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使用逐步蔗糖离心法制备病毒富集悬液

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2026年9月30日

本文内容

摘要

来源: Vijayraghavan, S. 和 Kantor, B. 一种用于分裂细胞中CRISPR/Cas9介导基因敲除的整合酶缺陷型慢病毒载体的生产方案。J. Vis. Exp.,(2017)

本视频演示了一种利用蔗糖梯度和蔗糖垫进行两步超速离心的方法,用于从细胞培养上清液中纯化和浓缩病毒颗粒。该方法基于浮力密度实现分离,可回收完整的病毒,适用于后续应用。

方案

1. 通过超速离心浓缩病毒颗粒

注意:我们采用双蔗糖纯化法,该方法包括两个步骤:蔗糖梯度步骤和蔗糖垫层步骤(图1)。

  1. 按以下顺序向锥形超速离心管中加样以形成蔗糖梯度:0.5 mL 70% 蔗糖(溶于1×磷酸盐缓冲液[PBS]),0.5 mL 60% 蔗糖(溶于DMEM),1 mL 30% 蔗糖(溶于Dulbecco改良Eagle培养基[DMEM]),以及2 mL 20% 蔗糖(溶于1× PBS)。
  2. 小心地将含病毒的上清液加至梯度中。由于来自四个15 cm培养皿的上清液总体积为100 mL,每次离心使用六根超速离心管以处理全部体积的病毒上清液。
    1. 本步骤所用的每根超速离心管最大容量为30 mL(包括蔗糖体积)。将病毒上清液等量分配至各管中,并至少保留10%的顶部空间以防止溢出。
    2. 当每次实验使用超过四个15 cm培养皿时,应将每块培养皿的培养液体积调整至约20–22 mL,以便最终汇集的病毒上清液总体积可轻松容纳于六根超速离心管中。
    3. 超速离心管的填充体积应至少达到其总容量的四分之三,否则在离心过程中可能发生管体破裂,导致样品损失和/或设备损坏。
  3. 用1× PBS平衡离心管,并在17 °C下以70,000 × g离心2小时
    注意:为防止加速过程中破坏蔗糖层,应将超速离心机设置为在离心开始的前3分钟内缓慢加速转子至200 rpm。同样,在离心结束时,应在3分钟内将转子从200 rpm缓慢减速至0 rpm。
  4. 小心收集30–60%蔗糖组分至洁净离心管中(图1)。向汇集的组分中加入冷的1× PBS,调节总体积至100 mL;通过反复吹打混匀数次。
  5. 通过将病毒样品小心地铺在蔗糖垫上,进入蔗糖垫层步骤。具体操作为:向每根离心管中加入4 mL 20%蔗糖(溶于1× PBS),然后每管加入约20–25 mL病毒溶液。若离心管填充体积不足四分之三,可用无菌1× PBS补足。
  6. 如前所述,小心平衡并以70,000 × g在17 °C下离心2小时。倒去上清液,并将离心管倒置于纸巾上使残留液体自然沥干。
  7. 吸除残留液滴,以彻底去除沉淀中的所有液体。此步骤中,含病毒的沉淀应仅表现为微小的半透明斑点,几乎不可见。
  8. 向第一根离心管中加入70 µL 1× PBS重悬沉淀,并充分吹打混匀,随后将悬液转移至下一管并如前混合,依次操作直至所有沉淀完全重悬。
  9. 用额外50 µL冷的1× PBS冲洗各离心管,并如前混匀。确保最终悬液的总体积约为120 µL,且呈轻微乳白色;在台式微量离心机中以10,000 × g离心30秒以澄清悬液。
  10. 将上清液转移至新的微量离心管中,分装为10 µL每份,并于-80 °C保存。
    注意:避免对慢病毒样品进行反复冻融。除必需离心外,其余操作应尽量在组织培养生物安全柜或指定的组织培养室内进行,并采取适当的生物安全防护措施。

结果

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图1: 使用双蔗糖梯度法浓缩病毒颗粒。从上清液(SN)中收集的病毒颗粒被加载到蔗糖梯度中。采用70%、60%、30%和20%的蔗糖溶液建立梯度。离心后,从30–60%蔗糖组分中收集的颗粒进一步加载到20%蔗糖垫上并进行沉淀。最终含有纯化病毒颗粒的沉淀用1x PBS重悬,用于后续实验。

材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
设备   
Optima XPN-80 超速离心机Beckman CoulterA99839 
Allegra 25R 台式离心机Beckman Coulter369434 
锥底超速离心管Seton Scientific5067 
锥形管适配器Seton ScientificPN 4230 
SW32Ti 摆桶转子Beckman Coulter369650 
50 mL 锥形离心管Corning430291 
组织培养移液管,25 mLCorning4489 

标签

病毒浓缩超速离心法蔗糖梯度病毒颗粒纯化病毒悬液制备浮力密度分离蔗糖垫病毒沉淀重悬慢病毒载体纯化