所有涉及人类参与者的操作均按照机构、国家和国际的人类福利指南进行,并已通过当地机构审查委员会的审查。
1. 获取组织样本
注意:本方案的一个关键步骤是在尸体解剖后立即正确处理组织捐献。样本的整体活性在很大程度上取决于尽量缩短死后间隔时间(Post-Mortem Interval, PMI),立即将组织转移至含有抗生素/抗真菌剂的适当低温保存液中,在运输过程中始终将样本置于湿冰上,并在整个操作过程中保持无菌技术。
- 接到即将进行捐赠的通知后,准备样本采集包。使用带有隔热容器的运输箱,该容器可直接用于组织样本的返程运输,并包含以下材料:
- 准备无菌操作所需材料,包括无菌手套、无菌巾和手术刀。
- 在隔热容器中放入8至10个无菌的50 mL锥形管,每管含30 mL运输培养基,并加入冰块或冷袋。
注意:尽管任何标准细胞培养基均可使用,但使用添加了抗生素/抗真菌剂的Hibernate-A培养基可获得最佳的样本活性。
- 根据其他分析需求(例如,固定剂),额外准备相应的样本管。
- 若解剖不在研究者所在机构进行,需附上一份明确说明如何采集肿瘤样本的文件。内容应包括保持无菌、将样本管置于湿冰上、以及采集中脑和延髓区域的样本,因为肿瘤细胞常侵入这些区域。
- 解剖过程中须保持无菌。脑组织在颅骨内被视为无菌,因此一旦打开颅骨,应遵循无菌操作规范(包括更换手套)。避免皮肤和毛发污染至关重要。
- 从腹侧(脑桥的“腹部”区域,见图1)分离肿瘤。使用无菌手术刀将肿瘤切成约1 cm的小块,立即转移至预冷的运输培养基(参见步骤1.1.2中的注意),并置于湿冰上。每管放入10 mL组织,使每管中组织与培养基的最终总体积为40 mL。
注意:对于弥漫性内生型脑桥胶质瘤(DIPG),肿瘤会弥漫性浸润脑桥,并常累及脑干其余部分。因此,应尽可能多地采集样本,通常包括来自脑桥的3至4管(30–40 mL组织),以及来自中脑和延髓的各1至2管(每管10–20 mL组织)。
- 采集与脑桥相邻的中脑和延髓区域的样本,这些区域通常含有大量肿瘤细胞。
- 样本采集完成后,将样本置于隔热容器中,用湿冰进行隔夜(O/N)运输。严禁使用干冰运输,因为冷冻会导致细胞死亡。
2. 样本处理的准备工作
- 开始样品制备前,在超紫外(UV)灯下对组织培养罩、剃刀刀片、弯头止血钳及所有其他非无菌工具进行1小时的灭菌处理。后续所有步骤均须在无菌条件下操作,以防止培养物污染。
- 配制并进行无菌过滤溶液。
- 配制1.8 M蔗糖溶液:将308.07 g蔗糖溶解于300 mL蒸馏水中,加入50 mL不含钙和镁的10x Hank's平衡盐溶液(HBSS),再用蒸馏水定容至500 mL。4 °C保存。
- 配制酶消化液:每10 mL剪碎的组织,取50 mL含钙和镁的HBSS,加入500 μL 5 mg/mL脱氧核糖核酸酶I(终浓度50 μg/mL)、500 μL 2.5 mg/mL胶原酶I/II与中性蛋白酶混合液(终浓度25 μg/mL)以及500 μL 1 M 4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)缓冲液。将消化液在37 °C水浴中预热。
- 配制肿瘤干细胞基础培养基(TSM base):混合250 mL Neurobasal-A、250 mL Dulbecco改良Eagle培养基:营养混合物F12(DMEM/F12)、5 mL 100x抗生素-抗真菌剂、5 mL 200 mM L-丙氨酰-L-谷氨酰胺二肽(GlutaMAX-A)、5 mL HEPES缓冲液、5 mL 100 mM丙酮酸钠以及5 mL 100x MEM必需氨基酸溶液。
- 配制含生长因子的完全TSM:向TSM基础培养基中添加以下补充成分:50x B27补充剂(不含维生素A)(1:50稀释)、人表皮生长因子(H-EGF,20 ng/mL)、人成纤维细胞生长因子(H-FGF,20 ng/mL)、人血小板源性生长因子AA(H-PDGF-AA,10 ng/mL)、人血小板源性生长因子BB(H-PDGF-BB,10 ng/mL)以及肝素溶液(2 μg/mL)。
- 将配备摆动桶转子的实验室离心机预冷至4 °C。
3. 机械解离
- 将组织转移至一个高壁的 100 mm × 20 mm 细胞培养皿中。去除运输过程中残留的培养基,并加入 10–15 mL 冷培养基替换。
- 使用弯头止血钳夹住刀片,将组织充分切碎,同时去除明显的血管或脑膜组织。
注意:最终的组织碎片应小于 1 mm(见图 2B)。
- 将组织转移至一个洁净的 50 mL 圆锥形离心管中。用额外的 5 mL 冷培养基冲洗细胞培养皿,并将冲洗液转移至离心管中。根据需要重复此洗涤步骤,以转移残留的组织。
- 使用 10 mL 移液管轻轻吹打 4–5 次。让较大的组织碎片沉降至管底。如有必要,将样品短暂离心 1 分钟(350 × g,4 °C)。
- 收集机械解离组分。
- 将上清液转移,经 100 μm 滤膜过滤至一个新的、标记为“机械解离”的 50 mL 圆锥形离心管中。将滤膜倒置在原始离心管上方,用培养基冲洗以回收残留的组织碎片。
- 将“机械解离”组分在 350 × g、4 °C 条件下离心 5 分钟。
- 去除“机械解离”组分沉淀中的上清液,并用冷培养基重悬组织。若“机械解离”离心管中的组织体积超过 5 mL,应将组织分装至其他 50 mL 离心管中,确保每管组织体积不超过 5 mL。
- 将机械解离组分置于冰上保存,直至进行蔗糖梯度离心步骤(第 5 步)。或者,可在酶解解离孵育期间(第 4.4 步)直接将机械解离组分转入第 5 步。
4. 酶解离
- 如果含有剩余较大组织碎片的离心管中组织体积超过5 mL,则将组织分装至其他新的50 mL锥形管中,确保每管组织体积不超过5 mL。
- 将含有剩余组织碎片的锥形管在 350 × g、4 °C 条件下离心 5 分钟。
- 移除上清液,加入预热的酶消化液,每1 mL组织加入5 mL消化液(例如, 5 mL 组织使用 25 mL 消化液。
- 用实验室封口膜密封锥形管管盖,并在37 °C下于旋转摇床上孵育反应30分钟。
- 孵育后,轻轻吹打混匀样品(参见 图2C).
- 使用10 mL血清移液管将样品上下吹打6至8次。避免产生过多气泡。
- 将1,000 μL移液器吸头安装到移液器末端,再吹打6至8次。
- 让剩余的组织块沉降到管底。将仍悬浮有细胞的上清液转移并经100 μm滤膜过滤至一个新的已标记为“酶解离”的50 mL锥形管中,置于冰上保存。
- 如果仍有显著的组织碎片存在,向碎片中加入额外的10 mL含钙和镁的HBSS,并重复步骤3.5.1和3.5.2。将此最终溶液通过100 μm滤器过滤至“酶解离”管中。
- 将“酶解离”管在350 × g、4 °C条件下离心5分钟,随后进行蔗糖梯度离心。
5. 蔗糖梯度离心
- 如果样品仍悬浮于溶液中,以 350 × g 离心 5 分钟(4 °C)。
- 弃去上清液,将组织重悬于 20 mL 不含钙和镁的冷 HBSS 中,再用冷 HBSS 补充至总体积为 25 mL。
- 缓慢加入 25 mL 1.8 M 蔗糖溶液,并倒置试管混匀。此操作可形成 0.9 M 蔗糖梯度。
- 以 800 × g 离心 10 分钟(4 °C),禁止使用离心机刹车。使用刹车会破坏梯度并降低得率(参见 图 2D 以查看离心前后样品的示例)。
- 小心吸除髓鞘碎片及尽可能多的蔗糖溶液。加入 30 mL 不含钙和镁的冷 HBSS 轻柔混匀以洗涤样品,然后以 350 × g 离心 5 分钟(4 °C)。
6. ACK 红细胞裂解
- 移除洗涤上清液。加入 5 mL ACK 裂解缓冲液,轻轻重悬细胞沉淀,在室温下轻轻摇动试管 1 分钟。
- 加入 30 mL 不含钙和镁的冷 HBSS 以终止裂解反应。
- 在 4 °C 下以 350 × g 离心 5 分钟。
7. 初始培养物的维持
- 用 10 - 15 mL 含生长因子的预热完全 TSM 重悬最终的细胞沉淀,并使用台盼蓝排斥法在血细胞计数板上定量活细胞密度。
注意: 活细胞数量因组织捐献的具体情况而异,且由于残留的细胞碎片较多,此早期阶段的定量可能较为困难。理想情况下,每份样本应获得一百万个活细胞。若存在大量残留碎片,则应在 T175 培养瓶中以较低密度接种。
- 将最终的细胞悬液转移至新的 T75 培养瓶中。每隔一天补充一次额外的生长因子,以维持总体生长因子水平,并监测肿瘤细胞神经球的形成(见 图 2E 和 图 3)。