在本视频文章中,我们介绍了一种利用红外捕获(IR)型激光显微切割技术(LCM)从三龄幼虫中分离单个或多个黑腹果蝇(Drosophila)da神经元的方法。从分离的神经元中获得的RNA可直接用于后续实验,包括定量逆转录PCR(qRT-PCR)或微阵列分析。
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在本视频文章中,我们介绍了一种利用红外捕获(IR)型激光显微切割技术(LCM)从三龄幼虫中分离单个或多个黑腹果蝇(Drosophila)da神经元的方法。从分离的神经元中获得的RNA可直接用于后续实验,包括定量逆转录PCR(qRT-PCR)或微阵列分析。
果蝇外周神经系统(PNS)中的树突分支(da)神经元为研究特定类型树突形态发生的分子机制提供了一个极佳的模型系统1,2。为了促进对特定类型da神经元发育的分子分析,至关重要的是获得高纯度的此类细胞群体。尽管目前已存在多种针对果蝇细胞的细胞或组织特异性RNA分离技术,包括基于磁珠的细胞纯化3,4、荧光激活细胞分选(FACS)5-8以及基于RNA结合蛋白的策略9,但这些方法均难以实现对单个或多个特定类型的果蝇da神经元进行具有高空间精度的分离。激光显微切割(LCM)作为一种极为强大的工具,已可用于从组织切片中以高空间分辨率和准确性分离特定类型的细胞。从分离得到的细胞中提取的RNA,可进一步用于特定细胞类型的分析,包括qRT-PCR和微阵列表达谱分析10-16。迄今为止,LCM在果蝇组织和细胞分析中的应用仍较为有限17,18,包括对三龄幼虫发育阶段的da神经元的研究。
在此,我们展示了优化的小胶质细胞分离方案 果蝇 使用红外(IR)类激光显微切割技术(LCM)分离da神经元。该方法可高特异性、高空间分辨率地捕获单个、特定类别或多个da神经元。选取表达相应标记物的同龄三龄幼虫进行实验。 UAS-mCD8::GFP19 由IV类da神经元特异性启动子调控的转基因 ppk-GAL420 驱动基因或 pan-da 神经元特异性 21-7-GAL421 驱动基因用于这些实验。从分离的da神经元中获得的RNA质量非常高,可直接用于后续应用,包括qRT-PCR或微阵列分析。此外,该LCM方案可轻松调整以捕获其他 果蝇 不同细胞类型在发育的各个阶段,依赖于细胞类型特异性 GAL4-GFP的驱动表达模式
激光显微切割(LCM)的一般注意事项 果蝇 外周神经元
根据组织类型和所需细胞数量,激光显微切割(LCM)的时间可从6小时到一周甚至更长时间不等。
所有操作均在严格无RNA酶的条件下,按照标准流程进行。本实验使用了表达 21-7-GAL4,UAS-mCD8::GFP 或 ppk-GAL4,UAS-mCD8::GFP 转基因报告基因品系的幼虫。
1. 幼虫的准备
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本文所述方案介绍了我们通过激光显微切割(LCM)分离 Drosophila 外周神经元的优化方法。尽管该LCM方案专为从三龄幼虫发育阶段特异性分离单个、类别特异或多个 Drosophila da神经元而设计,但对该方案进行轻微修改后,即可轻松适用于利用不同的 GAL4,UAS-mCD8-GFP 报告转基因标记并捕获各发育阶段的其他 Drosophila 细胞类型。我们的结果表明,通过激光显微切割获取的da神经元RNA质量极高,可直接用于qRT-PCR或基于微阵列的分析。该方案的应用不仅限于本文讨论的野生型目标细胞的捕获,还可将LCM与功能缺失(UAS-RNAi)和/或功能获得研究相结合,利用 GAL4/UAS 系统在特定细胞类型中开展研究。
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感谢 Yuh-Nung Jan 博士和 Wes Grueber 博士提供本研究中使用的果蝇品系,感谢 Virginia Espina、Emanuel Petricoin 博士和 Lance Liotta 博士在激光显微切割技术(LCM)方面的协助。作者感谢 Thomas F. 和 Kate Miller Jeffress 纪念信托基金对本研究的支持(D.N.C.),以及乔治梅森大学校长办公室(E.P.R.I.)的支持。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 10倍浓度磷酸盐缓冲液(PBS) | MP Biomedicals | PBS10X02 | 稀释至1X工作液 |
| 2.5% 胰蛋白酶 | Sigma-Aldrich | T1426 | |
| RNase-AWAY | Sigma-Aldrich | 83931 | |
| 二甲苯,组织学级 | Fisher Scientific | X3S-4 | |
| 无RNA酶水 | Fisher Scientific | BP561-1 | |
| 最佳切割温度(OCT)包埋剂 | Tissue-Tek | 4583 | |
| PicoPure RNA 提取试剂盒 | Molecular Devices | KIT0204 | 遵循制造商说明’s 指令 |
| 带圆顶盖的薄壁反应管 | 应用生物系统公司 | N8010611 | |
| ExtracSure 样本提取装置 | Molecular Devices | LCM 0208 | |
| CapSure HS 胶帽样本提取用孵育块 | Molecular Devices | LCM0505 | |
| CapSure HS 激光显微切割帽和ExtracSure样本提取装置的对齐托盘 | Molecular Devices | LCM0504 | |
| CapSure HS LCM 帽盖 | Molecular Devices | LCM0213 | |
| 75x100 毫米载玻片 | Fisher Scientific | 12-544-3 | |
| 组织包埋模具 | Fisher Scientific | NC9642669 | |
| 适用于1.5 ml微量离心管的聚丙烯研磨杵 | USA Scientific, Inc. | 1415-5390 | |
| 70% 乙醇;95% 乙醇;100% 乙醇 | |||
| 干冰 | |||
设备:
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