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方法文章

玉米赤霉菌子囊孢子的产生与收集用于微阵列实验

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DOI:

10.3791/115

2006年11月30日

本文内容

摘要

为了研究禾谷镰刀菌子囊孢子的发育过程,本实验拍摄了在无菌条件下收集子囊孢子的操作流程,以期为实验方案的描述提供尽可能详尽的信息。这将有助于提高实验的可重复性,尤其是在进行全基因组表达谱检测时,这一点至关重要。

摘要

禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum Schwabe,有性型为Gibberella zeae)是一种植物病原真菌,可引起小麦和大麦的赤霉病,导致作物产量和籽粒品质下降。禾谷镰刀菌还可引起玉米的茎腐病和穗腐病,并产生如单端孢霉烯类等真菌毒素,污染谷物,对人类和家畜有害(Goswami 和 Kistler,2004)。 该真菌产生两种类型的孢子。子囊孢子是其有性生殖产生的繁殖体,为主要的初侵染源。这些孢子从成熟的子囊壳中被强力释放,并通过风力传播(Francl 等,1999)。再侵染主要由大型分生孢子引起,后者通过无性方式在植物表面产生。为了研究该真菌子囊孢子的发育过程,需要一种在无菌条件下大量收集子囊孢子的操作流程。本实验方案已拍摄成视频,以提供最大程度的信息,便于理解与重复;尤其在进行全基因组基因表达谱的生成与解读时,这一点至关重要。特别是,子囊孢子的萌发率和生物学活性会受到前期材料处理方式的影响。因此,建议采用视频记录子囊孢子制备的每一步骤,以提高实验标准化程度,满足微阵列分析日益严格的要求。该操作仅需常规实验室设备,步骤设计可防止污染并促进子囊孢子在时间上的同步化。

方案

  1. 在直径为 9 cm 的培养皿中制备胡萝卜琼脂(Klittich 和 Leslie,1988)。
  2. 将含有在马铃薯葡萄糖琼脂上新鲜生长的菌丝体的 2 mm 琼脂块置于每个培养皿的中央。
  3. 培养物在 25°C 及 12 小时光照/12 小时黑暗光周期条件下培养 96 小时。
  4. 向培养物表面加入 1 ml 2.5% 的吐温 60 水溶液(Trail 和 Common,2000),并用塑料棒轻轻按压,使溶液均匀覆盖培养物表面。
  5. 在 25°C 及相同光周期条件下,将处理后的培养物置于高湿度环境中,7–10 天后子囊壳开始弹射子囊孢子。
  6. 通过更换培养皿盖进行孢子收集,将子囊壳在黑暗条件下弹射一定时间(例如 12 小时)。
  7. 向皿盖中加入无菌水,轻轻晃动使子囊孢子悬浮于水中。
  8. 将子囊孢子收集至无菌 Falcon 管中,洗涤后用于后续分析。

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讨论

本文所述方案基于先前用于尖孢镰刀菌(Fusarium spp.)子囊壳产生的实验方法(Klittich 和 Leslie,1988;Trail 和 Common,2000)。为了确保实验的可重复性,必须对产生大量子囊孢子(足以用于微阵列分析)的操作流程进行标准化。已有报道指出,环境因素、菌龄以及培养基差异均可能改变子囊孢子的生物学特性(Beyer 和 Verreet,2005)。因此,视频记录能够突出展示孢子产生与收集过程中的细微操作要点,有助于提高实验的可重复性。特别是该操作视频可提升不同实验室之间的标准化水平,并促进需要子囊孢子产生的全基因组转录研究之间的比较。由于实验所需RNA量相对较大,因此需同步处理大量培养皿。当需要在新型生物材料上开展全基因组转录研究时,视频是一种尤为适用的工具,可为后续实验建立统一标准。

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致谢

作者感谢Karen Hilburn提供的出色技术支持。本项目由美国农业部合作州立研究、教育与推广服务局的国家研究倡议(资助号:2004-35604-14327)资助。Matias Pasquali获得Branco Weiss奖学金的支持。同时感谢美国小麦和大麦赤霉病倡议项目对本研究的持续支持。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
9 厘米直径培养皿工具
Tween 60 (20%)试剂
胡萝卜琼脂(20% w/v 有机胡萝卜和 1.5% w/v 琼脂)试剂

参考文献

  1. Beyer, M., Verreet, J. A. Germination of Gibberella zeae ascospores as affected by age of spores after discharge and environmental factors. , (2005).
  2. Francl, L., Shaner, G., Bergstrom, G., Gilbert, J., Pedersen, W., Dill-Macky, R., Sweets, L., Corwin, B., Jin, Y., Gallenberg, D., Wiersma, J. Daily inoculum levels of Gibberella zeae on wheat spikes. Plant Disease 83,662-666. , (1999).
  3. Goswami, R. S., Kistler, H. C. Heading for disaster, Fusarium graminearum on cereal crops. Molecular Plant Pathology 5,515–525. , (2004).
  4. Klittich, C. J. R., Leslie, J. F. Nitrate reduction mutants in Fusarium moniliforme (Gibberella fujikuroi. Genetics. 118, 417-2013 (1998).
  5. Trail, F., Common, R. Perithecium development in Gibberella zeae, a light microscopy study. , (2000).
  6. Tschantz, A. T., Horst, R. L., Nelson, P. E. A substrate for uniform production of perithecia in Gibberella zeae. Mycologia. , 67-1101 (1975).
  7. Tschanz, A. T., Horst, R. K., Nelson, P. E. The effect of environment on sexual reproduction of Gibberella zeae. , (1976).

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标签

真菌孢子孢子收集无菌条件子囊壳释放小麦病原菌大麦感染玉米污染