为了研究禾谷镰刀菌子囊孢子的发育过程,本实验拍摄了在无菌条件下收集子囊孢子的操作流程,以期为实验方案的描述提供尽可能详尽的信息。这将有助于提高实验的可重复性,尤其是在进行全基因组表达谱检测时,这一点至关重要。
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为了研究禾谷镰刀菌子囊孢子的发育过程,本实验拍摄了在无菌条件下收集子囊孢子的操作流程,以期为实验方案的描述提供尽可能详尽的信息。这将有助于提高实验的可重复性,尤其是在进行全基因组表达谱检测时,这一点至关重要。
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本文所述方案基于先前用于尖孢镰刀菌(Fusarium spp.)子囊壳产生的实验方法(Klittich 和 Leslie,1988;Trail 和 Common,2000)。为了确保实验的可重复性,必须对产生大量子囊孢子(足以用于微阵列分析)的操作流程进行标准化。已有报道指出,环境因素、菌龄以及培养基差异均可能改变子囊孢子的生物学特性(Beyer 和 Verreet,2005)。因此,视频记录能够突出展示孢子产生与收集过程中的细微操作要点,有助于提高实验的可重复性。特别是该操作视频可提升不同实验室之间的标准化水平,并促进需要子囊孢子产生的全基因组转录研究之间的比较。由于实验所需RNA量相对较大,因此需同步处理大量培养皿。当需要在新型生物材料上开展全基因组转录研究时,视频是一种尤为适用的工具,可为后续实验建立统一标准。
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作者感谢Karen Hilburn提供的出色技术支持。本项目由美国农业部合作州立研究、教育与推广服务局的国家研究倡议(资助号:2004-35604-14327)资助。Matias Pasquali获得Branco Weiss奖学金的支持。同时感谢美国小麦和大麦赤霉病倡议项目对本研究的持续支持。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 | |
|---|---|---|---|---|
| 9 厘米直径培养皿 | 工具 | |||
| Tween 60 (20%) | 试剂 | |||
| 胡萝卜琼脂(20% w/v 有机胡萝卜和 1.5% w/v 琼脂) | 试剂 |
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