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调节秀丽隐杆线虫产卵行为的单个神经元中的钙成像

2025年7月8日

本文内容

摘要

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来源:Ravi, B. et al., 行为秀丽隐杆线虫中单个神经元的比率钙成像。J. Vis. Exp. (2018 年)。

该视频演示了一种使用遗传编码的荧光报告蛋白对行为秀丽隐杆线虫的单个神经元进行钙成像的技术。它概述了对蠕虫运动进行成像和测量神经元报告基因荧光比率以将细胞内钙水平与产卵过程中神经元活动和行为变化相关联所涉及的步骤。

方案

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1. 菌株、培养基和动物的安装

  1. 在 20 °C 下在接种有 OP50 大肠杆菌细菌食物的标准 60 毫米线虫生长培养基 (NGM) 琼脂平板上培养秀丽隐杆线虫蠕虫。
  2. 为每个感兴趣的细胞特异性启动子准备两个质粒:一个驱动 GCaMP5 的表达以记录细胞内 Ca2+,第二个驱动 mCherry 的表达,以允许 GCaMP5 荧光变化的比率定量并简化对象查找和测量><。 注意:GCaMP5:mCherry 比率成像校正由焦点和动物运动变化引起的 GCaMP5 荧光波动,而不是细胞内 Ca2+ 的实际变化。
  3. 表达 GCaMP5 和 mCherry 的质粒以及 pL15EK 可见拯救标记质粒注射到 LX1832 lite-1(ce314)、lin-15(n765ts) X 突变动物的性腺中,并从高拷贝转基因中回收表达 GCaMP5 和 mCherry 的非 Muv lin-15(+) 动物。使用 lite-1 突变背景来减少蓝光回避行为。
  4. 将转基因整合到染色体上,以减少嵌合体并简化复合突变菌株的生成><。 注意:此处描述的 LX2004 菌株携带一个集成的高拷贝转基因,该转基因在 nlp-3 启动子的 HSN 中表达 GCaMP5 和 mCherry(参见材料表)。发现 nlp-3 启动子在晚期 L4 和成年动物的 HSN 中强烈表达,与测试的其他启动子(例如 tph-1egl-6unc-86)相比,不会导致 HSN 发育或产卵行为出现显着缺陷。该菌株和其他在腹侧脊髓 (VC) 运动神经元、外阴肌肉和 uv1 神经内分泌细胞中表达 GCaMP5 和 mCherry 的菌株可从 Caenorhabditis 遗传学中心获得,并且已经描述了它们的构建细节。
  5. 将来自接种的 NGM 琼脂平板的 OP50 细菌食物涂在铂蠕虫镐的底部,并用它来转移 ~ 20 只晚期 L4 LX2004 动物,这些动物在 HSN 中表达 GCaMP5 和 mCherry 来自 nlp-3 启动子。确保发育中的外阴在立体显微镜下显示为一个被白色新月包围的透明黑点。将动物在 20 °C 下孵育 24-40 小时。
  6. 孵育后,将 OP50 施用到拾取物上,并将 ~ 3 条蠕虫转移到未接种的 NGM 板中,留下少量食物供蠕虫在成像过程中食用。确保食物充足,因为细菌食物太少会促使蠕虫远离盘子的中心,而过多的食物会增加背景荧光并导致缺氧。
  7. 使用扁平的圆形刮刀从携带蠕虫的板上切下 ~ 20 mm x 20 mm 的块,并将块面朝下转移到干净的 24 mm x 60 mm #1.5 盖玻片的中心(图 1)。从一侧开始应用,以防止气泡被困在盖玻片下并干扰成像。将 22 mm x 22 mm #1 盖玻片贴在块的顶部,以减少粘连和蒸发。

2. 硬件和检测设置

  1. 将暂存的转基因蠕虫放在倒置显微镜的载物台上,该显微镜具有≥ 0.7 数值孔径平场复消色差 20 倍物镜、电动 XY 载物台,可通过纵杆、图像分割器和荧光滤光片控制,用于同时 GCaMP5 和 mCherry 激发和发射,用于荧光和红外明场成像的相机,以及可触发的发光二极管 (LED) 照明系统(图 2A
    注意:80/20 分束器将 80% 的图像信号发送到荧光相机,将 20% 的图像信号发送到明场相机。也可以使用正置显微镜,但在这种情况下,NGM 块应放置在载玻片和大盖玻片之间。
    1. 使用双目目镜选择蠕虫进行成像。选择动物后,将红外滤光片滑入冷凝器上方的适当位置。
  2. 晶体管-晶体管逻辑 (TTL) 触发器
    1. 从荧光相机的三条 TTL 触发输出线中的每一条连接同轴电缆。将第一个输出连接到 LED 照明系统的 BNC 输入 #3。
    2. 将第二个输出连接到带有绿色和棕色线的 BNC"香蕉"适配器,从 8 针 GPIO 连接器分别连接到红外摄像机的 GPIO 输入 #3(引脚 4)和接地(引脚 5)。
    3. 将第三个输出连接到 BNC"香蕉"适配器,跳线连接到数字采集设备中的 #8 数字输入和接地(图 2B)。
  3. 数字采集设备 (DAQ)
    1. 通过 USB 电缆将 DAQ 微控制器板(参见材料表)连接到 PC。使用标准 Firmata 协议更新固件(请参阅 材料表),并将 USB 端口配置为以 57600 波特率进行通信。
  4. 发光二极管
    1. 运行 LED 控制器软件(参见材料表)。将触发模式从"连续"切换到"门控",并为 470 和 590 nm LED 选择触发通道"3"。
    2. 打开并输入每个 LED 的 LED 功率(例如,将 470 nm LED 设置为 20%,将 590 nm LED 设置为 40%)。
  5. 在 Bonsai 中运行串行阶段通信脚本"XY-stage-final" (请参阅 材料表) 。单击灰色的"CsvWriter"节点,然后选择一个文件夹以保存记录的 X 和 Y 阶段信息(图 3)。按下工具栏中的绿色箭头初始化 DAQ.
    注意:当荧光相机发送 TTL 信号时,该脚本将开始记录 X 和 Y 载物台位置。此脚本输出四列数据:帧编号、X 位置 (μm)、Y 位置 (μm) 和帧之间的间隔 (s)。
  6. 在红外摄像机录制软件(参见材料表)中,在"自定义视频模式"下,选择"模式 1"(2 x 2 像素合并;1,024 x 1,024 像素)和"像素格式 Raw 8"。在"触发/频闪"下,将触发输入线 (GPIO) 设置为"3",将极性设置为"高",将"模式"设置为"14"。切换 'Enable' 以停止帧采集,直到接收到 TTL 触发信号。
    1. 保持该窗口打开,单击主摄像机视图工具栏上的红色"Record"按钮。选择要保存的图像序列的文件夹。选择 'Buffered' Recording 模式并以 JPEG 格式保存 'Images'。点击 "Start Recording" 初始化采集。
  7. 荧光相机和图像分配器
    注意:必须同时收集 GCaMP5 和 mCherry 荧光通道,以确保正确配准用于比率定量。图像分流器允许在一个传感器上对 GCaMP5 和 mCherry 荧光进行双通道采集。
    1. 在图像采集软件的"捕获"选项卡中(参见材料表),将曝光时间设置为 10 毫秒,将像素合并设置为 4 倍,将图像深度设置为 16 位。选择一个 512 像素宽 x 256 像素高的居中摄像机子阵列。点击 'Show Output Trigger Options' 并将所有触发器设置为 'Positive.
      注意: 如果 TTL 触发为 10 ms 或更短,DAQ 偶尔会错过 TTL 触发。
    2. 确保将"触发器 1"和"触发器 2"设置为"曝光",同时将"触发器 3"设置为"可编程","周期"为 25 毫秒。在"序列"选项卡下,选择"延时摄影","场延迟 1"为 50 毫秒,以 20 Hz 的速度收集图像。选择"保存到临时缓冲区"。
  8. 三通道共聚焦成像期间的 PMT 增益和激光强度
    1. 设置 PMT 增益,使背景荧光处于略高于最小值(黑色水平)的水平。增加 561 nm(绿色)激光功率,直到在 mCherry 通道的突触前末端观察到单个饱和的 12 位或 16 位像素。
    2. 调整 488 nm(蓝色)激光强度,使 GCaMP5 荧光在背景上方的突触前末端可见。当荧光因强 Ca2+ 瞬变而增加时,此低设置可防止 GCaMP5 像素饱和。完全打开共聚焦针孔,以最大限度地捕获光线。

3. 比率式 Ca2+ 成像和行为记录

  1. 在荧光采集软件的"序列"选项卡下,单击"开始"开始记录。用纵杆跟踪蠕虫,使感兴趣的细胞和突触保持聚焦并在视野 (FOV) 的中心。点击直方图窗口中的 'Stats' 按钮,显示每个通道的像素统计数据。
  2. 调整 LED 功率以确保突触前末端的最大单像素 mCherry 荧光≥ 8,000 个计数(~ 4,000 个光电子),在背景上方提供 ~ 12 位动态范围(~ 100 个光电子)。在静息(低)Ca2+ 期间突触前末端的 GCaMP5 信号应在 ~ 2,500 计数左右 - 就在背景上方可见。
  3. 记录,直到达到一个产卵活跃状态;通常,在野生型蠕虫中每 20-30 分钟发生一次。保存一个 10 分钟的子集(12,001 帧),在第一次产蛋事件(第 6,001 帧)之前和之后保存 6,000 帧。请务必保持蠕虫行为的明场图像子集和 XY 阶段位置的时间点,否则数据流的精确同步将丢失。
  4. 使用 ImageJ 和 BioFormats 插件(参见材料表)将图像序列转换为图像细胞术标准 (.ics) 格式,以便将其导入 Ratiometric Quantitation 软件。

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结果

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图 1.秀丽隐杆线虫安装技术,用于产卵电路活动和行为的高分辨率成像。顶部,从侧面开始的最后一个安装。底部,通过大盖玻片的底部观察的最终安装。箭头表示 OP50 细菌食物、秀丽隐杆线虫蠕虫和卵,夹在 NGM 琼脂块和 24 mm x 60 mm 的大盖玻片之间。

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图 2.在倒置落射荧光显微镜上进行宽场比率 Ca2+ 成像和行为记录。A) 使用卤素灯通过 NGM 块发射的红外 (750-790 ...

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材料

<表格border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"> 本文使用的材料清单 姓名 公司 目录编号 评论 秀丽隐杆线虫的生长、培养和挂载 大肠杆菌细菌菌株,OP50 Caenorhabditis 遗传中心 OP50 秀丽隐杆线虫的食物。尿嘧啶营养不良。大肠杆菌 B. 生物安全 1 级 HSN GCaMP5+mCherry 蠕虫菌株 Caenorhabditis 遗传中心 LX2004 系列 使用 nlp-3 启动子的整合转基因驱动 HSN 中的 GCaMP5 和 mCherry 表达。全基因型:
vsIs183 [nlp-3p::GCaMP5::nlp-3 3'UTR + nlp-3p::mCherry::nlp-3 3'UTR + lin-15(+)],lite-1(ce314),lin-15(n765ts) X 用于转基因制备的 LITE-1(CE314)、LIN-15(N765TS) 突变菌株 作者 LX1832 系列 显微注射 pL15EK lin-15 (n765ts) 拯救质粒后用于回收高拷贝转基因的菌株。还携带连接的 lite-1 (ce314) 突变,可降低蓝光敏感性。可应要求从作者处获得 pL15EK lin-15a/b 基因组拯救质粒 作者 pL15EK 蛋白 用于回收注射到 LX1832 中的转基因动物的拯救质粒
LITE-1(CE314)、LIN-15(N765TS) X 菌株。可应要求从作者处获得 pKMC299 质粒 作者 pKMC299 用于在 nlp-3 启动子的 HSN 中表达 mCherry 的质粒。具有 nlp-3 3' 非翻译区 pKMC300 质粒 作者 pKMC300 抗体 用于在 nlp-3 启动子的 HSN 中表达 GCaMP5 的质粒。具有 nlp-3 3' 非翻译区 磷酸二氢钾 西格马 货号 P8281 用于制备 NGM 板 磷酸氢二钾 西格马 P5655 用于制备 NGM 板 Magnesium Sulfate Heptahydrate (七水硫酸镁) 阿姆雷斯科 662 元 用于制备 NGM 板 氯化钙二水合物 阿尔法埃撒 12312 用于制备 NGM 板 蛋白胨 贝克顿·狄金森 211820 用于制备 NGM 板 氯化钠 阿姆雷斯科 241 元 用于制备 NGM 板 胆固醇 阿尔法埃撒 编号 A11470 用于制备 NGM 板 琼脂,细菌学 A 型,超纯 Affymetrix 10906 元 用于制备 NGM 板 60 mm 培养皿 VWR 25384-164 用于制备 NGM 板 24 x 60 mm 微型盖玻片,#1.5 VWR 48393-251 蠕虫成像的盖玻片 22 x 22 mm 微型盖玻片,#1 VWR 48366-067 覆盖琼脂块顶部的盖玻片 带透射光底座的体视显微镜 徕卡 M50 系列 用于蠕虫菌株维护、分期和安装的解剖显微镜 铂铱丝,(80:20),0.2mm 阿尔法 AESAR AA39526-BW 用于蜗杆传输 钙成像显微镜 防振气台 TMC 63-544 Micro-g' Lab Table 30" x 48" 防振台,25mm 顶部带有 4" CleanTop M6 倒置复合显微镜 蔡司 431007-9902-000 Axio Observer.Z1 倒置显微镜 侧端口 L80/R100(3 位) 蔡司 425165-0000-000 将 20% 的输出转移到明场 (CMOS) 相机,将 80% 的输出转移到荧光 (sCMOS) 相机 Tilt Back Illumination Carrier (后倾照明托架) 蔡司 423920-0000-000 用于红外/行为成像 灯罩 12V/100W 带集电器 蔡司 423000-9901-000 用于红外/行为成像 卤素灯 12V/100W 蔡司 380059-1660-000 用于红外/行为成像。白光 LED 不会发出明显的红外光,因此它们不允许在红外带通滤光片之后进行明场成像 用于卤素灯的 32 mm 红外带通滤光片 (750-790 nm) 蔡司 447958-9000-000 BP 750-790;DMR 32mm,用于明场和行为的红外照明 6 片聚光镜转盘 (LD 0.55 H/DIC/Ph),电动 蔡司 424244-0000-000 用于红外/行为成像 冷凝器和快门 蔡司 423921-0000-000 用于红外/行为成像 用于红外 CMOS 相机的带光电管双目目镜 蔡司 425536-0000-000 用于红外/行为成像 目镜 10 倍,23 毫米 蔡司 444036-9000-000 用于琼脂块上的蠕虫定位 C 接口适配器 2/3" 0.63x 去传感器 蔡司 426113-0000-000 红外 CMOS 相机支架 用于红外明场和行为的 CMOS 相机(1 英寸传感器) FLIR(前身为 Point Grey Research) GS3-U3-41C6NIR-C 近红外 用于明场成像的相机 USB 3.0 主机控制器卡 FLIR(前身为 Point Grey Research) ACC-01-1202 Fresco FL1100,4 端口 8 针,1m GPIO 电缆,Hirose HR25 圆形连接器 FLIR(前身为 Point Grey Research) ACC-01-3000 型 用于 TTL 触发的电缆。绿线连接到 GPIO3 / 引脚 4,棕线连接到接地 / 引脚 5 平场复消色差物镜 20x/0.8 工作距离=0.55 m27 蔡司 420650-9901-000 放大倍率、数值孔径和工作距离的最佳组合 6 立方体反射器转盘,电动 蔡司 424947-0000-000 用于荧光成像 荧光灯列车,电动 蔡司 423607-0000-000 用于荧光成像 荧光快门 蔡司 423625-0000-000 用于荧光成像 GFP 和 mCherry 双激发和发射滤光片立方体(用于显微镜) 蔡司 489062-9901-000 用于荧光成像的 FL 滤光片组 62 HE BFP+GFP+HcRed LED 照明系统 蔡司 423052-9501-000 用于荧光照明的可触发 Colibri.2 LED 系统 GFP LED 模块 (470 nm) 蔡司 423052-9052-000 用于 GFP 荧光激发的 Colibri.2 LED mCherry LED 模块 (590 nm) 蔡司 423052-9082-000 用于 mCherry 荧光激发的 Colibri.2 LED 用于入射光设备的光圈光阑滑块 蔡司 000000-1062-360 视场孔径光圈,用于将 LED 照明限制在相机视场内 C 接口适配器 1" 1.0x 蔡司 426114-0000-000 用于图像分流器和 sCMOS 荧光相机的适配器 图像分割器 滨松 编号 A12801-01 Gemini W-View 可以使用其他图像分配器,但它们可能未针对 sCMOS 相机的大传感器尺寸进行优化 GFP / mCherry 二向色镜(图像分割器) 森洛克 型号 Di02-R594-25x36 从 mCherry 和红外信号中分离 GCaMP5 GFP 发射滤光片(图像分离器) 森洛克 FF01-525/30-25 型 捕获 GCaMP5 荧光 mCherry/ 发射滤光片(图像分割器) 森洛克 FF01-647/57-25 尾灯 此滤光片对于排除用于明场成像的红外光是必要的 用于荧光的 sCMOS 相机(1 英寸传感器) 滨松 编号 A12802-01 / C11440-22CU 逆戟鲸 FLASH 4.0 V2。较新的型号允许在传感器的不同部分进行单独的图像采集设置,从而允许结合图像分离器采集双通道图像 电动 XY 载物台 Märzhäuser 扫描 IM 130 x 100 载物台移动;该载物台的 XY 分辨率为每步 0.2μm 带纵杆的 XY Stage 控制器 LUDL MAC6000、XY纵杆 手动跟踪蠕虫。MAC6000控制器应通过配置为 115200 波特率的串行 (RS-232) 端口连接到 PC 数字采集板 (DAQ) Arduino的 宇野 接收来自 sCMOS 相机的 TTL 触发器。Uno 应该加载标准的 Firmata 包,并将计算机 USB 端口配置为 57600 波特 BNC 公头到 BNC 公头电缆 - 6 英尺 浩沙科技 霍布6 用于 TTL 触发的 BNC 连接器 镀金 BNC 公头转 SMA 公头同轴电缆 (8.8") 优赛尔 6.08642E+11 连接荧光相机触发输出 BNC 转头适配器 Hantek 汉特 RRBNCTH21 BNC 转香蕉插头适配器 (4mm) BNC 母对母连接器 诊断 20130530009 母对母 BNC 适配器,用于将摄像机的 BNC 输出连接到香蕉插头 无焊柔性试验板跳线 Z&T GK1212827 将 BNC 触发输出连接到 Arduiono DAQ。公对公。 高性能工作站 惠普 Z820 系列 Windows 7、64GB RAM、双至强处理器、固态 C:驱动器、串行 (RS-232) 端口、多个用于以太网连接的 PCIe3 插槽、USB 3.0 卡和其他固态驱动器 M.2 固态硬盘 三星 MZ-V5P512BW 图像数据的高速流式处理和分析 用于工作站的 M.2 固态硬盘适配器 莱科姆 DT-120 型 M.2 转 PCIe 3.0 4 速适配器 网络附加存储 群晖科技 DS-2415+ 系列 成像数据存储和分析 硬盘驱动器 西部数据 WD80EFZX RED 8 TB,5400 RPM 级 SATA 6 Gb/s 128MB 缓存 3.5 英寸。存储映像数据(10 个驱动器 + 2 个驱动器冗余) 软件 荧光采集 滨松 HCImage DIA 以 20 fps 的速度记录双通道(GCaMP5 和 mCherry)荧光图像序列 Brightfield 采集 FLIR(前身为 Point Grey Research) 飞捕 记录明场 JPEG 图像序列 Stage 串行端口读取器 盆景 https://bitbucket.org/horizongir/bonsai 有助于在行为期间跟踪蠕虫 LED 控制器软件 蔡司 Micro Toolbox 测试 2011 设置 Colibri.2 装置中不同 LED 的强度和触发输入 图像J 美国国立卫生研究院 https://imagej.net/Fiji/Downloads 轻松查看图像序列和格式更改,以便导入 Ratiometric Quantitation 软件 胜过 Microsoft 2002984-001-000001 用于从 Volocity 生成逗号分隔值数据的子集以进行 MATLAB 分析 峰值查找 MATLAB R2017a 用于 Ratio 峰值特征计算的脚本 比率定量 珀金·埃尔默 波动率 6.3 便于计算比率图像通道、用于对象查找的图像分割以及找到对象的比率测量 脚本 AnalyzeGCaMP_2017.m MATLAB 均值比和 XY 质心脚本 以 .csv 格式分析比率输出,合并对象和质心位置,计算比率变化 (ΔR/R),识别峰和峰特征,并以 postscript 格式编写绘图(带和不带注释的峰)。对于矩阵文件导入,该脚本会将数据输出到三个文件夹中:analyzed、peak 和 traces。"分析"输出是包含六列(单位)的合并对象的矩阵文件:时间 (s)、面积(平方微米)、比率、X 质心(微米)、Y 质心(微米)和 ΔR/R。"峰"输出是找到的峰的时间点、振幅(以 ΔR/R 为单位)、峰宽 (s)、 以及山峰的突出度。'Traces' 输出是钙迹线的 postscript 文件。 XY-stage-final.bonsai 盆景 TTL 触发的 DAQ 和载物台位置串行端口阅读器 当连接的 Arduino 在帧曝光期间从 sCMOS 相机接收到正 TTL 信号时,记录 X 和 Y 载物台位置(以微米为单位)。脚本编写一个包含四列的 .csv 文件:帧编号、X 位置(微米)、Y 位置(微米)和帧之间经过的时间(以 20 fps 录制时通常为 ~50 毫秒)。此输出中的 X 和 Y 舞台位置(分别为第 2 列和第 3 列)将添加到 AnalyzeGCaM 中的 X 和 Y 质心位置

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申请许可以重复使用本 JoVE 文章的文本或图表

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标签

GCaMP5 mCherry

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