来源:Ravi, B. et al., 行为秀丽隐杆线虫中单个神经元的比率钙成像。J. Vis. Exp. (2018 年)。
该视频演示了一种使用遗传编码的荧光报告蛋白对行为秀丽隐杆线虫的单个神经元进行钙成像的技术。它概述了对蠕虫运动进行成像和测量神经元报告基因荧光比率以将细胞内钙水平与产卵过程中神经元活动和行为变化相关联所涉及的步骤。
方法文章
2025年7月8日
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本文使用的材料清单
姓名
公司
目录编号
评论
秀丽隐杆线虫的生长、培养和挂载
大肠杆菌细菌菌株,OP50
Caenorhabditis 遗传中心
OP50
秀丽隐杆线虫的食物。尿嘧啶营养不良。大肠杆菌 B. 生物安全 1 级
HSN GCaMP5+mCherry 蠕虫菌株
Caenorhabditis 遗传中心
LX2004 系列
使用 nlp-3 启动子的整合转基因驱动 HSN 中的 GCaMP5 和 mCherry 表达。全基因型:
vsIs183 [nlp-3p::GCaMP5::nlp-3 3'UTR + nlp-3p::mCherry::nlp-3 3'UTR + lin-15(+)],lite-1(ce314),lin-15(n765ts) X
用于转基因制备的 LITE-1(CE314)、LIN-15(N765TS) 突变菌株
作者
LX1832 系列
显微注射 pL15EK lin-15 (n765ts) 拯救质粒后用于回收高拷贝转基因的菌株。还携带连接的 lite-1 (ce314) 突变,可降低蓝光敏感性。可应要求从作者处获得
pL15EK lin-15a/b 基因组拯救质粒
作者
pL15EK 蛋白
用于回收注射到 LX1832 中的转基因动物的拯救质粒
LITE-1(CE314)、LIN-15(N765TS) X 菌株。可应要求从作者处获得
pKMC299 质粒
作者
pKMC299
用于在 nlp-3 启动子的 HSN 中表达 mCherry 的质粒。具有 nlp-3 3' 非翻译区
pKMC300 质粒
作者
pKMC300 抗体
用于在 nlp-3 启动子的 HSN 中表达 GCaMP5 的质粒。具有 nlp-3 3' 非翻译区
磷酸二氢钾
西格马
货号 P8281
用于制备 NGM 板
磷酸氢二钾
西格马
P5655
用于制备 NGM 板
Magnesium Sulfate Heptahydrate (七水硫酸镁)
阿姆雷斯科
662 元
用于制备 NGM 板
氯化钙二水合物
阿尔法埃撒
12312
用于制备 NGM 板
蛋白胨
贝克顿·狄金森
211820
用于制备 NGM 板
氯化钠
阿姆雷斯科
241 元
用于制备 NGM 板
胆固醇
阿尔法埃撒
编号 A11470
用于制备 NGM 板
琼脂,细菌学 A 型,超纯
Affymetrix
10906 元
用于制备 NGM 板
60 mm 培养皿
VWR
25384-164
用于制备 NGM 板
24 x 60 mm 微型盖玻片,#1.5
VWR
48393-251
蠕虫成像的盖玻片
22 x 22 mm 微型盖玻片,#1
VWR
48366-067
覆盖琼脂块顶部的盖玻片
带透射光底座的体视显微镜
徕卡
M50 系列
用于蠕虫菌株维护、分期和安装的解剖显微镜
铂铱丝,(80:20),0.2mm
阿尔法 AESAR
AA39526-BW
用于蜗杆传输
钙成像显微镜
防振气台
TMC
63-544
Micro-g' Lab Table 30" x 48" 防振台,25mm 顶部带有 4" CleanTop M6
倒置复合显微镜
蔡司
431007-9902-000
Axio Observer.Z1 倒置显微镜
侧端口 L80/R100(3 位)
蔡司
425165-0000-000
将 20% 的输出转移到明场 (CMOS) 相机,将 80% 的输出转移到荧光 (sCMOS) 相机
Tilt Back Illumination Carrier (后倾照明托架)
蔡司
423920-0000-000
用于红外/行为成像
灯罩 12V/100W 带集电器
蔡司
423000-9901-000
用于红外/行为成像
卤素灯 12V/100W
蔡司
380059-1660-000
用于红外/行为成像。白光 LED 不会发出明显的红外光,因此它们不允许在红外带通滤光片之后进行明场成像
用于卤素灯的 32 mm 红外带通滤光片 (750-790 nm)
蔡司
447958-9000-000
BP 750-790;DMR 32mm,用于明场和行为的红外照明
6 片聚光镜转盘 (LD 0.55 H/DIC/Ph),电动
蔡司
424244-0000-000
用于红外/行为成像
冷凝器和快门
蔡司
423921-0000-000
用于红外/行为成像
用于红外 CMOS 相机的带光电管双目目镜
蔡司
425536-0000-000
用于红外/行为成像
目镜 10 倍,23 毫米
蔡司
444036-9000-000
用于琼脂块上的蠕虫定位
C 接口适配器 2/3" 0.63x 去传感器
蔡司
426113-0000-000
红外 CMOS 相机支架
用于红外明场和行为的 CMOS 相机(1 英寸传感器)
FLIR(前身为 Point Grey Research)
GS3-U3-41C6NIR-C 近红外
用于明场成像的相机
USB 3.0 主机控制器卡
FLIR(前身为 Point Grey Research)
ACC-01-1202
Fresco FL1100,4 端口
8 针,1m GPIO 电缆,Hirose HR25 圆形连接器
FLIR(前身为 Point Grey Research)
ACC-01-3000 型
用于 TTL 触发的电缆。绿线连接到 GPIO3 / 引脚 4,棕线连接到接地 / 引脚 5
平场复消色差物镜 20x/0.8 工作距离=0.55 m27
蔡司
420650-9901-000
放大倍率、数值孔径和工作距离的最佳组合
6 立方体反射器转盘,电动
蔡司
424947-0000-000
用于荧光成像
荧光灯列车,电动
蔡司
423607-0000-000
用于荧光成像
荧光快门
蔡司
423625-0000-000
用于荧光成像
GFP 和 mCherry 双激发和发射滤光片立方体(用于显微镜)
蔡司
489062-9901-000
用于荧光成像的 FL 滤光片组 62 HE BFP+GFP+HcRed
LED 照明系统
蔡司
423052-9501-000
用于荧光照明的可触发 Colibri.2 LED 系统
GFP LED 模块 (470 nm)
蔡司
423052-9052-000
用于 GFP 荧光激发的 Colibri.2 LED
mCherry LED 模块 (590 nm)
蔡司
423052-9082-000
用于 mCherry 荧光激发的 Colibri.2 LED
用于入射光设备的光圈光阑滑块
蔡司
000000-1062-360
视场孔径光圈,用于将 LED 照明限制在相机视场内
C 接口适配器 1" 1.0x
蔡司
426114-0000-000
用于图像分流器和 sCMOS 荧光相机的适配器
图像分割器
滨松
编号 A12801-01
Gemini W-View 可以使用其他图像分配器,但它们可能未针对 sCMOS 相机的大传感器尺寸进行优化
GFP / mCherry 二向色镜(图像分割器)
森洛克
型号 Di02-R594-25x36
从 mCherry 和红外信号中分离 GCaMP5
GFP 发射滤光片(图像分离器)
森洛克
FF01-525/30-25 型
捕获 GCaMP5 荧光
mCherry/ 发射滤光片(图像分割器)
森洛克
FF01-647/57-25 尾灯
此滤光片对于排除用于明场成像的红外光是必要的
用于荧光的 sCMOS 相机(1 英寸传感器)
滨松
编号 A12802-01 / C11440-22CU
逆戟鲸 FLASH 4.0 V2。较新的型号允许在传感器的不同部分进行单独的图像采集设置,从而允许结合图像分离器采集双通道图像
电动 XY 载物台
Märzhäuser
扫描 IM 130 x 100
载物台移动;该载物台的 XY 分辨率为每步 0.2μm
带纵杆的 XY Stage 控制器
LUDL
MAC6000、XY纵杆
手动跟踪蠕虫。MAC6000控制器应通过配置为 115200 波特率的串行 (RS-232) 端口连接到 PC
数字采集板 (DAQ)
Arduino的
宇野
接收来自 sCMOS 相机的 TTL 触发器。Uno 应该加载标准的 Firmata 包,并将计算机 USB 端口配置为 57600 波特
BNC 公头到 BNC 公头电缆 - 6 英尺
浩沙科技
霍布6
用于 TTL 触发的 BNC 连接器
镀金 BNC 公头转 SMA 公头同轴电缆 (8.8")
优赛尔
6.08642E+11
连接荧光相机触发输出
BNC 转头适配器
Hantek 汉特
RRBNCTH21
BNC 转香蕉插头适配器 (4mm)
BNC 母对母连接器
诊断
20130530009
母对母 BNC 适配器,用于将摄像机的 BNC 输出连接到香蕉插头
无焊柔性试验板跳线
Z&T
GK1212827
将 BNC 触发输出连接到 Arduiono DAQ。公对公。
高性能工作站
惠普
Z820 系列
Windows 7、64GB RAM、双至强处理器、固态 C:驱动器、串行 (RS-232) 端口、多个用于以太网连接的 PCIe3 插槽、USB 3.0 卡和其他固态驱动器
M.2 固态硬盘
三星
MZ-V5P512BW
图像数据的高速流式处理和分析
用于工作站的 M.2 固态硬盘适配器
莱科姆
DT-120 型
M.2 转 PCIe 3.0 4 速适配器
网络附加存储
群晖科技
DS-2415+ 系列
成像数据存储和分析
硬盘驱动器
西部数据
WD80EFZX
RED 8 TB,5400 RPM 级 SATA 6 Gb/s 128MB 缓存 3.5 英寸。存储映像数据(10 个驱动器 + 2 个驱动器冗余)
软件
荧光采集
滨松
HCImage DIA
以 20 fps 的速度记录双通道(GCaMP5 和 mCherry)荧光图像序列
Brightfield 采集
FLIR(前身为 Point Grey Research)
飞捕
记录明场 JPEG 图像序列
Stage 串行端口读取器
盆景
https://bitbucket.org/horizongir/bonsai
有助于在行为期间跟踪蠕虫
LED 控制器软件
蔡司
Micro Toolbox 测试 2011
设置 Colibri.2 装置中不同 LED 的强度和触发输入
图像J
美国国立卫生研究院
https://imagej.net/Fiji/Downloads
轻松查看图像序列和格式更改,以便导入 Ratiometric Quantitation 软件
胜过
Microsoft
2002984-001-000001
用于从 Volocity 生成逗号分隔值数据的子集以进行 MATLAB 分析
峰值查找
MATLAB
R2017a
用于 Ratio 峰值特征计算的脚本
比率定量
珀金·埃尔默
波动率 6.3
便于计算比率图像通道、用于对象查找的图像分割以及找到对象的比率测量
脚本
AnalyzeGCaMP_2017.m
MATLAB
均值比和 XY 质心脚本
以 .csv 格式分析比率输出,合并对象和质心位置,计算比率变化 (ΔR/R),识别峰和峰特征,并以 postscript 格式编写绘图(带和不带注释的峰)。对于矩阵文件导入,该脚本会将数据输出到三个文件夹中:analyzed、peak 和 traces。"分析"输出是包含六列(单位)的合并对象的矩阵文件:时间 (s)、面积(平方微米)、比率、X 质心(微米)、Y 质心(微米)和 ΔR/R。"峰"输出是找到的峰的时间点、振幅(以 ΔR/R 为单位)、峰宽 (s)、 以及山峰的突出度。'Traces' 输出是钙迹线的 postscript 文件。
XY-stage-final.bonsai
盆景
TTL 触发的 DAQ 和载物台位置串行端口阅读器
当连接的 Arduino 在帧曝光期间从 sCMOS 相机接收到正 TTL 信号时,记录 X 和 Y 载物台位置(以微米为单位)。脚本编写一个包含四列的 .csv 文件:帧编号、X 位置(微米)、Y 位置(微米)和帧之间经过的时间(以 20 fps 录制时通常为 ~50 毫秒)。此输出中的 X 和 Y 舞台位置(分别为第 2 列和第 3 列)将添加到 AnalyzeGCaM 中的 X 和 Y 质心位置
申请许可以重复使用本 JoVE 文章的文本或图表
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