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1. 使用自动化快速蛋白液相色谱(FPLC)系统通过亲和层析法纯化抗体
注意:以下步骤通常适用于大多数自动化系统。纯化可在室温或 4 °C 下进行(如果 FPLC 系统置于低温房间内)。可通过一系列预实验确定最佳纯化条件,包括合适的层析柱基质、结合缓冲液、洗脱缓冲液和 pH 值,以确保从条件培养基中最大程度回收纯化的抗体(参见结果部分)。最佳条件取决于待纯化的抗体或蛋白质。实验在自动化 FPLC 系统上进行,使用 5 ml Protein A 层析柱,并在室温下完成纯化。
- 使用超纯水配制以下缓冲液,并调节至推荐的 pH 值,然后通过 0.22 µm 滤膜过滤。
- 通过混合以下成分配制 1 L 磷酸盐缓冲盐水(PBS)pH 7.4(结合缓冲液):0.14 M NaCl、0.0027 M KCl、0.01 M Na2HPO4 和 0.001 M KH2PO4。必要时在过滤缓冲液前调节 pH。
- 配制 500 ml 0.1 M 甘氨酸-盐酸 pH 2.7(洗脱缓冲液)。在过滤缓冲液前调节 pH。
- 配制 50 ml 1 M Tris pH 9.0(中和缓冲液)。
- 确保所有系统电源和与计算机的通信连接均已正确连接。设备应在软件的“系统控制”模块中可见。确保紫外检测器设定在 280 nm 波长。可选:若已连接并计划使用 pH 计,则对其进行校准。
- 将 A、B 和样品泵的进样管浸入超纯水中以清洗系统。如果管路中存在气泡或怀疑系统中有空气,使用注射器对泵进行排气。通过系统控制器手动操作或采用自动化方法用水清洗系统。观察压力、电导率、UV280 谱线和 pH 值是否稳定,并确保压力未超过色谱柱制造商规定的最大限值。
注意:异常情况可能表明系统中存在空气或堵塞,应在继续操作前予以排除。
- 在系统控制器模块中,通过泵 A 手动启动流速为 1 ml/min,选择加载(旁路样品环)或注入(通过样品环)模式,开始连接色谱柱。断开色谱柱入口处的系统管路,并移除连接在色谱柱入口的堵头。
- 让水从系统管路逐滴流到色谱柱顶部,然后将系统管路连接至色谱柱。确保色谱柱入口及接头处有水滴持续溢出,以保证连接过程中无气泡产生。
- 连接色谱柱出口端的下游出口,并检查所有接头是否已牢固拧紧。色谱柱连接至系统后,不得超过色谱柱规格中规定的最大压力和流速限制。
- 用 5 个柱体积(CV)的水清洗色谱柱。如有必要,持续清洗直至 UV280 谱线稳定。
- 将 A 泵的进样管浸入结合缓冲液中,B 泵的进样管浸入洗脱缓冲液中,样品泵的进样管浸入结合缓冲液中,以使系统在正确的缓冲液中达到平衡。通过手动操作 PumpWash 将缓冲液充满进样管。
- 在软件的“方法编辑器”模块中,使用方法向导为拟使用的色谱柱设置亲和层析方法。
注意:自动 FPLC 系统通常预置了推荐设置(即流速和压力限值),并根据所选色谱柱(制造商、基质和尺寸)自动生成运行步骤。
- 蛋白 A 亲和层析使用以下运行步骤:
- 用 5 CV 的结合缓冲液平衡系统,并将穿流液收集至废液容器中。
- 将样品上样至色谱柱(上样体积在方法中手动指定),并将穿流液收集至单独容器中。
- 用 5 CV 的结合缓冲液清洗系统,并将穿流液收集至单独容器中。
- 使用洗脱缓冲液进行 5 CV 的等度洗脱,通过馏分收集器将纯化的抗体样品以馏分形式收集。
- 用 5 CV 的结合缓冲液重新平衡系统,并将穿流液收集至废液容器中。
- 方法设置完成后,指定需上样至色谱柱的条件培养基体积,并保存该方法。
注意:方法中指定的体积应比实际体积少 5–10 ml,以避免在样品运行过程中引入空气。本方案中使用的指定体积为 90–120 ml。
- 将样品泵管路浸入含有条件培养基的容器中。
- 准备一个单独的容器,通过指定的出口管路收集样品穿流液。
注意:在运行过程中若发生错误,或色谱柱结合能力超载需重新上样或重复纯化时,收集穿流液至关重要。
- 在馏分收集器中准备好收集管。每 1 ml 馏分体积加入 100 µl 中和缓冲液。FPLC 系统将自动将各馏分洗脱至收集管中。
- 在软件的“系统控制”模块中,打开待运行的方法。
注意:方法运行将通过一系列页面启动,包括检查方法变量、设置馏分收集器以及定义结果文件名和存储位置。
- 点击“开始”以启动运行。可在“系统控制”模块中监控运行过程。
- 纯化运行完成后,在系统软件的“评估”模块中查看所得色谱图。
- 将所有含蛋白的馏分合并至一个单独的离心管中,使用截留分子量为 30 kDa 的离心过滤装置在 PBS 中进行缓冲液置换并浓缩。离心步骤按照制造商说明书操作。
- 根据制造商说明书,使用二辛可宁酸法(BCA)测定抗体浓度。
- 若需进行另一次纯化运行,先用结合缓冲液对样品泵管路进行预处理,并重复步骤 1.9–1.14。
- 完成所有纯化运行后,将 A、B 和样品泵的进样管浸入超纯水中,按照步骤 3 的方法清洗系统和色谱柱。
- 将 A、B 和样品泵管路浸入 20% 乙醇中,并重复清洗程序,用于系统和色谱柱的储存。
- 从下游出口断开色谱柱,盖上柱堵头;然后在入口端断开色谱柱并盖上堵头,重新连接管路至系统。将色谱柱于 4 °C 保存。