F;&#x9009;&#x62E9;&#x548C;&#x906D;&#x53D7;&#x78B0;&#x649E;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x89E3;&#x79BB; (CID) &#x83B7;&#x5F97;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x4FE1;&#x606F;&#x3002;&#x4E0D;&#x5E78;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;N &#x94FE;&#x63A5;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x662F;&#x76F8;&#x5BF9;&#x8F83;&#x5927;&#x7684;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#xFF0C;&#x4E0D;&#x5BB9;&#x6613;&#x5206;&#x6563;&#x4F7F;&#x7528; CID&#x3002;&#x5728;&#x672C;&#x62A5;&#x544A;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8BF4;&#x660E;&#x4E86;&#x4F7F;&#x7528;&#x7684;&#x7EA2;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x79BB; (IRMPD) &#x83B7;&#x5F97;&#x5927; N-&#x8FDE;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x4FE1;&#x606F;&#x3002;&#x4E3A;&#x9AD8;&#x7518;&#x9732;&#x7CD6;&#x578B;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684; IRMPD &#x548C; CID &#x7684;&#x884C;&#x4E3A;&#x4F5C;&#x4E86;&#x6BD4;&#x8F83;&#x3002;&#x65E0;&#x6CD5;&#x83B7;&#x5F97;&#x901A;&#x8FC7;&#x5E38;&#x89C4; CID &#x5728;&#x5085;&#x91CC;&#x53F6;&#x53D8;&#x6362;&#x79BB;&#x5B50;&#x56DE;&#x65CB;&#x5171;&#x632F;&#x8D28;&#x8C31;&#x4E2D;&#x7684;&#x788E;&#x7247;&#x6709;&#x4EBA;&#x4E0E; N-&#x8FDE;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x3002;O &#x94FE;&#x63A5;&#x548C;&#x94FE;&#x63A5; N &#x805A;&#x7CD6;&#x540C;&#x6837;&#x5927;&#x5C3A;&#x5BF8;&#x4F5C;&#x4E86;&#x6BD4;&#x8F83;&#x3002;&#x5B83;&#x88AB;&#x53D1;&#x73B0;&#x5185;&#x90E8;&#x4EA4;&#x53C9;&#x73AF;&#x88C2;&#x75D5;&#x8DCC;&#x5E45;&#x4EC5;&#x4E3A; N &#x94FE;&#x63A5;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x3002;&#x663E;&#x7136;&#x66F4;&#x5BB9;&#x6613;&#x8DE8;&#x73AF;&#x88C2;&#x75D5;&#x7684; N-&#x8FDE;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7518;&#x9732;&#x7CD6;&#x5206;&#x652F;&#x70B9;&#x3002;

N-&#x8FDE;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x5728; FT ICR &#x8D28;&#x8C31;&#x4E2D;&#x4F7F;&#x7528;&#x7EA2;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x79BB;&#x7684;&#x8BAF;&#x95EE;&#x3002;

The structural elucidation of oligosaccharides remains a major challenge. Mass spectrometry provides a rapid and convenient method for structural elucidation based on tandem mass spectrometry. Ions commonly are selected and subjected to collision-induced dissociation (CID) to obtain structural information. Unfortunately, N-linked oligosaccharides are relatively large compounds and are not readily fragmented using CID. In this report, we illustrate the use of infrared multiphoton dissociation (IRMPD) to obtain structural information for large N-linked oligosaccharides. The IRMPD and CID behavior of oligosaccharides were compared for high-mannose-type oligosaccharides. Fragmentation that could not be obtained through conventional CID in Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry was observed with N-linked oligosaccharides. O-Linked and N-linked glycans of similarly large sizes were compared. It was found that internal cross-ring cleavages were observed only for N-linked oligosaccharides. The mannose branch points of N-linked oligosaccharides are apparently more susceptible to cross-ring cleavages.

Interrogation of N-Linked oligosaccharides using infrared multiphoton dissociation in FT-ICR mass spectrometry.

L&#39;&eacute;lucidation de la structure d&#39;oligosaccharides demeure un d&eacute;fi majeur. Spectrom&eacute;trie de masse fournit une m&eacute;thode rapide et pratique pour l&#39;&eacute;lucidation de la structure bas&eacute;e sur la spectrom&eacute;trie de masse. Ions sont couramment s&eacute;lectionn&eacute;es et soumises &agrave; une dissociation induite par collision (CID) pour obtenir des informations structurales. Malheureusement, oligosaccharides N-li&eacute;s sont des compos&eacute;s relativement importants et sont fragment&eacute;s pas facilement &agrave; l&#39;aide du CID. Dans ce rapport, nous illustrons l&#39;usage de dissociation multiphotonique infrarouge (DMPIR) pour obtenir des informations structurales pour grands oligosaccharides N-li&eacute;s. Le comportement DMPIR et CID des oligosaccharides a compar&eacute; des oligosaccharides de type haut-mannose. Fragmentation qui ne peut pas &ecirc;tre obtenue par le biais de CID classique en Fourier transform ion cyclotron resonance spectrom&eacute;trie de masse a &eacute;t&eacute; observ&eacute;e avec des oligosaccharides N-li&eacute;s. O-li&eacute;s et N-li&eacute;s glycanes de grandes tailles de m&ecirc;me ont &eacute;t&eacute; compar&eacute;s. Il a &eacute;t&eacute; constat&eacute; que les clivages de croix-bague internes ont &eacute;t&eacute; observ&eacute;s uniquement pour les oligosaccharides N-li&eacute;s. Les points de branche de mannose des oligosaccharides N-li&eacute;s sont apparemment plus sensibles &agrave; la Croix-bague clivages.

Interrogatoire des oligosaccharides N-li&eacute;s &agrave; l&#39;aide de dissociation multiphotonique infrarouge en spectrom&eacute;trie de masse FT-ICR.

Die Strukturaufkl&#xE4;rung von Oligosacchariden vor eine gro&#xDF;e Herausforderung. Die Massenspektrometrie bietet eine schnelle und bequeme Methode zur Strukturaufkl&#xE4;rung auf Tandem-Massenspektrometrie basieren. Ionen &#xFC;blicherweise ausgew&#xE4;hlt und einer Kollision-induzierte Dissoziation (CID) an diese Informationen zu erhalten. Leider sind N-gebundene Oligosaccharide relativ gro&#xDF;en Verbindungen und werden nicht leicht fragmentiert mit CID. In diesem Bericht zeigen wir die Verwendung von Infrarot-Multiphotonen (IRMPD), um strukturelle Information f&#xFC;r gro&#xDF;e N-gebundene Oligosaccharide erhalten. Die IRMPD und CID-Verhalten der Oligosaccharide wurden f&#xFC;r High-Mannose-Typ Oligosaccharide verglichen. Fragmentierung, die nicht durch konventionelle CID k&#xF6;nnte Fourier Transformations-Ionen-Zyklotron-Resonanz-Massenspektrometrie erhalten werden mit N-gebundene Oligosaccharide beobachtet. O-Linked-und N-gebundenen Glykane von &#xE4;hnlich gro&#xDF;en Gr&#xF6;&#xDF;en verglichen. Es wurde festgestellt, dass Innenquerschnitt Ringspaltungen nur f&#xFC;r N-gebundene Oligosaccharide wurden beobachtet. Die Mannose Verzweigungspunkte von N-gebundene Oligosaccharide sind offenbar anf&#xE4;lliger f&#xFC;r Cross-Ringspaltungen.

Abfrage der N-gebundenen Oligosacchariden mittels Infrarot-Mehrphotonen-Dissoziation in FT-ICR-Massenspektrometrie.

La delucidazione strutturale degli oligosaccaridi rimane una sfida importante. Spettrometria di massa fornisce un metodo rapido e conveniente per la delucidazione strutturale basati sulla spettrometria di massa tandem. Gli ioni sono comunemente selezionati e sottoposti a dissociazione indotta da collisione (CID) per ottenere informazioni strutturali. Purtroppo, oligosaccaridi N-linked sono composti relativamente grandi e non sono prontamente frammentati con CID. In questa relazione, illustriamo l&#39;utilizzo della dissociazione infrarossa multifotonica (IRMPD) per ottenere informazioni strutturali per grandi oligosaccaridi N-linked. Il comportamento di oligosaccaridi IRMPD e CID sono stati confrontati per tipo high-mannosio oligosaccaridi. Frammentazione che non poteva essere ottenuta attraverso CID convenzionali in trasformata di Fourier transform ione risonanza ciclotronica &egrave; stata osservata con oligosaccaridi N-linked. Glicani O-Linked e N-collegati di grandi dimensioni allo stesso modo sono stati confrontati. Si &egrave; constatato che fenditure cross-anello interni sono stati osservati solo per gli oligosaccaridi N-linked. I punti di ramo mannosio di oligosaccaridi N-linked sono apparentemente pi&ugrave; suscettibili a croce-anello fenditure.

Interrogatorio di oligosaccaridi N-collegato tramite dissociazione infrarossa multifotonica in spettrometria di massa FT-ICR.

&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x89E3;&#x660E;&#x4E3B;&#x8981;&#x8AB2;&#x984C;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x69CB;&#x9020;&#x89E3;&#x660E;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x8FC5;&#x901F;&#x3067;&#x7C21;&#x4FBF;&#x306A;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x3088;&#x304F;&#x9078;&#x629E;&#x3057;&#x3001;&#x885D;&#x7A81;&#x8A98;&#x8D77;&#x89E3;&#x96E2; (CID) &#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x60C5;&#x5831;&#x3092;&#x53D6;&#x5F97;&#x3059;&#x308B;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6B8B;&#x5FF5;&#x306A;&#x304C;&#x3089;&#x3001;N &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x7CD6;&#x9396;&#x306F;&#x6BD4;&#x8F03;&#x7684;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3057;&#x3001;&#x5BB9;&#x6613;&#x306B; CID &#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x65AD;&#x7247;&#x5316;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x3044;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x5831;&#x544A;&#x3067;&#x306F;, &#x8D64;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x96E2; (&#x5927; N &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x60C5;&#x5831;&#x3092;&#x53D6;&#x5F97;&#x3059;&#x308B; IRMPD) &#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E; IRMPD &#x3068; CID &#x306E;&#x6319;&#x52D5;&#x9AD8;&#x30DE;&#x30F3;&#x30CE;&#x30FC;&#x30B9;&#x578B;&#x7CD6;&#x9396;&#x3092;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30D5;&#x30FC;&#x30EA;&#x30A8;&#x5909;&#x63DB;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3; &#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x5171;&#x9CF4;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5F93;&#x6765;&#x306E; CID &#x3092;&#x53D6;&#x5F97;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3067;&#x3057;&#x305F;&#x65AD;&#x7247;&#x5316; N &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x7CD6;&#x9396;&#x3067;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x30B5;&#x30A4;&#x30BA;&#x306E; O &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x3001;N &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x7CD6;&#x9396;&#x3092;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5185;&#x90E8;&#x30AF;&#x30ED;&#x30B9; &#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x5288;&#x958B;&#x306E;&#x307F; N &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x7528;&#x306E;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x304C;&#x307F;&#x3089;&#x308C;&#x304C;&#x898B;&#x3064;&#x304B;&#x308A;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3067;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30DE;&#x30F3;&#x30CE;&#x30FC;&#x30B9; &#x30D6;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C1; &#x30DD;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8; N &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x7CD6;&#x306F;&#x3069;&#x3046;&#x3084;&#x3089;&#x30AF;&#x30ED;&#x30B9; - &#x5288;&#x958B;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;&#x5BFE;&#x3057;&#x3066;&#x654F;&#x611F;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#x8D64;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x96E2;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B; FT-ICR &#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F; N &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x7CD6;&#x306E;&#x5C0B;&#x554F;&#x3002;

Oligosaccharides&#xC758; &#xAD6C;&#xC870; &#xD574;&#xBA85; &#xC8FC;&#xC694; &#xB3C4;&#xC804; &#xB0A8;&#xC544; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; &#xD0E0;&#xB364; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; &#xAE30;&#xBC18; &#xAD6C;&#xC870; &#xD574;&#xBA85;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2E0;&#xC18D; &#xD558; &#xACE0; &#xD3B8;&#xB9AC;&#xD55C; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xC628; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC120;&#xD0DD; &#xD558; &#xACE0; &#xCDA9;&#xB3CC;&#xC744; &#xC774;&#xC6A9;&#xD55C; &#xBD84;&#xB9AC; &#xAD6C;&#xC870; &#xC815;&#xBCF4; (CID)&#xB97C; &#xBC1B;&#xAC8C; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBD88;&#xD589; &#xD558; &#xAC8C;&#xB3C4;, N &#xC5F0;&#xACB0; oligosaccharides &#xBE44;&#xAD50;&#xC801; &#xD070; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C;&#xACFC; &#xC27D;&#xAC8C; &#xC870;&#xAC01;&#xD654; &#xB418;&#xC9C0; CID&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;. &#xC774; &#xBCF4;&#xACE0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC801;&#xC678;&#xC120; multiphoton &#xBD84;&#xB9AC; (IRMPD) &#xD070; N &#xC5F0;&#xACB0; oligosaccharides&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD6C;&#xC870; &#xC815;&#xBCF4;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. Oligosaccharides&#xC758; IRMPD &#xBC0F; CID &#xB3D9;&#xC791; &#xB192;&#xC740; &#xC2A4; &#xD0C0;&#xC785; oligosaccharides&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBE44;&#xAD50; &#xD588;&#xB2E4;. &#xD478;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xBCC0;&#xD658; &#xC774;&#xC628; &#xC0AC;&#xC774;&#xD074; &#xB85C;&#xD2B8; &#xB860; &#xACF5;&#xBA85; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xAE30;&#xC874;&#xC758; CID&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xC5BB;&#xC744; &#xC218; &#xC5C6;&#xB294; &#xC870;&#xAC01;&#xD654; oligosaccharides N &#xC5F0;&#xACB0;&#xB85C; &#xAD00;&#xCC30; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC720;&#xC0AC; &#xD558; &#xAC8C; &#xD070; &#xD06C;&#xAE30;&#xC758; O&#xB97C; &#xC5F0;&#xACB0; &#xD558; &#xACE0; N &#xC5F0;&#xACB0; glycans &#xBE44;&#xAD50; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB0B4;&#xBD80; &#xD06C;&#xB85C;&#xC2A4; &#xBC18;&#xC9C0; cleavages oligosaccharides N &#xC5F0;&#xACB0;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574;&#xC11C;&#xB9CC; &#xAD00;&#xCC30; &#xD588;&#xB2E4; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC774; &#xBC1D;&#xD600;&#xC84C;&#xB2E4;. N &#xC5F0;&#xACB0; oligosaccharides &#xC2A4; &#xBD84;&#xAE30; &#xD3EC;&#xC778;&#xD2B8; &#xD06C;&#xB85C;&#xC2A4; &#xBC18;&#xC9C0; cleavages &#xBD84;&#xBA85;&#xD788; &#xB354; &#xAC10;&#xC5FC; &#xB418;&#xAE30; &#xC27D;&#xB2E4;.

N &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; oligosaccharides &#xD53C;&#xD2B8; ICR &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; &#xC801;&#xC678;&#xC120; multiphoton &#xBD84;&#xB9AC;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;&#xC758; &#xC2EC;&#xBB38;.

La elucidaci&oacute;n estructural de oligosac&aacute;ridos sigue siendo un desaf&iacute;o importante. Espectrometr&iacute;a de masas proporciona un m&eacute;todo r&aacute;pido y conveniente para la elucidaci&oacute;n estructural basado en espectrometr&iacute;a de masas en t&aacute;ndem. Iones com&uacute;nmente son seleccionados y sometidos a la disociaci&oacute;n inducida por colisi&oacute;n (CID) para obtener informaci&oacute;n estructural. Por desgracia, N-ligado oligosac&aacute;ridos son compuestos relativamente grandes y no se fragmentan f&aacute;cilmente usando el CID. En este informe, ilustramos el uso de infrarrojo multifot&oacute;n disociaci&oacute;n (IRMPD) para obtener informaci&oacute;n estructural para grandes oligosac&aacute;ridos N-ligado. Se compararon el comportamiento IRMPD y CID de oligosac&aacute;ridos para alto-manosa-tipo oligosac&aacute;ridos. Fragmentaci&oacute;n que no podr&iacute;a obtenerse a trav&eacute;s de CID convencional en espectrometr&iacute;a de masas y resonancia en ciclotr&oacute;n Fourier transform ion observ&oacute; con oligosac&aacute;ridos N-ligado. Se compararon glycans N-vinculados y O de semejantemente grandes tama&ntilde;os. Se encontr&oacute; que divisiones de cruz anillo internas se observaron s&oacute;lo por oligosac&aacute;ridos N-ligado. Los puntos de ramificaci&oacute;n de la manosa de oligosac&aacute;ridos N-ligados son al parecer m&aacute;s susceptibles a cruz-anillo divisiones.

Interrogatorio de oligosac&aacute;ridos N-ligado con infrarroja multifot&oacute;n disociaci&oacute;n en espectrometr&iacute;a de masas FT-ICR.

&#x56E0;&#x4E3A;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x5728;&#x80BF;&#x7624;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5728;&#x4E73;&#x817A;&#x764C;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x66F4;&#x6539;&#xFF0C;&#x7CD6;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x65B9;&#x6CD5;&#x7528;&#x4E8E;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x53D1;&#x73B0;&#x7684;&#x4E73;&#x817A;&#x764C;&#x76F8;&#x5173;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x8BB0;&#x7269;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x6539;&#x53D8;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x5173;&#x8054;&#x4E0E;&#x589E;&#x52A0;&#x80BF;&#x7624;&#x8D1F;&#x62C5;&#x548C;&#x9884;&#x540E;&#x4E0D;&#x826F;&#x3002;&#x5F53;&#x524D;&#x57FA;&#x4E8E;&#x6297;&#x4F53;&#x7684;&#x514D;&#x75AB;&#x5B66;&#x5316;&#x9A8C;&#x4E3A;&#x764C;&#x75C7;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x8BB0;&#x7269;&#x764C;&#x6297;&#x539F;&#x5375;&#x5DE2; (125)&#x3001; &#x4E73;&#x817A;&#x764C; (CA27.29 &#x6216;&#x764C;&#x6297;&#x539F; 15-3&#xFF09;&#x3001; &#x80F0;&#x817A;&#x3001; &#x80C3;&#x3001; &#x7ED3;&#x80A0;&#x3001; &#x548C;&#x764C; (&#x8840;&#x6E05;&#x7CD6;&#x7C7B;&#x6297;&#x539F; 19-9&#xFF09; &#x76EE;&#x6807;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x9ECF;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x7F3A;&#x4E4F;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x548C;&#x7075;&#x654F;&#x5EA6;&#x5728;&#x65E9;&#x671F;&#x68C0;&#x6D4B;&#x4E2D;&#x4F7F;&#x7528;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x7CD6;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x65B9;&#x6CD5;&#x53D1;&#x73B0;&#x7684;&#x4E73;&#x817A;&#x764C;&#x7CD6;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x6D89;&#x53CA;&#x5316;&#x5B66;&#x88C2;&#x89E3;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6; (&#x7CD6;) &#x4ECE;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x86CB;&#x767D;&#x68DA;&#x6216;&#x5206;&#x6CCC;&#x7684;&#x4E73;&#x817A;&#x764C;&#x80BF;&#x7624;&#x7EC6;&#x80DE;&#x682A;&#x3002;&#x7531;&#x6B64;&#x4EA7;&#x751F;&#x7684;&#x6E38;&#x79BB;&#x7CD6;&#x7269;&#x79CD;&#x9A6C;&#x5C14;&#x8FEA;-&#x91D1;&#x878D;&#x65F6;&#x62A5; &#x300B;-ICR &#x8D28;&#x8C31;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x53EF;&#x4EE5;&#x901A;&#x8FC7;&#x4E32;&#x8054;&#x8D28;&#x8C31;&#x4E0E;&#x7EA2;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x79BB;&#x98DE;&#x8F6E;&#x5728;&#x6267;&#x884C;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x7CD6;&#x914D;&#x7F6E;&#x6587;&#x4EF6;&#x662F;&#x4E3A;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x884C;&#x751F;&#x6210;&#x548C;&#x6BD4;&#x8F83;&#x3002;&#x7136;&#x540E;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x88AB;&#x7528;&#x4E8E;&#x5206;&#x6790;&#x6240;&#x5F97;&#x7684;&#x4E73;&#x817A;&#x764C;&#x548C;&#x5C11;&#x91CF;&#x7684;&#x83B7;&#x5F97;&#x4ECE;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x60A3;&#x8005;&#x8BCA;&#x65AD;&#x51FA;&#x60A3;&#x6709;&#x4E73;&#x817A;&#x764C;&#x6216;&#x6CA1;&#x6709;&#x5DF2;&#x77E5;&#x5386;&#x53F2;&#x7684;&#x4E73;&#x817A;&#x764C;&#x60A3;&#x8005;&#x7684;&#x8840;&#x6E05;&#x6837;&#x672C;&#x7684;&#x5C0F;&#x9F20;&#x6A21;&#x578B;&#x7684;&#x8840;&#x6E05;&#x3002;&#x9664;&#x4E86;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x53D1;&#x8FBE;&#x56FD;&#x5BB6;&#x7684;&#x5C0F;&#x9F20;&#x4E73;&#x817A;&#x80BF;&#x7624;&#x5728;&#x5C0F;&#x9F20;&#x4E2D;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5230;&#x7684;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x66F4;&#x6539;&#xFF0C;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x914D;&#x7F6E;&#x6587;&#x4EF6;&#x88AB;&#x53D1;&#x73B0;&#x5B58;&#x5728;&#x5145;&#x5206;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x6765;&#x533A;&#x5206;&#x90A3;&#x4E9B;&#x6CA1;&#x6709;&#x764C;&#x75C7;&#x60A3;&#x8005;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x8FC4;&#x4ECA;&#x4E3A;&#x6B62;&#x5DF2;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x60A3;&#x8005;&#x6837;&#x672C;&#x6570;&#x76EE;&#x5F88;&#x5C11;&#x662F;&#x4E0D;&#x8DB3;&#x4EE5;&#x5728;&#x6B64;&#x65F6;&#x505A;&#x51FA;&#x4EFB;&#x4F55;&#x5408;&#x6CD5;&#x7684;&#x7D22;&#x8D54;&#xFF0C;&#x4F46;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x627F;&#x8BFA;&#x4F46;&#x975E;&#x5E38;&#x521D;&#x6B65;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x7CD6;&#x914D;&#x7F6E;&#x6587;&#x4EF6;&#x53EF;&#x80FD;&#x5305;&#x542B;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x7CD6;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x53EF;&#x80FD;&#x5BF9;&#x5E94;&#x4E8E;&#x7CD6;&quot;&#x7684;&#x764C;&#x75C7;&#x7684;&#x7B7E;&#x540D;&quot;&#x3002;

&#x4E73;&#x817A;&#x764C;&#x80BF;&#x7624;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x8840;&#x6E05;&#x7CD6;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;

Because the glycosylation of proteins is known to change in tumor cells during the development of breast cancer, a glycomics approach is used here to find relevant biomarkers of breast cancer. These glycosylation changes are known to correlate with increasing tumor burden and poor prognosis. Current antibody-based immunochemical tests for cancer biomarkers of ovarian (CA125), breast (CA27.29 or CA15-3), pancreatic, gastric, colonic, and carcinoma (CA19-9) target highly glycosylated mucin proteins. However, these tests lack the specificity and sensitivity for use in early detection. This glycomics approach to find glycan biomarkers of breast cancer involves chemically cleaving oligosaccharides (glycans) from glycosylated proteins that are shed or secreted by breast cancer tumor cell lines. The resulting free glycan species are analyzed by MALDI-FT-ICR MS. Further structural analysis of the glycans can be performed in FTMS through the use of tandem mass spectrometry with infrared multiphoton dissociation. Glycan profiles were generated for each cell line and compared. These methods were then used to analyze sera obtained from a mouse model of breast cancer and a small number of serum samples obtained from human patients diagnosed with breast cancer or patients with no known history of breast cancer. In addition to the glycosylation changes detected in mice as mouse mammary tumors developed, glycosylation profiles were found to be sufficiently different to distinguish patients with cancer from those without. Although the small number of patient samples analyzed so far is inadequate to make any legitimate claims at this time, these promising but very preliminary results suggest that glycan profiles may contain distinct glycan biomarkers that may correspond to glycan "signatures of cancer."

A serum glycomics approach to breast cancer biomarkers.

Parce que la glycosylation des prot&eacute;ines est connue pour changer dans les cellules tumorales au cours du d&eacute;veloppement du cancer du sein, une approche glycomique est utilis&eacute;e ici pour trouver les biomarqueurs du cancer du sein. Ces changements de glycosylation sont connus pour mettre en corr&eacute;lation avec l&#39;augmentation de charge de la tumeur et de mauvais pronostic. Les tests immunochimiques antibody-based actuels pour les biomarqueurs du cancer de l&#39;ovaire (CA125), du sein (CA27.29 ou ca 15-3), du pancr&eacute;as, cancer gastrique, colique, et carcinome (CA19-9) cible hautement glycosyl&eacute;e prot&eacute;ines de mucine. Toutefois, ces tests n&#39;ont pas la sp&eacute;cificit&eacute; et la sensibilit&eacute; pour la d&eacute;tection pr&eacute;coce. Cette approche glycomique trouver glycane biomarqueurs du cancer du sein implique clivant chimiquement les oligosaccharides (glycanes) de prot&eacute;ines glycosyl&eacute;es hangar ou s&eacute;cr&eacute;t&eacute;es par les lign&eacute;es de cellules tumorales mammaires canc&eacute;reuses. Les esp&egrave;ces de glycane libre qui en r&eacute;sulte sont analys&eacute;s par MALDI-FT-ICR MS. Outre l&#39;analyse structurale des glycanes peut &ecirc;tre effectu&eacute;e en FTMS gr&acirc;ce &agrave; l&#39;utilisation de la spectrom&eacute;trie de masse en tandem avec dissociation multiphotonique infrarouge. Glycan profils ont &eacute;t&eacute; g&eacute;n&eacute;r&eacute;es pour chaque lign&eacute;e cellulaire et compar&eacute;es. Ces m&eacute;thodes ont &eacute;t&eacute; utilis&eacute;es ensuite pour analyser les s&eacute;rums obtenus &agrave; partir d&#39;un mod&egrave;le murin de cancer du sein et un petit nombre d&#39;&eacute;chantillons de s&eacute;rum provenant de patients humains diagnostiqu&eacute;s avec le cancer ou les patients sans ant&eacute;c&eacute;dents connus du cancer du sein. Outre les modifications de glycosylation d&eacute;tect&eacute;es chez les souris comme les tumeurs mammaires de souris d&eacute;velopp&eacute;es, glycosylation profils ont &eacute;t&eacute; jug&eacute;es suffisamment diff&eacute;rentes pour distinguer les patients atteints de cancer de ceux sans. Bien que le petit nombre d&#39;&eacute;chantillons de patients analys&eacute;s jusqu&#39;&agrave; maintenant est insuffisant pour faire aucune r&eacute;clamation l&eacute;gitime en ce moment, elles prometteur mais r&eacute;sultats tr&egrave;s pr&eacute;liminaires donnent &agrave; penser que glycane profils peuvent contenir des biomarqueurs de glycane distincts pouvant correspondre &agrave; glycan &laquo; signatures du cancer &raquo;.

Une approche glycomique s&eacute;rum biomarqueurs du cancer du sein.

Da die Glykosylierung von Proteinen in Tumorzellen zu &auml;ndern, w&auml;hrend die Entwicklung von Brustkrebs bekannt ist, dient ein Glykomik Ansatz hier relevante Biomarkern von Brustkrebs zu finden. Diese Glykosylierung &Auml;nderungen sind bekannterma&szlig;en korrelieren mit zunehmender Tumor Burden und schlechte Prognose. Aktuelle Antik&ouml;rper-basierte immunochemischen Tests f&uuml;r Krebs Biomarker der Eierstock (CA125), Brustkrebs (CA27.29 oder CA15-3), Pankreas, Magen, Kolon, und Karzinom (CA19-9) als Ziel stark glykosyliert Mucin Proteine. Diese Tests fehlt jedoch die Spezifit&auml;t und Sensitivit&auml;t f&uuml;r Fr&uuml;herkennung. Diese Glykomik-Ansatz Glykan-Biomarker von Brustkrebs finden beinhaltet von glykosylierter Proteine, die Schuppen oder abgesondert von Brust-Krebs-Tumor-Zelllinien chemisch Splei&szlig;en Oligosaccharide (Glykane). Die resultierende freie Glykan-Arten werden von FT-ICR-MALDI-MS analysiert. Strukturanalyse von der Glykane kann weiter durch den Einsatz von Tandem-Massenspektrometrie mit Infrarot multiphoton Dissoziation in FTMS durchgef&uuml;hrt werden. Glykan-Profile wurden f&uuml;r jede Zelllinie generiert und verglichen. Diese Methoden wurden dann zur Seren aus einem Mausmodell von Brustkrebs und eine kleine Anzahl von Serumproben aus menschlichen Patienten mit Brustkrebs oder Patienten ohne bekannte Geschichte von Brustkrebs diagnostiziert gewonnen gewonnen zu analysieren. Neben den Glycosylation-&Auml;nderungen in den M&auml;usen als Maus Milch-Tumoren entwickelt erkannt fanden sich Glycosylation Profilen unterschiedlich genug, um Patienten mit Krebs von denen ohne zu unterscheiden sein. Obwohl die geringe Zahl der Patientenproben analysiert bisher nicht ausreichen, um alle berechtigten Anspr&uuml;che zu diesem Zeitpunkt zu machen ist, empfehlen diese Versprechen aber sehr vorl&auml;ufige Ergebnisse Glykan-Profilen unterschiedliche Glykan-Biomarker enthalten, die entspricht Glykan &quot;Signaturen des Krebses.&quot;

Ein Serum-Glykomik-Ansatz zur Brust-Krebs-Biomarkern.

Perch&eacute; la glicosilazione delle proteine &egrave; conosciuta per cambiare nelle cellule tumorali durante lo sviluppo del cancro al seno, un approccio glycomics &egrave; qui utilizzato per trovare rilevanti biomarcatori del cancro al seno. Questi cambiamenti di glicosilazione sono noti per correlare con l&#39;aumento dell&#39;onere del tumore e la prognosi. Corrente basata su anticorpi test immunochimici per biomarcatori del cancro dell&#39;ovaio (CA125), della mammella (CA27.29 o CA15-3), del pancreas, gastrico, del colon, e carcinoma (CA19-9) target altamente glicosilata proteine mucina. Tuttavia, questi test mancano la specificit&agrave; e la sensibilit&agrave; per l&#39;utilizzo nella diagnosi precoce. Questo approccio glycomics trovare glycan biomarcatori del cancro al seno comporta chimicamente fendendo oligosaccaridi (glicani) dalle proteine glicosilate capannone o secreta dalle linee di cellule tumorali al seno cancro. La specie risultante glycan libero vengono analizzati mediante MS MALDI-FT-ICR. Ulteriori analisi strutturale dei glicani possono essere eseguita in FTMS attraverso l&#39;utilizzo di spettrometria di massa tandem con dissociazione infrarossa multifotonica. Glycan profili sono stati generati per ogni linea cellulare e rispetto. Questi metodi sono stati utilizzati poi per analizzare sieri ottenuti da un modello murino di cancro al seno e un piccolo numero di campioni di siero ottenuti da pazienti umani diagnosticati con cancro al seno o in pazienti con nessuna storia nota di cancro al seno. Oltre alle modifiche di glicosilazione rilevate nei topi come tumori mammari del mouse sviluppati, glicosilazione profili sono stati trovati per essere sufficientemente diverso per distinguere i pazienti con il cancro da quelli senza. Nonostante l&#39;esiguo numero di campioni analizzati finora &egrave; inadeguato a rendere qualsiasi rivendicazione legittime in questo momento, queste promettenti ma risultati molto preliminari suggeriscono che glycan profili possono contenere biomarcatori glycan distinti che possono corrispondere a glycan &quot;firme di cancro.&quot;

Un approccio glycomics siero biomarcatori del cancro al seno.

&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x7CD6;&#x9396;&#x306F;&#x4E73;&#x304C;&#x3093;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x4E2D;&#x306B;&#x816B;&#x760D;&#x7D30;&#x80DE;&#x3092;&#x5909;&#x66F4;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x3001;&#x95A2;&#x9023;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x4E73;&#x623F;&#x306E;&#x304C;&#x3093;&#x3092;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3053;&#x3053;&#x30B0;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B3;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x306E;&#x624B;&#x6CD5;&#x304C;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7CD6;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x306E;&#x8CA0;&#x62C5;&#x3068;&#x4E88;&#x5F8C;&#x4E0D;&#x826F;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x3068;&#x3068;&#x3082;&#x306B;&#x76F8;&#x95A2;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x6297;&#x4F53;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x514D;&#x75AB;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x691C;&#x67FB;&#x304C;&#x3093;&#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x5375;&#x5DE3; &#xFF08;CA125&#xFF09; &#x4E73;&#x304C;&#x3093; (CA27.29 &#x307E;&#x305F;&#x306F; CA15-3), &#x81B5;&#x81D3;, &#x80C3;, &#x7D50;&#x8178;, &#x3068;&#x764C; (CA19-9) &#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x9AD8;&#x7CD6;&#x30E0;&#x30C1;&#x30F3; &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x7279;&#x7570;&#x6027;&#x3068;&#x611F;&#x5EA6;&#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x3067;&#x306E;&#x65E9;&#x671F;&#x691C;&#x51FA;&#x3092;&#x6B20;&#x3044;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4E73;&#x764C;&#x306E;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3092;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x308B;&#x306B;&#x3053;&#x306E;&#x30B0;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B3;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x306E;&#x624B;&#x6CD5;&#x306B;&#x306F;&#x6D41;&#x3057;&#x305F;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x4E73;&#x623F;&#x304C;&#x3093;, &#x816B;&#x760D;&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5206;&#x6CCC;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x304B;&#x3089;&#x306F;&#x3001;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6; &#xFF08;&#x7CD6;&#xFF09; &#x3092;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x306B;&#x5207;&#x65AD;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7D50;&#x679C;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x7121;&#x6599;&#x7CD6;&#x7A2E; MALDI FT-ICR MS &#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5206;&#x6790;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x89E3;&#x6790;&#x3067; FTMS &#x8D64;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x96E2;&#x3068;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x5B9F;&#x884C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5404;&#x30BB;&#x30EB;&#x306E;&#x884C;&#x306E;&#x751F;&#x6210;&#x3057;&#x3001;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x306F;&#x3001;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9; &#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x4E73;&#x623F;&#x306E;&#x304C;&#x3093;&#x3068;&#x4E73;&#x304C;&#x3093;&#x3084;&#x306A;&#x3044;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x6B74;&#x53F2;&#x306E;&#x4E73;&#x304C;&#x3093;&#x60A3;&#x8005;&#x3068;&#x8A3A;&#x65AD;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x60A3;&#x8005;&#x304B;&#x3089;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x8840;&#x6E05;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x306E;&#x6570;&#x304C;&#x5C11;&#x306A;&#x3044;&#x304B;&#x3089;&#x8840;&#x6E05;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F;&#x5206;&#x6790;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x4E73;&#x817A;&#x816B;&#x760D;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x958B;&#x767A;&#x3057;&#x305F;&#x691C;&#x51FA;&#x7CD6;&#x9396;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x306B;&#x52A0;&#x3048;&#x3066;&#x3001;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x306A;&#x3057;&#x3067;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x764C;&#x60A3;&#x8005;&#x3092;&#x533A;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5341;&#x5206;&#x306B;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x898B;&#x3064;&#x304B;&#x308A;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5C11;&#x6570;&#x306E;&#x60A3;&#x8005;&#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x305F;&#x3068;&#x3053;&#x308D;&#x304C;&#x3053;&#x306E;&#x6642;&#x70B9;&#x3067;&#x4EFB;&#x610F;&#x306E;&#x6B63;&#x5F53;&#x306A;&#x4E3B;&#x5F35;&#x3092;&#x4F5C;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x5341;&#x5206;&#x3067;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x6709;&#x671B;&#x306A;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x4E88;&#x5099;&#x7684;&#x306A;&#x7D50;&#x679C;&#x304C;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x306B;&#x7CD6;&#x300C;&#x304C;&#x3093;&#x306E;&#x7F72;&#x540D;&#x300D;&#x306B;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x4E73;&#x623F;&#x304C;&#x3093;&#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3078;&#x306E;&#x8840;&#x6E05;&#x30B0;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B3;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9; &#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3002;

&#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; glycosylation &#xC885;&#xC591; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xBC29;&#xC554;&#xC758; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xBCC0;&#xACBD; &#xD558;&#xB824;&#xBA74; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xAE30; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xB2F9;&#xC1C4;&#xCCB4;&#xD559; &#xBC29;&#xBC95;&#xC740; &#xC720; &#xBC29; &#xC554; &#xAD00;&#xB828; &#xBC14;&#xC774;&#xC624; &#xB9C8;&#xCEE4;&#xC758; &#xCC3E;&#xC744; &#xC5EC;&#xAE30; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; glycosylation &#xBCC0;&#xACBD; &#xBE48;&#xC57D;&#xD55C; &#xC608; &#xC9C0;&#xC640; &#xC885;&#xC591; &#xBD80;&#xB2F4; &#xC99D;&#xAC00;&#xC640; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4;&#xB97C; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB09C;&#xC18C; (CA125)&#xC758; &#xC554; &#xC0DD;&#xCCB4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD604;&#xC7AC; &#xD56D; &#xCCB4; &#xAE30;&#xBC18; immunochemical &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; (CA27.29 &#xB610;&#xB294; CA15-3) &#xC720; &#xBC29;, &#xCDCC; &#xC7A5;, &#xC704; &#xC554;, &#xC800; &#xC2B9;, &#xC554; &#xC885; (CA19-9) &#xB300;&#xC0C1; &#xB192;&#xC740; &#xB2F9;&#xD654; mucin &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xD2B9;&#xC774;&#xC131; &#xBC0F; &#xC870;&#xAE30; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xAC10;&#xB3C4; &#xBD80;&#xC871;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC720; &#xBC29; &#xC554; &#xBC14;&#xC774;&#xC624; &#xB9C8;&#xCEE4;&#xC758; glycan &#xCC3E;&#xC744; &#xB2F9;&#xC1C4;&#xCCB4;&#xD559; &#xC774;&#xB807;&#xAC8C; &#xCC3D; &#xACE0; &#xB418;&#xAC70;&#xB098; &#xC720; &#xBC29; &#xC554; &#xC885;&#xC591; &#xC138;&#xD3EC; &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBD84; &#xBE44; &#xB418;&#xB294; &#xB2F9;&#xD654; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD654;&#xD559;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xACE0;&#xCC29; oligosaccharides (glycans) &#xD3EC;&#xD568;. &#xACB0;&#xACFC; &#xBB34;&#xB8CC; glycan &#xC885; MALDI-&#xD53C;&#xD2B8;-ICR MS&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBD84;&#xC11D; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCD94;&#xAC00; &#xB41C; glycans&#xC758; &#xAD6C;&#xC870; &#xBD84;&#xC11D; &#xC801;&#xC678;&#xC120; multiphoton &#xBD84;&#xB9AC;&#xC640; &#xD0E0;&#xB364; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; FTMS&#xC5D0;&#xC11C; &#xC218;&#xD589;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. Glycan &#xD504;&#xB85C;&#xD544; &#xAC01; &#xC140; &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0DD;&#xC131; &#xD558; &#xACE0; &#xBE44;&#xAD50; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBC29;&#xBC95;&#xC740; &#xB2E4;&#xC74C; &#xC138;&#xB77C; &#xC720;&#xBC29;&#xC554; &#xBC0F; &#xC720; &#xBC29; &#xC554; &#xB610;&#xB294; &#xC720;&#xBC29;&#xC554;&#xC758; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4; &#xC5ED;&#xC0AC; &#xC5C6;&#xC774; &#xD658;&#xC790;&#xB85C; &#xC9C4;&#xB2E8; &#xD558;&#xB294; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xD658;&#xC790;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5BB;&#xC740; &#xD608; &#xCCAD; &#xC0D8;&#xD50C; &#xC218;&#xAC00; &#xC801;&#xC740; &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; &#xBAA8;&#xB378;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5BB;&#xC740; &#xBD84;&#xC11D; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; &#xC720; &#xBC29; &#xC885;&#xC591; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xB85C; &#xAC10;&#xC9C0; glycosylation &#xBCC0;&#xD654; &#xC774;&#xC678;&#xC5D0; glycosylation &#xD504;&#xB85C;&#xD544; &#xCDA9;&#xBD84;&#xD788; &#xD558;&#xB294; &#xAC83; &#xC5C6;&#xC774; &#xC554; &#xD658;&#xC790;&#xB97C; &#xAD6C;&#xBCC4; &#xB2E4;&#xB978; &#xAC83;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC9C0;&#xAE08;&#xAE4C;&#xC9C0; &#xBD84;&#xC11D; &#xD658;&#xC790; &#xC0D8;&#xD50C; &#xC218;&#xAC00; &#xC801;&#xC740;&#xC774; &#xC774;&#xBC88;&#xC5D0; &#xD569;&#xBC95;&#xC801;&#xC778; &#xC8FC;&#xC7A5;&#xC744; &#xC801;&#xC808; &#xD55C; &#xC788;&#xC9C0;&#xB9CC;, &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xC608;&#xBE44; &#xACB0;&#xACFC; &#xC57D;&#xC18D;&#xC774; glycan &#xD504;&#xB85C;&#xD544; &#xBCC4;&#xAC1C; glycan &#xBC14;&#xC774;&#xC624; &#xB9C8;&#xCEE4;&#xC758; glycan &quot;&#xC554; &#xC11C;&#xBA85;.&quot;&#xC5D0; &#xD574;&#xB2F9; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xD3EC;&#xD568; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC720; &#xBC29; &#xC554; &#xC0DD;&#xCCB4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD608; &#xCCAD; &#xB2F9;&#xC1C4;&#xCCB4;&#xD559; &#xC811;&#xADFC;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Porque la glicosilaci&oacute;n de prote&iacute;nas se sabe que el cambio en las c&eacute;lulas del tumor durante el desarrollo del c&aacute;ncer de mama, se utiliza un enfoque de INNAVES aqu&iacute; encontrar biomarcadores relevantes del c&aacute;ncer de mama. Estos cambios de glicosilaci&oacute;n se saben que se correlacionan con el aumento de la carga tumoral y pron&oacute;stico pobre. Pruebas actuales basadas en anticuerpos de inmunoqu&iacute;micas para biomarcadores del c&aacute;ncer de ovario (CA125), mama (CA27.29 o CA15-3), p&aacute;ncreas, g&aacute;strico, colon, y carcinoma (CA19-9) altamente prote&iacute;nas de mucina glicosiladas. Sin embargo, estas pruebas carecen de la especificidad y sensibilidad para la detecci&oacute;n temprana. Este enfoque INNAVES encontrar glicanos biomarcadores del c&aacute;ncer de mama implica unirse qu&iacute;micamente oligosac&aacute;ridos (glicanos) de prote&iacute;nas glicosiladas arrojar o secretadas por l&iacute;neas de c&eacute;lulas de tumor de c&aacute;ncer de mama. Las especies de glicanos libre resultante son analizadas por MS MALDI-FT-ICR. Adem&aacute;s pueden realizarse an&aacute;lisis estructural de los glicanos en FTM mediante espectrometr&iacute;a total en t&aacute;ndem con infrarroja multifot&oacute;n disociaci&oacute;n. Perfiles de glicanos generaron para cada l&iacute;nea celular y comparados. Estos m&eacute;todos fueron luego utilizados para analizar los sueros obtenidos de un modelo murino de c&aacute;ncer de mama y un peque&ntilde;o n&uacute;mero de muestras de suero obtenidas de pacientes humanos con diagn&oacute;stico de c&aacute;ncer de mama o pacientes sin antecedentes conocidos de c&aacute;ncer de mama. Adem&aacute;s de los cambios de glicosilaci&oacute;n detectados en ratones como tumores mamarios rat&oacute;n desarrollados, perfiles de glicosilaci&oacute;n resultaron para ser suficientemente diferente a aquellos sin distinguir con pacientes con c&aacute;ncer. Aunque el escaso n&uacute;mero de muestras analizadas hasta ahora es insuficiente para hacer reclamos leg&iacute;timos en este momento, estos prometedores pero resultados muy preliminares sugieren que los glicanos perfiles pueden contener distintos glicanos biomarcadores que pueden corresponder a glicanos &quot;firmas de c&aacute;ncer&quot;.

Un suero INNAVES enfoque biomarcadores del c&aacute;ncer de mama.

&#x7FFB;&#x8BD1;&#x540E;&#x7684;&#x4FEE;&#x6539;&#xFF0C;&#x4F8B;&#x5982;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x53EF;&#x4EE5;&#x53D1;&#x6325;&#x5728;&#x4FE1;&#x53F7;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x666E;&#x901A;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8F6C;&#x5316;&#x4E3A;&#x4E00;&#x79CD;&#x6076;&#x6027;&#x7684;&#x57FA;&#x672C;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;&#x53D1;&#x5C55;&#x7684;&#x4E00;&#x9879;&#x8BAE;&#x5B9A;&#x4E66;&#xFF0C;&#x5728;&#x75BE;&#x75C5;&#x7684;&#x521D;&#x6B65;&#x9636;&#x6BB5;&#x68C0;&#x6D4B;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x66F4;&#x6539;&#x53EF;&#x5BFC;&#x81F4;&#x654F;&#x611F;&#x548C;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x8BCA;&#x65AD;&#x9274;&#x522B;&#x7CD6;&#x6A21;&#x5F0F;&#x6302;&#x94A9;&#x75C5;&#x56E0;&#x548C;&#x8FDB;&#x5C55;&#x7684;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x7B49;&#x6076;&#x6027;&#x80BF;&#x7624;&#x7684;&#x65E9;&#x671F;&#x8BCA;&#x65AD;&#x3002;&#x5DF2;&#x77E5;&#x4EEA;&#x8868;&#x53C2;&#x6570;&#x548C;&#x6837;&#x54C1;&#x5236;&#x5907;&#x6280;&#x672F;&#x7684;&#x5C0F;&#x53D8;&#x5316;&#x6709;&#x91CD;&#x8981;&#x5F71;&#x54CD;&#x7684;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x7ED3;&#x679C;&#x3002;&#x8981;&#x6709;&#x6548;&#x548C;&#x53EF;&#x91CD;&#x73B0;&#x5B9E;&#x9A8C;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x53C2;&#x6570;&#x5FC5;&#x987B;&#x4E3A;&#x6B63;&#x5728;&#x7814;&#x7A76; analyte(s) &#x8FDB;&#x884C;&#x4F18;&#x5316;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x76EE;&#x524D;&#x7684;&#x6837;&#x54C1;&#x5236;&#x5907;&#x7684;&#x8BE6;&#x7EC6;&#x7684;&#x5BA1;&#x67E5;&#x548C;&#x57FA;&#x8D28;&#x8F85;&#x52A9;&#x6FC0;&#x5149;&#x89E3;&#x5438;/&#x7535;&#x79BB;&#x5085;&#x91CC;&#x53F6;&#x53D8;&#x6362;&#x79BB;&#x5B50;&#x56DE;&#x65CB;&#x5171;&#x632F;&#x8D28;&#x8C31;&#x6CD5; (&#x9A6C;&#x5C14;&#x8FEA;-&#x91D1;&#x878D;&#x65F6;&#x62A5; &#x300B;-ICR-&#x8D28;&#x8C31;) O-&#x805A;&#x7CD6;&#x5206;&#x6790;&#x5168;&#x7403;&#x5206;&#x89E3;&#x4ECE;&#x9ECF;&#x86CB;&#x767D;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;&#x4E0E;&#x7A33;&#x5B9A;&#x540C;&#x4F4D;&#x7D20;&#x6807;&#x8BB0;&#x751F;&#x7269;&#x5206;&#x5B50;&#x5141;&#x8BB8;&#x5EFA;&#x7ACB;&#x9002;&#x5F53;&#x8D2D;&#x7F6E;&#x500D;&#x548C;&#x52B1;&#x78C1;&#x7535;&#x538B;&#x8FDB;&#x884C;&#x8D28;&#x8C31; FT ICR ms &#x7684;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x3002;&#x9ECF;&#x86CB;&#x767D;&#x805A;&#x7CD6;&#x4E0E;&#x56DB;&#x6781;&#x79BB;&#x5B50;&#x6307;&#x5357;&#x4F18;&#x5316;&#x7814;&#x7A76;&#x8BA4;&#x5B9A;&#x8FD9;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x4E2D;&#x7684;&#x6574;&#x4E2A;&#x4F53;&#x79EF; O &#x8303;&#x56F4;&#x94FE;&#x63A5;&#x7CD6;&#x7C7B;&#x7684;&#x5168;&#x9762;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x6761;&#x4EF6;&#x3002;&#x5728;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x53EF;&#x7528;&#x4E8E;&#x6709;&#x6548; O-&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7EB3;&#x5165;&#x5355;&#x72EC;&#x4F18;&#x5316;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x53C2;&#x6570;&#x3002;

&#x8C03;&#x67E5;&#x4E0E;&#x6FB3;&#x8054;&#x7CFB;&#x86CB;&#x767D;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x7684;&#x57FA;&#x8D28;&#x8F85;&#x52A9;&#x6FC0;&#x5149;&#x89E3;&#x5438;/&#x7535;&#x79BB;&#x5085;&#x91CC;&#x53F6;&#x53D8;&#x6362;&#x79BB;&#x5B50;&#x56DE;&#x65CB;&#x5171;&#x632F;&#x8D28;&#x8C31;&#x6CD5;&#x3002;

Posttranslational modifications such as glycosylation can play a fundamental role in signaling pathways that transform an ordinary cell into a malignant one. The development of a protocol to detect these changes in the preliminary stages of disease can lead to a sensitive and specific diagnostic for the early detection of malignancies such as ovarian cancer in which differential glycan patterns are linked to etiology and progression. Small variations in instrument parameters and sample preparation techniques are known to have significant influence on the outcome of an experiment. For an experiment to be effective and reproducible, these parameters must be optimized for the analyte(s) under study. We present a detailed examination of sample preparation and matrix-assisted laser desorption/ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry (MALDI-FT-ICR-MS) analysis of O-linked glycans globally cleaved from mucin glycoproteins. Experiments with stable isotope-labeled biomolecules allowed for the establishment of appropriate acquisition times and excitation voltages for MALDI-FT-ICR-MS of oligosaccharides. Quadrupole ion guide optimization studies with mucin glycans identified conditions for the comprehensive analysis of the entire mass range of O-linked carbohydrates in this glycoprotein. Separately optimized experimental parameters were integrated in a method that allowed for the effective study of O-linked glycans.

Investigations with O-linked protein glycosylations by matrix-assisted laser desorption/ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry.

Les modifications post-traductionnelles telles que glycosylation peuvent jouer un r&ocirc;le fondamental dans la signalisation des voies que transforment une cellule ordinaire en un malin. L&#39;&eacute;laboration d&#39;un protocole pour d&eacute;tecter ces changements aux stades pr&eacute;liminaires de la maladie peut conduire &agrave; un diagnostic pr&eacute;cis et sensible pour la d&eacute;tection pr&eacute;coce des tumeurs malignes comme le cancer de l&#39;ovaire dans lequel glycane diff&eacute;rentielle mod&egrave;les sont li&eacute;s &agrave; l&#39;&eacute;tiologie et la progression. Petites variations dans les param&egrave;tres de l&#39;instrument et des techniques de pr&eacute;paration d&#39;&eacute;chantillon sont connues pour avoir une influence notable sur les r&eacute;sultats d&#39;une exp&eacute;rience. Pour une exp&eacute;rience efficace et reproductible, ces param&egrave;tres doivent &ecirc;tre optimis&eacute;es pour l&#39;ou les analytes &agrave; l&#39;&eacute;tude. Nous pr&eacute;sentons un examen d&eacute;taill&eacute; de la pr&eacute;paration des &eacute;chantillons et laser assist&eacute;e par matrice d&eacute;sorption-ionisation Fourier transform r&eacute;sonance cyclotron d&#39;ion analyse de spectrom&eacute;trie de masse (MALDI-FT-ICR-MS) de O-glycanes cliv&eacute; dans le monde des glycoprot&eacute;ines de la mucine. Exp&eacute;riences avec stable isotope marqu&eacute; biomol&eacute;cules a permis l&#39;&eacute;tablissement de d&eacute;lais d&#39;acquisition appropri&eacute;e et de la tension d&#39;excitation pour MALDI-FT-ICR-MS d&#39;oligosaccharides. &Eacute;tudes d&#39;optimisation guide ionique quadripolaire avec mucine glycanes identifi&eacute; conditions pour l&#39;analyse d&eacute;taill&eacute;e des glucides masse gamme d&#39;O-li&eacute;s ensemble dans cette glycoprot&eacute;ine. Optimis&eacute;es s&eacute;par&eacute;ment des param&egrave;tres exp&eacute;rimentaux ont &eacute;t&eacute; int&eacute;gr&eacute;s dans une m&eacute;thode qui a permis &agrave; l&#39;&eacute;tude efficace d&#39;O-glycanes.

Enqu&ecirc;tes avec les prot&eacute;ines O-li&eacute;s glycosylations par d&eacute;sorption-ionisation de laser assist&eacute;e par matrice transform&eacute;e de Fourier transforment ion cyclotron resonance microanalyse.

Posttranslationale Modifikationen wie Glykosylierung k&ouml;nnen spielen eine wesentliche Rolle bei der Signalisierung von Bahnen, die eine normale Zelle in eine b&ouml;sartige umzuwandeln. Die Entwicklung eines Protokolls erkennen Sie diese &Auml;nderungen im Vorfeld der Krankheit kann zu einer sensitiven und spezifischen Diagnostik zur Fr&uuml;herkennung von b&ouml;sartigen Tumoren wie Eierstockkrebs f&uuml;hren in der differenziellen Glykan-Muster zu &Auml;tiologie und Progression verbunden sind. Kleine Schwankungen der Ger&auml;teparameter und Beispiel Vorbereitung Techniken sind bekannterma&szlig;en haben erheblichen Einfluss auf das Ergebnis eines Experiments. F&uuml;r ein Experiment wirksam und reproduzierbar sind m&uuml;ssen diese Parameter f&uuml;r dem(den) Analyten in der Konzentration unter Studie optimiert werden. Pr&auml;sentieren wir Ihnen eine detaillierte Untersuchung der Probenvorbereitung und Matrix-unterst&uuml;tzte Laser-Desorption/Ionisation-Fourier transform Ion-Zyklotron-Resonanz Massenspektrometrie (MALDI-FT-ICR-MS) Analyse der O-chromosomale Glykane weltweit von Mucin Glykoproteine zerspaltet. Experimente mit stabilen Isotopen-Label Biomolek&uuml;le erlaubt die Einrichtung von entsprechenden Erfassungszeiten und Erregung Spannungen f&uuml;r MALDI-FT-ICR-MS der Oligosaccharide. Quadrupol Ion F&uuml;hrer Optimierungsstudien mit Mucin-Glykane identifiziert Bedingungen f&uuml;r die umfassende Analyse der gesamten Masse Bereich der O-chromosomale Kohlenhydrate in dieses Glykoprotein. Separat optimierte experimentellen Parameter wurden in einer Methode integriert, die f&uuml;r die wirksame Untersuchung der O-chromosomale Glykane zul&auml;ssig.

Untersuchungen mit Protein O-linked Glycosylations von Matrix-unterst&uuml;tzte Laser-Desorption/Ionisation-Fourier transform Ion-Zyklotron-Resonanz-Massenspektrometrie.

Le modifiche di posttranslational come glicosilazione possono giocare un ruolo fondamentale nella segnalazione percorsi che trasformano una cellula normale in una maligna. Lo sviluppo di un protocollo per rilevare queste modifiche nelle fasi preliminari della malattia pu&ograve; portare a una diagnosi sensibile e specifica per la diagnosi precoce dei tumori maligni come il cancro ovarico in cui modelli differenziali glycan sono legate a eziologia e progressione. Piccole variazioni nei parametri dello strumento e tecniche di preparazione del campione sono noti per avere un&#39;influenza notevole sul risultato di un esperimento. Per un esperimento per essere efficace e riproducibile, questi parametri devono essere ottimizzati per l&#39;analita/gli analiti in fase di studio. Vi presentiamo un esame approfondito di preparazione del campione e matrix-assisted laser desorption/ionizzazione Fourier transform risonanza ionica ciclotronica analisi di spettrometria di massa (MALDI-FT-ICR-MS) dei glicani O-linked globalmente spaccati da glicoproteine di mucina. Esperimenti con biomolecole di marcato con isotopo stabile ha permesso per la determinazione dei tempi di acquisizione appropriati e tensioni di eccitazione per MALDI-FT-ICR-MS di oligosaccaridi. Quadrupole ion guida ottimizzazione studi con mucina glicani identificato le condizioni per l&#39;analisi completa dei carboidrati interi massa gamma di O-linked in questa glicoproteina. Separatamente ottimizzati i parametri sperimentali sono stati integrati in un metodo che ha permesso per lo studio efficacia dei glicani O-linked.

Indagini con proteina O-linked glycosylations da matrix-assisted laser desorption/ionizzazione Fourier trasformano ione risonanza ciclotronica.

&#x4FEE;&#x98FE;&#x7CD6;&#x9396;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306A;&#x3069;&#x306F;&#x666E;&#x901A;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x3092;&#x60AA;&#x6027;&#x306E;&#x3082;&#x306E;&#x306B;&#x5909;&#x63DB;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x30D1;&#x30B9;&#x306E;&#x57FA;&#x672C;&#x7684;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x518D;&#x751F;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x75C5;&#x6C17;&#x306E;&#x4E88;&#x5099;&#x7684;&#x306A;&#x6BB5;&#x968E;&#x3067;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5909;&#x66F4;&#x3092;&#x691C;&#x51FA;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C8;&#x30B3;&#x30EB;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x306F;&#x654F;&#x611F;&#x3068;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x8A3A;&#x65AD;&#x5DEE;&#x52D5;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x304C;&#x767A;&#x751F;&#x3068;&#x9032;&#x884C;&#x306B;&#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x60AA;&#x6027;&#x816B;&#x760D;&#x306E;&#x65E9;&#x671F;&#x767A;&#x898B;&#x306B;&#x3064;&#x306A;&#x304C;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x697D;&#x5668;&#x30D1;&#x30E9;&#x30E1;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3068;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x8ABF;&#x88FD;&#x6280;&#x8853;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5C0F;&#x3055;&#x306A;&#x5909;&#x52D5;&#x5B9F;&#x9A13;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306B;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x52B9;&#x679C;&#x7684;&#x3067;&#x518D;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5B9F;&#x9A13;&#x3001;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x4E0B;&#x3067; analyte(s) &#x3092;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30D1;&#x30E9;&#x30E1;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x6700;&#x9069;&#x5316;&#x3057;&#x306A;&#x3051;&#x308C;&#x3070;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x306E;&#x6E96;&#x5099;&#x306E;&#x8A73;&#x7D30;&#x306A;&#x691C;&#x8A0E;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DE;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x652F;&#x63F4;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B6;&#x30FC;&#x8131;&#x96E2;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x5316;&#x30D5;&#x30FC;&#x30EA;&#x30A8;&#x5909;&#x63DB;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3; &#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x5171;&#x9CF4;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790; &#xFF08;MALDI FT ICR MS&#xFF09; &#x5206;&#x6790;&#x7CD6;&#x306E;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB; &#x30E0;&#x30C1;&#x30F3;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x304B;&#x3089;&#x88C2;&#x304B;&#x3002;MALDI FT ICR MS &#x306E;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E;&#x9069;&#x5207;&#x306A;&#x53D6;&#x5F97;&#x6642;&#x9593;&#x3068;&#x52B1;&#x8D77;&#x96FB;&#x5727;&#x306E;&#x78BA;&#x7ACB;&#x3092;&#x8A31;&#x53EF;&#x5B89;&#x5B9A;&#x540C;&#x4F4D;&#x4F53;&#x6A19;&#x8B58;&#x751F;&#x4F53;&#x5206;&#x5B50;&#x3068;&#x306E;&#x5B9F;&#x9A13;&#x3002;&#x56DB;&#x91CD;&#x6975;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3; &#x30AC;&#x30A4;&#x30C9;&#x6700;&#x9069;&#x5316;&#x30B9;&#x30BF;&#x30C7;&#x30A3; &#x30E0;&#x30C1;&#x30F3;&#x7CD6;&#x9396;&#x3092;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x8CEA;&#x91CF;&#x7BC4;&#x56F2;&#x306E; O &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x306E;&#x70AD;&#x6C34;&#x5316;&#x7269;&#x3053;&#x306E;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x5305;&#x62EC;&#x7684;&#x306A;&#x5206;&#x6790;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6761;&#x4EF6;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5225;&#x306B;&#x6700;&#x9069;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5B9F;&#x9A13;&#x7684;&#x30D1;&#x30E9;&#x30E1;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306F;&#x7CD6;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x7684;&#x306A;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x8A31;&#x53EF;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x3067;&#x7D71;&#x5408;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

O &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x305F;&#x3093;&#x3071;&#x304F;&#x8CEA;&#x30B0;&#x30EA;&#x30B3;&#x30B7;&#x30EB;&#x5316;&#x30DE;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x652F;&#x63F4;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B6;&#x30FC;&#x8131;&#x96E2;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x5316;&#x30D5;&#x30FC;&#x30EA;&#x30A8;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8ABF;&#x67FB;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3; &#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x5171;&#x9CF4;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x3092;&#x5909;&#x63DB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Glycosylation &#xAC19;&#xC740; posttranslational &#xC218;&#xC815; &#xC545;&#xC131; &#xD558;&#xB098; &#xC77C;&#xBC18; &#xC140; &#xBCC0;&#xD658; &#xACBD;&#xB85C; &#xC2E0;&#xD638;&#xC5D0; &#xADFC;&#xBCF8;&#xC801;&#xC778; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC9C8;&#xBCD1;&#xC758; &#xCD08;&#xAE30; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBCC0;&#xACBD; &#xB0B4;&#xC6A9;&#xC744; &#xAC10;&#xC9C0; &#xD558;&#xB824;&#xBA74; &#xD504;&#xB85C;&#xD1A0;&#xCF5C; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xBCD1; &#xC778; &#xBC0F; &#xC9C4;&#xD589;&#xC5D0; &#xCC28;&#xB3D9; glycan &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xC5F0;&#xACB0; &#xD558;&#xB294; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xB4F1; &#xC545;&#xC131; &#xC885;&#xC591;&#xC758; &#xC870;&#xAE30; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD558; &#xACE0; &#xD2B9;&#xC815; &#xC9C4;&#xB2E8; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC545;&#xAE30; &#xB9E4;&#xAC1C; &#xBCC0;&#xC218;&#xC640; &#xC0D8;&#xD50C; &#xC900;&#xBE44; &#xD14C;&#xD06C;&#xB2C9;&#xC5D0; &#xC791;&#xC740; &#xBCC0;&#xD654; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC;&#xC5D0; &#xC0C1;&#xB2F9;&#xD55C; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBBF8;&#xCE60; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xB2E4;. &#xD6A8;&#xACFC;&#xC801;&#xC774; &#xACE0; &#xC7AC;&#xD604; &#xD558;&#xB294; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; analyte(s)&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB9E4;&#xAC1C; &#xBCC0;&#xC218;&#xB97C; &#xB099;&#xAD00; &#xD55C;&#xB2E4;. &#xC120;&#xBB3C;&#xC774; &#xC2DC;&#xB8CC; &#xC900;&#xBE44;&#xC758; &#xC0C1;&#xC138;&#xD55C; &#xAC80;&#xC0AC;&#xC640; &#xB9E4;&#xD2B8;&#xB9AD;&#xC2A4; &#xBCF4;&#xC870; &#xB808;&#xC774;&#xC800; &#xD0C8; &#xCC29;/&#xC774;&#xC628;&#xD654; &#xD478;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xBCC0;&#xD658; O &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; glycans&#xC758; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; (MALDI-&#xD53C;&#xD2B8;-ICR-MS) &#xBD84;&#xC11D; mucin glycoproteins&#xC5D0;&#xC11C; &#xC138;&#xACC4;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD2B9;&#xD788; &#xC774;&#xC628; &#xC0AC;&#xC774;&#xD074; &#xB85C;&#xD2B8; &#xB860; &#xACF5;&#xBA85;. &#xC548;&#xC815; &#xB3D9;&#xC704; &#xC6D0;&#xC18C; &#xB77C;&#xB294; biomolecules MALDI &#xD53C;&#xD2B8;-ICR-MS oligosaccharides&#xC758;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC801;&#xC808; &#xD55C; &#xC218;&#xC9D1; &#xC2DC;&#xAC04;&#xACFC; &#xAD6C;&#xB3D9; &#xC804;&#xC555;&#xC758; &#xC124;&#xB9BD;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD5C8;&#xC6A9;&#xACFC; &#xC2E4;&#xD5D8;. Quadrupole &#xC774;&#xC628; &#xAC00;&#xC774;&#xB4DC; &#xCD5C;&#xC801;&#xD654; &#xC5F0;&#xAD6C; mucin glycans&#xB85C; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC774; &#xB2F9;&#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC804;&#xCCB4; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBC94;&#xC704; O &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; &#xD0C4;&#xC218;&#xD654;&#xBB3C;&#xC758; &#xD3EC;&#xAD04;&#xC801;&#xC778; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xC870;&#xAC74;. &#xAC1C;&#xBCC4;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xCD5C;&#xC801;&#xD654; &#xB41C; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC801;&#xC778; &#xB9E4;&#xAC1C; &#xBCC0;&#xC218; O&#xC5D0; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; glycans&#xC758; &#xD6A8;&#xACFC;&#xC801;&#xC778; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD5C8;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC5D0; &#xD1B5;&#xD569; &#xD588;&#xB2E4;.

&#xB9E4;&#xD2B8;&#xB9AD;&#xC2A4; &#xBCF4;&#xC870; &#xB808;&#xC774;&#xC800; &#xD0C8; &#xCC29;/&#xC774;&#xC628;&#xD654; &#xD478;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; O &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; glycosylations&#xC640; &#xC870;&#xC0AC; &#xC774;&#xC628; &#xC0AC;&#xC774;&#xD074; &#xB85C;&#xD2B8; &#xB860; &#xACF5;&#xBA85; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; &#xBCC0;&#xD658;.

Modificaciones postraduccionales como glicosilaci&oacute;n pueden desempe&ntilde;ar un papel fundamental en la se&ntilde;alizaci&oacute;n de las v&iacute;as que transforman una c&eacute;lula normal en una maligna. El desarrollo de un protocolo para detectar estos cambios en las etapas preliminares de la enfermedad puede conducir a un diagn&oacute;stico sensible y espec&iacute;fico para la detecci&oacute;n temprana de tumores malignos como c&aacute;ncer de ovario en que patrones de glicanos diferencial est&aacute;n relacionados con la etiolog&iacute;a y progresi&oacute;n. Peque&ntilde;as variaciones en los par&aacute;metros del instrumento y t&eacute;cnicas de preparaci&oacute;n de muestra son conocidas por tener una influencia significativa sobre el resultado de un experimento. Para que un experimento ser eficaz y reproducible, estos par&aacute;metros deben optimizarse para el analyte(s) bajo estudio. Presentamos un examen detallado de la preparaci&oacute;n de la muestra y l&aacute;ser asistida por matriz desorci&oacute;n/ionizaci&oacute;n Fourier transforma de resonancia del ciclotr&oacute;n de ion an&aacute;lisis de espectrometr&iacute;a de masas (MALDI-FT-ICR-MS) de glicanos vinculados O globalmente troceados de glicoprote&iacute;nas de mucina. Experimentos con biomol&eacute;culas de marcados con is&oacute;topos estables permitida el establecimiento de tiempos de adquisici&oacute;n apropiada y tensiones de excitaci&oacute;n para MALDI-FT-ICR-MS de oligosac&aacute;ridos. Estudios de optimizaci&oacute;n de cuadrupolo ion gu&iacute;a con mucina glycans identifican las condiciones para el an&aacute;lisis integral de los carbohidratos de masa gama de O-ligado toda esta glicoprote&iacute;na. Optimizado por separado los par&aacute;metros experimentales fueron integrados en un m&eacute;todo que permiti&oacute; el estudio eficaz de glicanos O vinculados.

Las investigaciones con prote&iacute;na ligada O glycosylations por l&aacute;ser asistida por matriz desorci&oacute;n/ionizaci&oacute;n Fourier transforman spectrometry total de ion ciclotr&oacute;n resonancia.

&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x5F88;&#x96BE;&#x8BCA;&#x65AD;&#x7684;&#x5987;&#x5973;&#x56E0;&#x4E3A;&#x76F4;&#x5230;&#x75C5;&#x60C5;&#x53D1;&#x5C55;&#x5230;&#x665A;&#x671F;&#x6CBB;&#x6108;&#x8FD9;&#x79CD;&#x75BE;&#x75C5;&#x7684;&#x75C7;&#x72B6;&#x901A;&#x5E38;&#x4E0D;&#x88AB;&#x6CE8;&#x610F;&#x3002;&#x76EE;&#x524D;&#x53EF;&#x7528;&#x6765;&#x5E2E;&#x52A9;&#x8FDB;&#x884C;&#x76D1;&#x6D4B;&#x6CBB;&#x7597;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x8840;&#x6E05;&#x6D4B;&#x8BD5;&#xFF0C;&#x764C;&#x6297;&#x539F; 125&#xFF0C;&#x867D;&#x7136;&#xFF0C;&#x6B64;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x7F3A;&#x4E4F;&#x5FC5;&#x8981;&#x7684;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x548C;&#x654F;&#x611F;&#x6027;&#x7684;&#x65E9;&#x671F;&#x68C0;&#x6D4B;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x9700;&#x8981;&#x6709;&#x66F4;&#x597D;&#x7684;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x3002;&#x4E00;&#x79CD;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x5206;&#x6790;&#x65B9;&#x6CD5;&#x8FDB;&#x884C;&#x4F7F;&#x7528;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x5085;&#x7ACB;&#x53F6;&#x53D8;&#x6362;&#x79BB;&#x5B50;&#x56DE;&#x65CB;&#x5171;&#x632F;&#x8D28;&#x8C31;&#x5206;&#x6790;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x86CB;&#x767D;&#x5728;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x57F9;&#x517B;&#x6DB2;&#x4E2D;&#x548C;&#x4ECE;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x60A3;&#x8005;&#x548C;&#x6B63;&#x5E38;&#x7684;&#x63A7;&#x5236;&#x83B7;&#x5F97;&#x7684;&#x8840;&#x6E05;&#x4E2D;&#x5B58;&#x5728;&#x3002;&#x5728;&#x6B64;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x51DD;&#x80F6;&#x7535;&#x6CF3;&#x5206;&#x79BB;&#x7CD6;&#x5316;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x9274;&#x5B9A;&#x9009;&#x5B9A;&#x4E86;&#x4E2A;&#x522B;&#x7684;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;&#x9644;&#x4ECE;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x86CB;&#x767D;&#x7CD6;&#x88AB;&#x91CA;&#x653E;&#xFF0C;&#x5E76;&#x7531;&#x8D28;&#x8C31;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x4ECE;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5DF2;&#x786E;&#x5B9A;&#x7531;&#x5305;&#x542B;&#xFF0C;&#x4E3B;&#x8981;&#x662F; O-&#x805A;&#x7CD6; ES2 &#x5206;&#x79BB;&#x7684;&#x9ECF;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x5927;&#x7CD6;&#x5316;&#x86CB;&#x767D;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x3002;&#x56DB;&#x4E2A;&#x7A81;&#x51FA;&#x7684;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x8FD1;&#x4F3C; 517&#x3001; 370&#x3001; 250&#x3001; 163 kDa &#x4ECE;&#x8840;&#x6E05;&#x6837;&#x54C1;&#x88AB;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E3A;&#x4E24;&#x79CD;&#x5F62;&#x5F0F;&#x7684;&#x8F7D;&#x8102;&#x86CB;&#x767D; B 100&#x3001; &#x7EA4;&#x7EF4;&#x8FDE;&#x63A5;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x514D;&#x75AB;&#x7403;&#x86CB;&#x767D; A1&#xFF0C;&#x5206;&#x522B;&#x3002;&#x805A;&#x7CD6;&#x5206;&#x79BB;&#x8F7D;&#x8102;&#x86CB;&#x767D; B 100 &#x8D28;&#x8C31;&#x5206;&#x6790; (517 kD&#xFF09; &#x8868;&#x660E;&#x5C0F;&#x3001; &#x7279;&#x5B9A;&#x94FE;&#x63A5; O &#x5BE1;&#x7CD6;&#x7684;&#x5B58;&#x5728;&#x3002;&#x4E0E;&#x4E4B;&#x76F8;&#x53CD;&#xFF0C;&#x7EA4;&#x7EF4;&#x8FDE;&#x63A5;&#x86CB;&#x767D;&#x5206;&#x6790; (250 kD) &#x548C;&#x514D;&#x75AB;&#x7403;&#x86CB;&#x767D; A1 (163 kD) &#x4EA7;&#x751F;&#x8DB3;&#x591F;&#x4E0D;&#x540C;&#x4E8E;&#x7D22;&#x53D6;&#x76F8;&#x5E94;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x5E26;&#x672C;&#x6B63;&#x5E38;&#x8840;&#x6E05;&#x6837;&#x54C1;&#x4E2D;&#x7CD6;&#x7684;&#x5F62;&#x5F0F;&#x4E2D;&#x7684; N-&#x8FDE;&#x7CD6;&#x7247;&#x6BB5;&#x3002;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E;&#x5355;&#x4E00;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E0D;&#x4EC5;&#x51E0;&#x4E2A;&#x95ED;&#x5408;&#x7684;&#x7CD6;&#x5316;&#xFF0C;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5F02;&#x5E38;&#x7684;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x7684;&#x66F4;&#x6539;&#x53EF;&#x4EE5;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5230;&#x5E76;&#x6700;&#x7EC8;&#x53EF;&#x80FD;&#x6210;&#x4E3A;&#x7CD6;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x5BF9;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x3002;

&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x53CA;&#x5375;&#x5DE2;&#x764C;&#x60A3;&#x8005;&#x8840;&#x6E05; Glycoproteomic &#x5206;&#x6790;&#x663E;&#x793A;&#x4E2A;&#x522B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E0D;&#x540C;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x53D8;&#x5316;&#x3002;

Ovarian cancer is difficult to diagnose in women because symptoms of the disease are often not noticed until the disease has progressed to an advanced untreatable stage. Although a serum test, CA125, is currently available to assist with monitoring treatment of ovarian cancer, this test lacks the necessary specificity and sensitivity for early detection. Therefore, better biomarkers of ovarian cancer are needed. A glycoprotein analysis approach was undertaken using high resolution Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry to analyze glycosylated proteins present in the conditioned media of ovarian cancer cell lines and in sera obtained from ovarian cancer patients and normal controls. In this study, glycosylated proteins were separated by gel electrophoresis, and individual glycoproteins were selected for glycosylation analysis and protein identification. The attached glycans from each protein were released and profiled by mass spectrometry. Glycosylation of a mucin protein and a large glycosylated protein isolated from the ES2 ovarian cancer cell line was determined to consist of mostly O-linked glycans. Four prominent glycoproteins of approximate 517, 370, 250, 163 kDa from serum samples were identified as two forms of apolipoprotein B-100, fibronectin, and immunoglobulin A1, respectively. Mass spectrometric analysis of glycans isolated from apolipoprotein B-100 (517 kD) showed the presence of small, specific O-linked oligosaccharides. In contrast, analysis of fibronectin (250 kD) and immunoglobulin A1 (163 kD) produced N-linked glycan fragments in forms that were sufficiently different from the glycans obtained from the corresponding protein band present in the normal serum samples. This study shows that not only a single protein but several are aberrantly glycosylated, and those abnormal glycosylation changes can be detected and may ultimately serve as glycan biomarkers for ovarian cancer.

Glycoproteomic analyses of ovarian cancer cell lines and sera from ovarian cancer patients show distinct glycosylation changes in individual proteins.

Cancer de l&#39;ovaire est difficile &agrave; diagnostiquer chez les femmes, parce que les sympt&ocirc;mes de la maladie ne sont souvent pas remarqu&eacute;s jusqu&#39;&agrave; ce que la maladie a progress&eacute; &agrave; un stade avanc&eacute; incurable. Bien qu&#39;une s&eacute;ro, CA125, est actuellement disponible pour aider &agrave; suivre le traitement du cancer de l&#39;ovaire, ce test n&#39;a pas la sp&eacute;cificit&eacute; n&eacute;cessaire et la sensibilit&eacute; pour la d&eacute;tection pr&eacute;coce. Par cons&eacute;quent, meilleures biomarqueurs du cancer de l&#39;ovaire sont n&eacute;cessaires. Une approche d&#39;analyse de glycoprot&eacute;ine visait &agrave; haute r&eacute;solution Fourier transform ion cyclotron resonance spectrom&eacute;trie de masse pour analyser les prot&eacute;ines glycosyl&eacute;es pr&eacute;sents dans les milieux conditionn&eacute;s de lign&eacute;es cellulaires de cancer de l&#39;ovaire et dans des s&eacute;rums provenant de patients atteints de cancer ovarien et t&eacute;moins normaux. Dans cette &eacute;tude, prot&eacute;ines glycosyl&eacute;es sont s&eacute;par&eacute;s par &eacute;lectrophor&egrave;se sur gel et glycoprot&eacute;ines individuelles ont &eacute;t&eacute; s&eacute;lectionn&eacute;s pour l&#39;identification de prot&eacute;ines et de l&#39;analyse glycosylation. Les glycanes attach&eacute;es de chaque prot&eacute;ine ont &eacute;t&eacute; lib&eacute;r&eacute;s et profil&eacute;es par spectrom&eacute;trie de masse. La glycosylation d&#39;une prot&eacute;ine de mucine et une prot&eacute;ine glycosyl&eacute;e grand isol&eacute; de l&#39;ES2, lign&eacute;e cellulaire de cancer de l&#39;ovaire &eacute;tait d&eacute;termin&eacute;e &agrave; consistent principalement O-glycanes. Quatre &eacute;minents glycoprot&eacute;ines de 517 approximative, 370, 250, 163 kDa provenant d&#39;&eacute;chantillons de s&eacute;rum ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;es comme deux formes d&#39;apolipoprot&eacute;ine B-100, la fibronectine et immunoglobuline A1, respectivement. Des glycanes isol&eacute;es de l&#39;apolipoprot&eacute;ine B-100 analyse par spectrom&eacute;trie de masse (517 kD) a r&eacute;v&eacute;l&eacute; la pr&eacute;sence de petits, sp&eacute;cifiques des oligosaccharides O-li&eacute;s. En revanche, l&#39;analyse de la fibronectine (250 kD) et immunoglobuline A1 (163 kD) produit des fragments de glycane N-li&eacute;s dans les formes qui &eacute;taient suffisamment diff&eacute;rentes des glycanes obtenus &agrave; partir de la bande correspondante de prot&eacute;ines pr&eacute;sente dans les &eacute;chantillons de s&eacute;rum normal. Cette &eacute;tude montre que non seulement une seule prot&eacute;ine, mais plusieurs sont aberrantly glycosyl&eacute;e, et ces glycosylation anormale des changements peuvent &ecirc;tre d&eacute;tect&eacute;s et peuvent en fin de compte servir de glycane biomarqueurs pour le cancer de l&#39;ovaire.

Glycoproteomic analyses de lign&eacute;es cellulaires de cancer de l&#39;ovaire et de s&eacute;rums de patients de cancer de l&#39;ovaire montrent des changements distincts de glycosylation de prot&eacute;ines individuelles.

Eierstockkrebs ist schwierig, bei Frauen zu diagnostizieren, da die Symptome der Krankheit sind oft nicht bemerkt, bis die Krankheit zu weit fortgeschritten unbehandelbarer fortgeschritten ist. Obwohl ein Serum Test, CA125, derzeit gerne mit &Uuml;berwachung der Behandlung von Eierstockkrebs ist, fehlt dieser Test die erforderlichen Spezifit&auml;t und Sensitivit&auml;t f&uuml;r die Fr&uuml;herkennung. Daher sind bessere Biomarker Eierstockkrebs erforderlich. Ein Glykoprotein-Analyse-Ansatz wurde durchgef&uuml;hrt mit hochaufl&ouml;senden Fourier-Transformation-Ion Zyklotron-Resonanz-Massenspektrometrie glykosylierter Proteine in den konditionierten Medien ovarian Krebs-Zelllinien und in Seren Eierstock-Krebs-Patienten und normalen Kontrollen zu analysieren. In dieser Studie glykosylierter Proteine wurden durch Gelelektrophorese getrennt, und einzelne Glykoproteine Glycosylation Analyse und Protein-Identifizierung ausgew&auml;hlt wurden. Die angef&uuml;gte Glykane von jedem Protein wurden profiliert durch Massenspektrometrie und ver&ouml;ffentlicht. Glykosylierung ein Mucin-Protein und ein gro&szlig;er glykosiliertes Protein isoliert von der ES2 Eierstockkrebs-Zelllinie bestimmt wurde, der meist O-chromosomale Glykane bestehen. Vier prominente Glykoproteine der ungef&auml;hre 517, 370, 250, 163 kDa von Serumproben wurden als zwei Formen von Apolipoprotein B-100, Fibronektin und Immunglobulin A1, bzw. identifiziert. Mass-spektrometrischen Analyse der Glykane isoliert von Apolipoprotein B-100 (517 kD) zeigte das Vorhandensein von kleinen, speziellen O gebundene Oligosaccharide. Im Gegensatz dazu Analyse der Fibronektin (250 kD) und Immunglobulin A1 (163 kD) produziert N-chromosomale Glykan-Fragmente in Formen, die unterschiedlich genug aus der Glykane das entsprechende Protein-Band vorhanden in den normalen Serumproben entnommen wurden. Diese Studie zeigt, dass nicht nur ein einziges Protein, sondern mehrere abnorm HbA1c, und diese abnorme Glycosylation &Auml;nderungen k&ouml;nnen erkannt und k&ouml;nnen letztlich dienen als Glykan-Biomarker f&uuml;r Eierstockkrebs.

Glycoproteomic Analysen von Eierstock-Krebs-Zelllinien und Seren von Eierstock-Krebs-Patienten zeigen unterschiedliche Glykosylierung &Auml;nderungen in einzelne Proteine.

Cancro ovarico &egrave; difficile da diagnosticare nelle donne perch&eacute; i sintomi della malattia sono spesso non notati fino a quando la malattia &egrave; progredita ad uno stadio avanzato non trattabili. Anche se un test di siero, CA125, &egrave; attualmente disponibile per assistere con monitoraggio trattamento del cancro ovarico, questa prova manca la necessaria specificit&agrave; e sensibilit&agrave; per la diagnosi precoce. Quindi, meglio biomarcatori del cancro ovarico sono necessarie. Un approccio di analisi glicoproteina &egrave; stato eseguito utilizzando ad alta risoluzione di Fourier ione risonanza ciclotronica per analizzare le proteine glicosilate presenti nei media condizionati di linee di cellule di carcinoma ovarico e sieri ottenuti da pazienti con cancro ovarico e controlli normali. In questo studio, le proteine glicosilate erano separate tramite elettroforesi del gel, e glicoproteine individuali sono state selezionate per l&#39;identificazione della proteina e di analisi di glicosilazione. I glicani allegate da ogni proteina sono stati rilasciati e profilati da spettrometria di massa. Glicosilazione di una proteina di mucina e una proteina glicosilata grande isolato da ES2 linea cellulare di cancro ovarico era determinato a consistono principalmente legata O glicani. Quattro importanti glicoproteine di 517 approssimativo, 370, 250, 163 kDa da campioni di siero sono stati identificati come due forme di apolipoproteina B-100, fibronectina e immunoglobulina A1, rispettivamente. Analisi spettrometrica dei glicani isolato da apolipoproteina B-100 di massa (517 kD) ha mostrato la presenza di piccoli, specifici collegati O oligosaccaridi. In contrasto, analisi di fibronectina (250 kD) e immunoglobulina A1 (163 kD) prodotto N-linked glycan frammenti in forme che erano sufficientemente diverse da glicani ottenuti dalla band corrispondenti proteine presenti nei campioni di siero normale. Questo studio dimostra che non solo una singola proteina, ma molte sono modo anomalo glicosilata, e quelli anormale glicosilazione modifiche possono essere rilevate e in ultima analisi possono servire come glycan biomarcatori per cancro ovarico.

Glycoproteomic analisi delle linee di cellule di carcinoma ovarico e sieri di pazienti affetti da cancro ovarico Visualizza glicosilazione distinti cambiamenti nelle singole proteine.

&#x5375;&#x5DE3;&#x304C;&#x3093;&#x306F;&#x3001;&#x75C5;&#x6C17;&#x306F;&#x3001;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x306A;&#x6CBB;&#x7642;&#x4E0D;&#x53EF;&#x80FD;&#x306A;&#x6BB5;&#x968E;&#x306B;&#x9032;&#x3093;&#x3067;&#x3044;&#x308B;&#x307E;&#x3067;&#x75C5;&#x6C17;&#x306E;&#x75C7;&#x72B6;&#x306B;&#x6C17;&#x3065;&#x3044;&#x305F;&#x3088;&#x304F;&#x306A;&#x3044;&#x306E;&#x3067;&#x5973;&#x6027;&#x306E;&#x8A3A;&#x65AD;&#x306F;&#x56F0;&#x96E3;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x8840;&#x6E05;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;, CA125, &#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x306E;&#x6CBB;&#x7642;&#x306E;&#x76E3;&#x8996;&#x3092;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3059;&#x308B;&#x73FE;&#x5728;&#x5229;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x3067;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x306F;&#x5FC5;&#x8981;&#x306A;&#x7279;&#x7570;&#x6027;&#x3068;&#x611F;&#x5EA6;&#x306E;&#x65E9;&#x671F;&#x767A;&#x898B;&#x3092;&#x6B20;&#x3044;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x306E;&#x3088;&#x308A;&#x3088;&#x3044;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x304C;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x9AD8;&#x5206;&#x89E3;&#x80FD;&#x30D5;&#x30FC;&#x30EA;&#x30A8;&#x5909;&#x63DB;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30E1;&#x30C7;&#x30A3;&#x30A2;&#x3068;&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x60A3;&#x8005;&#x3068;&#x5065;&#x5E38;&#x8005;&#x304B;&#x3089;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x8840;&#x6E05;&#x5B58;&#x5728;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3059;&#x308B;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3; &#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x5171;&#x9CF4;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x5206;&#x6790;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x3046;&#x3051;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;, &#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x30B2;&#x30EB;&#x306E;&#x96FB;&#x6C17;&#x6CF3;&#x52D5;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5206;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3001;&#x500B;&#x3005; &#x306E;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x7CD6;&#x9396;&#x4FEE;&#x98FE;&#x89E3;&#x6790;&#x3084;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x8B58;&#x5225;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x9078;&#x3070;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6DFB;&#x4ED8;&#x306E;&#x7CD6;&#x9396;&#x5404;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x304B;&#x3089;&#x89E3;&#x653E;&#x3055;&#x308C;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30E0;&#x30C1;&#x30F3; &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3068;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x7CD6;&#x9396;&#x306F;&#x3001;&#x5375;&#x5DE3;&#x304C;&#x3093;&#x7D30;&#x80DE;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x4E3B; O &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x7CD6;&#x9396;&#x3067;&#x69CB;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F; ES2 &#x304B;&#x3089;&#x5206;&#x96E2;&#x3002;4 &#x3064;&#x306E;&#x8457;&#x540D;&#x306A;&#x7CD6;&#x304A;&#x304A;&#x3088;&#x305D; 517, 370, 250 &#x306E; 163 kDa &#x8840;&#x6E05;&#x8A66;&#x6599;&#x304B;&#x3089;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x305F; 2 &#x3064;&#x306E;&#x5F62;&#x614B;&#x306E;&#x30A2;&#x30DD;&#x30EA;&#x30DD;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; b-100&#x3001;&#x30D5;&#x30A3;&#x30D6;&#x30ED;&#x30CD;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x3068; A1, &#x514D;&#x75AB;&#x30B0;&#x30ED;&#x30D6;&#x30EA;&#x30F3;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x3002;&#x8CEA;&#x91CF;&#x30A2;&#x30DD;&#x30EA;&#x30DD;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA; b-100 &#x304B;&#x3089;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5; (517 kD) &#x5C0F;&#x3055;&#x306A;&#x3001;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E; O &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x306E;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5BFE;&#x7167;&#x7684;&#x306B;&#x3001;&#x30D5;&#x30A3;&#x30D6;&#x30ED;&#x30CD;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x5C40;&#x5728;&#x89E3;&#x6790; (250 kD) &#x3068;&#x514D;&#x75AB;&#x30B0;&#x30ED;&#x30D6;&#x30EA;&#x30F3; A1 (163 kD) &#x6B63;&#x5E38;&#x306A;&#x8840;&#x6E05;&#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x306B;&#x3042;&#x308B;&#x5BFE;&#x5FDC;&#x3059;&#x308B;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30D0;&#x30F3;&#x30C9;&#x304B;&#x3089;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x7CD6;&#x9396;&#x304B;&#x3089;&#x5341;&#x5206;&#x306B;&#x7570;&#x306A;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x5F62;&#x3067;&#x306E; N &#x578B;&#x7CD6;&#x9396;&#x65AD;&#x7247;&#x304C;&#x751F;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x5358;&#x4E00;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3060;&#x3051;&#x3067;&#x306A;&#x304F;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x7570;&#x5E38;&#x30B0;&#x30EA;&#x30B3;&#x3068;&#x5909;&#x5316;&#x691C;&#x51FA;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3057;&#x3001;&#x6700;&#x7D42;&#x7684;&#x306B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x7CD6;&#x9396;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x7570;&#x5E38;&#x306E;&#x30B5;&#x30FC;&#x30D6;&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x7CD6;&#x9396;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA; &#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3053;&#x3068;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x5375;&#x5DE3;&#x764C;&#x60A3;&#x8005;&#x8840;&#x6E05;&#x4E2D;&#x306E;&#x30B0;&#x30E9;&#x30A4;&#x30B3;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6; &#x30AA;&#x30FC;&#x30E0;&#x89E3;&#x6790;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x7CD6;&#x5909;&#x66F4;&#x500B;&#x3005; &#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3067;&#x8868;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xACE0;&#xAE09; untreatable &#xB2E8;&#xACC4;&#xB85C; &#xC9C4;&#xD589; &#xB420; &#xB54C;&#xAE4C;&#xC9C0; &#xC9C8;&#xBCD1;&#xC758; &#xC99D;&#xC0C1; &#xBC1C;&#xACAC; &#xC790;&#xC8FC; &#xD558;&#xC9C0;&#xB294; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xC5EC;&#xC131;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC9C4;&#xB2E8; &#xD558;&#xAE30; &#xC5B4;&#xB835;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD608; &#xCCAD; &#xAC80;&#xC0AC;, CA125, &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC758; &#xBAA8;&#xB2C8;&#xD130;&#xB9C1;&#xC744; &#xC9C0;&#xC6D0; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xD604;&#xC7AC; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC9C0;&#xB9CC;&#xC774; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xD2B9;&#xC774;&#xC131; &#xBC0F; &#xC870;&#xAE30; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC10;&#xB3C4; &#xACB0;&#xC5EC; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554;&#xC758; &#xB354; &#xB098;&#xC740; biomarkers &#xD544;&#xC694; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2F9;&#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBD84;&#xC11D; &#xC811;&#xADFC; &#xB192;&#xC740; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xD478;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xBCC0;&#xD658; &#xC774;&#xC628; &#xC0AC;&#xC774;&#xD074; &#xB85C;&#xD2B8; &#xB860; &#xACF5;&#xBA85; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC; &#xB77C;&#xC778;&#xC758; &#xBC14;&#xB978;&#xB41C; &#xBBF8;&#xB514;&#xC5B4;&#xC640; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xD658;&#xC790;&#xC640; &#xC77C;&#xBC18; &#xCEE8;&#xD2B8;&#xB864;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC00;&#xC838;&#xC628; &#xC138;&#xB77C; &#xB2F9;&#xD654; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xCC29;&#xC218; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C;&#xB294; &#xB2F9;&#xD654; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC824; &#xC804;&#xAE30; &#xC774;&#xB3D9; &#xBC95;&#xC73C;&#xB85C; &#xBD84;&#xB9AC; &#xD588;&#xB2E4; &#xD558; &#xACE0; &#xAC1C;&#xBCC4; glycoproteins glycosylation &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC120;&#xC815; &#xB410;&#xB2E4;. &#xAC01; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB41C; glycans &#xCD9C;&#xC2DC; &#xB418;&#xC5C8;&#xACE0; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558; &#xC5EC; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC; &#xB77C;&#xC778; &#xC8FC;&#xB85C; O &#xC5F0;&#xACB0; glycans&#xB85C; &#xC774;&#xB8E8;&#xC5B4;&#xC838; &#xACB0;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4; es2&#xC5D0;&#xC11C; Glycosylation mucin &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xACFC; &#xB300;&#xD615; &#xB2F9;&#xD654; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xACA9;&#xB9AC;. 4 &#xB208;&#xC5D0; &#xB744;&#xB294; glycoproteins &#xB300;&#xB7B5; 517, 370, 250, &#xD608; &#xCCAD; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC5D0;&#xC11C; 163 Kda&#xB85C; &#xD655;&#xC778; &#xB41C; &#xB450; &#xD615;&#xD0DC;&#xC758; apolipoprotein B-100, fibronectin, &#xBA74;&#xC5ED; &#xAE00;&#xB85C;&#xBD88;&#xB9B0; a 1, &#xAC01;&#xAC01;. &#xC9C8;&#xB7C9; spectrometric &#xBD84;&#xC11D; apolipoprotein B-100&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD84;&#xB9AC; &#xB41C; glycans&#xC758; (517 kD) &#xC791;&#xC740;, &#xD2B9;&#xC815; O &#xC5F0;&#xACB0; oligosaccharides&#xC758; &#xC874;&#xC7AC;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xBC18;&#xBA74;, fibronectin &#xBD84;&#xC11D; (250 kD) &#xBC0F; &#xBA74;&#xC5ED; &#xAE00;&#xB85C;&#xBD88;&#xB9B0; a 1 (163 kD) &#xCDA9;&#xBD84;&#xD788; &#xC815;&#xC0C1; &#xD608; &#xCCAD; &#xC0D8;&#xD50C;&#xC5D0; &#xD574;&#xB2F9; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBC34;&#xB4DC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5BB;&#xC740; glycans&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xB978; &#xD615;&#xD0DC;&#xC758; glycan N &#xC5F0;&#xACB0; &#xC870;&#xAC01;&#xC744; &#xC0DD;&#xC131; &#xD55C;&#xB2E4;&#xB294; &#xC0AC;&#xC2E4;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xBFD0;&#xB9CC; &#xC544;&#xB2C8;&#xB77C; &#xB2E8;&#xC77C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0;&#xB294; aberrantly &#xB2F9;&#xD654;, &#xBCC0;&#xD654;&#xC640; &#xAC10;&#xC9C0;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xAD81;&#xADF9;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xADF8; &#xBE44;&#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; glycosylation &#xC5ED;&#xD560; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xBC14;&#xC774;&#xC624; &#xB9C8;&#xCEE4;&#xC758; glycan &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC; &#xB77C;&#xC778;&#xACFC; &#xC138;&#xB77C; &#xB09C;&#xC18C; &#xC554; &#xD658;&#xC790;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; Glycoproteomic &#xBD84;&#xC11D; &#xAC1C;&#xBCC4; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xACE0;&#xC720; glycosylation &#xBCC0;&#xD654;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

C&aacute;ncer de ovario es dif&iacute;cil de diagnosticar en las mujeres debido a los s&iacute;ntomas de la enfermedad a menudo no se notan hasta que la enfermedad ha avanzado a una etapa avanzada de intratable. Aunque un examen del suero, CA125, est&aacute; actualmente disponible para ayudar a supervisar el tratamiento del c&aacute;ncer de ovario, esta prueba carece de la necesaria especificidad y sensibilidad para la detecci&oacute;n temprana. Por lo tanto, se necesitan mejores biomarcadores del c&aacute;ncer de ovario. Un enfoque de an&aacute;lisis de glicoprote&iacute;na se llev&oacute; a cabo con alta resoluci&oacute;n de Fourier spectrometry total de ion ciclotr&oacute;n resonancia analizar prote&iacute;nas glicosiladas presentes en los medios de comunicaci&oacute;n condicionada de l&iacute;neas celulares de c&aacute;ncer de ovario y en los sueros obtenidos de pacientes de c&aacute;ncer de ovario y controles normales. En este estudio, prote&iacute;nas glicosiladas se separaron por electroforesis en gel y glicoprote&iacute;nas individuales fueron seleccionados para la identificaci&oacute;n de an&aacute;lisis y prote&iacute;na de glicosilaci&oacute;n. Los glicanos adjuntos de cada prote&iacute;na fueron liberados y perfilados por espectrometr&iacute;a de masas. Glicosilaci&oacute;n de una prote&iacute;na de la mucina y una prote&iacute;na glicosilada grande aislado de la l&iacute;nea celular de c&aacute;ncer de ovario se determin&oacute; que consisten mayormente vinculados O glycans de ES2. Cuatro prominentes glicoprote&iacute;nas de 517 aproximado, 370, 250, 163 kDa de muestras de suero fueron identificados como dos formas de apolipoprote&iacute;na B-100, fibronectina e inmunoglobulina A1, respectivamente. Masa an&aacute;lisis espectrom&eacute;trico de glicanos aislado de apolipoprote&iacute;na B-100 (517 kD) demostr&oacute; la presencia de oligosac&aacute;ridos espec&iacute;ficos, peque&ntilde;os O vinculados. En contraste, an&aacute;lisis de fibronectina (250 kD) y de la inmunoglobulina A1 (163 kD) produce fragmentos N-ligado glicanos en formas que eran suficientemente diferentes de los glicanos de la correspondiente banda de prote&iacute;na presente en las muestras de suero normal. Este estudio demuestra que no s&oacute;lo una sola prote&iacute;na, pero varios son aberrantemente glucosilada, y &eacute;sos glicosilaci&oacute;n anormales cambios pueden detectarse y pueden en &uacute;ltima instancia sirven de glicanos biomarcadores para c&aacute;ncer de ovario.

Glycoproteomic an&aacute;lisis de l&iacute;neas celulares de c&aacute;ncer de ovario y sueros de pacientes de c&aacute;ncer de ovario muestran glicosilaci&oacute;n distintos cambios en las prote&iacute;nas individuales.

&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x6F84;&#x6E05;&#x4ECD;&#x7136;&#x662F;&#x4E00;&#x9879;&#x91CD;&#x5927;&#x6311;&#x6218;&#x3002;&#x8D28;&#x8C31;&#x63D0;&#x4F9B;&#x5FEB;&#x901F;&#x548C;&#x65B9;&#x4FBF;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x7ED3;&#x6784;&#x6F84;&#x6E05;&#x4E32;&#x8054;&#x8D28;&#x8C31;&#x7684;&#x57FA;&#x7840;&#x4E0A;&#x3002;&#x79BB;&#x5B50;&#x662F;&#x901A;&#x5E38;&#x9009;&#x62E9;&#x548C;&#x906D;&#x53D7;&#x78B0;&#x649E;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x89E3;&#x79BB; (CID) &#x83B7;&#x5F97;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x4FE1;&#x606F;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;CID &#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7F3A;&#x70B9;&#x662F;&#x4E0B;&#x964D;&#x7684;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x548C;&#x6548;&#x7387;&#x7684;&#x63D0;&#x9AD8;&#x8D28;&#x91CF;&#x4E0E;&#x89E3;&#x79BB;&#x3002;&#x5728;&#x672C;&#x7AE0;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8BF4;&#x660E;&#x4E86;&#x4F7F;&#x7528;&#x7684;&#x7EA2;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x79BB; (IRMPD)&#xFF0C;&#x4EE5;&#x83B7;&#x53D6;&#x4E3A; O &#x548C; N-&#x4E59;&#x9170;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x4FE1;&#x606F;&#x3002;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684; IRMPD &#x548C; CID &#x884C;&#x4E3A;&#x8FDB;&#x884C;&#x6BD4;&#x8F83;&#x3002;

&#x7EA2;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x79BB;&#x8D28;&#x8C31;&#x7684;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x9610;&#x91CA;&#x3002;

The structural elucidation of oligosaccharides remains a major challenge. Mass spectrometry provides a rapid and convenient method for structural elucidation on the basis of tandem mass spectrometry. Ions are commonly selected and subjected to collision-induced dissociation (CID) to obtain structural information. However, a disadvantage of CID is the decrease in both the degree and efficiency of dissociation with increasing mass. In this chapter, we illustrate the use of infrared multiphoton dissociation (IRMPD) to obtain structural information for O- and N-linked oligosaccharides. The IRMPD and CID behaviors of oligosaccharides are compared.

Infrared multiphoton dissociation mass spectrometry for structural elucidation of oligosaccharides.

L&#39;&eacute;lucidation de la structure d&#39;oligosaccharides demeure un d&eacute;fi majeur. Spectrom&eacute;trie de masse fournit une m&eacute;thode rapide et pratique pour l&#39;&eacute;lucidation de la structure sur la base de la spectrom&eacute;trie de masse. Ions sont couramment s&eacute;lectionn&eacute;es et soumises &agrave; une dissociation induite par collision (CID) pour obtenir des informations structurales. Cependant, un inconv&eacute;nient du CID est la diminution dans le degr&eacute; et l&#39;efficacit&eacute; de la dissociation avec l&#39;augmentation de masse. Dans ce chapitre, nous illustrons l&#39;usage de dissociation multiphotonique infrarouge (DMPIR) pour obtenir des informations structurales des oligosaccharides O - et N-li&eacute;s. On a compar&eacute; les comportements DMPIR et CID d&#39;oligosaccharides.

Spectrom&eacute;trie de masse de dissociation multiphotonique infrarouge pour l&#39;&eacute;lucidation de la structure d&#39;oligosaccharides.

Die strukturelle Aufkl&auml;rung der Oligosaccharide bleibt eine gro&szlig;e Herausforderung. Massenspektrometrie bietet eine schnelle und bequeme Methode f&uuml;r strukturelle Aufkl&auml;rung auf der Grundlage der Tandem-Massenspektrometrie. Ionen sind h&auml;ufig ausgew&auml;hlt und ausgesetzt induziert durch Kollision Dissoziation (CID), strukturelle Informationen zu erhalten. Ein Nachteil der CID ist jedoch der R&uuml;ckgang sowohl der Grad und die Effizienz der Dissoziation mit zunehmender Masse. In diesem Kapitel zeigen wir den Einsatz von Infrarot multiphoton Dissoziation (IRMPD) strukturellen Informationen f&uuml;r O und N gebundene Oligosaccharide zu. Die IRMPD und CID Verhaltensweisen der Oligosaccharide werden verglichen.

Infrarot multiphoton Dissoziation Massenspektrometrie f&uuml;r strukturelle Aufkl&auml;rung der Oligosaccharide.

La delucidazione strutturale degli oligosaccaridi rimane una sfida importante. Spettrometria di massa fornisce un metodo rapido e conveniente per la delucidazione strutturale sulla base della spettrometria di massa tandem. Gli ioni sono comunemente selezionati e sottoposti a dissociazione indotta da collisione (CID) per ottenere informazioni strutturali. Tuttavia, uno svantaggio del CID &egrave; la diminuzione in entrambi i gradi e l&#39;efficienza della dissociazione con l&#39;aumento di massa. In questo capitolo, abbiamo illustrato l&#39;utilizzo della dissociazione infrarossa multifotonica (IRMPD) per ottenere informazioni strutturali per O - e N-linked oligosaccaridi. Vengono confrontati i comportamenti IRMPD e CID di oligosaccaridi.

Spettrometria di massa di dissociazione infrarossa multifotonica per delucidazione strutturale degli oligosaccaridi.

&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x89E3;&#x660E;&#x4E3B;&#x8981;&#x8AB2;&#x984C;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x304F;&#x69CB;&#x9020;&#x89E3;&#x660E;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x8FC5;&#x901F;&#x3067;&#x7C21;&#x4FBF;&#x306A;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x3088;&#x304F;&#x9078;&#x3070;&#x308C;&#x3001;&#x885D;&#x7A81;&#x8A98;&#x8D77;&#x89E3;&#x96E2; (CID) &#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x60C5;&#x5831;&#x3092;&#x53D6;&#x5F97;&#x3059;&#x308B;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305F;&#x3060;&#x3057;&#x3001;CID &#x306E;&#x6B20;&#x70B9;&#x306E;&#x7A0B;&#x5EA6;&#x3068;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5897;&#x52A0;&#x3068;&#x89E3;&#x96E2;&#x306E;&#x52B9;&#x7387;&#x4F4E;&#x4E0B;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x7AE0;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x8D64;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x96E2; (O &#x30FB; N &#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x60C5;&#x5831;&#x3092;&#x53D6;&#x5F97;&#x3059;&#x308B; IRMPD) &#x306E;&#x4F7F;&#x7528;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E; IRMPD &#x3068; CID &#x306E;&#x52D5;&#x4F5C;&#x3068;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x8D64;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x96E2;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x89E3;&#x660E;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

Oligosaccharides&#xC758; &#xAD6C;&#xC870; &#xD574;&#xBA85; &#xC8FC;&#xC694; &#xB3C4;&#xC804; &#xB0A8;&#xC544; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; &#xD0E0;&#xB364; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xADFC;&#xAC70; &#xD558; &#xC5EC; &#xAD6C;&#xC870; &#xD574;&#xBA85;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC2E0;&#xC18D; &#xD558; &#xACE0; &#xD3B8;&#xB9AC;&#xD55C; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC774;&#xC628; &#xC120;&#xD0DD; &#xB418; &#xACE0; &#xCDA9;&#xB3CC;&#xC744; &#xC774;&#xC6A9;&#xD55C; &#xBD84;&#xB9AC; &#xAD6C;&#xC870; &#xC815;&#xBCF4; (CID) &#xB300;&#xC0C1;&#xC774;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, CID&#xC758; &#xB2E8;&#xC810;&#xC740; &#xC815;&#xB3C4; &#xC9C8;&#xB7C9;&#xC744; &#xC99D;&#xAC00; &#xD568;&#xAED8; &#xBD84;&#xB9AC; &#xD6A8;&#xC728;&#xC5D0; &#xAC10;&#xC18C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC7A5;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC801;&#xC678;&#xC120; multiphoton &#xBD84;&#xB9AC; (IRMPD) oligosaccharides O N &#xC5F0;&#xACB0;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAD6C;&#xC870; &#xC815;&#xBCF4;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. Oligosaccharides IRMPD &#xBC0F; CID &#xB3D9;&#xC791; &#xBE44;&#xAD50; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC801;&#xC678;&#xC120; multiphoton &#xBD84;&#xB9AC; oligosaccharides&#xC758; &#xAD6C;&#xC870; &#xD574;&#xBA85;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;.

La elucidaci&oacute;n estructural de oligosac&aacute;ridos sigue siendo un desaf&iacute;o importante. Espectrometr&iacute;a de masas proporciona un m&eacute;todo r&aacute;pido y conveniente para la elucidaci&oacute;n estructural sobre la base de espectrometr&iacute;a de masas en t&aacute;ndem. Los iones son com&uacute;nmente seleccionados y sometidos a la disociaci&oacute;n inducida por colisi&oacute;n (CID) para obtener informaci&oacute;n estructural. Sin embargo, una desventaja del CID es la disminuci&oacute;n en el grado y la eficiencia de la disociaci&oacute;n con el aumento de la masa. En este cap&iacute;tulo, nos ilustran el uso de infrarrojo multifot&oacute;n disociaci&oacute;n (IRMPD) para obtener informaci&oacute;n estructural de oligosac&aacute;ridos O - y N-ligado. Se comparan los comportamientos IRMPD y CID de oligosac&aacute;ridos.

Espectrometr&iacute;a de infrarrojo disociaci&oacute;n multifot&oacute;n para elucidaci&oacute;n estructural de oligosac&aacute;ridos.

&#x7CD6;&#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x7ED3;&#x6784;&#x6F84;&#x6E05;&#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x91CD;&#x5927;&#x7684;&#x6311;&#x6218;&#x3002;&#x4E32;&#x8054;&#x8D28;&#x8C31;&#x76EE;&#x524D;&#x662F;&#x4E00;&#x79CD;&#x9AD8;&#x6548;&#x3001; &#x529F;&#x80FD;&#x5F3A;&#x5927;&#x7684;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x8868;&#x5F81;&#x6280;&#x672F;&#x3002;&#x78B0;&#x649E;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x89E3;&#x79BB; (CID) &#x6700;&#x5E38;&#x7528;&#xFF0C;&#x548C;&#x6D89;&#x53CA;&#x9996;&#x5148;&#x9694;&#x79BB;&#x611F;&#x5174;&#x8DA3;&#x7684;&#x7CD6;&#x79BB;&#x5B50;&#x3001; &#x7FFB;&#x8BD1;&#x7684;&#x523A;&#x6FC0;&#xFF0C;&#x628A;&#xFF0C;&#x7136;&#x540E;&#x4E0E;&#x60F0;&#x6027;&#x76EE;&#x6807;&#x6C14;&#x4F53;&#x4EE5;&#x7247;&#x6BB5;&#x7684;&#x524D;&#x4F53;&#x79BB;&#x5B50;&#x51B2;&#x51FB;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x3002;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x4FE1;&#x606F;&#x53EF;&#x4EE5;&#x7D22;&#x53D6;&#x7684;&#x4E32;&#x8054;&#x8D28;&#x8C31;&#x5149;&#x8C31;&#x7684;&#x7247;&#x6BB5;&#x79BB;&#x5B50;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x4E00;&#x7AE0;&#xFF0C;&#x6301;&#x7EED;&#x7684;&#x975E;&#x5171;&#x632F;&#x8F90;&#x5C04;-&#x78B0;&#x649E;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x89E3;&#x79BB; (&#x8568;&#x7C7B; CID) &#x5B9E;&#x65BD;&#x4E0E;&#x57FA;&#x8D28;&#x8F85;&#x52A9;&#x6FC0;&#x5149;&#x89E3;&#x5438;/&#x7535;&#x79BB;&#x8D28;&#x8C31;&#x6CD5; (&#x9A6C;&#x5C14;&#x8FEA; FT ICR MS) &#x8BC1;&#x660E;&#x662F;&#x6709;&#x7528;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x5DE5;&#x5177;&#x7ED3;&#x6784;&#x6F84;&#x6E05;&#x7684;&#x9ECF;&#x86CB;&#x767D;&#x7C7B;&#x578B; O &#x7CD6;&#x4ECE;&#x9ECF;&#x86CB;&#x767D;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x91CA;&#x653E;&#x7684;&#x5085;&#x91CC;&#x53F6;&#x53D8;&#x6362;&#x79BB;&#x5B50;&#x56DE;&#x65CB;&#x5171;&#x632F;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#x8BA8;&#x8BBA;&#x4E86;&#x5176;&#x4E2D;&#x7CD6;&#x7ECF;&#x8FC7;&#x4E32;&#x8054;&#x5927;&#x89C4;&#x6A21;&#x5206;&#x6790;&#x4E2D;&#x7684;&#x788E;&#x88C2;&#x7684;&#x673A;&#x5236;&#x3002;

&#x78B0;&#x649E;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x89E3;&#x79BB;&#x8D28;&#x8C31;&#x7684;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x9610;&#x91CA;&#x3002;

The complexity of glycans poses a major challenge for structure elucidation. Tandem mass spectrometry is currently an efficient and powerful technique for the structural characterization of glycans. Collision-induced dissociation (CID) is most commonly used, and involves first isolating the glycan ions of interest, translationally exciting them, and then striking them with inert target gas to fragment the precursor ions. The structural information of the glycan can be obtained from the fragment ions of the tandem MS spectra. In this chapter, sustained off-resonance irradiation-collision-induced dissociation (SORI-CID) implemented with matrix-assisted laser desorption/ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry (MALDI FT ICR MS) is demonstrated to be a useful analysis tool for structural elucidation of mucin-type O-glycans released from mucin glycoproteins. The mechanisms by which the glycans undergo fragmentations in the tandem mass analysis are also discussed.

Collision-induced dissociation tandem mass spectrometry for structural elucidation of glycans.

La complexit&eacute; des glycanes repr&eacute;sente un d&eacute;fi majeur pour l&#39;&eacute;lucidation de la structure. Spectrom&eacute;trie de masse est actuellement une technique efficace et puissante pour la caract&eacute;risation des glycanes. Dissociation induite par collision (CID) est plus couramment utilis&eacute;e et implique tout d&#39;abord isoler les ions glycane d&#39;int&eacute;r&ecirc;t, translationnelle excitant eux et puis les frappant avec des gaz inertes cible &agrave; fragmenter les ions pr&eacute;curseurs. L&#39;information structurelle de la fraction glycane peut &ecirc;tre obtenue dans les ions fragments des spectres MS en tandem. Dans ce chapitre, maintenue hors-r&eacute;sonance dissociation induite par l&#39;irradiation-collision (SORI-CID) mis en &oelig;uvre avec laser assist&eacute;e par matrice d&eacute;sorption-ionisation Fourier transform ion cyclotron resonance spectrom&eacute;trie de masse (MALDI FT ICR MS) est d&eacute;montr&eacute;e pour &ecirc;tre un outil d&#39;analyse utile pour l&#39;&eacute;lucidation de la structure de type mucine O-glycanes, lib&eacute;r&eacute; des glycoprot&eacute;ines de la mucine. On discute aussi les m&eacute;canismes par lesquels les glycanes subissent une fragmentation dans l&#39;analyse de masse en tandem.

Dissociation induite par collision spectrom&eacute;trie de masse pour l&#39;&eacute;lucidation de la structure des glycanes.

Die Komplexit&auml;t der Glykane stellt eine gro&szlig;e Herausforderung f&uuml;r die Aufkl&auml;rung der Struktur. Tandem-Massenspektrometrie ist derzeit eine effiziente und leistungsstarke Technik f&uuml;r die strukturelle Charakterisierung der Glykane. Kollision-induzierte Dissoziation (CID) wird am h&auml;ufigsten verwendet und umfasst zun&auml;chst isolieren die Glykan-Ionen von Interesse, translationally ihnen spannende und dann schlagen sie mit inerten Ziel Gas zu die Vorl&auml;ufer-Ionen fragment. Die Strukturinformationen &uuml;ber die Glykan erhalten Sie bei der Fragment-Ionen von der Tandem-MS-Spektren. In diesem Kapitel aufrechterhalten-Resonanz-Bestrahlung-Kollision-induzierte Dissoziation (SORI-CID) mit Matrix-unterst&uuml;tzte Laser-Desorption/Ionisation-Fourier Transform Ion Cyclotron Resonanz, die Massenspektrometrie (MALDI FT-ICR MS) nachgewiesen wird, um eine n&uuml;tzliche Analyse-Tool f&uuml;r strukturelle Aufkl&auml;rung der Mucin-Typ O-Glykanen Mucin Glykoproteine entbunden werden umgesetzt. Die Mechanismen, mit denen die Glykane Dreiklangszerlegungen in der Tandem-Massen-Analyse unterzogen, werden ebenfalls behandelt.

Kollision-induzierte Dissoziation Tandem-Massenspektrometrie f&uuml;r strukturelle Aufkl&auml;rung der Glykane.

La complessit&agrave; dei glicani pone una grande sfida per la delucidazione. Spettrometria di massa tandem &egrave; attualmente una tecnica efficace e potente per la caratterizzazione strutturale dei glicani. Dissociazione indotta da collisione (CID) &egrave; pi&ugrave; comunemente usato e coinvolge in primo luogo isolare gli ioni glycan di interesse translationally eccitante li e poi li colpisce con gas inerte bersaglio per gli ioni precursore del frammento. Le informazioni strutturali della glycan possono essere ottenute dagli ioni frammento degli spettri MS tandem. In questo capitolo, subito fuori risonanza indotta da irradiazione-collisione dissociazione (SORI-CID) implementato con matrix-assisted laser desorption/ionizzazione risonanza Fourier transform ionica ciclotronica spettrometria di massa (MALDI FT ICR MS) dimostra di essere uno strumento di analisi utile per delucidazione strutturale della mucina-tipo O-glicani rilasciato da glicoproteine di mucina. Sono stati anche discussi i meccanismi con cui i glicani sottoporsi a frammentazione nell&#39;analisi di massa tandem.

Dissociazione indotta da collisione tandem mass spectrometry per delucidazione strutturale dei glicani.

&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x89E3;&#x660E;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x8AB2;&#x984C;&#x3092;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BA;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;&#x306F;&#x3001;&#x73FE;&#x5728;&#x3001;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x30AD;&#x30E3;&#x30E9;&#x30AF;&#x30BF;&#x30EA;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306E;&#x52B9;&#x7387;&#x7684;&#x3067;&#x5F37;&#x529B;&#x306A;&#x624B;&#x6CD5;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x885D;&#x7A81;&#x8A98;&#x8D77;&#x89E3;&#x96E2; (CID) &#x6700;&#x3082;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3001;&#x6700;&#x521D;&#x306E;&#x95A2;&#x5FC3;&#x306E;&#x7CD6;&#x9396;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x3092;&#x5206;&#x96E2;&#x3059;&#x308B;, &#x4E26;&#x9032;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306F;&#x3001;&#x30A8;&#x30AD;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C6;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x306A;&#x3068;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x524D;&#x99C6;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x3092;&#x30D5;&#x30E9;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306B;&#x4E0D;&#x6D3B;&#x6027;&#x5BFE;&#x8C61;&#x30AC;&#x30B9;&#x3067;&#x5370;&#x8C61;&#x7684;&#x306A;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0; MS &#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x30D5;&#x30E9;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8; &#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x3001;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x60C5;&#x5831;&#x3092;&#x53D6;&#x5F97;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x7AE0;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30DE;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x652F;&#x63F4;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B6;&#x30FC;&#x8131;&#x96E2;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3;&#x5316;&#x30D5;&#x30FC;&#x30EA;&#x30A8;&#x5909;&#x63DB;&#x30A4;&#x30AA;&#x30F3; &#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30C8;&#x30ED;&#x30F3;&#x5171;&#x9CF4;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790; &#xFF08;MALDI FT-ICR MS) &#x30E0;&#x30C1;&#x30F3;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x304B;&#x3089;&#x30EA;&#x30EA;&#x30FC;&#x30B9; &#x30E0;&#x30C1;&#x30F3;&#x578B; O &#x578B;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x89E3;&#x660E;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6709;&#x7528;&#x306A;&#x5206;&#x6790;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x3068;&#x5171;&#x306B;&#x5B9F;&#x88C5;&#x5171;&#x9CF4;&#x30AA;&#x30D5;&#x7167;&#x5C04;&#x8A98;&#x8D77;&#x885D;&#x7A81;&#x89E3;&#x96E2; &#xFF08;&#x66FD;&#x5229; CID&#xFF09; &#x6301;&#x7D9A;&#x3002;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x50FB;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x7CD6;&#x9396;&#x3092;&#x53D7;&#x3051;&#x308B;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x3082;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x885D;&#x7A81;&#x8A98;&#x8D77;&#x89E3;&#x96E2;&#x7CD6;&#x9396;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x89E3;&#x660E;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E0;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5;

Glycans&#xC758; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xAD6C;&#xC870; &#xD574;&#xBA85;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD070; &#xB3C4;&#xC804; &#xD3EC;&#xC988;. &#xD150; &#xB364; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC740; &#xD604;&#xC7AC; glycans&#xC758; &#xAD6C;&#xC870;&#xC801; &#xD2B9;&#xC131; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xD6A8;&#xC728;&#xC801;&#xC774; &#xACE0; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xAE30;&#xC220;. &#xCDA9;&#xB3CC;&#xC744; &#xC774;&#xC6A9;&#xD55C; &#xBD84;&#xB9AC; (CID) &#xAC00;&#xC7A5; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xACE0; &#xBA3C;&#xC800; &#xAD00;&#xC2EC; glycan &#xC774;&#xC628;&#xC744; &#xBD84;&#xB9AC; &#xD558; &#xACE0; translationally, &#xD765;&#xBBF8; &#xC9C4; &#xC9C4;&#xD55C; &#xB2E4;&#xC74C; &#xC804;&#xC870; &#xC774;&#xC628; &#xC870;&#xAC01; &#xB300;&#xC0C1; &#xBD88;&#xD65C;&#xC131; &#xAC00;&#xC2A4;&#xB85C; &#xC0BC;&#xC9C4;. &#xD0E0;&#xB364; MS &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC;&#xC758; &#xC870;&#xAC01; &#xC774;&#xC628;&#xC5D0;&#xC11C;&#xB294; glycan &#xAD6C;&#xC870; &#xC815;&#xBCF4;&#xB97C; &#xC5BB;&#xC744; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC7A5;&#xC5D0;&#xC11C;-&#xACF5;&#xBA85; &#xBC29;&#xC0AC;&#xC120; &#xCDA9;&#xB3CC; &#xC720;&#xBC1C; &#xBD84;&#xB9AC; (&#xC18C;&#xB9AC;-CID) &#xB9E4;&#xD2B8;&#xB9AD;&#xC2A4; &#xBCF4;&#xC870; &#xB808;&#xC774;&#xC800; &#xD0C8; &#xCC29;/&#xC774;&#xC628;&#xD654; &#xD478;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xBCC0;&#xD658; &#xC774;&#xC628; &#xC0AC;&#xC774;&#xD074; &#xB85C;&#xD2B8; &#xB860; &#xACF5;&#xBA85; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; (MS ICR MALDI FT) mucin &#xD615; &#xC624; glycans mucin glycoproteins&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xD45C;&#xC758; &#xAD6C;&#xC870; &#xD574;&#xBA85;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC720;&#xC6A9;&#xD55C; &#xBD84;&#xC11D; &#xB3C4;&#xAD6C; &#xC124;&#xBA85; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xAD6C;&#xD604; &#xC9C0;&#xC18D;. Glycans &#xBC1B;&#xC744; fragmentations &#xD0E0;&#xB364; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Glycans&#xC758; &#xAD6C;&#xC870; &#xD574;&#xBA85;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xCDA9;&#xB3CC;&#xC744; &#xC774;&#xC6A9;&#xD55C; &#xBD84;&#xB9AC; &#xD0E0;&#xB364; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D;.

La complejidad de glicanos plantea un gran desaf&iacute;o para la elucidaci&oacute;n de la estructura. Espectrometr&iacute;a de masa en t&aacute;ndem es actualmente una t&eacute;cnica eficiente y potente para la caracterizaci&oacute;n estructural de glicanos. Disociaci&oacute;n inducida por colisi&oacute;n (CID) es m&aacute;s com&uacute;nmente utilizada e implica aislar primero los iones de glicanos de inter&eacute;s, forma emocionante les y luego golpearlas con gas inerte destino a fragmentar los iones del precursor. La informaci&oacute;n estructural de los glicanos puede obtenerse de los iones del fragmento de los espectros de MS de t&aacute;ndem. En este cap&iacute;tulo, sostenido de resonancia inducida por irradiaci&oacute;n-colisi&oacute;n disociaci&oacute;n (SORI-CID) implementada con l&aacute;ser asistida por matriz desorci&oacute;n/ionizaci&oacute;n resonancia de ciclotr&oacute;n Fourier transform ion espectrometr&iacute;a de masas (MALDI FT ICR MS) se demuestra ser una herramienta de an&aacute;lisis &uacute;til para elucidaci&oacute;n estructural de tipo mucina O-glicanos liberados de glicoprote&iacute;nas de mucina. Tambi&eacute;n se discuten los mecanismos por los cuales los glicanos sufren fragmentaciones en el an&aacute;lisis de la masa de t&aacute;ndem.

Espectrometr&iacute;a de t&aacute;ndem disociaci&oacute;n inducida por colisi&oacute;n para elucidaci&oacute;n estructural de glicanos.

&#x764C;&#x75C7;&#x6709;&#x6DF1;&#x8FDC;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#xFF0C;&#x5BF9;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x673A;&#x5236;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x80BF;&#x7624;&#x4EA7;&#x751F;&#x6267;&#x884C;&#x7ED3;&#x6784;&#x660E;&#x663E;&#x4E0D;&#x540C;&#x4E8E;&#x6B63;&#x5E38;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4EA7;&#x751F;&#x76F8;&#x540C;&#x86CB;&#x767D;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x3002;&#x4E00;&#x79CD;&#x5355;&#x4E00;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x53EF;&#x4EE5;&#x6709;&#x8BB8;&#x591A;&#x6781;&#x5927;&#x5730;&#x653E;&#x5927;&#x5B83;&#x4EEC;&#x751F;&#x6210;&#x7684;&#x4FE1;&#x53F7;&#x76F8;&#x6BD4;&#x5176;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x9AA8;&#x5E72;&#x7684;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x7AD9;&#x70B9;&#x3002;

&#x8131;&#x81ED;&#x9505;&#xFF1A; &#x6DFB;&#x52A0;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x53D1;&#x73B0;&#x65B9;&#x7A0B;&#x3002;

Cancer has profound effects on gene expression, including a cell's glycosylation machinery. Thus, tumors produce glycoproteins that carry oligosaccharides with structures that are markedly different from the same protein produced by a normal cell. A single protein can have many glycosylation sites that greatly amplify the signals they generate compared with their protein backbones.

Sweetening the pot: adding glycosylation to the biomarker discovery equation.

Le cancer a des effets profonds sur l&#x26;#39;expression g&#xE9;nique, y compris les machines de glycosylation d&#x26;#39;une cellule. Ainsi, les tumeurs produisent des glycoprot&#xE9;ines qui transportent des oligosaccharides avec des structures qui sont nettement diff&#xE9;rentes de la m&#xEA;me prot&#xE9;ine produite par une cellule normale. Une seule prot&#xE9;ine peut avoir plusieurs sites de glycosylation qui a grandement amplifier les signaux qu&#x26;#39;ils g&#xE9;n&#xE8;rent par rapport &#xE0; leurs squelettes prot&#xE9;iques.

Adoucir le Pot: Ajout glycosylation &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;quation D&#xE9;couverte de biomarqueurs

Krebs hat tiefgreifende Auswirkungen auf die Genexpression, einschlie&szlig;lich einer Zelle Glycosylation Maschinen. Daher produzieren Tumoren Glykoproteine, die Oligosaccharide mit Strukturen tragen, die wesentlich von der gleichen Protein von einer normalen Zelle produziert werden. Ein einziges Protein kann viele Glycosylation Websites haben, die erheblich die Signale, die sie erzeugen verst&auml;rken, verglichen mit ihren Protein-Backbones.

S&uuml;&szlig;ung Pot: die Biomarker-Entdeckung-Gleichung Glycosylation hinzuf&uuml;gen.

Il cancro ha effetti profondi sulla espressione genica, compresi macchinari di glicosilazione di una cella. Cos&igrave;, i tumori producono glicoproteine che trasportano gli oligosaccaridi con strutture che sono notevolmente diverse dalla stessa proteina prodotta da una cellula normale. Una singola proteina pu&ograve; avere molti siti di glicosilazione che notevolmente amplificano i segnali che generano confrontati con loro dorsali della proteina.

Addolcire la pentola: aggiunta di glicosilazione dell&#39;equazione di scoperta del biomarker.

&#x304C;&#x3093;&#x306F;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x30B0;&#x30EA;&#x30B3;&#x30B7;&#x30EB;&#x5316;&#x6A5F;&#x68B0;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306B;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x304C;&#x6B63;&#x5E38;&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x751F;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x540C;&#x3058;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x304B;&#x3089;&#x8457;&#x3057;&#x304F;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x30AA;&#x30EA;&#x30B4;&#x7CD6;&#x3092;&#x904B;&#x3076;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5358;&#x4E00;&#x306E;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x304C;&#x5927;&#x5E45;&#x306B;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x9AA8;&#x683C;&#x3068;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x3066;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x304C;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x4FE1;&#x53F7;&#x3092;&#x5897;&#x5E45;&#x3059;&#x308B;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x30B0;&#x30EA;&#x30B3;&#x30B7;&#x30EB;&#x5316;&#x90E8;&#x4F4D;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x7518;&#x5473;&#x6599;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C8;&#xFF1A;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x63A2;&#x7D22;&#x65B9;&#x7A0B;&#x5F0F;&#x306B;&#x30B0;&#x30EA;&#x30B3;&#x30B7;&#x30EB;&#x5316;&#x3092;&#x8FFD;&#x52A0;&#x3059;&#x308B;

&#xC554; &#xC140;&#xC758; glycosylation &#xAE30;&#xACC4;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC5D0; &#xC9C0;&#xB300;&#xD55C; &#xD6A8;&#xACFC;&#xAC00; &#xC788;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xC885;&#xC591; oligosaccharides &#xD604;&#xC800; &#xD558; &#xAC8C; &#xB2E4;&#xB978; &#xC815;&#xC0C1; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC0DD;&#xC0B0; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xC804;&#xB2EC; &#xD558;&#xB294; glycoproteins&#xB97C; &#xC0DD;&#xC131; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2E8;&#xC77C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xBC31;&#xBCF8;&#xC5D0; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC5D0; &#xBE44;&#xD574; &#xC0DD;&#xC131; &#xC2E0;&#xD638;&#xB97C; &#xD06C;&#xAC8C; &#xC99D;&#xD3ED; &#xB9CE;&#xC740; glycosylation &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xB97C; &#xAC00;&#xC9C8; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xB0C4;&#xBE44; &#xAC10;&#xBBF8;&#xB8CC;: glycosylation biomarker &#xAC80;&#xC0C9; &#xBC29;&#xC815;&#xC2DD;&#xC5D0; &#xCD94;&#xAC00; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

El c&#xE1;ncer tiene profundos efectos en la expresi&#xF3;n de genes, incluida la maquinaria de glicosilaci&#xF3;n de una c&#xE9;lula. Por lo tanto, los tumores producen glicoprote&#xED;nas que llevan oligosac&#xE1;ridos con estructuras que son muy diferentes de la misma prote&#xED;na producida por una c&#xE9;lula normal. Una sola prote&#xED;na puede tener muchos sitios de glicosilaci&#xF3;n que grandemente amplificar las se&#xF1;ales que generan en comparaci&#xF3;n con espinas dorsales de sus prote&#xED;nas.

La edulcoraci&#xF3;n de la mezcla: Adici&#xF3;n de glucosilaci&#xF3;n de la ecuaci&#xF3;n de descubrimiento de biomarcadores

&#x7CD6;&#x662F;&#x5728;&#x53D1;&#x80B2;&#x671F;&#x95F4;&#x8C03;&#x5236;&#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7C7B;&#x578B;&#x7279;&#x5B9A;&#x3001; &#x7FFB;&#x8BD1;&#x540E;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4FEE;&#x6539;&#x548C;&#x75BE;&#x75C5;&#x8FDB;&#x7A0B;&#x3002;&#x4E3A;&#x6B64;&#xFF0C;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x662F;&#x6709;&#x5438;&#x5F15;&#x529B;&#x7684;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x5019;&#x9009;&#x4EBA;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5C06;&#x4ECB;&#x7ECD;&#x7EB3;&#x5165;&#x4E86;&#x51DD;&#x96C6;&#x7D20;&#x4EB2;&#x548C;&#x5C42;&#x6790;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x6267;&#x884C;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x7CD6;&#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E30;&#x5BCC;&#x7684;&#x5927;&#x89C4;&#x6A21;&#x57FA;&#x4E8E;&#x5149;&#x8C31;&#x6CD5;&#x7684;&#x5DE5;&#x4F5C;&#x6D41;&#x3002;&#x5982;&#x589E;&#x52A0;&#x800C;&#x4E14;&#x548C; fucosylation &#x90FD;&#x662F;&#x660E;&#x663E;&#x7684;&#x764C;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x4FEE;&#x6539;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x91CD;&#x70B9;&#x63A5;&#x9AA8;&#x9ED1;&#x8D28;&#x51DD;&#x96C6;&#x7D20; &#xFF08;SNA&#xFF09; &#x548C; Aleuria aurantia &#x51DD;&#x96C6;&#x7D20; (AAL) &#x5206;&#x522B;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x542B;&#x6709;&#x553E;&#x6DB2;&#x9178;&#x548C;&#x5CA9;&#x85FB;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x7684;&#x51DD;&#x96C6;&#x7D20;&#x3002;Fucosylated &#x548C; sialylated &#x4ECE;&#x4EBA;&#x4E73;&#x94C1;&#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x7CD6;&#x80BD;&#x62C5;&#x4EFB;&#x79EF;&#x6781;&#x7684;&#x63A7;&#x5236;&#x548C;&#x9AD8;&#x7518;&#x9732;&#x7CD6;&#x7ED3;&#x6784;&#x4ECE;&#x9175;&#x6BCD;&#x8517;&#x7CD6;&#x9176;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x9634;&#x6027;&#x5BF9;&#x7167;&#x3002;&#x6807;&#x51C6;&#x88AB;&#x98D9;&#x5347;&#x5230;&#x591A;&#x4E2A;&#x4EB2;&#x548C;&#x53BB;&#x9664;&#x7CFB;&#x7EDF; (MARS) 14 &#x8D2B;&#x3001; &#x80F0;&#x86CB;&#x767D;&#x9176;&#x6D88;&#x5316;&#x4EBA;&#x8840;&#x6D46;&#x4ECE;&#x5065;&#x5EB7;&#x7684;&#x6350;&#x52A9;&#x8005;&#x3002;&#x6837;&#x672C;&#x88AB;&#x88C5;&#x4E0A;&#x51DD;&#x96C6;&#x7D20;&#x5217;&#x3001; &#x9AD8;&#x6548;&#x6DB2;&#x76F8;&#x8272;&#x8C31;&#x6CD5;&#x5206;&#x4E3A;&#x6D41;&#x901A;&#x8FC7;&#x548C;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x7684;&#x5206;&#x6570;&#xFF0C;&#x548C;&#x80BD;&#x6CBB;&#x7597;&#xFF1A; N-&#x7CD6;&#x82F7;&#x9176; F &#x8981;&#x5220;&#x9664; N-&#x805A;&#x7CD6;&#x3002;Deglycosylated &#x591A;&#x80BD;&#x7EC4;&#x5206;&#x5BA1;&#x95EE;&#x4E86; ESI &#x9AD8;&#x6548;&#x6DB2;&#x76F8;&#x8272;&#x8C31;-&#x8D28;&#x8C31;/&#x8D28;&#x8C31;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#x603B;&#x5171;&#x6709; 122 &#x4EBA;&#x8840;&#x6D46;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x542B;&#x6709; 247 &#x72EC;&#x7279; glycosites&#x3002;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D; (&#x5982;&#x9499;&#x7C98;&#x86CB;&#x767D; 5 &#x548C;&#x4E2D;&#x6027;&#x7C92;&#x7EC6;&#x80DE;&#x660E;&#x80F6;&#x9176;&#x76F8;&#x5173;&#x8F7D;&#x8102;&#x86CB;&#x767D;) &#x7684;&#x51E0;&#x4E2A;&#x901A;&#x5E38;&#x5728;&#x6BCF;&#x6BEB;&#x5347;&#x7EA7;&#x522B;&#x4F4E;&#x6240;&#x7B49;&#x79BB;&#x5B50;&#x4F53;&#x4E2D;&#x5206;&#x53D1;&#x3002;&#x5728;&#x4E00;&#x8D77;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x63D0;&#x4F9B;&#x5927;&#x89C4;&#x6A21;&#x57FA;&#x4E8E;&#x8D28;&#x8C31;&#x6280;&#x672F;&#x8BC1;&#x636E;&#x51DD;&#x96C6;&#x7D20;&#x5206;&#x79BB;&#x5E73;&#x53F0;&#x7EB3;&#x5165;&#x764C;&#x751F;&#x7269;&#x6807;&#x5FD7;&#x7269;&#x53D1;&#x73B0;&#x7BA1;&#x9053;&#x7684;&#x5B9E;&#x7528;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x3002;

&#x9488;&#x5BF9; glycosite &#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x4E0E;&#x764C;&#x75C7;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x78B3;&#x6C34;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x7ED3;&#x6784;&#x80F0;&#x86CB;&#x767D;&#x9176;&#x6D88;&#x5316;&#x4EBA;&#x8840;&#x6D46;&#x4E2D;&#x51DD;&#x96C6;&#x7D20;&#x4EB2;&#x548C;&#x5DE5;&#x4F5C;&#x6D41;&#x3002;

Glycans are cell-type-specific, posttranslational protein modifications that are modulated during developmental and disease processes. As such, glycoproteins are attractive biomarker candidates. Here, we describe a mass spectrometry-based workflow that incorporates lectin affinity chromatography to enrich for proteins that carry specific glycan structures. As increases in sialylation and fucosylation are prominent among cancer-associated modifications, we focused on Sambucus nigra agglutinin (SNA) and Aleuria aurantia lectin (AAL), lectins which bind sialic acid- and fucose-containing structures, respectively. Fucosylated and sialylated glycopeptides from human lactoferrin served as positive controls, and high-mannose structures from yeast invertase served as negative controls. The standards were spiked into Multiple Affinity Removal System (MARS) 14-depleted, trypsin-digested human plasma from healthy donors. Samples were loaded onto lectin columns, separated by HPLC into flow-through and bound fractions, and treated with peptide: N-glycosidase F to remove N-linked glycans. The deglycosylated peptide fractions were interrogated by ESI HPLC-MS/MS. We identified a total of 122 human plasma glycoproteins containing 247 unique glycosites. Importantly, several of the observed glycoproteins (e.g., cadherin 5 and neutrophil gelatinase-associated lipocalin) typically circulate in plasma at low nanogram per milliliter levels. Together, these results provide mass spectrometry-based evidence of the utility of incorporating lectin-separation platforms into cancer biomarker discovery pipelines.

A lectin affinity workflow targeting glycosite-specific, cancer-related carbohydrate structures in trypsin-digested human plasma.

Glycanes sont un type de cellule-sp&#xE9;cifiques, des modifications post-traductionnelles des prot&#xE9;ines qui sont modul&#xE9;s au cours des processus de d&#xE9;veloppement et de la maladie. En tant que tel, les glycoprot&#xE9;ines sont des candidats biomarqueurs int&#xE9;ressants. Ici, nous d&#xE9;crivons une spectrom&#xE9;trie de masse &#xE0; base de workflow qui int&#xE8;gre chromatographie d&#x26;#39;affinit&#xE9; lectine &#xE0; enrichir pour des prot&#xE9;ines qui transportent sp&#xE9;cifiques structures glycanniques. Comme l&#x26;#39;augmentation des sialylation et fucosylation occupent une place importante parmi les associ&#xE9;s au cancer modifications, nous nous sommes concentr&#xE9;s sur Sambucus nigra agglutinine (SCN) et Aleuria aurantia lectine (AAL), les lectines qui lient l&#x26;#39;acide sialique et le fucose-structures contenant, respectivement. Glycopeptides fucosyl&#xE9;es et sialyl&#xE9;es de la lactoferrine humaine ont servi de t&#xE9;moins positifs, et de haute-mannose structures de invertase de levure ont servi de t&#xE9;moins n&#xE9;gatifs. Les normes ont &#xE9;t&#xE9; charg&#xE9;s dans le Syst&#xE8;me d&#x26;#39;affinit&#xE9; Enl&#xE8;vement multiples (MARS) de 14 appauvri, la trypsine-dig&#xE9;r&#xE9; plasma humain provenant de donneurs sains. Les &#xE9;chantillons ont &#xE9;t&#xE9; charg&#xE9;s sur des colonnes de lectine, s&#xE9;par&#xE9;s par HPLC en flux continu et fractions li&#xE9;es, et trait&#xE9;es avec le peptide: N-glycosidase F pour &#xE9;liminer N-glycanes. Les fractions peptidiques d&#xE9;glycosyl&#xE9;es ont &#xE9;t&#xE9; interrog&#xE9;s par CLHP-SM/SM ESI. Nous avons identifi&#xE9; un total de 122 glycoprot&#xE9;ines plasmatiques humaines contenant 247 glycosites uniques. Il est important, plusieurs des glycoprot&#xE9;ines observ&#xE9;es (par exemple, la cadh&#xE9;rine 5 et des neutrophiles associ&#xE9;e &#xE0; la g&#xE9;latinase lipocaline) g&#xE9;n&#xE9;ralement circuler dans le plasma &#xE0; faible nanogramme par millilitre niveaux. Ensemble, ces r&#xE9;sultats fournissent la spectrom&#xE9;trie de masse &#xE0; base de la preuve de l&#x26;#39;utilit&#xE9; d&#x26;#39;incorporer la lectine de s&#xE9;paration plates-formes dans les pipelines de biomarqueurs du cancer de d&#xE9;couverte.

Un flux de travail d&#x26;#39;affinit&#xE9; sur lectine de ciblage Glycosite-sp&#xE9;cifiques, des structures glucidiques li&#xE9;s au cancer dans la trypsine-dig&#xE9;r&#xE9; du plasma humain

Glykane sind zellspezifische-Typ, posttranslationale Protein-&Auml;nderungen, die w&auml;hrend der Entwicklungsbiologie moduliert werden und Krankheitsprozesse. Glykoproteine sind attraktive Biomarker-Kandidaten. Hier beschreiben wir einen Spektrometrie-basierten Massen-Workflow, der beinhaltet Lektin-Affinit&auml;ts-Chromatographie f&uuml;r Proteine, die bestimmte Glykan-Strukturen tragen zu bereichern. Wie Sialylation und Fucosylation unter Krebs-assoziierte Ver&auml;nderungen hervor, konzentrierten wir uns auf Sambucus Nigra Agglutinin (SNA) und Orangeroter Aurantia Lektin (AAL), Lektine die Sialins&auml;ure und Fucose-haltigen Strukturen, bzw. zu binden. Fucosylated und Sialylated Glycopeptides aus menschlichen Lactoferrin diente als Positivkontrollen und hoch-Mannose Strukturen aus Hefe Invertase diente als Negativkontrolle. Die Standards wurden in mehreren Affinity Removal System (MARS) 14-ersch&ouml;pft, Trypsin verdaut menschlichen Plasma von gesunden Spendern Pfennigabsatz. Proben wurden verladen Lektin Spalten durch HPLC in Passagen- und gebundene Fraktionen getrennt und mit Peptid behandelt: N-Glycosidaseinhibitoren F, N-chromosomale Glykane zu entfernen. Die Deglycosylated-Peptid-Br&uuml;che wurden von ESI-HPLC-MS/MS verh&ouml;rt. Wir haben insgesamt 122 Blutplasma Glykoproteine mit 247 einzigartige Glycosites identifiziert. Wichtiger ist, zirkulieren einige der beobachteten Glykoproteine (z. B. Cadherin 5 und neutrophil Gelatinase-assoziiertes Lipocalin) in der Regel im Plasma bei niedrigen Nanogramm pro Milliliter Ebenen. Zusammen bieten diese Ergebnisse Spektrometrie-basierten Massen-Beweis f&uuml;r den Nutzen der Einbeziehung von Lektin-Trennung-Plattformen in Krebs Biomarker Entdeckung Rohrleitungen.

Ein Lektin-Affinit&auml;t-Workflow f&uuml;r Glycosite-spezifische, Krebs-in Verbindung stehenden Kohlenhydrat-Strukturen im Blutplasma enthalten Trypsin verdaut.

Glicani sono specifici del tipo di cellula, post traduzionale della proteina le modifiche che sono modulate durante lo sviluppo e i processi di malattia. Come tale, glicoproteine sono attraenti biomarker candidati. Qui, descriviamo un flusso di lavoro basato su spettrometria di massa che incorpora la cromatografia di affinit&agrave; lectina arricchire per le proteine che trasportano glycan specifiche strutture. Come aumenti di sialylation e fucosylation sono prominenti tra modifiche associati al cancro, ci siamo concentrati su Sambucus nigra agglutinina (SNA) e Aleuria aurantia lectin (AAL), lectine che legano strutture contenenti acido sialico e fucosio, rispettivamente. Glicopeptidi Fucosylated e sialilato da lattoferrina umana servivano come controlli positivi e le strutture di alta-mannosio da lievito invertasi servito come controlli negativi. Gli standard sono stati a spillo in molteplici affinit&agrave; Removal System (MARS) 14-esaurito, digerite tripsina plasma umano da donatori sani. Campioni sono stati caricati su colonne lectina, separati mediante HPLC in frazioni flow-through e rilegate e trattati con peptide: N-glicosidasico F rimuovere N-linked glicani. Le frazioni di peptide deglycosylated sono state interrogate da HPLC ESI-MS/MS. Abbiamo identificato un totale di 122 glicoproteine di plasma umano contenente 247 glycosites unico. Importante, diverse le glicoproteine osservate (per esempio, 5 caderina e neutrophil gelatinase-associated lipocalin) in genere circolano nel plasma a basso nanogrammi per millilitro livelli. Insieme, questi risultati forniscono massa basati sulla spettrometria di prove dell&#39;utilit&agrave; di integrare piattaforme lectina-separazione nel cancro biomarker discovery oleodotti.

Un workflow di affinit&agrave; lectina targeting strutture glycosite specifici, legati al cancro carboidrati nel plasma umano digerite tripsina.

&#x7CD6;&#x9396;&#x306F;&#x3001;&#x767A;&#x751F;&#x3084;&#x75C5;&#x6C17;&#x306E;&#x904E;&#x7A0B;&#x3067;&#x5909;&#x8ABF;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x7D30;&#x80DE;&#x578B;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x3001;&#x7FFB;&#x8A33;&#x5F8C;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x4FEE;&#x98FE;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3001;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306F;&#x3001;&#x9B45;&#x529B;&#x7684;&#x306A;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x5019;&#x88DC;&#x3068;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x7CD6;&#x9396;&#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x904B;&#x3076;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3092;&#x6FC3;&#x7E2E;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x30EC;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x30A2;&#x30D5;&#x30A3;&#x30CB;&#x30C6;&#x30A3;&#x30FC;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C8;&#x30B0;&#x30E9;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x8FBC;&#x3093;&#x3060;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x30D5;&#x30ED;&#x30FC;&#x3092;&#x8AAC;&#x660E;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30B7;&#x30A2;&#x30EA;&#x30EB;&#x5316;&#x53CA;&#x3073;&#x30D5;&#x30B3;&#x30B7;&#x30EB;&#x5316;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x306F;&#x764C;&#x95A2;&#x9023;&#x306E;&#x4FEE;&#x6B63;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x9855;&#x8457;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x3001;&#x30CB;&#x30EF;&#x30C8;&#x30B3;&#x9ED2;&#x8CEA;&#x51DD;&#x96C6;&#x7D20;&#xFF08;SNA&#xFF09;&#x3068;&#x30D2;&#x30A4;&#x30ED;&#x30C1;&#x30E3;&#x30EF;&#x30F3;&#x30BF;&#x30B1;&#x30EC;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#xFF08;AAL&#xFF09;&#x3001;&#x30B7;&#x30A2;&#x30EB;&#x9178;&#x3068;&#x30D5;&#x30B3;&#x30FC;&#x30B9;&#x542B;&#x6709;&#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x7D50;&#x5408;&#x3059;&#x308B;&#x30EC;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x306B;&#x7126;&#x70B9;&#x3092;&#x5F53;&#x3066;&#x305F;&#x3002;&#x30D2;&#x30C8;&#x30E9;&#x30AF;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A7;&#x30EA;&#x30F3;&#x304B;&#x3089;&#x30D5;&#x30B3;&#x30B7;&#x30EB;&#x5316;&#x3068;&#x30B7;&#x30A2;&#x30EA;&#x30EB;&#x7CD6;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x306F;&#x3001;&#x6B63;&#x306E;&#x5BFE;&#x7167;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x9175;&#x6BCD;&#x30A4;&#x30F3;&#x30D9;&#x30EB;&#x30BF;&#x30FC;&#x30BC;&#x304B;&#x3089;&#x9AD8;&#x30DE;&#x30F3;&#x30CE;&#x30FC;&#x30B9;&#x69CB;&#x9020;&#x306F;&#x3001;&#x30CD;&#x30AC;&#x30C6;&#x30A3;&#x30D6;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30FC;&#x30EB;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x5F79;&#x7ACB;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x57FA;&#x6E96;&#x306F;&#x3001;&#x30DE;&#x30EB;&#x30C1;&#x30D7;&#x30EB;&#x30A2;&#x30D5;&#x30A3;&#x30CB;&#x30C6;&#x30A3;&#x9664;&#x53BB;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x200B;&#x200B;&#xFF08;MARS&#xFF09;14-&#x67AF;&#x6E07;&#x3001;&#x5065;&#x5EB7;&#x306A;&#x30C9;&#x30CA;&#x30FC;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x30C8;&#x30EA;&#x30D7;&#x30B7;&#x30F3;&#x6D88;&#x5316;&#x3057;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x8840;&#x6F3F;&#x306B;&#x6DFB;&#x52A0;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x30D5;&#x30ED;&#x30FC;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x3068;&#x7D50;&#x5408;&#x3057;&#x305F;&#x753B;&#x5206;&#x306B;HPLC&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x5206;&#x96E2;&#x3057;&#x3001;&#x30EC;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x30AB;&#x30E9;&#x30E0;&#x306B;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C9;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x3067;&#x51E6;&#x7406;&#x3057;&#x305F;&#xFF1A;N-&#x30B0;&#x30EA;&#x30B3;&#x30B7;&#x30C0;&#x30FC;&#x30BC;F&#x306F;N-&#x7D50;&#x5408;&#x578B;&#x7CD6;&#x9396;&#x3092;&#x9664;&#x53BB;&#x3059;&#x308B;&#x3002;&#x8131;&#x30B0;&#x30EA;&#x30B3;&#x30B7;&#x30EB;&#x5316;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x753B;&#x5206;&#x3092;ESI&#x306E;HPLC-MS/MS&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5C0B;&#x554F;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;247&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;glycosites&#x3092;&#x542B;&#x3080;122&#x30D2;&#x30C8;&#x8840;&#x6F3F;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x5408;&#x8A08;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x306E;&#x306F;&#x3001;&#x89B3;&#x6E2C;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x7CD6;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#xFF08;&#x4F8B;&#x3048;&#x3070;&#x3001;&#x30AB;&#x30C9;&#x30D8;&#x30EA;&#x30F3;5&#x3068;&#x597D;&#x4E2D;&#x7403;&#x30BC;&#x30E9;&#x30C1;&#x30CA;&#x30FC;&#x30BC;&#x95A2;&#x9023;&#x30EA;&#x30DD;&#x30AB;&#x30EA;&#x30F3;&#xFF09;&#x306E;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306F;&#x3001;&#x901A;&#x5E38;&#x3001;&#x30DF;&#x30EA;&#x30EA;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EB;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3054;&#x3068;&#x306B;&#x3001;&#x4F4E;&#x30CA;&#x30CE;&#x30B0;&#x30E9;&#x30E0;&#x3067;&#x8840;&#x6F3F;&#x4E2D;&#x306B;&#x5FAA;&#x74B0;&#x3059;&#x308B;&#x3002;&#x4E00;&#x7DD2;&#x306B;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x764C;&#x30D0;&#x30A4;&#x30AA;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306E;&#x63A2;&#x7D22;&#x30D1;&#x30A4;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x306B;&#x30EC;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x5206;&#x96E2;&#x30D7;&#x30E9;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30E0;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x8FBC;&#x3093;&#x3060;&#x306E;&#x30E6;&#x30FC;&#x30C6;&#x30A3;&#x30EA;&#x30C6;&#x30A3;&#x306E;&#x8CEA;&#x91CF;&#x5206;&#x6790;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30C8;&#x30EA;&#x30D7;&#x30B7;&#x30F3;&#x6D88;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x30D2;&#x30C8;&#x8840;&#x6F3F;&#x4E2D;Glycosite&#x7279;&#x6709;&#x306E;&#x304C;&#x3093;&#x95A2;&#x9023;&#x7CD6;&#x9396;&#x69CB;&#x9020;&#x3092;&#x6A19;&#x7684;&#x3068;&#x30EC;&#x30AF;&#x30C1;&#x30F3;&#x89AA;&#x548C;&#x6027;&#x306E;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x30D5;&#x30ED;&#x30FC;

Glycans&#xB294; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xBCC0;&#xC870; &#xC140; &#xC720;&#xD615;&#xBCC4;, posttranslational &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC218;&#xC815; &#xBC0F; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;. &#xC774;&#xC640; &#xAC19;&#xC774;, glycoproteins&#xB294; &#xB9E4;&#xB825;&#xC801;&#xC778; biomarker &#xD6C4;&#xBCF4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xD2B9;&#xC815; glycan &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xC804;&#xB2EC; &#xD558;&#xB294; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC744; &#xD48D;&#xBD80; &#xD558; &#xAC8C; lectin &#xCE5C;&#xD654;&#xC131; &#xD06C;&#xB85C;&#xB9C8;&#xD1A0;&#xADF8;&#xB798;&#xD53C; &#xD1B5;&#xD569; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; &#xAE30;&#xBC18; &#xC6CC;&#xD06C;&#xD50C;&#xB85C; &#xC124;&#xBA85; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Sialylation &#xBC0F; fucosylation&#xC758; &#xC99D;&#xAC00; &#xC554; &#xAD00;&#xB828; &#xC218;&#xC815; &#xC911; &#xB208;&#xC5D0; &#xB744;&#xB294;, &#xC6B0;&#xB9AC; Sambucus nigra agglutinin (SNA) &#xBC0F; Aleuria (AAL) aurantia lectin sialic &#xC0B0; &#xACE0; fucose &#xD3EC;&#xD568; &#xB41C; &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xAC01;&#xAC01; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD560; lectins&#xC5D0; &#xCD08;&#xC810;&#xC744; &#xB9DE;&#xCD98;. &#xC778;&#xAC04;&#xC758; lactoferrin &#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC778; &#xCEE8;&#xD2B8;&#xB864; &#xBC0F; &#xD6A8; &#xBAA8; &#xB2F9;&#xD654; &#xBD80;&#xC815;&#xC801;&#xC778; &#xCEE8;&#xD2B8;&#xB864; &#xC5ED;&#xC784;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB192;&#xC740; &#xC2A4; &#xAD6C;&#xC870;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; Fucosylated &#xBC0F; sialylated glycopeptides. &#xD45C;&#xC900; &#xAC74;&#xAC15; &#xD55C; &#xAE30;&#xC99D;&#xC790; &#xB85C;&#xBD80;&#xD130; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xC120;&#xD638;&#xB3C4; &#xC81C;&#xAC70; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; (&#xD654;&#xC131;) 14 &#xACE0;&#xAC08;, &#xD2B8;&#xB9BD; &#xC2E0; &#xC18C;&#xD654; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xD50C;&#xB77C;&#xC988;&#xB9C8;&#xB85C; &#xC544;&#xAD70; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC0D8;&#xD50C; lectin &#xC5F4;&#xC5D0; &#xB85C;&#xB4DC; &#xB41C; HPLC&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xAD6C;&#xBD84; &#xD558;&#xB294; &#xD750;&#xB984;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xD558; &#xACE0; &#xBC14;&#xC6B4;&#xB4DC; &#xBD84;&#xC218;&#xC5D0; &#xBC0F; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;&#xB85C; &#xCE58;&#xB8CC;: N glycosidase F glycans N &#xC5F0;&#xACB0;&#xC744; &#xC81C;&#xAC70; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Deglycosylated &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xBD84;&#xC218; ESI HPLC-MS/MS&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC2EC;&#xBB38;&#xC744; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xCD1D; 122 &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xD50C;&#xB77C;&#xC988;&#xB9C8; glycoproteins 247 &#xACE0;&#xC720;&#xD55C; glycosites&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xD655;&#xC778;. &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xAC83;&#xC740;, &#xAD00;&#xCC30; &#xB41C; glycoproteins (&#xC608;&#xB97C; &#xB4E4;&#xC5B4;, cadherin 5&#xC640; &#xD638; gelatinase &#xC5F0;&#xACB0; lipocalin)&#xC758; &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xBC00;&#xB9AC; &#xB808;&#xBCA8; &#xB2F9; &#xB0AE;&#xC740; &#xB098;&#xB178; &#xADF8;&#xB7A8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD50C;&#xB77C;&#xC988;&#xB9C8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC21C;&#xD658;. &#xD568;&#xAED8;, &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xACB0;&#xACFC; &#xC554; biomarker &#xAC80;&#xC0C9; &#xD30C;&#xC774;&#xD504;&#xB77C;&#xC778;&#xC73C;&#xB85C; lectin &#xBD84;&#xB9AC; &#xD50C;&#xB7AB;&#xD3FC;&#xC744; &#xD1B5;&#xD569;&#xC758; &#xC720;&#xD2F8;&#xB9AC;&#xD2F0;&#xC758; &#xC9C8;&#xB7C9; &#xBD84;&#xC11D; &#xAE30;&#xBC18; &#xC99D;&#xAC70;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Lectin &#xC120;&#xD638;&#xB3C4; &#xC6CC;&#xD06C;&#xD50C;&#xB85C; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xD50C;&#xB77C;&#xC988;&#xB9C8; &#xD2B8;&#xB9BD; &#xC2E0; &#xC18C;&#xD654;&#xC5D0;&#xC11C; glycosite &#xAD00;&#xB828;, &#xC554; &#xAD00;&#xB828; &#xD0C4;&#xC218;&#xD654;&#xBB3C; &#xAD6C;&#xC870;&#xB97C; &#xB300;&#xC0C1;&#xC73C;&#xB85C; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Los glicanos son las c&#xE9;lulas espec&#xED;ficas del tipo de prote&#xED;na, modificaciones postraduccionales que se modulan en los procesos de desarrollo y de la enfermedad. Como tal, glicoprote&#xED;nas son candidatos atractivos biomarcadores. A continuaci&#xF3;n, describimos una espectrometr&#xED;a de masas basado en flujo de trabajo que incorpora la cromatograf&#xED;a de afinidad de lectina para enriquecer las prote&#xED;nas que transportan determinadas estructuras de glicano. A medida que aumenta en sialilaci&#xF3;n y fucosilaci&#xF3;n destacan entre asociados al c&#xE1;ncer modificaciones, nos centramos en Sambucus nigra aglutinina (SNA) y la lectina Aleuria aurantia (AAL), lectinas que se unen con &#xE1;cido si&#xE1;lico y las estructuras de fucosa que contienen, respectivamente. Glicop&#xE9;ptidos fucosilados y sialilada de lactoferrina humana sirvieron como controles positivos, y alto contenido en manosa estructuras de invertasa de levadura sirvieron como controles negativos. Las normas se dispar&#xF3; en m&#xFA;ltiples sistemas de eliminaci&#xF3;n de afinidad (MARS) de 14 empobrecido, digerido con tripsina plasma humano de donantes sanos. Las muestras se cargaron en columnas de lectina, separados por HPLC en flujo continuo y fracciones enlazados, y tratados con el p&#xE9;ptido N-glicosidasa F para eliminar N-glicanos ligados. Las fracciones pept&#xED;dicas desglicosiladas fueron interrogados por HPLC-MS/MS ESI. Se identificaron un total de 122 glicoprote&#xED;nas del plasma humano que contienen 247 glycosites &#xFA;nicas. Es importante destacar que varias de las glicoprote&#xED;nas observados (por ejemplo, cadherina 5 y neutr&#xF3;filos lipocalina gelatinasa asociada) normalmente circulan en el plasma a baja nanogramos por mililitro niveles. En conjunto, estos resultados proporcionan la espectrometr&#xED;a de masas basada en la evidencia de la utilidad de la incorporaci&#xF3;n de la separaci&#xF3;n lectina-plataformas en las tuber&#xED;as descubrimiento de biomarcadores de c&#xE1;ncer.

Un flujo de trabajo de afinidad de lectina Orientaci&#xF3;n Glycosite espec&#xED;ficos, relacionados con el c&#xE1;ncer estructuras de carbohidratos en la tripsina digerido con plasma humano

&#x5341;&#x3001; &#x87FE;&#x548C;&#x5341;&#x3001; &#x70ED;&#x5E26;&#x5047;&#x4E1D;&#x9175;&#x6BCD;&#x7684;&#x975E;&#x6D32;&#x722A;&#x87FE;&#x5317;&#x6781;&#x65BD;&#x80A5;&#x884C;&#x4E3A;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x660E;&#x86CB;&#x6C34;&#x6BCD;&#x7684;&#x7CD6;&#x57FA;&#x5316;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x3002;&#x82E5;&#x8981;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x8FD9;&#x79CD;&#x5047;&#x8BBE;&#xFF0C;O-&#x805A;&#x7CD6;&#x5316;&#x5B66;&#x83B7;&#x91CA;&#x4ECE;&#x9E21;&#x86CB;&#x679C;&#x51BB;&#x5916;&#x5957;&#x7CD6;&#x86CB;&#x767D;&#x5341;&#x3001; &#x5317;&#x6781;&#x3002;&#x8D85;&#x8FC7; 50 &#x4E3B;&#x8981;&#x4E2D;&#x6027;&#x7CD6;&#x88AB;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#xFF0C;&#x5E76;&#x6CA1;&#x6709;&#x9634;&#x79BB;&#x5B50;&#x805A;&#x7CD6;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5230;&#x4ECE;&#x516C;&#x5E03;&#x7684;&#x6FB3;&#x7CD6;&#x6C60;&#x3002;&sim;30 &#x4E2D;&#x6027;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x521D;&#x6B65;&#x7ED3;&#x6784;&#x662F;&#x7528;&#x57FA;&#x8D28;&#x8F85;&#x52A9;&#x6FC0;&#x5149;&#x89E3;&#x5438; / (&#x9A6C;&#x5C14;&#x8FEA;) &#x7EA2;&#x5916;&#x591A;&#x5149;&#x5B50;&#x89E3;&#x79BB;&#x4E32;&#x8054;&#x8D28;&#x8C31; (MS) &#x6765;&#x786E;&#x5B9A;&#x7684;&#x3002;&#x5927;&#x89C4;&#x6A21;&#x7684;&#x6838;&#x5FC3; 2 &#x7ED3;&#x6784;&#x7684;&#x6FB3;&#x7CD6;&#x7FA4;&#x5CF0;&#x6307;&#x7EB9;&#x5B88;&#x6052;&#x7684;&#x4E32;&#x8054;&#x8D28;&#x8C31;&#x548C;&#x5FEB;&#x901F;&#x548C;&#x9AD8;&#x6548;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x6D4B;&#x5B9A;&#x4E2D;&#x53D1;&#x6325;&#x4E86;&#x91CD;&#x8981;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;29 O &#x86CB;&#x767D;&#x7CD6;&#xFF0C;22 &#x7CD6;&#x5305;&#x542B;&#x5178;&#x578B;&#x7684;&#x6838;&#x5FC3; 2 &#x7ED3;&#x6784;&#x3001; 3 &#x805A;&#x7CD6;&#x5177;&#x6709;&#x6838;&#x5FC3; 1 &#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x548C; 2 &#x805A;&#x7CD6;&#x6240;&#x8F7D;&#x5DF1;&#x7CD6;&#x51CF;&#x5C11;&#x5E74;&#x5E95;&#x4EE5;&#x524D;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684;&#x6838;&#x5FC3;&#x7ED3;&#x6784;&#x3002;&#x6709;&#x4E03;&#x5BF9;&#x4E3B;&#x8981; O &#x94FE;&#x63A5;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x4E2D;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x5F02;&#x6784;&#x4F53;&#x3002;&#x4F5C;&#x51FA;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x6F84;&#x6E05;&#x5341;&#x51E0; O-&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#xFF0C;&#x5177;&#x4F53;&#x548C;&#x6709;&#x9488;&#x5BF9;&#x6027;&#x7684; exoglycosidase &#x6D88;&#x89E3;&#x4E86;&#x5F00;&#x5C55;&#x548C;&#x4EA7;&#x54C1;&#x8FDB;&#x884C;&#x4E86;&#x76D1;&#x6D4B;&#x4E0E;&#x9A6C;&#x5C14;&#x8FEA;&#x5973;&#x58EB;&#x62A5;&#x544A;&#x8BF4;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6709;&#x6F84;&#x6E05;&#x4ED6;&#x7684; O &#x94FE;&#x63A5;&#x5341;.&#x5317;&#x6781;&#x86CB;&#x7CD6;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x679C;&#x51BB;&#x5927;&#x8863;&#x3002;&#x5341;.&#x5317;&#x6781;&#x548C;&#x5176;&#x8FD1;&#x4EB2;&#x7684;&#x679C;&#x51BB;&#x5927;&#x8863;&#x4ECE;&#x6FB3;&#x7CD6;&#x7ED3;&#x6784;&#x5DEE;&#x5F02;&#x53EF;&#x80FD;&#x63D0;&#x4F9B;&#x66F4;&#x597D;&#x5730;&#x7406;&#x89E3;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x4E0E;&#x529F;&#x80FD;&#x5173;&#x7CFB;&#x548C; Xenopodinae &#x5728;&#x53D7;&#x7CBE;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

&#x7531;&#x9A6C;&#x5C14;&#x8FEA; IRMPD &#x5927;&#x89C4;&#x6A21;&#x5149;&#x8C31;&#x548C; exoglycosidase &#x6D88;&#x89E3; O &#x94FE;&#x63A5;&#x4ECE;&#x975E;&#x6D32;&#x722A;&#x87FE;&#x5317;&#x6781;&#x9E21;&#x86CB;&#x679C;&#x51BB;&#x7684;&#x4F4E;&#x805A;&#x7CD6;&#x7684;&#x7ED3;&#x6784;&#x6D4B;&#x5B9A;&#x3002;

Differences in the fertilization behavior of Xenopus borealis from X. laevis and X. tropicalis suggest differences in the glycosylation of the egg jellies. To test this assumption, O-linked glycans were chemically released from the egg jelly coat glycoproteins of X. borealis. Over 50 major neutral glycans were observed, and no anionic glycans were detected from the released O-glycan pool. Preliminary structures of âˆ¼30 neutral oligosaccharides were determined using matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) infrared multiphoton dissociation tandem mass spectrometry (MS). The mass fingerprint of a group of peaks for the core-2 structure of O-glycans was conserved in the tandem mass spectra and was instrumental in rapid and efficient structure determination. Among the 29 O-glycans, 22 glycans contain the typical core-2 structure, 3 glycans have the core-1 structure and 2 glycans contained a previously unobserved core structure with hexose at the reducing end. There were seven pairs of structural isomers observed in the major O-linked oligosaccharides. To further elucidate the structures of a dozen O-linked glycans, specific and targeted exoglycosidase digestions were carried out and the products were monitored with MALDI-MS. Reported here are the elucidated structures of O-linked oligosaccharides from glycoproteins of X. borealis egg jelly coats. The structural differences in O-glycans from jelly coats of X. borealis and its close relatives may provide a better understanding of the structure-function relationships and the role of glycans in the fertilization process within Xenopodinae.

Structure determination by MALDI-IRMPD mass spectrometry and exoglycosidase digestions of O-linked oligosaccharides from Xenopus borealis egg jelly.

Diff&eacute;rences dans le comportement de la f&eacute;condation de Xenopus borealis de X. laevis et X. tropicalis sugg&egrave;rent des diff&eacute;rences dans la glycosylation des gel&eacute;es de l&#39;oeuf. Pour tester cette hypoth&egrave;se, O-glycanes sont lib&eacute;r&eacute;s chimiquement les glycoprot&eacute;ines de couche de gel&eacute;e oeuf de X. borealis. Plus de 50 glycanes neutres importants ont &eacute;t&eacute; observ&eacute;s, et aucun glycanes anioniques ont &eacute;t&eacute; d&eacute;tect&eacute;s du pool de O-glycanes lib&eacute;r&eacute;s. Structures pr&eacute;liminaires d&#39;oligosaccharides neutres &sim;30 ont &eacute;t&eacute; d&eacute;termin&eacute;es &agrave; l&#39;aide de laser assist&eacute;e par matrice (MALDI) de d&eacute;sorption-ionisation dissociation multiphotonique infrarouge spectrom&eacute;trie de masse (MS). L&#39;empreinte de masse d&#39;un groupe de pics pour la structure de base-2 d&#39;O-glycanes a &eacute;t&eacute; conserv&eacute; dans les spectres de masse en tandem et a jou&eacute; un r&ocirc;le dans la d&eacute;termination de la structure rapide et efficace. Parmi les 29 O-glycanes, 22 glycanes contiennent la structure typique de la base-2, 3 glycanes ont la structure de base-1 et 2 glycanes contient une structure de base pr&eacute;c&eacute;demment non observ&eacute;es avec hexose &agrave; l&#39;extr&eacute;mit&eacute; r&eacute;ductrice. Il y avait sept paires d&#39;isom&egrave;res structuraux observ&eacute;s dans les grands oligosaccharides O-li&eacute;s. Pour plus amples &eacute;lucider les structures d&#39;une douzaine O-glycanes, digestions &eacute;xoglycosidase sp&eacute;cifiques et cibl&eacute;es ont &eacute;t&eacute; men&eacute;es et les produits ont &eacute;t&eacute; suivis avec MALDI-Mme rapport&eacute;s ici sont les structures &eacute;lucid&eacute;s des oligosaccharides O-li&eacute;s des glycoprot&eacute;ines de &oelig;ufs X. borealis manteaux de gel&eacute;e. Des diff&eacute;rences structurelles dans O-glycanes de couches de gel&eacute;e de X. borealis et ses proches peuvent fournir une meilleure compr&eacute;hension de la relation structure-fonction et le r&ocirc;le des glycanes dans le processus de f&eacute;condation dans Xenopodinae.

D&eacute;termination de structure par MALDI-DMPIR massives spectrom&eacute;trie &eacute;xoglycosidase digestions et des oligosaccharides O-li&eacute;s de Xenopus borealis oeuf gel&eacute;e.

Article	Year
Infrared multiphoton dissociation of O-linked mucin-type oligosaccharides. Analytical chemistry\| PubMed ID: 15623298	2005
Cloning, sequencing, analysis, and heterologous expression of the fredericamycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces griseus. Journal of the American Chemical Society\| PubMed ID: 16305230	2005
Automatic determination of O-glycan structure from fragmentation spectra. Journal of proteome research\| PubMed ID: 16739994	2006
Profiling of glycans in serum for the discovery of potential biomarkers for ovarian cancer. Journal of proteome research\| PubMed ID: 16823970	2006
Interrogation of N-Linked oligosaccharides using infrared multiphoton dissociation in FT-ICR mass spectrometry. Analytical chemistry\| PubMed ID: 16841922	2006
A serum glycomics approach to breast cancer biomarkers. Molecular & cellular proteomics : MCP\| PubMed ID: 16847285	2007
Investigations with O-linked protein glycosylations by matrix-assisted laser desorption/ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry. Journal of mass spectrometry : JMS\| PubMed ID: 18324610	2008
Glycoproteomic analyses of ovarian cancer cell lines and sera from ovarian cancer patients show distinct glycosylation changes in individual proteins. Journal of proteome research\| PubMed ID: 18642944	2008
Infrared multiphoton dissociation mass spectrometry for structural elucidation of oligosaccharides. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)\| PubMed ID: 19277545	2009
Collision-induced dissociation tandem mass spectrometry for structural elucidation of glycans. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)\| PubMed ID: 19277555	2009
Sweetening the pot: adding glycosylation to the biomarker discovery equation. Clinical chemistry\| PubMed ID: 19959616	2010
A lectin affinity workflow targeting glycosite-specific, cancer-related carbohydrate structures in trypsin-digested human plasma. Analytical biochemistry\| PubMed ID: 20705048	2011
Structure determination by MALDI-IRMPD mass spectrometry and exoglycosidase digestions of O-linked oligosaccharides from Xenopus borealis egg jelly. Glycobiology\| PubMed ID: 21220250	2011
Confident identification of 3-nitrotyrosine modifications in mass spectral data across multiple mass spectrometry platforms. Journal of proteomics\| PubMed ID: 21514405	2011
A lectin chromatography/mass spectrometry discovery workflow identifies putative biomarkers of aggressive breast cancers. Journal of proteome research\| PubMed ID: 22309216	2012

Bensheng Li

Biography

JoVE Journal Publications

Other Publications