细菌生长与技术

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来源：Mercier, N., 等 革兰氏阳性菌中MS2亲和纯化与RNA测序联用技术。J. Vis. Exp.

来源：Mercier, N., et. al., 革兰氏阳性菌中MS2亲和纯化与RNA测序联用技术。 J. Vis. Exp.

来源：Feltwell, T., 等. 利用不连续密度梯度按荚膜含量分离细菌。J. Vis. Exp.

来源：Gupta, S., Marcela Rodriguez, G. 铁限制条件下分枝杆菌产生细胞外囊泡的分离与表征。 J. Vis. Exp. (2019)本视频展示了从在模拟宿主环境的限铁条件下培养的结核分枝杆菌（Mycobacterium...

来源：Watson, D. C., et.al. 大肠杆菌及其他细菌来源细胞外囊泡的可扩展分离与纯化. J. Vis. Exp.

来源：Watson, D. C., 等. 从大肠杆菌及其他细菌中可扩展地分离与纯化细胞外囊泡. J. Vis. Exp.

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来源：Ghadigaonkar, D. 和 Rath, A. 水源性抗生素耐药细菌的分离与鉴定及其抗生素抗性基因的分子表征。J. Vis. Exp.

来源：Kazi, M. I., 等.，利用高通量测序技术构建革兰氏阴性菌转座子插入文库。 J. Vis. Exp.

来源： Fernández-Coll, L. 和 Cashel, M. 利用微量滴定板放射性标记结合薄层色谱法对大肠杆菌（Escherichia coli）中 (p)ppGpp 进行多项活体测定。J. Vis. Exp. (2019)本视频介绍了一种利用薄层色谱法（TLC）高通量检测细菌应激反应核苷酸 ppGpp 和 pppGpp 水平及其动态变化的实验方案。该方法能够快速、经济且高效地定量分析在不同应激条件下细菌培养物中的 (p)ppGpp...

来源：Streather, B. R., et al. 大肠杆菌来源的重组蛋白填充囊泡的优化制备与分析。J. Vis. Exp.

来源：Shivaiah, K., et al. 从植物叶片组织和蓝细菌中分离质体小球脂滴。J. Vis. Exp.

来源：Armbruster, K. M., Meredith, T. C. 细菌脂蛋白的富集及用于质谱结构测定的N端脂肽制备。J. Vis. Exp.

来源： Leuthold, M. M., 等 人诺如病毒突出域的制备 E. coli 用于X射线晶体学。 J. Vis. Exp.

来源：Kuo, T., et al. 一步法负向色谱纯化在Escherichia coli中过表达的Helicobacter pylori中性粒细胞激活蛋白（批处理模式）。J. Vis. Exp.

来源：Murata, T., 等. 变形链球菌中一种高分子量蛋白的纯化. J. Vis. Exp. (2019)本视频演示了从Streptococcus...

来源： Venuprasad, K., 等 经气管给药 流感嗜血杆菌 在小鼠模型中研究气道炎症。 视频实验杂志 (2016)本视频展示了从感染了无荚膜型细菌的安乐死小鼠中收集和处理支气管肺泡灌洗液的过程 流感嗜血杆菌...

来源： Ginies, C., 等 脂肪酸的鉴定 Bacillus cereus. 视频实验杂志...

来源：Shivaiah, K., 等．从植物叶片组织和蓝细菌中分离质体小球脂滴．J. Vis. Exp.

从革兰氏阴性耶尔森菌属（Yersinia）菌种以及非耶尔森菌属的肠杆菌科（Enterobacteriaceae）培养物开始。使用无菌接种针，将培养物点种于传统的头孢磺啶-碘乙酰胺-新生霉素（Cefsulodin-Irgasan-Novobiocin）或CIN琼脂以及改良CIN琼脂上。孵育平板以促进细菌生长。传统CIN琼脂和改良CIN琼脂均支持细菌生长 耶尔森菌 和非耶尔森菌 肠杆菌科 发酵甘露醇产生酸性副产物。酸的产生会降低pH值，引发颜色变化，从而形成具有特征性红色中心的菌落形态。改良的CIN琼脂含有额外的底物，可检测非典型表达的特定酶活性耶尔森菌 科肠杆菌科.这些细菌代谢底物，导致 pH 值变化或色素生成，从而改变菌落的形态。相比之下， 耶尔森菌 物种保持其特征性的红色中心外观。因此，改良的CIN琼脂能够区分 耶尔森菌 物种和非耶尔森菌 科肠杆菌科...

从含有细菌群落的湿地土壤来源富集培养物开始。该培养物表现出铁氨氧化（Feammox）活性，即铵的氧化与三价铁还原相耦合，表明已富集到能够进行此种代谢过程的细菌。使用培养基对菌液进行连续稀释。将稀释后的样品划线接种于添加了三价铁和铵盐的测试琼脂平板上。使用缺乏铁离子或铵根离子的对照平板，或含有铁离子和有机碳但不含铵根离子的对照平板，以排除通过非Feammox途径发生的铁还原反应。将所有培养皿置于含有氮气-二氧化碳混合气体的厌氧手套袋中孵育。在测试平板上，仅那些在将铵氧化的同时将三价铁还原为二价铁的细菌才会形成灰色菌落。这证实了富集培养物中存在Feammox细菌。在测试平板上利用Feammox副产物或在对照平板上利用有机碳的其他细菌不会形成灰色菌落。分离灰色菌落并进行转接培养，以供进一步分析。...

来源：Becker, B., et al．一种基于荧光报告基因的简易检测方法，用于鉴定酵母中蓖麻毒素A链（RTA）转运所需的细胞组分．J. Vis. Exp.

来源：Wunderlin, T., et al. 通过靶向裂解营养细胞从环境样本中物理分离芽孢。 J. Vis. Exp.

来源：Gulla, S., 等. 利用多重PCR和毛细管电泳对鱼类致病性细菌Yersinia ruckeri进行多位点可变数目串联重复序列分析。J. Vis. Exp. (2019)。本方案通过将分离的菌落悬浮于超纯水中并加热裂解细胞，从而提取Yersinia...

来源：Gulla, S., 等. 利用多重PCR和毛细管电泳对鱼类致病性细菌Yersinia ruckeri进行多位点可变数目串联重复序列分析。J. Vis. Exp. (2019)。本方案通过将分离的菌落悬浮于超纯水中并加热裂解细胞，从而提取 Yersinia ruckeri...

来源：Stones, D. H., 等. 用于表征细菌-宿主相互作用的仿生材料. J. Vis. Exp.

来源：Jung, A. L. 等.，《嗜肺军团菌外膜囊泡：分离及其对巨噬细胞促炎潜力的分析》。视频实验杂志（2017）本视频展示了用嗜肺军团菌（Legionella pneumophila）外膜囊泡（OMVs）对巨噬细胞进行预处理，以研究其对细菌复制的影响。OMVs通过改变宿主免疫信号通路，使巨噬细胞更易于被感染。与未处理细胞相比，处理细胞中更高的菌落计数表明，OMVs可促进嗜肺军团菌（L.

来源：Jagau, H. 等. 肺炎链球菌在恒定流体条件下感染原代人血管内皮细胞. J. Vis. Exp.

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来源：Li, J. et al. 建立幼年斑马鱼感染模型用于研究Clostridioides difficile。 J. Vis. Exp. (2020)本视频演示了通过显微注射将荧光标记的Clostridioides...

来源：Cruz-Adalia, A., et al. T细胞通过树突状细胞的转感染捕获细菌。J. Vis. Exp.

来源： Balczon, R., 等 检测肺内皮细胞感染后细胞毒性淀粉样蛋白的方法 铜绿假单胞菌. 实验视频杂志 (2018)本视频演示了铜绿假单胞菌（Pseudomonas...

来源：Lee, H. et. al., 利用分裂绿色荧光蛋白系统可视化细菌感染过程中递送的效应蛋白。J. Vis. Exp.

来源： Islam, A., 等人， 新生儿肠道转胞吞作用的评估 大肠杆菌 菌血症分离株 视频实验杂志 (2023)本视频演示了评估新生期跨细胞转运的实验步骤 大肠杆菌...

来源：Anderson, Q. L., 等。一种高通量、高内涵、基于液体的C. elegans病理系统。J. Vis. Exp. (2018)该视频展示了一种基于液体的检测方法，其中将基因改造的C.

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来源：Sorokulova, I.，等。利用Bacillus subtilis菌株预防热应激对大鼠的不良影响。J. Vis. Exp.

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来源： Venuprasad, K., 等气管内给药 流感嗜血杆菌 在小鼠模型中研究气道炎症。 视频实验杂志...

来源： Taylor, M. N., 等。 利用单条线虫数据量化异质性 秀丽隐杆线虫- 细菌相互作用 视频实验杂志 (2022)本视频展示了将无菌且年龄匹配的Caenorhabditis...

来源： Taylor, M. N. 等 利用单条线虫数据量化异质性 秀丽隐杆线虫- 细菌相互作用 视频实验杂志 (2022)本视频展示了通过机械裂解法对单个秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis...

内生细菌定殖于植物组织并促进植物生长。为了研究盐胁迫下对番茄植株生长的影响，需从具有发育中叶片和根系的无菌幼苗开始。将实验幼苗的根部浸入内生细菌悬液中；对照组不接种。将两组均转移至灭菌土壤中，以防止外部微生物干扰，并在生长室中进行培养。细菌从土壤中通过根部短暂的开口进入，定植于植物内部组织，并扩散至其他植物部位。重新施加菌悬液以加强定植。每隔一天施加一次氯化钠溶液，以在两组中诱导逐步加重的盐胁迫。盐胁迫会触发活性氧（ROS）的产生，从而损伤植物细胞。内生菌通过产生清除活性氧的酶，并提供植物生长所需的植物激素和微量元素，从而缓解胁迫。孵育后，实验组幼苗继续保持生长，而对照组则表现出发育停滞。...

取溶磷细菌（PSB）和紫色非硫细菌（PNSB）的菌种混合物。将混合物喷洒到混有肥料和牛粪肥的土壤上。播种并用土壤覆盖。让植物生长。细菌定位于根部附近一个称为根际的区域。PSB 将不溶性土壤磷酸盐转化为可溶性形式。与此同时，光合细菌（PNSB）通过将大气中的氮气转化为氨来固定氮。植物吸收可溶性磷酸盐和氨，从而促进其生长。此外，光合细菌（PNSB）会分泌植物激素或促进植物生长的物质，进一步支持植物生长。PNSB...

从在黑暗、无菌条件下预先萌发的水稻幼苗开始，以确保出苗整齐一致。将这些幼苗转移至含有已接种测试细菌的营养丰富半固体培养基的锥形瓶中。随着植物的生长，根部会向周围培养基中释放趋化性化合物。这些化合物促进细菌增殖，导致细菌在根部表面黏附、繁殖并形成菌落。随着根系的发育，细菌通过自然开口和细胞间隙进入植物体内。进入植物体内后，细菌会在植物的根部和茎部形成内生菌落。随着时间的推移，这些菌落与植物组织形成稳定的关系，并开始产生抗菌化合物。接下来，将幼苗转移至模拟自然环境条件的温室中。随着植物的生长，内生细菌产生的抗菌化合物作为生物防治剂，保护幼苗免受环境中有害微生物的侵害。...

来源：Ocean E. Clarke1, Romy A. Dop1, Tom Hasell1, Joanne L. Fothergill1, Daniel R. Neill21利物浦大学,...

来源： Arroyo, M. C., 等 评估合成细菌群落在其上的存活能力 体外 肠道宿主-微生物界面 视频实验杂志...

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来源： Zhang, X., 等斑马鱼胚胎体内可视化与活体分析生物材料相关性的模型 金黄色葡萄球菌 感染。 视频实验杂志 (2019)本视频展示了注射了金黄色葡萄球菌（Staphylococcus...

来源：Schlimpert, S. 等。利用微流控装置对S. venezuelae完整生命周期进行荧光延时成像。J. Vis. Exp. (2016)本视频展示了利用微流控装置对细菌Streptomyces...

来源：Bru, J., 等. 细菌群游与集体应激反应的延时成像. J. Vis. Exp. (2020)本视频演示了如何利用群集琼脂平板实验对铜绿假单胞菌（Pseudomonas...

来源： Heering, J., 等细胞分化诱导与单细胞成像 副溶血性弧菌 游动细胞与群集细胞 J. Vis. Exp. (2017).本视频演示了从一株 Vibrio parahaemolyticus...

来源： Bennett, J. A. 等人 视觉与显微镜评估 链霉菌属 发育突变体 J. Vis. Exp. (2018)本视频展示了利用相差显微镜观察野生型与突变型Streptomyces...

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来源：Pioli, R., et al., 通过连续毛细辅助组装实现微生物与微粒的图案化。 J. Vis. Exp. (2021)本视频演示了使用无碳悬浮液和可控流体，通过微流控捕获装置捕获单个荧光标记的大肠杆菌（Escherichia...

来源： 文，J.，帕斯曼， 等人， 芽孢体及内膜的可视化 枯草芽孢杆菌 孢子。 视频实验杂志...

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来源： Chetrit, D., 等结合活细胞成像与冷冻电子断层扫描技术解析细胞时空动态特征 嗜肺军团菌 Dot/Icm 分泌系统 视频实验杂志 (2020)本视频展示了利用活细胞荧光成像技术定量分析嗜肺军团菌（Legionella...

来源： Chetrit, D., 等结合活细胞成像与冷冻电子断层扫描技术解析细胞时空特征 嗜肺军团菌 Dot/Icm 分泌系统 视觉实验杂志. (2020)该视频介绍了通过结合细菌培养、金纳米颗粒标记和玻璃化冷冻技术，制备嗜肺军团菌（Legionella...

来源：Weber, N., 等，丝状蓝细菌Phormidium lacuna的自然转化、蛋白表达与低温保存。J. Vis. Exp. (2022)本视频演示了通过将丝状培养物匀浆以制备均匀悬浮液、在显微镜载玻片上准备培养皿检测装置以及观察丝状物运动，来评估Phormidium...

来源：Sorokulova, I., 等。利用Bacillus subtilis菌株预防热应激对大鼠的不良影响。J. Vis. Exp. (2016)本视频展示了用于评估保护作用的组织学和血液显微镜分析方法 枯草芽孢杆菌...

来源： Chaimovitz, E. A., 等 生物噪声的连续测量 大肠杆菌 使用延时显微镜技术 视频实验期刊. (2021)本视频通过使用延时显微镜追踪细菌生长和分裂过程中绿色荧光蛋白（GFP）荧光强度的波动，实现了对大肠杆菌（E.

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来源：Schlimpert, S.，等．利用微流控装置对S. venezuelae完整生命周期进行荧光延时成像．J. Vis. Exp. （2016）本视频展示了从委内瑞拉链霉菌（Streptomyces...

来源： Heering, J., 等细胞分化诱导与单细胞成像 副溶血性弧菌 游动细胞与群集细胞 视频实验杂志 (2017)本视频展示了利用特殊制备的琼脂培养基诱导副溶血性弧菌（Vibrio...

来源：Li, J., et. al.，建立幼年斑马鱼感染模型用于研究Clostridioides difficile。J. Vis. Exp.（2020）本视频展示了从幼年斑马鱼肠道中分离和培养Clostridioides...

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来源： Bhaduri, S., 等人， 微生物诱导的碳酸钙沉淀 Sporosarcina pasteurii 视频实验杂志 (2016)本视频演示了利用尿素和氯化钙富集尿素芽孢杆菌（Sporosarcina...

来源：Figueroa, D. M., 等. 抗菌肽定位表征中细菌球状体与原生质体的制备与可视化。J. Vis. Exp. (2018)本视频演示了通过首先抑制大肠杆菌（Escherichia coli）细胞分裂以诱导丝状化，随后进行细胞壁的酶解，从而制备大肠杆菌球状体的方法。该过程包括可控地添加螯合剂、DNase...

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来源：Naji, A., 等. 研究缓症链球菌群在秀丽隐杆线虫中引起的氧化应激.J. Vis. Exp. (2019).本视频演示了在微需氧条件下使用含酵母提取物的托德-休伊特（Todd-Hewitt Yeast Extract，THY）琼脂培养基培养Streptococcus...

来源： Venuprasad, K. 等人， 经气管给药 流感嗜血杆菌 在小鼠模型中研究气道炎症。 视频实验杂志 (2016)本视频展示了不可分型流感嗜血杆菌的培养方法 流感嗜血杆菌...

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来源：Wiegand, D. J., Lee, 等, 利用快速生长的细菌Vibrio natriegens进行无细胞蛋白表达。 J. Vis. Exp. (2019)本视频展示了在通气条件下培养和收获快速生长的细菌——Vibrio...

来源： Wiegand, D. J., 等人无细胞蛋白表达利用快速生长的细菌 Vibrio natriegens 视觉实验杂志. (2019).本视频演示了从生长迅速且以高蛋白合成速率著称的细菌Vibrio...

来源： Wiegand, D. J., 等 利用快速生长细菌进行无细胞蛋白表达 Vibrio natriegens 视频实验杂志 (2019).本视频展示了利用基于Vibrio...

来源： Jian, X., et al., 利用微生物微滴培养系统（MMC）实现微生物自动化培养与适应性进化。J. Vis. Exp.

来源：Weber, N., 等，丝状蓝细菌Phormidium lacuna的自然转化、蛋白表达与低温保存。J. Vis. Exp.

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来源： Lea-Smith, D. J., et al. 模式蓝细菌物种中标记型与无标记突变体的构建. J. Vis. Exp.

从一个厌氧消化器开始，该消化器是一个密封的无氧反应器，接种了模拟废水中沉降固体的合成污泥。污泥中含有嗜中温厌氧微生物，这是一种混合微生物群落。这些微生物在中等温度下生长旺盛，并推动污泥中有机物的分解。持续搅拌污泥以维持细菌活性并促进消化。随后，将可生物降解的聚合物——即生物塑料——加入污泥中。孵育期间，水解细菌会附着在生物塑料上，并将其转化为可溶性化合物。发酵细菌随后将这些化合物转化为挥发性脂肪酸，即短链有机酸。产甲烷菌是一类产生甲烷的微生物，可利用这些酸生成甲烷气体和二氧化碳，从而形成沼气。沼气通过出口从反应器中排出，并收集到气体采样袋中。这种共消化方法能够将生物塑料和污泥高效地转化为可再生的生物燃气。...

从一个浊度恒定器开始，这是一种在培养过程中维持恒定细胞密度的装置。该装置包含一个装有细菌培养物的容器，通过搅拌持续通气，并保持恒定温度。激光二极管发射出一束光，该光束被分为两条光路。一条光路导向参考传感器以监测激光强度波动，另一条则穿过培养物。细菌细胞会散射和吸收光线，从而降低透射光强度，该变化可被第二个传感器检测到。这种强度的降低反映了细菌浓度，并以光密度（OD）来测量。当OD超过目标阈值时，泵会添加新鲜培养基以稀释培养物。同时，空气泵通过流出管去除多余的培养基，以维持恒定的体积。一种数学算法持续分析光学数据，以估算细菌的生长速率。...

从受石油污染的土壤中分离出一株Pseudomonas aeruginosa细菌，将其接种于含有氮源和过量食用油作为碳源的培养基中开始培养。该菌株可合成聚羟基烷酸酯（PHA），这是一种可用于生产生物塑料的长链聚合物。在振荡条件下孵育，以促进通气并促进细菌生长。最初，培养基提供碳源和氮源，以支持细菌增殖并产生高生物量。在细胞大量生长后，培养基中的氮耗尽会停止细胞进一步分裂，并将多余的碳源转向聚羟基脂肪酸酯（PHA）的生物合成。细菌分泌脂肪酶，将油分解为脂肪酸，这些脂肪酸被细胞内酶代谢为聚羟基脂肪酸酯（PHA）前体。PHA 合成酶将这些前体聚合为 PHA。PHA...

从一培养物开始，该培养物为Alishewanella，一种革兰氏阴性、耐盐细菌。接下来，将菌液划线接种到含有不同浓度氯化钠的琼脂平板上，以模拟不同程度的盐胁迫。用一层未凝固的培养基覆盖每个培养皿，以防止氧气扩散，使培养物保持在限氧环境中。密封平板并在适宜温度下孵育，以促进细菌生长。孵育期间，该细菌在不同氯化钠浓度的平板上表现出不同的生长速率。该细菌通过渗透调节机制发展出耐盐性，例如积累相容性溶质以平衡细胞内渗透压、通过主动离子转运维持细胞功能，以及表达耐盐酶和分子伴侣蛋白。在低至中等盐度下生长...

来源： Arias, S. L., et al．利用氧化铁纳米颗粒制备功能化磁性细菌纳米纤维素． J. Vis. Exp.

来源： Brumfield, K. D. 等 用于维持和区分生物型的实验室技术 霍乱弧菌 临床与环境分离株 视频实验杂志...

来源： Schumacher, D., 等荧光活细胞成像技术观察生长缓慢的社会性细菌完整营养细胞周期 黏球菌属黄色黏球菌。J. Vis. Exp. (2018)本视频演示了黏球菌（Myxococcus...

来源： 杨志， 等一种用于高通量筛选的平台 沙门氏菌 种（spp.）志贺氏菌 spp. 视频实验杂志 (2018)本视频展示了选择性富集与鉴定 沙门氏菌 使用木糖赖氨酸脱氧胆酸盐（XLD）和显色琼脂。亚硒酸盐肉汤可促进 沙门氏菌...

来源：Jeong, H., et. al．利用恒化器进行微生物适应性实验室进化的实验方案．J. Vis.

来源：Villela, H. D. M., 等. 用于共生体研究与保护的生物修复及益生菌开发微生物菌株筛选。JoVE 实验视频杂志...

来源：Villela, H. D. M.，等．用于共生体研究与保护的生物修复与益生菌开发中的微生物菌株筛选．J. Vis. Exp.

来源： 贝伦斯，C. 等 应用可诱导表达系统研究细菌毒力因子对细胞内信号通路的干扰 视频实验杂志 (2015)本视频演示了利用可诱导表达系统来确定细菌效应蛋白 CaeB 在宿主细胞凋亡级联反应中的干扰位点。该方法概述了使用四环素响应系统转染表达 CaeB...

来源：Wei, D., 等，利用竹水解物为底物通过Klebsiella pneumoniae生产化学品。J. Vis. Exp. (2017)本视频展示了在微氧和弱酸性条件下，通过在基于水解物的培养基中培养 Klebsiella...

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来源：Becker, B., et al. 一种基于荧光报告基因的简易检测方法，用于鉴定酵母中蓖麻毒素A链（RTA）转运所需的细胞组分。 J. Vis. Exp. (2017)本视频演示了在大肠杆菌（Escherichia...

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来源：Zhang, X. et. al., 一种用于活体可视化和原位分析生物材料相关Staphylococcus aureus感染的斑马鱼胚胎模型。J. Vis. Exp. (2019)本视频展示了一种用于研究与植入性生物材料相关感染的斑马鱼胚胎模型。通过显微注射 金黄色葡萄球菌...

来源： Yeung, M. 等 一种用于检测的更敏感且特异的显色培养基的开发 副溶血性弧菌 及其他 弧菌 物种。 视频实验杂志...

来源： Al Ahmar, R. 等小型菌落变体的培养 铜绿假单胞菌 及其海藻酸盐的定量 视频实验杂志 (2020)本视频演示了一种比色法，用于定量铜绿假单胞菌（Pseudomonas...

来源： Al Ahmar, R., 等小型菌落变体的培养 铜绿假单胞菌 及其海藻酸盐的定量 视频实验杂志 (2020)本视频演示了一种比色免疫测定法，用于定量分析铜绿假单胞菌（Pseudomonas...

来源： Hassan, J. A., 等 高通量鉴定抗性 Pseudomonas syringae pv. tomato 利用幼苗淹水法在番茄中进行检测。 J. Vis. Exp.

来源：Anderson, Q. L. 等 一种高通量、高内涵、基于液体的C. elegans病害系统。J. Vis. Exp. (2018)本视频展示了一种利用Caenorhabditis...

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来源：Cheng, C., 等．利用可见光光解核黄素-5′-磷酸盐使病原体失活．J. Vis. Exp. (2022)。在本视频中，含有...

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来源： Vidilaseris, K., 等筛选 Thermotoga maritima 膜结合型焦磷酸酶抑制剂 视频实验杂志 (2019)本视频演示了一种比色法检测，通过定量测定正磷酸盐的释放来筛选细菌膜结合型焦磷酸酶（mPPase）的抑制剂。该方法可用于鉴定抑制海栖热袍菌（Thermotoga...

来源： Sarathy, J. P. 等 一个 体外 预测药物在结核病病灶中渗透性的酪蛋白结合测定法 视频实验杂志...

来源： Rugjee, K. N. 等人， 建立高通量筛选体系用于发现调控c-di-GMP信号通路的小分子 铜绿假单胞菌. 视频实验杂志 (2016)本视频展示了利用电穿孔法在Pseudomonas...

来源： Rugjee, K. N., 等建立高通量筛选体系用于发现调控c-di-GMP信号通路的小分子 铜绿假单胞菌. 视频实验杂志...

来源：Chapman, I. J., 等，利用流式细胞术优化分子探针以测定光合生物（Microcystis aeruginosa）的细胞死亡率。J. Vis. Exp. (2016)本视频演示了区分活细胞与死细胞的方法 Microcystis aeruginosa...

来源：Nickling, J. H., 等. 通过选择性压力掺入非常规氨基酸产生的抗菌肽。 J. Vis. Exp. (2018)本视频演示了一种用于评估乳链菌肽变体抗菌活性的琼脂孔扩散实验。实验展示了表达膜结合肽酶 NisP 的Lactococcus lactis如何激活在E.

来源：Tokunou, Y., 等，电化学检测重氢动力学同位素效应对Shewanella oneidensis MR-1胞外电子传递的影响。J. Vis. Exp.

来源： Dodge, R., et al. 适用于Drosophila微生物组的96孔板快速菌落形成单位计数法。J. Vis. Exp. (2023)本视频展示了与肠道相关的细菌菌落形成单位（CFUs）的定量方法 果蝇...

来源： Maurakis, S., 等金属限制条件下的生长 淋病奈瑟菌 用于表征金属响应基因及从宿主配体获取金属的研究。 视频实验杂志.

来源： Maurakis, S.，和 Cornelissen, C. N. 金属限制条件下的生长 Neisseria gonorrhoeae 用于表征金属响应基因及从宿主配体获取金属的研究。 视频实验杂志 (2020)本视频演示了检测细胞表面金属转运蛋白的实验步骤 淋病奈瑟菌...

来源：Chen, Y., 等，利用功能获得性报告系统测量特异性分枝杆菌错译率。J. Vis. Exp. （2019）本视频演示了一种利用可诱导的 GFP 和分泌型突变荧光素酶报告系统，定量分析Mycobacterium smegmatis中翻译错误的方法。该方法展示了如何测量由翻译错误产生的发光信号，并将其与 GFP...

来源： Gilmore, S. F. 等 无细胞规模化生产及佐剂添加至一种重组主要外膜蛋白 Chlamydia muridarum 用于疫苗开发。 J. Vis. Exp.

来源： Stefan, A., 等. 蛋白质共表达的多重优势 大肠杆菌. 视频实验期刊. (96),...

来源：Jian, X. et. al., 利用微生物微滴培养系统（MMC）实现微生物自动化培养与适应性进化。J. Vis. Exp.

在多孔板中取一培养物，该培养物为携带质粒的Corynebacterium glutamicum，该质粒在其核糖核酸抗终止子（RAT）序列下游带有荧光报告基因。转录过程中，RAT-RNA 形成茎环结构，阻断 RNA 聚合酶，从而停止报告基因的表达。该质粒还组成型表达 LicV，这是一种融合蛋白，由 RAT-RNA 结合蛋白 LicT 和对蓝光敏感的 VVD 结构域组成。在黑暗条件下，LicV 保持单体状态，不能结合 RAT-RNA...

从含有经银纳米颗粒处理的细菌细胞的悬浮液开始，该悬浮液存在于胞外多糖基质中。向悬浮液中加入磷酸盐缓冲液以维持稳定的 pH...

对细菌培养物进行连续稀释，并将等分试样加入含有比色培养基的量热小瓶中。将密封的小瓶装入等温微量热仪的多孔板中，以测量代谢产热。该设备保持恒定温度，以确保检测到的热量完全来源于细菌代谢。当细菌代谢营养物质并增殖时，会释放热量，传感器可实时检测到这些热量。同时，将相同的试管放入培养箱中孵育。使用分光光度计测量光密度（OD）以监测细菌生长情况。利用稀释过程中的量热信号，构建热活性曲线，并将其与OD值进行关联。明显的第一个峰表明在指数生长期发生了有氧呼吸。当氧气变得受限时，细胞会转向无氧发酵，产生第二个明显的峰值。进入稳定期后，细菌会分泌酶以降解胞外蛋白质并维持代谢，从而产生一个宽峰。...

来源： Ali, I., 等 高通量筛选影响微生物分离物 秀丽隐杆线虫 健康。 视频实验杂志 (2022)本视频展示了一种高通量荧光检测方法，用于评估肠道细菌对秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis...

来源： Sutlief, A. L., 等活细胞剪切应力分析 铜绿假单胞菌 使用自动化高通量微流控系统。 J. Vis. Exp.

来源： Brumfield, K. D., 等用于维持和区分生物型的实验室技术 霍乱弧菌 临床与环境分离株 视频实验杂志 (2017)本视频演示了一种使用氯化三苯基四氮唑的软琼脂实验，通过观察活跃迁移细胞周围红色区域的形成来可视化代谢活性，从而评估和比较霍乱弧菌（Vibrio...

来源： Brumfield, K. D., 等用于维持和区分不同生物型的实验室技术 Vibrio cholerae 临床与环境分离株 视频实验杂志 (2017).本视频演示了伏格斯-普罗科菲耶夫（Voges-Proskauer，VP）试验，用于区分霍乱弧菌（Vibrio...

来源：Mettrick, K. A., Lawrence, 等，利用荧光阻遏蛋白-操纵子系统在E. coli中诱导位点特异性复制阻滞。J. Vis. Exp. (2016)本视频展示了利用阿拉伯糖诱导表达黄色荧光蛋白标记的TetR蛋白结合染色体上tetO阵列，从而在Escherichia...

来源： Domesle, K. J., 等环介导等温扩增用于筛查 沙门氏菌 动物饲料中的检测与确认 沙门氏菌 从培养分离。 视频实验杂志.

来源： Aigrain, L., et al. 通过电穿孔法实现活体微生物中荧光生物分子的内化与观察。 J. Vis. Exp. (2015)该视频演示了利用电穿孔技术将荧光生物分子导入电感受态微生物细胞的过程。首先，将带有荧光标记的 DNA...

来源：Kurokawa, M., et al．细菌生长的精确高通量分析．J. Vis. Exp.

来源： Dahl, J. 等 pH依赖性活性的检测 大肠杆菌 分子伴侣 HdeB 体外 和 在体 内. 视频实验杂志...

来源： Dahl, J., 等pH依赖性活性的检测 大肠杆菌 分子伴侣 HdeB 体外 和 体内. 视频实验杂志 (2016)本视频展示了利用重组大肠杆菌（E.

来源： Stenum, T. S., 等 转运RNA丰度及其氨酰化水平的定量分析 大肠杆菌. 视频实验杂志 (2017)本视频演示了如何通过分离氨酰化和去氨酰化的tRNA形式，利用凝胶电泳和RNA印迹技术来检测和比较大肠杆菌（E.

来源：Gulla, S.，等．通过多重PCR和毛细管电泳对鱼类致病性细菌Yersinia ruckeri进行多位点可变数目串联重复序列分析．J. Vis.

来源：Hockett, K. L., 和 Baltrus, D. A. 利用软琼脂覆盖法筛选细菌产生的抑制性化合物。J. Vis. Exp.

来源： Cabeen, M. T., 等单细胞微流控分析 芽孢杆菌属 subtilis. J. Vis. Exp.

来源：Scheidweiler, D., et al. 结合微流控装置与显微镜和流式细胞术研究多孔介质中跨空间尺度的微生物迁移。 J. Vis. Exp.

来源：Kim, H. et. al., 利用高通量遗传酶筛选系统进行多酶筛选。J. Vis. Exp.

来源： Samuels, D. J., 等 一种基于串联液相色谱-质谱法的代谢物分析方法 金黄色葡萄球菌. 视频实验杂志 (2017)本视频演示了使用液相色谱-质谱联用技术鉴定和定量金黄色葡萄球菌（S.