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评估 秀丽隐杆线虫 幼虫病原菌诱导的死亡率

2025年9月26日

本文内容

摘要

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资料来源: Anderson, Q. L. 人。一种高通量、高含量、液体基 秀丽隐杆线虫 病理学系统。 J. Vis. Exp. (2018年)

该视频演示了一种基于液体的测定,其中转基因秀 丽隐杆线虫 幼虫暴露于微孔板中的病原菌。分泌到培养基中的细菌毒素会诱导宿主压力和死亡。荧光染料对死虫进行染色,允许基于成像的死亡率量化,以评估遗传易感性或耐药性。

方案

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1. 液体杀灭测定设置(基本方案)

注意: 这是针对一种细菌菌株和一种蠕虫来源的方案。

  1. 使用细胞刮刀,从慢杀或SK板中取出 铜绿假单胞菌 ,并重悬于~5mL的S基础中。如果需要,可以扩大规模。使用分光光度计(OD600)测量细菌悬浮液的光密度
  2. 在OD600 ≈ 0.09(3倍终浓度)的S Basal中制备24mL稀释的铜绿假单胞菌原液。每孔的最终含量见 4.6.2,并相应地缩放细菌稀释液的体积。
  3. 加入 21 mL 液体慢杀培养基(3 g NaCl,3.5 g 蛋白胨/L,补充有 CaCl2 和 MgSO4 ,终浓度为 1 mM)。使用多通道移液器,将 45 μL 细菌和培养基转移到 384 孔板的每个孔中。
  4. 将蠕虫从源头清洗到50mL锥形管中,让蠕虫在重力下沉降。吸出上清液至5mL。重悬于总共 50 mL S 基础中。
  5. 重复步骤 1.4 两次。
  6. 使用蠕虫分选机,将大约 22 条蠕虫分选到 384 孔板的每个孔中。
    注意: 该装置将每个蠕虫滴入~1.1μL液体中。22 条蠕虫将达到 25 μL,使总测定体积达到 70 μL/孔。
    1. 每个孔的最终成分由 70 μL 组成。将 45 μL 该体积作为细菌培养基添加(0.03 OD600 细菌在 24 μL S 基础中,以及 21 μL SK 补充有 CaCl2 和 MgSO4)。另外 25 μL 与 22 个蠕虫一起加入。
    2. 如果此处使用的分选机(参见 材料表)不可用,则可以在S Baseal中将蠕虫稀释至终浓度为1 worm / μL,并使用多通道移液器移液25μL /孔。然而,结果可能会表现出更大的变异性。或者,可以使用蠕动液体分配器,如 Leung 及其同事所描述的那样。
  7. 将蠕虫分选到384孔板中后,用透气膜密封板,并将板在25°C下孵育24-48小时。
  8. 在所需时间,使用微孔板清洗机用 S Basal 洗涤 384 孔板共 5 次。
    1. 第二次洗涤后,吸出大部分培养基,留下~20μL。使用微孔板涡旋器剧烈摇动板至少30秒,以松开孔底部的任何碎屑)。
  9. 最终洗涤后,将上清液吸至20μL。加入50μL的0.98μM核酸染色剂(参见 材料表)/384孔板的孔,最终浓度为0.7μM。
  10. 在室温下孵育12-16小时。这种染料只会弄脏死虫。在所需的孵育期后,使用微孔板清洗机清洗板以去除任何多余的污渍(至少洗涤 3 次)。
  11. 对于数据采集,使用分光光度计或自动显微镜对透射光和荧光(531 nm激发和593 nm发射)进行成像。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
COPAS FP 生物分选仪联合生物识别 大型物体流式细胞仪/蜗杆菌分选仪
细胞化 5百泰克  
EL406 洗衣机分配器百泰克  
多创专业版信息器HT  
24 深孔 RB 块赛默飞世尔科技CS15124 
384孔板格雷纳生物一号MPG-781091 
线虫生长培养基 (NGM)  每升量:18 克琼脂、3 克 NaCl、2.5 克蛋白胨、1 mL CaCl₂ (1 M)、1 mL MgSO₄ (1 M)、25 mL 磷酸盐缓冲液和 973 mL 毫 Q 水
慢杀 (SK) 板  每升量:18 克琼脂、3 克 NaCl、3.5 克蛋白胨、1 mL CaCl₂ (1 M)、1 mL MgSO₄ (1 M)、25 mL 磷酸盐缓冲液和 973 mL 毫 Q 水
慢杀 (SK) 培养基  每升量:3 克 NaCl、3.5 克蛋白胨、1 mL CaCl₂ (1 M)、1 mL MgSO₄ (1 M)、25 mL 磷酸盐缓冲液和 973 mL 毫 Q 水
溶原性肉汤 (LB)USB生物生命科学L1520型 
Brian 心脏输液肉汤 (BHI)研究产品国际公司50-488-526 
蠕虫漂白剂溶液  每 100 mL 的量:10 mL 5 M NaOH 溶液、20 mL 5% 次氯酸钠溶液和 70 mL 无菌水
S 基础  每升含量:5.85 克 NaCl、6 克 KH₂PO₄、1 克 K₂HPO₄ 和 1 升毫 Q 水
琼脂USB生物生命科学A0930 
氯化钠USB生物生命科学S5000型 
蛋白胨USB生物生命科学P3300 
钙氯₂USB生物生命科学  
镁质₄费雪科学型号M63-500 
磷酸盐缓冲液  每升用量:132 mL K₂HPO₄ (1M) 和 868 mL KH₂PO₄ (1M)
KH₂PO₄Acros 有机物7778-77-0 
K₂HPO₄USB生物生命科学P5100 
5% 次氯酸钠溶液比卡7495.5-32 
NaOH溶液费雪科学SS255-1型 
轻松呼吸多元化生物科技BEM-1型 
SYTOX 橙色核酸染色剂费雪科学S11368 
菌株   
铜绿假单胞菌 (PA14)   
粪肠杆菌 (OG1RF)   
大肠杆菌 超级食品 (OP50)   
大肠杆菌 表达RNAi的细菌(HT115)   
蠕虫菌株   
glp-4(bn2)(Beanan 和 Strome,1992 年,PMID:1289064)   
PINK-1::GFP 报告者(Kang 等人,2018 年,PMID:29532717)   

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Liquid Killing AssayFluorescent Dye StainingMicroplate IncubationBacterial Toxin ExposureMortality QuantificationGenetic Susceptibility TestingAutomated Microscopy ImagingGas Permeable Membrane

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