方法文章

用于图案化生物分子的微电极上防污自组装单分子层

DOI:

10.3791/1390

2009年8月25日

本文内容

摘要

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我们介绍一种在带有金微电极的硅基底上形成聚乙二醇自组装单分子层(PEG-SAM)的方法。该PEG-SAM通过一步法形成,可防止硅和金表面的生物污染。随后利用电泳技术实现生物分子在纳米尺度上的图案化。

摘要

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$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
我们介绍一种在带有金微电极的硅基底上形成聚乙二醇三甲氧基硅烷(PEG-trimethoxysilane)自组装单分子层(SAM)的方法。该PEG-SAM通过一步组装形成,可有效防止硅和金表面的生物污染。该SAM可用于涂覆采用标准正性光刻工艺制备的微电极。以微管为例,我们施加直流电压,可逆地诱导微管通过电泳迁移至SAM包被的电极。实验中使用流动腔室对电泳迁移过程及微管的图案化进行成像观察。in situ使用落射荧光显微镜。该方法通常适用于生物分子的图案化,因为它利用电泳将目标分子固定,因而无需特定的分子相互作用。此外,该方法避免了直接使用光刻技术对自组装单分子层(SAM)分子进行图案化时所遇到的问题。与电子束光刻的兼容性使得该方法可用于纳米尺度的生物分子图案化。

方案

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试剂的制备

配制PIPES缓冲液(80 mM PIPES,1 mM MgCl2,1 mM EGTA,用KOH调节pH至6.8)。根据现有方案1,2,将葡萄糖氧化酶、过氧化氢酶和葡萄糖分装后于-70°C保存,紫杉醇于-20°C保存。按照供应商提供的说明,将微管蛋白分装后于-70°C保存。

使用光刻技术制备图案化金微电极

  1. 使用刻划工具或晶圆切割机将硅片切割成 1 cm × 1.5 cm 的基底。将基底放入烧杯中,加入足量丙酮完全浸没,超声清洗 5 分钟。在基底未干燥的情况下,用新鲜丙酮冲洗,随后立即用异丙醇冲洗,并用氮气吹干。
  2. 根据所需结构尺寸,采用标准正性光刻或电子束光刻技术在洁净的基底上制备金微电极3。设计电极图形时,应使每个电极图形的直径小于 100 微米,以确保后续可被 PEG 自组装单分子层(SAM)完全覆盖(见下节描述)。在距离图形 300 至 500 mm 处设置引线焊盘(约 300 mm2),并通过一条 1 mm 宽的导线将焊盘与电极相连(图 1)。将光刻图形置于基底中央附近,以便在图形周围留出足够空间用于组装流动池。
    带有金刮痕的硅基底,微电极引线结构的光刻图形示意图。
    图 1. 样品几何结构示意图。请点击此处查看图 1 的放大版本。
  3. 在光刻胶层显影后,用镊子从引线焊盘处刮一条线至基底边缘(图 1)。在金属沉积过程中,该刮痕可使电极与基底边缘实现电连接。使用沉积腔室(建议配备两个蒸发源)进行金属层沉积。依次沉积 2 nm 铬(用于增强附着力)和 6 nm 金,过程中保持真空不中断。腔室内可配备石英晶体微天平,用于实时监测薄膜沉积厚度。

制备 SAM

  1. 在通风良好的区域将烘箱预热至 75°C。取一个 250 mL 玻璃烧杯,加入 20 mL 甲苯,配制硅烷化溶液。然后使用塑料移液枪向甲苯中加入 1 mL PEG-硅烷(即 5% v/v)。通过上下吹打 5 至 10 次充分混合 PEG-硅烷,再用移液枪搅拌 30 秒。
  2. 将带有图案的样品放入烧杯中,图案面朝上,确保样品完全浸没在 PEG-硅烷甲苯溶液中,并均匀分布在烧杯底部。将烧杯放入烘箱,在 75°C 下加热 18 至 21 小时。在自组装单分子膜(SAM)形成的同时,制备对电极(见下文),并组装后续步骤所需的其他组件。
  3. 在烘箱中加热 18–21 小时后,甲苯应已蒸发,样品表面留下黏稠的 PEG-硅烷残留物。向烧杯中加入 20 mL 甲苯,浸泡样品 1–2 分钟。将样品从烧杯中取出,依次用甲苯、异丙醇冲洗,最后用氮气吹干。此时样品应看起来洁净,自组装单分子膜(SAM)层在肉眼观察下不可见。此类 SAM 样品在低温干燥条件(25 °C,中等湿度)下储存时,可在两天内使用。若 SAM 形成失败,则样品表面会残留浑浊或颜色不均的涂层。

制备对电极

在用于微电极沉积的同一沉积腔室装置中,通过在22 × 50 mm的1号或0号玻璃盖玻片上先沉积1 nm铬(Cr),再沉积4 nm金(Au),制备对电极。对电极应近乎透明,呈浅灰色或淡粉色。将对电极镀层面向上放置于培养皿中保存,以保持清洁。

将微管蛋白聚合形成微管

  1. 解冻未标记的微管蛋白和罗丹明标记的微管蛋白,立即按1:2的标记与未标记比例混合,以获得荧光明亮的微管(MTs)。通过反复吹吸数次混匀。将微管蛋白在37°C水浴中聚合20–40分钟。聚合时间越长,微管长度越长。在微管蛋白聚合的同时,向含有PIPES缓冲液的微量离心管中加入紫杉醇至终浓度为20 mM,配制PIPES-紫杉醇缓冲液。通过反复吹吸并涡旋充分混匀紫杉醇,随后将离心管置于37°C水浴中预热。聚合完成后,用预热的PIPES-紫杉醇缓冲液将微管稀释100倍,并避光保存。以此方法制备的微管会随时间延长而继续伸长并发生束化,可通过进一步稀释减轻该现象。
  2. 通过混合30 mL冷的PIPES缓冲液(0–4°C)、5 mL 50% 2-巯基乙醇、5 mL葡萄糖氧化酶、5 mL过氧化氢酶和5 mL葡萄糖,配制10倍浓缩的氧气清除混合液(OS)。2 葡萄糖应最后加入。每次添加组分后,通过移液器上下吹打3-5次混匀。将OS混合液置于冰上,其活性可保持约2小时。
  3. 通过使用1x OS混合液对制备的微管(MT)进行成像,验证微管聚合是否成功,并确认微管在数分钟荧光激发下保持稳定。对以该方法制备的微管进行成像时,务必选用适用于罗丹明荧光的激发/发射滤光片组合。为进一步确定适合成像单个微管丝的最优工作稀释度,可使用PIPES缓冲液将微管样品稀释1/10至1/100,再与1x OS混合液共同孵育后进行成像。
  4. 通过将两条双面胶带(相距2-3 mm)夹在一大(22 × 50 mm)一小(22 × 22 mm)玻璃盖玻片之间,制备一个流动小室。可将双面胶带贴于载玻片上,用剃刀片切割成条状,便于操作。使用微量移液器向流动小室内加入数微升微管(MTs)。对于高倍成像,可能需要使用长工作距离物镜来观察流动小室的上表面。从盖玻片/样品表面到流动小室上表面的距离由胶带厚度决定,应为60–100 μm。

利用电泳技术对微管进行图案化

  1. 通过在图案化的 SAM 涂层样品上放置两条双面胶带,制备电泳装置,使电极位于胶带之间,且连接路径与胶带垂直(图 2)。将对电极放置在双面胶带上,金属面接触胶带,使样品边缘约有 3 mm 伸出对电极之外(图 2)。剪取数段 15 cm 长的绝缘铜漆包线,并将两端各剥去 1 cm 绝缘层。使用少量银浆将一根导线连接至基底暴露的 Au 区域,注意避免与对电极形成电接触(可用万用表检测)。用银浆将第二根导线连接至对电极。用银浆固定的导线可用胶带进一步固定在样品上。
    微流控装置示意图,电压控制流体,样品分析,防止蒸发。
    图 2. 倒置荧光显微镜用流动池组装示意图。请点击此处查看图 2 的放大版本。
  2. 使用 PIPES 缓冲液将微管(MTs)稀释至所需浓度,并加入终浓度为 1x 的 OS。以 20X 放大倍数成像,在施加电压前定位硅片上的图案。可选步骤:可用指甲油密封流动室,以防止液体流动及微管在流动室平面内的迁移。
  3. 施加最高达 1 V 的电压,并观察微管的迁移行为。若需实现微管的可逆捕获,可使用较低电压(低至约 0.5 V),但此时需密封流动室以防止横向漂移。指甲油可有效密封流动室的开放端。当电压高于约 0.7 V 时,可在图案区域观察到部分微管粘附,但粘附较弱;当电压高于约 0.9 V 时,微管迁移速度加快,粘附也更强。当电压超过约 1.2 V 时,发生电解(产生气泡)以及微电极损坏的可能性显著增加。可通过调节显微镜的焦平面来追踪微管的迁移过程。若操作正确,微管将定位于电极表面。

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讨论

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由于微管(MTs)具有高亮度且背景荧光低,其迁移过程可通过荧光显微镜轻松观察。该方法通常适用于生物分子的图案化,仅需通过适当调节缓冲液pH值使生物分子带有净电荷即可。本实验装置中避免了电渗现象,因为不存在诸如毛细管电泳中使用的带电硅壁等带电表面。

该方法有多种可能的改进方式。密封流动室的两端对于观察可逆性至关重要,因为开放端的蒸发会导致体相液体流动和微管的非预期迁移。在光刻图形化之前对硅片进行氧化处理,可以阻止基底导电,从而允许同时使用具有独立电位的多个电极。

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披露

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作者无任何利益冲突需要披露。

致谢

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我们感谢 Melissa Grunlan 在自组装单分子膜(SAM)形成方面的有益讨论。本研究部分得到了罗伯特·A·韦尔奇基金会(A-1585)的支持。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
2-[甲氧基聚(乙二醇)丙基]三甲氧基硅烷(PEG-硅烷)Gelest 公司SIM6492.76-9 个 PEG 单元;分子量 450-600 g/mol-1
2-巯基–乙醇Sigma-AldrichM7522
丙酮EMD MilliporeAX0120-8ACS 级
过氧化氢酶Calbiochem219001-5MU
氯苯EMD MilliporeMK441908ACS级
乙二醇双(2-氨基–thylether)-N,N,N’,N’-四乙酸(EGTA)Calbiochem324626
葡萄糖EMD MilliporeDX0145-1
葡萄糖氧化酶MP Biomedicals100330
鸟苷-5’-[(α,Β)-亚甲基]三磷酸钠盐(GMPCPP)Jena Biosciences, GmbHNU-405s
鸟苷-5’-三磷酸Sigma-AldrichG8752
异丙醇EMD MilliporePX1835-5ACS级
甲基异丁基酮(MIBK)Fisher ScientificAC12739-0010
紫杉醇(taxol)Calbiochem580555
哌嗪-N,N’’-二(2-乙烷磺酸)(PIPES)Sigma-AldrichP1851
聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)Brewer Science, Inc.950K分子量 950K
罗丹明标记的微管蛋白Cytoskeleton, Inc.T331M来自牛脑,99%纯度,冻干粉
甲苯EMD MilliporeTX0735-5ACS级
微管蛋白Cytoskeleton, Inc.T238来自牛脑,99% 纯度,冻干粉

No. 1 硼硅酸盐玻璃盖玻片(22 × 50 mm)购自 VWR。抛光电子级 p 型 <111> 硅片购自Addison Engineering, Inc.。高纯度银漆购自Structure Probe, Inc.(目录号 # 5001 AB)。绝缘细径铜漆包线(~ 0.08 mm(0.003”)直径)可从电子器材供应商处获得。

参考文献

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$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Tubulin Polymerization with GTP/GMPCPP/Taxol [Internet]. , Harvard University. Cambridge, Ma. Available from: http://mitchison.med.harvard.edu/protocols/poly.html (2009).
  2. Flow Cell Assays with Microtubules: Motility/Dynamics [Internet]. , Harvard University. Cambridge, Ma. Available from: http://mitchison.med.harvard.edu/protocols/flowcell.html (2009).
  3. Handbook of Microlithography, Micromachining, and Microfabrication: Microlithography. Rai-Choudhury, P. , SPIE Press. Bellingham, WA. (1997).

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